Repositorio Institucional de Acceso Abierto (RIAA) (Universidad Autónoma del Estado de Morelos)
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Desarrollo de un nuevo método computacional para discriminar taxonómicamente las secuencias de virus generadas por tecnologías de secuenciación masiva de ADN para estudios de metagenómica
Get PDFLos virus son agentes microscópicos acelulares que requieren una célula hospedera para sobrevivir. Estos pueden infectar a todas las formas de vida en la Tierra, incluyendo los tres dominios de la vida, eucaria, bacteria y arquea. Los virus han causado algunas de las enfermedades más dramáticas y mortales en la historia humana. Sin embargo, la detección de virus permaneció muy limitada hasta el desarrollo de la metagenómica, la cual es el estudio de los fragmentos de secuencias del genoma de todos los diferentes microorganismos presentes en una muestra que se recupera directamente de un ambiente u hospedero. Los estudios metagenómicos han sido posibles gracias a las tecnologías de secuenciación de nueva generación (NGS; Next-Generation Sequencing), las cuales permiten obtener las secuencias de ADN de todos los ácidos nucleicos presentes en una muestra, generando grandes volúmenes de datos. Estos requieren ser analizados con métodos formales de computación; uno de los análisis es la clasificación taxonómica. La mayoría de los métodos existentes para este tipo de análisis se enfocan en la clasificación de secuencias bacterianas. Las herramientas encargadas de la clasificación de virus tienen una baja sensibilidad, debido a: i) La poca abundancia de las secuencias virales, ya que estas solo representan del 1% al 5% del ADN total obtenido de una muestra. ii) No existen genes marcadores universales, como en las bacterias, que permitan caracterizarlos fácilmente. iii) La mayoría (usualmente, entre el 60% y 99%) de las secuencias de virus obtenidas en cualquier ambiente no tienen similitud con otras secuencias en las bases de datos (BD) de referencia. Aunado a esto, el tiempo de procesamiento generalmente es muy costoso.
Con los problemas antes mencionados y aunado al aumento de datos metagenómicos, se han iniciado el uso de nuevas técnicas que sean capaces de trabajar con un gran conjunto de información y encontrar patrones de ellos, como lo son las redes neuronales profundas.
El objetivo de este proyecto fue desarrollar un nuevo método computacional que permite discriminar (clasificar) taxonómicamente las lecturas cortas de ADN de virus generadas por tecnologías de secuenciación masiva de ADN para estudios de metagenómica. El método desarrollado considera casi todas las familias virales definidas hasta enero del 2020 (169 para la información de NCBI nt y 127 para RefSeq) e incluye los virus que no pertenecen a ninguna familia viral, es decir, no tiene definida una asignación taxonómica a nivel familia. Dicho método realiza una clasificación a nivel nucleótido e identifica a qué familia pertenecen las secuencias mediante el uso de una red neuronal de convolución (en inglés Convolution Neural Networks, CNN), las cuales son un tipo de red neuronal profunda que identifica patrones en la información, comparte parámetros y reducen la dimensionalidad
Rendimiento académico en relación con los estilos de aprendizaje de los estudiantes de enfermería
Get PDFEl éxito de la propuesta implicaría un gran avance en los estilos de enseñanza-aprendizaje, por lo que no podemos olvidar que cada persona aprende de forma distinta, entender que cada persona aprende es el punto de partida para hablar de una enseñanza y para poder obtener un rendimiento académico adecuado, sin olvidar que el docente juega un rol el cual aplica estrategias y contenidos adecuados.
Este estudio es pertinente, en el cual se analizó el reporte de las actas de calificación de las unidades de aprendizaje de los semestres a estudios y la relación con los estilos de aprendizaje.The success of the proposal would imply a great advance in teaching-learning styles, so we cannot forget that each person learns differently, understanding that each person learns is the starting point to talk about teaching and to be able to obtain an adequate academic performance, without forgetting that the teacher plays a role which applies appropriate strategies and contents.
This study is pertinent, in which the report of the grading records of the learning units of the semesters of studies and the relationship with learning styles were analyzed
Efecto de fragmentos peptídicos en la formación de fibras amiloides de la proteína 6aJL2R24G inducidas por Cu(II)
Get PDFLas proteínas son esenciales para el funcionamiento óptimo de las células; de hecho, este grupo
de biomoléculas representa un poco más del 50% del peso seco celular y llevan a cabo una
amplia gama de funciones vitales, desde actuar como componentes estructurales hasta servir
como catalizadores biológicos e incluso participar en procesos inmunológicos [1].
