Universidad de Los Andes
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Análisis de pangenoma de Leishmania (Viannia) panamensis
No full textLa leishmaniasis es una enfermedad tropical desatendida causada por parásitos del género Leishmania, siendo L. (V.) panamensis el principal agente etiológico de leishmaniasis cutánea en Panamá y Colombia. A pesar de su importancia epidemiológica, los estudios de diversidad genómica mediante secuenciación de genoma completo son escasos, y el uso de un único genoma de referencia puede introducir sesgos en los análisis genómicos. En este estudio se secuenciaron 31 aislados clínicos de L. (V.) panamensis provenientes de Colombia utilizando tecnología de lecturas largas Oxford Nanopore, generando ensamblajes de alta calidad a nivel cromosoma con NGSEP Assembler, que mostraron alta contigüidad (N50 promedio: 807 kb, longitud total: ~35.47 Mb) con 50-90% de los cromosomas reconstruidos en contigs únicos. Se construyó el primer grafo de pangenoma para esta especie usando Minigraph-Cactus y se realizó identificación de ortogrupos para caracterizar la variación de presencia/ausencia. Los resultados revelaron una inversión de ~300 kb en el cromosoma 30 presente en 15 de 31 aislados, regiones repetitivas en los cromosomas 2, 5 y 27, y la detección de 785,865 SNVs y 514,411 variantes de otros tipos. El análisis filogenético mostró una clara diferenciación entre los zimodemas 2.2 y 2.3, con el zimodema 2.4 agrupándose más cerca de 2.3, mientras que los aislados de Antioquia formaron un clado diferenciado (Lpan3). El pangenoma de genes identificó 12,444 ortogrupos en 28 aislados, con 46.9% constituyendo el genoma central (3,033 ortogrupos), observándose expansiones en las familias génicas de amastinas y tuzinas distribuidas en múltiples cromosomas. Este primer análisis de pangenoma de L. (V.) panamensis y estructura poblacional asociada con la clasificación de zimodemas, proporcionando un marco robusto para futuros estudios sobre diagnóstico, respuesta al tratamiento y epidemiología de la leishmaniasis, mientras que el enfoque de pangenoma minimiza el sesgo de referencia y permite una caracterización comprehensiva de la diversidad genética en este parásito de importancia médica.Maestrí
En materia de cuidado
No full textLa enfermedad tiene la capacidad de interrumpir la vida en seco: altera sus ritmos y revela lo frágil que puede ser depender de un cuerpo que ya no funciona como antes. Vivimos con la seguridad de que el cuerpo siempre responderá, hasta que un día deja de hacerlo. Este proyecto busca comprender la enfermedad no solo como un proceso médico, sino como una experiencia humana donde la vulnerabilidad del cuerpo revela el papel esencial del cuidado. Aquí se revela la necesidad de cuidar también a quienes cuidan, puesto que de su bienestar depende la estabilidad y sostenibilidad del cuidado en el tiempo. Con esto como punto de partida, surge un epistolario dirigido a cuidadores, concebido como un espacio que devuelve cuidado a quienes cuidan buscando fortalecer esta infraestructura que sostiene la vida en sus momentos más frágiles.Pregrad
Analysis of the Protein–Protein Interaction and the Potential Stabilizing Effect of XopAEXpm on MePATL3
No full textLa yuca (Manihot esculenta Crantz) es un cultivo de gran importancia socioeconómica afectado por la bacteriosis vascular conocida como Cassava Bacterial Blight (CBB), causada por Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm). Durante la infección, Xpm transloca efectores bacterianos mediante el sistema de secreción tipo III para interferir con los mecanismos de defensa de la planta. Entre estos efectores, XopAE ha sido asociado con la supresión de la inmunidad basal, aunque sus mecanismos moleculares no están completamente caracterizados.
Estudios previos identificaron a MePATL3, una proteína de la familia PATELLIN asociada a membranas y tráfico vesicular, como un posible interactor de XopAE. En este trabajo se confirmó y caracterizó la interacción proteína–proteína entre XopAE^Xpm y MePATL3 utilizando sistemas heterólogos de expresión. La interacción física fue validada mediante ensayos de captura por afinidad (pull-down) acoplados a análisis por inmunoblot. Adicionalmente, se evaluó la interacción intracelular mediante complementación bimolecular de fluorescencia (BiFC) en Nicotiana benthamiana; sin embargo, no se detectó señal, lo que podría deberse a limitaciones técnicas del sistema o a la dependencia de microdominios de membrana.
