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Data used for the quantification by meta-analysis of the effect of reducing dietary crude protein in broiler chickens on nitrogen flows and litter characteristics
No full textCe jeu de données contient les données utilisées pour la réalisation d'une méta-analyse pour quantifier l'effet de la réduction de la teneur en protéines dans l'alimentation des poulets de chair sur le bilan azoté et les caractéristiques de la litière.
Cette méta-analyse est publié par de Rauglaudre et al. 2025 dans Animal - Open Space (https://doi.org/10.1016/j.anopes.2025.100104).This dataset contains the data used for the quantification by meta-analysis of the effect of reducing dietary crude protein content in broilers on nitrogen balance and litter characteristics.
This meta-analysis is published by de Rauglaudre et al. 2025 in Animal - Open Space (https://doi.org/10.1016/j.anopes.2025.100104)
Base de données COMBHERPIC
No full textCette collection comprend 3 bases de données :
- base des traits adventices
- base des traits des cultures
- base des traits des couverts et plantes compagnes
Ces bases de données permettent de renseigner avec plus de précision les variables d'entrée du DAG COMBHERPIC liées aux adventices ou au pouvoir couvrant des cultures ou des couverts présents dans le système
Replication data for the article: "Humans can categorise horse emotionally negative but not positive facial expressions" (Phelipon et al.)
No full textThis dataset includes all data and R code to reproduce the analyses and graphics presented in the article "Humans can categorise horse emotionally negative but not positive facial expressions". Phelipon, R., Lefort, G., Galland, O., Piégu, B., Hennes, N., Briefer, E., Lansade, L
Indicateurs des changements par niveaux de réchauffement TRACC issus des projections hydrologiques Explore2 pour le modèle MORDOR-SD (référence 1976-2005)
No full textIndicateurs des changements par niveaux de réchauffement TRACC issus des débits journaliers simulés par le modèle hydrologique MORDOR-SD pour l'ensemble des projections climatiques Explore2 sous RCP 8.5. Ces fichiers résultent de l'agrégation temporelle des simulations hydrologiques sous runs historiques (avant 2005) et des projections hydrologiques (post 2005), fichiers NetCDF disponibles au téléchargement dans la collection Explore2 - Projections hydrologiques.
Ce dépôt regroupe un tableau par indicateur, niveau de réchauffement et chaîne de simulation, c'est-à-dire, couple GCM/RCM et modèle hydrologique HM. Ces données sont brutes et contiennent donc des chaînes de projections jugées aberrantes / horsains qu'il est possible de filtrer grâce à des métadonnées supplémentaires. Pour des raisons techniques, ces indicateurs sont regroupés par dossiers compressés selon les différentes phases du régime hydrologique.
La description des chaines de modélisation du climat et celle des modèles hydrologiques sont, respectivement, disponibles dans le rapport https://doi.org/10.57745/PUR7ML et dans les annexes du rapport https://doi.org/10.57745/S6PQXD. Retrouvez le diagnostic des modèles hydrologiques résumé à l'échelle des régions hydrologiques dans les fiches téléchargeables ici : https://doi.org/10.57745/DMFUXW.
Définition des narratifs hydrologiques : L'ensemble des descriptions des narratifs hydrologiques définis dans le cadre de la TRACC par niveaux de réchauffement et secteurs hydrographiques est défini ici : https://doi.org/10.57745/KAHIWJ.
