Publications scientifiques de l'EnvA
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    La candidose due aux levures du genre Candida chez les colombidés

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    This thesis focuses on the study of candidiasis in columbidae birds, a fungal infection primarily caused by yeasts of the genus Candida, whose public health significance is heightened by the emergence of antifungal resistance. The main objective was to determine the prevalence of thisinfection in urban pigeons and to understand whether the carrier individuals exhibit clinical symptoms. This study was conducted using a cross-sectional approach. From March 1, 2023, to August 8, 2023, 215 subjects were included, consisting of 110 rock pigeons, 78 wood pigeons, and 27 Eurasian collared doves, all admitted to a wildlife rehabilitation center. The individuals presented either wounds or trauma, infectious or nutritional diseases, or were healthy. It was only possible to complete the study in its entirety for 88 of them. However, the data collected from these individuals could be used in the majority of the statistical analyses. Swab samples from the crop and cloaca revealed a prevalence of Candida of 15,6% among columbids received at CHUV-FS, with the majority of carrier birds being asymptomatic. Among the identified yeast species, Candida albicans accounted for 80% of the isolates, followed by Kazachstania telluris at 20%. Data analysis showed that birds carrying Candida did not exhibit significant differences in terms of weight gain or loss compared to non-carrier birds. No lesions indicative of candidiasis were observed during post-mortem analyses of the 41 birds that underwent autopsy. The study's findings of low prevalence and contagiosity of candidiasis suggest that systematic testing upon admission to wildlife rehabilitation centers is not necessary.Cette thèse porte sur l'étude de la candidose chez les colombidés, une infection fongique causée principalement par les levures du genre Candida, et dont l'importance en santé publique est grande avec l'émergence de leur résistance aux antifongiques. L'objectif principal était de déterminer la prévalence de cette infection chez les pigeons des centres de soins et de comprendre si les individus porteurs présentent des symptômes cliniques. Cette étude a été réalisée au travers d'une approche transversale. Du 1er mars 2023 au 8 août 2023, 215 sujets ont été inclus dont 110 pigeons bisets, 78 pigeons ramiers, 27 tourterelles turques, tous reçus en centre de soin. Les individus présentaient soit des plaies ou des traumatismes, soit des maladies infectieuses ou nutritionnelles, ou encore étaient sains. Il n'a été possible de réaliser l'étude dans sa totalité que pour 88 d'entre eux. Cependant, les données récoltées sur ces individus ont pu être utilisées dans la majorité des analyses statistiques. Les prélèvements effectués par écouvillonnage du jabot et du cloaque ont révélé que la prévalence de Candida est de 15,6 % chez les colombidés reçus au CHUV-FS et que la majorité des oiseaux porteurs est asymptomatique. Parmi les espèces de levure identifiées, Candida albicans représentait 80 % des isolats, suivie de Kazachstania telluris à 20 %. L'analyse des données a montré que les oiseaux porteurs de Candida ne présentaient pas de différences significatives en termes de prise ou perte de poids par rapport aux oiseaux non porteurs. Aucune lésion évocatrice de candidose n'a été observée lors des analyses post-mortem sur les 41 oiseaux passés en autopsie. La faible prévalence et contagiosité de la candidose mise en évidence par l'étude suggère que les tests systématiques à l'entrée dans les centres de soins à la faune sauvage ne sont pas nécessaires

    Enrichissement de l'hôpital virtuel des équidés de l'EnvA en ligne sur la plateforme Moodle avec des cas cliniques de coliques

