Portal de Revistas UNAL (Univ. Nacional de Colombia)
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Determinación de las necesidades hídricas de Carica papaya L. en los híbridos Paulina y Tainung mediante teledetección
No full textPapaya (Carica papaya L.), native to Central America, is one of the main fruit crops in tropical and subtropical regions. Accurately estimating the water requirements of C. papaya at different growth stages is essential for optimizing crop yields. Moreover, evapotranspiration (ET) is a key factor in determining crop water demand. The Normalized Difference Vegetation Index (NDVI) can be used to estimate the basal crop coefficient (Kcb), which in turn allows for the calculation of crop ET. This study evaluated two methods for determining Kcb and water requirements of C. papaya in the hybrid cultivars Paulina and Tainung using RGB and multispectral imagery. The study determined Kcb values and the duration of each phenological stage of C. papaya. These data were used to implement the FAO-56 model, which estimated an annual water requirement of 1278 mm for C. papaya under the conditions of the study area. Regarding fruit production, it was determined that 0.14 m³ of water is required to produce 1 kg of papaya.La papaya (Carica papaya L.), originaria de Centroamérica, es uno de los principales cultivos frutales en zonas tropicales y subtropicales. Estimar el agua necesaria para el cultivo de C. papaya en las diferentes etapas de crecimiento es crucial para mejorar el rendimiento del cultivo. La evapotranspiración (ET) es un componente clave para la estimación del requerimiento hídrico del cultivo. El índice de vegetación de diferencia normalizada (NDVI) puede utilizarse para estimar el coeficiente de cultivo basal (Kcb) y así determinar la ET del cultivo. Este estudio evaluó dos métodos para determinar el Kcb y el requerimiento hídrico de C. papaya en los híbridos Paulina y Tainung utilizando imágenes RGB y multiespectrales. Este estudio determinó los valores de Kcb y la duración de cada etapa fenológica de C. papaya. Con estos datos se implementó el modelo FAO-56, el cual muestra un requerimiento anual de 1278 mm de agua para el cultivo de C. papaya (en las condiciones del área de estudio). En relación con la producción, se requieren 0.14 m3 de agua para producir 1 kg de papaya
Análisis In Silico de la molécula OmcZ presente en los Nanocables Proteicos Conductores de Electricidad en Geobacter sulfurreducens
No full textGeobacter sulfurreducens is an anaerobic, mesophilic bacterium that uses fatty acids, alcohols and monoaromatic compounds as oxidative substrates, and iron oxides as electron acceptors. This bacterium has been shown to be efficient in electricity generation and plays an important role in carbon cycling and bioremediation. It was found that this microorganism produces and transfers electrons through highly conductive protein nanowires called pili; these pili act as metallic conductors, allowing the microorganisms to exchange electrons with the extracellular medium.
The article focuses on the analysis of the gene and gene product of a protein called OmcZ, which plays a crucial role in electron transfer between G. sulfurreducens to the pili.
In this study, several steps were carried out to investigate the OmcZ protein sequences in the genus Geobacter. First, a UniProt search was performed to obtain the OmcZ sequence of G. sulfurreducens. Then, sequence alignments were performed with the BLASTp program to identify orthologous microorganisms in NCBI. Sequences of 14 Geobacter species were obtained and multiple alignments were performed with MEGA11 software. A phylogenetic tree was constructed using MEGA11 and a Tajima molecular clock test was performed. In addition, OmcZ sequence alignments and characterizations were performed on G. sulfurreducens, including genome analysis and physicochemical characterization of the protein. RasMol software was used to perform protein predictions and modeling.
