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Regulation of the immune response observed in experimental PCM by the cytokines IL-27 and IL-35
No full textA Paracoccidioidomicose (PCM) é uma micose sistêmica endêmica na América Latina, especialmente no Brasil, e envolve complexa interação entre o patógeno e o sistema imunológico do hospedeiro. O objetivo deste trabalho é identificar o papel das citocinas IL-27 e IL-35 na regulação imunológica durante a infecção pelo fungo Paracoccidioides brasiliensis em modelos murinos. Foram utilizados camundongos selvagens (WT) e geneticamente deficientes para o receptor de IL-27 (IL-27R-/-) e a subunidade da citocina IL-27 e IL-35 (Ebi3-/-), infectados com a cepa Pb18 de P. brasiliensis. Foram analisadas as três fases da infecção: 15, 30 e 60 dias pós-infecção (d.p.i.). Este trabalho visa entender se a ausência dessas citocinas pode impactar na resposta imune, na formação de granulomas pulmonares, na carga fúngica e na sobrevida dos animais. Os principais achados demonstraram que a IL-27 é produzida durante a infecção e que a ausência de sua sinalização via receptor (IL-27R), assim como o Ebi3, compromete a capacidade do hospedeiro de controlar a infecção, resultando em maior carga fúngica e diminuição da sobrevida. A deficiência dessas citocinas também afetou negativamente o perfil das células mieloides e linfoides, especialmente as células T efetoras CD4 e CD8, além das células Treg convencionais (Foxp3+) e Tr1 (Foxp3-), fundamentais para a imunorregulação. A análise molecular revelou alterações significativas na expressão de genes relacionados a vias pró e anti-inflamatórias, além de alterações nas vias de sinalização associadas à ativação e função das células T reguladoras. Esses resultados sugerem que IL-27 e IL-35 possuem papéis centrais na modulação da resposta imune e no equilíbrio entre resistência e suscetibilidade à PCM. O estudo contribuiu com a caracterização inicial, para que os mecanismos imunorregulatórios envolvidos na PCM possam ser melhor explorados futuramente, destacando o potencial das citocinas IL-27 e IL-35 como alvos terapêuticos para modular a resposta inflamatória e melhorar o prognóstico da doença.Paracoccidioidomycosis (PCM) is a systemic mycosis endemic in Latin America, especially in Brazil, and involves a complex interaction between the pathogen and the host immune system. The aim of this study was to identify the role of the cytokines IL-27 and IL-35 in immune regulation during infection by the fungus Paracoccidioides brasiliensis in murine models. Wild-type (WT) and genetically deficient mice for the IL-27 receptor (IL-27R-/-) and the cytokine subunit IL-27 and IL-35 (Ebi3-/-) were infected with the P. brasiliensis Pb18 strain. The three phases were tested: 15, 30 and 60 days post-infection (d.p.i.). This study aims to understand whether the absence of these cytokines can impact the immune response, the formation of pulmonary granulomas, the fungal load and the survival of the animals. The main findings demonstrated that IL-27 is produced during infection and that the absence of its signaling via receptor (IL-27R), as well as Ebi3, compromises the host\'s ability to control the infection, resulting in increased fungal burden and decreased survival. The deficiency of these cytokines also affects the profile of myeloid and lymphoid cells, especially CD4 and CD8 effector T cells, in addition to conventional Treg (Foxp3+) and Tr1 (Foxp3-) cells, which are essential for immunoregulation. Molecular analysis revealed significant alterations in the expression of genes related to pro- and anti-inflammatory pathways, in addition to alterations in the signaling pathways associated with the activation and function of regulatory T cells. These results suggest that IL-27 and IL-35 have central roles in modulating the immune response and in the balance between resistance and susceptibility to PCM. The study contributed to the initial characterization, so that the immunoregulatory mechanisms involved in PCM can be better explored in the future, highlighting the potential of cytokines IL-27 and IL-35 as therapeutic targets to modulate the inflammatory response and improve the prognosis of the disease
Tarsila, filha querida,: Lydia Dias de Aguiar do Amaral writes to Tarsila do Amaral.
