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Contributions to Metagenomics: Classification, Dynamics and Applications.
Get PDFA microbiome is a community of microorganisms that inhabit a particular environment like soils, oceans or the human body. Those communities are made of a trillion of
microorganisms divided into a dozen or even hundreds of different species which interacts among them. The community behaves as a complex adaptive system and fluctuates
in response to changes in environmental factors such as acidity, pressure, temperature
or, when are host related it is sensible to perturbations like antibiotics, changes in the
diet and lifestyle factors. The recovery of the genetic material of the microbial communities directly from their environment, the classification and study of these samples is
called Metagenomics. The digitalization of the genetic material is done by high throughput sequencing technologies, such as Illumina which shreds the DNA into fragments
called reads.
In the first part of this work we propose a alignment-free method capable of assign
taxa to each read in a metagenomic sample by analyzing the statistical properties of the
reads. Given an environment, we collect genomes from public available databases and
generate synthetic genomic fragments libraries. Then, statistics of k-mer frequencies
are computed and stored in an environment-associated dataset used to build a robust
machine learning procedure based on multiple CART trees.
In the second part we study the dynamics of a gut microbiome under antibiotic
perturbation and Clostridium difficile infection (CDI). Here, interactions play a key role
in the development of the disease. Using a previously Boolean network model for CDI
we demonstrate that this model is in fact a threshold Boolean network (TBN). Once
the TBN model is set, we further explore the space of possible interactions generating
an evolutionary algorithm to identify alternative TBNs. Allowing the construction of a
neutral space conformed by a set of models that differ in their interactions, but share the
final community states of the gut microbiome under antibiotic perturbation and CDI.
We organize the resulting TBNs into clusters that share similar dynamic behaviors and
the most relevant interactions are identified. Finally, we discuss how these interactions
can either affect or prevent CDI.
In the third part we examined the microbial community across a transect of few
kilometers long, where there is a remarkable abiotic variations like pH, temperature and
humidity gradient, with acidic soils, to name a few. We studied the compositional structure of the community and constructed two co-occurrence networks representing two
sections that divided the transect. Using network analysis, we examined changes in putative ecological interactions among microbial Operational Taxonomic Units (OTUs), as
well as their associations to physicochemical and nutritional variables. Network comparisons allowed us to examine the nature of the ecological rearrangements that take
place in the microbial community when facing contrasting environments. L-GRAAL,
the graph alignment method we used provides a comprehensive way to understand
topological shifts among members from two networks. We show here that this method
provides a glimpse into the nature of the changes in microbial communities that can
foster resistance and resilience to contrasting environmental conditions
Boletín informativo N° 19 Año 2021 (Septiembre).
No full textEn el Registro Público de Sanciones de la Superintendencia de Educación Superior (SES), se encuentran disponible las primeras Instituciones de Educación Superior sancionadas (IES) por la SES, en el marco del Plan de Fiscalización. El pasado 5 de agosto de 2021, el Senado ingresó un proyecto de ley que tiene por finalidad introducir una normativa más actualizada en lo que dice relación con salud mental. Por medio de una moción presentada por la Cámara de Diputados, el 17 de agosto de 2021 ingresó un proyecto de ley que busca modificar el Código Penal, en el
sentido de incorporar la tipificación de acoso sexual calificado, estableciendo además las sanciones a las cuales estarán expuestos quienes incurran en estas conductas.Resultados plan de fiscalización Superintendencia de Educación Superior. --Ingresa proyecto de ley que crea el Estatuto de aseguramiento, protección y promoción de la salud mental. --Ingresa proyecto de ley para tipificar el delito de acoso sexual calificado
Los convidados de piedra.
No full textEn el siguiente afiche se ilustra la portada de la novela: Los convidados de piedra. Obra que plantea una investigación en la historia de una sociedad chilena agónica, en la que se evidencia la ruptura del "orden de las familias" que supone una revolución en la que los transgresores sufren y los que no, se sienten amenazados.Buen estado de conservació
Ludwid Erhard.
No full textVisita del economista Ludwid Erhard a la Escuela de Negocios en el año 1969 (Fotografía blanco y negro).Buen estado de conservació
Boletín informativo N° 7 Año 2020 (Octubre).
No full textNuestro sistema de educación superior descansa en una serie de principios transversales que deben inspirar su funcionamiento y regulación, estos principios son recogidos en varias leyes. En este documento se presentan los principios de: participación, transparencia e inclusión dando a conocer la forma en que estos se incorporan en la UAI.Participación, transparencia e inclusión en educación superior. -- Principio de participación. -- Participación en la UAI. -- Principio de transparencia. -- Transparencia en la UAI. -- Principio de inclusión. -- Inclusión en la UAI
Fundación Adolfo Ibáñez.
No full textLos apuntes que siguen están dedicados a los alumnos y a los profesores de la Escuela de Negocios de Valparaíso. A los que han sido y a los que serán. Unos han contribuido a perfilar su espíritu y forjar su estilo. Los que vengan habrán de fortalecer los propósitos que la han distinguido y prestigiado.
Porque la Escuela de Negocios es-y no puede sino ser-una idea que persiste, una finalidad que los embates del tiempo consolidan.
Es éste, pues, el relato de un ideal que alcanzada su realización, se proyecta hacia el futuro con fidelidad y vigor.Buen estado de conservació
Boletín informativo N° 23 Año 2021 (Octubre).
No full textEl 29 de septiembre de 2021, se publicó en el Diario Oficial la “Ley Dominga”, la cual tiene por objeto apoyar a los padres y madres que han sufrido la muerte gestacional o perinatal de un hijo(a). El 30 de septiembre de 2021, se publicaron en el Diario Oficial siete resoluciones que contienen nuevos Criterios y Estándares de calidad definidos por la Comisión Nacional de Acreditación (CNA), que entrarán a regir a contar del 01 de octubre del año 2023. El 27 de julio de 2021, se publicó la Ley N° 21.361, la cual modifica el Código del Trabajo en materia de documentos electrónicos laborales.Se publica ley que establece medidas especiales en caso de muerte gestacional o perinatal ("Ley Dominga"). --Nuevos criterios y estándares en materia de acreditación de la Comisión Nacional de Acreditación. -- Ley N° 21.361, que adecua el Código del trabajo en materia de documentos electrónicos laborales y resolución exenta N° 1340/2021, de la Dirección del trabajo
Fotografía de Jorge Edwards junto a dos hombres.
No full textEn la fotografía se puede apreciar a Jorge Edwards manteniendo una conversación con dos personas.Buen estado de conservació
Visita del Doctor Friederich Von Hayek
No full textVisita a la Escuela de Negocios del Premio Nobel Doctor Friederich Von Haye en 1997.
De izquierda a derecha: Pedro Ibáñez Ojeda, Friederich Von Hayek y Carlos Cáceres. (Fotografía en blanco y negro).Buen estado de conservació