University of Zagreb

Repository of Faculty of Science, University of Zagreb
Not a member yet
    12064 research outputs found

    The neuroprotective effect of dehydroepiandrosterone-sulphate (DHEAS) in in vitro models of Alzheimer's disease

    No full text
    Alzheimerova bolest (AB) je najučestaliji oblik demencije koji se očituje kroz gubitak raznih kognitivnih sposobnosti. Uzrokovana je propadanjem neurona i sinaptičkih veza unutar mozga i visoko je povezana s nakupljanjem peptida amiloid beta (Aβ) u središnjem živčanom sustavu. Uglavnom se razvija kod ljudi starijih od 65 godina, a udio oboljelog stanovništva je u stalnom porastu. Bolest je posljedica velikog broja čimbenika, što je čini vrlo složenom i zasad neizlječivom. Istraživanja u biomedicini su, između ostalog, usmjerena i na pronalazak tretmana koji bi značajno usporili proces odumiranja neurona u mozgu. Potencijalan kandidat za to je neurosteroid dehidroepiandrosteron-sulfat (DHEAS) koji u središnjem živčanom sustavu pomaže u očuvanju neurona, a njegove endogene razine pozitivno koreliraju s kognitivnim sposobnostima. Cilj ovog rada bio je istražiti potencijalni učinak DHEAS-a u promociji preživljenja stanica korištenjem dvaju in vitro modela AB-a, primarne kulture mišjih neurona i stanične linije SH-SY5Y, tretiranih oligomerima Aβ. Rezultati istraživanja sugeriraju neuroprotektivno djelovanje DHEAS-a u staničnom modelu AB-a temeljenom na primarnoj kulturi mišjih neurona. S druge strane, isti učinak nije bilo moguće postići na staničnoj liniji SH-SY5Y tretiranoj oligomerima Aβ.Alzheimer's disease (AD) is the main cause of dementia which is characterised by the loss of various cognitive abilities. It is caused by neural and synaptic loss within the brain and is highly associated with the accumulation of amyloid beta (Aβ) peptide in the central nervous system. It mostly affects people older than 65 years and the overall percentage of people affected by it is constantly increasing. Many factors play a role in the formation of the disease, which makes it very complex and currently incurable. Research in biomedicine is, among other things, focused on finding treatments that would significantly reduce the neural loss in the brain. A potential candidate for this is the neurosteroid dehydroepiandrosterone-sulphate (DHEAS) which participates in neuronal preservation in the central nervous system, and its endogenous levels positively correlate with cognitive abilities. The aim of this research was to investigate the potential effect of DHEAS in promoting cell survival using two in vitro models of AD, primary cultures of mouse neurons and the SH-SY5Y cell line, both treated with Aβ oligomers. The obtained results suggest a neuroprotective effect of DHEAS in an in vitro model of AD based on the primary culture of mouse neurons. On the other hand, the same effect could not be achieved on the SH-SY5Y cell line treated with Aβ oligomers

    Polymorphism of SULT2A1 gene and plasma levels of dehydroepiandrosterone sulfate (DHEAS) in individuals with neurocognitive disorder

