26023 research outputs found
Sort by
Democracy quality indicators in European regions in 2016–2020. Towards the erosion of democracy in the countries of Central and Eastern Europe?
Get PDFCechą wspólną w państwach Europy Środkowej i Wschodniej (EŚW) wydaje się być dość podobny poziom jakości demokracji. Celem artykułu jest przeanalizowanie, czy w państwach EŚW mamy obecne zjawisko odwrotu od demokracji oraz czy istnieją wyraźne różnice w poziomie demokracji między państwami EŚW a starymi państwami UE. Ocenie poddano wskaźniki jakości demokracji w grupach państw EŚW, Północnej, Południowej oraz Zachodniej. Analiza ujawniła, podobnie jak wcześniejsze badania litewskiego politologia Sauliusa Spurgi, iż nie ma wyraźnej różnicy między wskaźnikami grupy państw EŚW a grupą państw Europy Południowej (m.in. Hiszpanii, Portugalii, Grecji). Z kolei w przypadku państw skandynawskich i południowoeuropejskich pojawiają się istotne różnice w poziomie wskaźników demokracji. Dane wyraźnie wskazują wyższy poziom jakości demokracji w państwach skandynawskich. Potwierdzają to wyniki raportów jakości demokracji z lat 2006, 2008 oraz 2010. Na podstawie dokonanej analizy można stwierdzić, że różnice w jakości demokracji w grupie starych państw członkowskich UE są większe niż różnice pomiędzy państwami grupy EŚW a państwami Europy Południowej.A common feature in the countries of Central and Eastern Europe (CEE) seems to be a fairly similar level of quality of democracy. The aim of the article is to analyze whether the CEE countries are in the proces of retreat from democracy and whether there are clear differences in the level of development of democracy between the old EU countries and other EU countries. The indicators of the quality of democracy in the groups of CEE, North, South and West countries were assessed. The analysis revealed, similarly to the previous research by Lithuanian political scientist Saulius Spurga, that there is no clear difference between the indicators of the CEE group and the group of Southern European countries (including Spain, Portugal, Greece). On the other hand, in the case of Scandinavian and Southern European countries, there are significant differences in the level of democracy indicators. The data clearly show a higher level of quality of democracy in the Nordic countries. This is confirmed by the results of democracy quality reports from 2006, 2008 and 2010. Based on the analysis performed, it can be concluded that the differences in the quality of democracy in the group of old EU Member States are greater than the differences between the CEE countries and the countries of Southern Europe.27187Przegląd Politologiczn
Modifications of plant resistance inducers to an ionic form to enhance their biological activity
Get PDFWydział ChemiiCelem pracy doktorskiej było zbadanie wpływu modyfikacji jonowej związków chemicznych indukujących naturalną odporność u roślin na ich aktywność biologiczną. Hipotezą badań było stwierdzenie, że poznanie zależności pomiędzy strukturą kationu a aktywnością anionu indukującego naturalną odporność w roślinie, pozwoli na uzyskanie podstawowej wiedzy na temat wpływu poszczególnych jonów na poprawę lub pogorszenie właściwości biologicznych otrzymanych soli, co z kolei pozwoli na przewidywanie aktywności biologicznej nowych soli organicznych. W tym celu otrzymano serię soli organicznych składających się z anionu stymulującego układ odpornościowy roślin oraz kationu organicznego o innych właściwościach biologicznych. Łącznie otrzymano 131 soli, w tym: 9 soli z kationem benzethonium, 8 soli z kationem tetrabutyloamoniowym, 8 soli z kationem dimetylodecyloamoniowym, 8 soli z kationem butylodecylo-dimetyloamoniowym, 8 soli z kationem benzyldidecylometylamoniowym, 8 soli z kationem 1-decylopirydyniowym, 18 soli z kationem cholinowym, 8 soli z kationem chlorocholinowym, 8 soli z kationem betainowym i 48 soli z kationami rdzeniowymi dimetylotanoloaminy, dietyloetanoloaminy i butyloetanoloaminy. W doświadczeniach sprawdzających zdolność do indukowania naturalnej odporności u roślin wykazano, że prawie wszystkie otrzymane sole redukowały nekrozę na liściach tytoniu porażonych TMV w zakresie od 23% do 100%. Wyniki przedstawione w niniejszej pracy dowodzą, że modyfikacja induktorów odporności do formy jonowej może poprawić ich aktywność biologiczną.The aim of this dissertation was to study the effect of ionic modification of chemical compounds inducing natural resistance in plants on their biological activity. The hypothesis of the research was that the knowledge of the relationship between the structure of the cation and the activity of the anion inducing natural immunity in the plant, will allow to obtain a basic knowledge on the effect of individual ions on improving or deteriorating the biological properties of the obtained salts, which in turn will allow to predict the biological activity of new organic salts. To this end, a series of organic salts consisting of an anion that stimulates the plant immune system and an organic cation with other biological properties were obtained.
