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Un’architettura per la navigazione multidimensionale dei dati delle università
Da circa 10 anni, il CASPUR collabora con l’Ufficio di statistica del MIUR per la gestione delle banche dati. Il compito principale dell’Ufficio statistico è quello di rilevare, elaborare, diffondere e archiviare dati statistici che interessano i settori dell’Università Italiana, l’Alta Formazione Artistico Musicale e la Ricerca. Nell’ultimo anno il CASPUR ha realizzato un sistema per l’accesso ai dati acquisiti in questi anni da parte delle diverse tipologie di utenti del MIUR
Simulazioni cinetiche di flussi complessi
Le simulazioni cinetiche basate sul metodo Lattice Boltzmann (LB) consentono di studiare fenomeni fluidodinamici su scala mesoscopica. Questi metodi risultano particolarmente adatti allo studio di flussi complessi, come quelli costituiti da più componenti (fluide e non), o quelli caratterizzati da separazioni di fase. In questi sistemi, gli effetti idrodinamici svolgono un ruolo molto rilevante, del quale il metodo LB riesce a caratterizzare efficacemente la fenomenologia, tenendo conto delle principali proprietà fisiche dei fluidi componenti, ma consentendo di trascurare i dettagli del comportamento microscopico. Combinando metodi cinetici e altri modelli numerici tipicamente usati nello studio dei sistemi complessi, è possibile effettuare simulazioni accurate ed efficienti per descrivere la fisica di flussi multi-fase e multi-componente, integrando e indirizzando il lavoro sperimentale
Weather computing: l’indissolubile legame tra meteorologia e HPC
L’aspetto previsionistico meteorologico e quelli teorici e tecnologici della Computer Science sono, oggi, intimamente legati, sebbene la teoria di base che governa il comportamento e l’evoluzione dell’atmosfera sia stata sviluppata più di un centinaio di anni fa ovvero molto tempo prima che venisse costruito il primo computer elettronico. Accade molto spesso che i progressi compiuti nel settore tecnologico consentano di sviluppare, parametrizzare ed includere, nella descrizione modellistica dell’atmosfera, fenomenologie fisiche ritenute in un primo tempo ancillari rispetto alla descrizione di base, ma che, al crescere della raffinatezza della rappresentazione modellistica diventano fondamentali sia dal punto di vista qualitativo che quantitativo. È possibile tener conto del contributo di questi fenomeni solamente attraverso l’utilizzo massiccio di potenti supercalcolatori, a causa dell’enorme mole di calcoli necessari affinché essi siano adeguatamente “risolti” alla risoluzione spaziale e temporale necessaria, anche su scenari geografici relativamente poco estesi
La biologia computazionale come strumento di indagine delle malattie genetiche
I canali ionici sono proteine di membrana che regolano il passaggio di ioni specifici verso l’interno e l’esterno delle cellule. Tra questi, i canali del potassio rivestono un’importanza fondamentale nel contesto di molte patologie di natura genetica: le malattie metaboliche sono spesso causate, infatti, da un malfunzionamento di specifici canali ionici, la cui funzione biologica risulta alterata in seguito ad una mutazione del relativo gene che la codifica. La biologia computazionale consente di indagare e studiare, a livello molecolare, le cause che alterano la funzione dei canali ionici; fornisce a medici e biologi uno strumento di interpretazione dei loro esperimenti e permette la progettazione di nuovi farmaci volti a curare e migliorare la qualità della vita di molti pazienti. Le moderne risorse di calcolo parallelo, basate sui nuovi processori GPU ad architettura multicore, consentono di simulare il comportamento dinamico dei canali ionici su scale di tempo molto maggiori
Le pubblicazioni scientifiche prodotte con il contributo del CASPUR nel 2010
