SCRIPTORIUM (Université de Moncton)
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MalBERTv2: Code aware BERT-Based Model for Malware Identification
No full textTo proactively mitigate malware threats, cybersecurity tools, such as anti-virus and anti-malware software, as well as firewalls, require frequent updates and proactive implementation. However, processing the vast amounts of dataset examples can be overwhelming when relying solely on traditional methods. In cybersecurity workflows, recent advances in natural language processing (NLP) models can aid in proactively detecting various threats. In this paper, we present a novel approach for representing the relevance and significance of the Malware/Goodware (MG) datasets, through the use of a pre-trained language model called MalBERTv2. Our model is trained on publicly available datasets, with a focus on the source code of the apps by extracting the top-ranked files that present the most relevant information. These files are then passed through a pre-tokenization feature generator, and the resulting keywords are used to train the tokenizer from scratch. Finally, we apply a classifier using bidirectional encoder representations from transformers (BERT) as a layer within the model pipeline. The performance of our model is evaluated on different datasets, achieving a weighted f1 score ranging from 82% to 99%. Our results demonstrate the effectiveness of our approach for proactively detecting malware threats using NLP techniques.udemauteur: Moulay Akhlouf
Effets de la perméabilité du paysage et de la condition physique des individus sur le mouvement de parulines couronnées (seiurus aurocapilla) suivant une translocation expérimentale
No full textIl s'avère parfois complexe de comparer les effets de la perte d'habitat et ceux de la fragmentation d'habitat, car ces deux processus se produisent presque toujours simultanément. Dans des habitats fragmentés, certaines études ont montré que la quantité d'habitat a un effet plus grand sur la persistance des populations et la richesse spécifique que la fragmentation, tandis que d'autres études montrent que si les fragments sont bien connectés, les populations peuvent persister grâce, par exemple, à l'effet de sauvetage. D'autres études ont montré que les individus de certaines espèces peuvent se déplacer d'un fragment à un autre afin d'obtenir les ressources nécessaires à leur survie. Or, des obstacles au mouvement, tels que la réticence à travers certains types de milieux, pourraient avoir des effets néfastes sur la capacité d'un individu à obtenir ces ressources, comme la nourriture, un partenaire ou, dans des paysage très fragmentés, un territoire.
Afin d'étudier la perméabilité de divers types de matrices au mouvement d'espèces animales, plusieurs chercheurs ont utilisé les translocations expérimentales, soit le déplacement et la relâche d'individus à une certaine distance de leur territoire afin de mesurer leur temps de retour. Or, la distance sur laquelle les individus sont déplacés n'est pas toujours représentative de leur capacité de dispersion. De plus, ces études ne tiennent pas compte de l'effet potentiel de la variabilité interindividuelle, par exemple en termes de condition physique, sur la vitesse de retour. Afin de mieux comprendre les effets de la fragmentation des habitats sur les mouvements des individus, il semble important d'effectuer des translocations expérimentales sur une distance qui représente mieux la capacité de dispersion de l'espèce à l'étude.
Cette thèse visait à déterminer si la structure du paysage et la condition physique des individus ont un impact sur le taux de retour chez la Paruline couronnée (Seiurus aurocapilla) suite à une translocation expérimentale sur une distance de 24 à 27 km. Afin d'estimer la condition corporelle des individus, j'ai utilisé la méthode d'eau deutérée («hydrogen isotope-labeled water (D20)»). Cette technique consiste à injecter une quantité connue d'eau deutérée qui sera ensuite diluée par l'eau contenue dans l'oiseau, ce qui permet d'estimer l'eau corporelle totale, qui est elle-même étroitement liée à la masse maigre.
