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Contrats de baux portant sur des biens accessoires (art. 253a CO) : rappel des critères permettant d’établir l’existence d’un bail accessoire et cas particulier de la résiliation d’un tel contrat
No full textAnalyse de l'arrêt TF 4A_603/2024, 5 mai 2025, Ire Cour de droit civi
Las perdices y el licenciado: aspectos de la amplificatio en “Los felices amantes”, de Alonso Fernández de Avellaneda
Get PDFCet article analyse un cas de réécriture et d'utilisation de la rhétorique et du détail dans un récit inséré dans le Don Quichotte d'Alonso Fernández de Avellaneda : « Los felices amantes ». Après avoir examiné la question essentielle des sources du texte, nous étudions la réécriture d'Avellaneda en nous concentrant sur la manière dont l’écrivain construit son récit à l'aide de l'amplificatio, et plus particulièrement des détails de l'evidentia, qu'il utilise non seulement pour développer des thèmes et des personnages, mais aussi pour renforcer la structure du récit et pour souligner l'un des thèmes centraux du texte : le temp
A divergent haplotype with a large deletion at the berry color locus causes a white-skinned phenotype in grapevine
Get PDFThe current genetic model explaining berry skin color in Vitis vinifera is incomplete and fails to predict berry skin color phenotypes for one allele of VvMybA1, referred to as VvMybA1_SUB. Our study focuses on this specific allele, revealing that the haplotype containing VvMybA1_SUB (haplotype F) represents an ancient lineage of the berry color locus. Within haplotype F, we identified two functional subhaplotypes, HapF1 and HapF2, associated with black-skinned phenotype, and one non-functional subhaplotype, HapFDEL, responsible for white-skinned phenotype. HapF1 likely originated from wild populations domesticated in the Near East and subsequently spread globally with the expansion of viticulture. In contrast, HapF2 has a more restricted distribution and may have emerged from hybridization events between cultivated grapevines and local wild populations as viticulture migrated to the Italian peninsula. Furthermore, we found that in white-skinned berry cultivar, HapF has undergone a large deletion at the berry color locus, removing the majority of the VvMybA genes. Previous works suggested a single common origin for white-skinned varieties during grapevine domestication. Our results challenge this notion, instead proposing that white-skinned grape cultivars arose at least twice during grapevine domestication history. Alongside the major haplotype A, some white-skinned cultivars, such as cv. ‘Sultanina’ harbor HapFDEL. Since HapFDEL is present only in table grape varieties, we suggest that it likely arose from a recent mutational event and dispersed along the ancient Silk Road into East Asia. These findings enhance our understanding of the genetic diversity and evolutionary trajectory of grapevine cultivars, offering insights into their domestication and spread across different geographical regions
Congé-démolition
No full textRésumé et analyse, Tribunal fédéral – 4A_576/2024, destiné à la publication, Ire Cour de droit civil, Arrêt du 29 avril 202
L’accès à l’enseignement supérieur pour les personnes catégorisées d’« étudiantes exilées » en France : une exploration des expériences d’étudiant·e·s en Diplôme Universitaire Passerelle
Get PDFCette étude réalisée dans le cadre d’un mémoire de recherche de master vient contribuer à la littérature sur les expériences dans l’enseignement supérieur des personnes considérées comme « étudiantes en exil ». Utilisant une méthode qualitative inspirée de la Grounded Theory, l’étude se situe dans une approche féministe postcoloniale. Une exploration des expériences d’étudiant·e·s au sein de programmes universitaires français d’aide à la reprise d’études, les Diplômes Universitaires Passerelles a été menée. Les données issues d’entretiens centrés sur un problème, d’entretiens d’expertes et d’un atelier participatif inspiré de la méthode MINGA, ont été analysées au regard de la théorie des capitaux de Bourdieu et à travers une perspective intersectionnelle. L’analyse a mis en avant des inégalités d’accès à l’enseignement supérieur pour les étudiant·e·s exilé·e·s selon leur position sociale, à travers des mesures administratives discriminatoires qui contribuent à une répartition inégale des capitaux. Le DU Passerelle, produit de la création par le bas d’une nouvelle catégorie d’action publique « étudiant·e·s exilé·e·s » se pose comme une ressource qui facilite l’accès aux études supérieures mais s’avère insuffisant. Les étudiant·e·s mettent en oeuvre des stratégies pour améliorer leur capital économique, social et culturel et pour faire face aux situations de racisme institutionnel issues d’une catégorisation sociale, leur donnant ainsi plus de chances d’aller au bout de leur projet d’études
