Universidad de Los Andes
Repositorio institucional Séneca Universidad de los Andes (Colombia)Not a member yet
38709 research outputs found
Sort by
Relevancia probiótica de Ruminococcus flavefaciens RF y Pseudobutyrivibrio sp. B9: arsenal ultraestructural y capacidad enzimática
No full textEl rumen es un ecosistema microbiano clave para la digestión de fibras vegetales, con microorganismos que desempeñan funciones cruciales en la degradación de polisacáridos. Este trabajo se centró en la caracterización ultraestructural y metabólica de Ruminococcus flavefaciens RF y Pseudobutyrivibrio sp. B9, cepas anaeróbicas asociadas al probiótico Rumitec® desarrollado por AGROSAVIA. Mediante microscopía electrónica de transmisión, se identificaron estructuras como el glicocálix en R. flavefaciens y un posible flagelo en Pseudobutyrivibrio sp. B9, relacionadas con la adherencia y movilidad. Además, se evaluó la producción de ácidos grasos volátiles en medios específicos, destacando la formación predominante de ácido acético en ambas cepas, y se comprobó la actividad celulolítica de R. flavefaciens RF mediante ensayos enzimáticos semicuantitativos. Los resultados resaltan el potencial probiótico y biotecnológico de estas bacterias para la mejora de la salud y productividad del ganado.Pregrad
Estimation of the Wigner function of a quantum state via symplectic transformations
No full textThe Wigner distribution function (WDF) is a quasi-probability distribution that provides a phase-space representation of quantum states. It offers insights into the state dynamics and contains statistical information of it, such as the marginal probabilities. This thesis investigates a protocol for estimating the WDF of quantum states using symplectic transformations, which are linear canonical transformations that preserve phase-space structure and can be implemented experimentally using the technique of Gaussian optics. These transformations are studied because the time evolution of the WDF can be described by means of these transformations in cases where the Hamiltonian is a second-order (quadratic) polynomial in the phase-space variables.
Furthermore, it was found that the Fourier transform of the marginal probability (measured at the laboratory) is related to the characteristic function (Fourier transform of the Wigner function). This relationship is given by Equation 2.46, which states that, with each intensity data obtained by applying a given symplectic transformation, the value of the characteristic function (Fourier transform of the WDF) at a given point of the phase space can be obtained.
Based on this, an optical setup was implemented to perform symplectic transformations, such as free-space propagation and passing through a lens. The study focuses on the WDF of a one-dimensional electric field of two Gaussian beams, separated by a distance 2d, where d = 1.388 ± 0.004mm. The two beams are passed through the transformation system (propagation-lens-propagation) and then the marginal probability (intensity) is measured with a CCD camera. After this, the Fourier transform was computationally applied to the intensity data and compared with the theoretical plots of the characteristic function (Equation 2.2). In doing so, it was found that it is necessary to multiply the data obtained by an additional scaling factor to improve them to better fit the theoretical results. Finally, the protocol to be followed to reconstruct the Wigner function of this state with the obtained data was described.Pregrad
Identification of an interaction between diguanylate cyclase CdgB and a putative interacting partner (PIP) in Streptomyces
No full textStreptomyces is a group of filamentous bacteria, best known to produce diverse clinically important antibiotics. This group has a complex life cycle regulated by 3’-5’-cyclic diguanylic acid (c-diGMP). C-di-GMP is synthesized by enzymes called diguanylate cyclases (DGCs), and there are multiple genes that encode these enzymes. However, its function in regulating the life cycle is not completely clear. The deletion of the diguanylate cyclase-encoding gene, cdgB, affects the phenotype of the model species Streptomyces venezuelae, indicating its regulatory role in the organism's life cycle. In this internship, I was part of the Gallagher lab, and we aimed to implement the Bacterial Adenylate Cyclase two-hybrid system (BACTH) to determine possible candidates for protein-protein interaction with CdgB. The samples that showed positive interactions revealed alignment with various genes. A putative interacting partner (PIP) was screened directly through BACTH system, but the initial results were inconclusive.Pregrad
Therapeutic challenge against a highly variable microorganism: Effect of bacteriophage FSA6 combined with oxacillin against β-lactam-resistant Staphylococcus aureus
