26023 research outputs found
Sort by
Cyclic mismatch binding ligands interact with disease-associated CGG trinucleotide repeats in RNA and suppress their translation
No full textFragile X-associated tremor/ataxia syndrome (FXTAS) is a late-onset neurodegenerative disorder caused by a limited expansion of CGG repeats in the FMR1 gene. Degeneration of neurons in FXTAS cell models can be triggered by accumulation of polyglycine protein (FMRpolyG), a by-product of translation initiated upstream to the repeats. Specific aims of our work included testing if naphthyridine-based molecules could (1) block FMRpolyG synthesis by binding to CGG repeats in RNA, (2) reverse pathological alterations in affected cells and (3) preserve the content of FMRP, translated from the same FMR1 mRNA. We demonstrate that cyclic mismatch binding ligand CMBL4c binds to RNA structure formed by CGG repeats and attenuates translation of FMRpolyG and formation of nuclear inclusions in cells transfected with vectors expressing RNA with expanded CGG repeats. Moreover, our results indicate that CMBL4c delivery can reduce FMRpolyG-mediated cytotoxicity and apoptosis. Importantly, its therapeutic potential is also observed once the inclusions are already formed. We also show that CMBL4c-driven FMRpolyG loss is accompanied by partial FMRP reduction. As complete loss of FMRP induces FXS in children, future experiments should aim at evaluation of CMBL4c therapeutic intervention in differentiated tissues, in which FMRpolyG translation inhibition might outweigh adverse effects related to FMRP depletion.This work was supported by the National Centre for Research and Development grant ERA- NET-E-Rare-2/III/DRUG_FXSPREMUT/01/2016 (to KS), Foundation for Polish Science-TEAM program cofinanced by the European Union within the European Regional Development Fund (TEAM POIR.04.04.00-00-5C0C/17-00 to KS), by the National Science Centre grants: 2020/38/A/NZ3/00498 (to KS), 2018/30/E/NZ5/00065 (to PK), 2014/15/B/NZ5/00142 (to ESK), 2020/37/B/NZ5/01263 (to ESK) and 2017/24/C/NZ1/00112(to KT), and JSPS KAKENHI Grant-in-Aid for Specially Promoted Research (26000007 to KN)
The issue of raw material security in the programs of the largest Polish political parties in the parliamentary elections in 2019
No full textPrzedmiotem badań niniejszego artykułu jest wizja kreowania polityki energetycznej obecna w programach politycznych największych polskich partii politycznych w 2019 roku. Należy podkreślić, iż głównym jej celem jest zapewnienie bezpieczeństwa energetycznego. Celami podjętych przez autora badań jest wskazanie, omówienie i porównanie koncepcji zapewnienia Polsce bezpieczeństwa energetycznego w przypadku wygrania wyborów parlamentarnych. Do osiągnięcia tak określonych celów badań posłużyły następujące problemy badawcze: w jakim zakresie zapewnienie Polsce bezpieczeństwa energetycznego jest obecne w analizowanych programach politycznych? Poprzez jakie narzędzia największe partie polityczne w Polsce kreowały energetyczny wymiar bezpieczeństwa? Jakie główne trudności w zapewnieniu bezpieczeństwa energetycznego Polski uwypuklają badane partie polityczne? Czy istnieje zbieżność partii politycznych w wizji zagwarantowania Polsce bezpieczeństwa energetycznego? W poniższym artykule posłużono się następującymi metodami badawczymi: porównawczą oraz analizy źródeł. Zastosowano również technikę analizy treści.The subject of this article is the vision for energy policy in the political programs of the largest Polish political parties in 2019. It should be emphasized that energy policy’s main goal is to ensure energy security. The aim of the research undertaken by the author is to identify, discuss and compare the concepts for ensuring Poland’s energy security in the event of various parties winning the parliamentary elections. The following research problems were used to achieve the research objectives