OpenAccess@KU (Kastamonu University)
Not a member yet
29229 research outputs found
Sort by
From pixels to prognosis: leveraging radiomics and machine learning to predict IDH1 genotype in gliomas
Abstract Gliomas are the most common primary tumors of the central nervous system, and advances in genetics and molecular medicine have significantly transformed their classification and treatment. This study aims to predict the IDH1 genotype in gliomas using radiomics and machine learning (ML) methods. Retrospective data from 108 glioma patients were analyzed, including MRI data supported by demographic details such as age, sex, and comorbidities. Tumor segmentation was manually performed using 3D Slicer software, and 112 radiomic features were extracted with the PyRadiomics library. Feature selection using the mRMR algorithm identified 17 significant radiomic features. Various ML algorithms, including KNN, Ensemble, DT, LR, Discriminant and SVM, were applied to predict the IDH1 genotype. The KNN and Ensemble models achieved the highest sensitivity (92-100%) and specificity (100%), emerging as the most successful models. Comparative analyses demonstrated that KNN achieved an accuracy of 92.59%, sensitivity of 92.38%, specificity of 100%, precision of 100%, and an F1-score of 95.02%. Similarly, the Ensemble model achieved an accuracy of 90.74%, sensitivity of 90.65%, specificity of 100%, precision of 100%, and an F1-score of 95.13%. To evaluate their effectiveness, KNN and Ensemble models were compared with commonly used machine learning approaches in glioma classification. LR, a conventional statistical approach, exhibited lower predictive performance with an accuracy of 79.63%, while SVM, a frequently utilized ML model for radiomics-based tumor classification, achieved an accuracy of 85.19%. Our findings are consistent with previous research indicating that radiomics-based ML models achieve high accuracy in IDH1 mutation prediction, with reported performances typically exceeding 80%. These findings suggest that KNN and Ensemble models are more effective in capturing the non-linear radiomic patterns associated with IDH1 status, compared to traditional ML approaches. Our findings indicate that radiomic analyses provide comprehensive genotypic classification by assessing the entire tumor and present a safer, faster, and more patient-friendly alternative to traditional biopsies. This study highlights the potential of radiomics and ML techniques, particularly KNN, Ensemble, and SVM, as powerful tools for predicting the molecular characteristics of gliomas and developing personalized treatment strategies.https://doi.org/10.1007/s10143-025-03515-zhttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40299088http://dx.doi.org/10.1007/s10143-025-03515-
Lipopolysaccharide induces apoptosis and oxidative cytotoxicity through stimulation of the TRPV1 channel in retinal pigment epithelium cell line
Common and vision-threatening inflammatory ocular disorders are major issues on a global scale. The etiology and whole treatment for inflammatory disorders are yet unknown. With the exception of human retinal pigment epithelial-19 (ARPE-19), numerous cells have been shown to be involved in lipopolysaccharide (LPS)-induced free reactive oxygen species (ROS) and apoptosis through TRPV1 cation channel stimulation. I wanted to determine how TRPV1 affected the oxidative cytotoxicity and apoptosis caused by LPS in ARPE-19. Two main groups in the ARPE-19 cells were induced as control and LPS (1 g/ml for twenty-four hours). TRPV1 antagonist (100 M capsazepine (CAPZ) for 1 hour) blocked TRPV1 in the channel, whereas TRPV1 agonist (10 M capsaicin (CAPS) for 1 hour) stimulated cells of the main groups. The incubation of CAPS increased the amounts of apoptosis, caspases (caspase -3, -8, and -9), mitochondrial dysfunction, and ROS in the control and LPS groups, while CAPZ incubation diminished these amounts. However, their amounts were additionally increased in the LPS than in the control. LPS-induced increases of cell viability were diminished in the control and LPS groups by the CAPZ. In summary, CAPZ treatment through TRPV1 inhibition contributes to the oxidative stress and apoptosis that LPS causes in ARPE-19 cells. TRPV1 inhibition by CAPZ may be a viable treatment option for oxidative retinal damage induced by LPS.https://doi.org/10.37212/jcnos.1609591https://dergipark.org.tr/tr/pub/jcnos/issue/89990/160959
