Universidad de Los Andes
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Desarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR
Un transposón o elemento transponible es una secuencia de ADN que puede moverse de manera autosuficiente a diferentes ubicaciones del genoma de una célula. Los transposones se subdividen, entre otras clases, en retrotransposones LTR, los cuales se mueven mediante la acción de intermediarios de ARN. El objetivo principal de este proyecto es el desarrollo de un método para la identificación de transposones LTR. Para este fin, se desarrolló una herramienta que recibe secuencias de ADN de posibles retrotransposones LTR e identifica sus dominios y su superfamilia correspondientes. Se utilizaron modelos ocultos de markov para la identificación de los dominios y posterior clasificación por superfamilia. Los resultados muestran un alto grado de precisión en la identificación de los dominios para los retrotransposones LTR , así como una alta precisión de predicción para la superfamilia Gypsy. La herramienta desarrollada demuestra su utilidad en la identificación precisa de retrotransposones LTR y su clasificación, por medio de sus características biológicas, contribuyendo significativamente al análisis genómico.Pregrad
Viabilidad para el monitoreo de la integridad con fibra optica de pozo de disposicion de agua, Campo Platanito, Cuenca del Amazonas
Con el desarrollo del presente documento se pretende realizar un análisis integral para determinar la viabilidad del evaluar la integridad de un pozo de disposición de agua mediante la implementacion de la tecnología con fibra óptica y su monitoreo remoto mediante telemetria para la interpretación y análisis de los datos en un tiempo corto. Mediante la aplicación de metodologias cuantitativas; basadas en la evaluación comparativa con métodos de monitoreo convencionales desarrollados en la industria, análisis de probabilidad y estadística en función de eventos ocurridos, se formuló y desarrollo el
proyecto.El desarrollo de proyectos en la industria del petróleo, presentan uno de los mas altos riesgos, no sólo para el personal que realiza las actividades, sino para el medio ambiente, activos entre otros, de ahí la importancia que tiene el garantizar la integridad de pozos mediante la aplicación de soluciones orientadas a la reducción de riesgos durante todo el ciclo de vida de un pozo. La integridad de pozos es la capacidad de operar bajo condiciones controladas sin riesgo de accidentes, derrames de hidrocarburos, descontrol de pozos, pérdidas económicas, perdida de la contencion de fluidos a formaciones o superficies subterráneas, que para el presente documento seria nuestro caso principal de estudio. Con el desarrollo del presente documento se pretende realizar un análisis integral para determinar la viabilidad del evaluar la integridad de un pozo de disposición de agua mediante
la implementacion de la tecnología con fibra óptica y su monitoreo remoto mediante telemetria para la interpretación y analisis de los datos en un tiempo corto. Mediante la aplicación de metodologías cuantitativas; basadas en la evaluacion comparativa con métodos de monitoreo convencionales desarrollados en la industria, análisis de probabilidad y estadistica en funcion de eventos ocurridos, se formuló y desarrollo el proyecto.