Get PDFEsta dissertação apresenta a edição de texto fidedigno, com estudo introdutório, de 55 cartas de Lydia Dias de Aguiar do Amaral (1866-1948) à sua filha, a artista plástica modernista Tarsila do Amaral (1886-1973), documentação preservada no Fundo Tarsila do Amaral, no Instituto de Estudos Brasileiros da Universidade de São Paulo (IEB-USP). Essas mensagens, circunscritas entre 1922 e 1941, tratam de variados assuntos, relativamente à biografia da pintora e de sua mãe, vistas em uma rede de relações familiares. Evidenciam valores socioculturais e posições ideológicas da elite de São Paulo, na primeira metade do século XX. Oferecem substantivas informações biográficas sobre a família Amaral, favorecendo abordagens da história da vida privada no Brasil. A documentação inédita contribui para o desenvolvimento de estudos de epistolografia.This dissertation intends to deliver a trustworthy and noted edition, with an introductory study, of the correspondence between Lydia Dias de Aguiar do Amaral (1866-1948) with her daughter, the modernist plastic artist Tarsila do Amaral (1886-1973), containing 55 letters, this documentation is safeguarded in the Fundo Tarsila do Amaral at the Institute of Brazilian Studies of the University of São Paulo (IEB-USP). These texts, ranging from 1922 to 1941, talk about a series of themes pertaining to the artists and her mothers biography, shown in a wide net of familial relationships. These documents can also demonstrate the sociocultural values and ideological positions from the elite of the city of São Paulo in the early twentieth century, besides offer substantial biographical information on the Amaral family, favoring studies of the History of private life in Brazil. This never seen documentation contributes to the scientific field of Epistolography
Untitled in english
No full textO processo de pós-polimerização industrial da poliamida 6,6 em extrusora reativa foi modelado a partir de três abordagens distintas, com base em dados experimentais obtidos em uma planta industrial de produção de poliamida. Em uma primeira abordagem, puramente estatística, as variáveis de processo diretamente envolvidas na policondensação da poliamida foram alvo de uma análise estatística prévia para determinação das variáveis relevantes para o sistema, assim como para identificação de redundâncias e interações. A partir desta primeira etapa de análise preliminar, uma série de modelos empíricos com ou sem interações entre as variáveis independentes foram gerados e tiveram seus resultados julgados sob a ótica de uma análise de coerência fenomenológica. Em uma segunda abordagem, com base na criação de um modelo semi-empírico para a previsão do tempo de residência do polímero do interior da extrusora reativa, um modelo semi-empírico baseado em uma cinética de policondensação de ordem 3 (ordem 2 para com os grupamentos carboxílicos) foi desenvolvido, a partir de uma simplificação das reações de degradação da poliamida nas condições experimentais. O modelo em questão é baseado na predição da constante cinética aparente de policondensação em função de termos cinéticos e de equilíbrio semi-empíricos propostos. Em uma terceira etapa, um modelo fenomenológico de ordem 2 (ordem 1 com relação aos grupamentos carboxílicos), com uma constante cinética efetiva incluindo aparticipação do catalisador no modelo, foi desenvolvido a partir da simplificação das reações de degradação validada na etapa de desenvolvimento do modelo semi-empírico. Os três modelos obtiveram sucesso em representar a cinética de policondensação nas condições de processo estudadas, apresentando desvios bastante baixos, principalmente no caso dos modelos semi-empírico e fenomenológico.A PA 6,6 polymerization process in a reactive extruder was modeled by considering three different approaches, based on industrial data generated by a polyamide producer. Trough a first approach, a purely empirical (statistical) model including the most important process variables was developed, with judgment criteria being applied to verify data quality as well as possible interactions among process variables. A second step was the development of a set of empirical models including interactions among independent variables whose results and robustness were evaluated from a phenomenological point of view. A second approach for the problem included the experimental determination of residence time in the extruder and the proposal of a semi-empirical model to represent its dependence on main process variables. Considering this model as a starting point, semi-empirical terms were proposed to develop a third-order polymerization kinetics, including a simplified degradation approach, for modeling the apparent reaction rate of PA 6,6 polymerization. A third approach, purely phenomenological and also based on the residence time prediction developed in the second step of the work, proposed a second-order model for the system, including the effect of polymerization catalyst on reaction rates. All three approaches showed good results, in agreement with the expected phenomenology and with rather low deviations from the original experimental data
Mechanical properties of muscle tissue evaluated by elastography after intervention with thermal resources