A new molecular seed assay to predict Ustilago nuda field infection levels
Get PDFSeed health tests are performed to prevent sowing untreated seeds with problematic pathogen levels. The detection of internal seedborne pathogens like Ustilago nuda, causing loose smut in barley (Hordeum vulgare), is challenging because symptoms only appear when teliospores replace barley inflorescences and smutted ears develop. Currently, U. nuda seed infection levels are determined from the visual inspections of extracted embryos or fields of plants used for seed production, both of which are laborious and can be unreliable. To improve U. nuda detection, we developed a multiplex qPCR method targeting U. nuda and H. vulgare DNA. Naturally infected seed lots were tested using this qPCR method and the visual analysis of embryos. We grew the same seed lots in the field over two seasons and used the observed smutted ears as the reference infection level. The qPCR results, U. nuda DNA normalized to H. vulgare DNA, better correlated with observed field infections than the number of infected embryos. Our qPCR method more accurately distinguished seed lots with infections above and below the field tolerance threshold. It offers a reliable alternative to the visual analysis of extracted embryos. The integration of our qPCR method with field observations can enhance U. nuda management and reduce unnecessary prophylactic seed treatments, thereby bolstering integrated pest management strategies
Historic transposon mobilisation waves create distinct pools of adaptive variants in a major crop pathogen
Get PDFTransposable elements (TEs) shape host-pathogen interactions and contribute to antimicrobial resistance, but how adaptive TEs arise in populations and how historical contingencies affect TE dynamics remains unclear. Fungal crop pathogens provide unique frameworks to address such questions due to spatially explicit sampling and well-characterized niches. We characterise TE evolutionary dynamics in 1953 publicly available genomes across the global distribution range of the major wheat pathogen Zymoseptoria tritici. We characterise genomic diversity, benchmark methods to infer TE insertion polymorphism, and assess TEs as a source of adaptive variation. Across ~3.2 million annotated TE loci, we find substantial variation in TE content within and across populations. TE activity surged during the pathogen’s expansion from the Middle East, with distinct activity profiles in derived populations. TE-mediated adaptation emerged from waves of TE mobilization, with the highest TE activity observed over as little as 25 years. 45 TE loci within 1 kb of 49 host genes show local adaptation signatures, likely related to adaptation to antifungals and the plant host environment. This work highlights the power of vast genomic datasets to unravel intraspecies TE invasion histories and pinpoint factors driving recent adaptation and argues for deep population-level TE surveys to uncover molecular drivers of adaptive evolution
From cotton to odor sensors: unraveling the dynamics, specificity, and exploitability of herbivore-induced plant volatiles
No full textCommittee:
Prof. Ted Turlings, University of Neuchâtel (thesis director)
Prof. Sergio Rasmann, University of Neuchâtel (internal expert)
Dr. Emmanuel Defossez, University of Neuchâtel (internal expert)
Dr. Carla Marques Arce, University of Neuchâtel Arce (internal expert)
Prof. Meredith Schuman, University of Zürich, (external expert)
Prof. Matthias Erb, University of Bern, (external expert)
Defended on February 12, 2025
No de thèse : 3187Les plantes émettent des odeurs constituées de divers composés volatils pour interagir avec les organismes
de leur environnement. Parmi eux, les composés volatils induits par l’herbivorie jouent un rôle clé dans la
défense des plantes contre les insectes phytophages. Ces composés interviennent en modulant les interactions
avec les herbivores eux-mêmes, leurs ennemis naturels ou encore avec les plantes voisines. À ce titre,
les composés volatils produits par les plantes cultivées représentent un levier prometteur pour le développement
de stratégies de lutte durable contre les ravageurs.