Durant l'été 2017, j'ai capturé 45 Parulines couronnées mâles pour fins de translocation. Immédiatement après la capture, chaque individu a reçu une injection de 50 uL de D20 99.9% dans le muscle pectoral à l'aide d'une seringue à tuberculine de 1/2 ml (27G). Ensuite, chaque individu a été placé dans un sac en coton opaque et transporté par véhicule jusqu'au site de relâche. Une heure après l'injection, environ 15 uL de sang ont été prélevés de la veine brachiale à l'aide d'une aiguille 27G et d'un tube capillaire. De ces 45 individus, 38 sont revenus à leur territoire en mois de 15 jours (moyenne: 6 jours; minimum :< 1 jour; maximum : 15 jours). Des 45 individus qui ont été transloqués, 6 ont dû être exclus de l'analyse, car leur masse maigre estimée n'était pas biologiquement plausible. Cela est possiblement dû à une injection qui a été mal effectuée.
Aucune des variables considérées, soit la proportion d'habitat, l'indice de condition physique, la distance moyenne entre parcelles d'habitat, etc., n'est ressortie comme ayant un impact significatif sur le temps de retour, puisque le modèle nul s'est avéré le plus performant. Il est possible que le contraste entre les types de milieux dans le paysage de mon étude n'ait pas été suffisamment grand pour influencer les déplacements, contrairement <a ce qui est le cas dans les forêts fragmentées par une matrice agricole, par exemple. Bien qu'une étude effectuée dans la même région indiquait que les Parulines couronnées se déplaçaient moins facilement à travers des paysages dominés par des plantations de conifères, les individus transloqués pour la présente étude l'ont été sur une distance de 24 à 27 km, contre 5-6 km dans l'étude précédente. Le fait que nous n'ayons pas détecté un effet de la composition du paysage dans la présente étude demeure inexpliqué, mais pourrait refléter des différences dans le type de mouvement effectué sur 25 km par rapport à ceux effectués sur des distances plus courtes.thesis: M. Sc. (biologie) Université de Moncton 202
A novel detail injection framework using latent low-rank decomposition for multispectral pan-sharpening
No full textA novel framework for pansharpening based on Latent Low-Rank Representation theory, called Detail injection using Latent Low-Rank decomposition based Pansharpening approach (DiLRP), is proposed. Our proposal comprises two fusion stages. In the first step, a primary joint fusion scheme is defined as a combination of low-rank and saliency images, which is used further for extracting spatial details. In this model, the histogram-matched PAN and up-sampled images are decomposed into low-rank and saliency components, and the corresponding fusion strategies are designed according to their characteristics. Indeed, to preserve more global structural information, low-rank components are combined by an optimized weighted average fusion strategy to generate a low-rank image. Furthermore, the saliency image is obtained by a simple average fusion rule in order get high-frequencies details (i.e., edges) that are highly relevant to MS image. The second stage consists in injecting (globally or locally) the high-frequency details, extracted from the reconstructed primary joint fused image using a multi-scale approach, into the up-sampled MS image. The performances of the proposed method have been studied both at reduced resolution and at full resolution. Three different datasets, acquired by the QuickBird, Pléaides-1A and WorldView-2 sensors, are used for validation. Compared with several well-known algorithms, experimental results reveal the validity and the advantages of the proposed DiLRP method.udemauteur: Habib Hama
A Review of Intimate Partner Violence Interventions Relevant to Women During the COVID-19 Pandemic
No full textWomen have experienced increased rates of intimate partner violence (IPV) since the onset of the COVID-19 global pandemic, and at the same time requirements for physical distancing and/or remote delivery of services have created challenges in accessing services. We synthesized research evidence from 4 systematic reviews and 20 individual studies to address how IPV interventions can be adapted within the context of the pandemic. As many interventions have been delivered via various technologies, access to technology is of particular importance during the pandemic. Our results can inform the provision of services during the remainder of the COVID-19 pandemic including how to support women who have little access to in-person services.udemauteur: Suzanne Dupuis-Blanchar
Satisfaction du couple et troubles psychologiques chez les hommes ayant participé au programme de psychoéducation CoeurAl'Esprit® après avoir vécu un syndrome coronarien aigu
Get PDFCette thèse de maîtrise ès arts en psychologie (M.A.Ps.) a étudié les effets de la satisfaction du couple et d’une intervention de psychoéducation précoce, axée sur le couple et adaptée aux hommes, sur la dépression et l’anxiété en post-syndrome coronarien aigu. Un échantillon de base de 50 patients masculins a été suivi sur une période de 12 mois et a complété le Couples Satisfaction Index et le Depression Anxiety and Stress Scale. Les résultats ont révélé une amélioration significative des symptômes de dépression de T0 à T1, au cours de laquelle tous les participants ont complété l’intervention de psychoéducation CœurAl’Esprit®. De plus, une analyse de régression hiérarchique a montré que la satisfaction du couple est un prédicateur important de cette amélioration des symptômes de dépression. Nos résultats suggèrent que les partenaires de vie devraient être activement impliqués dans les interventions de psychoéducation pour augmenter le bien-être psychologique