A total of 131 salts were obtained including: 9 salts with benzethonium cation, 8 salts with tetrabutylammonium cation, 8 salts with dimethyldidecylammonium cation, 8 salts with butylodecyl-dimethylammonium cation, 8 salts with benzyldidecylmethylammonium cation, 8 salts with 1-decylpyridinium cation, 18 salts with choline cation, 8 salts with chlorocholine cation, 8 salts with betaine cation and 48 salts with dimethylethanolamine, diethylethanolamine and butylethanolamine core cations. In experiments testing the ability to induce natural resistance in the plant, it was shown that almost all of the salts obtained reduced necrosis on tobacco leaves infected with TMV in the range of 23% to 100%. The results presented within this dissertation demonstrate that modifications of resistance inducers to the ionic form can improve their biological activity.Badania finansowane przez Narodowe Centrum Nauki w ramach projektu OPUS (nr 2015/17/B/NZ9/01676) „Systemiczna odporność nabyta (Systemic Acquired Resistance, SAR) roślin przeciwko wirusom: nowe induktory oraz biologiczna i molekularna charakterystyka mechanizmów ich działania” oraz PRELUDIUM (nr 2018/29/N/NZ9/01813) „Badanie wpływu dodatku czynnika antystresowego na obniżenie fitotoksycznego efektu wywołanego poprzez podanie induktora odporności roślinie”.
Praca finansowana ze środków projektu „INNChem – rozwój kompetencji doktorantów kluczowych w pracy o charakterze badawczo-rozwojowym” (nr POWR.03.02.00-00-I023/17) współfinansowanego przez Unię Europejską za pośrednictwem Europejskiego Funduszu Społecznego w ramach Programu Operacyjnego Wiedza Edukacja Rozwój
Ecopoetics (im)possible. Nature in women's poetry after 1989
Get PDFWydział Filologii Polskiej i KlasycznejRozprawa doktorska została poświęcona problematyce natury wyłaniającej się z polskiej poezji pisanej przez kobiety po 1989 roku, analizowanej z ekokrytycznej perspektywy. Podstawowym wyzwaniem pracy było zbadanie relacji zachodzących między piszącym podmiotem, wierszem i nie-ludzką przyrodą, a także językowych strategii ustanawiania tychże zależności. Aporetyczną oś refleksji badawczej wyznaczył z jednej strony namysł nad językiem poetyckim, rozumianym jako struktura mogąca wykonywać pracę ekologiczną, z drugiej zaś pytanie o (nie)możliwość wypracowania uniwersalnego modelu sprawczej, ekologicznej narracji. Projekty (eko)poetyckie, analizowane w pierwszej kolejności, odnoszą się do pytania o źródła, z konieczności naruszając cezurę roku 1989. Stąd obecność Urszuli Kozioł, Krystyny Miłobędzkiej, a także Wisławy Szymborskiej. Następnie, uwzględniając wyłaniającą się z dobranego materiału poetyckiego przekrojowość i pokoleniowość oraz zróżnicowanie obecne w indywidualnych projektach, interpretacji poddana została poezja Marzanny Bogumiły Kielar, Elżbiety Michalskiej, Julii Fiedorczuk, Urszuli Zajączkowskiej oraz poetyckie przedsięwzięcia poetek urodzonych w latach 80. i 90. Wgląd w poezję najnowszą, pozwolił poszukać odpowiedzi na pytanie o reakcję literatury na współczesne problemy, tendencje i przemiany światopoglądowe oraz ich potencjalny wpływ na kształt natury współtworzonej w wierszu.The doctoral dissertation was dedicated to the issues of nature emerging from Polish poetry written by women after 1989, analyzed from an ecocritical perspective. The main challenge of the work was to study the relations between the writing subject, the poem and non-human nature, as well as the linguistic strategies of establishing these relations. The aporetic axis of the research reflection was determined, on the one hand, by the reflection on poetic language, understood as a structure capable of performing ecological work, and, on the other hand, by the question about the (im)possibility of developing an universal model of causal, ecological narration. The (eco)poetic projects that were analyzed in the first place, refer to the question of the sources, necessarily breaking the caesura of 1989. Therefrom the presence of Urszula Kozioł, Krystyna