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Cross-Feeding interaction within microcystis phycosphere: New perspectives from the combination of metagenomics, metametabolomics and genome-scale metabolic modeling approaches
No full textInternational audienceIn the face of global changes, cyanobacterial blooms are of increasing concern due to their impact on the environment, animal and human health, withpotential significant economic consequences. Despite evidence regarding environmental factors that promote such harmful events, there remains alimited understanding of the physiological and ecological mechanisms behind them. However, cross-feeding interactions between cyanobacteria andtheir microbiome may be involved, facilitating an optimal and symbiotic use of nutrients within the phycosphere.To elucidate these mechanisms, this study aims to characterize the cross-feeding interactions within the phycosphere of 12 Microcystis strains and theirassociated heterotrophic bacteria, sampled during a bloom in a lake in France. Metagenomics formed the basis for reconstructing genomes and theirassociated genome-scale metabolic networks (GSMNs). These are particularly relevant due to their ability to predict metabolic networks and microbialinteractions. Complementary, metabolomics was used as a tool to validate these predictions.Taking advantage of this multi-omics approach, we compared the metabolic capacities (e.g., production of microcystins) of the 12 microbiomes.Although the bacterial taxa associated with the 12 Microcystis strains differ, the metabolic functions carried out by the communities are similar. Wehighlighted differential metabolite synthesis, both at the modeling and metabolomics levels, between individual strains and communities, suggestingcomplementary functions between Microcystis and its associated bacteria. Metabolomics revealed discrepancies in the chemical composition of the12 Microcystis communities. Notably, it showed that some metabolites were detectable only in one or a few strains (e.g., Aeruginosins). While severalclasses of bioactive peptides were identified (e.g., microcystins, microginins), ongoing investigations aim to expand the annotation to support thevalidation of metabolism predictions from GSMNs.Overall, our study demonstrates the relevance of multi-omics approaches and computational models to unravel functional and ecological mechanismsrelated to the relationship between cyanobacteria and their microbiome that potentially contribute to blooms
Les formes pulmonaires de leptospirose canine, étude bibliographique et rétrospective des cas présentés à l'ENVA entre 2007 et 2025
No full textPulmonary forms (PF) of canine leptospirosis are feared for their lethality and remain poorly characterized. This study aimed to provide a comparative synthesis of the human and veterinary literature, to describe PF, and to compare them with non-pulmonary forms (controls, C) in order to identify distinctive features and assess the specific prognosis. This monocentric retrospective study (CHUV-AC, ENVA) included 49 dogs (18 PF, 31 C). The variables analyzed combined clinical, paraclinical, and laboratory data. Comparisons were performed using tests adapted to distribution (Student/Mann-Whitney, Fisher ; significance threshold p<0.05). Demographic characteristics did not differ significantly between groups. PF were associated with more extra-pulmonary hemorrhages (83% vs 33%, p<0.01) and hypothermia during hospitalization (77% vs 41%, p<0.05). Oligo-anuria was more frequent among PF, suggesting associated acute renal involvement. Median creatinine at admission was higher in PF (p<0.05). Among the pulmonary forms, the worsening of hyperkalemia during hospitalization suggested a progression of renal impairment. The evolution of hematocrit and venous PCO₂ in PF was consistent with the onset of pulmonary hemorrhage. On imaging, alveolar opacity was very frequently observed on radiographs of PF (71% vs 5.9%, p<0.01); thoracic POCUS was abnormal in 100% of PF (vs 36.6%, p<0.05). Abdominal ultrasound examinations revealed an association between biliary sludge and PF (73% vs 32%, p<0.05) and a trend for gallbladder mucocele (p = 0.06). Prognosis was markedly unfavorable (survival 29% vs 89%, p<0.01), with shorter hospitalization, probably due to early death. In dogs, PF of leptospirosis represent a major marker of severity, combining respiratory abnormalities, hemorrhagic signs, more severe renal dysfunction, and increased mortality. Early diagnosis (clinical + imaging), strict hemodynamic monitoring, rigorous fluid management, and early implementation of organ support are recommended. Multicentric prospective studies are needed to validate these findings and standardize management strategies.Les formes pulmonaires (FP) de leptospirose canine sont redoutées pour leur létalité et restent peu caractérisées. Cette étude vise à présenter une synthèse comparée de la littérature humaine et vétérinaire, à décrire les FP et à les comparer aux formes non pulmonaires (contrôles, C) afin