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Book reviews: A dialogical reviewing process
No full textAs part of a theoretical and friendly dialogue that we have developed over the years (Marková et al., 2020, 2022; Zittoun, 2017), we both realised that our newly published books appeared almost simultaneously at the same publisher (Marková, 2023; Zittoun, 2024). To pursue this dialogue, we proposed to review each other’s book, and we then had a dialogue on these two reviews. The present “dialogical review” has thus three parts: the first part presents some of the points emerging from our dialogue; the second part is the review of Ivana Marková’s The making of a dialogical theory. Social representations and communication (2023) by Tania Zittoun; and the third is the review of Tania Zittoun’s Pleasure of thinking (2024) by of Ivana Marková
Characterization of domesticated clove ("Syzygium aromaticum") and comparison with related species
No full textThesis committee
Dr. Nicolas Sierro (Thesis supervisor) – Philip Morris International Research & Development
Dr. Nikolai V. Ivanov (Thesis co-director) – Philip Morris International Research &
Development, University of Neuchâtel
Prof. Felix Kessler (Thesis co-director) – University of Neuchâtel
Dr. Gaétan Glauser (Internal expert) – University of Neuchâtel
Prof. Lukas Mueller (External expert) –Boyce Thompson Institute, USA
November 2023
No de thèse : 3080Le giroflier, Syzygium aromaticum, est un arbre à épices appartenant à la famille des Myrtacées. Les boutons floraux encore fermés et séchés (clous de girofle), l'huile essentielle et l'oléorésine produits à partir du giroflier sont riche en eugénol et utilisés commercialement dans un large éventail d'industries. Malgré son importance économique et le potentiel thérapeutique prometteur de l'eugénol, peu de données omiques étaient disponibles pour la recherche fondamentale et appliquée sur le giroflier. Un génome de référence est un outil important pour l'avancement de la recherche en biologie végétale et des programmes d'amélioration des cultures. Dans le cadre de cette thèse, le génome du giroflier a été séquencé, et assemblé à l'échelle chromosomique, puis analysé en utilisant des approches de génomique comparative et multi-omiques dans le but d’étudier l'évolution du génome du giroflier et la base génétique de la biosynthèse de l'eugénol. Les assemblages des génomes de Syzygium malaccense (430 Mb), Syzygium aqueum (392 Mb), Syzygium jambos (426 Mb), et Syzygium syzygioides (431 Mb) ont également été construits pour être comparés aux génomes du giroflier (370 Mb), de Syzygium grande (405 Mb) ainsi qu’au génome d’une autre espèce de Myrtacées, Eucalyptus grandis (690 Mb), afin d'acquérir de nouvelles connaissances sur l'évolution des génomes des espèces de Syzygium. En analysant l'assemblage du génome du giroflier et en intégrant les données transcriptomiques et métabolomiques produites à partir des feuilles et des bourgeons floraux, les principales familles de gènes impliquées dans la biosynthèse des précurseurs de la lignine et des phénylpropènes volatils (eugénol, isoeugénol, chavicol) ont été identifiées ainsi que les gènes potentiellement impliqués dans la biosynthèse de l'eugénol. Sur la base de cette étude multiomiques, nous avons émis l'hypothèse que l'acétate d'eugénol pourrait jouer un rôle clé dans la forte accumulation d'eugénol dans les feuilles et les bourgeons floraux du giroflier. En outre, un nombre inférieur de gènes codant pour une possible eugénol synthase — une enzyme clé dans la biosynthèse de l'eugénol — ont été identifiés dans les génomes des 4 espèces de Syzygium nouvellement assemblés (1 à 3) que dans le génome du giroflier (15), suggérant que cette variation du nombre de copie peut être impliquée dans la teneur élevée en eugénol des organes de ce dernier. Les analyses de synténie ont révélé une bonne conservation de l'organisation chromosomique des 6 espèces de Syzygium étudiées et des réarrangements intrachromosomiques sur 7 des 11 chromosomes entre les espèces de Syzygium et E. grandis. Ces nouveaux génomes de Syzygium sont une contribution précieuse aux ressources génomiques de la famille des Myrtacées, et en particulier pour le genre Syzygium, le plus riche en espèces d’arbre au monde. De plus, la disponibilité d’un génome de référence pour le giroflier ouvre de nouvelles perpectives pour la recherche appliquée visant à optimiser la productivité des girofliers.
