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Use of reference markers in the speech of people with schizophrenia spectrum disorders: Evidence from two referential communication tasks manipulating common ground with the interaction partner
Get PDFIntroduction: People with schizophrenia spectrum disorders present with language dysfunctions, yet we know little about their use of reference markers (indefinite markers, definite markers, pronouns or names), a fundamental aspect of efficient speech production.
Methods: Twenty-five (25) participants with a recent-onset schizophrenia spectrum disorder (SZ) and 25 healthy controls (HC) completed two referential communication tasks. The tasks involved presenting to an interaction partner a series of movie characters (character identification task) and movie scenes composed of six images (narration task). A manipulation was introduced such that half of the movies could be considered as Likely-Known by the interaction partner, whereas the other half was Likely-Unknown. The analyses focused on the reference markers used to present the movie characters during the tasks.
Results: During the character identification task, the SZ group used fewer names and more pronouns than the HC. During the narration task, the SZ group used fewer names and more definite references when initially introducing
the main story characters, while no group effect emerged for subsequent mentions of the characters. The observed effects of conditions were generally present across both groups, except for a lesser adjustment in the use
of definite markers when introducing the story characters.
Conclusions: While some group differences emerged, people with SZ were generally sensitive to the manipulation regarding their interaction partner's likely knowledge of the characters. A better understanding of the conditions in which speech production is affected in SZ could help promote more efficient communication.tru
Seeing Through the Fog: The Ability to Resolve Ambiguity Reduces Dishonesty
Get PDF Ambiguity acts as a veil that can help conceal and justify dishonest behavior. While an individual’s ability to disambiguate information in a task may help remove the veil of ambiguity and thus promote honesty, the relationship between ambiguity, ability, and dishonesty is currently unexplored. To investigate this, we employed an experimental design where participants attempted to resolve an ambiguous task and reported their performance. Results showed that ambiguity and dishonesty increase in unison. Importantly, the participants who resolved ambiguity acted less dishonestly (Study 1). In Studies 2a, 2b, and 3, we increased participants’ ability by briefly training them to disambiguate the information presented in the task. The results showed that participants acted less dishonestly when their ability levels were increased. Overall, the findings indicate that dishonesty can be reduced not only by making tasks less ambiguous but also by enhancing an individual’s ability to successfully resolve ambiguity. </jats:p
Le calcul de l’assiette et la clef de répartition lors de la détermination de la part à l’excédent de l’enfant : analyse de l’arrêt du Tribunal fédéral 5A_384/2024
No full textRésumé et analyse, Tribunal fédéral – 5A_384/2024, IIe Cour de droit civil, Arrêt du 10 septembre 2025 (f
Collaborer face aux défis de la cohabitation humain-loup : le cas du projet OPPAL
No full textUniversité de Neuchâtel, Institut d'ethnologie. Mémoire de master en sciences sociales - pilier anthropologie - Soutenu le 12 décembre 2025Ce mémoire s’intéresse à la cohabitation entre les êtres humains et les loups en Suisse, à travers l’analyse du projet OPPAL. Dans ce projet, éleveurs et bénévoles collaborent malgré des visions et des intérêts parfois divergents : d’une part, ceux qui cherchent à protéger les activités pastorales et à réduire les risques ; d’autre part, ceux qui souhaitent favoriser la présence du loup et la conservation de la biodiversité. L’objectif est de comprendre comment cette collaboration est rendue possible au quotidien et quels mécanismes permettent de dépasser la complexité et les tensions liées à cette thématique.
À travers une approche qualitative fondée sur l’observation participante et des entretiens semi-structurés menés dans quatre alpages, cette recherche analyse le fonctionnement d’OPPAL en tant qu’acteur de la conservation, les visions des acteurs impliqués dans le projet et les mécanismes qui permettent la formation et le maintien d’un réseau stable et fonctionnel de coopération entre des acteurs hétérogènes.