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    The following thesis allowed for two clinical cases of colics in horses to develop on the Moodle platform in the perspective of enriching the Alfort National Veterinary School’s equine virtual hospital. Firstly, theoretical and practical teachings dispensed at Alfort National Vet School on colic management and the frame of reference of veterinary studies are detailed in order to draw attention to the knowledge that is still to be developed in both clinical cases. The domestic carnivore virtual hospital’s improvements and recent benefits to the equine virtual hospital were highlighted. Subsequently, an evaluation form at gathering feedback from recent graduates on the education they received during their studies and their use of virtual hospitals was created and sent to the last 4 year-groups with an equine major of Alfort Vet School. The results of evaluation highlight that former students are very favorable and encourage the creation of clinical cases of colic. It also revealed that 80% of them would usually use self-assessment exercises. The two intestinal disorders usually treated in practice and detailed in this thesis are the strangulated obstruction of the small intestine due to a pedunculated lipoma and the nephro-splenic entrapment of the left ventral and dorsal colon. For each of these cases, a thorough presentation was carried out following the same progression: anatomical reminders, epidemiology, clinical signs, differential diagnosis, supplementary examinations, treatment, complications and prognosis. The bibliography as well as several real cases of colic enabled the development of 20 to 25 questions by disorder dealing with fundamental knowledge and the diagnostic approach that are crucial to acquire. The questions are automatically corrected by the software and the answers related to further explanations - called « feedbacks » - are provided as the clinical case goes. Lastly, a synoptic sheet is associated with each of the presented disorder, therefore creating a visual and precise mnemonic support to help students in their learning and revising.La présente thèse a permis de développer deux cas cliniques de coliques chez le cheval sur la plateforme Moodle dans le but d'enrichir l'hôpital virtuel des équidés de l'École nationale vétérinaire d'Alfort. Dans un premier temps, les enseignements théoriques et pratiques portant sur la gestion des coliques prodigués à l'EnvA et le référentiel des études vétérinaires sont détaillés afin de mettre en évidence les connaissances à développer dans les deux cas cliniques. Les enrichissements de l'hôpital virtuel des carnivores domestiques, ainsi que les apports récents à l'hôpital virtuel des équidés, ont été mis en évidence. Par la suite, un questionnaire, visant à obtenir le retour des jeunes diplômés sur les enseignements reçus au cours de leur scolarité et sur leur utilisation des hôpitaux virtuels, a été réalisé et envoyé aux quatre dernières promotions de dominante équine de l'EnvA. Les résultats de ce questionnaire mettent en évidence que les anciens étudiants sont très favorables et encouragent la création de cas cliniques de coliques et que 80 % d'entre eux utilisaient souvent les exercices d'auto-évaluations durant leur scolarité. Les deux affections de coliques fréquemment traitées en pratique et qui sont détaillées dans cette thèse sont une obstruction étranglée de l'intestin grêle causée par un lipome pédonculé et un accrochement néphro-splénique du côlon ventral et dorsal gauche. Pour chacun de ces cas, une présentation détaillée a été faite en suivant la même progression : rappels anatomiques, épidémiologie, signes cliniques, diagnostic différentiel, examens complémentaires, traitement, complications et pronostic. La bibliographie réalisée ainsi que le support de cas réels de coliques, ont permis de développer 20 à 25 questions par affection portant sur les connaissances fondamentales et la démarche diagnostique nécessaires à acquérir. Les questions sont automatiquement corrigées par le logiciel et les réponses sont associées à des explications complémentaires appelées « feedback », fournies au fur et à mesure du cas clinique. Enfin, une fiche de synthèse est associée à chacune des affections présentées, créant ainsi un support mnémotechnique visuel et concis afin d'aider les étudiants dans leur apprentissage et leurs révisions

