HAL ENVT (Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse)
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Attitudes of Australian Veterinary Professionals to Diagnosing and Managing Canine Cognitive Dysfunction
No full textInternational audienceCanine cognitive dysfunction (CCD) is a neurodegenerative disease similar to Alzheimer's disease (AD) likely to affect 14% to 35% of dogs over the age of eight years. Clinical signs are highly varied and include inactivity, inattention, anxiety, incontinence, wandering, and sleep-wake cycle disorder. The aim of this study was to determine how veterinary professionals (veterinarians and veterinary nurses/technicians) manage CCD and their attitudes towards the disease using an anonymous online survey. Veterinarians diagnosed CCD based on their own experience or by excluding other diseases and mostly diagnosed a few cases per year or a few in their career. CCD was managed using specific medication, diet adjustments, or environmental changes. Although veterinary professionals are aware of CCD, the low rate of diagnosis suggests many dogs are undiagnosed. Increased awareness of the disease by the veterinary profession will enhance human and dog welfare
PITX2 expression and Neanderthal introgression in HS3ST3A1 contribute to variation in tooth dimensions in modern humans.
No full textInternational audienceDental morphology varies greatly throughout evolution, including in the human lineage, but little is known about the biology of this variation. Here, we use multiomics analyses to examine the genetics of variation in tooth crown dimensions. In a human cohort with mixed continental ancestry, we detected genome-wide significant associations at 18 genome regions. One region includes EDAR, a gene known to impact dental features in East Asians. Furthermore, we find that EDAR variants increase the mesiodistal diameter of all teeth, following an anterior-posterior gradient of decreasing strength. Among the 17 novel-associated regions, we replicate 7/13 in an independent human cohort and find that 4/12 orthologous regions affect molar size in mice. Two association signals point to compelling candidate genes. One is ∼61 kb from PITX2, a major determinant of tooth development. Another overlaps HS3ST3A1, a paralogous neighbor of HS3ST3B1, a tooth enamel knot factor. We document the expression of Pitx2 and Hs3st3a1 in enamel knot and dental epithelial cells of developing mouse incisors. Furthermore, associated SNPs in PITX2 and HS3ST3A1 overlap enhancers active in these cells, suggesting a role for these SNPs in gene regulation during dental development. In addition, we document that Pitx2 and Hs3st3a1/Hs3st3b1 knockout mice show alterations in dental morphology. Finally, we find that associated SNPs in HS3ST3A1 are in a DNA tract introgressed from Neanderthals, consistent with an involvement of HS3ST3A1 in tooth size variation during human evolution
Pivotal Role of Mass Spectrometry for the Assessment of Exposure to Reactive Chemical Contaminants: From the Exposome to the Adductome
No full textInternational audienceA large part of the Human chemical exposome is now well characterized, and its health effects has been widely documented, although precise causal links remain difficult to establish. In parallel, genetic factors only were shown to contribute less than 30% to various pathologies. Therefore, environmental factors may represent the predominant cause of chronic diseases. Mass Spectrometry has been established for many years as a main "gold standard" in this field due to its performances both in sensitivity and selectivity. However, some unstable or highly reactive compounds may escape their detection in the biological samples because of their short half-life although some of their stable metabolites, if any, can be used for the exposure assessment. These electrophilic molecules are known to bind covalently to nucleophilic molecules in the body to form what are commonly called adducts. The study of adducts formed with DNA, proteins or with glutathione, nowadays called adductomics, can provide additional toxicologically relevant information in biomonitoring studies. This review describes this particular part of the reactive exposome and the related mass spectrometric methods developed therein. Three dedicated parts of this review are devoted to the contribution of mass spectrometry respectively to the assessment of DNA modifications, protein modifications, and reaction with glutathione
Strong genotype-by-environment interaction across contrasted sites for summer mortality syndrome in the Pacific oyster Crassostrea gigas