No full textIntrodução: A aplicação de recursos térmicos, como a crioterapia e a diatermia por ondas curtas, é comum nos serviços de fisioterapia, podendo alterar rigidez muscular. A elastografia destaca-se na avaliação desse desfecho, embora o componente viscoso dos tecidos ainda seja pouco explorado. Objetivo: O estudo pretende analisar as propriedades mecânicas do músculo esquelético após a aplicação da crioterapia e da diatermia por ondas curtas por meio da elastografia. Método: O estudo é do tipo crossover, com a participação de 33 voluntários saudáveis de ambos os sexos. As intervenções foram aleatorizadas e ocorreram em três dias distintos com um período de washout entre 24 a 48 horas. O desfecho primário foi a velocidade da onda de grupo de cisalhamento, parâmetro associado a rigidez muscular e teve como desfechos secundários a viscosidade muscular, temperatura, umidade e elasticidade cutânea. Os recursos térmicos foram aplicados na porção média do músculo quadríceps femoral, do membro dominante, por um período de 30 minutos para a crioterapia e 20 minutos para a diatermia. A coleta dos dados ocorreu nos tempos pré e pós imediato a intervenção, bem como follow-up de 10, 20 e 30 minutos. Para o processamento de dados, em um primeiro momento, foi realizada uma análise da confiabilidade intra e interavaliador do sistema de processamento de dados da elastografia. Para os dados com distribuição normal foi utilizado o modelo misto generalizado e para os demais o teste de Friedman, considerando nível de significância de 5%. Resultados: A confiabilidade foi excelente, com baixos valores de Mínima Mundança Detectável (MMD) e Erro Padrão de Medida (EPM) para a maioria dos modelos avaliados. Em relação ao estudo transversal, os agentes térmicos não geraram alterações na rigidez ou viscosidade muscular, bem como na elasticidade e umidade cutânea. A temperatura cutânea apresentou alterações nas interações grupo x tempo. Conclusão: Os agentes térmicos geraram alterações na temperatura cutânea, porém, nesse modelo proposto, não geraram diferenças na rigidez e viscosidade muscular, bem como na elasticidade e umidade cutânea.Introduction: The application of thermal resources, such as cryotherapy and shortwave diathermy, is common in physical therapy services and can alter muscle stiffness. Elastography stands out in the evaluation of this outcome, although the viscous component of tissues is still little explored. Objective: This study aims to analyze the mechanical properties of skeletal muscle after the application of cryotherapy and shortwave diathermy through elastography. Method: The study is a crossover design, with the participation of 33 healthy volunteers of both sexes. The interventions were randomized and took place over three different days with a washout period between 24 to 48 hours. The primary outcome was muscle stiffness, with secondary outcomes including muscle viscosity, temperature, humidity, and skin elasticity. The thermal resources were applied to the middle portion of the quadriceps femoris muscle of the dominant limb for 30 minutes for cryotherapy and 20 minutes for diathermy. Data collection occurred at pre- and immediate post-intervention times, as well as at 10, 20, and 30-minute follow-ups. For data processing, initially, an analysis of intra- and inter-rater reliability of the elastography data processing system was conducted. For data with normal distribution, a generalized mixed model was used, and for the others, the Friedman test was applied, with a significance level of 5%. Results: Reliability was excellent, with low values of Minimal Detectable Change (MDC) and Standard Error of Measurement (SEM) for most of the evaluated models. Regarding the cross-sectional study, the thermal agents did not cause changes in muscle stiffness or viscosity, as well as in skin elasticity and humidity. Skin temperature showed changes in the group × time interactions. Conclusion: The thermal agents caused changes in skin temperature, but in this proposed model, they did not generate differences in muscle stiffness and viscosity, as well as in skin elasticity and humidity
Law applicable to the employment relationship of athletes with an international dimension.
No full textO presente trabalho estuda o direito aplicável à relação laboral de atleta com dimensão internacional, cujo objetivo é analisar a validade e a eficácia dos regulamentos, estatutos e regras das federações internacionais e do Comitê Olímpico Internacional ante a legislação nacional e os tratados em um contexto de pluralismo jurídico. Para proceder à tal análise, a metodologia incluiu as pesquisas documental, bibliográfica e qualitativa. Na documental, consultaram-se a legislação nacional, as convenções internacionais, decisões judiciais e alguns laudos da Corte Arbitral do Esporte. A pesquisa bibliográfica, entre outros estudos, tomou como base a teoria do ordenamento jurídico de emérito pesquisador da área e em uma consistente obra de um eminente teórico sobre regras aplicáveis às relações esportivas transnacionais, como os marcos teóricos para harmonizar as normas públicas e as regras esportivas transnacionais que regulamentam os contratos de trabalho plurilocalizados de atletas. Por meio da pesquisa qualitativa, analisaram-se a evolução da legislação sobre a atividade profissional de atleta em âmbito nacional e internacional, e os institutos próprios e singulares da relação laboral de