The study focused on the alignment of OmcZ protein sequences in different species of Geobacter spp, as it found that the electrically conductive filaments are mainly composed of OmcZ. A low level of mutations and some deletions were found in the analyzed sequences. Possible conserved domains were identified and highly conserved amino acids were found in most of the sequences. Phylogenetic analysis revealed two major clades and showed the relationship between Geobacter species. The molecular clock indicated that the OmcZ protein sequence does not behave strictly as a molecular clock. The genome of G. sulfurreducens was characterized and the specific region encoding the OmcZ protein was identified. A physicochemical characterization of the protein was performed and found to be stable and contain heme groups. Overall, this study provides insight into protein nanowires and their importance in the metabolism of Geobacter spp. with implications for electrochemical technologies and bioremediation.Geobacter sulfurreducens es una bacteria anaerobia y mesófila que utiliza ácidos grasos, alcoholes y compuestos monoaromáticos como sustratos oxidativos, y óxidos de hierro como aceptor de electrones. Se ha demostrado que esta bacteria es eficiente en la generación de electricidad y desempeña un papel importante en el ciclo del carbono y la biorremediación. Se descubrió que este microorganismo produce y transfiere electrones a través de nanocables proteínicos altamente conductores llamados pili; estos pili actúan como conductores metálicos, permitiendo que los microorganismos intercambien electrones con el medio extracelular.
El artículo se centra en el análisis del gen y producto génico de una proteína llamada OmcZ, que desempeña un papel crucial en la transferencia de electrones entre G. sulfurreducens a los electrodos.
En este estudio, se llevaron a cabo varios pasos para investigar las secuencias de la proteína OmcZ en el género Geobacter. Primero, se realizó una búsqueda en UniProt para obtener la secuencia del OmcZ de G. sulfurreducens. Luego, se efectuaron alineamientos de secuencias con el programa BLASTp para identificar microorganismos ortólogos en el NCBI. Se obtuvieron secuencias de 14 especies de Geobacter, las cuales se alinearon múltiples con el software MEGA11. Se construyó un árbol filogenético utilizando MEGA11 y se realizó una prueba de reloj molecular de Tajima. Además, se llevaron a cabo alineamientos y caracterizaciones de la secuencia OmcZ en G. sulfurreducens, incluyendo el análisis de su genoma y la caracterización fisicoquímica de la proteína. Se usó el software RasMol para realizar predicciones y modelamientos de la proteína.
El estudio se centró en el alineamiento de las secuencias de la proteína OmcZ en diferentes especies de Geobacter spp, ya que descubrió que los filamentos conductores de electricidad están compuestos principalmente por OmcZ. Se encontró un nivel bajo de mutaciones y algunas deleciones en las secuencias analizadas. Se identificaron posibles dominios conservados y se encontraron aminoácidos altamente conservados en la mayoría de las secuencias. El análisis filogenético reveló dos clados principales y mostró la relación entre las especies de Geobacter. El reloj molecular indicó que la secuencia de la proteína OmcZ no se comporta estrictamente como un reloj molecular. Se caracterizó el genoma de G. sulfurreducens y se identificó la región específica que codifica la proteína OmcZ. Se realizó una caracterización fisicoquímica de la proteína y se encontró que era estable y contenía grupos hemo. En general, este estudio proporciona una comprensión de los nanocables proteínicos y su importancia en el metabolismo de Geobacter spp., con implicaciones en tecnologías electroquímicas y biorremediación
Análisis y aplicación del acoplamiento molecular de serotonina para la caracterización de dianas terapéuticas en trastornos depresivos
No full textSerotonin is a neurotransmitter responsible for many functions within the human body and has a great influence on a person\u27s mood. On the other hand, SSRI drugs have the function of inhibiting the reuptake of serotonin in the 5HT protein. In this study, we validated this condition using molecular docking, finding the great influence that these drugs have on the molecular targets of this protein. In addition, we analyzed whether an external epigenetic factor such as cortisol, a hormone generated in stress situations, influences the binding sites of the 5HT protein. In conclusion, it was found that the coupling of the cortisol hormone did not present congruence with the molecular couplings of the other drugs, being relevant to determine that the binding sites of these are not directly affected by the hormone, despite the fact that it demonstrates a great influence in studies carried out in vitro and in vivo.La serotonina es un neurotransmisor encargado de muchas funciones dentro del cuerpo humano, además tiene gran influencia en el estado de ánimo de la persona. De otra parte, los fármacos ISRS tienen