HAL - La Rochelle Université, Archives Ouvertes
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An enduring, 20-year, multidisciplinary seal-borne ocean sensor research collaboration in the Southern Ocean
No full textInternational audienceOver the last 20 years (2004 to 2025), a French-Australian research and ocean observing collaboration has collected > 400,000 temperature-salinity profiles providing broad coverage within the Indian Sector of the Southern Ocean. The collaboration is the cornerstone of the emerging global Animal-Borne Oceanographic Sensors (AniBOS) network, from which the data are freely available to the operational, ocean and climate research, and public communities. These data are a primary source of information for the study of ocean properties in this remote region, enabling major advances in knowledge of dense water formation, glacial ice shelf melting, frontal structure and recent trends driven by climate change in the Southern Ocean. The data have also provided key observations of biological processes, redefining our understanding of the ecology of seals in the Southern Ocean and providing a detailed picture of how they utilise their dynamic ocean-ice environment. The two-fold delivery of essential oceanographic and ecological observations makes this a flagship program, one which has enabled a step-change in our understanding of coupling between physics and biology. Sustaining the observations delivered by AniBOS is critical within the context of a rapidly changing Southern Ocean, for detecting change and anticipating consequences for these unique coupled systems
The copper ionophore disulfiram improves mitochondrial function in various yeast and human cellular models of mitochondrial diseases
No full textInternational audienceAbstract The copper ionophore disulfiram (DSF) is commonly used to treat chronic alcoholism and has potential anti-cancer activity. Using a yeast-based screening assay of FDA-approved compounds, DSF was herein identified for its ability to improve oxidative phosphorylation-dependent growth of various yeast models of mitochondrial diseases caused by a wide range of defects in ATP synthase, complexes III and IV, cardiolipin remodeling, maintenance and translation of the mitochondrial genome. This compound also showed beneficial effects in cells derived from patients suffering from Barth or MELAS syndromes, two mitochondrial diseases associated respectively with a lack in cardiolipin remodeling and protein synthesis inside the organelle. We provide evidence that the rescuing activity of DSF results from its ability to transport copper ions across biological membranes. Indeed, other copper ionophores (pyrithione and elesclomol) and supplementation of the growth media with copper ions had also beneficial effects in yeast and human cells with dysfunctional mitochondria. Our data suggest that the copper-dependent rescuing activity in these cells results from a better capacity to assemble cytochrome c oxidase. Altogether, our findings hold promise for the development of new therapeutic strategies for mitochondrial disorders
Severe environmental constraints can alter mitochondrial coupling efficiency: is it truly beneficial or only the last chance to survive?
No full textInternational audienceConverting food to cellular energy (ATP) is a fundamental requirement to sustain life. In aerobic organisms, mitochondria are the major source of ATP, becoming a strong physiological link between environmental resources and organism’s performances. Environmental fluctuations in abiotic (temperature and oxygen) and biotic (food resources) parameters have the potential to alter mitochondrial oxidative ATP production and efficiency at different temporal levels. For instance, it is well described that thermal acclimation induces compensatory adjustments triggering mitochondrial fluxes resilience across large shifts in temperature. Poor food quality or quantity is also known to triggers a shift of mitochondrial metabolism toward a more economical phenotype. Using several experimental studies, we will try to answer the following question: is change in energy coupling efficiency is truly beneficial or the ultimate mitochondrial adjustment to sustain life on “the razor blade”
Modelling connectivity at a regional scale during seasonal movements of the greater horseshoe bat
No full textInternational audienceContext : Connectivity modelling is a powerful tool for strengthening the link between landscape and species conservation. This approach often relies on expert knowledge of connectivity indicators or limited, small numbers and small‐scale monitoring data, for example during animal foraging activities. However, integrating larger scale movement data, including dispersal or seasonal movements, is crucial to making conservation relevant by covering the entire life cycle of species.Approach and methods : Using Resource Selection Function, the movement patterns of greater horseshoe bats (GHB) studied on a local scale were transposed to a regional scale to model the connectivity in western France. GHB is highly sensitive to loss of connectivity and makes seasonal regional migrations. How the local landscape heterogeneity influenced the conductance parameters estimation for modelling was examined using the gap‐crossing method at four different sites with variable landscape composition. The inferred parameters were used to create a regional connectivity map based on circuit theory. To validate this map, acoustic monitoring was conducted