No full textStaphylococcus aureus es un patógeno conocido por su amplia resistencia a antibióticos β-lactámicos, como en el caso del SARM (S. aureus resistente a la meticilina), resistencia mediada por la proteína PBP2a, codificada por los genes mecA y mecC. No obstante, se han identificado aislamientos de S. aureus resistentes a β-lactámicos que carecen de estos genes (MRLM, por sus siglas en inglés), cuya resistencia se debe a mutaciones en los genes pbp1-4, blaZ, gdpP y/o acrB. Esto hace que se dificulte el diagnóstico molecular de S. aureus resistente a β – lactámicos, así como su abordaje terapéutico. Ante este desafío, los bacteriófagos ofrecen una alternativa terapéutica prometedora. El tratamiento combinado con bacteriófagos y antibióticos en concentraciones subinhibitorias ha mostrado potencial para debilitar la pared celular y reducir la proliferación de variantes resistentes, tanto a los antibióticos como a los fagos. Este estudio investiga el efecto del bacteriófago FSA6 en combinación con concentraciones subinhibitorias de oxacilina sobre aislamientos SARM, sensibles a meticilina (SASM) y resistentes a β – lactámicos sin genes mec (MRLM). Esta combinación tiene el potencial de generar un efecto sinérgico en la reducción bacteriana , mejorando el control de las infecciones resistentes, promoviendo tratamientos más efectivos y específicos.Maestrí
La alquimia del alma: iniciación y gnosticismo en Fernando Pessoa
No full textLa tesis se centra en la obra de Fernando Pessoa, particularmente en su interés por el esoterismo occidental y el concepto de iniciación. A lo largo de su vida, Pessoa exploró temas relacionados con el conocimiento oculto, especialmente en sus últimos años (1930-1935).
El estudio de la obra esotérica de Pessoa ha sido considerado marginal, la tesis busca reivindicar esta faceta de su obra, utilizando textos esotéricos Pessoanos custodiados por la Biblioteca Nacional de Portugal, muchos de los cuales permanecen inéditos.
El interés de Pessoa por el ocultismo es notable; no solo por sus escritos sino también por sus lecturas de obras de figuras del esoterismo de su época como Aleister Crowley y Arthur Edward Waite que se constituyen como piezas de una constelación de ideas sobre la iniciación. Este concepto de iniciación se presenta como un proceso transformativo que permite al individuo acceder a nuevas dimensiones de conocimiento y experiencia, y en el caso de Pessoa, además, permite explorar su producción literaria como parte de su camino iniciático, contribuyendo a una comprensión más profunda de su legado en el esoterismo occidental.Doctorad
Paravertebral muscle segmentation for body composition analysis in CT scans
No full textIn this study, deep learning techniques, specifically U-Net-based architectures, are used to automate the segmentation of paraspinal muscles in CT scans. This undergraduate research thesis aims to strengthen segmentation accuracy and improve body composition analysis (BCA) precision. Several models are evaluated, including U-Net, U-Net++, AttU-Net, TransUNet, UNETR, and SwinUNETR to compare their performance under a transfer learning approach on the CAVAAT dataset.
The models are evaluated using performance metrics such as the Dice Similarity Coefficient (DSC) and Hausdorff Distance (HD). In addition, SAM (Segment Anything Model) is tested for its adaptability to medical imaging tasks, providing insights into its accuracy and potential applications in scenarios with limited annotations. \href{https://github.com/Lina-go/PMSegmentation.git}{Github Repository} has models, data, and code.Pregrad
Detección de Leishmania “Point of care”: descentralizando el diagnóstico molecular
No full textLas leishmaniasis son enfermedades tropicales desatendidas causadas por parásitos protozoarios del género Leishmania que han sido reportadas en diferentes regiones del mundo entre las que se encuentran Centroamérica, América del Sur, Europa y Asia sur oriental. Colombia es el tercer país con más especies de Leishmania que infectan a los seres humanos, siendo la leishmaniasis cutánea la afección más común en el territorio. Existen diferentes alternativas para el diagnóstico de esta infección entre las que se incluyen técnicas convencionales de detección molecular como la PCR que representa ventaja sobre otras alternativas como exámenes directos y pruebas inmunológicas debido a su alta precisión. Sin embargo, esta requiere de equipos costosos y especializados, lo que limita su uso en zonas rurales de difícil acceso donde existe prevalencia de leishmaniasis. Con el objetivo de reducir los costos por reacción y mejorar la portabilidad de los métodos de diagnóstico molecular, se estandarizó un protocolo de detección de material genético de Leishmania basado en la técnica de amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP) con el uso de una Bst-LF homemade junto a una extracción cruda de ADN. Los resultados principales indican que la extracción cruda permitió obtener una mayor cantidad de ADN que el kit comercial basado en columnas con el que se comparó. Además, se observó que la mastermix homemade funciona tiempos comparables a los de la mastermix Warmstart que es utilizada como Gold standard en LAMP y se concluyó que la estandarización realizada representa una alternativa accesible y eficiente para el diagnóstico de Leishmania en áreas rurales.Pregrad