la función de inhibir el proceso de recaptura de serotonina en la proteína 5HT, en este estudio validamos dicha condición usando acoplamiento molecular, encontrando la gran influencia que tienen estos fármacos en las dianas moleculares de esta proteína. Además, analizamos si un factor epigenético externo como el cortisol, hormona generada en situaciones de estrés, influye en los sitios de unión de la proteína 5HT. Como conclusión, se encontró que el acoplamiento de la hormona cortisol no presento una congruencia con los acoplamientos moleculares de los demás fármacos, siendo esto relevante para determinar que los sitios de unión de estos no se ven afectados directamente por la hormona, a pesar de que esta demuestra gran influencia en estudios realizados in vitro e in vivo
Producción de enzimas fúngicas M6P21 a partir de residuos de piña (Ananas Comosus) y maracuyá (Passiflora Edulis): Aprovechamiento biotecnológico para la valorización de subproductos agroindustriales
No full textThis study evaluated the pectinolytic activity of enzymes produced by the Aspergillus niger M6P21 isolate (P. Micheli, 1729), using pineapple albedo, passion fruit albedo, and a combination of both as sole carbon sources, with commercial pectin serving as the control. The M6P21 isolate was isolated from a pineapple crop in the Sarandelo district of Lorica, Córdoba, Colombia. Enzyme production was assessed across four treatments: pineapple albedo, passion fruit albedo, their mixture, and commercial pectin. Pectinolytic activity was monitored over three days, with results expressed as reducing sugar concentration. The findings demonstrated notable enzymatic activity: 0.2816 g/L for pineapple albedo, 0.2740 g/L for passion fruit albedo, 0.3923 g/L for the mixed substrates, and 0.3046 g/L for commercial pectin. Statistical analysis using ANOVA yielded a p-value of 0.9383, indicating no significant differences among the treatments. These results highlight the potential of Aspergillus niger M6P21 for pectinase production from agro-industrial by-products, offering a sustainable biotechnological approach for the valorization of fruit waste in the food and biotechnology industries.Este estudio evaluó la actividad pectinolítica de las enzimas producidas por el aislado Aspergillus niger M6P21 (P. Micheli, 1729), utilizando albedo de piña, albedo de maracuyá y una combinación de ambos como únicas fuentes de carbono, con pectina comercial como control. El aislado M6P21 fue obtenido de un cultivo de piña en el distrito Sarandelo de Lorica, Córdoba, Colombia. La producción enzimática se evaluó en cuatro tratamientos: albedo de piña, albedo de maracuyá, su mezcla y pectina comercial. La actividad pectinolítica se monitoreó durante tres días, y los resultados se expresaron como concentración de azúcares reductores. Los hallazgos demostraron una actividad enzimática notable: 0,2816 g/L para el albedo de piña, 0,2740 g/L para el albedo de maracuyá, 0,3923 g/L para la mezcla de sustratos y 0,3046 g/L para la pectina comercial. El análisis estadístico mediante ANOVA arrojó un valor – p de 0,9383, lo que indica que no hubo diferencias significativas entre los tratamientos. Estos resultados resaltan el potencial de Aspergillus niger M6P21 para la producción de pectinasas a partir de subproductos agroindustriales, ofreciendo un enfoque biotecnológico sostenible para la valorización de residuos frutales en las industrias alimentaria y biotecnológica
Fenomenología de la depresión: La angustia depresiva y la inhibición de la apertura hacia el otro
No full textOur purpose is to consider the issue of depressive anguish, characterized as a structural loss of the sense of self, as well as its relationship with a specific form of inhibition of openness to the other. First, we present a conceptual clarification of anguish and depression starting from their etymology. Afterwards, we show how resources exist in the tradition of phenomenological psychiatry to describe depressive distress and differentiate it from philosophical analyses of anguish in its existential sense. Finally, we present an analysis of the inhibition of the relationship in cases of depression.Nuestro propósito es abordar el tema de la angustia depresiva, caracterizada como una pérdida estructural del sentido de sí mismo, así como su relación con una forma específica de inhibición de la apertura al otro. En primer lugar, presentamos una aclaración conceptual de la angustia y la depresión a partir de su etimología. Posteriormente, mostramos cómo, en la tradición de la psiquiatría fenomenológica, existen recursos para describir la angustia depresiva y diferenciarla de los análisis filosóficos de la angustia en su sentido existencial. Finalmente, presentamos un análisis de la inhibición de la relación con el otro en los casos de depresión
Calidad del diligenciamiento del certificado de defunción en hospitales universitarios de Bogotá, Colombia
No full textObjective Evaluate the quality of filling out the underlying cause of death on the death certificate.