defined in this way: to what extent is Poland’s energy security present in the analyzed political programs? Through what tools have the largest political parties in Poland created the energy dimension of security? What are the main difficulties in ensuring Poland’s energy security highlighted by the political parties studied? Is there a convergence of political parties in the vision of guaranteeing Poland’s energy security? The following research methods were used in the article: comparative and source analysis. The content analysis technique was also used.11931Środkowoeuropejskie Studia Polityczn
The functioning and activities of the Central Commission for the Investigation of German/Nazi Crimes in Poland in the years 1945-1984, with particular emphasis on Poznan branch
No full textWydział Prawa i AdministracjiRozprawa doktorska opracowana została pod kątem dziedziny nauki, jaką jest historia prawa. Praca podzielona została na trzy obszerne rozdziały dotyczące; podstaw prawnych ścigania zbrodniarzy hitlerowskich, funkcjonowania Głównej Komisji oraz dziejów jej Oddziału w Poznaniu. Główna Komisja zajmowała się zbieraniem materiału dowodowego koniecznego do formułowania aktów oskarżenia przeciwko podejrzanym o zbrodnie popełnione podczas drugiej wojny światowej. Większa ich część wykorzystywana była, celem ekstradowania ujętych w dawnej III Rzeszy zbrodniarzy i osądzenia ich przed sądami polskimi. Główna Komisja oraz jej oddziały, prowadziła też samodzielnie postępowania przygotowawcze przeciwko zbrodniarzom hitlerowskim. Gromadzenie i zbieranie dokumentów, prace ekshumacyjne i osobowe źródła dowodowe, pozyskiwane były również ze względów naukowych i historycznych. Część rozprawy doktorskiej obejmuje powstanie, funkcjonowanie i działalność Okręgowej Komisji w Poznaniu. W oddziale tym prowadzono zakrojone na szeroką skalę, prace ekshumacyjne i dokumentacyjne. Ogrom zadań, jaki wzięli na siebie mieszkańcy stolicy Wielkopolski, wykonywany był społecznie. Rozprawa doktorska jest pierwszym opracowaniem dotyczącym Głównej Komisji pod kątem nauk historyczno-prawnych i pierwszym w ogóle dotyczącym Okręgowej Komisji w Poznaniu.The PhD thesis has been prepared in terms of the history of law as a field of study and is composed of three parts. The work has been divided into three extensive chapters covering : the legal basis for the prosecution of the Nazi criminals, the functioning of the Central Commission and the history of its branch in Poznań. The Central Commission was collecting evidence necessary to formulate indictments against suspects of crimes committed during the Second World War. Most of them were used to extradite criminals caught in the former Third Reich and tried them before Polish courts. The Central Commission and its branches also conducted independent preparatory proceedings against Nazi criminals. Collecting documents, exhumation works and personal evidence sources were also obtained for scholarly and historical reasons. Part of this doctoral dissertation covers the establishment, functioning and activity of the Central Commission branch in Poznań, where very extensive exhumation and documentation works were carried out. The enormity of the tasks undertaken by the inhabitants of the capital of Greater Poland was performed by volunteers. The doctoral dissertation is the first study on the Central Commission in terms of historical and legal matters and the first one concerning the Central Commission branch in Poznań
Situational curiosity and interest in the glottodidactic process. Research study including adolescents learning English as a foreign language