Seguono le pubblicazioni scientifiche prodotte con il contributo del CASPUR nell'anno 2010
La simulazione dell’emodinamica per la prevenzione dell’infarto
Lo studio dell’emodinamica, cioè delle proprietà fisiche del flusso sanguigno, ha, tra i suoi obiettivi, la comprensione della genesi delle malattie cardiovascolari per arrivare, auspicabilmente, a prevederne l’evoluzione. Una nuova tecnica computazionale multiscala, descritta nell’articolo, permette di studiare, ad un altissimo livello di risoluzione, il sistema arterioso umano in tutta la sua complessità. I risultati ottenuti dalle simulazioni permettono di offrire nuove possibilità per salvare la vita a chi non ha ancora manifestato i sintomi dell’infarto pur avendone in atto le cause prime
Elettricità dalla plastica: un progetto IIT per il fotovoltaico del futuro
La scoperta dei polimeri conduttori ha offerto la possibilità di realizzare celle solari di plastica, flessibili e con bassi costi di produzione, che potranno cambiare gli scenari futuri in campo fotovoltaico. Lo studio alla scala atomica di questi materiali strutturalmente e chimicamente complessi, richiede lo sviluppo di modelli teorici e l’uso intensivo del supercalcolo, al fine di migliorarne le proprietà di fotoconversione e renderli tecnologicamente competitivi
Reti neurali per il job placement
Nel 2008 il CASPUR, in Associazione Temporanea di Scopo con le Università La Sapienza e Roma Tre, ha realizzato, utilizzando i finanziamenti messi a disposizione dal Fondo Sociale Europeo, il portale di placement universitario SOUL (Sistema Orientamento Università Lavoro). La forza dell’iniziativa ha aperto la strada all’adesione, nei tre anni successivi, di tutte le università statali della Regione Lazio ed oggi, il portale www.jobsoul. it rappresenta un punto di riferimento per oltre 42.000 utenti iscritti e più di 3.000 imprese registrate. Il motore di prossimità neurale, sviluppato dal CASPUR per valutare il livello di corrispondenza tra un’offerta di lavoro e gli elementi presenti in un curriculum vitae (CV), rappresenta l’aspetto tecnologicamente più innovativo del portale. L’algoritmo basato su reti neurali è in grado di analizzare ogni CV ed ogni opportunità di lavoro identificandone non solo gli elementi caratteristici, che possono provenire dai campi strutturati (titoli di studio conseguiti o richiesti, sede di lavoro indicata etc.), ma soprattutto le informazioni normalmente descritte nei campi a testo libero (descrizione dell’attività, di esperienze lavorative etc.)
Il CASPUR investe nell’alta formazione: un’esperienza di dottorato
Sono uno studente di dottorato del XXIV ciclo in Genetica e Biologia Cellulare presso l’Università della Tuscia ed ho avuto l’opportunità di lavorare nel gruppo del professor Alessio Valentini e della dottoressa Lorraine Pariset del Dipartimento di Produzioni Animali, partecipando a diversi progetti di ricerca riguardanti la genomica animale.Il dottorato, finanziato dal CASPUR, mi ha permesso di svolgere ricerche sia presso il Dipartimento di Produzioni Animali sia nel Consorzio. La possibilità di lavorare con studiosi di diversa formazione è stata un’importante occasione per accrescere la mia formazione accademica e tecnologica. Il contributo informatico/computazionale, infatti, gioca un ruolo chiave, in molteplici ambiti scientifici
L’uso di sequenziatori di ultima generazione nella lotta ai virus
Negli ultimi anni si è verificato un intenso avanzamento nello studio di alcune tecniche molecolari, tra cui spicca il sequenziamento massivo di DNA, che sta determinando un rivoluzionario cambiamento nell’approccio diagnostico alle malattie da infezione. Affinché tutto questo si traduca in un reale beneficio per i pazienti è necessaria una proficua interazione tra ricercatori bioinformatici e sperimentali che possa rendere automatico il processo di analisi e semplificare gli strumenti di interpretazione del risultato