Universidad de Los Andes
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Machine learning-assisted discovery of cytochromes P450 putatively involved in the biosynthesis of Amaryllidaceae alkaloids in Crinum asiaticum
No full textAmaryllidaceae alkaloids (AAs) represent a valuable class of plant specialized metabolites with diverse pharmacological properties. However, the discovery of enzymes involved in AA biosynthesis through traditional methods demands labor-intensive screening and optimized growing conditions, and has been subjected to several drawbacks over time. Here, we introduce a Machine Learning-based approach that overcomes these challenges by predicting enzyme-substrate interactions based solely on amino acid sequences and molecular fingerprints. With this model, we identified cytochrome P450s from Crinum asiaticum that readily metabolize 4’-O-methylnorbelladine (4OMET), the key branch point in AA biosynthesis. This strategy bypasses the need for stringent alkaloid accumulation conditions and precise tissue sampling, streamlining candidate enzyme selection and functional characterization. Our method provides a high-throughput, cost-effective alternative for enzyme discovery, with significant applications in metabolic engineering and industrial biocatalysis for more efficient natural product biosynthesis.Maestrí
Genotipificacion del KADN para el seguimiento de poblaciones persistentes de Leishmania
No full textEl objetivo del proyecto es implementar técnicas de genotipificación del kADN de Leishmania mediante PCR anidada para evaluar la selección de subpoblaciones del parásito. Este estudio busca contribuir a la comprensión de los mecanismos de persistencia intracelular de Leishmania, apoyando la identificación de estrategias terapéuticas más efectivas y mejorando el monitoreo a largo plazo de la leishmaniasis.PregradoParasitologí
El vuelo de la Mariposa
No full textLa propuesta: Bajo la idea construida de borde como transición dinámica (De- espacio, o también tiempo y movimiento, así como su cualidad de ser activa y propulsora) surge la idea de proceder desde North Point hacia la mariposa y viceversa. La creación de borde por medio de la ruptura del límite genera que este proyecto corte por medio de North Point, llegando hasta la montaña para horadarla y generar la huella sobre el suelo que se convertirá en el camino del cual surgirá el acontecimiento, llegando finalmente hasta el parque de la mariposa. En estos “acontecimientos” se dará la actividad que es el elemento dinámico que impulsa el movimiento y el proceder desde y hacia la mariposa y/o North Point. Asimismo, los acontecimientos se convierten en el espacio para pausar y mirar hacia la ciudad. Estos enmarcan a la ciudad y, por medio de esta acción, la traen al presente, haciéndola propia. La acción de enmarcar aquella ciudad que North Point oculta detrás de sí posando la mirada en otras partes, es lo que permite develar aquello que se encuentra oculto detrás de ese gran muro. Por otra parte, el camino enmarca y resalta la monumentalidad tanto de la montaña, así como de North Point, guiando a su vez la mirada que recorre el espacio como una cámara cinematográfica. Al estilo de Le Corbusier, quien utilizó el recurso del storyboard proveniente del cine para la creación de un promenade (recorrido arquitectónico), es que se pensó esta propuesta. No obstante, se toman también los elementos atmosféricos de la casa Can Lis como punto para crear las distintas atmósferas que generan distintos espacios y sensaciones a lo largo del recorrido. Esta composición de la propuesta, casi de manera cinematográfica y atmosférica del recorrido, es la que deriva en ese impulso activo y propulsor que invita a seguir recorriendo el camino.Pregrad
Practica de investigación en el Museo de Historia Natural Marina de Colombia-MAKURIWA del Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras “José Benito Vives de Andréis”
No full textLa práctica profesional la realice en el Museo de Historia Natural Marina de Colombia –MAKURIWA(MHNMC), parte del Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras "José Benito Vives de Andréis" (INVEMAR). Esta consistió en una inmersión al trabajo investigativo de un museo de historia natural, incluyendo la curaduría de colecciones biológicas, el tratamiento de tejidos para su delimitación molecular y en actividades relacionadas con la apropiación social del conocimiento. En donde como resultado principal se generaron secuencias genéticas de especímenes de colección asociados a ecosistemas marino-costeros del Pacifico Norte Colombiano una región poco estudiada, permitiendo así el fortalecimiento de los inventarios de biodiversidad de esta zona.Pregrad
Análisis no lineal estructura con sistema estructural muros de muros de carga
No full textEl presente trabajo contiene la información técnica para el diseño de una edificación con sistema estructural en muros de carga según los requerimientos del ACI 318-19. Asimismo, en este documento se realizó un análisis no lineal estático y un análisis cronológico no lineal considerando los efectos no lineales de las estructuras tales como no linealidad de los materiales, efecto P-delta y flexibilidad de la cimentación. Después de ejecutar estos análisis, se realizan comentarios sobre posibles modificaciones que se pueden implementar al diseño. Finalmente, se estima un costo directo de materiales y mano de obra para tener un valor por metro cuadrado el cual se pueda comparar con otros tipos de sistemas estructurales.El presente trabajo contiene la información técnica para el diseño de una edificación con sistema estructural en muros de carga según los requerimientos del ACI 318-19. Asimismo, en este documento se realizó un análisis no lineal estático y un análisis cronológico no lineal considerando los efectos no lineales de las estructuras tales como no linealidad de los materiales, efecto P-delta y flexibilidad de la cimentación. Después de ejecutar estos análisis, se realizan comentarios sobre posibles modificaciones que se pueden implementar al diseño. Finalmente, se estima un costo directo de materiales y mano de obra para tener un valor por metro cuadrado el cual se pueda comparar con otros tipos de sistemas estructurales.Maestrí