during the autumn migration to assess its effectiveness in identifying connectivity gradients. Finally, the resulting connectivity map was superimposed on the Natura 2000 network.Results : First, it can be assumed that connectivity parameters are identical whatever the landscape context. Second, the regional connectivity model identified the main potential corridors connecting all the major sites in the region. Finally, based on acoustic sampling, the number of GHB in transit was significantly higher in areas of higher connectivity. In terms of overlap with conservation, the functional connectivity of the GHB has been variously addressed in the current Natura 2000 network, with an overall lack of representativeness.Policy implications : Studying pathways during high mobility periods is one of the main missing elements for effective conservation, particularly for small species such as bats. An acoustic, stratified sampling at both local and large scale provided sufficient spatial and temporal accuracy to model connectivity throughout the life cycle of bats. This framework can easily be applied to other bat species to improve our understanding of connectivity, in order to explicitly integrate this crucial aspect for highly mobile species into the protection network.Contexte : La modélisation de la connectivité est un outil puissant pour renforcer le lien entre le paysage et la conservation des espèces. Cette approche s'appuie souvent sur une connaissance approfondie des indicateurs de connectivité ou sur des données de suivi limitées, en petit nombre et à petite échelle, par exemple lors des activités de recherche de nourriture. Cependant, l'intégration de données de mouvements à plus grande échelle, notamment pour la dispersion ou les déplacements saisonniers, est essentielle pour rendre la conservation pertinente en couvrant l'ensemble du cycle de vie des espèces.Approche et méthodes : À l'aide de la méthode des fonctions de sélection des ressources (RSF), les caractéristiques de déplacement des Grands Rhinolophes (GR) étudiées à l'échelle locale ont été transposées à l'échelle régionale afin de modéliser la connectivité dans l'Ouest de la France. Le GR est très sensible à la perte de connectivité et effectue des migrations régionales saisonnières. L'influence de l'hétérogénéité du paysage local sur l'estimation des paramètres de conductance utilisés pour la modélisation a d'abord été examinée par la méthode du franchissement de trouées sur quatre sites différents à composition paysagère variable. Les paramètres inférés ont été ensuite utilisés pour créer une carte de connectivité régionale basée sur la théorie des circuits. Pour valider cette carte, un suivi acoustique a de plus été réalisé pendant la migration d'automne afin d'évaluer son efficacité à identifier les gradients de connectivité. Enfin, la carte de connectivité obtenue a été confrontée au réseau Natura 2000.Résultats : Premièrement, les résultats montrent que les paramètres de connectivité sont vraisemblablement identiques quel que soit le contexte paysager. Deuxièmement, le modèle de connectivité régionale a identifié les principaux corridors potentiels reliant tous les sites majeurs de la région. Enfin, sur la base d'un échantillonnage acoustique, le nombre de GR en transit était significativement plus élevé dans les zones de connectivité plus élevée. En termes d'implication pour la conservation, la connectivité fonctionnelle des GR se retrouve à des degrés variables dans le réseau Natura 2000 actuel, avec globalement un manque global de représentativité.Implications dans la gestion : L'étude des voies de mouvement pendant les périodes de forte mobilité est l'un des principaux éléments manquants pour une conservation efficace, en particulier pour les petites espèces comme les chauves‐souris. Un échantillonnage acoustique stratifié à la fois à l'échelle locale et à grande échelle a fourni une précision spatiale et temporelle suffisante pour modéliser la connectivité tout au long du cycle de vie des chauves‐souris. Ce cadre peut facilement être appliqué à d'autres espèces afin d'améliorer notre compréhension de la connectivité, pour permettre d'intégrer explicitement cet aspect crucial pour les espèces très mobiles dans le réseau de protection
Complex interactions between the gut microbiota, pesticide contamination and physiological traits in grey partridges
No full textThe intensification of agriculture in recent years, particularly through the massive use of pesticides and fertilizers, has caused a decline in biodiversity, specifically among farmland birds. Emerging research highlights the adverse effects of chronic and low-dose pesticide exposure, particularly on the gut microbiota, which is essential for host metabolism and immune health. Understanding how pesticides disrupt microbial diversity and physiological traits is thus critical to inform management and conservation strategies. This study examines the impact of pesticide contamination on the gut microbiota composition and physiological responses of captive-bred male grey partridges, a threatened species frequently exposed to pesticide cocktail residues through their habitat and diet. We detected residues of 27 pesticide molecules in the birds' blood, including fungicides, herbicides, and insecticides. Among the different microbial diversity metrics analysed, only bacterial richness was significantly affected by the interaction between pesticide load and body condition, with contrasting effects observed across different body condition groups. Furthermore, higher microbial diversity was positively associated with hematocrit levels, suggesting that microbial diversity may be related to the physiological health of birds. These findings highlight the complex relationship between pesticide exposure, gut microbiota, and host physiology, emphasizing the need for further research to understand these interactions in wildlife health
