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Reducing the CAV1-dependent trafficking of G6PC1 in the liver protects against the development of type 2 diabetes
No full textTargeting hepatic gluconeogenesis is an efficient strategy to counteract the development of type 2 diabetes. Hepatic glucose production into the bloodstream is controlled by the GLUT2 transporter and a vesicular pathway dependent on Caveolin-1 (CAV1) involving G6PC1 location at the plasma membrane. We hypothesized that decreasing hepatic gluconeogenesis by targeting CAV1 specifically in the liver (L.Cav1-/- mice) improves energy and glucose metabolism in diabetic mice. Here we show that the absence of hepatic CAV1 increases insulin sensitivity, glucose tolerance and decreases fasting hyperglycemia and hyperinsulinemia in mice feeding a high fat high sucrose diet (HFHS diet). The decrease in insulin sensitivity takes place also in L.Cav1-/- mice feeding a standard diet (STD diet). Moreover, we demonstrated an improvement of glycemic control when hepatic Cav1 is deleted in previously prediabetic mice. In parallel, the absence of CAV1 in the liver reduces body weight gain and lipid intestinal absorption. Together these findings highlight that the vesicular pathway of glucose production represents a promising therapeutic target in the prevention of type 2 diabetes
Combining wheat with multi-species prairie strips reduces the development of Septoria tritici blotch
No full textCrop diversification, notably through intercropping, is known for regulating disease development in agroecosystems. However, intercropping usually involves two or three species, limiting its potential to enhance ecosystem multifunctionality. This study investigates the impact of "agroprairies", a cropping system design consisting of alternating narrow strips of wheat and multispecies prairies (~12 species), on the development of Zymoseptoria tritici, the causal agent of Septoria tritici blotch (STB), a major foliar disease in wheat.Two complementary field experiments were conducted. The first one monitored the incidence and severity of STB under natural epidemic conditions across combinations of four wheat cultivars and four prairie mixtures with contrasted functional traits. The second experiment used above-canopy inoculation on a subset of treatments to assess disease dynamics under high disease pressure, independent of physical barrier effects. Rhizosphere microbiomes were analyzed before inoculation to evaluate potential enrichment in taxa associated with plant defense and disease suppression. Under natural conditions, STB incidence and severity were reduced by 52% and 41%, respectively, in two agroprairie types. Prairie biomass and specific leaf area (SLA) were identified as key factors associated with this reduction. When the disease was inoculated above the canopy, this reduction effect disappeared, highlighting the dominant role of physical barriers in disease regulation. However, one agroprairie treatment still reduced disease progression by 18%, suggesting the involvement of additional regulatory mechanisms. Microbiome analysis revealed shifts in bacterial beta diversity and an enrichment of potentially beneficial taxa in the wheat rhizosphere, although no direct link with disease regulation was established
Cluefish: explorer l’invisible des données transcriptionnelles en série grâce à une analyse de sur-représentation nourrie par l’agrégation de connaissances biologiques existantes
No full textInternational audienceInterpreting transcriptomic data presents significant challenges, particularly in non-targeted approaches. While modern functional enrichment methods are well-suited for experimental designs involving two conditions, they are less applicable to data series. In this context, we developed Cluefish, a free and open-source, semi-automated R workflow designed for untargeted, comprehensive biological interpretation of transcriptomic data series. Cluefish applies over-representation analysis on pre-clustered protein–protein interaction networks, using clusters as anchors to identify smaller, more specific biological functions. Innovative features, including cluster merging and recovery of isolated genes through shared biological contexts, enable a more complete exploration of the data. We applied Cluefish to an in-house dataset with zebrafish exposed to a dose-gradient of dibutyl phthalate and to two published toxicology datasets featuring different organisms. Combined with DRomics, a tool for dose–response analysis—Cluefish identified gene clusters deregulated at low doses and linked to biological functions overlooked by the standard approach. Notably, it revealed that retinoid