University of Zagreb

Repository of Faculty of Science, University of Zagreb
Not a member yet
    12064 research outputs found

    Changes in microbial community structure and functional diversity under salinization of a coastal lake

    No full text
    Jezerski sustavi u područjima oskudnim vodom, poput Mediterana, su od iznimne važnosti za razvoj lokalnog gospodarstva, često imajući ulogu glavnog vodnog resursa. Vransko jezero kod Biograda na moru je obalno plitko jezero čiji vodni režim ovisi o precipitacijsko-evaporacijskoj ravnoteži. Ovo jezero ostvaruje komunikaciju s Jadranskim morem preko djelomično okršenog karbonatnog grebena i kanala Prosika. Prostorno-vremenskim istraživanjem mikrobne zajednice jezera pomoću visoko-protočne metode sekvenciranja mikrobne DNA istražen je utjecaj zaslanjenja na raznolikost i funkcije mikrobnih zajednica Vranskog jezera. Tijekom sušnih razdoblja, u jezeru se bilježe periodični prodori morske vode koji su se pokazali da utječu na promjene unutar autohtonih mikrobnih zajednica te time mijenjaju strukturu zajednice i potencijalne metaboličke procese od iznimne važnosti za funkciju ekosustava. Mikrobne zajednice, otopljena organska tvar i biogeni ciklus metana mijenjali su se pod utjecajem nekoliko okolišnih pritisaka, uključujući sušu, zaslanjenje i pljuskove. Ova disertacija doprinosi istraživanju utjecaja globalnih klimatskih promjena na obalne vodne resurse.Lake systems in the freshwater-scarce Mediterranean region play a crucial role in the local economy by frequently acting as primary water resources. Lake Vrana is a shallow coastal lake that depends on the balance of precipitation and evaporation and is connected to the Adriatic Sea by the semi-karstified carbonate ridge and the Prosika canal. By investigating the spatio-temporal distribution of microbial communities in the lake using high-throughput sequencing of microbial DNA, it was possible to study the impact of salinization on microbial diversity and function. During periods of drought, seawater intrusions occur in the lake, which have been shown to affect autochthonous microbial communities and lead to changes in microbial structures and potential metabolisms vital for the functioning of the lake. Microbial communities, DOM structure, and biogenic methane cycling were driven by multiple environmental stressors, including drought, salinization and heavy rainfall events. Studying changes in the microbial communities of Lake Vrana could help interpret the effects of global climate change on coastal water resources