Miłobędzka and Wisława Szymborska. Next, taking into consideration the cross-sectional and generational nature that emerged from the selected poetic material, as well as the diversity present in individual projects, the poetry of Marzanna Bogumiła Kielar, Elżbieta Michalska, Julia Fiedorczuk, Urszula Zajączkowska were interpreted, as well as, poetic undertakings of the youngest poets, born in the 1980s and 1990s. This insight into the newest poetry, made it possible to look for an answer to the question of how literature reacts to contemporary problems, tendencies and worldview transformations, as well as their potential impact on the shape of nature co-created in a poem
Emulsje Pickeringa wytwarzane za pomocą fal ultradźwiękowych i pola elektrycznego - ich właściwości i zastosowania
Get PDFWydział FizykiEmulsje spotykamy w wielu obszarach naszego życia. Niezależnie od konkretnego zastosowania powinny zachowywać one swoje właściwości wraz z upływem czasu. Dlatego nadal pracuje się nad coraz doskonalszymi metodami wytwarzania stabilnych emulsji i ich charakteryzowania. Jedną z metod stabilizacji jest użycie cząstek stałych do pokrycia kropel emulsji, a takie emulsje nazywamy emulsjami Pickeringa. W tej rozprawie składającej się z cyklu 6 publikacji zaproponowano nową metodę wytwarzania takich emulsji z użyciem fal ultradźwiękowych i pola elektrycznego. Działanie metody zostało sprawdzone metodami optycznymi i ultradźwiękowymi. Pokazano również, że magnetyczne emulsje Pickeringa wykazują różną efektywność nagrzewania magnetycznego na różnych etapach wytwarzania, co może być istotne z punktu widzenia przyszłych zastosowań w terapii hipertermii magnetycznej, czy w wytwarzaniu metodą spiekania w polu magnetycznym kapsułek koloidalnych mających potencjalne zastosowanie w nowoczesnych terapiach medycznych. Zaprezentowane w ramach rozprawy wyniki mogą przyczynić się do wynalezienia skuteczniejszych metod stabilizacji emulsji i lepszego zrozumienia fundamentalnych procesów zachodzących w nich, gdy są wystawiane na działanie zmiennego pola magnetycznego.Emulsions are ubiquitous colloidal systems that we encounter in everyday life. These should maintain their properties for a long time in order to be safe and useful. Therefore, scientists have still been working on better methods of emulsion formation and their characterization. Using solid particles to cover droplets in an emulsion is one approach for obtaining a stable emulsion and "Pickering emulsions" is a typical term for this kind of colloidal systems. In this thesis, that consists of the series of 6 publications, I proposed a novel approach to producing Pickering emulsions by employing ultrasound and electric fields. Optical and ultrasonic techniques were used to assess the method's effectiveness. Furthermore, the efficiency of magnetic heating in magnetic Pickering emulsions varied depending on the stage of stabilization, which could be very important for future applications of such emulsions in magnetic hyperthermia therapy or the fabrication of colloidal capsules via magnetic heating, which could be useful in new medical targeted therapy. The findings given in this thesis may aid in the search for more efficient and applicable emulsion preparation methods, as well as a better understanding of the processes that occur in such emulsions when exposed to an alternating magnetic field.I also thank the Polish National Science Center for its financial support through the research projects within OPUS programs (project no. 2015/19/B/ST3/03055 and no. 2015/17/B/ST7/03566), and within PRELUDIUM program (project no. 2019/35/N/ST5/00402: Formation of Pickering-emulsion-based microcapsules by using magnetic heating and their characterization)
System zabezpieczeń trwałości i skuteczności Inicjatywy Trójmorza