ABSTRACT
Clove, Syzygium aromaticum, is a valuable spice crop tree belonging to the Myrtaceae family. Its dried, unopened flower buds, essential oil, and oleoresin-rich in eugenol, are used commercially in a broad range of industries. Despite its economic importance and the promising therapeutic potential of eugenol, little -omics information was available for fundamental and applied research on clove. A reference genome is an important tool for the advancement of plant biology research and crop improvement programs. In this thesis, the clove genome was sequenced, assembled at the chromosome level and subsequently analysed using comparative genomics and multi-omics approaches to investigate clove genome evolution and the genetic basis of eugenol biosynthesis. In addition, the genome assemblies of Syzygium malaccense (430 Mb), Syzygium aqueum (392 Mb), Syzygium jambos (426 Mb), and Syzygium syzygioides (431 Mb) were constructed and compared to the genome assemblies of clove (370 Mb), Syzygium grande (405 Mb) and their Myrtaceae relative Eucalyptus grandis (690 Mb) to provide further genomic insights into the evolution of Syzygium genomes. By analysing the clove genome assembly and sets of transcriptomic and metabolomic data from leaves and buds, the key gene families involved in the biosynthesis of the precursor of lignin and phenylpropene volatiles (eugenol, isoeugenol, chavicol) were identified as well as genes possibly involved in the biosynthesis of eugenol. On the basis of this multi -omics study, we hypothesized that eugenol acetate may play a key role in the high accumulation of eugenol in clove leaves and buds. Fewer genes were found in the newly assembled Syzygium genomes (1 to 3) than in clove (15) to encode for putative eugenol synthase—a key enzyme in the eugenol biosynthetic pathway—suggesting that this copy number variation may be involved in the high content in eugenol of clove. Synteny analyses revealed a high conservation of the chromosomal organization of the 6 Syzygium species studied and intrachromosomal rearrangements on 7 of the 11 chromosomes, between the Syzygium species and E. grandis. This new set of Syzygium genomes is a valuable contribution to genomics resources for the Myrtaceae family, and especially to the Syzygium genus, the world’s most species-rich tree genus. Moreover, the availability of the clove reference genome opens new perspectives for applied research aiming to optimize clove production
A pique en mar de sirenas: fraude y peligro en la estructura metafórica de De cosario a cosario, de Lope de Vega
No full textThis article analyzes the metaphorical structure of Lope de Vega’s De cosario a cosario focusing on two recurrent semantic fields: the field of sailing and the one related to “picar” (‘to bite’, ‘to incite’). After a brief review of criticism on De cosario a cosario, we examine both the quantitative weight and the logic and derivations of the two metaphors in question, which will lead us to elucidate the play’s hidden structure and some of Lope’s literary habits.tru
The Intimate and Everyday Geopolitics of the Russian War Against Ukraine
Get PDFThe contributions in this Forum analyse the Russian war against Ukraine from the micro perspective of everyday life, conveyed by scholars who have been impacted at a variety of personal levels. Framed within the existential threat that continues to endanger Ukrainians and Ukraine, the contributions collected here embrace the messiness of lived experience away from the grand narratives that circulate at global scales. Instead, the authors explore a variety of processes of situated bordering that fracture not just territory, but also families and individual lives. In so doing, they shine light on the people and places where geopolitics takes shape on the ground. Taken together, this collection provides a nuanced and human-scale exploration of one of the most momentous geopolitical events in recent history
Le congé abusif est-il dorénavant réservé à des «situations très graves» (krasse Fälle) ? : commentaire de l’arrêt du Tribunal fédéral 4A_396/2022 du 7 novembre 2023
No full textRésumé et commentaire, Tribunal fédéral – 4A_396/2022, destiné à la publication, Ire Cour de droit civil, Arrêt du 7 novembre 2023 (f
Designing digital choice architecture : studies on the behavioral and attitudinal impact of digital nudges
No full textCette thèse explore l'espace de conception des nudges numériques et leurs effets sur les utilisateurs dans trois domaines d'application : la vie privée en ligne, l'utilisation des médias sociaux et les dons de charité en ligne. Après le chapitre d'introduction, une revue systématique de la littérature liée aux études empiriques sur les nudges numériques est menée, révélant le paysage actuel de la recherche. Ensuite, une expérience en ligne et une étude descriptive sur le terrain sont utilisées pour démontrer l'efficacité des nudges numériques dans la sensibilisation à la protection de la vie privée en ligne pour les utilisateurs de certaines plateformes digitales. Le chapitre suivant utilise une expérience de terrain, menée en ligne, pour modifier l'architecture des choix numériques d'une plateforme de médias sociaux populaire. Cette étude évalue les régimes restreints des fils d'actualité et leur impact sur les comportements et les expériences des utilisateurs. Le cinquième chapitre est une expérience factorielle en ligne concernant les dons de charité avec des enjeux monétaires réels. Cette dernière étude examine systématiquement les combinaisons de plusieurs nudges numériques sur les comportements de don en ligne des utilisateurs et leurs attitudes associées en matière de manipulation et d'autonomie. La thèse présente plusieurs contributions liées aux nudges numériques et à l'architecture de choix. L'examen systématique met en lumière plusieurs pistes de recherche ouvertes pour le domaine qui appellent à des recherches futures. L'expérimentation liée à la confidentialité en ligne montre que les nudges numériques pourraient améliorer les interactions des utilisateurs avec les conditions et les politiques de confidentialité, sans toutefois renforcer leur mémorisation de ce qu'ils ont accepté. L'expérience sur le terrain concernant les régimes des fils d'actualité des médias sociaux démontre leur impact sur le temps passé sur la plateforme de médias sociaux, mais ces interventions de conception s'accompagnent d'expériences positives et négatives pour l'utilisateur. L'expérience factorielle en ligne relative aux dons de charité révèle que certaines combinaisons de nudges numériques augmentent les dons, mais ces nudges suscitent également des inquiétudes chez les utilisateurs quant aux menaces pesant sur leur autonomie et leur sentiment de manipulation. Ensemble, les chapitres de la thèse mettent en évidence l'impact complexe des nudges numériques sur le comportement et les attitudes dans plusieurs domaines d'application pertinents.