    Istraživanje trovalentnih titanata rijetkih zemalja lokalnim probama

    No full text
    This thesis contains an in-depth experimental investigation of trivalent rare-earth titanates. Titanates are a model system for exploring intricate interactions between spin, orbital, and lattice degrees of freedom. These compounds belong to a broader family of transition metal oxides. Their ground state can be easily manipulated by strain, chemical, and charge doping, offering a unique opportunity to explore the Mott insulator phase and metal-insulator transitions. One of the foremost open questions is the orbital state of titanates which we try to resolve with this thesis. We present a detailed nuclear magnetic resonance (NMR) and electron spin resonance (ESR) study of single-crystalline samples of (Y,Ca,La)TiO_3 in a wide range of isovalent substitution (La) and hole doping (Ca). 89^Y NMR demonstrates a clear discrepancy between the static and dynamic local magnetic susceptibilities, with deviations from Curie-Weiss behavior far above the Curie temperature _. ESR of the unpaired Ti electron shows broad resonance lines at all temperatures and substitution/doping levels, which we find to be caused by short electron spin-lattice relaxation times. Modeling of the relaxation as an Orbach process revealed a small gap likely produced by Jahn-Teller splitting of the two lower Ti _2 orbitals. We find that the value of the gap closely follows _ and is consistent with the temperatures at which deviations from Curie-Weiss fluctuations are observed in NMR. These results indicate that full orbital degeneracy lifting is associated with ferromagnetic order. Ferromagnetic resonance with orientational dependence on the three primary YTiO_3 axes was successfully measured and modeled. Free energy description of the data revealed values for the parameters reflecting the inherent magnetocrystalline anisotropy. Furthermore, we present measurements of uniaxial strain on a range of (Y,Ca,La)TiO_3 single crystals and its influence on the bulk ferromagnetism. The results demonstrate direct, reversible and continuous control of ferromagnetism by influencing the TiO6 octahedral tilts and rotations. Ab initio calculations, provided by our collaborators, agree well with the experimental data and offer a better understanding of the complex interactions among structural, orbital and magnetic properties that drive the physics of rare-earth titanates.Rezultati ovog rada daju jedinstven i detaljan uvid u lokalne interakcije u titanatima rijetkih zemalja. Mjerenja lokalnih statičkih i dinamičkih susceptibilnosti s pomoću reix zonantnih tehnika upotpunjavaju fazni dijagram ne samo stehiometrijskog spoja YTiO_3, već i čvrstih otopina Y(Ca,La)TiO_3 na kojima do sada nije bilo eksperimentalnih rezultata. Pokazali smo da postoje anomalna ponašanja u paramagnetskoj fazi titanata, koja se posebno očituju u relaksacijskim mjerenjima detektiranim NMR tehnikom. Snažna divergencija relaksacije 1/_2 na temperaturama ≈ 70K nije objašnjena, što upućuje na potrebu boljeg razumijevanja važnosti mehanizma relaksacije spin-spin u titanatima i srodnim oksidima prijelaznih metala. Jedinstven uvid u orbitalno stanje titanata dobili smo mjerenjem elektronske spinske rezonancije. Potvrdili smo postojanje malog procjepa između najnižih nivoa _2 orbitala te utvrdili jasnu vezu s feromagnetizmom ovih spojeva. Naši rezultati potvrđuju važnost blagih Jahn-Tellerovih deformacija oktaedara za bolje razumijevanje kompleksnih interakcija u jakokoreliranim elektronskim sustavima. Ovim radom ističemo važnost korištenja rezonantnih tehnika pri istraživanju oksida prijelaznih metala. Nadalje, originalnim eksperimentom uniaksijalnog naprezanja potvrdili smo teorijska predviđanja o utjecaju kontrolirane kompresije na magnetsko osnovno stanje. Naši rezultati, uz dobro slaganje s teorijskim modelom, dali su uvid u točne distorzije rešetke koje pospješuju FM i AFM vezanja u titanatima. Ovaj jedinstveni eksperiment daje snažan poticaj za mogućnost inženjerstva željenih svojstava u materijalima s pomoću naprezanja

    Computational study on the effect of deuteration on the ligand binding to the adenosine A2A receptor

    No full text
    Primjenom niza modernih računalnih metoda dobiven je detaljan uvid u interakcije koje antagonist istradefilin ostvaruje s adenozinskim A2A receptorom. Temeljem identifikacije strukturnih elemenata koji najviše doprinose vezanju, dizajnirani su derivati većeg afiniteta. Osim konvencionalnog pristupa koji uključuje uvođenje novih funkcionalnih skupina, primijenjena je i modifikacija deuteriranjem čime je postignuto poboljšano vezanje istradefilina u A2A receptor. U ovom radu izotopna supstitucija predstavlja originalan koncept moduliranja farmakodinamičkih svojstava, a dobiveni rezultati ukazuju na veću učinkovitost istradefilina obogaćenog deuterijem što bi se moglo iskoristiti za poboljšanje njegovog farmakoterapijskog profila u liječenju Parkinsonove bolesti.By utilising a series of modern computational methods, a detailed insight into the interactions of the antagonist istradefylline with the adenosine A2A receptor was obtained. Based on the identification of structural elements that contribute the most to binding, higher affinity derivatives were designed. In addition to the conventional approach that includes the introduction of new functional groups, modification by deuteration was also applied, which achieved improved binding of istradefylline to the A2A receptor. In this work, isotopic substitution represents an original concept of modulating pharmacodynamic properties, and the obtained results indicate a greater efficiency of deuterium-enriched istradefylline, which could be used to improve its pharmacotherapeutic profile in the treatment of Parkinson's disease

