Czasopisma Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Not a member yet
2127 research outputs found
Sort by
MOLECULAR DIVERSITY AND PHYLOGENY OF TRITICUM-AEGILOPS SPECIES POSSESSING D GENOME REVEALED BY SSR AND ISSR MARKERS
Get PDFThe aim of this study is investigation the applicability of SSR and ISSR markers in evaluating the genetic relationships in twenty accessions of Aegilops and Triticum species with D genome in different ploidy levels. Totally, 119 bands and 46 alleles were detected using ten primers for ISSR and SSR markers, respectively. Polymorphism Information Content values for all primers ranged from 0.345 to 0.375 with an average of 0.367 for SSR, and varied from 0.29 to 0.44 with the average 0.37 for ISSR marker. Analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that 81% (ISSR) and 84% (SSR) of variability was partitioned among individu-als within populations. Comparing the genetic diversity of Aegilops and Triticum accessions, based on genetic parameters, shows that genetic variation of Ae. crassa and Ae. tauschii species are higher than other species, especially in terms of Nei’s gene diversity. Cluster analysis, based on both markers, separated total accessions in three groups. However, classification based on SSR marker data was not conformed to classification ac-cording to ISSR marker data. Principal co-ordinate analysis (PCoA) for SSR and ISSR data showed that, the first two components clarified 53.48% and 49.91% of the total variation, respectively. This analysis (PCoA), also, indicated consistent patterns of genetic relationships for ISSR data sets, however, the grouping of acces-sions was not completely accorded to their own geographical origins. Consequently, a high level of genetic diversity was revealed from the accessions sampled from different eco-geographical regions of Iran
Ocena wartości hodowlanej wybranych linii wsobnych kukurydzy (Zea mays L.)
Get PDFThe main objective of the present study was to evaluate the breeding value of 17 (10 dent and 7 flint) inbred lines of maize based on yield performance of 70 hybrids produced according to North Carolina II design “dent × flint”. Material consisted of lines used in a breeding program 40 years ago and nowadays. Except the line F2, which have been developed in the INRA in France, other lines have been bred in Smolice. Two separate series of comparative trials were carried out: for 70 experimental hybrids and the 17 parental inbred lines in two growing seasons (2005; 2006), and three locations. It has been shown that 40-year-old elite lines have proved to be unsuitable for direct use in the currently run maize breeding program. The values per se of inbred lines are not sufficient to predict the value of quantitative traits of their hybrid offspring. The flint line S61328 obtained the highest score of breeding value, measured by general combining ability, grain yield of the line itself and its earliness per se. The breeding progress of elite inbred lines used in formulas of Smolice’s hybrid varieties registered between 1971–2006 has been estimated on 59.4 kg/year.Celem pracy była ocena wartości hodowlanej 10 linii wsobnych o ziarnie zębokształtnym (dent) i 7 linii o ziarnie szklistym (flint) kukurydzy na podstawie plonowania 70 mieszańców eksperymentalnych powstałych w wyniku czynnikowego układu krzyżowania „dent × flint”. Materiał badawczy stanowiły linie wykorzystywane w programie hodowlanym przed 40. laty i obecnie. Poza linią F2, którą wyhodowano w INRA we Francji, pozostałe linie zostały wyhodowane w Smolicach. Przeprowadzono dwie oddzielne serie doświadczeń porównawczych: dla 70 mieszańców eksperymentalnych oraz dla 17 rodzicielskich linii wsobnych w dwóch sezonach wegetacyjnych 2005 i 2006 oraz trzech miejscowościach. Wykazano, że elitarne linie sprzed 40. lat okazały się nieprzydatne do bezpośredniego wykorzystania w obecnie prowadzonym programie hodowli mieszańcowej kukurydzy. Wartości per se linii nie są wystarczające do prognozowania wartości cech ilościowych ich potomstwa mieszańcowego. Najwyższą ocenę wartości hodowlanej, mierzoną ogólną zdolnością kombinacyjną, plennością samej linii i jej wczesnością per se, uzyskała linia o ziarnie szklistym S61328. Uzyskany postęp genetyczny elitarnych linii wsobnych tworzących formuły mieszańców rejestrowanych przez Smolice w latach 1971–2006 wyniósł 59,4 kg/rok
Identyfikacja markerów SSR przydatnych do konstrukcji mapy genetycznej i mapowania genów odporności na kanciastą plamistość liści ogórka (Cucumis sativus L.)