Anteriormente, se creía que la función de las proteínas estaba intrínsecamente ligada a su
estructura tridimensional. Sin embargo, aunque esta premisa sigue siendo en gran parte válida,
se ha descubierto un grupo especial de proteínas conocidas como proteínas intrínsecamente
desordenadas (IDP, por sus siglas en inglés), las cuales no poseen una estructura única al
equilibrio, si no que existen como conjuntos heterogéneos de conformaciones y aún así,
desempeñan funciones biológicas [2]. En cualesquiera de los dos casos y bajo ciertas
condiciones, las proteínas pueden perder su estructura nativa, lo que las lleva a adoptar una
conformación que puede provocar que se autoensamblen y formen agregados
Efectos de la Actividad Física sobre los Procesos Atencionales de los Adolescentes de Segundo Grado de la Escuela Secundaria Francisco González Bocanegra
No full textSe ha encontrado que la atención como parte de la capacidad humana permite al individuo seleccionar lo que le es interesante (Contreras & Trejo, 2013). La reciente evidencia científica sustenta que una relación directa entre la actividad física (AF) y la Atención permite establecer las bases para la mejora en la educación. El objetivo fue analizar el cambio de los procesos atencionales a partir de una intervención de AF en adolescentes de la Escuela Secundaria General Francisco González Bocanegra de Cuernavaca, Morelos. Se diseñó un estudio cuasiexperimental controlado con pre y post test donde participaron 106 adolescentes de segundo grado de secundaria, estableciendo grupos de control (GC) y grupos de intervención (GI) mediante una aleatorización. Se midieron diferentes variables como: atención selectiva y sostenida, concentración, motivación, nivel de AF y capacidades físicas. Los datos fueron analizaron mediante el software STATA versión 14; encontrándose diferencias estadísticamente significativas (p=<0.01) en capacidades físicas como la motora, aeróbica y musculoesquelética del tren inferior, así como valores cercanos a diferencias significativas en concentración (p=0.02) como parte de la atención
Diseño de un sistema de gestión de calidad para la elaboración de aceites esenciales
Get PDFLa empresa Feltday FQO SPR DE RL DE CV es una empresa dedicada a la producción de aceites esenciales, que ha descubierto nuevas áreas de oportunidad para colocar su producto en otros países, pero requiere cumplir con las normas que solicita cada país, para llevar a la empresa al siguiente nivel de exportación se diseñó un sistema de Gestión de Calidad apegado a la Norma ISO 9001:2015 que es de carácter certificable y que es aceptado a nivel internacional
Optimización de la producción in vitro de los ácaros Caloglyphus mycophagus y Tyrophagus putrescentiae y su posible efecto dañino en ratones BALB/c
Get PDFEl presente estudio se divide en dos etapas, de manera in vitro se optimizo la producción de los ácaros Caloglyphus mycophagus y Tyrophagus putrescentiae. Se evaluaron tres sustratos: avena, amaranto y levadura durante 21 días, los parámetros evaluados fueron número de huevos y viabilidad de huevos. Se observó que la avena resulto ser el mejor sustrato ya que indujo una ovoposición 3.7 veces mayor (P≤0.0001) y una viabilidad 4.8 veces mayor (P≤0.001) en comparación de la dieta convencional en los ácaros C. mycophagus. La ovoposición en los ácaros T. putrescentiae fue 2.3 veces mayor (P≤0.001) y una viabilidad 2.1 veces mayor (P≤0.001) en comparación de la dieta convencional. Por otra parte, de manera in vivo se determinó el posible efecto dañino de la aplicación de los extractos de los ácaros en ratones (BALB/c) mediante las variables conductuales: actividad locomotora, exploratoria, permanencia en zonas oscuras/ luz, defecaciones y micciones, no se encontró aumento o disminución en los periodos de pre y post inoculación de los extractos de los ácaros, tampoco en el número de defecaciones y micciones. Posteriormente con la prueba de intradermorreacción se evaluó a nivel tisular la capacidad alergénica de los ácaros de inducir una reacción de hipersensibilidad. La evaluación tisular revelo un engrosamiento epidérmico, hiperplasia en las glándulas sebáceas y una infiltración celular en los sitios de inoculación que alcanzó su punto máximo a las 72 horas después de la inmunización en los grupos tratados con hidróxido de aluminio y el extracto del ácaro T. putrescentiae. Finalmente se propone el uso de la avena y la levadura como sustratos para la producción masiva del ácaro C. mycophagus, además por tener un menor efecto alergénico a nivel tisular se podría proponer a este ácaro como posible controlador biológico de parasitosis
Modelación de un sistema sustentable para el aprovechamiento de la energía geotérmica de baja entalpía por medio de un intercambiador de calor tierra-aire
Get PDFA principios del siglo XX con el inicio de la segunda revolución industrial los avances tecnológicos enfocados a la aplicación de nuevas fuentes de energía como el gas y el petróleo, además del ya utilizado carbón, permitieron el desarrollo del transporte, la comunicación, maquinaria pesada, entre otros beneficios tecnológicos, sin embargo, al tener como fuente de energía principal la quema de estos combustibles fósiles, surgió un problema de carácter ambiental debido a la sobreproducción artificial de gases de efecto invernadero, cenizas y exposición de contaminantes al ambiente, etc.
