Portail "HAL-Francophonie Afrique et Océan Indien"
Not a member yet
43052 research outputs found
Sort by
Sensitivity of lumped and semi-distributed hydrological models to 20 gridded precipitation products in a transboundary basin
No full textInternational audienceThis study proposes a dual approach to assess 20 Gridded Precipitation Products (GPPs) within a transboundary region with complex topography. GPPs were first compared with observed precipitation to assess their spatio-temporal accuracy. They were then integrated into a lumped (GR4J) and a semi-distributed (MGB-IPH) hydrological model to evaluate their impact on streamflow simulations for three basins. Even if most GPPs effectively captured the dominant north-south precipitation gradient shaped by the Andean topography, the results show significant variations in GPP effectiveness across the considered basins. The most reliable GPPs for streamflow simulation across Katari, Ilave, and Ramis basins are MSWEP, CHIRPS, and MSWEP when considering the lumped GR4J model and SM2Rain_CCI, IMERG_FR, and SM2Rain_CCI when considering the semi-distributed MGB model. This discrepancy among the models shows that GPPs' reliability assessment is sensitive to the model structure and that different conclusions could be made according to the selected model. Our findings show that the GR4j lumped model is barely influenced by precipitation bias due to its buffering capacity. In contrast, the semi-distributed MGB-IPH model is sensitive to precipitation bias in space and time and therefore is more suitable to reveal GPP inconsistencies. Overall, this study not only provides GPP reliability feedback but also new insights on the respective limits and advantages of different assessment methods (i.e., gauges, lumped and semi-distributed models). These findings support the development of a practical framework for GPP selection according to the forecast use.</div
Effects of variety and culture site on nutritional composition of cowpea in Burkina Faso
No full textThis volume follows on from the Rencontres Francophone Légumineuses (RFL) held in March 2024, organized by CIRAD, INRAE, Terres Inovia and Terres Univia, and co-organized by the Institut Sénégalais de Recherches Agricoles (ISRA). This unique event brings together all those involved in development, the supply chains and research into grain and forage legumes. It's an opportunity to exchange views, share knowledge and accelerate innovation around legumes. The RFLs focus on seed, forage and woody legumes, and aim to cover the diversity of production systems, as well as the diversity of uses: food, feed and non-food. Pulses are a major lever for meeting the global challenges of climate change and food and nutritional security. All over the world, they play a strategic role, providing nutritional benefits and ensuring protein and food sovereignty. The many species of pulses also represent a formidable breeding ground for food innovation.International audienceCowpea is a legume, rich in protein, B vitamins and minerals (magnesium, zinc), but also rich in antinutritional factors such as α-galactosides and phytic acid. The nutritional composition of cowpea seeds is therefore a criterion that should be taken into account to improve varietal selection.The nutritional composition of 13 varieties of cowpea cultivated in Burkina Faso was characterised in order to identify varietal selection criteria based on nutritional potential. Nine varieties were cultivated in Tenkodogo (T), 10 in Kamboinsé (K), and 6 in both localities. Protein content were determined by the Kjeldahl method, mineral content by ICP-OES, thiamine content by UHPLC-FLR, phytic acid content by HPAEC-CD and α-galactosides and low-molecular-weight sugars content were quantified by HPAEC-PAD. Variance analysis allowed to evaluate the effect of variety using results obtained in each site (nT=9, and nK= 10), as well as effect of locality using results from varieties cultivated in both sites.The protein contents of the samples studied vary between 19,9 and 26,2 g/100 g DM depending on the variety. The phytate content was higher on the Kamboinsé plot (with results ranging from 0,70 to 1,17 g IP6/100 g DM) than on the Tenkodogo plot (0,42 to 0,80 g IP6/100 g DM). Thiamine equivalent contents, ranging from 0,34 to 0,73 mg/100 g DM, showed a significant variety and plot effect. The main forms of thiamine (di-phosphate and hydrochloride thiamins) were present in variable proportions depending on the variety and the plot. Iron and zinc content were mainly affected by variety and varied between 3,70 to 5,92 mg/100 g DM and from 3,30 to 5,14 mg/100 g DM respectively. The total α-galactoside content was between 3,27 and 6,09 g/100 g DM, and the sucrose content ranged from 1,29 to 5,80 g/100 g DM, both influenced by variety. All components were also influenced by the interaction between variety and plot.Results of nutritional composition should be related to agriculture and processing practices to identify processes decreasing antinutritional factors (α-galactosides, phytic acid) while taking account consumers preferences. Phyate, iron, zinc, thiamin, α-galactoside contents could constitute additional criteria in varietal selection of cowpea, in Burkina Faso.</p