signaling disruption may be the most sensitive pathway affected by dibutyl phthalate during zebrafish development, potentially leading to morphological changes. The Cluefish workflow aims to provide valuable clues for biological hypothesis generation and experimental validation. It is freely available at https://github.com/ellfran-7/cluefish.L’interprétation des données transcriptomiques pose des défis majeurs, en particulier dans les approches non ciblées. Si les méthodes modernes d’enrichissement fonctionnel sont bien adaptées aux designs expérimentaux comparant deux conditions, elles le sont beaucoup moins pour l’analyse de séries de données. Dans ce contexte, nous avons développé Cluefish, un workflow semi-automatisé en R, libre et open source, conçu pour offrir une interprétation biologique globale et non ciblée des données transcriptomiques en série. Cluefish applique une analyse de sur-représentation à des réseaux d’interactions protéine–protéine pré-regroupés, en utilisant les clusters comme points d’ancrage afin d’identifier des fonctions biologiques plus spécifiques et ciblées. Des fonctionnalités innovantes — comme la fusion de clusters et la réintégration de gènes isolés à partir de contextes biologiques partagés — permettent une exploration plus complète des données. Nous avons appliqué Cluefish à un jeu de données interne, dans lequel des embryons de poisson zèbre étaient exposés à un gradient de doses de phtalate de dibutyle, ainsi qu’à deux jeux de données publiés en toxicologie portant sur d’autres organismes. Combiné avec DRomics, un outil d’analyse dose–réponse, Cluefish a permis d’identifier des clusters de gènes dérégulés à faibles doses et associés à des fonctions biologiques passées inaperçues avec l’approche standard. Notamment, il a révélé que la perturbation de la signalisation des rétinoïdes pourrait constituer la voie la plus sensible affectée par le phtalate de dibutyle au cours du développement du poisson zèbre, avec de potentielles répercussions morphologiques. Le workflow Cluefish vise ainsi à fournir des pistes précieuses pour la génération d’hypothèses biologiques et leur validation expérimentale. Il est librement disponible à l’adresse : https://github.com/ellfran-7/cluefish
Method: An accurate method for detecting drinking bouts in dairy cows based on reticulorumen temperature
No full textInternational audienceThis study evaluated the performances of three methods for detecting drinking bouts in dairy cows using reticulorumen temperature (RT): the 'FixT' method based on a fixed RT threshold, the 'Cow-dT' method based on a cow-day-specific RT threshold, and the 'FallST' method based on RT fall slope. We observed the drinking behaviours of 28 dairy cows equipped with reticulorumenal sensors over 96 h to create a reference dataset. A total of 730 drinking bouts were observed. We matched detected drinking bouts against observed drinking bouts to obtain the number of true-positives, false-negatives, and falsepositives, and then calculated the detection performances of the three methods in terms of sensitivity (Se), positive predictive value (PPV), and F-score. The performances of the three RT-based methods (Se ≥ 90%, PPV > 96% and F-score ≥ 93%) were better than those from previous work using collarattached accelerometers, but slightly lower than methods using drinking troughs connected to electronic identification systems or methods combining accelerometers with geomagnetic sensors or with ultrawideband location. The FallST method showed slightly better performance (highest F-score) than the FixT and Cow-dT methods. The FallST method accurately detected drinking bouts lasting more than 30 s and at least 30 min apart, with a detection time accuracy of 10 min. The models using RT curve parameters failed to predict characteristics of the drinking bouts. In conclusion, the method developed here can accurately detect drinking bouts in dairy cows using RT, but without further characterisation of the drinking bouts (e.g. duration)
Design and evaluation of diversification of a wine-growing system through the introduction of pastoral herd
No full textInternational audienc
Assessing the eco-efficiency of inter-municipal waste management services in France
No full textInternational audienceWe assess the eco-efficiency of French inter-municipal cooperation entities in charge of waste management. We employ a conditional order-m approach to (i) estimate their eco-efficiency considering variables characterizing their environmental context, (ii) evaluate the effect of these contextual variables on the eco-efficiency. Our results demonstrate that the population size, the type of area (e.g., tourist, rural), and the waste pricing systems significantly influence eco-efficiency. These findings underscore the importance of tailoring local waste management policies to the specific characteristics and available resources of each area. They provide valuable insights for local authorities seeking to enhance eco-efficiency and optimize waste management practices. © 2025 The Author