IĞDIR’IN COĞRAFİ İŞARETLİ ÜRÜNLERİNİN GASTRONOMİ TURİZMİ AÇISINDAN İNCELENMESİ
Gastronomi turizmi, günümüzde önem taşıyan bir alandır. Bu alanın önem taşımasında coğrafi işaretlerin de bir etkisi vardır. Bundan dolayı bu konulara yönelik bir çalışma oluşturmak istenmiştir. Bu çalışmanın amacı, Iğdır’ın coğrafi işaretli ürünlerini gastronomi turizmi açısından incelemektir. Çalışma, Iğdır’ın coğrafi işaretli ürünlerinin bilinmesine ve tanıtılmasına yardımcı olmak, bunların gastronomi turizmi açısından değerlendirilmesine olanak sağlamak yönlerinden önem arz etmektedir. Çalışma kapsamına Iğdır’ın dâhil edilmesinin nedeni, bu kentin turizm açısından fazla gelişmemiş olarak görülmesi, konu özelinde de kentin coğrafi işaretleri ile gastronomi turizmini tek çatı altında bir araya getiren fazla çalışmaya rastlanmamasıdır. Çalışmada derleme yöntemi, bu yöntem çerçevesinde de geleneksel derleme yöntemi kullanılmıştır. Çalışmanın bulgularına göre; Iğdır’ın altı adet coğrafi işaretli ürünü vardır. Bunlar; Iğdır kayısısı, Iğdır patlıcan reçeli, Iğdır taş köfte yemeği, Iğdır omaç aşı çorbası, Iğdır bozbaş yemeği ve Iğdır beyaz üzümü/miskalıdır. Söz konusu coğrafi işaretli ürünlerin de Iğdır’a hem gastronomi hem de gastronomi turizmi yönünden olumlu etkiler sağladığı kanısına varılmıştır. Sonuç olarak; Iğdır’ın coğrafi işaretli ürünlerinin gastronomi turizmi açısından özellikle yörede önemli yere ve potansiyele sahip olduğu görülmektedir. Çalışmanın sonunda Iğdır ile ilgili çeşitli öneriler verilmiştir. Bu kapsamda önemli görülen iki önerinin ifade edilmesi uygun görülmüştür. Bu önerilerden biri, Iğdır’ın coğrafi işarete sahip olan ürünlerinin söz konusu ilin genel turizmi üzerine mevcut ve olası etkilerinin multidisipliner yaklaşımlara başvurularak araştırılmasıdır. Bu önerilerden bir diğeri, Iğdır’ın coğrafi işarete sahip olan ürünlerinin ilgili ilin yerel halkı tarafından bilinirliği üzerine bir araştırmanın tasarlanmasıdır.https://doi.org/10.7460/turar.1587386https://dergipark.org.tr/tr/pub/turar/issue/91511/158738
Development and Validation of the Sexual Health Attitude Scale for Young Adults
Background and Purpose:The scale was developed to assess the attitudes of young adults aged 18–25 years toward sexual health.Method:The scale was methodologically developed based on the instrument development guidelines proposed by Robert F. DeVellis. The sample consisted of 721 young individuals in Turkey.Results:In the exploratory factor analysis, a scale with seven subdimensions explained 56.29% of the total variance was obtained. The confirmatory factor analysis demonstrated the scale had acceptable fit indices (χ² statistic divided by the degrees of freedom = 2.553, root-mean-square error of approximation = .066). The total Cronbach’s α value of the scale was determined to be .94.Conclusion:The analyses conducted demonstrated that the scale is a valid and reliable measurement tool for determining young adults’ attitudes toward sexual health.https://doi.org/10.1891/jnm-2024-0117https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/4028074
An analysis of sixty manuscripts preserved in Istanbul Beyazıt Manuscript Library Pazvantoğlu Collection in terms of illumination art and artistic productions
Türkler, İslamiyet’in kabulü ile birlikte Asya’dan getirdikleri sanatları kutsal kitapların süslemesinde kullanmışlardır. Kültür tarihimiz açısından önemli bir yere sahip olan yazma eserler, içermiş oldukları dinî, ilmî, edebî vb. konularla geçmişten günümüze ışık tutmaktadır. Yazıldıkları dönemlere ışık tutan bu eserler kütüphanelerde, müze ve özel koleksiyonlarda koruma altına alınmıştır. Bu araştırmada İstanbul Beyazıt Yazma Eser Kütüphanesi Pazvantoğlu Koleksiyonu’nda korunan 2900 adet eser incelenmiş içlerinden süslemeli olanlar belirlenmiştir. Bu el yazması eserlerden altmış tanesi tez konusu olarak seçilmiştir. “İstanbul Beyazıt Yazma Eser Kütüphanesi Pazvantoğlu Koleksiyonu’nda Korunan Altmış Adet Yazma Eserin Tezyini Açıdan İncelenmesi ve Sanatsal Üretimler” başlıklı tez çalışması yazma eserlerin cilt ve tezhip tezyinatları incelenerek, belirlenen eserler hakkında detaylı bir çalışma yapılması açısından önem arz etmektedir. Korunan yazma eserler yerinde taranarak görselleri dijital ortamda yapılan arşiv taramasından elde edilmiş ve ayrıca eserler bulundukları kütüphanede yerinde incelemeye tabi tutulmuştur. Daha önce hiçbir çalışmaya konu edilmeyen, altmış adet eser belirlenerek dönem özellikleri, motif, desen, cilt ve tezhip özellikleri açısından ele alınmıştır. İstinsah tarihi belli olmayan yazma eserlerin işçilik, motif, kompozisyon, üslup özelliklerine bakılarak tezhiplerinin hangi döneme ait olduğu belirlenmeye çalışılmıştır. Çalışmada incelenen yazma eserlerin cilt ve tezhiplerinin detaylı çizimlerle yazılı olarak kayıt altına alınması, Türk sanatı ile ilgili çalışma yapan araştırmacılara kaynak oluşturması ve gelecek nesillere aktarılması bakımından önem arz etmektedir