Trois axes principaux guident cette recherche. Le premier concerne les approches de conservation et permet d’examiner le fonctionnement, les objectifs et les principes qui orientent l’action d’OPPAL, visant la conciliation des exigences écologiques et des activités pastorales. Le deuxième explore les différentes relations entre l’être humain et la nature, en approfondissant les multiples représentations du non-humain, du paysage, du sauvage et le rôle attribué à l’humain par rapport à ces dimensions. Le troisième se concentre sur les processus qui rendent possible la collaboration entre des acteurs hétérogènes aux visions et objectifs potentiellement contrastés, en mettant en évidence les mécanismes qui favorisent la construction d’un réseau opérationnel capable de soutenir un travail commun et de dépasser la complexité de la thématique dans laquelle s’inscrit le projet.This thesis examines the coexistence between humans and wolfs in Switzerland through an analysis of the OPPAL project. Within this initiative, livestock farmers and volunteers collaborate despite sometimes divergent visions and interests: on the one hand, those seeking to protect pastoral activities and reduce risks; on the other, those aiming to promote the presence of the wolf and biodiversity conservation. The objective is to understand how this collaboration is made possible in everyday practice and which mechanisms allow actors to overcome the complexity and tensions inherent to this issue.
Using a qualitative approach based on participant observation and semi-structured interviews conducted in four alpine pastures, this research analyses the functioning of OPPAL as a conservation actor, the perspectives of those involved in the project, and the mechanisms that enable the formation and maintenance of a stable and functional network of cooperation among heterogeneous actors.
Three main axes guide this research. The first focuses on conservation approaches and examines the functioning, objectives, and principles guiding OPPAL’s action, aimed at reconciling ecological requirements with pastoral activities. The second explores human–nature relationships by examining representations of the non-human, landscapes, and wilderness, as well as the role attributed to humans in relation to these dimensions. The third axis concentrates on the processes that make collaboration possible among actors with potentially contrasting visions and objectives, highlighting the mechanisms that support the construction of an operational network capable of sustaining collective work and addressing the complexity of the project’s context
Social media and textual data : three empirical studies
No full textDans cette thèse, j'étudie comment les données non structurées et les sources de données alternatives peuvent être utilisées pour répondre à de nouvelles questions et revisiter d'anciens problèmes dans la littérature financière. À mesure que notre monde se numérise, les possibilités de recherche s'élargissent également pour les chercheurs. Les données textuelles sont extrêmement riches, et donc précieuses. Comme les analyses causales ne sont pas toujours possibles, les textes peuvent être analysés pour comprendre pourquoi les entreprises ou les investisseurs entreprennent certaines actions. Bien qu'ils traitent de sujets distincts, les trois chapitres de cette thèse de doctorat partagent cet idéal qui consiste à tirer parti des dernières technologies pour faire avancer la recherche d'un petit pas.Le premier chapitre étudie comment l'attention anormale des investisseurs affecte la section transversale des rendements des crypto-monnaies entre 2018 et 2022. Nous capturons l'attention anormale en utilisant le nombre (log) de messages Twitter sur les crypto-monnaies individuelles le jour en cours moins une moyenne de 30 jours. Nos résultats révèlent que l'attention anormale est positivement associée à la performance contemporaine et à celle à un jour des crypto-monnaies. Parmi les différents tweets, la prévisibilité des rendements est due aux tweets Ticker des investisseurs, mais pas aux tweets du canal des crypto-monnaies. Ces tweets Officiel sont toutefois capables de prévoir les innovations technologiques sur la blockchain.Dans le deuxième chapitre, j'utilise des transcriptions de négociations pour mesurer les efforts déployés par les conseillers lors des négociations privées d'opérations de fusion-acquisition aux États-Unis. Je montre que l'effet moyen des services des conseillers sur les résultats des transactions est bénéfique tant pour la cible que pour l'acquéreur. Une analyse plus approfondie des transcriptions des négociations suggère que les entreprises bénéficient principalement de la capacité de leurs conseillers à négocier de meilleures conditions de fusion. Je montre que les conseillers exploitent les différences de pouvoir de négociation entre les candidats à la fusion. Lorsque les différences de pouvoir de négociation sont plus importantes, l'effet des conseillers est plus marqué et leur stratégie de négociation devient plus agressive. Le troisième chapitre montre que les entreprises ont recours aux fusions et acquisitions d'entreprises pour gérer leur exposition à certains risques commerciaux. À partir des informations obligatoires sur les risques divulgués par les entreprises, je constate que celles qui sont de plus en plus exposées aux risques financiers sont plus susceptibles d'être la cible d'un acquéreur potentiel et moins susceptibles d'acquérir une autre entreprise dans les douze mois suivant la date de dépôt du formulaire 10-K. À l'inverse, les entreprises inquiètent de l'incertitude grandissante