atleta e a noção de lex sportiva. Os resultados dessa análise apontaram a existência de conflitos entre normas estatais e não estatais em contratos de trabalho plurilocalizados de atleta, antinomias entre regras da federação internacional e das associações continentais, lacunas nos estatutos e regulamentos federativos sobre direitos trabalhistas de atletas e o afastamento das regras federativas pelas autoridades judicantes competentes. Concluiu-se que as regras, regulamentos e estatutos das federações internacionais prevalecem não só sobre as demais normas das suas congêneres afiliadas, haja vista o princípio da aplicação universal das federações internacionais (Ein-Platz-Princip), mas, igualmente sobre as legislações nacionais na relação laboral de atleta com dimensão internacional, desde que não violem o princípio da ordem pública e a lois de police.The present work studies the law applicable to the employment relationship of athletes with an international dimension whose objective is to analyze the validity and effectiveness of the regulations, statutes and rules of international federations and the International Olympic Committee in relation to the national legislation and treaties in a context of legal pluralism. To conduct such an analysis, the methodology included documental, bibliographic, and qualitative research. In the documental one, national legislation, international conventions, court decisions and some reports from the Court of Arbitration for Sport were consulted. The bibliographical research, among other theoretical studies, was based upon the theory of the legal system by an emeritus researcher in the area and on a consistent work by an eminent theorist on rules applicable to transnational sporting relations, such as the theoretical frameworks for harmonizing public norms and the sporting transnational rules which regulate athletes multi- location employment contracts. Through the qualitative research, we analyzed the evolution of the legislation concerning the professional activity of athletes at a national and international level as well as the singular institutes in charge of dealing with the athlete\'s employment relationship, and the concept of lex sportiva The results of the analysis pointed to the existence of conflicts between state and non-state norms in multi-sited athlete employment contracts, antinomies between the rules of the international federation and continental associations, gaps in federative statutes and regulations on athletes\' labor rights and the neglect of the rules of the federative authorities on part of the competent judicial authorities. It was concluded that the rules, regulations, and statutes of international federations prevail not only over other standards of their affiliated counterparts, given the principle of universal application of international federations (Ein-Platz-Princip), but also over national legislation in the employment relationship of an athlete with an international dimension if they do not violate the principle of public order and the lois de police
Implementation of Building Information Modeling in the military works system
No full textEsta dissertação de mestrado contempla a elaboração de uma proposta de especificação técnica que possa ser utilizada pelos órgãos de execução do Sistema de Obras Militares (SOM) como base para a contratação de projetos BIM (Building Information Modeling), à luz da gestão da informação contida na ABNT NBR ISO 19650-2:2022. O procedimento utilizado no desenvolvimento do estudo foi o Design Science Research (DSR). Inicialmente, foi realizada uma ambientação relacionada ao planejamento e execução das obras de engenharia a cargo do Exército Brasileiro (EB), oportunizando o enfoque no Sistema de Obras Militares. O SOM, sistema vinculado ao EB, cuja missão é gerir os seus ativos durante todo o ciclo de vida, conta com doze órgãos de execução dispostos por todo o território nacional, responsáveis pelo planejamento, elaboração e contratação de projetos de engenharia e arquitetura, além da contratação e fiscalização das obras militares. Posteriormente, os principais conceitos ligados à ABNT NBR ISO 19650-2:2022, necessários ao desenvolvimento do artefato, foram abordados. Além disso, a revisão da literatura identificou e explorou as principais referências sobre o assunto, destacando manuais, cadernos e guias BIM. A proposta de especificação técnica de projetos BIM foi desenvolvida a partir do diagnóstico obtido de uma unidade específica, por meio de um estudo de caso. Como forma de testar o artefato elaborado, foi desenvolvido o projeto-piloto da obra do Centro de Coordenação de Operações Táticas (CCOp), da 2ª Divisão de Exército, localizado na cidade de São Paulo/SP. Os resultados da pesquisa, provenientes de respostas do público interno e das empresas participantes do certame licitatório durante a fase de divulgação do edital, revelam o êxito da proposta implantada.This master\'s thesis draws up a proposal for a technical specification that can be used by the works execution departments of the Military Works System as a basis for contracting BIM (Building Information Modeling) projects, in the light of the information management contained in ABNT NBR ISO 19650-2:2022. The procedure used to develop the study was Design Science Research (DSR). Initially, a contextualization was made