    Indicators of partial melting in metapelites from Moslavačka Gora

    No full text
    Kristalin Moslavačke gore predstavlja magmatsko-metamorfni kompleks kojeg čine granitoidne stijene, metamorfne stijene srednjeg stupnja metamorfizma te migmatitne stijene. Dosadašnja istraživanja kao migmatite dominantno opisuju različite varijetete migmatiziranih gnajseva. Cilj ovoga rada je potkrijepiti hipotezu da je pojava parcijalnog taljenja zabilježena i u metapelitima Moslavačke gore, na što ukazuju dosadašnja geotermobarometrijska istraživanja. U tu svrhu optičkim istraživanjima obuhvaćeno je pet uzoraka metapelita Moslavačke gore te je analizirana velika količina mikrostrukturnih indikatora parcijalnog taljenja. Glavne mikrostrukturne indikatore predstavljaju zrna peritektičkog i retrogradnog cordijerita koja su zaobljena u kontaktu sa „zašiljenim“ volumenima felsičnih minerala. Navedena kombinacija indikatora potvrđuje da je u metapelitnim stijenama bila prisutna taljevina, odnosno, da se u migmatizirane stijene Moslavačke gore, uz gnajseve, mogu ubrojiti i metapelitne stijene.Moslavačka Gora crystalline represents a magmatic-metamorphic complex consisting of granitoid rocks, medium-grade metamorphic rocks, and migmatitic rocks. Previous research predominantly describes different varieties of migmatised gneisses as migmatites. The aim of this work is to support the hypothesis that the occurrence of partial melting was also recorded in the metapelites of Moslavačka Gora, as indicated by previous geothermobarometric research. For this purpose, five samples of metapelites from Moslavačka Gora were included in optical research, and a large number of microstructural indicators of partial melting were analyzed. The main microstructural indicators are peritectic and retrograde cordierite grains that were rounded in contact with pointed volumes of felsic minerals. The aforementioned combination of indicators confirms that melt was present in metapelitic rocks, i.e., that metapelitic rocks can be regarded as migmatites of Moslavačka Gora, along with gneisses

    Rezultati jedinstvenosti i regularnosti za probleme interakcije fluida i strukture i povezane teme