de leurs futurs cash-flows sont plus susceptibles d'acquérir une autre entreprise. L'analyse des objectifs déclarés de ces fusions confirme que les entreprises fusionnent effectivement pour gérer leur exposition aux risques. Au niveau sectoriel, je montre que les variations dans la similitude entre les déclarations des entreprises permettent de prédire négativement le nombre futur d'opérations de fusion-acquisition annoncées. À mesure que les risques sectoriels se concentrent, les entreprises ont moins d'intérêts à fusionner. Dans l'ensemble, les résultats sont cohérents avec le mécanisme selon lequel les entreprises décident de fusionner en partie pour diversifier et atténuer certains de leurs risques commerciaux.In this thesis, I investigate how unstructured data and alternative data sources can be used to answer new questions and to revisit old problems in the finance literature. As our world becomes increasingly digitalized, the research opportunities available to researchers are widening as well. Textual data is extremely rich and therefore valuable. Since causal analyses are not always possible, texts can be used to understand why companies or investors take certain actions. Despite being on separate topics, the three chapter of this PhD thesis share this ideal to leverage the latest technology to advance research a tiny bit.The first chapter investigates how investors' abnormal attention affects the cross-section of cryptocurrency returns in the period from 2018 to 2022. We capture abnormal attention using the (log) number of Twitter posts on individual cryptocurrencies on the current day minus a 30-day average. Our results reveal that abnormal attention is positively associated with contemporaneous and one-day ahead crypto performance. Among the different Twitter tweets, return predictability arises due to Ticker-tweets from investors, but not due to tweets from the cryptocurrency channel. These Official-tweets, however, are able to forecast technological innovations on the blockchain.In the second chapter, I use negotiation transcripts to capture advisor efforts during the private negotiation of US M&A deals. I show that the average effect of advisor services on deal outcomes is beneficial both for the target and the acquirer. Further sentiment analysis of the negotiation transcripts suggests that firms mainly benefit from the ability of their advisors to negotiate better merger terms. I document that advisors are skilled at identifying differences in negotiation power between the merger candidates. When differences in bargaining power are larger, advisor effects become larger and their negotiation strategy becomes more aggressive.The third chapter show that firms use business combinations to manage their exposure to some of their business risks. Using mandatory corporate risk disclosures, I find that companies with increasing exposure to financial risks are more likely to become the target of a potential acquirer, and become less likely to acquire another company within twelve of the 10-K filing date. In contrast, firms with increasing cash-flow uncertainty are more likely to acquire another firm. Analyses of disclosed deal objectives and merger negotiations confirm that firms are indeed merging to manage their risks exposures. At the industry level, I show that variations in similarity between firms filings predict negatively the future number of M&A deals announced. As industry risks become more concentrated, companies have less incentives to merge. Overall, the results are consistent with the mechanism whereby firms decide to merge in part to mitigate some of their business risks
Los sistemas de los pronombres átonos de tercera persona en la Audiencia de Quito de los siglos XVI-XVIII
Get PDFUniNE, FLSH, Institut de langue et littérature hispaniques, soutenue le 16 juin 2025Cette thèse propose une approche de la description historique du système ou des systèmes de pronoms atones de la troisième personne dans l'Audience de Quito à l’époque coloniale, ainsi que l'analyse des facteurs externes et internes de l'histoire de la langue espagnole qui ont pu influencer son évolution. Ce système ou ces systèmes sont reflétés dans la documentation archivistique sélectionnée, qui se compose de 183 documents de différents types textuels, allant d'un continuum d'une situation communicative plus immédiate à une polarité de distance communicative plus marquée. Une partie du corpus utilisé était éditée à des fins philologiques, et une autre partie restait inédite et consultée dans les archives en ligne (PARES) ou dans l'Archivo General de Indias (AGI) à Séville. Le cadre étudié couvre la première moitié du XVIe siècle jusqu’à la première décennie du XVIIIe siècle.
L'objectif principal de cette thèse doctorale a donc été d'analyser la variation interne du système pronominal atone de troisième personne dans l'Audience royale de Quito. L'étude s'est basée sur la description formelle fournie par des études antérieures, qui font état d'un système majoritairement étymologique, avec quelques cas d'usages référentiels, notamment du léisme masculin au singulier, toutefois, l'analyse des formes référentielles comme faisant partie de l'état de variation au-delà du cas minoritaire n'avait pas été envisagée auparavant. Ainsi, les objectifs spécifiques étaient de déterminer la variation des clitiques dans le corpus étudié, ainsi que d'analyser la possibilité d'attribuer un système différencié de clitiques à différents niveaux diastratiques et diaphasiques, et de vérifier s'il sést produit une restructuration patrimoniale, selon les principes exposés par Rivarola (2001).