of the planning and execution of engineering works carried out by the Brazilian Army, focusing on the Military Works System. The Military Works System, a system linked to the Brazilian Army, whose mission is to manage its assets throughout their life cycle, has twelve execution departments throughout the country, responsible for planning, preparing and contracting engineering and architectural projects, as well as contracting and inspecting military works. Subsequently, the main concepts linked to ABNT NBR ISO 19650-2:2022, necessary for the development of the artifact, were addressed. In addition, the literature review identified and explored the main bibliography on the subject, highlighting BIM manuals, booklets and guides. The proposal for a technical specification for BIM projects was developed based on the diagnosis obtained from a specific unit, through a case study. As a way of testing the artifact, a pilot project was developed for the construction of the Tactical Operations Coordination Center (CCOp) of the 2nd Army Division, located in the city of São Paulo/SP. The results of the survey, which came from responses from the internal stakeholders and from the companies taking part in the bidding process during the invitation to tender, show the success of the proposal implemented
fMRI Brain Encoding with Large Language Models: Evaluating Multi-subject Training and Inter-subject Mapping Strategy
No full textCompreender como a atividade cerebral generaliza entre indivíduos permanece um desafio central na neurociência cognitiva, especialmente devido à alta variabilidade intersujeitos presente em dados de fMRI. Essa variabilidade compromete o uso direto de dados entre indivíduos, dificultando a criação de representações neurais compartilhadas e limitando a aplicação de modelos em situações com poucos dados do sujeito de interesse. Este trabalho tem como objetivo propor e avaliar uma estratégia de mapeamento intersujeito que possibilite integrar informações de múltiplos sujeitos, reduzindo o ruído individual e promovendo a extração de representações cerebrais mais robustas e compartilhadas. Para isso, foi desenvolvido um método simples, e que se mostrou eficaz, baseado em modelos lineares treinados para prever a atividade de uma região central (parcela) no cérebro de um sujeito-alvo a partir da atividade das regiões vizinhas de diversos sujeitos-fonte. As previsões geradas por múltiplos mapeamentos intersujeito são combinadas pela média, resultando em sinais mais consistentes e menos suscetíveis à variabilidade individual. Esses sinais mapeados são então utilizados para treinar modelos de codificação cerebral, também lineares, que buscam estimar as respostas neurais do sujeito-alvo a partir de representações linguísticas contextualizadas geradas por modelos baseados em redes neurais profundas, em particular, grandes modelos de linguagem, como BERT e Tiny LLaMA. Os resultados experimentais mostram que o uso desse mapeamento intersujeito melhora o desempenho dos modelos de codificação, mesmo quando há pouca quantidade de dados reais do sujeito-alvo. Pelos resultados, é possível concluir que essa abordagem permite o uso mais eficiente de dados de neuroimagem, contribuindo para o avanço de modelos computacionais mais generalizáveis e acessíveis capazes de simular respostas cerebrais a novos estímulos linguísticos com base em dados de outros indivíduos.Understanding how brain activity generalizes across individuals remains a central challenge in cognitive neuroscience, particularly due to the high inter-subject variability present in fMRI data. This variability hinders the direct use of data across individuals, making it difficult to create shared neural representations and limiting the application of models in scenarios with limited data from the target subject. This work aims to propose and evaluate an inter-subject mapping strategy that enables the integration of information from multiple individuals, reducing individual noise and promoting the extraction of more robust and shared brain representations. To this end, a simple, that was shown to be effective, method based on linear models trained to predict the activity of a central brain region (parcel) in a target subject using the activity of neighboring regions from multiple source subjects. The predictions generated by multiple inter-subject mappings are averaged, resulting in more consistent signals that are less susceptible to individual variability. These mapped signals are then used to train linear brain encoding models that aim to estimate the target subjects neural responses from contextualized language representations generated by models such as BERT and Tiny LLaMA. Results show that using this inter-subject mapping improves the performance of the encoding models, even when only a small amount of real data from the target subject is available. According to the results, it is possible to conclude that this approach enables a more efficient use of neuroimaging data, contributing to the development of more generalizable and accessible computational models capable of simulating brain responses to new linguistic stimuli based on data from other individuals
Optimization of poly-3-hydroxybutyrate production with different microorganisms using the Dynamic Simulations for Evaluation of Economic Potential (DySEEP) approach.