Thesaurus multilingue des Arts de la scène (version 1)
No full textThis PDF file presents a prototype of a multilingual thesaurus dedicated to the performing arts, developed using the Opentheso platform (IR* HumaNum), an open-source and collaborative tool for managing controlled vocabularies.This work was carried out within the framework of two interdisciplinary and international research projects: THEATRALIA, a working group supported by DARIAH-EU, the European infrastructure for digital humanities, and PERFORMA, a research program funded by the Institut des Amériques, focused on the study of the Americas.The thesaurus aims to provide a coherent and standardized structure of concepts related to the performing arts (theatre, dance, performance, circus arts, etc.) in several languages, including French, English, Spanish, Portuguese, indonesian and croatian. It is designed to facilitate the description, indexing, and interoperability of documentary and archival resources, to support multilingual database research, and to contribute to the valorization of intangible cultural heritage in scientific, cultural, and digital contexts.This prototype represents an exploratory step toward the development of a shared and evolving tool, open to contributions from research communities and professionals in the field.This PDF file presents a prototype of a multilingual thesaurus dedicated to the performing arts, developed using the Opentheso platform (IR* HumaNum), an open-source and collaborative tool for managing controlled vocabularies.This work was carried out within the framework of two interdisciplinary and international research projects: THEATRALIA, a working group supported by DARIAH-EU, the European infrastructure for digital humanities, and PERFORMA, a research program funded by the Institut des Amériques, focused on the study of the Americas.The thesaurus aims to provide a coherent and standardized structure of concepts related to the performing arts (theatre, dance, performance, circus arts, etc.) in several languages, including French, English, Spanish, Portuguese, indonesian and croatian. It is designed to facilitate the description, indexing, and interoperability of documentary and archival resources, to support multilingual database research, and to contribute to the valorization of intangible cultural heritage in scientific, cultural, and digital contexts.This prototype represents an exploratory step toward the development of a shared and evolving tool, open to contributions from research communities and professionals in the field.Este archivo PDF presenta un prototipo de tesauro multilingüe dedicado a las Artes Escénicas, desarrollado con la plataforma Opentheso (IR* HumaNum), una herramienta libre y colaborativa para la gestión de vocabularios controlados.Este trabajo se enmarca en dos proyectos de investigación interdisciplinarios e internacionales: THEATRALIA, un grupo de trabajo apoyado por DARIAH-EU, infraestructura europea para las humanidades digitales, y PERFORMA, un programa de investigación financiado por el Instituto de las Américas, dedicado al estudio de las Américas.El tesauro tiene como objetivo ofrecer una estructura coherente y normalizada de los conceptos relacionados con las artes performativas (teatro, danza, performance, artes circenses, etc.) en varios idiomas, especialmente francés, inglés, español, portugués, indonesio y croata. Está diseñado para facilitar la descripción, la indexación y la interoperabilidad de recursos documentales y archivísticos, la búsqueda en bases de datos multilingües, así como la valorización del patrimonio vivo en contextos científicos, culturales y digitales.Este prototipo constituye un paso exploratorio hacia la implementación de una herramienta compartida, evolutiva y abierta a la contribución de comunidades de investigación y profesionales del ámbito.Ce fichier PDF présente un prototype de thésaurus multilingue dédié aux Arts de la scène, développé à l’aide de la plateforme Opentheso (IR* HumaNum), un outil libre et collaboratif de gestion de vocabulaires contrôlés.Ce travail s’inscrit dans le cadre de deux projets de recherche interdisciplinaires et internationaux : THEATRALIA, un groupe de travail soutenu par DARIAH-EU, infrastructure européenne pour les humanités numériques, et PERFORMA, un programme de recherche financé par l’Institut des Amériques, dédié à l’étude des Amériques.Le thésaurus a pour objectif de proposer une structuration cohérente et normalisée des concepts liés aux arts performatifs (théâtre, danse, performance, arts du cirque, etc.) dans plusieurs langues, notamment le français, l’anglais, l’espagnol, le portugais, l'indonésien et le croate. Il est conçu pour faciliter la description, l’indexation et l’interopérabilité des ressources documentaires et archivistiques, la recherche dans des bases de données multilingues, ainsi que la valorisation des patrimoines vivants dans des contextes scientifiques, culturels et numériques.Ce prototype constitue une étape exploratoire vers la mise en œuvre d’un outil partagé, évolutif et ouvert à la contribution des communautés de recherche et des professionnels du domaine