Après cette analyse et le croisement avec les différentes variables indépendantes ou facteurs linguistiques, sociaux et textuels, une série de résultats ont pu être obtenus pour chaque période analysée. De cette manière, une approche fidèle du comportement des clitiques et de leur variation formelle, ainsi que la chronologie de celle-ci, a pu être établie. Il a également été possible de retracer la coexistence de différents usages des clitiques, et il offre une nouvelle version sur les pronoms atones de la troisième personne dans l’espagnol en Amérique, une réalité plus complexe que ce qui est connu jusqu’à présent.This thesis offers an approach to the historical description of the system or systems of third-person unstressed pronouns in the Royal Audience of Quito, as well as the analysis of external and internal factors in the history of the Spanish language that may have interfered with its evolution. This system or systems are reflected in the selected archival documentation, which consists of 183 documents of various textual types, ranging from a continuum of a more immediate communicative situation to a polarity with greater communicative distance. Part of the corpora was edited for philological purposes, while other part remained unpublished and was consulted in online archives (PARES) or at the Archivo General de Indias (AGI) in Seville.
The studied framework spans from the first half of the 16th century to the first decade of the 18th century.
The main objective of this doctoral thesis, therefore, has been to analyze the internal variation of the third-person unstressed pronominal system in the Royal Audience of Quito. It is based on the formal description provided in previous studies, which report a predominantly etymological system, with some cases of referential uses, particularly masculine leísmo in the singular form. However, the analysis of referential forms as part of the variation state beyond the minority cases had not been considered before. Thus, the specific objectives are to determine the variation of clitics in the studied corpus, as well as to analyze the possibility of assigning a differentiated clitic system to different diastratic and diaphasic strata, and to verify whether there was any patrimonial restructuring, according to the principles outlined by Rivarola (2001).
After this analysis and cross-referencing with various independent variables or linguistic, social, and textual factors, a series of results have been obtained for each analyzed period. This way, a reliable approach to the behavior of clitics and their formal variation, as
well as their chronology, has been established. Futhermore, it has also been possible to trace the coexistence of different uses of clitics and offers a new vision on the third-person unstressed pronouns in American Spanish, a reality that is more complex than whatever has been known until today.Esta tesis ofrece una aproximación a la descripción histórica del sistema o sistemas de pronombres átonos de tercera persona en la Audiencia de Quito virreinal, así como el análisis de factores externos e internos de la historia de la lengua española que han podido interferir en su evolución. Este sistema o sistemas es reflejado en la documentación archivística seleccionada, la cual se compone de 183 documentos de diversos tipos textuales, desde un continuum de una situación comunicativa más inmediata a una polaridad de más distancia comunicativa. Parte del corpus se ha tomado de fuentes editadas para fines filológicos, parte de él era inédito y consultado en los archivos en línea (PARES) o en el Archivo General de Indias (AGI), en Sevilla. El marco estudiado abarca desde la primera mitad del siglo XVI hasta el primer decenio del siglo XVIII.
El objetivo principal de la presente tesis doctoral, por lo tanto, ha sido analizar la variación interna del sistema átono pronominal de tercera persona en la Audiencia de Quito virreinal. Se ha partido de la descripción formal que se han dado en anteriores estudios, en los que se da cuenta de un sistema mayoritariamente etimológico, con algunos casos de usos referenciales, sobre todo, de leísmo masculino de persona singular, pero no se ha barajado con anterioridad el análisis de las formas referenciales como parte del estado de variación más allá de lo minoritario. Así pues, los objetivos específicos son determinar la variación de clíticos en el corpus estudiado, así como analizar la posibilidad de adscribir un sistema diferenciado de clíticos a distintos estratos diastráticos y diafásicos, y comprobar si hubo reestructuración patrimonial, según los principios expuestos por Rivarola (2001).