The Scope, Applications, and Future of Artificial Intelligence in Instructional Design
This chapter examines the role, applications, and future potential of artificial intelligence (AI) in instructional design. It begins by addressing the rise of AI in education and its intersection with instructional design. The integration of AI with established instructional design models is discussed, alongside an exploration of how AI aligns with various learning theories. The chapter explores AI-driven instructional design applications ranging from personalized learning systems to adaptive learning platforms. It illustrates, with examples, how automated feedback and assessment systems can reduce teachers' workloads while enhancing students' educational experiences. Ethical concerns and challenges encountered during the transformative process of AI in education are also addressed. In conclusion, AI is considered a powerful tool with the potential to make instructional design more personalized, data-driven, and effective. In the future, the role of AI in education is likely to expand further, reshaping instructional processes across diverse educational contexts.https://doi.org/10.4018/979-8-3373-2612-2.ch01
Akbaba’nın Renkli ve Zevkli Refiki: Tavus Mecmuası
Türk edebiyatında başka bir mecmuayla aynı isimle yayımlandığı için karıştırılan süreli yayınlar mevcuttur. Bu yayınlar üzerine özenli bir çalışma yapılmadığında aralarındaki farklar tespit edilememekte ve bilgi kirliliği ortaya çıkmaktadır. Benzer bir durum “Tavus” adını kullanan iki mecmuada da göze çarpar. Bu çalışmada incelenen Tavus dergisi; Faruk Nafiz, Yusuf Ziya ve Ressam Ramiz Gökçe tarafından hazırlanırken 1908 yılında Ferid Hâc tarafından aynı isimle çıkarılan bir mecmua daha bulunmaktadır. Ferid Hâc’ın Tavus’u mizah ağırlıklı kabul edildiği için dönem, tür ve içerik farkına dikkat etmeyen araştırmacılar tarafından 1925 tarihli sanat ve edebiyat dergisi olan Tavus da mizah içerikli bir mecmua olarak değerlendirilir. Dergiye bu şekilde yapılan atıflar ise sonraki araştırmacıları da yanıltır. Ayrıca iki mecmua arasındaki farkın ortaya konmaması, birçok orijinal edebî metni ihtiva eden bu derginin araştırmacılar tarafından ihmal edilmesine de neden olur. Bu çalışmada ilk olarak mecmualar hakkındaki bilgi yanlışları giderilip Tavus (1925) dergisinin künyesi belirginleştirilmiştir. Daha sonra derginin yayım süreci, fiziki özellikleri ve içeriğine dair bilgiler paylaşılıp yayın anlayışına dair çeşitli tespitler dile getirilmiştir. Derginin yayın anlayışının merkezinde kadınlar ve salon hayatına dair unsurlar yer aldığından çalışmadaki değerlendirmeler de bu eksenden yapılmıştır. Ayrıca dergi, yer verdiği resim unsurlarıyla da okurlara renkli ve zevkli bir içerik sunar. Elde edilen sonuçlar neticesinde Akbaba dergisi ile dirsek teması kurarak yayın hayatına başlayan Tavus mecmuasının kısa süren yayın macerasına rağmen önemli bir mecmua olduğu görülmüş, bol resimli içeriği ile sanata, modaya ve kadın konusuna yaklaşımından dolayı Cumhuriyet devri Türk kadın dergileri arasında büyük bir potansiyele sahip olduğu tespit edilmiştir.https://doi.org/10.21547/jss.152046
An Action Research on the Utilization of Formative Assessment Components in Online Environments in Science Education
Purpose: This research aimed to identify the utilization status of formative assessment components by teachers and analyze the process of addressing the problems encountered in these components. Design/Methodology/Approach: The research was designed considering Stringer's (2007) model supporting the collaborative action research process. Weekly action cycles were planned with teachers during the research. Data collection tools for the study included video recordings (classroom observations), teacher interviews, researcher field notes, lesson plans, planning and reflection meetings with teachers, and meetings with the validation committee. Data analysis in this research was conducted using descriptive analysis and constant