Get PDFAbstract The purpose of this article is to evaluate the security system for the durability and effectiveness of the Three Seas Initiative as an informal union of Central European countries. The author diagnoses a set of elements that constitute potential ‘fuses’ for implementing the goals set by 3SI: embedding the Initiative’s priorities within strategic EU programmes, informalization and decentralization of cooperation, and development of mutual business and economic cooperation. The analysis of the security system has been embedded in the context of contemporary challenges faced by Europe. In order to verify the problem of security mechanisms, desk research was carried out, which consisted of a system (political) analysis and elements of strategic analysis. The result of the research work was to determine the mutual interaction and conditioning of the individual pillars of the durability and effectiveness of 3SI. Thus, evidence was carried out for the legitimacy of recognizing the three previously defined aspects as crucial for the effective operation of the Three Seas Initiative.Celem niniejszego artykułu jest ocena systemu zabezpieczeń dla trwałości i skuteczności Inicjatywy Trójmorza jako nieformalnego bloku państw Europy Środkowej. Autor diagnozuje zbiór elementów stanowiących potencjalne „bezpieczniki” dla realizacji założonych przez 3SI celów: osadzenie priorytetów Inicjatywy w ramach strategicznych programów UE, odformalizowanie i zdecentralizowanie współpracy oraz rozwijanie wzajemnej współpracy biznesowej i gospodarczej. Analiza systemu zabezpieczeń została osadzona w kontekście współczesnych wyzwań, z jakimi mierzy się Europa. Celem weryfikacji problemu mechanizmów zabezpieczenia przeprowadzono analizę danych zastanych, na co składały się analiza systemowa (polityczna) oraz elementy analizy strategicznej. Rezultatem pracy badawczej było określenie wzajemnego oddziaływania na siebie i warunkowania poszczególnych filarów trwałości i skuteczności 3SI, a tym samym przeprowadzono dowodzenie na rzecz zasadności uznania trzech określonych wcześniej aspektów za kluczowe dla efektywnego działania Trójmorza
Content and exercise of the fractional co-ownership
Get PDFWydział Prawa i AdministracjiPrzedmiotem rozprawy jest problematyka normatywnej konstrukcji współwłasności w częściach ułamkowych ukształtowanej w Kodeksie cywilnym. Celem rozprawy jest wyjaśnienie konstrukcji normatywnej współwłasności w częściach ułamkowych określonej przepisami Kodeksu cywilnego ze szczególnym uwzględnieniem treści przysługujących współuprawnionym praw oraz przyjętego modelu ich wykonywania. Rozważania zawarte w niniejszej pracy opierają się na założeniu, że w ramach współwłasności w częściach ułamkowych występują równolegle dwa prawa podmiotowe, tj. wspólne prawo własności oraz udział we wspólnym prawie własności, a także na rozróżnieniu pojęcia treści, sposobu wykonywania i faktycznego realizowania praw podmiotowych. Zakres przeprowadzonych badań objął m.in. przedmiot współwłasności; istotę współwłasności; prawa współwłaścicieli, a w szczególności: prawo do współdziałania w zarządzie rzeczą wspólną, prawo do podejmowania tzw. czynności zachowawczych, współposiadanie i korzystanie z rzeczy wspólnej, prawo do rozporządzania swoim udziałem, prawo do żądania zniesienia współwłasności; umowne modyfikacje sposobu wykonywania praw współwłaścicieli; obowiązki współwłaścicieli; związanie udziału we wspólnym prawie własności z innym prawem.The subject of the dissertation is the issue of normative construction of the fractional co-ownership established in the Polish Civil Code. The aim of the dissertation is to explain the normative construction of the fractional co-ownership, as defined by the provisions of the Civil Code, with particular emphasis on the content of the co-owners' rights and the established model for exercising them. The considerations included in this work are based on the assumption that within the framework of co-ownership in fractions of shares there are two parallel subjective rights, i.e. a (joint) ownership and co-owners' shares, as well as on the distinction between the concept of content, way of exercising and actual exercising of subjective rights. The scope of the research included, among others, the subject of the co-ownership; the essence of co-ownership; rights of co-owners, and in particular: the right to cooperate in managing a subject of the co-ownership, the right to undertake so-called preservative actions, co-possession and use of a subject of the co-ownership, the right to dispose of own's share, the right to demand the dissolution of co-ownership; contractual modifications of the way of exercising the co-owners' rights; duties of co-owners; relating a co-owner’s share with another right