Cricket protein-based composite film containing Andrographis paniculata leaf extract-based nanoparticles for meat emulsion
No full textInternational audienceA cricket (Acheta domestica) protein (Crik-Prot)-based composite film was developed to preserve the quality of the goat meat emulsion (Got-met-Emul). The A. paniculata leaf extract-based nanoparticles (And-Pan-NPs) were used as an active agent for Crik-Prot-based film. The addition of And-Pan-NPs [0.5 % (T-1), 1.0 % (T-2) and 1.5 % (T-3)] imparted antimicrobial and antioxidant properties to the film [indicated by the results of total phenolic and flavonoid contents, DPPH, ABTS and FRAP activities, antioxidant release (%), and inhibitory halos against S. aureus and Escherichia coli] and significantly (P < 0.05) altered its physicochemical [increased density (g/ml) whereas reduced the WVTR (mg/mt(2)), transmittance (%) and moisture content (%)] and colour [increased a* and b* and reduced L* values] properties. Crik-Prot-based films incorporated with And-Pan-NPs (0.5-1.5 %) significantly (P < 0.05) enhanced the oxidative stability [protein oxidation (total carbonyl content) and lipid oxidation (TBARS and free fatty acids)], antioxidant potential (ABTS, DPPH, and FRAP activities), and microbiological quality of Got-met-Emul during two weeks storage at 4 +/- 1 degrees C. The Crik-Prot-based film (T-1, T-2 and T-3) enhanced the sensory quality of Got-met-Emul on day 7 of storage and gastrointestinal digestion increased (P < 0.05) the antioxidant potential of Got-met-Emul. The Crik-Prot-based film incorporated with And-Pan-NPs enhanced the storage quality and functional value of Got-met-Emul
Note d'appui scientifique et technique relative aux modalités de surveillance et de lutte contre la brucellose des bouquetins dans les massifs du Bargy et des Aravis
No full textAnses. (2025). Note d’AST relative aux modalités de surveillance et de lutte contre la brucellose des bouquetins dans les massifs du Bargy et des Aravis (saisine 2024-SA-0146). Maisons-Alfort : Anses, 19 p.L’Anses a été saisie le 19 juillet 2024 par la Direction générale de l’alimentation (DGAL), la Direction de l’eau et de la biodiversité (DEB) et la Direction générale de la prévention des risques (DGPR) pour la réalisation de l’appui scientifique et technique concernant une réponse préliminaire à la deuxième étape de la saisine 2024-SA-0146 relative aux modalités de surveillance et de lutte contre la brucellose chez le Bouquetin des Alpes (Capra ibex) dans les massifs du Bargy et des Aravis.La France est reconnue officiellement indemne de brucellose bovine depuis 2005, et de brucellose ovine et caprine depuis 2014 sur le territoire hexagonal, à l’exception du département des Pyrénées-Atlantiques (64) reconnu officiellement indemne en mars 2021. En 2012, un foyer bovin de brucellose à Brucella melitensis a été détecté en Haute-Savoie sur le massif du Bargy et a conduit à la découverte d’un réservoir de Brucella melitensis dans lapopulation de bouquetins de ce massif.Depuis 2012, sur le massif du Bargy, des campagnes de gestion par capture et euthanasie des bouquetins séropositifs, ainsi que des tirs, se sont succédé tous les ans. En 2013, des captures de bouquetins avec tests sérologiques ont également été conduites sur les massifs des Aravis et de Sous-Dîne, voisins du Bargy.La surveillance des espèces de ruminants sensibles chassables, i.e. le Chamois (Rupicapra rupicapra), le Cerf élaphe (Cervus elaphus) et le Chevreuil (Capreolus capreolus), est également mise en place depuis 2012 avec l’aide de la Fédération départementale des chasseurs de la Haute-Savoie. Depuis 2023, cette surveillance est également étendue sur la partie savoyarde du massif des Aravis avec l’aide de la Fédération départementale des chasseurs de la Savoie. Par ailleurs, dans ce contexte, la surveillance événementielle à travers le réseau SAGIR [1] est renforcée [2].Les mesures mises en œuvre depuis 2012 dans la population de bouquetins ont permis de faire fortement baisser la séroprévalence3 de la brucellose dans le massif du Bargy (Anses 2023).En octobre 2021, lors des opérations de surveillance renforcée des troupeaux de bovins domestiques (sérologie mensuelle), un nouveau foyer a été découvert dans un élevage bovin laitier, lié à la persistance de la brucellose dans la faune sauvage du massif du Bargy (Anses 