Get PDFWydział NeofilologiiGłównym celem niniejszej rozprawy było zbadanie znaczenia i roli ciekawości sytuacyjnej oraz zainteresowania w procesie glottodydaktycznym. W projekcie badawczym trwającym od 2017 r. do 2019 r. uczestniczyło 50 uczniów szkoły podstawowej położonej na terenie wiejskim. W toku badania sprawdzono, czy i w jakim stopniu można rozbudzić ciekawość sytuacyjną adolescentów na lekcjach języka angielskiego poprzez: nowe techniki dydaktyczne (gesty kodowane, ruch sceniczny, elementy krajobrazu językowego), niestandardową formę zajęć (projekt teatralny, lekcje terenowe), materiały dydaktyczne o właściwościach potencjalnie wzbudzających zainteresowanie, rozwój myślenia pytajnego. Ponadto podjęto próbę ustalenia zależności pomiędzy poziomem indywidualnego zainteresowania uczniów językiem angielskim a ich ogólną ciekawością poznawczą oraz nastawieniem ich rodziców do znajomości tego języka. Analiza pozyskanego materiału badawczego wykazała, iż podjęte działania dydaktyczne w sposób znaczący rozbudziły ciekawość sytuacyjną uczniów oraz wpłynęły pozytywnie na ich zainteresowanie językiem angielskim. Zaobserwowano także wpływ badanych czynników pozaszkolnych. Zainicjowana i stymulowana u adolescentów ciekawość objawiła się znacząco w sferze afektywnej (pozytywne emocje i wrażenia), w obrębie koncentracji uwagi, w sferze poznawczej oraz w obrębie osobistego zaangażowania.The main aim of the present thesis was to explain the significance and role of curiosity and interest in the glottodidactic process. The research project lasted from 2017 to 2019 and included 50 students from a rural primary school. During the study it was examined if and to what extent adolescents’ situational curiosity in English lessons can be fostered by the means of: new teaching methods (codified gestures, scenic learning, linguistic landscape), unusual forms of teaching (a drama project, out-of-school learning), properties of teaching aids/ materials and enhancing students’ question thinking. What is more, an attempt to observe if early adolescents’ individual interest in a foreign language (English in this case) is in close relation with their epistemic curiosity and their parents’ attitude towards practical knowledge of the language. The analysis of the collected empirical material showed that the didactic actions and measures taken had a significant positive influence on students’ situational curiosity and interest in a foreign language. A positive influence of the out-of-school factors was also observed. Induced and stimulated curiosity in a foreign language emerged significantly at the level of adolescents’ emotions, attention, knowledge and personal engagement
The conscious vs. the intentional stance. Folk psychology strategies in attributing conscious states to other persons
Get PDFWydział Psychologii i KognitywistykiTematem pracy jest próba odpowiedzi na pytanie, czy przypisywanie innym osobom świadomych stanów mentalnych polega na przypisywaniu im stanów fenomenalnych. Zdaniem wielu badaczy świadomości jej podstawową odmianą jest świadomość fenomenalna, która ma być oczywista i uchwytna przez każdego człowieka. Stanowisko to nie było dotąd gruntownie przebadane. W nielicznych dotychczasowych badaniach nad przypisywaniem innym stanów świadomych również skupiano się na atrybucji stanów fenomenalnych, ale ich trafność budzi wątpliwości. Celem raportowanych w tej pracy badań lingwistycznych i kwestionariuszowych było przetestowanie podstawowych założeń fenomenalnego ujęcia świadomości: tez o fenomenalności i o oczywistości świadomego przeżycia. Uzyskane wyniki wskazują, że laicy nie podzielają fenomenalnego ujęcia świadomości z ekspertami, jak również potwierdzają wątpliwości co do trafności wcześniejszych badań. Jaki jest zatem potoczny obraz świadomości? Autor postuluje zastąpienie rozważanego w literaturze nastawienia fenomenalnego, polegającego na przypisywaniu innym stanów fenomenalnych, rozumianym znacznie szerzej nastawieniem świadomościowym, zgodnie z którym dokonujemy atrybucji świadomości innym aby przewidzieć ich przyszłe stany umysłowe.The topic of this work is an attempt to answer the question of whether