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Effects of biochar on soil microbial communities: A meta-analysis
No full textInternational audienceChanges in soil microbial communities may impact soil fertility and stability because microbial communities are key to soil functioning by supporting soil ecological quality and agricultural production. The effects of soil amendment with biochar on soil microbial communities are widely documented but studies highlighted a high degree of variability in their responses following biochar application. The multiple conditions under which they were conducted (experimental designs, application rates, soil types, biochar properties) make it difficult to identify general trends. This supports the need to better determine the conditions of biochar production and application that promote soil microbial communities. In this context, we performed the first ever meta-analysis of the biochar effects on soil microbial biomass and diversity (prokaryotes and fungi) based on high-throughput sequencing data. The majority of the 181 selected publications were conducted in China and evaluated the short-term impact (<3 months) of biochar. We demonstrated that a large panel of variables corresponding to biochar properties, soil characteristics, farming practices or experimental conditions, can affect the effects of biochar on soil microbial characteristics. Using a variance partitioning approach, we showed that responses of soil microbial biomass and prokaryotic diversity were highly dependent on biochar properties. They were influenced by pyrolysis temperature, biochar pH, application rate and feedstock type, as wood-derived biochars have particular physico-chemical properties (high C:N ratio, low nutrient content, large pores size) compared to non-wood-derived biochars. Fungal community data was more heterogenous and scarcer than prokaryote data (30 publications). Fungal diversity indices were rather dependent on soil properties: they were higher in medium-textured soils, with low pH but high soil organic carbon. Altogether, this meta-analysis illustrates the need for long-term field studies in European agricultural context for documenting responses of soil microbial communities to biochar application under diverse conditions combining biochar types, soil properties and conditions of use
Numérisation dans le système alimentaire et transitions
No full textInternational audienceThe current food system is reaching its limits of economic, environmental and social sustainability. It has a high environmental impact, contributing to more than a third of global greenhouse gas emissions. It also has social consequences on the health of consumers, due to the over-consumption of processed products, which leads to an increase in global obesity, cardiovascular diseases and cancers. Like the entire economy, the food system is currently affected by the spread of digital techniques, i.e. robotization, the internet of things, connected objects, big data. The blockchain technique is also finding a favorable field of application because the food system has, since the 1980s, been part of global value chains. The issue of product traceability and the possibility of strengthening our ability to provide proof for claims, as part of the corporate social responsibility strategy of companies, favor its diffusion. These techniques are meant to bring about a new industrial revolution, allowing production systems to evolve into so-called 4.0 systems. Their promoters also attribute to them an ability to remedy the limits of sustainability, in particular environmental ones. The objective of this article is to analyze their diffusion in the food system and their effects. Are they really able to fix sustainability issues or, on the contrary, will they contribute to blocking the emergence of alternative trajectories, by reinforcing the trajectory of the current system and by creating socio-technical lock-in effects?Le système alimentaire actuel atteint des limites de soutenabilité, économiques, environnementales et sociales. Il a un impact environnemental élevé, il contribue à plus du tiers des émissions de GES au niveau mondial. D’autre part, il a également des conséquences sociales sur la santé des consommateurs, la surconsommation de produits transformés entraînant la hausse de l’obésité mondiale, des maladies cardiovasculaires et des cancers. Comme l’ensemble de l’économie, le système alimentaire est touché actuellement par la diffusion des techniques numériques : robotisation, internet des objets, objets connectés, big data. La technique des blockchains y trouve également un champ d’application favorable car le système alimentaire s’est inséré, depuis les années 1980, dans les chaînes de valeur globales et que l’enjeu de la traçabilité des produits et de la possibilité de renforcer la capacité de preuve et allégations dans le cadre de la stratégie RSE des entreprises favorise sa diffusion. Ces techniques sont censées constituer une nouvelle révolution industrielle faisant évoluer les systèmes productifs vers des systèmes dits 4.0. Leurs promoteurs leur attribuent également une capacité à remédier aux limites de soutenabilité, en particulier environnementales. L’objectif de l’article est d’analyser leur diffusion dans le système alimentaire et leurs effets. Sont-elles réellement en capacité de remédier aux enjeux de soutenabilité, ou au contraire, ne vont-elles pas contribuer à bloquer l’émergence de trajectoires alternatives en renforçant la trajectoire du système actuel et en créant des effets de verrouillage sociotechnique