    Late gestation heat stress alters O2 regulation in placenta and neonatal heifers

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    International audienceIntroduction: Maternal hyperthermia (i.e. heat stress) can adversely affect placental development and function, with severity varying based on pregnancy stage. During the last half of pregnancy, cow uterine blood flow increases 4.5-fold, and decreased maternal blood circulation can reduce placental diffusion capacity, impacting fetal growth.Material and methods: Milk removal was discontinued (i.e. dried off) in multiparous pregnant Holstein cows 54 ± 5 days before expected calving and assigned to cooling (CLD) or heat stress (HT) treatments. Oxygen measurements were taken within ±3 h after birth (n = 7 per group) using the Rad-G Pulse Oximeter. RNA sequencing of cotyledonary tissue examined pathways and genes related to gas and oxygen transport.Results: Heifers exposed to late gestation in utero hypoxia (HT) had significantly lower oxygen saturation at birth compared with those from dams with normal (CLD) oxygen levels (83.4 % vs. 90.7 %, p = 0.03). The peripheral index of oxygen diffusion was also lower in HT-exposed heifers (2.04 % vs. 4.84 %, p = 0.01). Gene enrichment analysis of cotyledonary tissue revealed affected pathways, including response to hypoxia, oxygen transport, and VEGF signaling. Late gestation HT potentially influenced blood circulation and nitric oxide biosynthesis pathways, with various genes showing upregulation and downregulation.Discussion: The placenta is vital for fetal development, and late gestation hyperthermia can significantly affect its function, reducing fetal oxygen delivery and altering genes regulating placental gas and oxygen transport. These disruptions may result in fetal hypoxemia and growth restriction

    Group and Individual Changes in Spinal Mobility During a 12-Week Rehabilitation Program Including Swimming in Horses with Axial Musculoskeletal Lesions

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    International audienceLocomotor disorders involving the spine are a major cause of impaired performance and early retirement in sport horses. Swimming is increasingly incorporated into rehabilitation protocols, but its effects on spinal biomechanics remain poorly understood. This prospective study evaluated changes in thoracolumbar mobility in sixteen sport horses diagnosed with cervical or thoracolumbar axial musculoskeletal lesions over a 12-week rehabilitation program comprising 4 weeks of land-based training followed by 8 weeks during which swimming sessions were incorporated three times per week. Weekly measurements of thoracolumbar flexion–extension range of motion (ROM) were performed during straight-line trot on a hard surface using inertial measurement units attached to the withers, T18, and tubera sacrale. Group-level analyses revealed minimal changes across training phases: in horses with thoracolumbar lesions, mean ROM decreased slightly during the second month of aquatic training (−0.1° [95% CI −0.1; 0], Cohen’s d = 0.2), whereas no significant variation was detected in horses with cervical lesions. As the study did not include a control group, these temporal changes cannot be specifically attributed to swimming and should be interpreted as descriptive rather than causal. Individual trajectories showed heterogeneous patterns, but these were not consistent enough to alter the group-level interpretation. Overall, the findings suggest that thoracolumbar mobility remains relatively stable throughout this type of rehabilitation program, highlighting the importance of individualized monitoring rather than the expectation of a uniform biomechanical response

    From Big Data to Prediction: Machine Learning for source attribution in a One Health approach - A case study on L. monocytogenes

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    International audienceSource attribution is essential for food safety and public health, enabling the identification of contamination origins and supporting outbreak response. Listeria monocytogenes (Lm), a widespread foodborne pathogen, causes listeriosis, a severe illness with high fatality rates among vulnerable populations. Machine learning (ML) has shown promise in addressing source attribution, but prior studies often relied on small, temporally and geographically limited datasets.In this study, we leveraged a high-quality dataset of 5,366 Lm isolates collected between 1997 and 2024 from six food sources (mammals’ meat, birds’ meat, dairy, fish and seafood, vegetables, and fruits) across five continents5. We evaluated four genomic feature sets: core genome multilocus sequence typing (cgMLST), pangenome gene presence/absence, genetic variants, and 21-mers. LightGBM model was trained with a stratified 80/20 train-test split, ensuring balanced representation of source, location, and date. Hyperparameters were optimized using randomized search with 10-fold cross-validation.Tuned models outperformed default configurations, improving F1-scores by 1–2% and achieving scores between 72–74%, with cgMLST yielding the highest performance. Model accuracy varied across food sources; for example, fruit-derived isolates consistently achieved F1-scores above 80%, especially with cgMLST and pangenome-based features. While 16% of isolates were correctly classified by only one feature type, 9% were misclassified across all, and combining feature sets did not reduce overall error rates.To address misclassification, we restructured the source categories to reflect practical groupings used in the food industry. Grouping meats together and separating plant-based and animal-derived products led to improved model performance, with F1-scores reaching 78%.We further compared LightGBM with Random Forest, a widely used model in the literature. While overall performance was similar, error distributions differed between the two. Finally, we assessed model robustness across time and geography. Accuracy declined when predicting isolates collected years after training or from different continents, indicating temporal and spatial limitations.Overall, our findings confirm the potential of ML-based source attribution for Lm on a global scale. Our results suggest that strains can be difficult to discriminate when evolved in same production facility. We also highlight the importance of diverse, representative datasets for improving predictive performance and reproducibility among time and space