The mechanism of the action of the chaperone protein Hfq in the pairing of regulatory RNAs MgrR and ChiX with mRNA molecules in Escherichia coli
No full textWydział BiologiiU bakterii małe, regulatorowe RNA (sRNA) biorą udział w odpowiedzi na czynniki stresowe pochodzące ze środowiska zewnętrznego. U Escherichia coli oraz pokrewnych gatunków bakterii białko opiekuńcze Hfq stymuluje wiązanie sRNA do regulowanych przez nie cząsteczek mRNA. Białko to posiada trzy powierzchnie oddziaływania z RNA. W oparciu o profile akumulacji sRNA w komórkach E. coli z mutacjami w miejscach wiązania RNA w poprzednich badaniach zaproponowano podział tych cząsteczek na dwie klasy. sRNA Klasy I oddziałują ze stroną proksymalną za pomocą ogona poli(U) zlokalizowanego na ich 3ʹ końcach oraz z powierzchnią dystalną wewnętrznymi motywami bogatymi w reszty U i A. Cząsteczki mRNA regulowane przez te sRNA wiążą się do strony dystalnej Hfq za pomocą motywów ARN. sRNA Klasy II oddziałują z białkiem w alternatywny sposób. W komórkach z mutacją stron proksymalnej i dystalnej charakteryzowała je niższa akumulacja niż w obecności Hfq z mutacją strony bocznej. Na tej podstawie stwierdzono, że sRNA Klasy II kontaktują się z powierzchnią proksymalną i dystalną, podczas gdy mRNA przez nie regulowane wiążą się do strony bocznej. W rozprawie doktorskiej badałam wpływ białka Hfq na asocjację cząsteczek sRNA Klasy II MgrR i ChiX do regulowanych przez nie mRNA, odpowiednio eptB lub ygdQ i chiP. W pierwszym etapie badań wyznaczyłam struktury drugorzędowe badanych RNA. Zbadałam również zależność powinowactwa MgrR do Hfq od mutacji w poszczególnych miejscach wiązania oraz określiłam właściwości tego sRNA w procesie konkurencji o dostęp do Hfq z innymi cząsteczkami. Następnie wykorzystując program KinTek Explorer przeprowadziłam globalną analizę danych asocjacji MgrR do eptB lub ygdQ oraz ChiX do chiP w obecności Hfq i wariantów białka z mutacjami stron rozpoznających RNA. Sprawdziłam także efekt kompetytorowej cząsteczki sRNA na dysocjację kompleksu ChiX-chiP od białka. Otrzymane wyniki pozwoliły na lepsze zrozumienie sposobu rozpoznawania MgrR przez Hfq. Wskazałam również motywy sekwencyjne w MgrR, eptB i ygdQ odpowiadające za kontakt z białkiem. Następnie, scharakteryzowałam wpływ białka na asocjację badanych sRNA Klasy II do regulowanych przez nie mRNA. Zauważyłam także, że mutacja w miejscu wiązania RNA znajdującym się na bocznej stronie Hfq zatrzymywała MgrR i ChiX na białku i uniemożliwiała ich asocjację do mRNA. Co więcej, stwierdziłam, że mutacje w miejscach wiązania RNA na stronach dystalnej i proksymalnej miały bardziej negatywny wpływ na wiązanie MgrR do eptB lub ygdQ niż na wiązanie ChiX do chiP. Jest to zgodne z danymi innych badaczy, potwierdzającymi silniejsze oddziaływanie ChiX z przeciwległymi powierzchniami białka. Wykorzystując program KinTek Explorer wyznaczyłam kinetycznie preferowane ścieżki dla wykonanych reakcji asocjacji. Na ich podstawie zauważyłam, że strona dystalna Hfq jest miejscem wiązania kompetytorowego RNA, które warunkuje uwalnianie kompleksu sRNA Klasy II-mRNA od białka. Obserwację tę potwierdziłam przeprowadzając analizy kinetyk dysocjacji kompleksu ChiX-chiP od Hfq, indukowane obecnością dodatkowej cząsteczki sRNA. Podsumowując, wyniki wykonanych eksperymentów pokazały, że zarówno MgrR jak i ChiX wykorzystują typowy dla sRNA Klasy II model oddziaływania z Hfq. Jednakże