Quantum Gravitational Effects on Curved Spacetimes
No full textEn este trabajo estudiamos el proceso de cuantizacion de campos escalares en diferentes espacios-tiempos curvos. Fue posible observar las diferencias con el caso de la métrica de Minkowski, en particular, como la ausencia de simetrías lleva a la no unicidad del vacío. De esta forma, no existe una definición natural de partícula. Usando esto, mostramos el efecto Unruh mediante la cuantizacion de una campo escalar en un observador acelerado y notamos la existencia de un baño térmico debido a su aceleración. Mas aun, usamos el efecto Unruh para encontrar la temperatura de un agujero negro y describimos el proceso mediante el cual este puede producir pares de partícula-anti partícula cuando el campo gravitacional es lo suficientemente fuerte.In this work we studied the quantization process of scalar fields in different curved space-times. We observed the differences with the Minkowski metric, specifically, how the absence of symmetries leads to the non-uniqueness of the vacuum. Thus, there is no natural definition of a particle. Using this, we showed the Unruh effect by quantizing a scalar field in an accelerated observer and noted the existence of a heat bath due to its acceleration. Furthermore, we used the Unruh effect to find the temperature of a black hole and described the process by which it can produce particle-anti-particle pairs when the gravitational field is strong enough.Pregrad
Clasificación de ciberataques, fallas y eventos de operación normal en subestaciones digitales utilizando el protocolo GOOSE a partir de redes LSTM
No full textEste proyecto presenta el diseño e implementación de un modelo de clasificación basado en redes neuronales Long Short-Term Memory (LSTM) para la identificación de eventos en subestaciones digitales. El trabajo se enfoca en tres tipos principales de eventos: operaciones normales, fallas eléctricas y ciberataques, utilizando información contenida en mensajes GOOSE bajo el estándar IEC 61850. A partir de un dataset sintético, se procesaron características clave como las corrientes, el número de estado (stNum) y el número de secuencia (sqNum). Además, se implementó una estrategia de selección de ventana temporal para reducir el ruido en los datos, maximizando la relevancia de las características utilizadas en el modelo. El conjunto de datos fue dividido en un 80\% para entrenamiento y un 20\% para validación, asegurando una distribución representativa de las clases. El modelo LSTM mostró un desempeño sobresaliente, alcanzando una precisión del 100% en el conjunto de validación. Este resultado fue corroborado por la matriz de confusión, que evidenció una clasificación perfecta en todas las categorías. Además, se observó una mejora consistente en las métricas de pérdida durante el entrenamiento y validación, demostrando la capacidad del modelo para generalizar. En comparación con enfoques basados en redes convolucionales (CNN) y transformada wavelet continua (CWT), el modelo LSTM destaca por su habilidad para capturar dependencias temporales en secuencias largas, eliminando la necesidad de preprocesamiento intensivo y mejorando la robustez en escenarios complejos. Estos hallazgos contribuyen a la confiabilidad y ciberseguridad de subestaciones digitales, sentando las bases para su aplicación en entornos reales y exploración futura en escenarios más variados.Pregrad
Medición integral de productividad agrícola en sistemas socioecológicos
No full textLas métricas tradicionales de productividad agrícola suelen centrarse en maximizar el rendimiento físico sin tener en cuenta las externalidades ambientales negativas, lo cual resulta en prácticas que muchas veces comprometen la sostenibilidad a largo plazo del sistema. En este trabajo se propone un enfoque integral que combina variables ecológicas y socioeconómicas, utilizando herramientas tanto teóricas como prácticas para evaluar la productividad desde una perspectiva socioecológica. A diferencia de estudios previos, incorpora elementos como la configuración de los cultivos, la asociatividad y la gestión de recursos, lo cual permite una comprensión más completa de cómo las dinámicas socioecológicas influyen en los sistemas agrícolas. La metodología incluye el análisis multivariado de características de dichos sistemas, para la posterior construcción y aplicación de un indicador de productividad socioecológica (IPS) que premia las prácticas más sostenibles y penaliza aquellas que afectan negativamente al ecosistema. Asimismo, se evaluó la relación entre la métrica convencional de productividad y el IPS respecto a la integridad ecológica del paisaje (IEP), con el fin de demostrar empíricamente que la inclusión de una medición más amplia permite priorizar decisiones en las que se equilibra de forma más acertada la tensión entre la productividad y la sostenibilidad. Los resultados muestran que mientras que la productividad convencional está correlacionada con una mayor disminución de la IEP, el IPS presenta una relación menos negativa. El estudio concluye que una medición integrada de productividad, como puede ser el IPS, puede ser útil en la formulación de políticas que reconozcan la interdependencia entre sostenibilidad y rendimiento sin comprometer el entorno ecológico.Maestrí
Taking Care of those who take Care of Us: What if a Manzana del Cuidado Was Just Around the Corner?