Vécu des médecins généralistes victimes de violences sexistes et sexuelles de la part de patient·es
No full textContext: Sexual and gender-based violence (SGBV) against private general practitioners (GPs) perpetrated by their patients, are common, affecting practitioners’ mental health and their relationships with patients. To date, there are only a very few qualitative studies exploring the experiences of GPs facing this phenomenon.Objective: Explore GPs’ experiences in private practice facing SGBV from their patients, focusing on perceived psychological impact and coping strategies of physicians. Method : This is a phenomenological qualitative study. Participants were recruited by purposive sampling. Eight in-depth interviews were conducted between august 2023 and April 2024 with GPs who experienced SGBV from their patients and analyzed according to a method inspired by interpretative phenomenological analysis. Results: SGBV can take many forms, from gender-based remarks and inappropriate physical behaviors to harassment. The psychological impact differs between male and female GPs, with the latter reporting feelings of fear, insecurity and self-doubt. To protect themselves, physicians adopt postural prevention strategies, modifying their attitude and appearance, and organizational strategies, including working in group practices or selectively choosing their patient base. The sensitivity of these doctors, reinforced by their personal experiences, is reflected in their commitment to the fight against SGBV. In response to this recurring problem, all participants stressed the importance of raising awareness and training future GPs to meet these challenges. Conclusion: Our study sheds light on the reality of sexism and sexual violence suffered by GPs from their patients, their psychological repercussions and the coping measures developed to face them. It also underlines the active involvement of doctors in the fight against SGBV and the need to raise awareness and train future GPs in these challenges, to ensure a safe and respectful working environment.Contexte : Les violences sexistes et sexuelles (VSS) envers les médecins généralistes exerçant en libéral de la part de leurs patient·es sont fréquentes, impactant la santé mentale des médecins et la relation médecin-patient·e. A ce jour, il existe très peu d’études qualitatives explorant le vécu des médecins généralistes confronté·es à ce phénomène.Objectif : Explorer le vécu des médecins généralistes exerçant en libéral, confronté·es aux VSS de leurs patient·es, en s'intéressant à l’impact psychologique perçu et aux stratégies d'adaptation des médecins.Méthode : Il s’agit d’une étude qualitative phénoménologique. Les participant·es ont été sélectionné·es par échantillonnage raisonné. Huit entretiens compréhensifs ont été menés entre août 2023 et avril 2024 auprès de médecins généralistes ayant été exposé·es à des VSS de la part de patient·es et analysés selon une méthode inspirée de l’analyse phénoménologique interprétative. Résultats : Les VSS se manifestent sous différentes formes, allant de remarques sexistes et comportements physiques inappropriés jusqu’à des faits de harcèlement. L’impact psychologique perçu par les médecins diffère entre les médecins hommes et femmes, ces dernières exprimant des sentiments de peur, d’insécurité et de remise en question. Pour se protéger, ils·elles adoptent des stratégies de prévention posturale, modifiant leur attitude et apparence, et des stratégies organisationnelles, favorisant une installation en groupe ou la sélection de leur patientèle. La sensibilité de ces médecins, renforcée par leurs expériences personnelles, se manifeste par un engagement dans la lutte contre les VSS. Face à ce problème récurrent, tous·tes soulignent l’importance de sensibiliser et de former les futur·es médecins à ces enjeux.Conclusion : Notre étude met en lumière la réalité que représentent le sexisme et les violences sexuelles subies par les médecins généralistes de la part de leurs patient·es, leurs répercussions psychologiques et les mesures d’adaptation mises en place pour y faire face. Elle souligne par ailleurs l’engagement actif des médecins dans la lutte contre les VSS et la nécessité de sensibiliser et former les futur·es médecins à ces enjeux, pour garantir un environnement de travail sécurisant et respectueux
Éducation thérapeutique en MSP : source de satisfaction ou dérive vers un surinvestissement ?