attributing conscious mental states to others consists of attributing phenomenal states to them. For many scholars of consciousness, the basic type of consciousness is phenomenal consciousness, which is supposed to be both obvious and graspable by the each person. This view was never subjected to an exhaustive empirical examination: while sparse studies that were performed focused on attributions of phenomenal states, their validity raises concerns. The aim of the linguistic and questionnaire research reported here was to test the fundamental assumptions of the phenomenal reading of consciousness: the phenomenal and the obviousness claims. The outcomes indicate that laypersons do not share this phenomenal view with experts, and corroborate the validity concerns regarding earlier studies on the subject. What is, then, the folk view about consciousness? The author postulates replacing the phenomenal stance, tendency to attribute phenomenal stance to others, with a more broadly understood conscious stance, according to which we attribute consciousness to others to predict their future mental states
Produktywność naukowa – uczelnie badawcze i ich kadra akademicka
Get PDFRośnie intensywność stratyfikacji według produktywności badawczej w ramach profesji akademickiej. Na poziomie indywidualnym, społeczna stratyfikacja w nauce oznacza, że społeczność naukowa nie jest „grupą równych”. Raczej jest tak, że niewielki odsetek naukowców „wnosi niewspółmiernie duży wkład w rozwój nauki i otrzymuje nieproporcjonalnie dużą część nagród i środków potrzebnych na badania” (Zuckerman 1988: 526). Na różnych poziomach analizy oznacza to, że „jednostki, grupy, laboratoria, instytuty, uniwersytety, czasopisma, pola i specjalności, teorie i metody są nieustannie oceniane i klasyfikowane według prestiżu”, który opiera się na badaniach i publikacjach (Zuckerman 1988: 526). Dla naukowców uznanie ich pracy jest „jedynym oczywistym dowodem na to, że to, co zrobili, ma znaczenie dla nauki” (Zuckerman 1988: 526). W nauce uznanie przekłada się na środki na dalsze badania, a dystrybucja nagród akademickich – oraz finansowanie badań – jest silnie podzielona. Jedni dostają wiele, drudzy dostają mniej, a jeszcze inni nie dostają ich (nagród i finansowania) wcale. Zawsze tak było i zawsze tak będzie, chyba że zmieni się koncepcja uprawiania nauki akademickiej, która w tej chwili – w ramach obowiązującego paradygmatu – wydaje się najbardziej racjonalna. Koncepcja ta sprawia, że naukowcy pracują po 50-60 godzin tygodniowo i najczęściej, jak pokazują wieloletnie międzynarodowe badania porównawcze kadry akademickiej, są ze swojej pracy zadowoleni. Mniej zadowoleni mogą z niej być wykładowcy akademiccy, zwłaszcza w systemach silnie rozgraniczających działalność dydaktyczną i naukową – których tradycyjny system nagradzania w nauce akademickiej siłą rzeczy nie obejmuje. Istotne jest rozróżnienie na pracę w szkolnictwie wyższym, między innymi na uniwersytecie, i zajmowanie się akademickimi badaniami naukowymi. Jedno z drugim nie musi się łączyć, to częsty przypadek w mniej konkurencyjnych systemach
Akademia Królewska
Get PDFPierwsza część książki „Collegium Minus w Poznaniu” wydanej w serii „Zabytki Poznania” poświęcona historii i architekturze siedziby pruskiej Akademii Królewskiej, która po I wojnie światowej stała się jednym z głównych gmachów Uniwersytetu Poznańskiego. Kompleks składający się z reprezentacyjnej Auli i budynku dydaktyczno-administracyjnego pierwotnie stanowił istotny element zaprojektowanego na początku XX wieku założenia architektoniczno-urbanistycznego tzw. Dzielnicy Zamkowej, po przejęciu przez władze polskie – jako Collegium Minus – stał się emblematem akademickiego Poznania
Defectiveness of the resolutions in partnerships