No full textInternational audienceGenotype-by-environment (GxE) interaction in aquaculture is usually estimated for continuous traits and based on data from a limited number of 2-3 rearing sites. Here we report the results of a GxE study for resistance to Pacific oyster mortality syndrome (POMS), a multi-factorial disease that severely impacts Pacific oyster production worldwide. The syndrome is largely associated with Ostreid Herpes Virus 1 (OsHV-1). Resistance to OsHV-1 in Crassostrea gigas has been shown to be heritable, meaning that selective breeding is a suitable strategy for reducing mortalities. However, limited information was available about GxE interaction or the possible need to consider it in selective breeding. Survival of two cohorts (C1 and C2), consisting of a total of 104 full-sib families, was evaluated during the summer of 2013 in 7 sites along the French Atlantic, Channel and Mediterranean coasts. Mean survivals in autumn 2013 were 12.6% ± 10.9 and 4.6% ± 6.4 for C1 and C2, respectively. Genetic parameters were computed by MCMC, which is suitable for binary data like survival. Heritability estimates ranged from 0.16 to 0.42 depending on site and cohort, with a mean of 0.24 [0.20; 0.27] when including all data. GxE interactions were estimated by the genetic correlations between pairs of sites. Genetic correlations were high (ρ > 0.80) for C1 between most tidal Atlantic and Channel sites, and intermediate between tidal sites and a Mediterranean lagoon site, while they were lower and more variable for C2 (0.21-0.77). Expected genetic gains were maximal when production site was the same as selection site. They were closed to this expected maximum when the selection site was different from the production site along the Atlantic or Channel coast. Limited GxE interaction along the French Atlantic coast is favorable to wide dissemination of genetically improved oysters along this coast. Limited potential improvement was shown in the Mediterranean site if selection was carried out elsewhere, confirming the specificity of this environment. Consequently, a specific strategy such as dedicated breeding should be used to achieve genetic progress for this site.</div
Gender-Specific chemical exposure in arctic communities
No full textInternational audienceThis review explores the challenges Arctic populations face regarding contaminant exposure and its intricate relationship with traditional diets. Particular attention is given to the unique situation of northern women, whose dietary habits influence their exposure to these contaminants. Despite the recent and rapid dietary shift towards a more “westernized” diet, traditional foods remain a cornerstone of Arctic communities’ sustenance. However, the consumption of such foods, particularly marine mammals, has been consistently associated to elevated levels of lipophilic contaminants including persistent organic pollutants (POPs) and trace elements. Notable gendered differences emerge in dietary patterns, with northern women reportedly consuming fewer traditional products, thereby reducing their contaminant exposure. Additionally, women of childbearing age benefit from unique elimination pathways––through pregnancy, breastfeeding, and menstruation––that men lack. This combination of lower traditional food intake and the existence of gender-specific elimination routes has resulted in a lower contaminant burden in women compared to men. For instance, blood concentrations of organic contaminants such as polychlorinated biphenyls, organochlorine pesticides, per- and polyfluoroalkyl substances, and trace elements like lead, are on average 20 to 40% lower in women. Nevertheless, these lower contaminant levels do not necessarily imply reduced health risks, as women’s susceptibility to these substances may differ markedly from that of men
Methods to assess on-farm biosecurity in Europe and beyond
No full textInternational audienceThe aim of this study was to identify which biosecurity assessment methods (BAMs) are currently used in practice in animal farms. To address this, a structured questionnaire was developed to gather information such as the animal species, main objectives, type of enforcement, output generated and feedback of the result. In the context of the BETTER Cost Action project, country representatives identified in each of their countries which BAMs were used and completed an online survey. The survey was prepared and translated in 23 languages. Besides a descriptive analysis, clusters of BAMs were determined using a multiple correspondence analysis. Responses, collected between December 2022 and July 2023, included 74 BAMs used in 28 countries. Most of them were used in a single country while three were used in multiple countries. This study provides a comprehensive picture of existing BAMs and insights into their diversity, such as variations in objectives, implementation, evaluators, respondents, feedback, or assessment outputs. Moreover, we identified four BAMs clusters differentiated by their objective, evaluator and type of feedback provided. This study might also represent the basis for future research on strengths and weaknesses of different BAMs