    No full text
    We study nonlinear fluid-rigid body interaction problems involving the 3D Navier-Stokes equations for fluid flow and ordinary differential equations for rigid body motion. The fluid and rigid body together occupy a bounded and fixed domain Ω\Omega. We examine two initial-boundary value problems: one with incompressible flow and no-slip boundary conditions, and another with compressible flow and inhomogeneous boundary conditions on the boundary Ω\partial \Omega. In both cases, we assume that the rigid body does not touch the boundary Ω\partial \Omega. In this thesis, we explore three main topics across three chapters. The first two topics deal with the incompressible fluid-rigid body interaction problem. Our goal is to extend the well-known results of weak-strong uniqueness and regularity for the Navier-Stokes equations to the considered fluid-rigid body system. We prove the uniqueness of the weak solution, which satisfies the Prodi-Serrin LrLsL^r – L^s condition, within a broader class of Leray-Hopf weak solutions. Additionally, we establish that the Prodi-Serrin condition implies the LtpWx2,pWt1,pLxpL_t^p W_x^{2,p}\cap W_t^{1,p}L_x^p regularity for the fluid velocity and the LtpWx1,pL_t^p W_x^{1,p} regularity for the fluid pressure. Moreover, we show that the solutions are CC^\infty if we additionally assume that the acceleration of the rigid body is bounded almost everywhere in time. The final chapter focuses on the motion of a rigid body in a compressible, isentropic, viscous fluid. We consider a scenario where a time-independent fluid velocity is prescribed on the entire boundary Ω\partial \Omega, along with a time-independent fluid density on the inflow boundary of Ω\Omega. Our objective is to establish the existence of a global-in-time weak solution to the given problem on a time interval where the rigid body does not touch the boundary Ω\partial \Omega.Proučavamo nelinearne probleme interakcije fluida i strukture u kojima je tok fluida dan 3D Navier-Stokesovim jednadžbama, dok je struktura kruto tijelo čije je gibanje određeno sustavom običnih diferencijalnih jednadžbi koje opisuju očuvanje linearnog i kutnog momenta. Jednadžbe su u potpunosti povezane preko dinamičkih i kinematičkih uvjeta spajanja. Nadalje, pretpostavljamo da fluid i kruto tijelo zajedno zauzimaju ograničeno i fiksno područje Ω\Omega. Razmatramo dvije različite inicijalno-rubne zadaće. U prvom slučaju, tok fluida je zadan inkompresibilnim Navier-Stokesovim jednadžbama, pri čemu je na granici domene Ω\Omega postavljen homogeni rubni uvjet. U drugom slučaju, tok fluida određuju kompresibilne Navier-Stokesove jednadžbe, s nehomogenim rubnim uvjetima na granici Ω\Omega. Također, u oba slučaja pretpostavljamo da kruto tijelo ne dodiruje rub Ω\partial \Omega. U disertaciji istražujemo tri različite teme predstavljene kroz tri poglavlja. Prva tema odnosi se na pitanje jedinstvenosti slabog rješenja problema interakcije inkompresiblinog fluida i krutog tijela. Naš cilj je proširiti poznati rezultat slabo-jake jedinstvenosti za Navier-Stokesove jednadžbe na promatrani sustav fluid-kruto tijelo. Konkretno, dokazujemo da je slabo rješenje koje zadovoljava Prodi-Serrinov LrLsL^r – L^suvjet jedinstveno unutar šire klase Leray-Hopfovih slabih rješenja. U ovom poglavlju uzimamo u obzir dvije različite vrste kinematičkih uvjeta povezivanja: uvjet bez klizanja (no-slip) i uvjet klizanja (slip), dok u nastavku pretpostavljamo uvjet bez klizanja. Druga tema je regularnost slabog rješenja iste inicijalno-rubne zadaće. Cilj nam je poopćiti klasični rezultat o regularnosti za 3D inkompresibilne Navier-Stokesove jednadžbe, koji kaže da je slabo rješenje koje zadovoljava Prodi-Serrinov LrLsL^r – L^suvjet glatko. Dokazujemo da Prodi-Serrinov uvjet za sustav fluid-kruto tijelo implicira LtpWx2,pWt1,pLxpL_t^p W_x^{2,p}\cap W_t^{1,p}L_x^p regularnost za brzinu fluida i LtpWx1,pL_t^p W_x^{1,p} regularnost za tlak fluida. Nadalje, pokazujemo da su rješenja CC^\infty ako dodatno pretpostavimo ograničenost akceleracije krutog tijela gotovo svugdje u vremenskoj varijabli. Zadnje poglavlje posvećeno je proučavanju gibanja krutog tijela uronjenog u kompresibilni, izentropski, viskozni fluid. Na rubu domene Ω\Omega postavljamo vremenski neovisnu brzinu fluida na cijeloj granici Ω\partial \Omega i vremenski neovisnu gustoću fluida na dijelu ruba na kojim fluid utječe u područje Ω\Omega. Naš cilj je dokazati postojanje slabog rješenja dane zadaće na intervalu na kojem kruto tijelo ne dodiruje rub Ω\partial \Omega

    Phenology and ecology of species Ibisia marginata (Insecta, Diptera) in the Plitvice Lakes National Park