    Apport du profil stéroïdien évalué par chromatographie liquide dans le diagnostic de l'hyperaldostéronisme primaire chez le chat

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    Primary hyperaldosteronism (PAH) is defined as the excessive and autonomous secretion of aldosterone by the adrenal zona glomerulosa, occurring independently of stimulation by the renin–angiotensin–aldosterone system (RAAS). It is most commonly caused by unilateral adrenal tumors, although bilateral tumors and hyperplasia have also been described in cats. PAH is considered an emerging condition in cats, though likely underdiagnosed. While a combination of clinical signs, laboratory findings, and imaging investigations usually allows identification of PAH, certain cases remain ambiguous. In this context, steroid profiling appears to be a promising diagnostic approach. This thesis is divided into two parts. The first provides a concise review of current knowledge in veterinary and human medicine. The second presents the development and analysis of 67 serum steroid profiles from cats examined at the École Nationale Vétérinaire d'Alfort between 2020 and 2025. Profiles were obtained using liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry (LC-MS/MS), a method with high sensitivity, specificity, and potential for automation. The study included 29 healthy cats, 25 cats with kidney disease, and 13 cats with confirmed or strongly suspected PAH. Results support the existence of distinct steroid profiles between primary and secondary hyperaldosteronism, as well as between unilateral and bilateral disease. Differences were also observed between benign and malignant adrenal conditions. Steroid profiling may therefore represent a valuable diagnostic tool in cases where adrenalectomy is contraindicated, as well as in the evaluation of incidental or multi-secreting adrenal masses, by providing an integrated overview of steroid secretion. Although these results are preliminary and limited by the relatively small number of animals and group inclusion criteria, they highlight the potential of steroid profiling in feline adrenal disorders and underscore the need for further investigations in larger cohorts.L'hyperaldostéronisme primaire (HAP) correspond à une sécrétion excessive et autonome d'aldostérone par la zone glomérulée de la glande surrénale, indépendamment du système rénine-angiotensine-aldostérone (SRAA). Principalement lié à des tumeurs unilatérales, il peut également résulter d'hyperplasies ou de tumeurs bilatérales. Bien qu'émergente chez le chat, cette affection reste probablement sous-diagnostiquée. Si l'association des données cliniques, biologiques et d'imagerie permet le plus souvent d'orienter le diagnostic, certaines situations demeurent ambiguës. Dans ce contexte, l'étude du profil stéroïdien apparaît comme une approche prometteuse. Cette thèse s'articule en deux parties. La première dresse une synthèse des connaissances actuelles en médecine vétérinaire et humaine sur l'HAP et le métabolisme stéroïdien. La seconde décrit une étude prospective menée à l'École nationale vétérinaire d'Alfort entre 2020 et 2025, portant sur l'analyse de 67 profils stéroïdiens sanguins obtenus par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem (LC-MS/MS), méthode sensible, spécifique et automatisable. L'effectif comprenait 29 chats sains, 25 chats atteints de maladie rénale, et 13 chats atteints ou fortement suspects d'HAP. Les résultats mettent en évidence des différences de profils stéroïdiens entre HAP et hyperaldostéronisme secondaire, entre atteintes unilatérales et bilatérales, ainsi qu'entre affections bénignes et malignes. Le profil stéroïdien pourrait également constituer un outil d'aide au diagnostic lors de masses fortuites ou multi-sécrétantes, ou en cas de contre-indication chirurgicale, en fournissant une cartographie globale des sécrétions stéroïdiennes. Ces observations, bien que préliminaires et limitées par la taille restreinte des groupes étudiés, ouvrent des perspectives intéressantes pour la caractérisation et le diagnostic des affections surrénaliennes du chat et justifient la poursuite des travaux dans des cohortes plus larges