Get PDFThe aim of this study was identification of SSR markers useful for construction of genetic map of cucumber population that consists of 110 recombinant inbred lines (RILs). RILs population segregating for angular leaf spot (ALS) resistance was developed by crossing two inbred lines, an American line Gy14 showing tolerance for angular leaf spot and a Polish line B10, susceptible to this disease. A set of SSR markers was preliminary examined for polymorphism using bioinformatic analysis. There were 222 selected SSR markers and 160 of them were further tested on parental lines and chosen RILs. The polymorphism was confirmed for 103 (64.4%) SSR markers. Fifty two SSR markers were found to be useful for construction of genetic map of cucumber population Gy14 × B10 and further mapping of angular leaf spot resistance genes. Preliminary results suggest that SSR00398 located on chromosome 5 may be linked to angular leaf spot resistance gene.W pracy podjęto próbę identyfikacji markerów SSR użytecznych do konstrukcji mapy genetycznej ogórka dla populacji mapującej 110 rekombinacyjnych linii wsobnych (RIL). Populację uzyskano z krzyżowania amerykańskiej linii Gy14 wykazującej tolerancję na bakteryjną kanciastą plamistość z polską linią B10 wrażliwą na tę chorobę. Analiza bioinformatyczna zróżnicowania sekwencji loci mikrosatelitarnych pozwoliła wskazać markery SSR potencjalnie przydatne do mapowania w tej populacji. Wytypowano 222 markery SSR, spośród których 160 przetestowano na liniach rodzicielskich i wybranych RIL. Potwierdzono polimorfizm dla 103 markerów SSR (64,4%), zaś dla 52 z nich wykazano przydatność do konstrukcji mapy genetycznej populacji Gy14 × B10 i mapowania genów odporności na kanciastą plamistość liści ogórka. Wstępnie wskazano, że marker SSR00398 zlokalizowany na chromosomie 5 może być sprzężony z genem odporności na tę chorobę
Wspomnienie - Profesor Dr Hab. Maria Rakowska
No full textMemory - Professor Dr. Hab. Maria RakowskaWspomnienie - Profesor Dr Hab. Maria Rakowsk
Selekcja rodów hodowlanych jęczmienia jarego na podstawie analizy statystycznej trzyletniej serii doświadczeń
Get PDFIn this paper the results of the analysis of three year breeding trial cycle with lines of spring barley is presented. Single replication, pre-preliminary and preliminary trials were conducted in the 2008, 2009 and 2010 respectively. The analyzed trials were conducted at the plant breeding station in Polanowice (Małopolska Hodowla Roślin). The presented conception of description of the results of the trial series with breeding lines and controls is based on an extensive use of the statistical methods. This approach enables a holistic view on the results of the conducted trials for the spring barley lines both from given breeding station and from different experimental stations. The analysis made it possible to show a small variation between the yields of breeding lines in a the not replicated trial. Variation between lines can be demonstrated when more advanced statistical methods, such as analysis of variance of augmented designs, analysis of variance of hierarchical designs or analysis of many years of trials, are used. On the basis of the three year synthetic evaluation of genotypes, which were bred in Polanowice, the interaction genotype × year has been shown by the revealed instability in yielding. A separate analysis of each year of the trials may result in the loss of valuable genotypes.W pracy przedstawiono wyniki analizy trzyletniego cyklu doświadczeń hodowlanych z rodami jęczmienia jarego. Były to: doświadczenie jednopowtórzeniowe, przedwstępne i wstępne wykonane odpowiednio w 2008, 2009 i 2010 roku przeprowadzone w stacji Hodowli Roślin w Polanowicach (Małopolska Hodowla Roślin). Przedstawiona w pracy koncepcja opracowania wyników serii doświadczeń z nowymi rodami oparta jest na szerokim wykorzystaniu metod statystycznych. Takie podejście umożliwia całościowe spojrzenie na wyniki doświadczeń przeprowadzonych dla rodów jęczmienia jarego z jednej stacji hodowli jak również rodów pochodzących z różnych stacji doświadczalnych. Przeprowadzona analiza wykazała małe zróżnicowanie pomiędzy plonami rodów badanych w doświadczeniu jednopowtórzeniowym. Uwypuklenie zróżnicowania pomiędzy rodami można uzyskać poprzez zastosowanie bardziej zaawansowanych metod statystycznych takich jak analiza wariancji doświadczeń ze wzorcami, analiza wariancji układów hierarchicznych (z powtórzeniami), analiza doświadczeń wieloletnich. Trzyletnia syntetyczna ocena genotypów pochodzących z hodowli Polanowice wykazała występowanie interakcji genotyp × lata objawiającą się niestabilnością w plonowaniu. Oddzielne analizowanie każdego roku badań może spowodować utratę cennych genotypów
Uzyskiwanie haploidów i ocena zmienności cech ilościowych linii dihaploidalnych jęczmienia jarego z wykorzystaniem metody Hordeum bulbosum i mutagenezy