cząsteczki te różnią się powinowactwem do poszczególnych miejsc wiązania RNA na powierzchni badanego białka opiekuńczego. Proponuję, że obserwowane różnice mogą mieć wpływ na fizjologiczną rolę badanych sRNA, zapewniającą przystosowanie komórek bakteryjnych do zmieniających się warunków środowiska.In bacteria, small noncoding RNAs (sRNAs) are involved in response to changes in environmental conditions. The Hfq protein facilitates the base-pairing of sRNAs to their target mRNAs in Escherichia coli and related bacteria. This protein utilizes three distinct RNA binding sites to facilitate RNA interactions. Based on the sRNAs accumulation profile in cells carrying the Hfq protein with mutations in RNA binding sites, sRNAs were previously divided into two classes. Most tested sRNAs showed an overall decrease in accumulation in the rim mutants. These so-called Class I sRNAs bind to the proximal face of Hfq using their 3ʹ-terminal uridine tails, while their internal UA-rich sequences contact the rim of Hfq ring. mRNAs regulated by these sRNAs bind to the distal face of Hfq using repeated ARN sequences. However, a subset of sRNAs, called Class II, were reduced in the distal and proximal face mutants but the levels of a subset of sRNAs increased in the rim mutants. These results suggested that Class II sRNAs interact with opposite sites of the ring, while their target mRNAs interact with the rim of Hfq. In the presented PhD dissertation, the contribution of Hfq protein to association of Class II sRNAs MgrR and ChiX to eptB or ygdQ and chiP mRNAs, respectively, was studied. Firstly, the secondary structures of MgrR and its regulated mRNA fragments were established. Additionally, the affinity of MgrR to RNA recognition sites in Hfq and its properties in the competition to access to the protein were assessed. Then, KinTek Explorer software was used to globally analyze the kinetics data of MgrR and ChiX annealing to regulated mRNAs in the presence of Hfq and its variants with mutations in RNA binding sites. Finally, the effect of an sRNA competitor on the release of the ChiX-chiP complex from the Hfq protein was tested. Overall, the presented results explained how MgrR is recognized by Hfq. Moreover, the sequence motifs in MgrR, eptB and ygdQ responsible for the binding to the chaperone were indicated. The analysis of kinetics of MgrR and ChiX to regulated mRNAs revealed that mutation in the rim of Hfq was the most detrimental as it trapped each sRNA on the Hfq protein and prevented their annealing to regulated mRNAs. On the other hand, the mutations in the proximal and distal face of Hfq were more detrimental for MgrR than ChiX pairing to respective mRNAs, which suggested that ChiX bound tighter than MgrR to each face of Hfq, which would enable it to remain bound to this protein even when one of the binding sites was mutated. Further studies of the effect of sRNA competitor on ChiX annealing to chiP mRNA in presence of Hfq confirmed the role of the Hfq rim site for chiP mRNA binding to Hfq. Additionally, the analysis of kinetically preferred pathways revealed that the distal face of Hfq is a place for RNA competitor binding, enabling the dissociation of sRNA Class II-mRNA complex from the protein. The effect was confirmed by direct dissociation of ChiX-chiP complex from Hfq induced by sRNA competitor. In summary, the data indicate that besides the major similarities in the modes of both Class II sRNAs binding to Hfq there are also subtle differences between them, which can affect the tuning of sRNA-dependent regulation in the adaptation of bacterial cells to changing environmental conditions.Badania zawarte w rozprawie doktorskiej były finansowane z środków:
1. Narodowego Centrum Nauki – grant OPUS: 2018/31/B/NZ1/02612 „Mechanizmy rozpoznawania RNA przez białko ProQ oraz rola tego białka w oddziaływaniach pomiędzy niekodującymi RNA a regulowanymi mRNA u bakterii Escherichia coli”, kierownik projektu – dr hab. Mikołaj Olejniczak, prof. UAM.