En la década de 1970 se empezó a considerar a las energías renovables como una alternativa a la quema de combustibles fósiles para la producción de energía, debido a su disponibilidad y al menor impacto ambiental que presenta su explotación
Percepción de riesgo, resiliencia comunitaria y afrontamiento frente a sismos: una propuesta de medición y análisis
No full textLos fenómenos de origen natural siempre han estado presentes en la vida del ser humano y por ende los efectos que estos ocasionan, por lo que diferentes disciplinas como la Psicología de Emergencia y Desastres, la Psicología del Riesgo en conjunto con Organismos Internacionales se han encargado de estudiar e implementar acciones encaminadas a disminuir el efecto ocasionado por estos evento, promoviendo herramientas como la Resiliencia Comunitaria la cual contiene acciones de prevención,
preparación, gobernanza, capacitación, entre otras acciones en las comunidades afectadas, como parte de la gestión integral del riesgo. Objetivo por lo que pretendió analizar el efecto moderador de las estrategias de afrontamiento en la relación entre la Percepción de Riesgo y el beneficio percibido con la Resiliencia Comunitaria en las personas que han vivido los efectos de un sismo. Muestra: 271 pobladores de una comunidad del estado de Morelos, hombres y mujeres con un rango de edad de 18 a 79
años. Método: Estudio cuantitativo, exploratorio, ex post facto. Resultados: se obtuvo una moderación negativa en la relación de peligros para los bienes con la resiliencia comunitaria en la población estudiada, además de la construcción y validación de las Escalas de Percepción de Riesgo, Beneficio percibido y Resiliencia comunitaria. Conclusiones: Se reconoce la importancia de conocer la percepción de riesgo, la resiliencia comunitaria y el afrontamiento para la implementación de acciones
encaminadas a la gestión de integral riesgo ante situaciones de desastre
Hongos: una alternativa biodegradable en la industria textil
No full textEn los últimos años se han realizado esfuerzos en la búsqueda de alternativas en el área textil que no generen residuos contaminantes, como es el caso de los productos derivados del plástico o de origen animal. Entre estas alternativas se pueden mencionar los hongos, de los cuales se obtienen materiales con características idóneas para su aprovechamiento en la industria textil. Debido a su estructura, morfología y resistencia, el micelio produce un material biodegradable que presenta un aspecto similar al cuero. En este artículo se revisan algunas investigaciones en las que se han obtenido productos para la industria textil con características similares a las del cuero de origen animal.In recent years, efforts have been made in the search for alternatives in the textile area that do not generate polluting waste, as is the case of products derived from plastics or animal origin. Among these alternatives, fungi can be mentioned, from which materials with ideal characteristics for use in the textile industry can be obtained. Due to its structure, morphology and resistance, the mycelium produces a biodegradable material that has a leather-like appearance. This article reviews some researches in which products have been obtained for the textile industry with characteristics similar to those of leather of animal origin
Desarrollo de un entorno virtual para operar de forma segura el proceso de desorción utilizando el método HAZOP
No full textEn este trabajo se describe la metodología del desarrollo de un entorno virtual para el monitoreo de la seguridad industrial de un proceso de desorción a escala laboratorio. La metodología HAZOP fue utilizada para la identificación de los riesgos en el proceso de desorción, analizando de manera particular la alimentación del vapor. Los programas de cómputo Blender y Unity fueron utilizados para el desarrollo del entorno virtual y Python y C# para la programación de scripts. Con la interfaz gráfica desarrollada, el usuario pudo establecer las condiciones de operación del proceso de desorción para predecir las situaciones de riesgo y tomar decisiones previo a la operación física del equipo.This work describes the methodology for the development of a virtual environment to industrial safety monitoring of a desorption process on a laboratory scale. The HAZOP methodology was used to identify risks in the desorption process, specifically the steam feed. The computer programs Blender and Unity were used for the development of the virtual environment and Python and C# for script programming. With the developed graphical interface, the user was able to set the operating conditions of the desorption process to predict risk situations and make decisions before the physical operation of the equipment