Get PDFIn performed studies on the use of mutagenesis in DH system, the seeds of malting barley cultivar Rudzik were treated with laser light and chemomutagen — N-methyl-N-nitroso urea (MNU). The plants grown from the treated plants were crossed with Hordeum bulbosum. The effectiveness of haploid production was measured by proportion of the obtained seeds to the number of pollinated florets and number of haploids to number of pollinated florets and immature embryos transferred to in vitro culture. The obtained results as compared to control (non-treated seeds) indicates that the applied dose of MNU decreased the effectiveness of haploid production. In result of diploidization, a numerous DH plants were obtained which were propagated and used for estimation of quantitative traits variability in a field trial. The use of multivariate statistical method indicates that DH lines were characterized by a broader range of traits variability in comparison with their initial cultivar Rudzik.W badaniach nad wykorzystaniem mutagenezy w systemie DH, ziarniaki browarnej odmiany jęczmienia jarego Rudzik naświetlano biostymulującą dawką światła lasera a następnie poddawano działaniu chemomutagenu — N-metylo-N-nitrosmocznika (MNU). Otrzymane rośliny krzyżowano z Hordeum bulbosum a efektywność uzyskiwania haploidów mierzono stosunkiem liczby uzyskanych ziarniaków do liczby zapylonych kwiatów oraz liczby haploidów do liczby zapylonych kwiatów i wykładanych na pożywkę niedojrzałych zarodków. Uzyskane wyniki w porównaniu z kombinacją kontrolną (bez traktowania mutagenem) wykazały, że mutagen wpływał na obniżenie wartości wyżej wymienionych parametrów. Linie dihaploidalne (DH) uzyskane w wyniku podwajania liczby chromosomów rozmnażano, a następnie w warunkach pola doświadczalnego analizowano zmienność ich cech ilościowych, głównie plonotwórczych w porównaniu z kombinacją kontrolną. Wykorzystując wielocechową analizę statystyczna wykazano poszerzenie zakresu zmienności ocenianych cech linii DH w porównaniu z ich odmianą wyjściową Rudzik
Using SSR markers for assessment genetic diversity and detection drought escape candidate genes in barley lines (Hordeum vulgare L.)
Get PDFAssessment of genetic diversity using molecular markers is one of the primary and important steps in breeding programs. In this study, genetic diversity of 52 barley lines evaluated using 68 SSR primer pairs and 47 primer pairs produced clear and polymorphic banding pattern. In general, 153 polymorphic alleles de-tected. The number of observed polymorphic alleles varied from 2 to 9, with an average of 3.26 alleles per locus. Polymorphic Information Content (PIC) ranged from 0.07 to 0.81, with an average of 0.45. In this research, SSR markers differentiated the studied lines efficiently. Using cluster analysis, studied barley lines divided into two groups. Genetic diversity was relatively corresponding with geographical origins, because the lines related to a country somewhat diverged from each other. Two-rowed Iranian and Chinese barleys classified in one subgroup. Also, most six-rowed barleys classified in one subgroup. Association mapping analysis was used to identify candidate genes for drought escape in barley lines and 16 informative markers were identified after which confirmation in other tests could be suitable for marker assisted breeding drought escape
Genetic diversity among ethiopian coffee (Coffea Arabica L.) collections available in indian gene bank using sequence related amplified polymorphism markers
Get PDFThe South-Western highlands of Ethiopia are considered to be the centre of origin and diversity of the arabica coffee, Coffea arabica. More than 80 accessions of arabica coffee collected from Ethiopia are avail-able in Indian gene bank. However, the genetic diversity of these accessions is not studied in detail. In the present study, genetic diversity analysis of 48 accessions collected from eight provinces of Ethiopia was car-ried out using Sequence-related amplified Polymorphism (SRAP) marker. Among the thirty two SRAP primer combinations tested, 14 primer pairs were polymorphic and generated 203 distinct fragments. The number of fragments ranged from 7 to 21 with a mean of 14.5 fragments per primer combination. Of the total 203 ampli-fied fragments, 182 (89.65%) were polymorphic and the percent of polymorphism ranged from 53.84% to a maximum of 100% using different primers. The average resolving power (Rp) and average polymorphism information content (PIC) of the 14 SRAP primer combinations was 14.31 and 0.648 respectively. A total of 13 rare alleles were obtained from SRAP assays, of which six rare alleles were obtained from the accessions collected from Shoa province.The UPGMA clustering algorithm from SRAP analysis grouped the 48 coffee accessions into two major clusters. The accessions collected from particular province clustered together which could be attributed to the substantial gene flow between adjacent population and the influence of geographical origin on genetic diver-sity. The study demonstrated the existence of substantial genetic variation in Ethiopian germplasm which could be utilized in coffee germplasm conservation and improvement program