When host populations move north, but disease moves south: Counter-intuitive impacts of climate change on disease spread
No full textEmpirical observations and mathematical models show that climate warming can lead to the northern (or, more generally, poleward) spread of host species ranges and their corresponding diseases. Here, we consider an unexpected possibility whereby climate warming facilitates disease spread in the opposite direction to the directional shift in the host species range. To explore this possibility, we consider two host species, both susceptible to a disease, but spatially isolated due to distinct thermal niches, and where prior to climate warming the disease is endemic in the northern species only. Previous theoretical results show that species distributions can lag behind species thermal niches when climate warming occurs. As such, we hypothesize that climate warming may increase the overlap between northern and southern host species ranges, due to the northern species lagging behind its thermal tolerance limit. To test our hypothesis, we simulate climate warming as a reaction-diffusion equation model with a Susceptible-Infected (SI) epidemiological structure, for two competing species with distinct temperature-dependent niches. We show that climate warming, by shifting both species niches northwards, can facilitate the southward spread of disease, due to increased range overlap between the two populations. As our model is general, our findings may apply to viral, bacterial, and prion diseases that do not have thermal tolerance limits and are inextricably linked to their hosts distributions, such as the spread of rabies from arctic to red foxes.udemauteur: Nicolas Lecomt
Apprentissage profond et la radiomique pour la détection du cancer du sein
Get PDFLe cancer du sein est un type de cancer qui se développe dans les cellules du sein. Il peut survenir chez les hommes mais il est beaucoup plus fréquent chez les femmes. Le cancer du sein peut être détecté par des techniques d’imagerie médicale pour examiner le tissu mammaire à la recherche de tout signe de cancer. Les méthodes de dépistage du cancer du sein les plus courantes sont la mammographie, la thermographie, l’échographie et l’imagerie par résonnance magnétique. Les radiologues jouent un rôle essentiel dans la détection du cancer du sein en analysant des images médicales et en identifiant toute anomalie ou tout signe de cancer. Ils sont chargés d’interpréter les images de dépistage, de faire des recommandations pour une imagerie supplémentaire ou des tests supplémentaires et de fournir des conseils aux autres professionnels de la santé impliqués dans les soins du patient. Dans le domaine de l’intelligence artificielle (IA), l’apprentissage profond peut aider les radiologues de plusieurs façons. L’un des principaux avantages de l’apprentissage profond est sa capacité à analyser et à détecter des ressemblances dans de grandes quantités de données d’imagerie médicale, ce qui peut être long et difficile à faire manuellement pour les radiologues. Dans ce travail, nous avons d’abord présenté une revue de littérature détaillée des avancées récentes des modèles d’apprentissage profond pour la détection du cancer du sein en utilisant différentes méthodes de dépistage. Ensuite, une nouvelle approche basée sur la détection du cancer du sein a été proposée pour segmenter les régions mammaires des thermogrammes et les classifier en trois classes (saine, malade et inconnue). Nous avons par la suite développé un système de détection des masses mammaires qui utilise des techniques récentes de détection d’objets par apprentissage profond. Le système utilise des techniques de prétraitement des images pour améliorer la qualité des images de mammographies et ensuite deux détecteurs d’objets profonds récents pour détecter les masses mammaires. Mots-clés : Cancer du sein; Mammographie; Thermographie; Apprentissage profond; Réseaux de neurones convolutifs
Plant size, latitude, and phylogeny explain within-population variability in herbivory
No full textLes interactions entre les plantes et les herbivores jouent un rôle central dans la plupart des écosystèmes, mais leur intensité varie considérablement. Cependant, notre compréhension de ce qui influence cette variabilité est limitée en raison du manque de données. Nous avons réalisé des enquêtes standardisées sur l'herbivorie pour 503 espèces de plantes dans 790 sites répartis à travers le monde. Avec ces données, nous démontrons que la variabilité au sein des populations en ce qui concerne l'herbivorie augmente avec la latitude, diminue avec la taille de la plante, et suit une structure phylogénétique. Ainsi, les différences dans l'ampleur de la variabilité sont essentielles pour comprendre comment la biologie plante-herbivore varie à travers les gradients spatiaux très grands. Mettre davantage l'accent sur la variabilité des interactions trophiques dans la recherche contribuera à une meilleure compréhension de la biologie plante-herbivore, de la stabilité écologique à l'évolution de la défense des plantes.