El propósito del presente estudio es contribuir en la mitigación de los impactos ambientales, económicos y de afectación social que pueden generar los riesgos asociados a perdida de integridad de un pozo de disposición de agua; mediante la implementacion de nuevas tecnologías como la fibra óptica, automatización de procesos y telemetria para la transmisión de datos.Maestrí
Manufactura y caracterización de cinética de liberación de microcapsulas de hueso bovino
El aumento de la resistencia a los antibióticos ha puesto de manifiesto la necesidad de sistemas de liberación de fármacos que sean tanto dirigidos como eficientes. Este estudio explora el uso de hueso bovino como material biocompatible para la fabricación de microcápsulas cargadas con antibióticos, diseñadas para la liberación localizada del fármaco en entornos infecciosos. Se produjeron microcápsulas con diámetros externos entre 0.5 y 0.8 mm y grosores de pared variables mediante técnicas de micromecanizado. La vancomicina fue seleccionada como el antibiótico utilizado debido a su amplio uso contra bacterias. El desempeño funcional de las cápsulas fue evaluado in vitro mediante pruebas de difusión en agar con Pseudomonas aeruginosa. Se utilizaron halos de inhibición como indicador de la liberación del antibiótico. Solo las cápsulas con un diámetro externo de 0.8 mm mostraron actividad antibacteriana medible contra Pseudomonas aeruginosa. Los hallazgos proporcionan evidencia preliminar que respalda el uso de microcápsulas de hueso bovino como vehículos funcionales para la liberación de antibióticos. Los resultados destacan la relevancia de la geometría de las cápsulas en la influencia sobre la liberación del fármaco y la interacción bacteriana.Pregrad
Fortalecimiento del análisis literario mediante el uso de fuentes históricas con estudiantes de grado séptimo: Sistematización de una experiencia pedagógica
Esta disertación sistematiza una experiencia pedagógica para el fortalecimiento del análisis literario en la escuela. Dicha estrategia consistió en proponer diversas prácticas para desarrollar herramientas de lectura literal, inferencial y crítica, así como ejercicios de análisis intertextual que vincularon la literatura con las fuentes históricas. Este proyecto fue planeado, ejecutado y evaluado con estudiantes de grado séptimo de un colegio privado en la localidad de Usme, al sur de Bogotá, entre julio y septiembre de 2024. Hay que decir, además, que el eje temático de la experiencia pedagógica fue una novela juvenil colombiana que aborda el secuestro como práctica de guerra en el marco del conflicto armado en Colombia. La literatura, las fuentes históricas y los demás fundamentos teóricos y metodológicos leídos y analizados se enfocaron en el fortalecimiento del análisis crítico de la literatura, la utilidad del uso de fuentes históricas, el tratamiento educativo del conflicto armado colombiano a través de la ficción literaria y la formación del pensamiento crítico, reflexivo y sensible en el contexto escolar actual.This dissertation systematizes a pedagogical experience for the strengthening of literary analysis in school. This strategy consisted of proposing various practices to develop literal, inferential and critical reading tools, as well as intertextual analysis exercises that linked literature with historical sources. This project was planned, executed and evaluated with seventh grade students from a private school in the town of Usme, south of Bogotá, between July and September 2024. It must also be said that the thematic axis of the pedagogical experience was a Colombian youth novel that addresses kidnapping as a war practice in the framework of the armed conflict in Colombia. The literature, historical sources and other theoretical and methodological foundations read and analyzed focused on strengthening the critical analysis of literature, the usefulness of using historical sources, the educational treatment of the Colombian armed conflict through literary fiction and the formation of critical, reflective and sensitive thinking in the current school context.Maestrí
Evaluación del comportamiento sísmico mediante análisis no lineal de un puente vehicular
Este documento presenta la elaboración de un análisis estático no lineal y un análisis dinámico ni lineal para un puente vehicular de tipología vano a vano de losa aligerada de canto constante que está compuesto por 7 vanos con una longitud total de 151 metros. El puente analizado se ubica en zona de amenaza sísmica alta, específicamente en la ciudad de Neiva, departamento del Huila. Para la correcta ejecución del análisis no lineal, se siguieron las recomendaciones establecidas en normativas y guías de diseño, como AASHTO, CALTRANS y diversas guías especializadas en análisis no lineal.