2021).L’Anses a alors été saisie en novembre (Anses 2021) et décembre 2021 (Anses 2022) pour évaluer l’efficacité de six scénarios de lutte contre la brucellose dans la population de bouquetins du massif du Bargy. Outre cette évaluation, les experts ont rappelé dans leurs avis l’importance d’une gestion adaptative, consistant à adapter les mesures de gestion à l’évolution de la situation sanitaire, ce qui impose une surveillance continue de la situation dans les compartiments sauvage et domestique et de l’efficacité des mesures de lutte.Suite à la capture ou recapture de 135 bouquetins et à l’abattage de 61 bouquetins sur le massif du Bargy en 2022, ainsi que la découverte fortuite sur le massif des Aravis d’une étagne (femelle bouquetin) trouvée infectée par B. melitensis, l’Anses a été saisie en octobre 2022 afin de réactualiser les mesures de surveillance et de lutte sur le massif du Bargy et les mesures à mettre en place sur le massif des Aravis.Les mesures de gestion mises en place pendant la saison de capture 2023 suite à l’avis de l’Anses 2022-SA-0220 ont été renouvelées au printemps 2024. Suite aux nouvelles données recueillies sur l’évolution de la brucellose dans les populations de bouquetins des massifs du Bargy et des Aravis lors de cette saison de capture, l’avis de l’Anses a été à nouveau sollicité le 19 juillet 2024 sur les mesures de surveillance et de lutte à mettre en place dans les populations de bouquetins des massifs du Bargy et des Aravis. Un premier avis en urgence a été rendu le 31 août 2024 afin de proposer des adaptations aux mesures de gestion pour l’automne 2024 (étape 1 de la saisine) (Anses 2024).Dans les étapes 2 et 3 de la saisine, il est demandé à l’Anses :• Étape 2 : « de formuler des recommandations pour le printemps 2025 (les captures pouvant démarrer au 15 avril, et celles du printemps étant généralement plus « fructueuses » que celles d’automne), en termes de surveillance et de lutte de la brucellose à Brucella melitensis dans les populations de bouquetins, notamment à la lumière des premiers résultats des nouveaux travaux de modélisation qui ont redémarré cette année.Il s’agira notamment :- d’établir des recommandations chiffrées et qualitatives (secteurs et populations à cibler prioritairement, etc.) en termes de captures et de tirs dans chacun des deux massifs, pour le printemps 2025,- d’évaluer l’intérêt des recaptures, et d’établir le cas échéant des recommandations chiffrées, pour les massifs du Bargy et des Aravis, - d’envisager la nécessité d’élargir la zone de surveillance et de lutte à d’autres massifs,- d’identifier le cas échéant d’autres mesures de lutte non mises en œuvre jusqu’alors,- de fournir des recommandations pratiques de biosécurité, applicables dans les contraintes topographiques alpines, pour protéger dès la montée en estive de 2025 les élevages de ruminants de l’infection à B. melitensis (par exemple effarouchement des bouquetins avant la mise en alpage des ruminants domestiques, etc.). Ces recommandations pourront s’appuyer sur le rapport d’expertise relatif à l’occupation spatiale des bouquetins produit par l’OFB et VetAgroSup à la demande de la DGAL en juin 2023, et sur une sollicitation de l’Inrae. »• Étape 3 : « d’établir des recommandations en termes d’effort de lutte annuel à mettre en œuvre pour atteindre une prévalence faible, favorable à l’extinction de l’infection, à l’horizon 2030. Ce travail pourra éventuellement s’appuyer sur les retours d’expériences d’extinction de la brucellose dans des populations d’animaux sauvages dans d’autres pays ».Appui scientifique et technique de l’AnsesDemande n° « 2024-SA-0146 »Saisine(s) liée(s) n°2024-SA-0099, 2022-SA-0220, 2021-SA-0228, 2021-SA-0200, 2021-AST-0203, 2018-SA-0017, 2016-SA-0229, 2014-SA-0218, 2013-SA-0129page 2 / 19chasseurs de la Haute-Savoie. Depuis 2023, cette surveillance est également étendue sur lapartie savoyarde du massif des Aravis avec l’aide de la Fédération départementale deschasseurs de la Savoie. Par ailleurs, dans ce contexte, la surveillance événementielle à traversle réseau SAGIR1 est renforcée2.Les mesures mises en œuvre depuis 2012 dans la population de bouquetins ont permis defaire fortement baisser la séroprévalence3 de la brucellose dans le massif du Bargy (Anses2023).En octobre 2021, lors des opérations de surveillance renforcée des troupeaux de bovinsdomestiques (sérologie mensuelle), un nouveau foyer a été découvert dans un élevage bovinlaitier, lié à la persistance de la brucellose dans la faune sauvage du massif du Bargy (Anses2021).L’Anses a alors été saisie en novembre (Anses 2021) et décembre 2021 (Anses 2022) pourévaluer l’efficacité de six scénarios de lutte contre la brucellose