Cette thèse explore différents aspects de la production de composés volatils chez le cotonnier (Gossypium
hirsutum) en réponse aux attaques d’insectes herbivores, et examine leur potentiel pour la détection précoce
et précise des ravageurs dans les cultures, en utilisant le maïs comme plante modèle.
Le premier chapitre s'intéresse à la spécificité de l’accumulation de composés stockés dans les glandes du
cotonnier suite à des dommages. Les deuxième et troisième chapitres portent sur la caractérisation des réponses
volatiles de cotonniers sauvages originaires du Yucatán, cousins des variétés domestiquées. Ces travaux
ont été menés d'abord en conditions contrôlées en laboratoire avec de jeunes plants cultivés en serre,
puis dans l’environnement naturel des cotonniers, avec des plantes matures. Le quatrième chapitre examine
la réponse volatile du cotonnier à Bucculatrix thurberiella, un insecte spécialiste. Ensemble, ces chapitres
fournissent un éclairage nouveau sur la dynamique et la spécificité des volatiles chez le cotonnier. Enfin, le
dernier chapitre adopte une approche plus appliquée en évaluant le potentiel de technologies existantes de
détection d’odeurs pour identifier la présence de ravageurs dans les champs agricoles.
ABSTRACT
Plants emit odors composed of diverse volatile compounds that serve as signals to interact with surrounding
organisms. Among these, herbivore-induced plant volatiles (HIPVs) play a central role in plant defense by
mediating interactions with herbivores, their natural enemies, and neighboring plants. As such, HIPVs produced
by crop plants represent a promising avenue for sustainable pest management.
This thesis investigates multiple aspects of HIPV production in cotton (Gossypium hirsutum) in response to
herbivory and explores how these volatiles could be harnessed for the early and accurate detection of pests
in agricultural fields, using maize as a model system.
The first chapter examines the specificity of damage-induced accumulation of compounds stored in the glandular
structures of cotton plants. Chapters two and three focus on characterizing the volatile responses of
wild cotton populations from Yucatán, relatives of domesticated varieties. These studies were first conducted
under controlled conditions in the laboratory with greenhouse-grown seedlings, and subsequently in the
plants’ natural environment, with mature plants. The fourth chapter investigates the HIPV response of cotton
to the specialist herbivore Bucculatrix thurberiella. Together, these chapters provide new insights into the
dynamics and specificity of HIPV in cotton. The final chapter adopts a more applied perspective, assessing
whether existing odor-sensing technologies may be used to detect pest presence in crops
A Custom OpenFOAM Solver for Fully-Coupled Surface and Subsurface Hydrological Modelling
Get PDFAccepted on the recommendation of:
Prof. Dr. Philip Brunner, University of Neuchâtel, Switzerland (Thesis Director)
Prof. Dr. Jan H. Fleckenstein, UFZ, Germany (Thesis Co-Director, Rapporteur)
Prof. Dr. Daniel Hunkeler, University of Neuchâtel, Switzerland (Rapporteur)
Prof. Dr. René Therrien, Laval University, Canada (Rapporteur)
Defended: 26th May 2025
No de thèse : 3190Les modèles numériques jouent un rôle essentiel dans l’étude des interactions entre les eaux de surface (SW) et les eaux souterraines (GW). Ils permettent de résoudre les hydrodynamiques complexes et les processus associés, comme le transport de solutés et le transfert de chaleur, qui se produisent à l’interface sédiment-eau sous diversesconditions de forçage. Alors que les approches traditionnelles traitaient séparément les écoulements de surface et souterrains, ou ne considéraient que des rétroactions unidirectionnelles, les avancées en sciences hydrologiques et en puissance de calcul ont conduit au développement de techniques plus sophistiquées, capables de mieux représenter la nature bidirectionnelle des échanges SW-GW. Ces techniques incluent
les modèles entièrement couplés (FCMs) et les modèles entièrement intégrés (FIMs).