d'identifier des caractéristiques distinctives et d'évaluer le pronostic spécifique. Cette étude rétrospective monocentrique (CHUV-AC, ENVA) a recruté 49 chiens (18 FP, 31 C). Les caractères étudiés combinaient données cliniques, paracliniques et de laboratoire. Les comparaisons ont utilisé des tests adaptés à la distribution (Student/Mann-Whitney, Fisher ; seuil p < 0,05). Les caractéristiques démographiques ne différaient pas significativement entre groupes. Les FP présentaient davantage d'hémorragies extra-pulmonaires (83 % vs 33 %, p < 0,01), (en particulier d'hémorragies externalisées et de méléna) et d'hypothermie en cours d'hospitalisation (77 % vs 41 %, p < 0,05). La présence d'une oligo-anurie était plus fréquente parmi les FP, suggérant une atteinte rénale aiguë associée. La créatininémie médiane à l'admission était plus élevée dans les FP (p < 0,05). Parmi les FP, l'aggravation de l'hyperkaliémie au cours de l'hospitalisation suggérait une aggravation de l'atteinte rénale. L'évolution de l'hématocrite et de la PCO₂ veineuse parmi les FP était cohérente avec l'apparition d'hémorragies pulmonaires. En imagerie, une opacité alvéolaire était très fréquemment retrouvée sur les clichés radiographiques des FP (71 % vs 5,9 %, p < 0,01) ; le POCUS thoracique était anormal chez 100 % des FP (vs 36,6 %, p<0,05). L'étude des examens échographiques a permis d'identifier une association entre la boue biliaire et la FP (73 % vs 32 %, p < 0,05) et une tendance pour la mucocèle biliaire (p = 0,06). Le pronostic était nettement défavorable (survie 29 % vs 89 %, p < 0,01) avec une hospitalisation plus courte, du fait de décès précoces. Chez le chien, la FP de leptospirose est un marqueur majeur de gravité, associant anomalies respiratoires, signes hémorragiques, dysfonction rénale plus grave et surmortalité. Un diagnostic précoce (clinique + imagerie), une surveillance hémodynamique stricte, une gestion rigoureuse des fluides et un recours anticipé aux supports d'organes sont recommandés. Des études prospectives multicentriques seront nécessaires pour valider ces résultats et standardiser les stratégies de prise en charge
Établissement d'un intervalle de référence des valeurs d'hématocrite et des protéines totales chez les poules pondeuses de la filière œuf de consommation
No full textThe table-egg production sector plays a major role in French poultry farming, and the health monitoring of laying hens largely relies on routine blood analyses, the interpretation of which requires reliable reference values. Among the field-accessible parameters, hematocrit and total protein concentrations are relevant, easy-to-measure, and directly exploitable indicators. However, their interpretation remains limited by the lack of reference intervals established according to current methodological standards. This study aimed to establish rigorously defined reference intervals for these two parameters, applicable to laying hens reared in conditions representative of the commercial egg production sector. A total of 148 apparently healthy hens, aged between 20 and 80 weeks, were sampled from nine commercial farms located in Western France. The selected farms showed no clinical signs of disease, maintained a good health status, and operated under stable production conditions. Blood samples were collected and analyzed following standardized protocols. Hematocrit values were determined by microcentrifugation, and total protein levels were measured using refractometry. Statistical processing was performed with the Reference Value Advisor software, following the guidelines of the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) for establishing reference intervals. The reference interval for hematocrit was defined between 23,0 % and 30,0 %, and that for total proteins between 70 and 120g/L. Significant variability in total protein concentrations was observed between farms. This heterogeneity, likely linked to extrinsic factors such as feeding practices, health status, or management conditions, raises questions about the relevance of a single reference interval for the entire sector. It suggests that a more individualized, farm-specific approach may be more appropriate in certain contexts. In conclusion, this work provides useful biological benchmarks for the interpretation of hematocrit and total protein values in poultry farming, thereby enhancing the relevance of field blood tests and supporting veterinary decision-making. The hematocrit reference interval, established from a homogeneous population, emerges as a robust and reliable parameter that can be confidently used and considered a central marker for the clinical evaluation of laying hens.La filière œuf de consommation occupe une place majeure dans la production avicole française et le suivi sanitaire des poules pondeuses repose en grande partie sur des analyses biologiques de routine, dont l'interprétation nécessite des valeurs de référence fiables. Parmi les paramètres accessibles en terrain, l'hématocrite et les protéines totales représentent