    No full text
    Vrsta Ibisia marginata (Diptera, Athericidae), čini važnu, ali nedovoljno istraženu komponentu slatkovodnih ekosustava. Životni ciklus sastoji se od jaja, ličinke, kukuljice i imaga. Ličinke žive u vodi, a odrasli na kopnenim staništima. Emergencija ove vrste do sada nije istraživana u Hrvatskoj. U razdoblju od 2007. do 2022. godine na dvije lokacije, Barijera Labudovac i Barijera Kozjak-Milanovac te od 2007. do 2008. godine na još dodatne tri lokacije, Barijera Novakovića Brod, Potok Plitvica i Korana u selu, unutar područja Plitvičkih jezera, prikupljene su mjesečno odrasle jedinke pomoću emergencijskih klopki. Klopke su postavljene na različitim tipovima mikrostaništa. Ciljevi istraživanja bili su utvrditi fenologiju i ekologiju vrste I. marginata, odnos spolova, ovisnost vrste o određenim fizikalno-kemijskim čimbenicima i sklonost prema određenim mikrostaništima. Sveukupno je sakupljeno 373 jedinki vrste I. marginata. Najveću brojnost vrsta je imala na Barijeri Novakovića Brod 2007. godine, a preferirani supstrat su joj mahovina i šljunak. Emergencija se odvija ljeti tijekom lipnja, srpnja i kolovoza, s maksimumom emergencije u srpnju. Značajna korelacija vrste I. marginata dokazana je s temperaturom vode, količinom otopljenog kisika u vodi te s KPK (Kemijskom potrošnjom kisika) što može poslužiti kao temelj budućim istraživanjima.The Ibisia marginata, belonging to Dipteran family Athericidae, is an important but understudied component of freshwater ecosystems. The life cycle consists of egg, larva, pupa and imago. Larvae live in water, and adults live on land. Emergence of this species has not been investigated in Croatia so far. In the period from 2007 to 2022 at two sites, tufa barrier Labudovac and tufa barrier KozjakMilanovac, and from 2007 to 2008 at three additional sites, tufa barrier Novakovića Brod, Stream Plitvica and Korana in the village, within the area of Plitvice Lakes, adults were collected monthly using emergence traps. Traps were placed on different types of microhabitats. The objectives of the research were to determine the phenology and ecology of I. marginata, the relationship between the sexes, the dependence of the species on certain physico-chemical factors and the preference for certain microhabitats. A total of 373 individuals of I. marginata were collected. It had the highest number of specimens at the tufa barrier Novakovića Brod in 2007, and its preferred substrate is moss and gravel. Emergence takes place in summer during June, July and August, with the peak of emergence in July. A significant correlation of I. marginata has been proven with water temperature, the amount of dissolved oxygen in the water, and with COD (Chemical Oxygen Demand), which can serve as a basis for future research

    The effect of excess and lack of water on the bioavailability of bioactive compounds in broccoli (Brassica oleracea convar. botrytis var. cymosa) seedlings and the antioxidant capacity of their extracts in an in vitro model of digestion

    No full text
    Učestalost ekstremnih klimatskih promjena poput poplava i suše povećava se svakodnevno, zajedno sa opsegom štete koju uzrokuju. Klijanci kupusnjača popularna su namirnica zbog visokog udjela fenolnih spojeva, vitamina, glukozinolata i vlakana, te mogućnosti lakog i jeftinog uzgoja, što ih čini zanimljivima za istraživanja. Međutim, udjeli ovih spojeva u biljkama značajno ovise o dostupnosti vode u tlu. Cilj ovog rada bio je usporediti učinak viška i manjka vode u tlu prilikom uzgoja klijanaca brokule na biodostupnost fenolnih spojeva, proteina i vitamina te antioksidacijski kapacitet etanolnih ekstrakata nakon in vitro simulacije ljudske probave u ustima, želucu i crijevu. Metode spektrofotometrije i tekućinske kromatografije visoke moći razlučivanja (HPLC) pokazale su značajan doprinos manjka vode većoj biodostupnosti folne kiseline i vitamina B12 nakon probave u crijevima. S druge strane, isti uvjeti značajno smanjuju biodostupnost sinapinske kiseline. Uvjeti viška vode pozitivno utječu na biodostupnost proteina i kempferola, a negativno na ukupne fenole, flavonoide i vitamin biotin, kao i antioksidacijski kapacitet ekstrakata nakon crijevne faze probave. Oba uvjeta vodnog stresa uzrokovala su smanjenje biodostupnosti ukupnih hidroksicimetnih kiselina. Neproporcionalnost odnosa udjela i biodostupnosti nekih spojeva nakon pojedinih faza probave sugerira utjecaj drugih faktora u biljnom materijalu, osim njihove koncentracije, na biodostupnost.Frequent extreme weather conditions caused by climate change, such as flooding and drought, have been increasing their impact on the environment. Brassica sprouts are popular for their high content of phenolics, vitamins, glucosinolates and fibers, which along with simple and inexpensive production makes them an interesting subject of research. Considering the dependency of the amount of these compounds on the availability of water in soil, the goal of this research was to compare its effects during broccoli seedling growth on the bioavailability of phenolics, proteins and vitamins, as well as the antioxidant capacity of their ethanol extracts after an in vitro simulation of human digestion in the mouth, stomach and intestine. Methods of spectrophotometry and highperforming liquid chromatography (HPLC) showed that lack of water significantly increased the bioavailability of folic acid and vitamin B12 after digestion in the intestinal phase, while the same watering conditions significantly decreased the bioavailability of sinapic acid. Excess water had a favorable effect on bioavailability of proteins and kaempferol, and negative on total phenolics, flavonoids and vitamin biotin, along with the decrease of the extracts’ antioxidant capacity after digestion in the intestinal phase. Both watering stress conditions caused lowering of total hydroxycinnamic acid bioavailability. Disproportional values of amount and bioavailability of some compounds after certain phases of digestion suggest the influence of other existing factors, beside their concentration, on bioavailability