    Conditions, motivations et freins de la pratique en phyto-aromathérapie en élevage bovin : enquête auprès des vétérinaires

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    Medicine with plants is interesting more and more veterinarians. Every little step has its importance in the fight against antibiotic resistance. With the “One Health” concept, the phytoaromatherapy seems to be a good candidate as a complement of allopathy. However, the current veterinary medicine legislation is a real obstacle to use these substances. In breeding, there is a double issue: the toxicity of the phyto-aromatherapy product for the animal and for the administrator, but also the risk of residues in the animal products from the treated animals. To be properly used, a medicine must be registered in table 1 of authorized substances, so that it can have a marketing authorization for the target species, and a MRS (maximum residue limits) status. Thus, waiting times will be able to be applied. Unfortunately, a lot of phyto-aromatherapy medicine aren't registered in the table 1 of authorized substances. Hence, their use is theoretically impossible for the bovine species. The French Agency for Food, Environmental and Occupational Health and Safety (ANSES) published two decisions trees thanks to which a conclusion of a potential alleviation could be made, especially in the adaptation of the marketing authorization application files for several plants. It could increase the therapeutic arsenal of veterinarians and permit a faster use in routine. In order to assess the adaptation of the regulations to field conditions, a survey was distributed to veterinarians via Google Forms. Data was collected concerning their practice: plants used, therapeutic indications, plant synergies, associations, perception and level of satisfaction with the practice, notions of efficacy and safety, etc. Both veterinarians and breeders are motivated, but it seems important to adapt these regulations to guarantee a more serene and reasoned use of phyto-aromatherapy.La médecine par les plantes attire une population grandissante de vétérinaires praticiens. Dans un contexte où chaque geste compte pour raisonner l'utilisation des antimicrobiens et avec l'apparition du concept « One Health », la phyto-aromathérapie semble être une solution adéquate en complément des médicaments allopathiques. Cependant, la réglementation actuelle du médicament vétérinaire constitue un frein majeur à l'utilisation de ces substances. En élevage, l'enjeu est double : la toxicité du produit de phyto-aromathérapie pour l'animal et pour l'administrateur, mais aussi le risque de résidus dans les denrées issus des animaux traités. Afin qu'un médicament puisse être utilisé, il doit être inscrit au tableau 1 des substances autorisées, et donc bénéficier d'une AMM pour l'espèce cible ainsi que d'un statut LMR, d'où découleront les temps d'attente. Malheureusement, une grande majorité de substances de phyto-aromathérapie n'est pas inscrite dans le tableau 1 des substances autorisées, rendant leur utilisation théoriquement impossible pour l'espèce bovine. Les travaux de l'ANSES ont permis de dresser deux arbres décisionnels permettant de conclure ou non à un allègement et une adaptation des dossiers de demande d'AMM pour certaines plantes. Cela permettrait d'élargir l'arsenal thérapeutique des vétérinaires phytoaromathérapeutes et d'utiliser rapidement ces plantes en routine. Afin d'évaluer l'adaptation de la réglementation aux conditions de terrain, une enquête a été diffusée à destination des vétérinaires via Google Forms. Des données ont pu être récoltées concernant leur pratique : plantes utilisées, indications thérapeutiques, associations, perception et niveau de satisfaction de la pratique, notions d'efficacité et d'innocuité… Vétérinaires comme éleveurs sont motivés, mais il semble important d'adapter cette réglementation pour garantir une utilisation plus sereine et raisonnée de cette médecine