Tras dicho análisis y cruce con las distintas variables independientes o factores lingüísticos, sociales y textuales, se han podido mostrar una serie de resultados obtenidos en cada periodo analizado. De este modo, se ha podido establecer una aproximación fidedigna del
comportamiento de los clíticos y su variación formal, así como la cronología de esta. Asimismo, se ha podido trazar la convivencia de distintos usos de los clíticos, y se ofrece una nueva visión de los pronombres átonos de tercera persona en el español en América, una realidad más compleja de lo que se conoce hasta ahora
How ecology shapes brain and behaviour in wrasses
No full textExamination committee:
Prof. Redouan Bshary, University of Neuchâtel, supervisor
Prof. Klaus Zuberbühler, University of Neuchâtel, internal examiner
Prof. Carel P. van Schaïk, University of Zurich, external examiner
Defended the 19th of December, 2024
No de thèse : 3163Les animaux doivent continuellement interagir avec leur environnement, ajustant leurs comportements en réponse aux pressions écologiques. Au coeur de cette capacité d’adaptation réside la cognition - définie comme l’aptitude d’un animal à acquérir et traiter de l’information ainsi qu’à agir en fonction de celle-ci -, laquelle régit les interactions entre les organismes et leur environnement. La cognition est profondément ancrée dans le cerveau, et dévoiler les relations complexes entre les facteurs écologiques, la cognition et les paramètres cérébraux demeure une quête fondamentale en biologie. Traditionnellement, les études portant sur ces relations s’appuient sur un cadre comparatif.
Récemment, cependant, cette approche a été critiquée en raison des différences dans la composition du cerveau selon les espèces et des rôles nuancés que jouent des composants cérébraux spécifiques dans la cognition. Par exemple, des paramètres tels que le nombre de neurones ou les ratios non-neurones / neurones qui pourraient expliquer les capacités cognitives ne sont pas reflétés uniquement par la taille du cerveau et ne peuvent pas être déduits en fonction de la taille du cerveau d’une espèce à l’autre. Pour résoudre ces complexités, une approche « bottom-up » a été proposée, se concentrant sur la variation individuelle au sein des espèces et utilisant des tâches cognitives en concordance avec l’écologie unique de l’espèce. Cette approche fournit des informations complémentaires sur la manière dont les pressions écologiques, les capacités cognitives et la composition cérébrale interagissent, offrant ainsi une compréhension plus complète de ces dynamiques.
Dans cette optique, cette thèse explore différentes facettes de la relation entre l’écologie, la cognition et les complexités cérébrales chez les poissons labres. Plus précisément, il se concentre sur le labre nettoyeur Labroides dimidiatus, une espèce connue pour s'engager dans des interactions de nettoyage mutualistes et qui présente des variations de comportement et de morphologie cérébrale au sein de populations basées sur des écologies différentes.
Cependant, comme la complexité de l'habitat et les densités interspécifiques et intraspécifiques varient chez les labres nettoyeurs, il est difficile de démêler les effets relatifs de chaque facteur sur la morphologie cérébrale ou le comportement. Pour répondre à ce problème, j'examine dans le premier chapitre comment les facteurs sociaux et environnementaux influencent la morphologie cérébrale chez le poisson des récifs coralliens Coris batuensis, une espèce de labre dont les densités de population inter- et intraspécifiques et l'habitat ne sont pas interdépendants, permettant une évaluation plus claire de l'impact écologique sur la morphologie cérébrale entre les sous-groupes d'une population, tout en fournissant également un aperçu des facteurs qui influencent la variation cérébrale chez les poissons nettoyeurs. J'ai constaté que les individus issus de sous-groupes à plus forte densité de population présentaient une taille globale de cerveau plus grande, due à un élargissement de toutes les principales régions du cerveau, tandis que la taille du cerveau ne montrait aucune corrélation avec la densité de population interspécifique ou la complexité de l'habitat. Ces résultats soutiennent une version élargie de l'hypothèse du cerveau social, mettant l'accent sur les exigences cognitives des interactions intraspécifiques et l'importance des adaptations du cerveau entier aux défis sociaux.
Dans le chapitre II, je me suis concentrée sur les labres nettoyeurs pour étudier les mécanismes neuronaux à plus petite échelle qui sous-tendent la composition cérébrale et la cognition. Ce chapitre a examiné les relations allométriques entre la masse corporelle, la masse cérébrale et le nombre de cellules neuronales et non neuronales dans les régions du cerveau. Les objectifs étaient triples : clarifier la composition cellulaire et les configurations allométriques dans les cerveaux de labres nettoyeurs et les comparer avec d'autres espèces, évaluer si des traits neuronaux spécifiques expliquent leurs capacités cognitives avancées malgré une taille de cerveau moyenne pour un poisson, et analyser si la taille du cerveau ou de la région crérébrale et le nombre de cellules varient en fonction des pressions écologiques.