    Korelacija između mehanike bioaktivnog matriksa i fenotipova staničnih linija izvedenih iz stanične linije MCF-10A Correlation between bioactive matrix mechanics and MCF-10A-derived cell lines phenotypes

    No full text
    During the development of a tumor, various changes occur that cause the formation of tumor tissue. These changes are largely at cellular and extracellular matrix level. As some other materials, the extracellular matrix has a physical property called viscoelasticity. This property is defined by the deformation and return of the matrix to its original position during and after physical stress respectively. In tumor tissues, it is denser, and cells with an invasive phenotype must overcome movement through a denser and stiffer matrix. In this work, a synthesized bioactive matrix was used for seeding cells in 3D cultures, the main components of which are alginate and collagen type 1, and whose viscoelastic properties can be controlled by regulating the concentration of calcium crosslinker. The goal of this research is to determine whether there is a significant difference in the observed phenotypic parameters of the same cell line-derived spheroids seeded in a bioactive matrix of softer and stiffer mechanical properties. This is being studied for three different cell lines: MCF-10A, MCF-10AT and MCF-DCIS.com. The obtained data indicate that the cell line MCF-DCIS.com shows the smallest changes in spheroid phenotype, followed by MCF-10AT and the largest by MCF-10A, which show a difference in all studied phenotypic parameters for the two matrices of distinct stiffness.ijekom razvoja tumora događaju se razne promjene koje rezultiraju formiranjem tumorskog tkiva. Te su promjene uvelike na razini stanica i ekstracelularnog matriksa. Kao i neki drugi materijali, ekstracelularni matriks ima specifično fizikalno svojstvo zvano viskoelastičnost. To je svojstvo definirano deformiranjem i povratkom materijala u njegov prvobitni položaj tijekom odnosno nakon fizičkog stresa. Kod tumorskih tkiva on je gušći, a stanice invazivnog fenotipa moraju savladati kretanje kroz gušći i krući ekstracelularni matriks. U ovome radu za nasađivanje stanica u 3D kulture koristio se sintetizirani bioaktivni matriks za nasađivanje stanica u 3D kulturama čije su glavne komponente alginat i kolagen tipa 1. Krutost tog matriksa može se kontrolirati regulacijom koncentracije kalcija. Cilj ovog istraživanja je utvrditi postoji li značajna razlika u promatranim fenotipskim parametrima istih sferoida izvedenih iz staničnih linija nasađenih u bioaktivni matriks mekših i krućih mehaničkih svojstava. To se proučava za tri različite stanične linije: MCF-10A, MCF-10AT i MCF-DCIS.com. Dobiveni podaci ukazuju na to kako stanična linija MCF-DCIS.com pokazuje najmanje promjene fenotipa sferoida, zatim MCF-10AT, a zatim MCF-10A koje pokazuju razliku u svim promatranim fenotipskim parametrima za dvije različite krutosti bioaktivnog matriksa