Get PDFA preocupação com impactos ambientais tem levado a um aumento de interesse em bioprocessos como por exemplo a produção de bioplásticos nas últimas décadas. Contudo, a viabilidade econômica continua sendo uma barreira para uma produção mais ampla de bioplásticos como o conhecido poli-3-hidroxibuturato (PHB). Devido a isso, muitas pesquisas têm usado modelos metabólicos e ferramentas computacionais para guiar estratégias de engenharia metabólica com o intuito de melhorar a produção de PHB. No entanto, muitos desses trabalhos focam em construir cepas capazes de maior conversão para produto, sem levar muito consideração outros parâmetros importantes de bioprocesso como a concentração final do produto e a produtividade. Visto que pode haver um compromisso entre a formação de biomassa e de produto, especialmente em casos de produção associada ao crescimento, abordagens que podem acompanhar todos esses parâmetros são mais adequadas para avaliação de bioprocessos, e isso pode ser feito usando ferramentas como o Dynamic Flux Balance Analysis (DFBA). Simulações de DFBA usam modelos estequiométricos, expressões cinéticas para as reações de consumo, problema de otimização vindo de Flux Balance Analysis (FBA) para predizer fluxos internos, e equações de balanço de massa para acompanhar a concentração de metabólitos externos. Em vista disso, este trabalho apresenta uma abordagem para a avaliação do potencial de produção de produtos de interesse industrial a partir do uso de DFBA e modelos estequiométricos de escala genômica, junto a métricas adequadas de avaliação econômica. A abordagem é nomeada Simulações Dinâmicas para Avaliação do Potencial Econômico (no Inglês, DySEEP). Usando a abordagem DySEEP, a produção de PHB usando o microrganismo recombinante Cupriavidus necator, e os microrganismos Escherichia coli e Saccharomyces cerevisiae recombinantes com rota de síntese de PHB dependente do cofator NADPH ou NADH foi analisada sob condições diferentes como um estudo de caso. Através das simulações, foi possível encontrar os cenários que levariam a um fluxo de dinheiro positivo e ao lucro bruto mensal máximo teórico, e qual fonte de carbono é a mais promissora. Também através da abordagem proposta, análise econômica foi realizada para calcular as métricas clássicas de avaliação econômica como o Valor Presente Líquido, tempo de retorno, Retorno sobre Investimento, e Taxa Interna de Retorno, para cada cenário simulado. Para as simulações de produção de PHB associada ao crescimento em batelada alimentada com E. coli recombinante, foi calculado que há cenários que alcançam viabilidade econômica, e com isso, foi identificado o chamado ponto de equilíbrio (break-even point). Esta informação foi utilizada junto a um algoritmo de design de cepas chamado Minimal Cut Set, para identificar sugestões de deleções de genes que poderiam melhorar a produção de PHB, apontando então alvos para estratégias de engenharia metabólica. E para produção de PHB não associada ao crescimento, foi identificado os instantes ideais para mudança de estágio, apontando assim alvos em potencial para operação de biorreator e estratégias de biologia sintética. Esses resultados demonstram a capacidade da abordagem DySEEP em obter informações relevantes para a pré-avaliação e otimização de bioprocessos de interesse industrial.The concern with environmental impacts has led to an increase in the interest for bioprocesses such as the production of bioplastics in recent decades. However, economic viability remains a barrier to a broader production of bioplastics such as the well-known poly-3-hydroxybutyrate (PHB). Because of this, many works using metabolic models and computational tools to guide metabolic engineering strategies to improve PHB production have been carried out. However, most of these works focused on engineering strains capable of high yields, without much consideration of other important bioprocess parameters such as product titer and productivity. Since there may be a trade-off between biomass and product formation, especially in cases of growth-associated production, approaches that can track all these important parameters are more suitable for evaluation of potential bioprocesses, and this can be done using tools such as Dynamic Flux Balance Analysis (DFBA). DFBA simulations use stoichiometric models, kinetic expressions for the uptake reactions, a Flux Balance Analysis (FBA) optimization problem for prediction of internal fluxes, and mass balance equations to track the concentrations of external metabolites. In light of that, this work presents an approach for evaluating the production potential of products of industrial interest using DFBA and genome-scale stoichiometric models, together with suitable economic evaluation metrics. The approach is named Dynamic Simulations for Evaluation of Economic Potential (DySEEP). Using the DySEEP approach, the production of PHB with recombinant Cupriavidus necator, and with recombinant Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae harboring a NADPH or NADH-dependent PHB synthesis pathway was analyzed in different conditions as a case study. With the DySEEP approach, it was possible to find the scenarios that would lead to a positive cash flow and the theoretical maximum monthly gross profit, and which carbon source is the most promising. Through the proposed approach, economic analysis was also carried out to estimate classic economic evaluation metrics such as the Net Present Value, payback time, Return on Investment, and Internal Rate of Return, for each scenario simulated. For the growth-associated fedbatch PHB production simulations with recombinant E. coli, it was calculated that there are scenarios that achieve economic viability, and with this, the so-called break-even point was identified. This information was used together with a strain design algorithm called Minimal Cut Sets to identify gene knockouts that could improve PHB production, setting therefore targets for metabolic engineering strategies. For the non-growth-associated PHB production simulations the ideal switch points were identified, setting targets for bioreactor operation and synthetic biology strategies. These results demonstrate the ability of the DySEEP approach to obtain relevant information for the pre-evaluation and optimization of bioprocesses of industrial interest