ABSTRACT:
This dissertation explores the design space of digital nudges and their effects on users in three application domains: online privacy, social media usage, and online charitable giving. After the introductory chapter, a systematic review of empirical studies on digital nudging is conducted, uncovering the current research landscape. Next, an online experiment and a descriptive field study is used to demonstrate the effectiveness of digital nudges for enhancing the online privacy awareness of users for popular online services. The next chapter uses an online field experiment to alter the digital choice architecture of a popular social media platform. This study evaluates restricted newsfeed diets and their impact on user behaviors and experiences. The fifth chapter is an online factorial experiment concerning charitable giving with real monetary stakes. This last study systematically investigates combinations of several digital nudges on users' online donation behaviors and their associated attitudes around manipulation and autonomy. The dissertation extends several contributions related to digital nudging and choice architecture. The systematic review illuminates several open research avenues for the domain at large that call for future research. The experiment related to online privacy awareness shows that digital nudges could elevate user interactions with terms and privacy policies, although without bolstering users' recollections of what they have agreed to. The field experiment concerning social media newsfeed diets demonstrates their impact regarding time spent on the social media platform, but these design interventions come with both positive and negative user experiences. The online factorial experiment related to charitable giving reveals that some combinations of digital nudges increase donations, but these particular nudges also invoke users' concerns about autonomy threats and an experienced sense of manipulation. Together, the chapters of the dissertation highlight the complex behavioral and attitudinal impact of digital nudges across several relevant application domains
Combining planting trees and natural regeneration promotes long-term structural complexity in oil palm landscapes
Get PDFVegetation structural complexity has been identified as a vital factor for forest ecosystem function, stability, and resilience. However, agricultural land with much reduced structural complexity has largely replaced natural forests in the tropics. Therefore, restoring structural complexity in large-scale plantation monocultures by introducing agroforestry systems may counteract the loss of biodiversity and ecosystem functions. However, we still have limited knowledge of how the structural complexity of agroforests develops under different restoration treatments. We established a large-scale biodiversity enrichment experiment in a conventional monoculture oil palm plantation in Sumatra, Indonesia. In this experiment, agroforests were implemented by planting clusters of native trees (“tree islands”) within the oil palm plantation, systematically varying initially planted tree richness ranging from 0–6 (0 corresponding to natural regeneration only) and plot area (25–1600 m2). We tested the effect of the experimental treatments on nine years of the development of local structural complexity using a stand structural complexity index (SSCI) derived from terrestrial laser scanning. We found that tree planting and natural regeneration treatments promoted structural complexity by creating denser and more complex vegetation structures. Plots with a tree planting treatment tended to show greater structural complexity than plots with natural regeneration only. However, during the study period, oil palms still dominated heights, and the temporal change in structural complexity among plots with or without a tree planting treatment did not differ. As for plot area, our results indicate that structural complexity looking from the center of plots did not necessarily depend on the area during the study period, and even small tree islands can increase local structural complexity in a monoculture oil palm plantation. Initially planted tree richness did not significantly affect the development of structural complexity. Nine years after establishment, not planted trees but regenerated woody plants strongly positively affected vegetation density and structural complexity. Our findings highlight that sustaining vegetation density below oil palm canopies is a key strategy to increase the structural complexity of oil palm landscapes
Hybridization load introduced by Alpine ibex hybrid swarms
No full textSpecies restoration efforts can be threatened by the accumulation of deleterious mutations and inbreeding depression associated with the historic population contraction. However, even successfully restored species could face deleterious mutation swamping from hybridization with an abundant and closely related species. Here, we analyze this risk for Alpine ibex (Capra ibex), a flagship species of large mammal restoration in the Alps. The Alpine ibex faced near-extinction two centuries ago, resulting in exceptionally low genome-wide diversity and increased inbreeding, which facilitated the purging of severe deleterious mutation load. For this, we produced a highly contiguous chromosome-level genome assembly of the Alpine ibex capturing structural divergence from domestic goat (Capra hircus) and mapping immune-relevant MHC genes. Analyses of eight recent ibex-goat hybrids from two swarms in Northern Italy, combined with 29 non-hybrid Alpine ibex and 22 domestic goats, identified 215 masked loss-of-function (LOF) mutations introduced via hybridization. Yet, we found no evidence for counter-selection in early backcrosses. This exposes Alpine ibex to further backcrosses compounding the deleterious mutation load of the species by a factor of up to two. Our work provides one of the first direct estimates of hybridization load and guides conservation efforts to preserve endangered species gene pools
Adaptation du loyer à l’expiration de la période d’indexation : point de référence temporel pour déterminer l’évolution du taux hypothécaire
Get PDFRésumée et analyse, Tribunal fédéral – 4A_252/2023, destiné à la publication, Ire Cour de droit civil, Arrêt du 24 octobre 202