deux indicateurs pertinents, faciles à mesurer et directement exploitables. Néanmoins, leur interprétation reste limitée par l'absence d'intervalles de référence construits selon les standards méthodologiques en vigueur. Ce travail a ainsi pour objectif de proposer un intervalle de référence rigoureusement établi pour ces deux paramètres, applicable aux poules pondeuses de la filière œuf de consommation élevées dans des conditions comparables. Un total de 148 poules apparemment saines, âgées de 20 à 80 semaines, ont été prélevées dans neuf élevages commerciaux localisés dans l'Ouest de la France. Les élevages sélectionnés répondaient à une absence de signes cliniques, un statut sanitaire sain et des conditions de production stables. Les échantillons sanguins ont été analysés selon des protocoles standardisés. Les valeurs d'hématocrite ont été déterminées par microcentrifugation et les protéines totales ont été mesurées par réfractométrie. Les données ont été traitées statistiquement avec le logiciel Reference Value Advisor, en suivant les recommandations de l'Institut des Normes et de la Santé en Laboratoire (CLSI) relatives à l'établissement d'intervalles de référence. L'intervalle de référence de l'hématocrite a été établi entre 23,0% et 30,0%, et celui des protéines totales entre 70 et 120g/L. Une variabilité importante des concentrations de protéines totales a été observée entre les élevages. Cette hétérogénéité, liée à des facteurs potentiellement extrinsèques tels que l'alimentation, le statut sanitaire ou les pratiques d'élevage, soulève la question de la pertinence d'un intervalle de référence unique pour les protéines totales applicable à l'ensemble de la filière. Elle suggère qu'une approche individualisée par élevage pourrait être plus adaptée dans certains contextes. En conclusion, ce travail fournit des repères biologiques utiles pour l'interprétation de l'hématocrite et des protéines totales en élevage avicole, renforçant la pertinence des bilans biologiques et la prise de décision vétérinaire. L'intervalle de référence de l'hématocrite, établi à partir d'une population homogène, apparaît comme une donnée robuste et fiable, pouvant être utilisée avec confiance et constituant un marqueur central pour l'évaluation clinique des poules pondeuses
Systèmes agri-alimentaires circulaires : valoriser les excrétats humains séparés à la source pour assurer la sécurité alimentaire et en eau sur les territoires
No full textInternational audienc
Can action heroines age? The return of Sarah Connor in Terminator: Dark Fate (2019)
No full textInternational audienc
Intravenous administration of antibiotics by prolonged and continuous infusion
No full textInternational audienceHighlightsProlonged or continuous infusions may improve the ease of administration and/or clinical effectiveness in some situations.Antibiotics, in particular beta-lactam antibiotics, are unstable molecules, their infusion modes must be strictly controlled.These guidelines, based on a literature review, suggest practical methods of administration in hospitals and outpatient care.</ul
Oncology pharmacy practice: Key insights, challenges, and perspectives – A position paper from the French Society for Oncology Pharmacy (SFPO)
No full textInternational audienceThe role of hospital oncology pharmacists (HOP) in the care of cancer patients has evolved considerably. This evidence led the experts of the French Society for Oncology Pharmacy (SFPO) to write a position paper. The first part presents the key insights of oncology pharmacy services (technology aspects of anticancer drug preparation and clinical pharmacy services), training of HOPs and research activities (clinical trials, research in oncology pharmacy). The second part of this position paper refers to the challenges and perspectives of E-health and artificial intelligence, precision medicine, access to innovation, and environmental issues
Estimation des besoins en santé mentale : cadre conceptuel et approche territorialisée en France
No full textPlusieurs politiques publiques récentes ont mis en avant la nécessité de mieux estimer les besoins dans le champ de la santé mentale en France avec une approche territorialisée. C’est notamment le cas de la dotation populationnelle au cœur de la réforme du financement de la psychiatrie hospitalière de 2022. De plus, les diagnostics partagés des Projets Territoriaux de Santé Mentale (PTSM), introduits par la loi de modernisation de notre système de santé de 2016, soulèvent des réflexions sur des méthodes d’estimation des besoins facilement mobilisables par les acteurs locaux afin d’enrichir ces diagnostics territoriaux. Dans ce mémoire, nous effectuons une étude exploratoire de l’estimation des besoins en santé mentale sur les territoires, en nous intéressant aux apports de la géographie pour une telle étude. La première partie propose un cadre conceptuel pour une gradation des besoins et des réponses dans le champ de la santé mentale sur les territoires, qui nous permet d’adopter une approche graduée de la sévérité des