No full textBackground: Childhood obesity requires, according to the High Authority of Health (HAS), a coordinated multiprofessional approach with the implementation of Patient Therapeutic Education (PTE). In 2022, the Pediatric Resource Centre (PRC) in La Réunion developed the PTE program “Sois bien”. In 2023, for the first time, this program was made available (MA) to a Multiprofessional Health Center (MHC) for their patients. The objective of this study was to explore the perceptions of professionals who participated in this project.Method: A qualitative study inspired by grounded theory. We conducted 8 semi-structured interviews with professionals from the MHC, the PRC and the Regional Health Agency (RHA) of La Réunion from May 2023 to May 2024, and observed a collective workshop of the PTE program “Sois bien”.Results: Patient absenteeism, perceived lack of motivation, family complexities, underestimated workload and insufficient remuneration were major obstacles to the smooth running of the project. At the same time, the overinvestment and frustration of professionals led to a risk of exhaustion and deterioration of the caregiver-patient relationship. However, patient progress, the feeling of better knowing the families and improve the care thanks to collaborative approach with the teamwork were sources of satisfaction and allowed the project to succeed.Conclusion: The development of PTE closer to patients' living environment by a multiprofessional team that knows them seems a relevant approach to develop quality of care. This approach requires the practice of Motivational Interview in parallel of the program, and a quality approach to teams to prevent exhaustion and ensure the sustainability of the program.Introduction : L’obésité infantile nécessite, selon la Haute Autorité de Santé (HAS), une prise en charge pluriprofessionnelle coordonnée avec mise en place d’Éducation Thérapeutique du Patient (ETP). En 2022, le Pôle Ressource Pédiatrique (PRP) à La Réunion a élaboré le programme ETP « Sois bien ». En 2023, pour la première fois, ce programme a été Mis À Disposition (MAD) d’une Maison de Santé Pluriprofessionnelle (MSP) pour leur patientèle. L’objectif de cette étude était d’explorer les représentations des professionnels de santé ayant participé à ce projet.Méthode : Étude qualitative inspirée de la théorisation ancrée. Nous avons mené 8 entretiens semi-dirigés auprès des professionnels de santé de la MSP, du PRP et de l’Agence Régionale de Santé (ARS) de La Réunion de mai 2023 à mai 2024, et avons observé un atelier collectif du programme d’ETP « Sois bien ».Résultats : L’absentéisme des patients, leur motivation perçue insuffisante, les complexités familiales, une charge de travail sous-évaluée et une rémunération insuffisante ont été des obstacles majeurs au bon déroulement du projet. En parallèle, le surinvestissement des professionnels et leur frustration ont mené à un risque d’épuisement et de détérioration de la relation soignant-patient. Cependant, les progressions des patients, le sentiment de mieux connaitre les familles et d’améliorer la prise en charge grâce à l’approche collaborative du travail en équipe ont été source de satisfaction et ont permis l’aboutissement du projet.Conclusion: Le développement de l’ETP au plus près du lieu de vie des patients par une équipe pluriprofessionnelle les connaissant semble une approche pertinente pour développer la qualité des soins. Cette approche nécessite la pratique d’Entretien Motivationnel en parallèle du programme, et une démarche qualité auprès des équipes afin de prévenir leur épuisement et d’assurer la pérennité du programme
Nutritional and microbiological dynamics in the preparation of prahoc fish paste
No full textInternational audiencePrahoc is a traditional fermented fish widely consumed in Cambodia. Nevertheless, the processing and nutritional values of this daily-consumed product were poorly described. This study offers a detailed analysis of the biochemistry, nutritional composition, and microbiota during the six-month Prahoc incubation. Macronutrients (e.g. lipids, proteins) are rather well preserved during the preparation of the fish paste but the fatty acid and amino acid profiles are slightly modified at the end of the unit operation. Free amino acids increased, which facilitates the in vitro digestibility of the final paste, while beneficial fatty acids, such as eicosapentaenoic and docosahexaenoic acids, decreased. At the end of the process, the peroxide value was nearly five times greater than the limit set by the Codex Alimentarius (10 meq O 2 /kg). Biogenic amines, particularly cadaverine, were present but remained within acceptable limits. Metabarcoding analysis revealed that salt-tolerant bacteria dominated the fermentation process, while fungal activity was minimal. Lactic acid bacteria, such as Vagococcus and Streptococcus , were predominant before salt addition, while the fish pathogen Aeromonas established itself immediately after. Clostridium remained steady throughout, and Lentibacillus became dominant after six months. Food safety concerns related to biogenic amines, peroxides, and Clostridium highlight the need for establishing standard operational practices among national processors to mitigate food risks