    No full text
    Neurosteroid dehidroepiandrosteron sulfat (DHEAS) uključen je u brojne moždane funkcije, uključujući učenje, pamćenje, ponašanje, neurogenezu, neuralnu plastičnost i neuroprotekciju. Istraživanja su utvrdila povezanost između endogenih koncentracija DHEAS-a i demencije, te kognitivnih sposobnosti osoba tijekom starenja. Međutim, u osoba s demencijom utvrđene su snižene, ali i povišene koncentracije DHEAS-a povezane s kognitivnim disfunkcijama, dok je pozitivan učinak DHEAS-a na kognitivne funkcije primijećen samo u nekim studijama. Cilj rada bio je istražiti razlike u plazmatskoj koncentraciji DHEAS-a te raspodjeli genotipova polimorfizma rs2637125 gena SULT2A1, koji kodira za enzim sulfotransferazu 2A1, odgovornu za pretvorbu dehidroepiandrosterona u sulfatni oblik, u 213 osoba s blagim i 91 osobe s velikim neurokognitivnim poremećajem. Također sam istražio utječu li varijacije u genu SULT2A1 na koncentraciju DHEAS-a u plazmi te postoji li njihova povezanost s težinom neurokognitivnog poremećaja. Dijagnoza demencije postavljena je prema DSM-5 kriterijima, a kognitivni simptomi evaluirani su testovima procjene mentalnog stanja. Iz krvi osoba izolirao sam plazmu i DNA. U plazmi sam odredio koncentraciju DHEAS-a metodom ELISA, dok sam genotipizaciju proveo metodom lančane reakcije polimerazom u stvarnom vremenu. Istraživanje nije utvrdilo značajne razlike u plazmatskoj koncentraciji DHEAS-a između osoba s blagim i velikim neurokognitivnim poremećajem, kao niti značajnu povezanost SULT2A1 polimorfizma s težinom neurokognitivnog poremećaja.Neurosteroid dehydroepiandrosterone sulfate (DHEAS) is involved in numerous brain functions, including learning, memory, behavior, neurogenesis, neural plasticity, and neuroprotection. Research suggested association of endogenous DHEAS concentrations with dementia and cognitive functions during aging. However, in dementia patients, both decreased and increased DHEAS concentrations were associated with cognitive dysfunctions, while DHEAS beneficial effects on cognition were observed only in some studies. The study aim was to investigate differences in DHEAS plasma concentration and genotype distribution of rs2637125 polymorphism in SULT2A1 gene, coding for enzyme sulfotransferase 2A1, responsible for conversion of dehydroepiandrosterone into its sulfate form, in 213 people with mild and 91 people with severe neurocognitive disorder. I also investigated whether variations in SULT2A1 gene affect plasma DHEAS concentration and their association with neurocognitive disorder severity. Dementia was diagnosed according to DSM-5 criteria, and cognitive symptoms were evaluated using mental state examination tests. Plasma and DNA were isolated from blood of subjects. Plasma DHEAS concentration was determined using ELISA method, while genotyping was performed using real time polymerase chain reaction.The study did not find any significant differences in DHEAS plasma concentration between individuals with mild and severe neurocognitive disorder, or any significant association of SULT2A1 polymorphism with severity of neurocognitive disorder

    Classification of credit score by logistic regression model: the problem of unbalanced categories

    No full text
    Cilj ovog rada je klasificirati kreditnu sposobnost modelom logističke regresije. U prvom poglavlju obrađeni su najvažniji pojmovi potrebni za razumijevanje logističke regresije. Prvo je objašnjeno kako se može definirati logistička regresija pomoću generaliziranih linearnih modela i koja je uloga funkcije veze logit. Zatim je dano objašnjenje kako se metodom maksimalne vjerodostojnosti procjenjuju parametri modela. Takoder, dani su najvažniji rezultati i testovi koji se koriste prilikom prilagodbe modela podacima. Drugo poglavlje bazirano je na primjeni logističke regresije za klasifikaciju klijenata koji su kreditno sposobni i onih koji nisu. Nakon analize i čišćenja podataka u deskriptivnoj statistici, testirana je značajnost nezavisnih varijabli modela. Nakon odabira modela, dane su metrike kojima se ispitala točnost predikcija modela. Treće poglavlje uzima u obzir da podaci imaju problem nebalansiranih kategorija. Iz tog razloga uveden je algoritam SMOTE kao pomoćni alat koji smanjuje razliku izmedu broja opažanja dviju klasa. Na kraju se usporeduju rezultati sa i bez SMOTE-a.The aim of this thesis is credit score classification using a logistic regression model. In the first chapter, the key concepts necessary for understanding logistic regression are covered. First, it explains how logistic regression can be defined using generalized linear models and the role of the logit link function. Then, an explanation is given of how the parameters of the model are estimated using the maximum likelihood method. Additionally, the most important results and tests used for the goodness of fit of the model to the data are presented. The second chapter focuses on applying logistic regression for credit score classification. After analyzing and cleaning the data in descriptive statistics, the significance of the independent variables in the model is tested. Following the model selection, metrics are provided to evaluate the performance of the model’s predictions. The third chapter addresses the issue of imbalanced data. For this reason, the SMOTE algorithm is introduced as an auxiliary tool to reduce the difference between the number of observations of the two classes. Finally, the results with and without the use of SMOTE are compared