2. Narodowego Centrum Nauki – grant OPUS: 2014/15/B/NZ1/03330 „Regulacja translacji na etapie elongacji przez niekodujące RNA bakterii”, kierownik projektu – dr hab. Mikołaj Olejniczak, prof. UAM.
3. Narodowego Centrum Nauki – grant OPUS: 2011/01/B/NZ1/05325 „Bakteryjne białko opiekuńcze Hfq w regulacji translacji przez niekodujące RNA”, kierownik projektu – dr hab. Mikołaj Olejniczak, prof. UAM.
4. Fundacji na Rzecz Nauki Polskiej – projekt TEAM: 2011-8/5 „Molecular mechanisms of translation regulation by small RNAs of pathogenic bacteria”, kierownik projektu – dr hab. Mikołaj Olejniczak, prof. UAM.
5. Uniwersytetu im. A. Mickiewicza w Poznaniu - grant Dziekana Wydziału Biologii: GDWB-03/2017 pt. „Wpływ antysensownych oligonukleotydów na zmianę ramki odczytu w mRNA dnaX z Escherichia coli”, kierownik projektu – Joanna Kwiatkowska.
6. Krajowego Naukowego Ośrodka Wiodącego (KNOW) Poznańskiego Konsorcjum RNA (01/KNOW2/2014).
7. Narodowego Centrum Badań i Rozwoju – projekt „Paszport do przyszłości - Interdyscyplinarne studia doktoranckie na Wydziale Biologii UAM” (POWR.03.02.00-00-I006/17)
Modified DNAzymes with peroxidase activity. Obtaining, properties and bioanalytical application
No full textWydział ChemiiRozprawa doktorska poświęcona została problematyce zmodyfikowanych układów G-kwadrupleks/hemina jako nowych DNAzymów o aktywności peroksydazowej. Ponieważ niezmodyfikowane DNAzymy wykazują niższą aktywność katalityczną niż zwyczajowo używana w diagnostyce medycznej peroksydaza chrzanowa (HRP), wciąż poszukuje się nowych strategii modyfikacji tych katalizatorów w celu poprawienia ich zdolności katalitycznych. Przedstawione w pracy badania skupiają się na dwóch rodzajach modyfikacji tych układów. Jedną ze strategii było kowalencyjne przyłączenie heminy do oligonukleotydu, które miało na celu zniwelowanie sygnału analitycznego pochodzącego od próby referencyjnej w potencjalnych biosensorach opartych na DNAzymach, ponieważ w przypadku niekowalencyjnych układów obecna w tej próbie jest hemina, która posiada niewielką aktywność peroksydazową zwiększając sygnał tła. Modyfikacja ta miała również na celu zwiększenie stabilności temperaturowej DNAzymu oraz poprawę siły oddziaływań między heminą a G-kwadrupleksem, a co za tym idzie również zwiększenie aktywności peroksydazowej. Drugim typem modyfikacji było przyłączenie do oligonukleotydu kropki kwantowej jako generatora reaktywnych form tlenu. Modyfikacja ta miała na celu uniknięcie dodatku nadtlenku wodoru do medium reakcyjnego oraz możliwość przeprowadzenia reakcji indukowanej światłem wobec odpowiednich substratów organicznych.The doctoral dissertation is devoted to the problem of modified G quadruplex/hemin systems as new DNAzymes with peroxidase activity. As unmodified DNAzymes have lower catalytic activity than horseradish peroxidase (HRP) conventionally used in medical diagnostics. New strategies for modifying these catalysts in order to improve their catalytic abilities are still being sought. The presented research focuses on two types of modification of these systems. One strategy was to covalently attach hemin to the oligonucleotide to eliminate the analytical signal from the reference sample in potential DNAzyme-based biosensors, since in non-covalent systems, hemin is present in reference samples, and hemin itself possess some peroxidase activity what increases the background signal. This modification was also aimed at increasing the temperature stability of DNAzyme and improving the strength of interactions between hemin and G-quadruplex, and thus also improve the peroxidase activity of DNAzymes. The second type of modification was the attachment of a quantum dot to the oligonucleotide as a generator of reactive oxygen species. This modification was aimed at avoiding the addition of hydrogen peroxide to the reaction medium and the possibility of carrying out the light-induced reaction with appropriate organic substrates