Évolution de la prescription des anti-CD20 au CHU de Bordeaux : les anti-CD20 en "vie réelle"
No full textBackground: Recent data suggest the benefit of early use of high-efficacy therapies (HET) in relapsing-remitting multiple sclerosis (RR-MS). The aim is to analyze real-world evolution of anti-CD20 prescriptions at Bordeaux University Hospital and to compare the effectiveness of early introduction of HET with anti-CD20 monoclonal antibodies versus therapeutic escalation strategy.Method: This is a retrospective monocentric study based on the local EDMUS database. RR-MS patients receiving anti-CD20 treatment and followed for at least two years were classified into the therapeutic escalation (ESC) group if they had received at least one platform treatment before anti-CD20 or into the Early Intensive Treatment (EIT) group. Propensity score-matched linear regression analyses were conducted to compare the EDSS at two years of treatment and at last follow-up. The profile of patients treated since 2021 was compared to that of patients treated before 2021.Results: 217 patients were included in the ESC group and 102 in the EIT group. The median EDSS at 2 years and at last follow- up (median duration 12 years) were lower in EIT group (1.5 in EIT group, 2.5 in ESC group, p 0.001). Patients treated with anti-CD20 since 2021 received fewer treatment lines, had a lower annualized relapse rate and less gadolinium- enhancement at treatment initiation.Conclusion: This study shows that early initiation of high-efficacy treatment with anti-CD20 in RR-MS has an impact on long-term neurological disability. In real world, anti-CD20 are used earlier in the therapeutic sequence.Introduction : De récentes données suggèrent l’intérêt de l’utilisation précoce des thérapies de haute efficacité (THE), dans la sclérose en plaques rémittente (SEP RR). Le but est d’analyser en vie réelle l’évolution de prescription des antiCD20 au CHU de Bordeaux et de comparer l’efficacité de l’introduction précoce d’un THE par anti-CD20 par rapport à l’escalade thérapeutique (ESC).Méthode : Il s’agit d’une étude monocentrique rétrospective de la base de données locale EDMUS. Les patients atteints de SEP- RR, suivis au moins 2 ans, recevant un traitement anti-CD20 étaient classés dans le groupe ESC s’ils recevaient au moins un traitement plateforme avant le THE ou dans le groupe Early Intensive Treatment (EIT). Des analyses de régressions linéaires appariées sur score de propension ont été réalisées pour comparer l’EDSS à 2 ans du traitement et à la fin du suivi. Le profil des patients traités à partir de 2021 a été comparé à celui des patients traités avant 2021.Résultats : 217 patients ont été inclus dans le groupe ESC et 102 dans le groupe EIT. Les EDSS médians à 2 ans et au terme du suivi moyen de 12 ans étaient plus faibles dans le groupe EIT (1,5 dans le groupe EIT, 2,5 dans le groupe ESC, p 0,001). Les patients traités par anti-CD20 à partir de 2021 recevaient moins de lignes de traitement, avaient un taux annualisé de poussées et un nombre de prises de contraste plus faibles à l’instauration du traitement.Conclusion : Cette étude montre que l'instauration précoce d’un traitement de haute efficacité par anti-CD20 dans la SEP-RR a un impact sur le handicap neurologique à long terme. En vie réelle, les anti-CD20 sont utilisés plus rapidement dans la séquence thérapeutique
Sévérité et prévalence du mal aigu des montagnes sur la station Concordia