Porównanie metod selekcji genotypów jęczmienia jarego na podstawie doświadczeń jednopowtórzeniowych
Get PDFThe paper deals with the methodology of inference from non-replicated breeding experiments using standard treatments (check plots). The selection of genotypes for further breeding is one of the important problems of this methodology. In the literature, there are many proposals of genotype selection methods. It is impossible to compare analytically those methods. Hence, we propose to compare six selection methods known from a literature with the method proposed by the authors. The last method is based on the theory of response surface. We compare the rankings of genotypes obtained by the all methods on the basis of the experiment with spring barley. We can see that the rankings are completely different. In the paper we recommend the selection methods based on the response surface methodology with proper using check plots.Praca dotyczy metodyki analizowania doświadczeń genetyczno-hodowlanych jednopowtórzenio-wych z wykorzystaniem obiektów wzorcowych. Celem takiej analizy jest, między innymi, selekcja genotypów do dalszych badań. W literaturze istnieje wiele propozycji metod selekcji genotypów. W pracy dokonujemy porównań wybranych z literatury sześciu metod selekcji z metodą propono¬waną przez autorów opartą na teorii powierzchni reakcji. Powyższych metod nie można porównać analitycznie. Jedynym sposobem jest porównanie rankingów genotypów uzyskanych wszystkimi rozważanymi metodami na podstawie tego samego doświadczenia. Porównania tego dokonujemy na podstawie doświadczenia z jęczmieniem jarym. W pracy rekomendujemy metodę selekcji opartą na teorii powierzchni reakcji z wykorzystaniem poletek kontrolnych
Ochrona ziemniaka zgodna z zasadami integrowanej ochrony roślin. Część I. Niechemiczne metody ochrony
Get PDFSince 1st January of 2014, all countries of the European Union are under an obligation to apply the principles of Integrated Pest Management (IPM) in accordance with Directive 2009/128/EC and Regulation No 1107/2009. In this paper the definitions relating to the integrated pest management are discussed and the differences between the IPM (integrated plant protection) and the IP (integrated plant production) are defined. More fungicides are applied to protect potato crops than in any other crop. Integrated management therefore requires a combination of management techniques in order to keep fungal and bacterial pathogens, pests and weeds at low levels and at the same time to maintain the quality of the environment. The results of long-term experiments carried out by a team of authors and the literature data allowed to arrange the most important, non-chemical elements of the IPM of applied in potato crops at all stages of its development. Control measures can be divided in strategic and tactical measures. Strategic measures (non-chemical methods), aiming at reducing the occurrence of agrophages and the infection pressure, such as rotation, fertilization, cultivar choice and measures to limit primary inoculum sources, are presented in this part of the work.Od 1. stycznia 2014, wszystkie kraje Unii Europejskiej zobowiązane są do stosowania zasad Integrowanej Ochrony Roślin (IPM), zgodnie z dyrektywą 2009/128/WE oraz rozporządzeniem nr 1107/2009. W pracy omówiono definicje dotyczące integrowanej ochrony roślin i określono różnice między IPM (integrowaną ochroną roślin) a IP (integrowaną produkcją roślin). W ochronie upraw ziemniaka stosuje się więcej fungicydów niż w innych uprawach. Zintegrowana ochrona wymaga zatem połączenie różnych metod postępowania, aby utrzymać niski poziom grzybowych i bakteryjnych patogenów, szkodników i chwastów i jednocześnie zachować dobrą jakość środowiska. Wyniki wieloletnich badań prowadzonych w uprawach ziemniaka przez zespół autorów oraz dane literaturowe pozwoliły uszeregować ważne elementy integrowanej ochrony ziemniaka, wykorzy¬stywane w uprawach ziemniaka na wszystkich etapach jego rozwoju. Działania stosowane w ochronie można podzielić na działania strategiczne i taktyczne. Działania strategiczne (niechemiczne metody) mające na celu zmniejszenie nasilenia i presji agrofagów wykorzystujące elementy, takie jak płodo¬zmian, nawożenie, wybór odmiany i działania ograniczające źródła infekcji zostały przedstawione w tej części pracy