    Two-factor Vasicek term stucture model of interest rates

    No full text
    Glavna ideja ovog rada bila je uvođenje i analiza dvofaktorskog Vasičekovog modela kamatnih stopa. Cilj je bio usporediti dvofaktorske modele s jednofaktorskim, predstaviti dvofaktorski Vasičekov model te izvesti formulu za cijenu obveznica bez kupona u tom modelu. U prvom poglavlju upoznali smo se s financijskim pojmovima potrebnima za daljnji rad. Uveli smo pojmove Brownovog gibanja, Itovog integrala, Itovog procesa i Itove formule, a zatim smo napravili uvod u cijene obveznica bez kupona. Ukratko smo opisali Hull-Whiteov model kamatnih stopa, budući da je verzija tog modela s konstantnim koeficijentima upravo dvofaktorski Vasičekov model, koji je glavna tema ovog rada. U drugom poglavlju dana je motivacija za uvodenje višefaktorskih modela kamatnih stopa. Treće poglavlje bilo je posvećeno Vasičekovom modelu. Najprije smo dvofaktorski model definirali sustavom stohastičkih diferencijalnih jednadžbi nakon čega smo ga reducirali na kanonski dvofaktorski Vasičekov model. Zatim smo izveli formulu za cijenu obveznica bez kupona u kanonskom modelu. Nadalje, izveli smo sustav stohastičkih diferencijalnih jednadžbi za kratkoročnu i dugoročnu stopu. U nastavku smo uveli degenerirani Vasičekov model, Gaussovske faktorske procese te smo proveli kalibraciju kanonskog Vasičekovog modela, gdje smo u jednadžbi kamatne stope konstantu δ0\delta_{0} zamijenili neslučajnom funkcijom vremena δ0t\delta_{0t}. Rad smo završili usporedbom jednofaktorskih i dvofaktorskih modela te naveli zašto je prihvatljivije koristiti dvofaktorski Vasičekov model u odnosu na jednofaktorski

    Theory of classical electrodynamics with topologically quantized singularities as electric charges

    No full text
    U ovom radu iskazana je teorija klasične elektrodinamike u kojoj jedini dozvoljeni električni naboji odgovaraju topološkim singularitetima u elektromagnetskom polju, dok kontinuirane raspodjele naboja nisu dopuštene. Kvantizacija naboja unutar teorije garantirana je Chernovim teoremom. Teorija je formulirana pomoću para Weylovih jednadžbi, čija svojstvena stanja parametarski ovise o prostornim i vremenskim koordinatama i obliku trajektorije singulariteta. Pomoću svojstvenih stanja Weylove jednadžbe računaju se Berryjeva koneksija i Berryjeva zakrivljenost. Dobivene komponente Berryjeve zakrivljenosti egzaktno odgovaraju komponentama elektromagnetskog polja točkastog naboja dobivenog iz Maxwellovih jednadžbi, do na fiksnu multiplikativnu konstantu. Detaljnim računom pokazano je da ovaj rezultat vrijedi za proizvoljnu trajektoriju naboja.This thesis presents an alternative formulation of classical electrodynamics where the only permissible electric charges correspond to topological singularities in the electromagnetic field, thereby disallowing continuous charge distributions. Charge quantization within this theory is guaranteed by the Chern theorem. The theory is formulated using a pair of Weyl equations, whose eigenstates have a parametric dependence on spacetime coordinates and the trajectory of the singularity. These eigenstates are then used to calculate the Berry connection and Berry curvature. The obtained components of Berry curvature exactly correspond to the electromagnetic field components of a singular electric charge, as predicted by Maxwell equations. This result is demonstrated, via detailed calculation, to be valid for an arbitrary motion trajectory of the charge