No full textBackground : Acute Mountain Sickness (AMS) occurs at altitudes above 2500m. Without rapid treatment, the progression of this pathology can quickly progress to death. Prevention and knowledge of this disease are essential, even more so in isolated environments where medical evacuation is inherently difficult. The objective of this study is to assess the prevalence and severity of AMS in newcomers to the Franco-Italian scientific base Concordia located in Antarctica at 3233m altitude. We also examined the influence of potential risk factors and the Lake Louise Questionnaire Score after it’s update in 2018.Methods: in this observational cross-sectional study, AMS was assessed by medical staff on the day of arrival using the Lake Louise Score (LLQS, 2018 version) and daily until a maximum follow-up of 5 days. Severity was graded into mild, moderate and severe. Various parameters such as barometric pressure, gender, age and medications were also collected. Results: the overall prevalence of acute mountain sickness (AMS) according to the 2018 Lake Louise Questionnaire Score (LLQS) classification was estimated at 16.5% at 3233m. The AMS severity increased until the 1st day of follow-up and decreases until it disappears after 2 days of follow-up. A total of 53 participant (54.6% [44.7%; 64.2%]) reported experiencing headaches. Gastrointestinal symptoms were reported by 14 participant (14.4% [8.8%; 22.8%]). Fatigue was reported by 46 participant (47.4% [37.8%; 57.3%]). Dizziness was reported by 14 participant (14.4% [8.8%; 22.8%]). There were only mild severity AMS according to the LLQS classification, but one participant had to be evacuated from the site for a High-altitude pulmonary oedema. Conclusion: AMS is common at 3233m on Concordia Station. It can be severe and lead to medical evacuation without having classic warning signs detectable by LLQS2018.. Better knowledge and corrective action must be taken for security and well-being at work.Introduction : Le Mal Aigu des Montagnes (MAM) survient à des altitudes supérieures à 2 500 m. Sans prise en charge rapide, l’évolution de cette pathologie peut évoluer jusqu'au décès. L'objectif de cette étude est d'évaluer la prévalence et la sévérité du MAM chez les néo-arrivants sur la base scientifique franco-italienne Concordia, située à 3233 m d'altitude au cœur du continent Antarctique.Méthode : Dans cette étude observationnelle transversale réalisée lors de l’été austral 2023-2024, le MAM a été diagnostiqué et classé selon sa sévérité chez 97 participants selon le score de Lake Louise (LLQS, version 2018). Le suivi est quotidien à partir du jour d’arrivée jusqu’à un maximum de 5 jours. Divers paramètres tels que la pression barométrique au jour d’arrivée, le sexe, l’âge et l’automédication ont été relevés étudier leur effet sur la prévalence et la sévérité du MAM Résultats : 16 participants ont éprouvé un MAM ce qui fait une prévalence estimée à 16.5% [10.4%; 25.1%] à 3233m d’altitude. La prévalence du MAM augmente jusqu'a un pic à J1 puis diminue jusqu'à disparaître après J2. Au total, 53 participants soit 54,6% [44,7% ; 64,2%] de l’effectif ont déclaré avoir éprouvé des maux de tête . Des symptômes gastro-intestinaux ont été signalés par 14 participants soit 14,4% [8,8% ; 22,8%] de la cohorte. La fatigue a été signalée par 46 participants soit 47,4% [37,8% ; 57,3%]. Des étourdissements par 14 participants soit 14,4% [8,8% ; 22,8%]. La totalité (100%) des MAM étudiés ont été classé comme légers selon la classification LLQS2018. Cependant un participant a dû être évacué du site par précaution pour un œdème pulmonaire de haute altitude.Introduction Le Mal Aigu des Montagnes (MAM) survient à des altitudes supérieures à 2 500 m. Sans prise en charge rapide, l’évolution de cette pathologie peut aboutir au décès. La prévention et la connaissance de cette maladie sont essentielles, a fortiori en milieu isolé où l'évacuation sanitaire et le traitement des complications sont par nature difficiles. L'objectif de cette étude est d'évaluer la prévalence et la sévérité du MAM chez les néo-arrivants sur la base scientifique franco-italienne Concordia, située à 3233 m d'altitude au cœur du continent Antarctique afin de déterminer la nécessité d’entreprendre des mesures correctives. Nous avons également examiné l’influence des facteurs de risque connus ainsi que l’impact de la réévaluation en 2018 du score de Lake Louise sur la prévalence et la sévérité du MAMMéthodeDans cette étude observationnelle transversale réalisée lors de l’été austral 2023-2024, le MAM a été diagnostiqué et classé selon sa sévérité chez 97 participants selon le score de Lake Louise (LLQS, version 2018). Le suivi est quotidien à partir du jour d’arrivée jusqu’à un maximum de 5 jours. Divers paramètres tels que la pression barométrique au jour d’arrivée, le sexe, l’âge et l’automédication ont été relevés étudier leur effet sur la prévalence et la sévérité du MAM. Résultats 16 participants ont éprouvé un MAM ce qui fait une prévalence estimée à 16.5% [10.4%; 25.1%] à 3233m d’altitude. La prévalence du MAM augmente jusqu'a un pic à J1 puis diminue jusqu'à disparaître après J2. Au total, 53 participants soit 54,6% [44,7% ; 64,2%] de l’effectif ont déclaré avoir éprouvé des maux de tête . Des symptômes gastro-intestinaux ont été signalés par 14 participants soit 14,4% [8,8% ; 22,8%] de la cohorte. La fatigue a été signalée par 46 participants soit 47,4% [37,8% ; 57,3%] de la cohorte. Des étourdissements ont été signalés par 14 participants soit 14,4% [8,8% ; 22,8%] de la cohorte. La totalité (100%) des MAM étudiés ont été classé comme légers selon la classification LLQS2018. Cependant un participant a dû être évacué du site par précaution pour un œdème pulmonaire de haute altitude malgré un score LLQS2018 égal à 3/12. Conclusion : Le MAM n’est pas rare à 3233m sur la station Concordia. Malgré une sévérité décrite comme légère dans la majorité des cas à cette altitude; le MAM n’est pas le seul SHAI et peut évoluer vers l’oedème cérébral ou pulmonaire de haute altitude sans présenter de signes avant-coureurs détectables par le LLQS2018. Une meilleure connaissance de ces pathologies, et des mesures correctives, axées sur la prévention et la reconnaissance précoce des personnes à risque de MAM et de SHAI en général doivent être prises pour le bien-être et la sécurité des travailleurs sur Concordia
FT-IR Analysis of Ultrasonic-assisted Extracts of Total Alkaloid and Total Phenolic Contents from Uvaria chamae (Annonaceae) Root Bark and its Biological Effects
No full textInternational audienceBackground: The concept of sustainable development relevant nowadays creates a beneficial approach both environmentally and economically eco-friendly. This motivates the use of an innovative extraction technique with a positive environmental impact to obtain the active ingredients of plants. Aims: Besides Fourier Transform Infrared (FTIR) spectroscopy analysis of U. chamae root bark extracts. This study investigates the antioxidant and antiplasmodial potential of various crude extracts from the root bark of Uvaria chamae P. Beauv (Annonaceae). Methods: Two extraction techniques and different solvents were used. Ultrasonic-assisted extraction (UAE) and magnetic stirring extraction with ethanol and hydroethanolic solvent (30:70). The total alkaloid content (TAC) and total phenolic content (TPC) were quantified using the acid dye colorimetric method and the Folin-Ciocalteu method, respectively. The antioxidant activity was assessed using the DPPH (2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl) scavenging method and In vitro antiplasmodial activity was evaluated through the SYBR Green I-based fluorescence assay. Results: Total Alkaloid Content (TAC) and Total Phenolic Content (TPC) with values of (1.5 ± 0.3) μgAE/g of extract and (11.6 ± 0.4) μgGAE/g of extract, respectively are obtained. IC50 values of antioxidant potential ranging from (0.075 ± 0.001 to 0.183 ± 0.003) mg mL-1. IC50 values of antiplasmodial activity ranging from (9.84 ± SD to 28.69 ± SD) µg mL-1. The extraction yield of 9.80% achieved with UAE demonstrated its superior efficiency compared to the conventional solvent extraction method, which yielded only 3.18%. Fourier Transform Infrared (FTIR) spectroscopy analysis of U. chamae root bark extracts identified the presence of active functional groups typically associated with alkaloids and polyphenols. Conclusion: Obtained results using the green extraction method (UAE) confirming its suitability and efficiency for recovering secondary metabolites with antioxidant and antiplasmodial potential from U. chamae root bark. This provides a strong database for pharmaceutical research and the galenic formulation of phytomedicines against oxidative stress with antimalarial properties. Graphical Abstract
Incontinence urinaire et troubles du plancher pelvien chez les traileuses : une problématique sous-estimée ? Épidémiologie et facteurs de risque (IU-TRAIL-Quest)
No full textIntroduction: High-impact exercises, such as trail running, increase intra-abdominal pressure, placing stress on pelvic floor structures. This study hypothesized that trail running could promote the development of pelvic floor disorders (PFD) and that specific associated factors could be identified.Methods: A cross-sectional observational study was conducted via an online questionnaire. Collected data included demographic and anthropometric information, trail running practices, PFD symptoms, and medical and obstetric history. Prevalence rates were estimated with 95% confidence intervals, and associations between variables were analyzed using logistic regression.Results: A total of 3,283 female trail runners completed the questionnaire. Nearly one in two women (48.8%) reported currently experiencing at least one PFD, and the overall prevalence including past symptoms reached 67.3%. Stress urinary incontinence (SUI) was