Finalmente, ensayos de abundancia proteica en líneas SALK1 de Arabidopsis thaliana complementadas con MePATL3 e infectadas con Pseudomonas fluorescens portadora de XopAE mostraron un aumento consistente de MePATL3 en presencia del efector, sugiriendo un posible efecto estabilizador. En conjunto, estos resultados aportan evidencia sobre el papel de XopAE en la manipulación de proteínas asociadas a la membrana durante la infección.Maestrí
Tercer sector: innovación en la gestión del voluntariado en organizaciones sin ánimo de lucro
No full textEste trabajo de grado explora cómo el diseño puede generar un impacto significativo en las organizaciones sin ánimo de lucro y en la experiencia de sus voluntarios, a partir de un enfoque de Diseño Centrado en el Ser Humano (HCD). A través de investigación secundaria y primaria, que incluyó entrevistas a líderes de organizaciones, observación en jornadas de voluntariado y el mapeo de la experiencia del voluntario, se evidenció la necesidad de innovar en un sector históricamente rezagado en términos de inversión, estructura y desarrollo de experiencias. El estudio identifica la importancia de diferenciar entre voluntarios fijos y voluntarios ocasionales, reconociendo que estos últimos responden a motivaciones, tiempos y expectativas distintas. Como respuesta, el proyecto propone el diseño de una plataforma digital que facilite la conexión entre organizaciones y voluntarios ocasionales, simplifique los procesos de vinculación y fortalezca la confianza. La propuesta plantea que innovar desde el diseño y reconocer estas diferencias es clave para ampliar la participación, reducir barreras de acceso y fortalecer el impacto social de las organizaciones sin ánimo de lucro.Pregrad
VitalMatch
No full textVitalMatch es una plataforma de orquestación clínica que estandariza y coordina, en un solo flujo auditable y seguro, procesos hospitalarios como triaje, interconsultas, UCI y altas, reduciendo la fragmentación de la información y el retrabajo documental que hoy consume tiempo clínico y genera errores; la plataforma asigna y enruta tareas por rol, dispara alertas en tiempo real para eventos y tiempos críticos, y mantiene trazabilidad completa de decisiones, responsables y estados del proceso, permitiendo medir KPIs operativos, como tiempos de respuesta, latencia de alertas, disminución de duplicidad de registros y facilitar la continuidad asistencial entre servicios, con un enfoque preparado para interoperar con ecosistemas hospitalarios y para operar bajo buenas prácticas de privacidad y control de acceso acordes con la Ley 1581/2012.Pregrad
Optimización de sistema de tuberías para la distribución de agua fría y caliente en un distrito térmico intramural.