    Élaboration d'un site internet à destination des propriétaires de chiens atteints de dermatite atopique canine

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    Canine atopic dermatitis is a chronic, common disease that significantly impacts the daily life of both the animal and its owner. Its complex management and the importance of local treatments require the owner's active involvement throughout the animal's life. Patient education is a concept initially developed in human medicine for chronic diseases, aiming to encourage patients' active participation in managing their condition and engaging in shared decision-making with healthcare providers. Written materials are frequently used as educational tools to complement oral exchanges between caregivers and patients. The goal of this study was to assess the benefits of owner education in managing canine atopic dermatitis and to develop a reliable educational tool for them. The primary goal was to address owners' need for additional information in order to actively participate in the therapeutic plan. The secondary goal was to meet veterinarians' needs by providing a reliable tool to supplement the oral information given during consultations. A website was chosen as the preferred format, in response to the growing use of the internet for health-related information searches. The feedback results highlighted that most owners were satisfied with the website and felt it was useful in helping them understand the disease. The sections they found most useful were "Understanding the disease" and "Treatment." The veterinarians surveyed were also satisfied, and all of them considered recommending the website to their clients.La dermatite atopique canine est une maladie chronique, fréquente et impactante au quotidien tant pour l'animal que pour son propriétaire. La complexité de sa prise en charge ainsi que l'importance des soins locaux impliquent un engagement actif du propriétaire tout au long de la vie de l'animal. L'éducation du patient est un concept initialement développé en médecine humaine dans le cadre des maladies chroniques, visant à favoriser l'implication active des patients dans la gestion de leur maladie et une prise de décision partagée avec le soignant. Les supports écrits sont fréquemment utilisés comme outils éducatifs, renforçant les échanges oraux entre le soignant et le patient. L'objectif de ce travail était d'étudier l'intérêt d'une éducation des propriétaires dans le cadre de la dermatite atopique canine et d'élaborer un outil éducatif fiable à leur intention. L'objectif primaire était de répondre à une demande du propriétaire, demandeur d'informations supplémentaires pour participer activement au suivi thérapeutique. L'objectif secondaire était de répondre à une demande du vétérinaire, en lui fournissant un outil d'accompagnement fiable et complémentaire aux informations orales données en consultation. Le choix du support s'est porté vers un site internet, en réponse à l'usage croissant d'internet pour les recherches d'informations liées à la santé. Les résultats du retour d'expérience ont mis en évidence que la plupart des propriétaires étaient satisfaits du site internet et estimaient qu'il leur avait utile pour mieux comprendre la maladie. Les sections les plus utiles selon eux étaient les parties « comprendre la maladie » et « traitement ». Les vétérinaires interrogés étaient également satisfaits, et tous envisageaient de recommander le site internet à leurs clients

    Relation entre la position intra-utérine et le développement de l'unité fœto-placentaire dans l'espèce canine