No full textWydział Prawa i AdministracjiNiniejsza praca za cel stawia sobie gruntowne zbadanie problematyki wadliwości uchwał spółek osobowych. Tematyka ta, choć w praktyce nie mniej doniosła niż w przypadku spółek kapitałowych, jak dotąd nie spotkała się bowiem z równym zainteresowaniem ze strony piśmiennictwa. Punktem wyjścia dla prowadzonych rozważań, jest zawarta w Rozdziale I analiza cywilnoprawnego charakteru uchwał oraz ich miejsca na tle pozostałych, kolektywnych decyzji, jakie podejmowane są w ramach struktur wewnętrznych spółek osobowych. W kolejnych trzech rozdziałach (Rozdziały II-IV) omawiane są natomiast rodzajowo wyróżnione naruszenia, jakie skutkować mogą wadliwością uchwały. W szczególności badane są konsekwencje sprzeczności z ustawą, umową spółki oraz pozostałymi normami o charakterze pozaustawowym. Rozważania te przede wszystkim koncentrują się wokół odpowiedzi na pytania dotyczące wpływu poszczególnych naruszeń na skuteczność uchwał, dopuszczalności ich zaskarżania oraz właściwości przepisów mających zastosowanie w poszczególnych przypadkach naruszeń. Praktycznym skutkom tych uchybień poświęcony został natomiast Rozdział V, dotyczący procesowych aspektów zaskarżania uchwał spółek osobowych. Całość pracy kończą wnioski de lege lata oceniające obecny stan przedmiotowej regulacji oraz wnioski de lege ferenda, w których zaproponowane zostały kierunki zmian legislacyjnych w zakresie omawianej regulacji.The aim of this thesis is to examine the issue of defectiveness of the resolutions in partnerships. This issue shows a great importance for the practice, even though it has not been yet a subject of a more comprehensive academic study. Chapter I contains the analysis of the legal nature of the resolutions and study the relation between the resolutions and the other collective decisions that are made by partners. The following three chapters (Chapters II-IV) discuss various violations that may result in a resolution being defective. In particular, the consequences of the resolution being contrary to the statute law and it’s violations of the articles of association and other standards are examined. This part of the thesis mainly focuses on how each of the violations effect the resolution and if is it possible to challenge the resolution on these grounds. It is also discussed which of the statutory provisions shall be applied in a case of each violation. Chapter V focuses on the procedural aspects of challenging the resolutions at court. The thesis is summarized by de lege lata conclusions in which an assessment of the current state of the regulation concerning partners’ resolutions is made. In the following de lege ferenda conclusions some legal changes for the future are proposed
Profesjonalna wiedza i świadomość nauczyciela w izraelskich szkołach
Get PDFWydział Studiów EdukacyjnychThe aim of the study is to examine the professional knowledge and awareness of teachers for traditional or innovative teaching in an environment that includes scientific and technological development and rapid changes of a global world, in schools in Israel. Also, creating a theoretical model and practical guidelines for developing professional knowledge and teachers' awareness. The doctoral dissertation and definition of teacher awareness is based on the theory of Illeris, a social constructivist theory that links teacher awareness to environmental interaction. The literary review focuses on Multidimensional Contexts teachers' knowledge and its relation to teacher awareness, opportunities and barriers to learning awareness. Also, defining awareness as an interdisciplinary category, new modern human needs and the need of teachers to see the “big picture” and adapt teaching to the changing environment. In addition, the unique physical and organizational characteristics of schools in Israeli society, traditional and modern teaching, professional development of teachers and their effects on the of teachers in Israel. The methodology is based on the mixed method approach that combines