Les FIMs résolvent les processus de surface et de subsurface dans un même cadre de calcul via un ensemble unifié d’équations, tandis que les FCMs utilisent des équations spécifiques à chaque domaine et simulent leur interaction par échange itératif de conditions aux limites. Pour simuler l’écoulement de surface, les FCMs recourent souvent aux équations de Navier-Stokes, qui permettent de représenter les dynamiques turbulentes tridimensionnelles (3D) complexes et, ainsi, de tenir compte de leur impact sur les échanges SW-GW. Ces équations sont résolues à l’aide de logiciels de dynamique des fluides numérique, tels qu’OpenFOAM. Grâce à sa structure modulaire et extensible, cette puissante boîte à outils C++ open-source constitue un cadre idéal
pour développer des FCMs personnalisés. En exploitant cette flexibilité, cette thèse développe darcyInterTransportFoam, un nouveau modèle SW-GW 3D entièrement couplé. Il repose sur hyporheicScalarInterFoam, en corrigeant plusieurs limitations liées à l’hétérogénéité des paramètres, aux conditions aux limites et aux processus de transport, qui limitaient son application à des contextes réels. Ces améliorations sont rendues possibles par de nouvelles fonctionnalités, incluant des mises à jour internes et des modules externes, qui élargissent les capacités du modèle. Une description complète des nouveautés, ainsi qu’une évaluation de leurs performances, est présentée. Cette évaluation se fait en deux étapes : (1) la simulation des processus d’écoulement,
de transport de solutés et de transfert de chaleur à l’échelle d’un tronçon de rivière dans deux segments différents d’un système alluvial réel; et (2) la comparaison des performances numériques et de la précision de darcyInterTransportFoam avec celles d’interFoam (FIM standard d’OpenFOAM), via la simulation des rétroactions écoulement–soluté sur un lit de rivière ondulé, synthétique et 3D. En améliorant la représentation des interactions SW-GW, ce travail contribue à l’avancement de la modélisation numérique pour la recherche hydrologique et environnementale.
ABSTRACT
Numerical models play a crucial role in studying surface water-groundwater (SW-GW) interactions. They enable the resolution of complex hydrodynamics and associated processes, such as solute transport and heat transfer, that occur across the sedimentwater interface under varying forcing conditions. While traditional modelling approachestreated SW and GW flows separately or accounted for the interfacial feedback in a unidirectional manner, advances in hydrological science and computational power have enabled the development of more sophisticated techniques that better represent the bidirectional nature of SW-GW exchanges. These include fully-coupled models (FCMs) and fully-integrated models (FIMs). FIMs solve both surface and subsurface processes within a single computational framework using a unified suite of equations, whereas CMs use distinct, domain-specific equations and simulate their interaction through the iterative exchange of boundary conditions across their interface. Among the equations commonly used by FCMs to simulate surface flow, the Navier-Stokes equations enable the resolution of the complex three-dimensional (3D) turbulent dynamics and, therefore, allow the impact of turbulence on the SW–GW exchange to be accounted for. These equations are solved by Computational Fluid Dynamics (CFD) software, such as OpenFOAM. Beyond its standard CFD applications, the modular and extensible structure of this powerful, open-source C++ toolbox makes OpenFOAM an ideal framework for implementing user-defined FCMs. Leveraging this flexibility, the present PhD thesis develops darcyInterTransportFoam, a novel, fully-coupled 3D SW-GW model. The
new solver builds upon hyporheicScalarInterFoam, addressing key modelling limitations in parameter heterogeneity, boundary conditions and transport processes, among others, that previously constrained its applicability to real-world hydrogeological settings. These improvements are achieved through newly implemented simulation features, including internal solver updates and external add-ons, which expand the model’s capabilities for improved SW-GW exchange simulations. A complete description of the modelling novelties, along with an evaluation of their performance, is provided in this thesis. The latter is conducted in two steps: (1) simulating the reach-scale flow, solute transport and heat transfer processes at two different river segments of an actual alluvial system; and (2) comparing the computational demands, efficiency and simulation performance of darcyInterTransportFoam with those of interFoam (standard OpenFOAM FIM) by simulating the flow and solute feedback across a 3D, synthetic rippled streambed. By improving the representation of SW-GW interactions, this work contributes to advancing numerical modelling techniques and their application to hydrological and environmental research