Note d'appui scientifique et technique relative aux modalités de surveillance et de lutte contre la brucellose des bouquetins dans les massifs du Bargy et des Aravis
No full textAnses. (2025). Note d’AST relative aux modalités de surveillance et de lutte contre la brucellose des bouquetins dans les massifs du Bargy et des Aravis (saisine 2024-SA-0146). Maisons-Alfort : Anses, 19 p.L’Anses a été saisie le 19 juillet 2024 par la Direction générale de l’alimentation (DGAL), la Direction de l’eau et de la biodiversité (DEB) et la Direction générale de la prévention des risques (DGPR) pour la réalisation de l’appui scientifique et technique concernant une réponse préliminaire à la deuxième étape de la saisine 2024-SA-0146 relative aux modalités de surveillance et de lutte contre la brucellose chez le Bouquetin des Alpes (Capra ibex) dans les massifs du Bargy et des Aravis.La France est reconnue officiellement indemne de brucellose bovine depuis 2005, et de brucellose ovine et caprine depuis 2014 sur le territoire hexagonal, à l’exception du département des Pyrénées-Atlantiques (64) reconnu officiellement indemne en mars 2021. En 2012, un foyer bovin de brucellose à Brucella melitensis a été détecté en Haute-Savoie sur le massif du Bargy et a conduit à la découverte d’un réservoir de Brucella melitensis dans lapopulation de bouquetins de ce massif.Depuis 2012, sur le massif du Bargy, des campagnes de gestion par capture et euthanasie des bouquetins séropositifs, ainsi que des tirs, se sont succédé tous les ans. En 2013, des captures de bouquetins avec tests sérologiques ont également été conduites sur les massifs des Aravis et de Sous-Dîne, voisins du Bargy.La surveillance des espèces de ruminants sensibles chassables, i.e. le Chamois (Rupicapra rupicapra), le Cerf élaphe (Cervus elaphus) et le Chevreuil (Capreolus capreolus), est également mise en place depuis 2012 avec l’aide de la Fédération départementale des chasseurs de la Haute-Savoie. Depuis 2023, cette surveillance est également étendue sur la partie savoyarde du massif des Aravis avec l’aide de la Fédération départementale des chasseurs de la Savoie. Par ailleurs, dans ce contexte, la surveillance événementielle à travers le réseau SAGIR [1] est renforcée [2].Les mesures mises en œuvre depuis 2012 dans la population de bouquetins ont permis de faire fortement baisser la séroprévalence3 de la brucellose dans le massif du Bargy (Anses 2023).En octobre 2021, lors des opérations de surveillance renforcée des troupeaux de bovins domestiques (sérologie mensuelle), un nouveau foyer a été découvert dans un élevage bovin laitier, lié à la persistance de la brucellose dans la faune sauvage du massif du Bargy (Anses 2021).L’Anses a alors été saisie en novembre (Anses 2021) et décembre 2021 (Anses 2022) pour évaluer l’efficacité de six scénarios de lutte contre la brucellose dans la population de bouquetins du massif du Bargy. Outre cette évaluation, les experts ont rappelé dans leurs avis l’importance d’une gestion adaptative, consistant à adapter les mesures de gestion à l’évolution de la situation sanitaire, ce qui impose une surveillance continue de la situation dans les compartiments sauvage et domestique et de l’efficacité des mesures de lutte.Suite à la capture ou recapture de 135 bouquetins et à l’abattage de 61 bouquetins sur le massif du Bargy en 2022, ainsi que la découverte fortuite sur le massif des Aravis d’une étagne (femelle bouquetin) trouvée infectée par B. melitensis, l’Anses a été saisie en octobre 2022 afin de réactualiser les mesures de surveillance et de lutte sur le massif du Bargy et les mesures à mettre en place sur le massif des Aravis.Les mesures de gestion mises en place pendant la saison de capture 2023 suite à l’avis de l’Anses 2022-SA-0220 ont été renouvelées au printemps 2024. Suite aux nouvelles données recueillies sur l’évolution de la brucellose dans les populations de bouquetins des massifs du Bargy et des Aravis lors de cette saison de capture, l’avis de l’Anses a été à nouveau sollicité le 19 juillet 2024 sur les mesures de surveillance et de lutte à mettre en place dans les populations de bouquetins des massifs du Bargy et des Aravis. Un premier avis en urgence a été rendu le 31 août 2024 afin de proposer des adaptations aux mesures de gestion pour l’automne 2024 (étape 1 de la saisine) (Anses 