dans la population debouquetins du massif du Bargy. Outre cette évaluation, les experts ont rappelé dans leurs avisl’importance d’une gestion adaptative, consistant à adapter les mesures de gestion àl’évolution de la situation sanitaire, ce qui impose une surveillance continue de la situationdans les compartiments sauvage et domestique et de l’efficacité des mesures de lutte.Suite à la capture ou recapture de 135 bouquetins et à l’abattage de 61 bouquetins sur lemassif du Bargy en 2022, ainsi que la découverte fortuite sur le massif des Aravis d’une étagne(femelle bouquetin) trouvée infectée par B. melitensis, l’Anses a été saisie en octobre 2022afin de réactualiser les mesures de surveillance et de lutte sur le massif du Bargy et lesmesures à mettre en place sur le massif des Aravis.Les mesures de gestion mises en place pendant la saison de capture 2023 suite à l’avis del’Anses 2022-SA-0220 ont été renouvelées au printemps 2024. Suite aux nouvelles donnéesrecueillies sur l’évolution de la brucellose dans les populations de bouquetins des massifs duBargy et des Aravis lors de cette saison de capture, l’avis de l’Anses a été à nouveau sollicitéle 19 juillet 2024 sur les mesures de surveillance et de lutte à mettre en place dans lespopulations de bouquetins des massifs du Bargy et des Aravis. Un premier avis en urgence aété rendu le 31 août 2024 afin de proposer des adaptations aux mesures de gestion pourl’automne 2024 (étape 1 de la saisine) (Anses 2024).Dans les étapes 2 et 3 de la saisine, il est demandé à l’Anses :• Étape 2 : « de formuler des recommandations pour le printemps 2025 (les capturespouvant démarrer au 15 avril, et celles du printemps étant généralement plus« fructueuses » que celles d’automne), en termes de surveillance et de lutte de labrucellose à Brucella melitensis dans les populations de bouquetins, notamment à la[1] SAGIR : réseau de surveillance des maladies infectieuses des oiseaux et des mammifères sauvages terrestres.Il existe depuis 1955 et repose sur un partenariat entre les fédérations des chasseurs et l’Office français de labiodiversité.[2] Dépistage systématique de la brucellose sur les différents cadavres collectés dans le cadre du dispositif SAGIRclassique sur les départements de Savoie et Haute-Savoie et renfort de collecte avec dépistage systématique descadavres de cerfs, chevreuils, chamois, mouflons et bouquetins dans les massifs du Bargy, des Aravis et de Sous-Dine.[3] La séroprévalence est la proportion d’animaux présentant des anticorps contre l’agent de la brucellose.(Saisine(s) liée(s) n°2024-SA-0099, 2022-SA-0220, 2021-SA-0228, 2021-SA-0200, 2021-AST-0203, 2018-SA-0017, 2016-SA-0229, 2014-SA-0218, 2013-SA-0129
Chitosan@DOTAGA-based hydrogel: A metal-chelating dressing for the treatment of complex wounds
No full textInternational audienceComplex wounds, whether acute or chronic, often suffer from delayed healing, especially when contaminated with metals. These metals worsen the wound environment by promoting the formation of reactive oxygen species (ROS), sustaining inflammation, and promoting microbial growth. Additionally, some heavy metals are intrinsically toxic, further damaging tissues and hindering repair. In this study, we investigated the potential of a novel chitosan-based swelling hydrogel functionalized with the chelating molecule DOTAGA (chitosan@DOTAGA) as a treatment of complex wounds. By combining the known beneficial properties of chitosan with the enhanced metal-binding ability of DOTAGA, this hydrogel aims to tackle the harmful effects of metals in wounds. In vitro assays demonstrated the hydrogel's biodegradability and potent antimicrobial properties, confirming its suitability as a wound dressing. In vivo studies conducted in rat and porcine wound models reveal the hydrogel's effectiveness and safety in various wound types, showcasing its potential to improve healing outcomes. Our results indicate that chitosan@DOTAGA hydrogel significantly improves healing, reducing inflammation and microbial growth. The hydrogel's ability to modulate the wound environment underscores its promise as an advanced dressing for complex wounds particularly in case of metallic contamination.</div
Synthèses d'articles parus dans la presse internationale: Rubrique coordonnée par Monika Gangl
No full textNational audience- Étude préliminaire pour évaluer l'utilisation de l'échographie abdominale FLASH chez les chevaux en coliques en pratique ambulatoire de première opinion, synthèse réalisée par Fanette Sénéchal- Revue de la maladie glandulaire gastrique équine, synthèse réalisée par Clara Lozano Rodriguez- Leptospirose aiguë du cheval : étude rétrospective de 11 cas, synthèse réalisée par Garance Mortie