Métadonnées supplémentaires : Récapitulatif de l'ensemble des indicateurs hydrologiques : https://doi.org/10.57745/JVNHQL Récapitulatif de l'ensemble des chaînes de simulation : https://doi.org/10.57745/R6HG5X Description de l'ensemble des points de simulation : https://doi.org/10.57745/UTKWR5 Liste des chaînes de modélisation jugées aberrantes / horsains : https://doi.org/10.57745/YZNENQ Récapitulatif des années pivots utilisées pour la TRACC : https://doi.org/10.57745/DCOQM6
Décomposition des chaînes de caractères formant le nom des fichiers parquet, séparées par des "_" : {1} Indicateur : Le nom de l’indicateur, du type de statistique calculée {2} Échantillonnage : Échantillonnage temporel sur laquelle est calculé l’indicateur → {1}_{2} Variable : Variable résultante d'un indicateur temporellement contextualisé {3} RWL : Niveau de réchauffement TRACC (RWL-(20|27|40)) → {1}_{2}_{3} Changement : Changement d'une variable pour un niveau de réchauffement TRACC par rapport à une période de référence, défini dans le récapitulatif des indicateurs hydrologiques {4} EXP : Identifiant de l’expérience historique (post 2005) ou future (post 2005) {5} GCM : Identifiant du GCM forçeur {6} RCM : Identifiant du RCM {7} BC : Identifiant de la méthode de correction de biais statistique {8} HM : Identifiant du modèle hydrologique {9} Référence : Période de référence (ref-YYYYMMDD-YYYYMMDD)
Les colonnes des fichiers parquet sont : EXP : Voir ci-dessus GCM : Voir ci-dessus RCM : Voir ci-dessus BC : Voir ci-dessus HM : Voir ci-dessus code : Code à 10 caractères du point de simulation fourni dans la description des points de simulation *Changement* : Voir ci-dessus
Retrouvez des scripts d'aide pour utiliser ces données parquet
PASHA (PedAgogic StocHastic data Assimilation)
No full textThe global structure of the package is mainly composed of a model
class which implements the model and a DAscheme
class which implements the data assimilation method that is used. The
model class is composed of a set of methods allowing to initialize
the model, to propagate it on one or several consecutive time steps
and to update the initial conditions and/or the parameters for the
next assimilation cycle. The DAscheme class allows to drive the whole
assimilation experiment by performing alternating prediction and
analysis steps. Different variants of the Kalman filter are
integrated in the form of classes inheriting from DAscheme:
EnKF (two integrated variants:
Ensemble Transform Kalman Filter (Bishop et al. 2001) and stochastic
version of EnKF as proposed in Burgers et al. 1998),
ES
ES-MDA
iEnKS
For each of them, the analysis and DAfull methods are redefined
according to the strategy used for the analysis and according to the
type of assimilation considered (filter or fixed point smoother or
fixed interval smoother with fixed interval). No numerical
optimization has been done and the algorithms have been kept as
compact and transparent as possible, which allows a better overview
of the mathematical theory they implement. Moreover, an ObsInfo
class allows to provide all the information related to the
observations (values, frequency, observation operator, error
covariance matrix,) and a Trajectory class allows to
extract some values from the state vector to constitute temporal
trajectories. The ObsInfo and Trajectory classes also include a set
of methods facilitating the visualization of the temporal evolution
of the set of observations and their errors. Finally, the PerfStudy
class allows to compute a set of of metrics allowing to evaluate the
quality of the assimilation results in relation to a reference
trajectory (bias, RMSE, dispersion, CRPS)
ECL5-CATANA-DATASET-1-2025
No full textThe dataset contains experimental data from the first experiments with the UHBR fan open test case ECL5, that was investigated in the European Project CATANA. Within this project, the open-test-case fan stage ECL5 was designed with the objective of high efficiency and operability to achieve a geometry representative for near future civil aircraft propulsion designs. The dataset comprises aerodynamic and aeroelastic measurements to validate numerical simulations. Furthermore, structural modeshapes derived from FEM simulations are provided
Fiches de synthèse des inondations issues de la base de données BDHI
No full textLa Base de données historiques sur les inondations (BDHI) a été constituée et alimentée entre 2015 et 2023 dans le but de documenter, lorsque c'était possible, les principales inondations ayant causé des dommages significatifs sur le territoire hexagonal et ultra-marin, depuis le Moyen Âge jusqu’à la période contemporaine.