En esta investigación se realizó un primer análisis estático incremental, conocido como push-over, considerando tres escenarios de estudio. En el primer escenario, se analizó la estructura contemplando únicamente la no linealidad del material mientras que, en el segundo, se incluyó además la no linealidad geométrica. Finalmente, en el tercer escenario se incorporó la flexibilidad de la cimentación, sumada a los efectos no lineales previamente considerados. Esto con el fin de poder evaluar la capacidad y el correcto desempeño del puente frente a un evento sísmico. Para el análisis cronológico se llevó a cabo una desagregación sísmica que permita determinar la contribución de las fuentes sísmicas en la zona del proyecto. Con esta información, se seleccionaron las señales que siguen el comportamiento del espectro de diseño y se evaluó el comportamiento de la estructura ante estos eventos.Maestrí
Optimización de la asignación de horarios académicos en bachillerato: un enfoque de programación lineal entera para la satisfacción estudiantil y la gestión de electivas
Esta tesis presenta una herramienta de apoyo a la decisión para la generación automática de horarios académicos en escuelas secundarias, dirigida específicamente a los grados sexto a octavo. La solución propuesta modela el problema de asignación de horarios escolares como una formulación de Programación Lineal Entera (PLE), con el objetivo de maximizar la satisfacción estudiantil en la asignación de cursos electivos mientras se cumplen todas las restricciones académicas y operativas. El modelo incorpora tanto restricciones duras (por ejemplo, disponibilidad de docentes, tamaños de clase, requisitos curriculares) como restricciones blandas (por ejemplo, preferencias de los estudiantes, agrupamiento entre pares) y fue implementado en Python utilizando el optimizador Gurobi. El sistema fue probado utilizando datos reales de un colegio en Bogotá, Colombia, y su desempeño fue evaluado bajo diferentes escenarios. Los resultados demuestran que el algoritmo produjo horarios factibles únicamente cuando el problema se descompuso en subproblemas más pequeños, es decir, resolviendo cada grado escolar de manera independiente. Sin embargo, al intentar resolver el problema a gran escala —incluyendo simultáneamente los tres grados—, el algoritmo no logró generar una solución factible, lo que evidencia limitaciones de escalabilidad en instancias grandes y altamente restringidas. Este trabajo contribuye al campo de la planificación educativa automatizada al ofrecer un enfoque riguroso, adaptable y sensible a las preferencias para la asignación de horarios, y proporciona pautas de implementación para las escuelas que buscan modernizar sus procesos de programación.This thesis presents a decision-support tool for the automatic generation of academic schedules in secondary schools, specifically targeting grades 6 through 8. The proposed solution models the school timetabling problem as an Integer Linear Programming (ILP) formulation, aiming to maximize student satisfaction in the assignment of elective courses while fulfilling all academic and operational constraints. The model incorporates both hard constraints (e.g., teacher availability, class sizes, curriculum requirements) and soft constraints (e.g., student preferences, peer grouping), and was implemented using Python with the Gurobi solver. The system was tested using real data from a school in Bogotá, Colombia, and its performance evaluated under different scenarios. Results demonstrate that the algorithm effectively produced feasible schedules only when the problem was decomposed into smaller subproblems, i.e., by solving each school grade independently. However, when attempting to solve the full-scale problem—including all three grades simultaneously—the algorithm failed to generate a feasible solution, highlighting scalability limitations in large, highly constrained instances. This work contributes to the field of automated educational planning by offering a rigorous, adaptable, and preference-sensitive approach to scheduling, and provides implementation guidelines for schools aiming to modernize their scheduling processes.Maestrí
Desigualdades sociales y letalidad por dengue en Colombia (2019–2023): un análisis territorial y multivariado
Este estudio analiza la influencia de los determinantes sociales de la salud en la letalidad por dengue en Colombia durante el periodo 2019–2023, aplicando un enfoque territorial y multivariado. A través de un diseño ecológico longitudinal, se examinan patrones territoriales y poblacionales en los desenlaces clínicos del dengue, considerando variables como estrato socioeconómico, afiliación al sistema de salud, edad, discapacidad, y área geográfica de ocurrencia.
Los hallazgos muestran una concentración de muertes por dengue en municipios con alta pobreza estructural y en poblaciones con condiciones de vulnerabilidad social. Las personas no aseguradas, con discapacidad, residentes en zonas rurales y centros poblados, así como niños y adultos mayores, presentan mayores probabilidades de fallecimiento. Se identifican desigualdades marcadas en los desenlaces según el tipo de afiliación al sistema de salud, el estrato socioeconómico y el índice de necesidades básicas insatisfechas (NBI), lo que evidencia que la letalidad por dengue está fuertemente determinada por factores sociales más allá de las condiciones epidemiológicas.