Children in Maranhãos Bumba meu Boi: childhood cultures, participation, and intergenerational encounters in a traditional cultural festival
No full textEsta tese apresenta as incursões realizadas no Bumba Meu Boi Unidos de Santa Fé, reconhecido como uma das mais expressivas manifestações da cultura popular do Maranhão, que reúne majoritariamente adultos, mas também acolhe crianças na brincadeira. A pesquisa teve como objetivo investigar a presença das crianças no complexo cultural do Bumba Meu Boi maranhense, com foco nas dinâmicas geracionais que se entrelaçam nesse espaço, bem como nas formas pelas quais as crianças negociam, compartilham e criam culturas tanto com os adultos quanto com seus pares. O ciclo festivo do Boi é composto por quatro etapas ensaios, batismo, apresentações públicas (também chamadas de brincadas) e morte e articula símbolos, rituais e significados que atravessam gerações, constituindo e reconstituindo a história do povo que o realiza. Acompanhar cada uma dessas fases permitiu lançar luz sobre a participação das crianças, identificando quando e onde elas ocupam o espaço da festa e constroem seus próprios territórios. Buscou-se compreender de que modo as crianças se relacionam com o Bumba Meu Boi e, assim, refletir o encontro entre infância e manifestação cultural, com especial atenção à presença infantil em espaços não marcados como infantis seja como brincantes, seja como espectadoras. A participação das crianças no folguedo é mediada por relações intra e, sobretudo, intergeracionais, o que evidencia tanto a presença ativa da infância quanto as tensões e negociações com o universo adulto. A pesquisa mobilizou a Sociologia da Infância como referencial teórico, destacando as culturas infantis como motor das ações sociais das crianças. As análises revelam que as interações culturais e geracionais, forjadas nas ruas, nos bairros e nos territórios onde vivem e transitam, são centrais para entender sua inserção no Boi. As crianças não apenas participam da festa, mas também produzem culturas infantis próprias, que lhes conferem agência, pertencimento e protagonismo nos modos de viver e celebrar. Concluímos, assim, que as crianças atuam como agentes culturais e sociais na brincadeira, tensionando os limites do adultocentrismo e reafirmando a infância como tempo de potência, criação e participação.This thesis investigates the participation of children in Bumba Meu Boi Unidos de Santa Fé, recognized as one of the most significant expressions of popular culture in the state of Maranhão, Brazil. Although the group is predominantly composed of adults, it also includes children in its activities. The research aims to examine the presence of children within the broader cultural framework of Bumba Meu Boi, focusing on the intergenerational dynamics that unfold in this context and the ways in which children negotiate, share, and construct cultural meanings in interaction with both adults and their peers. The festival cycle of Bumba Meu Boi comprises four main stagesrehearsals, baptism, public performances, and symbolic deatheach involving complex symbols, rituals, and meanings transmitted across generations, contributing to the historical and cultural continuity of the community. Observing each of these phases allowed for a deeper understanding of children\'s participation, identifying the moments and spaces in which they engage and create their own cultural territories. The study seeks to understand how children relate to Bumba Meu Boi and, thus, to reflect upon the intersection between childhood and cultural traditions, with particular attention to their presence in domains not conventionally designated for childrenwhether as participants or as audience members. Childrens engagement is mediated by intra- and, most notably, intergenerational relationships, revealing both their active participation and the inherent tensions and negotiations with adult-centered norms. The research draws on the Sociology of Childhood as a theoretical framework, highlighting children\'s cultures as central to their social agency. The analysis demonstrates that cultural and generational interactionsshaped by the everyday spaces where children live and circulateare fundamental to understanding their involvement in the festival. Children not only take part in the event, but also produce their own cultural expressions, granting them agency, a sense of belonging, and protagonism. The study concludes that children act as cultural and social agents within the performative tradition, challenging adult-centric paradigms and reaffirming childhood as a period of creativity, power, and active participation
Urinary calcium excretion and bone resorption in dogs with calcium oxalate urolithiasis