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    The aim of this study is to evaluate the relationships between macroscopic placental characteristics (weight and surface area of the placental attachment zone) and birth weight in Boerboel puppies, a large-sized, polytocous breed. This work is part of a broader effort to optimize neonatal health, a crucial challenge in veterinary medicine, where low birth weight is a major risk factor for early mortality and can influence long-term development. Data for this study were collected during 22 scheduled cesarean sections performed at term, involving a total of 187 puppies. The measured parameters include the average birth weight, estimated at 575 ± 123 g, and placental characteristics, with an average weight of the placental attachment zone (PAZ) of 49 ± 12 g and an average PAZ surface area of 102 ± 17 cm². The study models intrauterine position using three approaches: laterality, categorized position, and standardized position. In 11 out of 19 litters, the largest puppy was located in the apex of a uterine horn. Intrauterine position, particularly when distinguishing the apex from other positions (categorized modeling), significantly influences birth weight and PAZ weight. However, PAZ surface area does not appear to be affected by intrauterine position. These observations suggest that the uterine apex may provide more favorable conditions for vascularization and nutrient supply, likely due to its proximity to the ovarian artery.L'objectif de cette étude est d'évaluer les liens entre les caractéristiques macroscopiques placentaires (poids et surface de la zone d'attachement placentaire) et le poids de naissance chez les chiots de race Boerboel, une race polytoque de grande taille. Ce travail s'inscrit dans un cadre plus large visant à optimiser la santé néonatale, un enjeu crucial en médecine vétérinaire, où le faible poids de naissance constitue un facteur de risque majeur de mortalité précoce et peut influencer le développement à long terme. Les données de cette étude ont été collectées lors de 22 césariennes programmées, réalisées à terme sur un total de 187 chiots. Les paramètres mesurés incluent le poids de naissance moyen, estimé à 575 ± 123 g, et les caractéristiques placentaires, avec un poids moyen de la zone d'attachement placentaire (ZAP) de 49 ± 12 g et une surface moyenne de ZAP de 102 ± 17 cm². L'étude modélise la position intra-utérine selon trois approches : latéralité, position catégorisée, et position standardisée. Dans 11 portées sur 19, le chiot le plus gros est situé à l'apex d'une corne utérine. La position intra-utérine, en particulier lorsque l'on distingue l'apex des autres positions (modélisation catégorisée), influence significativement le poids de naissance et le poids de la ZAP. En revanche, la surface de la ZAP ne semble pas être affectée par la position intra-utérine. Ces observations suggèrent que l'apex de l'utérus pourrait offrir des conditions de vascularisation et d'apports nutritifs plus favorables, probablement en raison d'une proximité avec l'artère ovarienn

    Role of Interferon-Stimulated Genes (ISGs) in the interspecies transmission of Hepatitis EVirus (HEV)

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    International audienceHepatitis E virus (HEV) is a virus presenting a high risk of zoonosis. Among all the described genotypes of HEV, some are human-restricted, such as HEV-1, whereas some are zoonotic, such as HEV-3. Swine are the main reservoir of zoonotic HEV that causes asymptomatic infection in this host, whereas in some human patients, the disease can progress to fulminant or even chronic hepatitis. These observations suggest that swine can control efficiently HEV-3. Recently, we have identified interferon-stimulated genes (ISGs) that are differentially expressed in human hepatic cells (HepaRG) and pig livers upon HEV-3 infection. Now, our aim is to unveil the role of ISGs in the restriction of the HEV infection among different species and among HEV genotypes. In this study, we have screened the impact of hundreds of ISGs from different species on HEV-3 replication in HepG2/C3A cells using lentiviral vectors. A panel of ISG were found to modulate viral replication. Then, we addressed the anti- or pro-viral activity of these ISG candidates in an infectious context. To achieve this goal, we overexpressed these ISGs of interest in different cell lines (HepaRG, A549-D3 and HepG2/C3A) before infection with HEV-3f. The amount of HEV-3f genome copies was monitored by RT-qPCR as well as cell viability and transduction levels by flow cytometry. These methods have allowed us to identify several ISGs interfering with HEV infection including IRF1, IRF7, RIG-I and MDA5. We are now investigating the mode of action of the ISG candidates of interest and assessing potential differences in their antiviral activity among species (human vs swine) and HEV genotypes (HEV-1 vs HEV-3). We have also investigated the importance of these 2 sensors on HEV-3 infection in HepaRG KO cells using the CRISPR-Cas9 technology. Overall, this work will contribute to a better understanding of the key effectors of the IFN response needed to efficiently control HEV infection and how they might influence inter-species transmission of HEV

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