two research methods, quantitative and qualitative, for a deeper insight into experimental diagnostic research. The independent variables are professional knowledge and teacher awareness, the dependent variable is the schools in Israel. The number of study participants included 90 science and technology teachers from Jewish elementary schools. The conclusions of the study showed that Israeli teachers are more aware of traditional teaching in cognitive, emotional and social functioning. Teachers who have been trained about globalization have a The aim of the study is to examine the professional knowledge and awareness of teachers for traditional or innovative teaching in an environment that includes scientific and technological development and rapid changes of a global world, in schools in Israel. Also, creating a theoretical model and practical guidelines for developing professional knowledge and teachers' awareness. The doctoral dissertation and definition of teacher awareness is based on the theory of Illeris, a social constructivist theory that links teacher awareness to environmental interaction. The literary review focuses on Multidimensional Contexts teachers' knowledge and its relation to teacher awareness, opportunities and barriers to learning awareness. Also, defining awareness as an interdisciplinary category, new modern human needs and the need of teachers to see the “big picture” and adapt teaching to the changing environment. In addition, the unique physical and organizational characteristics of schools in Israeli society, traditional and modern teaching, professional development of teachers and their effects on the of teachers in Israel. The methodology is based on the mixed method approach that combines two research methods, quantitative and qualitative, for a deeper insight into experimental diagnostic research. The independent variables are professional knowledge and teacher awareness, the dependent variable is the schools in Israel. The number of study participants included 90 science and technology teachers from Jewish elementary schools. The conclusions of the study showed that Israeli teachers are more aware of traditional teaching in cognitive, emotional and social functioning. Teachers who have been trained about globalization have a much higher awareness of innovative teaching compared to those who do not. Israeli women teachers have a higher awareness of innovative teaching compared to male teachers, and young Israeli teachers have a higher awareness of innovative teaching compared to older teachers, but adapt to the existing traditional school reality.Celem badania jest zbadanie profesjonalnej wiedzy i świadomości nauczycieli w zakresie tradycyjnego lub innowacyjnego nauczania w środowisku obejmującym rozwój naukowy i technologiczny oraz szybkie zmiany w globalnym świecie, w szkołach w Izraelu. Stworzenie modelu teoretycznego i praktycznych wskazówek dla rozwijania wiedzy zawodowej i świadomości nauczycieli. Rozprawa doktorska i definicja świadomości nauczyciela oparta jest na teorii Illerisa, społecznej konstruktywistycznej teorii, która łączy świadomość nauczyciela z interakcjami środowiskowymi. Przegląd literacki koncentruje się na wiedzy nauczycieli kontekstów wielowymiarowych i jej związku ze świadomością nauczycieli, możliwościami i barierami w świadomości uczenia się. Ponadto zdefiniowanie świadomości jako kategorii interdyscyplinarnej, nowych potrzeb współczesnego człowieka i potrzeby nauczycieli, aby zobaczyć „duży obraz” i dostosować nauczanie do zmieniającego się środowiska. Ponadto wyjątkowe cechy fizyczne i organizacyjne szkół w izraelskim społeczeństwie, tradycyjne i nowoczesne nauczanie, rozwój zawodowy nauczycieli i ich wpływ na nauczycieli w Izraelu. Metodologia opiera się na podejściu metody mieszanej, które łączy dwie metody badawcze, ilościową i jakościową, w celu głębszego wglądu w