Methods Formative (prospective) and evaluative (retrospective) study. 288 medical records of non-fetal natural deaths that occurred in 2021 in three university hospitals in Bogotá were analyzed. The quality of filling out the underlying cause of death was evaluated in two ways: the frequency of use of useless codes and the agreement by ICD-10 chapters, between medicine students trained in filling out death certificates and physicians who registered the death in 2021.
Results The use of useless codes as the underlying cause of death was higher among trained medicine students (14.2%) than among physicians (8.7%). 72.6% of these codes could have a high or very high negative impact on guiding public health policies. When grouping the basic causes of death by ICD-10 chapters and comparing between students and physicians, a gross matching of 84.7% and a kappa index of 0.76 (95% CI: 0.70-0.83) were obtained.
Conclusions It is pertinent to strengthen the training of doctors in the correct filling out of death certificates and to routinely calculate quality indicators such as the frequency of use of useless codes and the kappa index, in order to obtain more accurate mortality statistics that support the evaluation and design of public policies in the country.Objetivo Evaluar la calidad del diligenciamiento de la causa básica de muerte en el certificado de defunción.
Métodos Estudio formativo (prospectivo) y valorativo (retrospectivo). Se analizaron 288 historias clínicas de muertes naturales no fetales ocurridas en 2021 en tres hospitales universitarios de Bogotá. Se evaluó la calidad del diligenciamiento de la causa básica de muerte por dos vías: la frecuencia de uso de códigos inútiles y la concordancia por capítulos de la CIE-10, entre estudiantes de medicina capacitados en el diligenciamiento de certificados de defunción y los médicos que registraron la muerte en el año 2021.
Resultados El uso de códigos inútiles como causa básica de muerte fue mayor entre los estudiantes de medicina capacitados (14,2%) que entre los médicos (8,7%). El 72,6% de estos códigos podrían tener un impacto negativo alto o muy alto para orientar políticas de salud pública. Al agrupar las causas básicas de muerte por capítulos de la CIE-10 y comparar entre estudiantes y médicos, se obtuvo una concordancia bruta del 84,7% y un índice kappa de 0,76 (95% IC: 0,70-0,83).