La production et le traitement de données filmiques au sein du réseau VISA : contexte, filiation et problématiques (présentation du dossier)
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Relation entre usage d’herbicide, adventice et rendement des cultures : analyse critique de la littérature scientifique et technique
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Avis de l'Anses relatif à la présence de parasites Toxocara spp. dans les viandes de sanglier sauvage
No full textCitation suggérée : Anses. (2023). Avis relatif à la présence de parasites Toxocara spp. dans les viandes de sanglier sauvage (saisine 2023-SA-0055). Maisons-Alfort : Anses, 20 p.Des analyses sur les carcasses de sangliers sauvages inspectées dans les établissements français de traitement de gibiers sauvages ont révélé depuis deux ans la présence régulière de larves de Toxocara spp. Ce constat a conduit les services vétérinaires d'inspection à saisir ces carcasses, conformément à l'article 45 du règlement d'exécution (UE) n°2019/627 de la Commission du 15 mars 2019 qui prévoit que les viandes présentant une infestation parasitaire sont déclarées impropres à la consommation humaine. La problématique pour le gestionnaire est double. Le premier enjeu est lié au risque de toxocarose pour les consommateurs de viandes de sanglier et des recommandations relatives à la conservation et la cuisson des viandes à adresser aux chasseurs. Le second enjeu est relatif à la gestion des lots de sangliers détectés positifs.Les demandes instruites dans le cadre de cette expertise sont les suivantes :Demande 1 : Établir un profil de risque pour Toxocara spp. dans les viandes de sanglier sauvage.Demande 2 : Évaluer l’efficacité de traitements assainissants de la carcasse sur la viabilité duparasite Toxocara spp., plus particulièrement la congélation et la cuisson, dans le cas où cestraitements sont réalisés, soit par les établissements du secteur alimentaire, soit directementpar les consommateurs
Régulation biologique des adventces par les couverts d'interculture dans les cultures suivantes : mythe ou réalité?
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Strategy using a combination of physico/chemical analysis and in vitro bioassays for chemical safety of food contact articles
No full textInternational audienceConducting risk assessments for Non-Intentionally Added Substances (NIAS) in food contact articles (FCA) that may migrate into food presents a significant challenge for food packaging manufacturers, as well as for risk assessors and managers. This challenge becomes even more pronounced in the context of a circular economy where the utilization of bio-based, reusable, and recycled materials is expected to surge in the coming years. The objective of the Packsafe project is to propose a comprehensive strategy for ensuring the chemical safety of FCAs. This strategy involves the combination of analytical tools and in vitro studies, enabling the identification of hazards within complex mixtures.The project involves extracting various FCAs and subjecting them to thorough analysis through analytical chemistry to establish a unique chemical signature or fingerprint. Simultaneously, these extracts will undergo in vitro biotests to assess genotoxicity (Ames test, micronucleus assay, DDR test) and endocrine disruption (employing an Estrogen/Androgen/Thyroid/Steroidogenesis approach). The initial phase of the project entailed extracting forty-one articles, including LDPE, HDPE, PP, PET, PS, and cardboard. The extraction protocol involved a mixture of methanol and dichloromethane (1/3), followed by a concentration step to transfer the substances into a biocompatible solvent (DMSO). These mixtures were then subjected to a battery of in vitro bioassays. Positive results were observed in some cases, suggesting potential genotoxicity and endocrine disruption, which will require further confirmation. For extracts with negative results, additional spiked experiments will be conducted to study the matrix effect of the extract and determine the threshold of biological detection.The subsequent phase of the project involves the preparation of extracts enriched with NIAS, which will be tested using selected biotests. Concurrently, chemical analysis will be carried out to characterize the extracts and attempt to identify their chemical signature.All the collected data will be integrated into an expert system, which will serve as a comprehensive toolbox for risk assessment
La culture de la moutarde enBourgogne, c’est aussi une histoire de génétique