eksperymentalne badania diagnostyczne. Zmiennymi niezależnymi są wiedza zawodowa i świadomość nauczycieli, zmienną zależną są szkoły w Izraelu. Wśród uczestników badania było 90 nauczycieli przedmiotów ścisłych i technicznych z żydowskich szkół podstawowych. Wnioski z badania pokazały, że izraelscy nauczyciele są bardziej świadomi tradycyjnego nauczania w zakresie funkcjonowania poznawczego, emocjonalnego i społecznego. Nauczyciele, którzy zostali przeszkoleni w zakresie globalizacji, mają znacznie większą świadomość innowacyjnego nauczania niż ci, którzy tego nie robią. Izraelskie nauczycielki mają większą świadomość innowacyjnego nauczania niż nauczyciele płci męskiej, a młodzi izraelscy nauczyciele mają większą świadomość innowacyjnego nauczania w porównaniu ze starszymi nauczycielami, ale dostosowują się do istniejącej tradycyjnej rzeczywistości szkolnej
PRP40 mediates the communication between transcription, splicing and miRNA biogenesis
No full textWydział BiologiiMicroRNA (miRNA) są to krótkie cząsteczki RNA biorące udział w regulacji ekspresji wielu genów. Transkrybowane są przez polimerazę RNA II (RNAPII) jako prekursorowe miRNA (pri-miRNA), które następnie ulegają przekształceniu w dojrzałe cząsteczki miRNA z udziałem kompleksu nazywanego mikroprocesorem. Kompleks ten jest zbudowany z trzech głównych białek: endorybonukleazy DCL1 (Dicer like 1), SERRATE oraz HYL1 (Hyponasic Leaves 1). Z mikroprocesorem odziałują także inne białka, takie jak: TGH (TOUGH), helikaza CHR2 (Chromatin Remodeling Factor 2), fosfataza CPL1 (C-Terminal Domain Phosphatase-like), SMA1 (Small 1), HOS1 (High Expression of Osmotically Responsive Genes 1), CDF2 (Cyclin DOF 2), NOT2a oraz NOT2b (Negative on TATA Less 2). Poza biogenezą miRNA, białko SERRATE zaangażowane jest w proces alternatywnego splicingu, oddziałuje z kompleksem CBC oraz białkami pomocniczymi U1 snRNP, takimi jak PRP40. Ponieważ PRP40 oddziałuje również z domeną CTD polimerazy RNA II (RNAPII), może pośredniczyć w komunikacji pomiędzy polimerazą a mikroprocesorem. W niniejszej pracy postanowiłem zbadać rolę białka PRP40 w komunikacji pomiędzy transkrypcją, splicingiem oraz biogenezą miRNA. Wykorzystując metody mikroskopii konfokalnej pokazałem, że PRP40 pośredniczy w asocjacji U1-70K oraz SERRATE z kompleksem RNAPII. W mutancie prp40ab zaobserwowałem spadek kolokalizacji obu tych białek z aktywną transkrypcyjnie RNAPII (z fosforylowaną seryną 5 i seryną 2 w domenie CTD). Poza tym, w mutancie prp40ab oraz se-2 obniżeniu ulega także asocjacja DCL1 z kompleksem RNAPII. Otrzymane dane wskazują, że PRP40 i SERRATE wpływają na kolokalizację DCL1 i RNAPII. W przeciwieństwie do tego, asocjacja białka HYL1 z aktywną transkrypcyjnie RNAPII jest niezależna od SERRATE. Otrzymane dane pozwoliły mi zaproponować model kotranskrypcyjnego tworzenia kompleksu mikroprocesora i rozpoznania miejsca splicingowego 5'. Zgodnie z nim, białko PRP40, oddziałując z domeną CTD RNAPII, pośredniczy w asocjacji SERRATE z RNAPII. Na etapie inicjacji transkrypcji, do kompleksu RNAPII dołącza także białko HYL1, jednak jego asocjacja z kompleksem polimerazy RNA II jest niezależna od SERRATE. Następnie, w trakcie elongacji, do kompleksu RNAPII rekrutowany jest U1 snRNP, jeżeli w powstającym miRNA znajduje miejsce 5’ SS. Na tym etapie do mikroprocesora dołącza także białko DCL1, przy czym jego asocjacja z kompleksem RNAPII regulowana jest przez PRP40 oraz SERRATE. Obecnie uważa się, że miejscem biogenezy miRNA są struktury D (ang. dicing bodies, D-bodies). Wykorzystując metody mikroskopowe, takie jak hybrydyzacja FISH (ang. fluorescence in situ hybridization) oraz RNA Stellaris, zlokalizowałem pri-miRNA163 oraz pri-miRNA156a w jądrze komórkowym. Oba te prekursory gromadzą się w specyficznych ciałach jądrowych. Przeprowadzone badania pokazały jednak, że opisane przez mnie struktury, chociaż zawierają nowe transkrypty oraz białka biorące