    Substrates for microtopographic and galvanotropic axonal guidance

    No full text
    Tijekom razvoja mozga aksoni rastu prema svom cilju s visokim stupnjem preciznosti. Za točno usmjeravanje odgovorne su kemijske, topografske i galvanotropske naznake. Istraživanje djelovanja vanjskih naznaka na vodenje aksona bitno je za moguće kliničke primjene, kao što su ubrzavanje regeneracije živčanih puteva nakon traumatskih ozljeda, ali i za znanstvena istraživanja kao što su karakterizacije živih neuralnih mreža. U ovom radu izradujemo podloge s različitim topografskim i galvanotropskim elementima koje se mogu koristiti za daljnje istraživanje aksonalnog vodenja. Za izradu topografskih naznaka koristimo nanosekundni i femtosekundni laser kojima mikrostrukturiramo površinu laserskom ablacijom. Podloge proizvodimo na komadima borosilikatnog stakla i silicija te promatramo efekte laserskih pulseva različite duljine i energije na dielektrični i poluvodički materijal. Za karakterizaciju uzoraka koristimo optički i kontaktni profilometar te pretražni elektronski mikroskop. Mjerimo ovisnosti volumena, promjera i dubine ablacijskog kratera o energiji pulsa te D2 metodom računamo minimalnu ekspoziciju. Za galvanotropsko vodenje koristimo organske elektrolitske fotokondenzatore (OEPC) koji su izradene od organskih poluvodiča. OEPC su optoelektronički stimulatori koji se koriste za kapacitivnu neurostimulaciju. Koristeći nanosekundni i kontinuirani laser uklanjamo dizajnirani uzorak p-n dvosloja s površine fotokondenzatora čime stvaramo inverzne fotokondenzatore. Karakteriziramo inverzne fotokondenzatore mjerenjem tranzijentnog električnog potencijala.During brain development axons grow towards their target with a high degree of accuracy. Chemical, topographical and galvanotropic cues are responsible for their guidance. Research of external cues for axonal guidance is vital for the possible clinical applications, such as accelerating nerve regeneration after traumatic injuries, as well as for scientific research (e.g. characterization of living neural networks). We designed and produced substrates with different topographical and galvanotropic elements which can be used for the investigation of axonal guidance. Microstructuring of the surface is done by using nanosecond and femtosecond laser ablation. Materials used for the substrates are borosilicate glass (dielectric) and silicon (semiconductor) on which the effects of different duration and energy of laser pulses are studied. Characterization was done using an optical profilometer, a contact profilometer and a scanning electron microscope. Dependence of the ablated volume, the diameter and the depth of ablation craters for different pulse energies is measured. The ablation threshold fluence is determined by the D2 method. Organic electrolytic photocapacitors (OEPCs) were used for fabrication of the substrates with the galvanotropic cues. OEPCs are optoelectronic stimulators based on a p-n bilayer of organic semiconductors which are used for capacitive neurostimulation. Using a nanosecond and a continuous laser, a designed pattern of a p-n bilayer was removed from the surface of the photocapacitor, thus making an inverse photocapacitor. Characterization of said inverse photocapacitors is done by measuring the transient electric potential inside the physiological medium mimicking electrolyte

    Impact of endocrine disruptors on reproduction of sea molluscs

    No full text
    Mnoge vrste koje pripadaju koljenu mekušaca imaju veliku komercijalnu i ekološku važnost. Poseban naglasak stavlja se na skupine, ponajviše školjkaše i puževe, koji služe kao bioindikatori u okolišnim studijama, uglavnom vezanim uz čistoću voda. Neke komponente donesene u okoliš mogu znatno utjecati na njihovo razmnožavanje i razvoj. Te komponente nazvane su EDC (Endocrine disrupting compounds) ili ED (endocrine disruptors), a ovisno o proučavanoj vrsti, njihov utjecaj je različit. Možemo ih podijeliti u tri skupine. Androgene, kseno-estrogene i antiandrogene. Najbolje istražena pojava kod mekušaca je imposeks fenomen koji je uočen prvenstveno kod prosobranhijalnih puževa, a primarni uzročnik je tributil-kositar (TBT) koji je možda najbitniji primjer endokrinog disruptora (ED) u moru unesen od strane čovjeka. Još je niz pojava uzrokovanih ED-a, no nisu tako detaljno proučene.Many species which belong to phylum Mollusca have great commercial and ecological importance. Special emphasis is on the species, specifically bivalves and gastropods, which are used as bioindicators in environmental studies, mainly about water quality. There are a lot of anthropogenic components in environment which affect animal endocrine system, including their reproduction. They are called EDCs (Endocrine disrupting compounds) or EDs (endocrine disruptors) and they have different impact on investigated species. We can divide EDin three categories: xeno-estrogens, androgens and antiandrogens. The most known phenomenon in molluscs, specifically prosobranchial snails, is imposex, which is direct consequence of trybutyl-tin (TBT), an organogenic compound introduced in the environment by human. There are more deformations caused by EDs, but they have to be researched more thoroughly yet