No full textNational audienceDepuis plus de 25 ans, la production bourguignonne de pâte de moutarde repose sur des importations de graines canadiennes. En 1990, les industriels transformateurs de la graine de moutarde ont sollicité l’ENITA (aujourd’hui l’Institut Agro Dijon) afin d’entreprendre un programme d’amélioration génétique. Depuis, ce programme d’amélioration génétique constitue l’une des clés de voûte d’un vaste projet de relance de la culture de moutarde brune en Bourgogne, dans lequel sont impliqués tous les partenaires de la filière, des producteurs aux industriels. Les variétés semées en Bourgogne sont toutes issues du programme d’amélioration génétique conduit par l’Institut Agro Dijon.Le programme de sélection génétique a pour objectif de fournir, aux partenaires d’amont (agriculteurs producteurs de graines) et d’aval (industriels transformateurs), des variétés qui correspondent à des critères quantitatifs et qualitatifs. Il s’agit de créer des variétés de moutarde brune productives (rendement, tolérantes au froid et aux insectes) et dont la qualité des graines répond au cahier des charges des industries condimentaires (aptitude technologique et organoleptique à la transformation en pâte de moutarde). Les travaux réalisés ont permis à ce jour l’inscription de 9 variétés de moutarde brune. Parallèlement un programme de création de génotypes de type « hiver » par introduction chez la moutarde de gènes responsables de la vernalisation a été initié (croisements entre moutarde et colza d’hiver). Des marqueurs moléculaires ont été développés et sont maintenant utilisés en routine pour assister les différentes étapes de ce programme comme la vérification des croisements et le suivi des gènes responsables de la vernalisation.Plus récemment nous avons débuté un nouveau projet, en collaboration avec des collègues de Biochimie et Physicochimie, qui vise à mettre au point des critères d’évaluation de la qualité technologique de la graine, en vue de la fabrication de moutarde. Ces critères permettront le suivi des lots de graines tout au long de la sélection, de la production et de la transformation. Les objectifs étaient donc de mieux comprendre les liens entre les paramètres biochimiques des graines et les localisations de production et du suivi technique et de réaliser un outil de sélection rapide des lignées et graines (microprocess)
Repenser l’ingénierie territoriale en milieu rural peu dense : L’expérimentation « Villages du futur » par la Région Bourgogne Franche-Comté
No full textInternational audienceDe 2021 à 2023, neuf communes rurales de Bourgogne-Franche-Comté ont participé à une expérimentation « Villages du Futur » initiée par la Région. Les communes ont été accompagnées par des équipes techniques pour proposer des cadres d’action aux élus et habitants pour coopérer, inventer, tester et construire collectivement l’avenir de leur village. Les résultats démontrent l’importance (i) des besoins de formation des élus locaux aux démarches de démocratie participative et (ii) de l’ingénierie publique nécessaire pour générer des dynamiques collectives au-delà des seules participations individuelles et ponctuelles
Dynamic of soil microbial communities in response to long-term repeated organic or inorganic fertilizations
No full textInternational audienceWithin the soil biodiversity reservoir, the microbial community is essential for ecosystem functioning and resilience. Applications of organic and inorganic products in agriculture could improve soil microbial quality and increase crop productivity. However, little is known about the dynamic of the soil microbial communities after several years of repeated fertilizer inputs. In this study, we take advantage of a longterm field experiment in Rennes (SOERE PRO – EFELE), Brittany region (France). The EFELE experiment was set up in 2012 and has been cropped with wheat-maize rotationsince the beginning of the trial. A mineral fertilizer (MIN), and three different organic amendments: cattle manure (CM), pig slurry (PS), and anaerobic digestate (DIG), were applied once a year from 2013 to the present. These treatments were compared to a control (CON) that has not received any organic or inorganic input. To monitor soil microbial community changes throughout 10 years of repeated fertilization practices, every two years (on wheat culture), soil samples were collected twelve months after the last organic or inorganic material application. We used high-throughput sequencingtargeting 16S and 18S ribosomal RNA genes to describe the evolution of microbial soil communities. DNA extractions of all soil samples were performed in 2022. Resultsshowed that the soil molecular biomass remained stable over 10 years of repeated fertilization practices, except for the CON treatment where a decrease (~58%) was observed. Interestingly, regardless of the sampling time considered, soils treated with CM displayed 20% higher soil molecular biomass compared to those that received DIG. The richness diversity index based on operational taxonomic units (OTUs) remained stable for both prokaryotic and fungal communities over time for all treatments. The Non-Metric multiDimensional Scaling approach (NMDS) showed that the structure of the prokaryotic community changed over time depending on the treatment. Regarding the fungal community structure, a time-dependent effect was also observed, although the discrimination between different treatments seemed less pronounced than the one observed for the prokaryotic structure. To conclude, the present study highlights that the soil microbial community could be lastingly modified after 10 years of repeated fertilization practices. These changes depend on the nature of the treatment applied