2024).Dans les étapes 2 et 3 de la saisine, il est demandé à l’Anses :• Étape 2 : « de formuler des recommandations pour le printemps 2025 (les captures pouvant démarrer au 15 avril, et celles du printemps étant généralement plus « fructueuses » que celles d’automne), en termes de surveillance et de lutte de la brucellose à Brucella melitensis dans les populations de bouquetins, notamment à la lumière des premiers résultats des nouveaux travaux de modélisation qui ont redémarré cette année.Il s’agira notamment :- d’établir des recommandations chiffrées et qualitatives (secteurs et populations à cibler prioritairement, etc.) en termes de captures et de tirs dans chacun des deux massifs, pour le printemps 2025,- d’évaluer l’intérêt des recaptures, et d’établir le cas échéant des recommandations chiffrées, pour les massifs du Bargy et des Aravis, - d’envisager la nécessité d’élargir la zone de surveillance et de lutte à d’autres massifs,- d’identifier le cas échéant d’autres mesures de lutte non mises en œuvre jusqu’alors,- de fournir des recommandations pratiques de biosécurité, applicables dans les contraintes topographiques alpines, pour protéger dès la montée en estive de 2025 les élevages de ruminants de l’infection à B. melitensis (par exemple effarouchement des bouquetins avant la mise en alpage des ruminants domestiques, etc.). Ces recommandations pourront s’appuyer sur le rapport d’expertise relatif à l’occupation spatiale des bouquetins produit par l’OFB et VetAgroSup à la demande de la DGAL en juin 2023, et sur une sollicitation de l’Inrae. »• Étape 3 : « d’établir des recommandations en termes d’effort de lutte annuel à mettre en œuvre pour atteindre une prévalence faible, favorable à l’extinction de l’infection, à l’horizon 2030. Ce travail pourra éventuellement s’appuyer sur les retours d’expériences d’extinction de la brucellose dans des populations d’animaux sauvages dans d’autres pays ».Appui scientifique et technique de l’AnsesDemande n° « 2024-SA-0146 »Saisine(s) liée(s) n°2024-SA-0099, 2022-SA-0220, 2021-SA-0228, 2021-SA-0200, 2021-AST-0203, 2018-SA-0017, 2016-SA-0229, 2014-SA-0218, 2013-SA-0129page 2 / 19chasseurs de la Haute-Savoie. Depuis 2023, cette surveillance est également étendue sur lapartie savoyarde du massif des Aravis avec l’aide de la Fédération départementale deschasseurs de la Savoie. Par ailleurs, dans ce contexte, la surveillance événementielle à traversle réseau SAGIR1 est renforcée2.Les mesures mises en œuvre depuis 2012 dans la population de bouquetins ont permis defaire fortement baisser la séroprévalence3 de la brucellose dans le massif du Bargy (Anses2023).En octobre 2021, lors des opérations de surveillance renforcée des troupeaux de bovinsdomestiques (sérologie mensuelle), un nouveau foyer a été découvert dans un élevage bovinlaitier, lié à la persistance de la brucellose dans la faune sauvage du massif du Bargy (Anses2021).L’Anses a alors été saisie en novembre (Anses 2021) et décembre 2021 (Anses 2022) pourévaluer l’efficacité de six scénarios de lutte contre la brucellose dans la population debouquetins du massif du Bargy. Outre cette évaluation, les experts ont rappelé dans leurs avisl’importance d’une gestion adaptative, consistant à adapter les mesures de gestion àl’évolution de la situation sanitaire, ce qui impose une surveillance continue de la situationdans les compartiments sauvage et domestique et de l’efficacité des mesures de lutte.Suite à la capture ou recapture de 135 bouquetins et à l’abattage de 61 bouquetins sur lemassif du Bargy en 2022, ainsi que la découverte fortuite sur le massif des Aravis d’une étagne(femelle bouquetin) trouvée infectée par B. melitensis, l’Anses a été saisie en octobre 2022afin de réactualiser les mesures de surveillance et de lutte sur le massif du Bargy et lesmesures à mettre en place sur le massif des Aravis.Les mesures de gestion mises en place pendant la saison de capture 2023 suite à l’avis del’Anses 2022-SA-0220 ont été renouvelées au printemps 2024. Suite aux nouvelles donnéesrecueillies sur l’évolution de la brucellose dans les populations de bouquetins des massifs duBargy et des Aravis lors de cette saison de capture, l’avis de l’Anses a été à nouveau sollicitéle 19 juillet 2024 sur les mesures de surveillance et de lutte à mettre en place dans lespopulations de bouquetins des massifs du Bargy et des Aravis. Un premier avis en urgence aété rendu le 31 août 2024 afin de proposer des adaptations aux mesures de gestion pourl’automne 2024 (étape 1 de la saisine) (Anses 2024).Dans les étapes 2 et 3 de la saisine, il est demandé à l’Anses :• Étape 2 : « de formuler des recommandations pour le printemps 2025 (les capturespouvant démarrer au 15 avril, et celles du printemps étant généralement plus« fructueuses » que celles d’automne), en termes de surveillance et de lutte de labrucellose à Brucella melitensis dans les populations de bouquetins, notamment à la[1] SAGIR : réseau de surveillance des maladies infectieuses des oiseaux et des mammifères sauvages terrestres.Il existe depuis 1955 et repose sur un partenariat entre les fédérations des chasseurs et l’Office français de labiodiversité.