Interactions between plants and herbivores are central in most ecosystems, but their strength is highly variable. The amount of variability within a system is thought to influence most aspects of plant-herbivore biology, from ecological stability to plant defense evolution. Our understanding of what influences variability, however, is limited by sparse data. We collected standardized surveys of herbivory for 503 plant species at 790 sites across 116° of latitude. With these data, we show that within-population variability in herbivory increases with latitude, decreases with plant size, and is phylogenetically structured. Differences in the magnitude of variability are thus central to how plant-herbivore biology varies across macroscale gradients. We argue that increased focus on interaction variability will advance understanding of patterns of life on Earth.udemauteur: Lecomte, Nicola
The transcription factors Junb and Fosl2 cooperate to regulate Cdh3 expression in 15P‐1 Sertoli cells
No full textIn Sertoli cells of the testis, cadherins (Cdh) are important cell-to-cell interaction proteins and contribute to the formation of the blood-testis barrier being essential for germ cells' protection. P-cadherin or Cdh3 is only expressed in Sertoli cells from embryonic to prepubertal development. Interestingly, the expression profile of Cdh3 correlates with that of activating protein-1 (AP-1) transcription factors during Sertoli cells development. To assess their potential implications in the regulation of Cdh3, different AP-1 transcription factors were overexpressed in 15P-1 Sertoli cells. We found that the overexpressions of Junb and Fosl2 activated Cdh3 promoter. ChIP-qPCR assay and luciferase reporter assay with 5′ promoter deletions and site-directed mutagenesis confirmed the recruitment of Junb and Fosl2 to an AP-1 regulatory element at -47 bp in the proximal region of Cdh3 promoter in 15P-1 cells. These findings were further supported by histone modification markers and chromatin accessibility surrounding Cdh3 promoter in mouse testis. Moreover, the knockdowns of Junb and/or Fosl2 by siRNA decreased Cdh3 protein levels. Taken together, these data suggest that in 15P-1 Sertoli cells, the AP-1 family members Junb and Fosl2 are responsible for the regulation of Cdh3 expression, which requires the recruitment of both factors to the proximal region of the Cdh3 promoter.udemauteur: Ha T Nguyen; Luc J Marti
Transformer models used for text-based question answering systems
No full textThe question answering system is frequently applied in the area of natural language processing (NLP) because of the wide variety of applications. It consists of answering questions using natural language. The problem is, in general, solved by employing a dataset that consists of an input text, a query, and the text segment or span from the input text that provides the question’s answer. The ability to make human-level predictions from data has improved significantly thanks to deep learning models, particularly the Transformer architecture, which has been state-of-the-art in text-based models in recent years. This paper reviews studies related to the use of transformer models in the implementation of question-answering (QA) systems. The paper’s first focus is on the attention and transformer models. A brief description of the architectures is presented by classifying them into models based on encoders, decoders, and on both Encoder-Decoder. Following that, we examine the most recent research trends in textual QA datasets by highlighting the architecture of QA systems and categorizing them according to various criteria. We survey also a significant set of evaluation metrics that have been developed in order to evaluate the models’ performance. Finally, we highlight solutions built to simplify the implementation of Transformer models.udemauteur: Moulay Akhlouf