    Determinants of financial literacy

    No full text
    Financijska pismenost je ključna za moderni život, zbog svojeg pozitivnog utjecaja na pojedince i društvo, a smanjujući zaduženost i povećavajući štednju doprinosi i javnim financijama. OECD definira financijsku pismenost kao kombinaciju svijesti, znanja, vještina, stavova i ponašanja potrebnih za donošenje ispravnih financijskih odluka i postizanje financijske dobrobiti. Financijsko obrazovanje pomaže pojedincima razumjeti financijske proizvode i koncepte, razviti vještine i donositi informirane odluke. Mnoge zemlje, pa tako i Hrvatska, razvile su programe i kampanje financijskog obrazovanja. OECD ima ključnu ulogu u istraživanju i promicanju financijske pismenosti, podupiranjem principa financijske uključenosti, zaštite potrošača i nacionalnih strategija za financijsko obrazovanje. Globalna istraživanja pokazuju da je financijska pismenost na niskim razinama u mnogim zemljama, neovisno o razvijenosti financijskih tržišta ili vrsti mirovinskog sustava. U Hrvatskoj, kao i globalno, empirijski dokazi ukazuju na potrebu za intervencijama koje ciljaju na poboljšanje financijske pismenosti, s posebnim fokusom na ranjive skupine poput žena i mladih. U ovom radu utvrđujemo odrednice financijske pismenosti u Europskoj uniji koristeći pregled ranijih istraživanja i statističkih metoda primijenjenih na podacima iz istraživanja Eurobarometra provedenog 2023. godine. Korištena je ordinalna logistička regresija, pri čemu je finalni model odabran korištenjem forward–stepwise metode uz pomoć Akaikeovog informacijskog kriterija. Analiza pokazuje da žene ostvaruju nešto niže ocjene u financijskom znanju nego muškarci. Viša razina obrazovanja povezana je s boljim rezultatima u financijskom znanju. Istraživanje financijske pismenosti pruža vrijedne uvide u oblikovanju ciljanih strategija za unapređenje financijske pismenosti. U odnosu na ranija istraživanja, pokazuje se da građani bolje razumiju inflaciju. Hrvatski građani postigli su iznadprosječan rezultat ukupne financijske pismenosti u odnosu na zemlje sudionice, međutim je digitalna financijska pismenost niža od prosjeka. Rezultati sugeriraju važnost prilagodbe pristupa specifi čnim potrebama različitih demografskih skupina kako bi se osigurala učinkovitost implementacije

    Modeliranje rasta avaskularnog tumora

    No full text
    In this thesis, the aim was to analyze the growth of tumour spheroids using the Gompertz, logistic, classical von Bertalanffy and general models of growth. The data set contains average volumes of 16 multicellular tumour spheroids of chondroblastic osteosarcoma tumours measured at 7 time points. The models were fitted to the data and compared. The Gompertz and classical von Bertalanffy models provided poor fits to the data, while the logistic and general models fit the data well. To decide which model is the best, the post hoc analysis was used. The F-test showed that there is no sufficient evidence to conclude that the models are significantly different in terms of their effectiveness. Since the logistic model has one parameter less than the general model, it is more parsimonious and should be used for further analysis

    Axially deformed relativistic quasiparticle random-phase approximation based on point-coupling interactions

    No full text
    Collective nuclear excitations, like giant resonances, are sensitive to nuclear deformation, as evidenced by alterations in their excitation energies and transition strength distributions. A common theoretical framework to study these collective modes, the random-phase approximation (RPA), has to deal with large dimensions spanned by all possible particle-hole configurations satisfying certain symmetries. It is the aim of this work to establish a new theoretical framework to study the impact of deformation on spin-isospin excitations, that is able to provide fast and reliable solutions of the RPA equations. The nuclear ground state is determined with the axially deformed relativistic Hartree-Bogoliubov (RHB) model based on relativistic point-coupling energy density functionals (EDFs). To study the excitations in the charge-exchange channel, an axially deformed proton-neutron relativistic quasiparticle RPA (pnRQRPA) is developed in the linear response approach. After benchmarking the axially deformed pnRQRPA in the spherical limit, a study of spin-isospin excitations including Fermi, Gamow-Teller (GT), and spin-dipole (SD) is performed for selected pf -shell nuclei. For GT transitions, it is demonstrated that deformation leads to a considerable fragmentation of the strength function. A mechanism inducing the fragmentation is studied by decomposing the total strength to different projections of total angular momentum K and constraining the nuclear shape to either spherical, prolate, or oblate. A similar fragmentation is also observed for SD transitions, although somewhat moderated by the complex structure of these transitions, while, as expected, the Fermi strength is almost shape independent. The axially deformed pnRQRPA introduced in this work open perspectives for the future studies of deformation effects on astrophysically relevant weak interaction processes, in particular beta decay and electron capture

    4,455

    full texts

    12,064

    metadata records
    Updated in last 30 days.
    Repository of Faculty of Science, University of Zagreb
    Access Repository Dashboard
    Do you manage Open Research Online? Become a CORE Member to access insider analytics, issue reports and manage access to outputs from your repository in the CORE Repository Dashboard! 👇