the most frequently reported disorder (37.9%), followed by pelvic pain (20%), urgency urinary incontinence (UUI, 15.5%), anal incontinence (10%), and pelvic organ prolapse (1.4%). Main associated factors included parity, vaginal delivery (linked to SUI), a BMI ≥ 25 (linked to SUI and UUI), chronic constipation (linked to UUI and anal incontinence), and family history of PFD.Conclusion: Trail running, through its specific biomechanical stresses, may contribute to the onset or worsening of PFD, particularly SUI. These results highlight the need to raise awareness among female trail runners and to develop targeted prevention strategies.Introduction : Les exercices à fort impact, comme le trail, augmentent la pression intra-abdominale, provoquant une surcharge des structures du plancher pelvien. Cette étude a émis l'hypothèse que la pratique du trail favoriserait l’apparition de troubles du plancher pelvien (TPP) et que certains facteurs spécifiques y seraient associés.Méthode : Une étude observationnelle transversale a été réalisée via un questionnaire en ligne. Les données recueillies incluaient des informations démographiques, anthropométriques, les caractéristiques de la pratique du trail, les symptômes de TPP, ainsi que les antécédents médicaux et obstétricaux. Les prévalences ont été estimées avec des intervalles de confiance à 95 %, et les associations entre variables ont été analysées par régression logistique.Résultats : Au total, 3 283 traileuses ont été incluses. Près d'une femme sur deux (48,8 %) présentait actuellement au moins un TPP, et 67,3 % en incluant les antécédents. L’incontinence urinaire d’effort (IUE) était le trouble le plus fréquent (37,9 %), suivie des douleurs pelviennes (20 %), de l’incontinence urinaire par urgenturie (IUU, 15,5 %), de l’incontinence anale (10 %) et du prolapsus des organes pelviens (1,4 %). Les principaux facteurs associés étaient la parité, l’accouchement par voie basse (IUE), un IMC ≥ 25 (IUE et IUU), la constipation chronique (IUU et IA), et les antécédents familiaux de TPP.Conclusion : Le trail, par ses contraintes biomécaniques spécifiques, pourrait favoriser l’apparition ou l’aggravation des TPP, notamment de l’IUE. Ces résultats soulignent l’importance de sensibiliser les traileuses et de développer des stratégies de prévention adaptées
Improvement of Nanopore sequencing provides access to high quality genomic data for multi-component CRESS-DNA plant viruses
No full textInternational audienceBackground Faced with the recrudescence of viral CRESS-DNA plant diseases, the availability of efficient and costeffective tools for routine diagnosis and genomic characterisation is vital. As these viruses possess circular singlestrand DNA genomes, they have been routinely characterised using rolling circle amplification (RCA) coupled with Sanger sequencing. However, while providing the basis of our knowledge of the diverse CRESS-DNA viruses, this approach is laboratory-intensive, time-consuming and ultimately ineffective faced with co-infection or viruses with multiple genomic components, two common characteristics of these viruses. Whereas alternatives have proved effective in some applications, there is a strong need for next-generation sequencing methods suitable for small-scale projects that can routinely produce high quality sequences comparable to the gold standard Sanger sequencing. ResultsHere, we present an RCA sequencing diagnostic technique using the latest Oxford Nanopore Technology flongle flow cells. Originally, using the tandem-repeat nature of RCA products, we were able to improve the quality of each viral read and assemble high-quality genomic components. The effectiveness of the method was demonstrated on two plant samples, one infected with the bipartite begomovirus African cassava mosaic virus (ACMV) and the other infected with the nanovirus faba bean necrotic stunt virus (FBNSV), a virus with eight genomic segments. This method allow us to recover all genomic components of both viruses. The assembled genomes of ACMV and FBNSV shared 100% nucleotide identity with those obtained with Sanger sequencing. Additionally, our experiments demonstrated that for similar-sized components, the number of reads was proportional to the segment frequencies measured using qPCR. ConclusionIn this study, we demonstrated an accessible and effective Nanopore-based method for high-quality genomic characterisation of CRESS-DNA viruses, comparable to Sanger sequencing. Face with of increasing challenges posed by viral CRESS-DNA plant diseases, integrating this approach into routine workflows could pave the way for more proactive responses to viral epidemics.</div