A Survey on Services Placement Algorithms in Integrated Cloud-Fog / Edge Computing
No full textInternational audienceThe evolution of computing paradigms, such as Fog and Edge, has led to the emergence of new applications that require a placement of services close to the end users. Optimal placement of such applications over network nodes is therefore an important issue in integrated Cloud-Fog/Edge computing environments. The service placement problem is challenging due to the complexity of such distributed systems, limited computing resources, placement constraints, global efficiency of the application and quality requirements for end users. This survey attempts to provide a comprehensive and structured presentation of services placement problem research in integrated Cloud-Fog/Edge. We propose a new classification of services placement problem approaches by adopting an algorithmic viewpoint and a breakdown into three categories: graph-based, heuristics and machine-learning approaches. We also provide an analysis and some discussions of the methods, and identify some future challenges and issues in the case of microservices. We hope that this survey will provide a better understanding of the solutions and directions taken by research on this important topic
Design de l'isolation des parois pour améliorer l'efficacité énergétique
No full textInternational audienceCe travail propose une méthode innovante pour améliorer la performance énergétique des parois multicouches de bâtiments afin de minimiser leur consommation énergétique. Le problème direct repose sur la résolution d'une équation de transfert de chaleur 2D en régime transitoire, en utilisant le schéma de différences finies de DUFORT-FRANKEL. Les conditions aux limites incluent des échanges convectifs à l'intérieur, un couplage convection-rayonnement solaire à l'extérieur avec des coefficients variant dans le temps et l'espace. L'interface entre deux matériaux est modélisée par une fonction paramétrique permettant de décrire la distribution des propriétés thermiques. Une étude paramétrique explore la variation de la fonction objectif de design énergétique en fonction des paramètres de l'interface, identifiant ainsi des solutions intéressantes. Le cas de Chambéry est étudiée et les résultats montrent l'intérêt de cette approche.</div
: The extreme flood of February 1904 on the River Charente (South-West, France): a forgotten flood?
No full textInternational audienceLa crue de février 1904 a causé l’une des inondations les plus remarquables que le fleuve Charente ait connues depuis le XVIIIe siècle. À Angoulême, la Charente a atteint la cote 5,29 m à l’échelle du quaiSaint-Cybard (T = ~50 ans) et 6,77 m à l’échelle amont du pont Palissy à Saintes (T = ~80 ans). Cetteinondation a touché une grande partie de la vallée de la Charente, en particulier le linéaire entreAngoulême et Saintes (46 communes), aujourd’hui classé comme Territoire à Risque d'InondationImportant (TRI). Cette inondation n’a pas été particulièrement menaçante pour les vies humaines enraison de sa cinétique lente et de ses faibles vitesses d’écoulement. Cependant, elle a eu un impactmajeur sur la vie des riverains et sur le fonctionnement du territoire à cause de l’inondation prolongéedes habitations et de la dégradation des infrastructures. Pour autant, la crue de 1904 est jusqu’à présentpeu mentionnée dans les documents de gestion du risque d’inondation au profit des crues extrêmesrécentes de Décembre 1982 et Janvier 1994. Cet évènement majeur reste également méconnu desscientifiques et des populations riveraines. Dans ce contexte, ce travail propose d’analyser lesconditions météorologiques et le déroulement de la crue de Février 1904 ainsi que ses répercussionssur les territoires charentais et les sociétés riveraines à partir de l’étude de données instrumentales et desources documentaires variées. Si des repères de crue rappellent les hauteurs d’eau exceptionnellesatteintes par cet évènement majeur, ce sont surtout des cartes postales qui témoignent de l’ampleur del’inondation de 1904. Toutefois, ces documents iconographiques de qualité sont jusqu’à présent peumobilisés alors qu’ils permettraient de rendre visible cette crue majeure auprès des nouvellesgénérations et de l’ancrer dans la mémoire locale afin de rappeler aux habitants que les crues extrêmesrécentes de Février 2021 et Décembre 2023 bien que rares, ne sont pas des évènements inédit
Bursts of brain erosion: seizures and age-dependent neurological vulnerability
No full textInternational audienceHypersynchronous and exaggerated neuronal firing, exemplified by epileptiform activity and seizures, are disruptors of brain function across acute and chronic neuropathological conditions. Here, we focus on how seizure activity, whether as a primary symptom or a secondary comorbid event within a complex pathological setting, adversely impacts neurological trajectories. We discuss experimental and clinical evidence illustrating the participation of neurodegenerative and senescence-like adaptations. Paroxysmal neuronal events, through bidirectional causality, are linked with immune and microvascular changes, disrupting cellular homeostasis and creating a feed-forward loop that intertwines with age-related frailty to deteriorate mental health. We emphasize the clinical significance of early detection of these brain vulnerabilities through biomarkers, monitoring neurodevelopmental risks in children, and tracking neurodegenerative disease progression in aging populations