When archaeology meets environmental sciences: the Bruszczewo site revisited
Get PDFSettlement archaeology is often supported by geoarchaeology in which human
habitation is drawn on the timeframe of landscape changes derived through interdisciplinary
research. An example of a geoarchaeological approach to settlement study is the Bruszczewo
Lake project conducted in Central-Western Poland. The area of Bruszczewo and the Samica
River Valley witnessed human occupation since the Neolithic period and is most widely known
for the presence of an Early Bronze Age fortified settlement. Previous research provided
initial information about the presence of a lake and marshland in prehistoric and early historical
times. A new geoarchaeological project aims to create a detailed environmental and landscape
transformation history combined with the extensive knowledge of the archaeology of the area.
Using GIS techniques, conventional drilling, and vibra-coring, a new set of data is brought to
light and analysed in palaeoenvironmental terms. Constructed geological profiles across the
valley revealed the basin’s morphology and provided insight into the subsequent landscape
transformation phases, from the Late Glacial ribbon lake lasting until the end of the Bronze
Age to the marshlands that thrived until the Early Medieval period. The ongoing analyses of
samples derived from drillings provide a perspective for detailed reconstructions of landscape
changes.218235Treasures of Time: Research of the Faculty of Archaeology of Adam Mickiewicz University in Pozna
The barrow culture of the Upper Dniester Basin in the 3 rd and 2 nd millennia BC: The Polish-Ukrainian research projects
Get PDFSince 2009, the international Upper Dniester Expedition has conducted field research
(field-walking surveys, non-invasive and excavation) and analytical studies in the Eastern
Transcarpathia. These investigations are part of a broader research programme – a study of
‘The Biocultural Borderland between the East and the West of Europe’. The projects concern
a comprehensive reconnaissance of barrow cemeteries dated to the 3 rd and 2 nd millennia BC,
located in the mixed forest-steppe and forest belt in the basin of the Upper Dniester River. For
almost 1500 years, this type of funeral architecture shaped the ‘mortuary landscapes’ of the
communities successively inhabiting that area. Hence, the barrow cemeteries are an important
source for understanding the mechanisms and trajectories of cultural development in this part
of Europe, and consequently the subject of intensive studies within several research projects.
This article describes the aims and results of two already completed and one ongoing
project in the Upper Dniester Basin. Thanks to the use of modern research methods, both
in the field of archaeology and ‘archaeological sciences’, it has been possible to present a
wide spectrum of regularities/principles concerning the ‘barrow landscapes’, the chronology
of the creation of selected cemeteries, and the construction of regular, linear arrangements of
barrows. Furthermore, the projects have and are providing large collections of archaeological
(ceramic, lithic, metals, etc.), anthropological, archaeobotanical and archaeofaunal material for
future analyses.176195Treasures of Time: Research of the Faculty of Archaeology of Adam Mickiewicz University in Pozna