Conclusiones Resulta pertinente fortalecer la capacitación de los médicos en el correcto diligenciamiento de los certificados de defunción y calcular de manera rutinaria indicadores de calidad como la frecuencia de uso de códigos inútiles y el índice kappa, con el fin de obtener estadísticas más precisas de mortalidad que apoyen la evaluación y diseño de políticas públicas en el país
Diseño de un concentrador de oxígeno de acuerdo con las normas ISO 80601-2-69
No full textThis work focuses on the design, construction and economic analysis of an oxygen concentrator in the city of Moquegua, Peru, under ISO 80601-2-69 standards. The methodology used was experimental, consisting of the design and construction of an oxygen concentrator, as well as its economic analysis. The results of the prototype tests indicate that it provides oxygen with a concentration of 95%, up to 10 litres/min, consuming 280 W of power, being powered by 220 V alternating current, working under a process called oscillating pressure absorption. The final cost of the device was S/1220.80, which contrasts with the cost of similar equipment that in the market have a value of S/1500.00 and that in pandemic 2020 reached S/15000.00. In conclusion, the manufacture of an oxygen concentrator in Moquegua is both technically and economically feasible.Este trabajo se enfoca en el diseño, construcción y análisis económico de un concentrador de oxígeno en la ciudad de Moquegua, Perú, bajo las normas ISO 80601-2-69. La metodología utilizada fue experimental, que consistió en el diseño y construcción de un concentrador de oxígeno, así como el análisis económico del mismo. Los resultados de las pruebas del prototipo indican que proporciona oxígeno con una concentración del 95%, hasta por 10 litros/min, consumiendo 280 W de potencia, siendo alimentado por corriente alterna de 220 V, trabajando bajo un proceso denominado absorción por presión oscilante. El costo final del dispositivo fue de S/1220.80, que contrasta con el costo de equipos similares que en el mercado tienen un valor de S/1500.00 y que en pandemia del 2020 alcanzó los S/15000.00. En conclusión, la fabricación de un concentrador de oxígeno en Moquegua resulta factible tanto técnica como económicamente
Detección de imágenes adversarias basada en capas neuronales Bayesianas
No full textAlthough Deep Neural Networks (DNNs) have repeatedly shown excellent performance, they are known to be vulnerable to adversarial attacks that contain human-imperceptible perturbations. Multiple adversarial defense strategies have been proposed to alleviate this issue, but they often demonstrate restricted practicability regarding efficiency and handling solely specific attacks. In this paper, we analyze the performance of Bayesian Neural Networks (BNNs) endowed with flexible approximate posterior distribution for detecting adversarial examples. Furthermore, we study how robust the detection method is when Bayesian layers are located at the top or throughout the DNNs to determine the role of the network\u27s hidden layers, and we compare the results with the deterministic ones. We show how BNNs offer a powerful, and practical method of detecting adversarial examples in comparison with deterministic approaches. Finally, we discuss the impact of having well-calibrated models as detectors and how non-gaussian priors enhance the performance of the detection.Aunque las redes neuronales profundas (DNN, por sus siglas en inglés) han demostrado un excelente desempeño, se sabe que son vulnerables a ataques adversarios que contienen perturbaciones imperceptibles para el ser humano. Se han propuesto múltiples estrategias de defensa adversaria para mitigar este problema, pero a menudo estas muestran una viabilidad limitada en cuanto a eficiencia y manejo de ataques específicos. En este artículo, analizamos el desempeño de las redes neuronales bayesianas (BNN, por sus siglas en inglés) dotadas de una distribución a posteriori aproximada flexible para detectar ejemplos adversarios. Además, estudiamos la robustez del método de detección cuando las capas bayesianas se ubican en la parte superior o a lo largo de las DNN para determinar el papel de las capas ocultas de la red, y comparamos los resultados con los deterministas. Mostramos cómo las BNN ofrecen un método potente y práctico para detectar ejemplos adversarios en comparación con los enfoques deterministas. Finalmente, analizamos el impacto de contar con modelos bien calibrados como detectores y cómo las distribuciones a priori no gaussianas mejoran el desempeño de la detección
Ocurrencia de camalánidos (Nematoda: Camallanidae) en peces hospedadores de la Amazonía peruana