El análisis territorial revela también una distribución desigual de la letalidad, con municipios que concentran de forma desproporcionada el número de muertes. A partir de estos resultados, el estudio propone una serie de recomendaciones de política pública, como el fortalecimiento de la vigilancia con enfoque social, el diseño de mapas de riesgo socioepidemiológico, la atención diferenciada para grupos vulnerables, la articulación intersectorial, y una mayor inversión pública en salud con criterios de equidad territorial.
Este trabajo aporta evidencia clave para la formulación de políticas de salud pública más equitativas y sensibles a las desigualdades estructurales que afectan los desenlaces clínicos del dengue en Colombia.Maestrí
Estrategia multitoque
Este proyecto tiene como objetivo fortalecer la marca empleadora de Primax Colombia, con un enfoque en atraer, conectar y fidelizar talento joven, especialmente practicantes universitarios. La iniciativa surge del reconocimiento de la necesidad de consolidar una experiencia significativa para quienes inician su vida profesional dentro de la organización, potenciando tanto su desarrollo personal como laboral.
El proceso se estructuró en tres etapas: descubriendo el camino, conectando puntos y dando vida a las ideas, todas guiadas por metodologías de diseño centradas en las personas. A través de investigación secundaria, primaria, entrevistas, arquetipos y ejercicios de benchmarking, se logra comprender el posicionamiento actual de Primax en el sector de hidrocarburos, así como las percepciones y necesidades de los jóvenes frente a la experiencia de prácticas. La combinación de estas herramientas permitió trazar oportunidades claras para fortalecer la comunicación, visibilizar los beneficios existentes y diseñar estrategias que generen mayor sentido de pertenencia.
Como resultado, se identificaron retos y posibilidades que no solo enriquecen la propuesta de valor para los practicantes, sino que también abren camino hacia una marca empleadora más cercana y memorable en el mercado laboral colombiano.Pregrad
Pruebas de hipótesis no paramétricas para el problema de dos muestras de redes complejas
Código de las simulaciones: https://github.com/luistejon17/Statistical-Analysis-in-Random-Graphs.gitEste trabajo aborda el problema extremo de pruebas de hipótesis para dos muestras de grafos: determinar si dos grafos aleatorios provienen de la misma distribución a partir de una única realización de cada uno. Se realizó una discusión sobre distintos modelos de grafos aleatorios y su aplicabilidad al problema de dos muestras. Se propone un procedimiento no paramétrico que combina modelos de posiciones latentes en la esfera (Random Spherical Graph, RSG) con técnicas de remuestreo tipo bootstrap, específicamente mediante subgrafos inducidos (subsampling), para aproximar la distribución nula sin depender de desigualdades de concentración. Se presentan simulaciones controladas que evalúan el desempeño del método en términos de errores tipo I y II bajo distintos escenarios de complejidad estructural. Los resultados muestran que el enfoque es flexible y robusto frente a diferentes configuraciones de comunidades y escalas de conexión, aportando una herramienta generalizable para la inferencia estadística en redes complejas de alta dimensión y bajo tamaño muestral.Pregrad
Rediseño de un extractor solar de líquido de coraza de marañón
En este documento se presenta un método iterativo en espiral en un proceso de ingeniería para rediseñar y hacer un nuevo prototipo de un extractor solar de líquido de coraza de marañón. Durante la caracterización del prototipo base, se identificaron oportunidades de mejora a partir de pruebas dentro y fuera del laboratorio, termografías y revisiones de literatura aplicables en el diseño, el tamaño y los materiales del prototipo. Con lo cual se obtuvo un mejor entendimiento de los principios físicos y de ingeniería que pueden satisfacer los requerimientos y necesidades del proyecto.Pregrad