Une découverte clé était un rapport non-neurone/neurone remarquablement faible dans le cerveau antérieur, une caractéristique qui peut être liée à la fonction cognitive. De plus, les individus issus de densités de population élevées présentaient des densités neuronales plus élevées dans le cerveau antérieur que ceux provenant de zones à faible densité de population, malgré l'absence de différences dans la masse globale du cerveau ou du cerveau antérieur. Ces résultats soulignent la prédominance potentielle de la composition neuronale par rapport à la taille du cerveau dans la compréhension des performances cognitives et de l’adaptation écologique.
Enfin, au chapitre III, j'intègre le comportement dans l'analyse, en examinant en quoi l’écologie se rapporte au comportement et à l'activité neuronale chez les labres nettoyeurs. Bien que le contexte écologique ne permette pas de prédire la performance dans une tâche de gestion de la réputation, les schémas d'activité neuronale variaient en fonction de la performance. Une activité accrue du télencéphale correspondait à des performances plus élevées, tandis que le mésencéphale présentait des schémas d'activité opposés, soulignant l'importance d'examiner l'activité neuronale car elle peut révéler des mécanismes qui ne sont pas visibles par l’observation de la morphologie seule. En outre, le lien entre activité et performance s'étendait au-delà des régions cérébrales traditionnellement associées aux fonctions cognitives « supérieures », soulignant l'importance d'étudier l'activité dans l'ensemble du cerveau.
Pris ensemble, ces résultats révèlent une relation complexe et non linéaire entre l’écologie, les composants neuronaux et la cognition. Même si le lien entre les pressions écologiques et la complexité cérébrale est constant, ses manifestations varient, remettant en question les hypothèses simplistes. Ce travail souligne l’importance d’adopter un cadre plus large - examinant l’interaction dynamique entre les facteurs écologiques, la cognition et les paramètres cérébraux - pour mieux comprendre les vecteurs multiformes de la cognition.
ABSTRACT
Animals must continuously interact with their environment, adjusting their behaviours in response to ecological pressures. At the core of this adaptive ability is cognition—defined as an animal’s capacity to acquire, process, and act on information—which mediates interactions between organisms and their surroundings. Cognition is ultimately rooted in the brain, and uncovering the intricate relationships between ecological factors, cognition, and brain metrics remains a fundamental pursuit in biology. Traditionally, studies investigating these relationships have relied on a comparative framework.
Recently, however, this approach has faced criticism due to differences in brain composition across species and the nuanced roles that specific brain components play in cognition. For example, metrics like neuron numbers or non-neuron-to-neuron ratios that could explain cognitive abilities are not captured by brain size alone and cannot be inferred based on brain size between species. To address these complexities, a “bottom-up” approach has been proposed, focusing on individual variation within species and using cognitive tasks to align with the species’ unique ecology. This approach provides complementary insights into how ecological pressures, cognitive abilities, and brain composition interact, offering a more complete understanding of these dynamics.
With that in mind, this thesis explores different facets of the relationship between ecology, cognition and brain complexities in wrasse fish. Specifically, it focuses on the cleaner wrasse Labroides dimidiatus, a species known for engaging in mutualistic cleaning interactions and which exhibit variation in both behaviour and brain morphology within populations based on differing ecologies. However, because habitat complexity, interspecific, and intraspecific
densities covary in cleaner wrasses, it is challenging to disentangle the relative effects of each factor on brain morphology or behaviour. To address this, in the first chapter, I examine how social and environmental factors influence brain morphology in the coral reef fish Coris batuensis, a wrasse species whose inter- and intraspecific densities and habitat are not interdependent, allowing for a clearer assessment of how ecological factors impact brain morphology between demes of a population while also providing insights into what factors influencing brain variation in cleaners. I found that individuals from higher population density demes showed larger overall brain sizes, driven by enlargement across all major brain regions, while brain size showed no correlation with interspecific population density or habitat complexity. These findings support an expanded version of the social brain hypothesis, emphasizing the cognitive demands of intraspecific interactions and the significance of whole-brain adaptations to social challenges.