troubles psychiques dans la suite de notre étude. La deuxième partie se compose d’une revue de littérature sur les méthodes d’estimation des besoins en santé mentale, centrée sur les méthodes d’estimation qui intègrent les déterminants sociaux de la santé mentale. Ces méthodes s’appuient sur la corrélation entre variables sociales et besoins en santé mentale au niveau des territoires. Dans la troisième partie, nous identifions les sources d’informations mobilisables pour estimer les besoins en santé mentale en France. Dans la quatrième partie, nous présentons la méthodologie d’une première application d’une approche territorialisée de l’estimation des besoins en santé mentale en France sur quatre territoires, et nous décrivons les résultats de cette application dans la cinquième partie. La sixième et dernière partie discute les résultats de ce travail et présente les perspectives de recherche futures sur l’estimation des besoins en santé mentale dans le champ de la géographie
La séquence lœssique de Morcourt (Somme, France) : un enregistrement remarquable du Pléniglacaire weichselien en contexte de versant
No full textInternational audienceIn the loess sequences of the Last Glacial (Weichselian) of northern France, the Middle Pleniglacial (MPG, 60 - 35 ka) almost equivalent to the marine isotope stage (MIS) 3, is relatively poorly understood due to a thin and generally uncontrasted pedosedi- mentary record. The Morcourt slope sequence (Somme) presents an exceptional total sedimentary accumulation of approximately 10 m in thickness on which geochronological, malacological and sedimentological analyses were carried out to propose a detailed paleoenvironmental reconstruction.The chronological framework established for the soil complex at the base of the sequence (~ 2 m thick) between approxi- mately 58 and 30 ka confirms its attribution to the MPG. The sequence rests directly on the weathered calcareous substrate and begins with a phase of major slope erosion marking the transition with the Lower Pleniglacial, rarely recorded on sites in this region. It is followed by the deposit of levels of colluvium and the formation of several levels of boreal to arctic brown soils in a context of low loess sedimentation. In these weakly carbonated horizons, the study of mollusc assemblages highlights for the first time the tran- sition from a steppe environment to a more humid tundra. Finally, the 6-m thick upper layered calcareous loess deposit is attributed to the Upper Pleniglacial (UPG, ≈ MIS 2, 35 - 15 ka) by comparison with other regional records. The identification of MPG and UPG marker horizons and their dating make it possible to propose long-distance correlations with stratigraphic sequences across northwestern Europe (Germany and Belgium) as well as with a reference indicator of global climate variations (δ18O from NGRIP).Field and laboratory work demonstrated the quality of the high-resolution recording of the Morcourt sequence, making it a new reference for the Last Glacial loess of northern France.Dans les séquences lœssiques du Dernier Glaciaire (Weichselien) du nord de la France, le Pléniglaciaire moyen (PGM, 60 - 35 ka), associé au stade isotopique marin (SIM) 3, est assez mal défini en raison d’un bilan pédosédimentaire peu épais et généralement peu contrasté. La séquence de versant de Morcourt (Somme) présente une accumulation sédimentaire exceptionnelle d’environ 10 m d’épaisseur sur laquelle des analyses géochronologiques, malacologiques et sédimentologiques ont été réalisées en vue de proposer une reconstitution paléoenvironnementale détaillée. Le cadre chronologique établi pour le complexe de sols à la base de la séquence (~ 2 m d’épaisseur) entre environ 58 et 30 ka confirme son attribution au PGM. La séquence repose sur un substrat crayeux altéré et débute par une phase d’érosion majeure du versant marquant la transition avec le Pléniglaciaire inférieur rarement enregistrée sur les sites de cette région. S’ensuit la mise en place de niveaux de colluvions puis de plusieurs niveaux de sols bruns boréaux à brun arctique dans un contexte à sédimentation lœssique faible. Dans ces horizons faiblement carbonatés (inédit pour la période), l’étude malacologique met en évidence la transition d’un environnement steppique vers une toundra plus humide. Enfin, le dépôt de lœss calcaire sus-jacent de 6 m d’épaisseur est attribué au Pléniglaciaire supérieur (PGS, 35 - 15 ka, ≈ SIM 2) par comparaison avec les autres enregistrements régionaux. L’identification d’horizons repères du PGM et du PGS et leur datation permet de proposer des corrélations longue-distance avec les séquences stratigraphiques à l’échelle de l’Europe nord-occidentale (Allemagne et Belgique), ainsi qu’avec l’enregistrement de référence des variations climatiques globales au Pôle Nord (δ18O de NGRIP). Les travaux de terrain et les analyses de laboratoire ont démontré la qualité de l’enregistrement à Morcourt, qui devient ainsi une nouvelle séquence de référence pour les lœss du Dernier Glaciaire du nord de la France