No full textCamallanids are nematodes that have been reported to parasitize different fish species in South America and can compromise the health of those species bred in captivity for fish farming and ornamental purposes. To date, in Peru, there are few studies related to camallanid parasitism in fish, so the main objective of this study was to report and identify species of this group of parasites present in 20 species of fish collected in the Peruvian Amazonia. Samples were analyzed through tissue and organ dissection methods for macroscopic evaluation and subsequent parasitic morphological and morphometric evaluation. Six species of camallanids were identified infecting the internal organs of analyzed fish: Paracamallanus amazonensis, Spirocamallanus krameri, Spirocamallanus iheringi, Procamallanus (Spirocamallanus) inopinatus, Procamallanus (Spirocamallanus) juana and Procamallanus (Spirocamallanus) pintoi.Los camalánidos son nemátodos que han sido reportados parasitando a diferentes especies de peces en Sudamérica, pudiendo comprometer la salud de aquellas especies criadas en cautiverio con fines piscícolas y ornamentales. A la fecha, en Perú existen escasos estudios relacionados al parasitismo de camalánidos en peces, por lo que el presente estudio tuvo como objetivo principal reportar e identificar a especies de este grupo de parásitos presentes en 20 especies de peces colectados en la Amazonía peruana. Las muestras se analizaron mediante métodos de disección de tejidos y órganos para su evaluación macroscópica y posterior evaluación morfológica y morfométrica. Como resultado, se identificaron seis especies de camalánidos infectando los órganos internos de los peces analizados: Paracamallanus amazonensis, Spirocamallanus krameri, Spirocamallanus iheringi, Procamallanus (Spirocamallanus) inopinatus, Procamallanus (Spirocamallanus) juana y Procamallanus (Spirocamallanus) pintoi
Quechuismos en el español hablado en Colombia: frecuencia de uso y distribución diatópica del fenómeno
No full textThis study presents an approach to the diatopic distribution and frequency of usage of Quechua loanwords in Colombian Spanish. The Quechua diasystem has been identified as the primary source of most indigenous lexical items found in the varieties of Spanish spoken in Colombia, also, Quechua-derived terms function as dialectal differentiation markers within the country. Therefore, their study is essential for the description of linguistic variation in Colombian Spanish. This work is part of an ongoing research project based on materials from the Linguistic-Ethnographic Atlas of Colombia (ALEC), which aims to systematize various aspects of the phenomenon. The study supports the identification of a center-periphery structure in the spatial distribution of variants and provides quantitative data to characterize both the density by locality and the frequency of Quechua loanword usage in Colombian Spanish.El presente estudio ofrece una aproximación a la distribución diatópica y a la frecuencia de uso del fenómeno de préstamo de palabras del quechua al español hablado en Colombia. El diasistema quechua ha sido señalado como la fuente de la mayoría de indigenismos en las variedades del español hablado en Colombia y los quechuismos funcionan como rasgos de diferenciación dialectal al interior del país, por lo que su estudio es relevante para la descripción de la variabilidad del español colombiano. Este trabajo hace parte de un proyecto de investigación en curso basado en materiales del Atlas Lingüístico-Etnográfico de Colombia, ALEC, que busca sistematizar diversos aspectos del fenómeno. El estudio concluye a favor de la identificación de una estructura centro-periferia en la distribución espacial de las variantes, y aporta elementos cuantitativos para caracterizar la densidad por localidad y frecuencia de uso de quechuismos en el español hablado en Colombia.O presente estudo oferece uma análise da distribuição diatópica do fenômeno de empréstimo lexical das línguas quíchuas para o espanhol falado na Colômbia, além de abordar algumas características lexicológicas do corpus estudado. As línguas quíchuas foram identificadas como a principal fonte de indigenismos nas variedades do espanhol falado na Colômbia, e os quechuísmos funcionam como traços de diferenciação dialectal no interior do país, tornando seu estudo relevante para a descrição da variação do espanhol colombiano. Este trabalho faz parte de um projeto de pesquisa em andamento baseado em materiais do Atlas Lingüístico-Etnográfico da Colômbia (ALEC), que visa sistematizar diversos aspectos do fenômeno. O estudo conclui pela identificação de uma estrutura centro-periférica na distribuição espacial das variantes e fornece elementos quantitativos para caracterizar a frequência de uso de quechuísmos no espanhol falado na Colômbia