Análisis técnico y socioeconómico para la planificación de proyectos agrofotovoltaicos en microrredes ubicados en zonas no interconectadas de Colombia
No full textEl documento presenta un análisis técnico y socioeconómico para la planificación de proyectos agrofotovoltaicos en microrredes ubicadas en zonas no interconectadas (ZNI) de Colombia. Se fundamenta en la necesidad de diversificar la matriz energética del país y mejorar el acceso a electricidad en comunidades rurales mediante el uso de energías renovables. La metodología aborda la caracterización del territorio, selección de comunidades, diseño y simulación de microrredes, y evaluación de factibilidad. Se priorizan 22 comunidades a través del método VIKOR, considerando indicadores técnicos, económicos y sociales. Los resultados muestran que las microrredes con sistemas agrofotovoltaicos pueden garantizar más del 90% de disponibilidad del servicio y reducir costos operativos en comparación con los sistemas diésel convencionales. Además, la combinación de generación solar con cultivos agrícolas optimiza el uso del suelo y mejora la seguridad alimentaria. Sin embargo, se identifican desafíos como costos iniciales elevados, barreras regulatorias y variabilidad en los precios del diésel. Se concluye que la implementación de estos sistemas es viable en ciertas comunidades, destacándose la importancia de un enfoque adaptado a las condiciones locales y la inclusión de otras tecnologías renovables complementarias.Pregrad
Análisis de riesgo en tiempo real de redes de comunicaciones interdependientes al sistema eléctrico
No full textEste trabajo de grado presenta el diseño e implementación de un simulador avanzado para sistemas eléctricos de potencia, capaz de evaluar el impacto de fallas mediante indicadores de consecuencia, probabilidad de falla y riesgo. El simulador integra un modelo dinámico de red de comunicaciones, lo que permite analizar la interacción entre los sistemas eléctricos y cibernéticos, optimizando la resiliencia ante fallas en cascada y ataques dirigidos. Se realizaron simulaciones utilizando los casos IEEE de 14, 39 y 118 buses, validando los resultados mediante comparaciones con estudios previos. Además, se desarrollaron representaciones gráficas en 3D y animaciones dinámicas para visualizar los impactos y el funcionamiento del protocolo de comunicaciones. Este enfoque proporciona una herramienta robusta para el análisis crítico de redes eléctricas, contribuyendo a mejorar la planificación y operación de sistemas resilientes.Pregrad
Farmacogenómica poblacional de VKORC1 en Colombia
No full textLa farmacogenómica es esencial en los procesos de medicina personalizada, pues permite ajustar los tratamientos médicos según la genética de cada individuo; optimizando así su eficacia y reduciendo los efectos adversos. En Colombia, donde la población presenta un alto grado de mestizaje entre las ancestrías Africana, Americana y Europea, la variabilidad genética juega un papel clave en la respuesta de los medicamentos como la Warfarina. En particular, su metabolismo está regulado por el gen VKORC1; en donde el SNP rs9923231influye significativamente en la dosis requerida. Para entender más está interacción, en el estudio se analizaron 873 individuos del consorció CÓDIGO-Colombia, evaluando la distribución del SNP rs9923231 en función de la ancestría genética. Para ello, se realizaron diversas pruebas estadísticas, incluyendo en principio de Hardy-Weinberg, ANOVA de Welch, una regresión logística y clustering k-means; con el objetivo de identificar patrones poblacionales y asociaciones significativas. Como resultado, se encontró que el genotipo CC es predominante en individuos con una mayor proporción de ancestría africana; mientras que el CT y TT es mucho más común en individuos con ancestrías europeas y africanas. Adicionalmente, se observó que ciertas poblaciones, como ATQCES y CHG, no cumplen con el equilibrio de Hardy-Weinberg: esto sugiere la presencia de influencias evolutivas, presión de selección o factores poblacionales específicos que terminarían afectando la distribución de los genotipos. En conclusión, a partir de los hallazgos encontrados se resalta la importancia de incorporar la genética poblacional en la dosificación de la Warfarina; ya que considerad la ancestría en los tratamientos anticoagulantes podría mejorar la seguridad y la eficacia de la terapia para poblaciones con un alto nivel de mestizaje, reduciendo el riesgo de sobredosificación y promoviendo un enfoque más preciso en la medicina personalizada.Pregrad