No full textHoy en día nos encontramos en un contexto mundial en donde se buscan nuevas alternativas a implementar para disminuir el impacto en la producción de energía, dado que las fuentes de producción de energía con las que contamos actualmente tienen impactos negativos con el medio ambiente, Frente a este contexto mundial se ha aumentado el incentivo a utilizar distritos energéticos en las ciudades y zonas industriales. Un distrito energético consiste en la generación centralizada de frio, calor y/o energía eléctrica para ser suministrada a una o varias edificaciones, en este documento se establece un algoritmo de optimizacion por medio de una funcion objetivo planteada desde el concepto de resistencias termicas para una red de tuberias que suministra agua fria y caliente en un distrito termico intramural. Ademas, se compara el desempeño del algoritmo de optimizacion con relaciones de diseño empiricas propuestas en la literatura.Pregrad
Amilka
No full textEl proyecto Amilka surge como respuesta a una necesidad poco atendida en el campo de la salud materna: el dolor en las primeras semanas de lactancia, una de las principales causas de su abandono. A través de la metodología Biodesign, se desarrolló un kit preventivo y educativo compuesto por tres elementos: una crema exfoliante química que prepara el pezón durante el embarazo, un rodillo termoestable para masajes que alivian la congestión mamaria, y una aplicación móvil (AmilkApp) que guía a la madre con contenido educativo, recordatorios y seguimiento del tratamiento. El diseño del kit se basa en múltiples iteraciones validadas con madres y profesionales de la salud, destacando una solución accesible, intuitiva y segura. Las pruebas de concepto mostraron un alto interés por la crema y la app, y permitieron mejorar la ergonomía del rodillo. Si bien algunas pruebas requieren mayor duración para confirmar efectos a largo plazo, los resultados preliminares son prometedores. Se proyecta la implementación del kit mediante venta directa y en centros médicos, con integración digital al historial clínico de las pacientes. Amilka representa una propuesta innovadora y ética que promueve una experiencia de lactancia más informada, cómoda y acompañada.Pregrad
Habitantes de corteza y raíz
No full textEl TransMilenio es un escenario marcado por el caos y la prisa, donde los viajeros recorren la ciudad en piloto automático, repitiendo trayectos diarios con el único objetivo de llegar a su destino. El recorrido no tiene valor en sí mismo y muchas veces es llenado con distracciones que lo hagan más llevadero. Este proyecto encuentra una oportunidad para resignificar el “tiempo muerto” en los recorridos y darles un valor, transformándolos en una experiencia de descubrimiento del territorio a través de la observación consciente. Por medio de una narrativa ilustrada que revela información sobre distintos árboles que habitan la ciudad de Bogotá, se busca reconectar con el territorio de manera sensible, activando nuevas formas de percepción.Pregrad
Métodos de clustering basados en deep learning aplicados en el análisis biológico de la microbiota intestinal
No full textLa microbiota intestinal juega un papel crucial en la salud humana, aunque su complejidad y la alta dimensionalidad de la información que la describe dificultan su caracterización mediante métodos tradicionales. Por lo cual, la investigación se enfocó en implementar modelos de clustering basados en deep learning que explicaran esta diversidad microbiana según datos de personas provenientes de Colombia, buscando identificar factores determinantes que promuevan la investigación y desarrollo de tratamientos médicos. Utilizando un conjunto de datos de 441 individuos, se emplearon dos aproximaciones: mapas autoorganizados (SOM) para la visualización topológica de la información y sparse autoencoder (SAE) combinado con el algoritmo de agrupación por densidad OPTICS para la reducción de dimensionalidad y generación de clustering robusto, respectivamente. El modelo SAE + OPTICS identificó exitosamente siete clusters distintos con coeficiente de Silhouette de 0,756), desvelando biomarcadores específicos de menor abundancia, aunque de alta relevancia estructural (como Bilophila). Es así que el uso de deep learning es altamente eficaz para descifrar la estructura latente de la microbiota más allá de la abundancia por sí sola, proporcionando una base cuantitativa sólida para el diseño de diagnósticos de precisión y terapias nutricionales personalizadas.Pregrad
Orbital angular momentum of light towards implementation of high-dimensional quantum gates
No full textHigh-dimensional quantum computing has emerged as a recent alternative to conventional qubit-based approaches, offering advantages such as an increased information density and enhanced robustness against noise. In this work, we explore the use of the orbital angular momentum (OAM) of light as a degree of freedom in which high-dimensional quantum gates can be implemented. We present a theoretical and experimental study of structured light beams carrying OAM, with emphasis on Laguerre–Gauss modes, as a natural basis for high-dimensional quantum computing. We then describe the generation of OAM beams using computer-generated holograms and spatial light modulators, detailing practical methods for encoding arbitrary phase profiles. Building on this framework, we analyze the implementation of high-dimensional quantum logic gates, focusing on the generalized Pauli Z_d and X_d operations. Optical setups based on Dove prisms, Sagnac interferometers, spiral phase plates, and parity sorters are proposed and theoretically validated. Finally, we report experimental results demonstrating the generation of Laguerre–Gauss beams, the transformation properties of Dove prisms, and the operation of a parity sorter, which constitutes a building block for realizing high-dimensional quantum gates. These results establish a solid foundation for future implementations of high-dimensional quantum information processing using the orbital angular momentum of light.Pregrad