    Regulacija aktivnosti ubikvitinske ligaze HACE1

    No full text
    The HECT ubiquitin ligase HACE1 is involved in membrane dynamics regulation, mitophagy, redox homeostasis, and cytoskeleton organization. Despite HACE1 being a tumor suppressor and a significant factor in neural development, it remains biochemically poorly characterized, and its regulatory mechanisms are not known. This master’s thesis explores the impact of phosphorylation as a regulatory mechanism and its effect on HACE1 activity and dimerization. Phosphomimetic variants were generated and characterized using functional assays, mass photometry, and analytical size exclusion chromatography. The findings reveal that the phosphomimetic mutations within the N-terminal helix disrupted dimerization and activated HACE1 activity, providing insights into how the monomer could be stabilized in its active state. Furthermore, recombinantly purified kinases PAK1 and TBK1 were investigated as potential regulators of HACE1 activity, and the sites targeted by these kinases in HACE1 sites were identified through mass spectrometry.Ubikvitinska HECT ligaza HACE1 sudjeluje u regulacije dinamike membrana, mitofagiji, redokshomeostazi i organizaciji citoskeleta. Unatoč tome što je ligaza HACE1 tumor-supresor i značajan faktor u razvoju živčanog sustava, nije detaljno biokemijski karakterizirana, a regulatorni mehanizmi nisu poznati. Ovaj diplomski rad istražuje utjecaj fosforilacije kao regulatornog mehanizma na aktivnost i dimerizaciju HACE1. Pripremljene su fosfomimetičke varijante i karakterizirane korištenjem funkcionalnih eseja, masene fotometrije i analitičke kromatografije temeljene na isključivanju. Rezultati otkrivaju da fosfomimetičke varijante unutar N-terminalnog heliksa narušavaju dimerizaciju i aktiviraju aktivnost ligaze HACE1, pružajući uvid u to kako se monomer može stabilizirati u aktivnom stanju. Nadalje, rekombinantno pročišćene kinaze PAK1 i TBK1 istražene su kao potencijalni regulatori. Mjesta u ligazi HACE1 koje te kinaze ciljaju identificirana su putem masene spektrometrije

    Genetic evidences of hybridization between mountain (Teucrium montanum L.) and felty germander (Teucrium polium L.)

    No full text
    Ovim diplomskim radom se po prvi put molekularnim pristupom istražila spontana interspecijska hibridizacija između vrsta Teucrium montanum L. i T. polium L.. Primijenjeno je 12 novorazvijenih mikrosatelitnih biljega zajedničkih za obje vrste. Istražen je polimorfizam mikrosatelitnih lokusa 70 jedinki roditeljskih vrsta i njihovih hibrida skupljenih na simpatričnom lokalitetu Vojnić Sinjski. Novi mikrosatelitni biljezi uspješno su razlučili obje roditeljske vrste kao i njihove hibride. Uz nedostatak F1 i F2 hibrida utvrđena je dominacija povratnih hibrida. Dominacija povratnog križanja u odnosu na međusobno križanje hibrida ukazuje na introgresiju kao primarni ishod, a ne na specijaciju hibrida. Premda T. montanum i T. polium zauzimaju jako široke ekološke niše, ekološki uvjeti na lokalitetu Vojnić Sinjski mnogo su bliži ekološkom optimumu nešto termofilnije vrste T. polium pa ne čudi puno češće povratno križanje baš s ovom vrstom. Buduća primjena novorazvijenih mikrosatelitnih biljega na cjelokupnim arealima omogućit će rasvjetljavanje zamršene taksonomije, filogeografije i hibridizacije ove dvije usko srodne vrste unutar sekcije Polium roda Teucrium.In this thesis, spontaneous interspecific hybridisation between the species Teucrium montanum L. and T. polium L. was studied for the first time using a molecular approach. Twelve newly developed microsatellite markers common to both species were applied. The microsatellite loci polymorphism of 70 individuals of the two parental species and their hybrids collected at the sympatric locality Vojnić Sinjski was studied. The new microsatellite markers successfully distinguished both parent species as well as their hybrids. Besides the absence of F1 and F2 hybrids, the dominance of backcross hybrids was observed. The dominance of backcrosses over hybrid intercrossing suggests that introgression is the primary outcome rather than hybrid speciation. Although T. montanum and T. polium occupy very broad ecological niches, the ecological conditions at the Vojnić Sinjski site are much closer to the ecological optimum of the more thermophilic T. polium, so it is not surprising that backcrosses with this species are much more common. The future application of the newly developed microsatellite markers to the entire distribution ranges will make it possible to clarify the complicated taxonony, phylogeography and hybridisation of these two closely related species within the section Polium of the genus Teucrium

    4,455

    full texts

    12,064

    metadata records
    Updated in last 30 days.
    Repository of Faculty of Science, University of Zagreb
    Access Repository Dashboard
    Do you manage Open Research Online? Become a CORE Member to access insider analytics, issue reports and manage access to outputs from your repository in the CORE Repository Dashboard! 👇