comparative analysis. Interview and observation data, along with lesson plans, were analyzed by the researcher after each action cycle, based on the 'formative assessment classroom observation form' created, to determine the extent to which each teacher used formative assessment components in their lessons. Data were also shared with the validation committee to complete evaluations related to formative assessment components for each teacher. Upon examining the development of teachers' formative assessment components, it was observed that two teachers reached expert levels in all components, while one teacher reached an expert level in all components except for peer assessment. Findings: Factors generally influencing the use of formative assessment components by teachers, based on the findings of this study, included teachers' instructional beliefs and attitudes, collaboration and adequate support, time, experience, and standardized tests, as well as teachers' educational philosophies and their utilization of online learning environments. The findings of the study were discussed in relation to the literature, and various recommendations were provided to practitioners to contribute to the use of formative assessment in classroom practices and to researchers aiming to improve teachers' formative assessment practices. Highlights: Factors generally affecting the use of formative assessment components by teachers can be stated as teachers' pedagogical beliefs and attitudes, collaboration and adequate support, time, experience, and centralized exams, teachers' educational understanding, and their use of online learning environments.https://doi.org/10.24106/kefdergi.168348
Türkiye, in annual reports of British embassy in 1948-1949
Türkiye’de olan önemli gelişmeler, iç ve dış politik olaylar, rapor haline getirilerek, İngiliz Büyükelçiliği tarafından, Birleşik Krallık Hükümetine gönderilmektedir. Bu çalışmada, İngiltere’nin Ankara Büyükelçiliği’nin Türkiye hakkında 1948 ve 1949 yılında tuttuğu raporların orijinalleri Türkçeye çevrilmek suretiyle, belirtilen yıllarda olan olaylar, İngiliz bakış açısıyla aktarılmıştır. Giriş ve sonuç bölümü dâhil olmak üzere altı bölümden oluşmuştur. Çalışmanın ikinci bölümünde II. Dünya Savaşı sonrası Türk-İngiliz ilişkileri, ilişkilerde yaşanan sorunlar, çözüm yöntemleri aktarılmıştır. Çalışmanın üçüncü bölümünde, İngiliz Belgelerine göre Türk İç Politikası, Türkiye’deki Siyasi Olaylar, İngiliz bakış açısı ile aktarılmıştır. Çalışmanın dördüncü bölümünde ise Türk dış politikası, yapılan anlaşmalar, görüşmeler ve bu konudaki İngilizlerin görüşleri aktarılmıştır. Çalışmanın altıncı bölümü ise; İngiliz Büyükelçiliğimin, Türkiye’deki önemli şahsiyetler hakkında tuttuğu raporlardan oluşmaktadır. İngiliz Büyükelçiliği tarafından aktarılan olayların, dönem içinde basına yansımalarını anlamak amacıyla ulusal basın incelenmiş ve gazete haberleri de çalışmaya eklenmiştir. Yapılan çalışma ile, İngiliz bakış açısı anlaşılmaya çalışılmıştır
Structural characterization of antiviral compounds from medicinal plants against SARS-CoV-2: A computational study
Natural products are vital and rich sources for plant-based drugs and new medicines. Recent studies emphasize secondary metabolites of natural products due to their unparalleled pharmacological action, biological activity and high usage cost. In addition, with the progress of investigation on biosynthesis and molecular metabolism of medicinal plants, the procedures for illustrating the pharmacological impacts and biological activity of these compounds are firmly developing. The principal section of the translation process is the synthesis of secondary metabolites. In this work, seven flavonoids, namely apigenine–7–glucoside, catechin, demethoxycurcumine, kaempferol, naringenin, oleuropein and quercetin have also previously been reported to inhibit RNA (Ribonucleic acid) replication and viral translation. Among applied extracted phytochemicals in this investigation, oleuropein’s has exhibited lowest Gibbs free energy of −1206.893 × 103 kcal/mol with high dipole moment of 6.1962 Debye. In this study, we combine CAM-B3LYP-D3 and NQR (Nuclear quadrupole resonance) for evaluating plant-derived anti-SARS-CoV-2 compounds through computationally estimating the binding mechanisms and thermodynamic stability of seven flavonoids against SARS-CoV-2’s TMH (Tyrosine 160–Methionine 161–Histidine 162) active site.https://doi.org/10.62617/mcb111