In Chapter II, I shifted focus to cleaner wrasses to investigate the finer-scale neural mechanisms underlying brain composition and cognition. This chapter examined the allometric relationships between body mass, brain mass, and the numbers of neuronal and non-neuronal cells across brain regions. The goals were threefold: to clarify cellular composition and allometric patterns in cleaner wrasse brains and compare them with other species, to explore whether specific neural traits explain their advanced cognitive abilities despite average brain size for a fish, and to assess whether brain or region sizes and cell numbers vary with ecological pressures. A key finding was a remarkably low non-neuronto-neuron ratio in the forebrain, a feature that may be linked to cognitive function. Additionally, individuals from high population densities exhibited higher neuronal densities in the forebrain compared to those from low-density areas, despite no differences in overall brain or forebrain mass. These results underscore the potential importance of neural composition over brain size in understanding cognitive performance and ecological adaptation.
Finally, in Chapter III, I integrate behaviour into the analysis, examining how ecology relates to behaviour and neural activity in cleaner wrasses. While ecological context did not predict performance in a reputation management task, neural activity patterns varied with performance. Increased telencephalon activity corresponded with higher performance, while the mesencephalon showed opposing activity patterns, emphasizing the importance of examining neural activity as it may reveal mechanisms that are not apparent through morphology alone. Furthermore, the link between activity and performance extended beyond brain regions traditionally associated with 'higher' cognitive functions, emphasizing the importance of investigating activity across the entire brain.
Taken together, these findings reveal a complex and non-linear relationship between ecology, neural components, and cognition. While the link between ecological pressures and brain complexity is consistent, its manifestations vary, challenging simplistic assumptions. This work underscores the importance of adopting a broader framework—one that examines the dynamic interplay among ecological factors, cognition, and brain metrics—to better understand the multifaceted drivers of cognition
…when the category ‘migration’ lost its innocence for migration scholars. And what now? A plea for dialogue
Get PDFABA-dependent differential regulation of chloroplast protein import pathways during the seed-to-seedling transition
No full textThesis committee:
Prof. Dr. Felix Kessler (Thesis Director) – University of Neuchâtel
Dr. Shanmugabalaji Ventakasalam (Thesis supervisor) – University of Neuchâtel
Prof. Dr. Josephus Vermeer – University of Neuchâtel
Dr. Barbara Pfister – ETH Zurich
4th July 2025
No de thèse : 3207La biogenèse des chloroplastes définit la transition des proplastides non photosynthétiques vers les chloroplastes photosynthétiquement actifs dans les cellules embryonnaires des graines en germination (“transition de la graine à la plantule”). C'est la clé de la croissance photoautotrophe des plantes. Le chloroplaste a besoin d'environ 2500 protéines codées par le noyau pour fonctionner. Celles-ci sont synthétisées dans le cytoplasme sous forme de préprotéines avec un peptide de transit N-terminal. Au cours de la biogenèse du chloroplaste, deux classes de préprotéines, à savoir celles associées à la photosynthèse et celles non associées à la photosynthèse, sont importées par des translocons au niveau des membranes externe et interne du chloroplaste, appelées respectivement TOC et TIC. Deux types de complexes TOC existent et accueillent les préprotéines respectives. Ils sont trimériques et composés de TOC159, TOC33, TOC75 (appelé pTOC pour les protéines associées à la photosynthèse) ou de TOC132/-120, TOC34 et TOC75 (appelé nTOC pour les protéines non associées à la photosynthèse). TOC159 et TOC33 (ainsi que leurs homologues TOC132/-120 et TOC34) contiennent des domaines GTPase et jouent un rôle dans la reconnaissance des préprotéines. Ils s'assemblent avec la protéine “β-barrel” TOC75, ce qui donne un translocon trimérique fonctionnel. Notamment, le domaine C-terminal de TOC159 (ainsi que TOC132/-120 selon les prédictions) adopte également une structure β-barrel et, avec celui de TOC75, s'assemble en canal hybride. La germination des graines est favorisée par l'hormone végétale acide gibbérellique (GA) et régulée négativement par l'acide abscissique (ABA). Cependant, la manière dont ces hormones, et en particulier l'ABA, influencent la biogenèse des chloroplastes et sa synchronisation avec le développement de la plante est encore mal comprise. Dans cette étude, j’ai tout d’abord examiné les effets globaux