No full textCódigos JEL.: D13, J16, J22, H41The study of the effect of integrative care policies—as those that target the needs of caregivers and multiple care recipients—on time allocation for both women and men, is an empirical exercise not widely covered in the existing Care Economy literature, specially in diverse developing settings. I focus on the impact of the District Care System implemented by Bogot´a’s local government in 2020 through the study of Manzanas del Cuidado (MCs), as they offer well-being and human capital formation services to unpaid caregivers. For the period between 2019 and 2021, I estimate the Intention to treat (ITT) effect on time allocation in paid and unpaid labor, as well as labor market outcomes for women and men using an Event Study approach. Results indicate that women do not change their patterns of unpaid and paid time use, and while men exhibit a reduction in time allocated to paid work, estimates do not remain robust across various specifications, and identification issues may arise, limiting a conclusive causal interpretation attributable to the program. Labor market participation do not change for both women and men. Mechanisms such as the rigidity of gender social norms, the frequency of service usage, and methodological constraints may help unravel the reasons behind the observed effects.El estudio del efecto de las políticas de cuidado integrales—como aquellas que atienden las necesidades tanto de cuidadora(e)s como de múltiples poblaciones receptoras de cuidado—sobre la distribución del tiempo por parte de mujeres y hombres, es un ejercicio empírico poco explorado en la literatura existente sobre Economía del Cuidado, especialmente en contextos diversos de desarrollo. Este estudio se centra en el impacto del Sistema Distrital de Cuidado implementado por la alcaldía de Bogotá en 2020 a través del análisis de las Manzanas del Cuidado (MCs), que ofrecen servicios de bienestar a cuidadora(e)s no remunerada(o)s. Para el período comprendido entre 2019 y 2021, se estima el efecto asociado a la Intención del tratamiento (ITT por sus siglas en inglés) sobre la asignación de tiempo a trabajo remunerado y no remunerado, y sobre los resultados laborales para mujeres y hombres empleando un enfoque de diferencias-en-diferencias con tratamiento escalonado. Los resultados indican que las mujeres no modifican sus patrones de uso del tiempo, y aunque los hombres presentan una reducción en el tiempo destinado al trabajo pago, las estimaciones no se mantienen robustas a diversas especificaciones y pueden surgir problemas de identificación; lo que limita una interpretación causal concluyente atribuible al programa. La participación en el mercado laboral no cambia para mujeres ni para hombres. Mecanismos como normas sociales de género rígidas, frecuencia de uso de servicios y limitaciones metodológicas pueden ayudar a explicar los efectos observados
Hard Discount to Food Insecurity? Ara, D1 and Justo & Bueno en Bogotá
No full textTesis de Maestría en Economía (PEG)En Bogotá cerca de 1,8 millones personas enfrentan algún grado de inseguridad alimentaria. La ciudad también es escenario de un acentuado crecimiento de las Tiendas de Descuento Duro (TDD), que buscan ofrecer precios bajos y una mayor cercanía a los hogares. A partir de rastrear la ubicación y la fecha de apertura de las tiendas junto con la información de la Encuesta Multipropósito de Bogotá, en este artículo se estudia el efecto que ha tenido la expansión de estos negocios sobre la inseguridad alimentaria a partir de un modelo de Diferencias en Diferencias usando los sectores catastrales como unidades de tratamiento. Los resultados sugieren que la entrada de una tienda incrementa el gasto en alimentos en 4,4 puntos porcentuales y reduce la participación de los alimentos en el gasto total en 1 punto porcentual. La evidencia sugiere que las TDD al disminuir los precios (efecto directo) y reducir los costos de desplazamiento y aumentar la competencia en los canales de comercialización (efecto indirecto) mejoran el acceso a los alimentos de los hogares bogotanos.In Bogota, nearly 1.8 million people face some degree of food insecurity. The city is also the scene of big growth in Hard Discount Stores (HDS), which seek to offer low prices and greater proximity to homes. By tracking the location and opening date of the stores along with data from the Bogotá Multipurpose Survey, this paper studies the effect that the expansion of these businesses has had on food insecurity based on a Difference-in-Differences model using cadastral sectors as treatment units. The results suggest that the entry of a store increases the food expenditure by 4,4 percentage points and reduces the share of food in total expenditure by 1 percentage point. The evidence suggests that HDS by lowering prices (direct effect) and reducing travel costs and increasing competition in commercialization channels (indirect effect) improve food access for households in Bogota.Maestrí