Les événements recensés, sélectionnés en fonction de la gravité de leurs impacts, couvrent différents types d'inondation : débordements de cours d'eau, ruissellements, remontées de nappe, submersions marines, etc. Pour chaque événement, la base rassemble des documents contenant des données sur les phénomènes physiques, ainsi que des informations sur les impacts humains, socio-économiques, environnementaux et culturels. Elle peut inclure également des descriptions de la gestion de la crise et des suites de l’événement.
La BDHI n’est plus maintenue et elle n'est accessible qu'aux agents de l'Etat .Ce jeu de données est constitué de 222 fiches de synthèse extraites de la BDHI, qui fournit un descriptif de 222 événements d'inondation de 1770 à 2018. La base BDHI contient les informations sur les documents qui ont été utilisés pour produire les fiches de synthèse
données pour Characterisation of phenolic compounds and polysaccharides in strawberry: Cultivar and harvest effects and their correlation with nectar colour stability
No full textThis data set contains the phenolic compounds and cell wall content and composition and color data used to produce the paper "Characterisation of phenolic compounds and polysaccharides in strawberry: Cultivar and harvest effects and their correlation with nectar colour stability" as a part of the HiStabJuice Project
Jeu de donnée pour les tables supplementaire "Diminution des teneurs en pesticides et métaux lourds des vins par traitement microbiologiques : rôle des interactions entre les levures non-Saccharomyces et ces xénobiotiques" - Data set for supplementary tables "Reduction of pesticide and heavy metal levels in wines through microbiological treatment: role of interactions between non-Saccharomyces yeasts and these xenobiotics"
No full textTables de données complémentaires aux manuscrit de thèse de Tristan JACQUI (2025).
Supplementary data tables for Tristan JACQUI's thesis manuscript (2025)
Replication Data for: Diversity of soil bacterial communities in response to fonio genotypes and pedoclimatic conditions in Benin
No full textThis dataset comprises environmental DNA (eDNA) sequences obtained from the rhizosphere of Digitaria exilis (fonio), a cereal crop cultivated in West Africa. The sequencing effort was conducted as part of a doctoral study aimed at characterising bacterial community structures associated with fonio rhizosphere across contrasting pedoclimatic conditions. DNA was extracted from rhizosphere soil samples and subjected to 16S rRNA gene amplicon sequencing, targeting the V4–V5 regions. Library preparation followed standard protocols for Illumina paired-end sequencing and was performed by Genoscreen Innovative Genomics. For each sample, two FASTQ files were generated (R1 and R2), corresponding to forward and reverse reads; the reads did not contain the primer sequences. These raw reads can be used for downstream microbial diversity and composition analyses (e.g., taxonomic assignment, alpha/beta diversity, community profiling).Ce jeu de données comprend des séquences d’ADN environnemental obtenues à partir de la rhizosphère de Digitaria exilis (fonio), une céréale cultivée en Afrique de l’Ouest. Le séquençage a été réalisé dans le cadre d’une étude doctorale visant à caractériser la structure des communautés bactériennes associées à la rhizosphère du fonio dans des conditions pédoclimatiques contrastées. L’ADN a été extrait de sols prélevés dans la rhizosphère, puis soumis à un séquençage ciblé du gène de l’ARNr 16S, en ciblant les régions V4–V5. La préparation des librairies a suivi les protocoles standards pour le séquençage Illumina en lectures appariées (paired-end) et a été réalisée par Genoscreen Innovative Genomics. Pour chaque échantillon, deux fichiers FASTQ ont été générés (R1 et R2), correspondant respectivement aux lectures avant et arrière ; les séquences obtenues ne contiennent pas les amorces. Ces lectures brutes peuvent être utilisées pour des analyses ultérieures de diversité et de composition microbienne (par exemple, assignation taxonomique, diversité alpha/bêta, profilage des communautés)