udział w biogenezie miRNA, nie są ciałami D. Wyniki moich badań wskazują, że biogeneza miRNA u roślin jest procesem kotranskrypcyjnym.MiRNAs are short, non-coding RNAs which are engaged in the regulation of many genes. They are transcribed by RNA polymerase II (RNAPII) as long precursors (pri-miRNAs) which then are processed to mature miRNAs. The processing of pri-miRNAs to miRNAs is catalyzed by the complex called Microprocessor, consisting of endoribonuclease Dicer like 1 (DCL1), SERRATE (SE) and Hyponastic Leaves 1 (HYL1). In addition, several proteins like TGH (TOUGH), helicase CHR2 (Chromatin Remodeling Factor 2), phosphatase CPL1 (C-Terminal Domain Phosphatase-like), SMA1 (Small 1), HOS1 (High Expression of Osmotically Responsive Genes 1), CDF2 (Cyclin DOF 2), NOT2a and NOT2b (Negative on TATA Less 2) have been found to be involved in plant miRNA biogenesis. It has been shown that SERRATE is engaged in the regulation of alternative splicing and interacts with the nuclear cap-binding complex (CBC) as well as auxiliary proteins of U1 snRNP, like PRP40. On the other hand, it has been also reported that PRP40 interacts with the CTD domain of RNAPII. In this project I have investigated the role of PRP40 in the communication between transcription, splicing and miRNA biogenesis. To this end, I have applied confocal microscopy approaches and found that PRP40 affects the association of SERRATE and U1-70K (a core protein of U1 snRNP) with RNAPII. In the prp40ab mutant, co-localization between these proteins and transcriptionally active RNAPII (phosphorylated at serine 5 and serine 2 in its CTD domain) was decreased in comparison with WT plants. Interestingly, I have also found that co-localization of DCL1 with RNAPII is also decreased in prp40ab and se-2 mutants. On the contrary to that, the association of HYL1 with RNAPII is SERRATE-independent. I did not find any changes in co-localization of HYL1 and RNAPII in the se-2 mutant. The obtained results let me to propose a model presenting co-transcriptional assembly of the Microprocessor complex. According to the model, PRP40 interacts with the CTD domain of RNAPII and mediates the association of SERRATE with RNAPII. At the transcription initiation stage, HYL1 is also recruited to the RNAPII complex, however, in the SERRATE-independent manner. Next, at the transcription elongation stage, U1 snRNP associates with RNAPII if a primary transcript contains a 5’ SS. At this step, DCL1 is also recruited and its association with RNAPII depends on presence of PRP40 and SERRATE, but not HYL1. Currently, it is commonly accepted that miRNA biogenesis in plants occurs in special nuclear structures - dicing bodies (D-bodies). By the application of FISH (fluorescence in situ hybridization) and RNA Stellaris methods I have localized pri-miRNA163 and pri-miRNA156 in one or two nuclear bodies containing newly synthesized transcripts and proteins engaged in miRNA biogenesis. Interestingly, the described by me nuclear structures containing pri-miRNAs are not D-bodies, supporting the idea of co-transcriptional miRNA biogenesis in plant.Narodowego Centrum Nauki (NCN), granty:
- UMO-2013/10/A/NZ1/00557 (MAESTRO), kierownik projektu: prof. dr. hab. Artur Jarmołowski, tytuł projektu: Molekularne interakcje pomiędzy białkami kompleksu dojrzewania mikroRNA i czynnikami odpowiedzialnymi za splicing i poliadenylację u roślin.
- UMO-2016/23/N/NZ1/00010 (PRELUDIUM), kierownik projektu: mgr Tomasz Gulanicz, tytuł projektu: Nowe ciała jądrowe zawierające prekursory miRNA i ich rola w biogenezie roślinnych miRNA.
2. Poznańskiego Konsorcjum RNA KNOW (01/KNOW2/2014).
Autor uzyskał także środki finansowe na przygotowanie rozprawy doktorskiej z Narodowego Centrum Nauki (ETIUDA) na podstawie decyzji numer UMO-2019/32/T/NZ1/00508, tytuł projektu: PRP40 pośredniczy w komunikacji pomiędzy transkrypcją, splicingiem i biogenezą miRNA