de 0,5 μM d’ABA sur le protéome et le transcriptome de plantules âgées de 36 heures, en utilisant les approches RNA-seq et la spectrométrie de masse. J’ai ensuite analysé différentes concentrations d’ABA sur des plantules âgées de 72 heures afin de valider les résultats omiques, en portant une attention particulière aux composantes TOC et TIC ainsi qu’à leurs substrats. L’expression des ARNm et l’accumulation des protéines ont été évaluées par PCR en temps réel et par western blot, dans le but d’élucider les mécanismes régulateurs sous-jacents. Mon analyse RNA-seq à l'échelle du transcriptome indique la régulation à la baisse des termes GO liés à la photosynthèse et la régulation à la hausse des termes GO non liés à la photosynthèse/au stress en réponse au traitement par l'ABA. L'analyse des protéines à l'échelle du protéome a révélé que la plupart des protéines correspondantes présentaient un comportement similaire. Sous ABA également, les composants du pTOC ont été régulés à la baisse, tandis que ceux du nTOC ont été régulés à la hausse au niveau des protéines. Cependant, les niveaux d'ARN du pTOC et du nTOC étaient en hausse. Les données indiquent que l'ABA réprime la biogenèse du chloroplaste par une régulation spécifique à la baisse des protéines associées à la photosynthèse ainsi que des composants du pTOC, tandis que les protéines non associées à la photosynthèse/au stress sont régulées à la hausse ainsi que les composants du nTOC. Les résultats démontrent le rôle clé des p- et n-TOC dans le contrôle de la biogenèse des chloroplastes sous ABA. Ainsi, mes données donnent un nouvel aperçu de la synchronisation de la biogenèse du chloroplaste dépendante de l'ABA pendant la transition de la graine à la plantule.
ABSTRACT
Chloroplast biogenesis defines the transition of non-photosynthetic proplastids to photosynthetically active chloroplasts in the embryonic cells of germinating seeds (“seed-to-seedling transition”). It is the key to photoautotrophic growth in plants. The chloroplast requires around 2500 nuclear-encoded proteins for its function. These are synthesized in the cytoplasm as preproteins with an N-terminal transit peptide. During chloroplast biogenesis, two classes of preproteins namely photosynthesis-associated and non-photosynthesis-associated ones, are imported by translocons at the outer and inner membrane of the chloroplast, called TOC and TIC, respectively. Two types of TOC complexes exist and accommodate the respective preproteins. They are trimeric and composed of TOC159, TOC33, TOC75 (for photosynthesis- associated proteins, termed pTOC) or TOC132/-120, TOC34, and TOC75 (for non- photosynthesis-associated proteins, termed nTOC). TOC159 and TOC33 (as well as their homologs TOC132/-120 and TOC34) contain GTPase domains and function in preprotein recognition. They assemble with the β-barrel protein TOC75, resulting in a functional trimeric translocon. Notably, the C-terminal domain of TOC159 (as well as TOC132/- 120, predictably) also takes on a β-barrel structure and, together with that of TOC75 forms a hybrid protein translocation channel. Seed germination is promoted by the plant hormone gibberellic acid (GA) and negatively regulated by abscisic acid (ABA). However, there is still a lack of understanding of how these hormones, and especially ABA, impact chloroplast biogenesis and its synchronization with plant development. In this study, I first investigated the global effects of 0.5 μM ABA on the proteome and transcriptome of 36-hour-old seedlings using RNA-seq and mass spectrometry methods. I then analyzed various concentrations of ABA on 72-hour-old seedlings to validate the omics results, with a particular focus on TOC and TIC components and their substrates. mRNA expression and protein accumulation were analyzed by real-time PCR and western blotting, aiming to elucidate the underlying regulatory mechanisms. My transcriptome-wide RNA-seq analysis indicates the downregulation of photosynthesis-related GO terms and the upregulation of non-photosynthesis/stress-related ones in response to ABA treatment. Proteome-wide mass spectrometric analysis revealed that most corresponding proteins exhibited similar behavior. Under ABA also, components of pTOC were downregulated, whereas those of nTOC were upregulated at the protein level. However, RNA levels of both pTOC and nTOC were up. The data indicate that ABA represses chloroplast biogenesis by specific down-regulation of photosynthesis-associated proteins together with pTOC components, whereas nonphotosynthetic/ stress-related proteins are upregulated together with components of nTOC. The results demonstrate a key role for p- and n-TOC in controlling chloroplast biogenesis under ABA. Thereby, my data provide new insight into the ABA-dependent synchronization of chloroplast biogenesis during the seed-to-seedling transition