No full textA urolitíase por oxalato de cálcio corresponde a cerca de 40 a 50% dos casos em cães, e a hipercalciúria tem sido relatada como um dos fatores de risco mais importantes. Em ratos e humanos, a origem do aumento da excreção urinária de cálcio pode ser justificada pelo alto "turn over" ósseo, naqueles casos cuja hipercalciúria é considerada idiopática. Na espécie canina, entretanto, a associação entre a excreção urinária de cálcio e o remodelamento ósseo permanece pouco compreendida. Desta forma, a hipótese do presente estudo é de que cães com cálculos de OxCa podem apresentar hipercalciúria e aumento da reabsorção óssea. Os objetivos principais foram avaliar a excreção urinária de cálcio, por meio da razão cálcio:creatinina urinária (uCa:Cr), e o remodelamento ósseo, por meio da mensuração sérica do marcador β- Crosslaps. O delineamento do estudo foi "caso-controle", e assim, cães com cálculo (CaOx; n= 10) e cães não- formadores (NF; n= 10), pareados quanto à raça, idade, sexo e peso, foram selecionados da rotina de atendimento do Hospital Veterinário da Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade de São Paulo (HOVET/FMVZ/USP). Os animais foram submetidos ao período de adaptação ao alimento coadjuvante para dissolução de cálculo de estruvita e prevenção de oxalato de cálcio, durante 20 dias, e então avaliados em dois momentos subsequentes (T1 e T2), com intervalo de 20 dias entre eles. Quanto à análise estatística, para a avaliação do efeito de tempo, grupo, e grupo vs. tempo, utilizou-se a Análise de variância com medidas repetidas em dois fatores (ANOVA Two-way repeated measures) e o modelo misto foi considerado em casos de dados faltantes. Os testes de Pearson ou Spearman para avaliar a correlação entre as variáveis principais (uCa:Cr e concentrações séricas de β-crosslaps) foram adotados. Para todos os testes, foi considerado o nível de significância de 5%. O Software Prism (GraphPad, versão 10.0) foi utilizado para as análises. Os principais resultados observados no presente estudo foram que, todos os cães com urolitíase por oxalato de cálcio apresentaram hipercalciúria (uCa:Cr>0,05), em 100% no T1 e 70% no T2, enquanto no grupo NF foi observada em 40% e 60%, respectivamente. Houve correlação negativa entre β- Crosslaps e uCa:Cr nos cães OxCa (rho = -0,59; p=0,005), a qual não foi observada no grupo NF. O colesterol sérico foi maior no grupo CaOx (T1: 256,8 ± 63,0; T2: 284,8 ± 69,9 mg/dL) em comparação ao NF (T1: 193,1 ± 54,2; T2: 225,9 ± 71,6 mg/dL; p=0,03). A densidade urinária apresentou diferença entre T1 e T2 em ambos os grupos (p=0,003). Conclui-se que a avaliação do perfil lipídico em cães com urolitíase por OxCa deve ser considerada, embora a relação de causa e efeito das dislipidemias sobre a formação dos cálculos de OxCa permanece por ser investigada. Ainda, a origem da hipercalciúria nos cães com urolitíase por OxCa não esteve associada ao "turnover" ósseo, cabendo investigações futuras quanto às possibilidades de hipercalciúria absortiva intestinal ou primariamente renal. Tais resultados possuem implicações terapêuticas, como a não recomendação de uso de agentes antirreabsorptivos ósseos nestes casos.Calcium oxalate (CaOx) urolithiasis accounts for approximately 4050% of cases in dogs, and hypercalciuria has been reported as one of the most important risk factors. In rats and humans, the origin of increased urinary calcium excretion may be explained by an increased bone turnover in cases of idiopathic hypercalciuria. In dogs, however, the association between urinary calcium excretion and bone remodeling remains poorly understood. Therefore, the hypothesis of the present study was that dogs with CaOx uroliths may present hypercalciuria and increased bone resorption. The main objectives were to evaluate urinary calcium excretion, through the urinary calcium-to- creatinine ratio (uCa:Cr), and bone remodeling, through the measurement of the serum biomarker -Crosslaps. A case-control design was made, including dogs with CaOx uroliths (n=10) and non-forming dogs (NF; n=10), matched for breed, age, sex, and weight, recruited from the caseload of the Veterinary Teaching Hospital, School of Veterinary Medicine and Animal Science, University of São Paulo (HOVET/FMVZ/USP). All dogs underwent a 20-day diet adaptation period with a commercial formulation indicated for struvite dissolution and CaOx prevention, and were subsequently evaluated at two time points (T1 and T2), with a 20-day interval between them. Statistical analyses included two-way repeated measures ANOVA to assess the effects of time, group, and time vs. group interaction, with mixed-effects modeling applied in cases of missing data. Pearson or Spearman correlation tests were used to evaluate the association between the main variables (uCa:Cr and serum β-Crosslaps concentrations). A significance level of 5% was adopted for all analyses, performed using Prism software (GraphPad, version 10.0). The main findings were that all dogs with CaOx urolithiasis exhibited hypercalciuria (uCa:Cr>0.05), in 100% of cases at T1 and 70% at T2, while in the NF group hypercalciuria was observed in 40% and 60%, respectively (p>0.05). A negative correlation between β-Crosslaps and uCa:Cr was identified in CaOx dogs (rho = -0.59; p=0.005), but not found in NF dogs. Serum cholesterol was higher in CaOx dogs (T1: 256.8± 63.0; T2: 284.8 ± 69.9 mg/dL) compared with NF dogs (T1: 193.1 ± 54.2; T2: 225.9 ± 71.6 mg/dL; p=0.03). Urine specific gravity differed between T1 and T2 in both groups (p=0.003). In conclusion, lipid profiling in dogs with CaOx urolithiasis should be considered, although its relationship with stone formation remains uncertain. Hypercalciuria did not appear to be bone-related, suggesting intestinal absorptive or renal causes, which contraindicates the use of bone antiresorptive agents and highlights the need for attention to dietary calcium composition