[2] Dépistage systématique de la brucellose sur les différents cadavres collectés dans le cadre du dispositif SAGIRclassique sur les départements de Savoie et Haute-Savoie et renfort de collecte avec dépistage systématique descadavres de cerfs, chevreuils, chamois, mouflons et bouquetins dans les massifs du Bargy, des Aravis et de Sous-Dine.[3] La séroprévalence est la proportion d’animaux présentant des anticorps contre l’agent de la brucellose.(Saisine(s) liée(s) n°2024-SA-0099, 2022-SA-0220, 2021-SA-0228, 2021-SA-0200, 2021-AST-0203, 2018-SA-0017, 2016-SA-0229, 2014-SA-0218, 2013-SA-0129
Avis de l’Anses relatif à la « demande d'évaluation du risque de résurgence de la brucellose suite à l'utilisation d'embryons issus du foyer de brucellose bovine en Haute Savoie en 2021»
No full textCitation suggérée:Anses. (2024). Avis relatif aux modalités de surveillance et de lutte contre la brucellose desbouquetins dans les massifs du Bargy et des Aravis (saisine 2024-SA-0099). Maisons-Alfort :Anses, 36 p.D’après le texte de la saisine : « En 2021, le dernier foyer de brucellose bovine, a conduit à assainir le troupeau par l’abattage de tous les bovins du troupeau. Cependant, les vaches laitières de cet élevage de race Abondance, race rustique locale, produisaient un lait à forte valorisation. L’éleveur et ses ascendants avaient opéré une sélection génétique que celui-ci souhaitait préserver. A cet effet, l’Anses avait été saisie pour un avis sur le prélèvement etl’utilisation d’embryons chez les femelles gestantes de ce foyer. A la suite de l’avis et de la sollicitation de la Commission Européenne, le laboratoire national de référence a prescrit un protocole de collecte le 21 novembre 2021. En 2023, la DDETSPP de Haute Savoie a présenté à l’éleveur les scénarii d’utilisation des embryons prélevés sur 12 génisses saines, sous réserve que son troupeau soit déqualifié pendant la période de gestation et qu’il suive leprocessus d’octroi de qualification. Cette proposition correspondait donc à une perte du statut indemne de son troupeau pendant 15 mois. Or aujourd’hui, les professionnels considèrent que ce processus est trop long.Le protocole de collecte des embryons a permis de s’assurer que le matériel génétique sauvegardé, n’est pas de nature à générer, par la suite, une résurgence de foyer de brucellose bovine. Considérant que ces 52 embryons sont dorénavant détenus dans un établissement agrée de produits germinaux, le gestionnaire souhaite s’appuyer sur la définition prévue par le règlement délégué (UE) 2020/689 dans son annexe IV partie I Chapitre 1 section 1 paragraphe f point ii) et section 2 pour maintenir la qualification du troupeau receveur.Un protocole d’utilisation de ces 52 embryons a été présenté début juin par le GDS des Savoie. Celui-ci prévoit leur utilisation en septembre 2024 dans une exploitation distincte de l’ancien foyer de 2021. Cette exploitation située dans l’Ain accueillerait sur son site uniquement des génisses en location vouées à être transplantées. Il est prévu de transférer ces embryons dans 52 de ces 65 génisses en deux fois à deux semaines d’intervalle. »Dans ce contexte, la DGAL souhaite disposer selon le texte de saisine :- « d’une évaluation de risque de résurgence de la brucellose suite à l’utilisation de ces embryons,- d’une évaluation de la surveillance à réaliser et des recommandations concernant la gestion de ces génisses et de leurs futurs veaux, notamment :• le devenir des génisses qui ne seront finalement pas transplantées : peuvent-elles être commercialisées vers un autre élevage ou doivent-elles être abattues ?• le devenir des génisses transplantées mais qui ne seront finalement pas gravides : peuvent-elles être commercialisées vers un autre élevage ou doivent-elles être abattues ?• le devenir des jeunes vaches ayant vêlé : peuvent-elles être commercialisées vers un autre élevage ou doivent-elles être abattues ;• la surveillance et la biosécurité renforcée à appliquer à ce troupeau de génisses pendant et après la gestation et aux futurs veaux, sachant que ces derniers partiront rapidement après la naissance dans l’exploitation où les femelles ont été prélevées et que seules les femelles seront conservées. »(Saisines liées n° 2024-AST-0131 et 2024-SA-0132
The use of eponyms can also promote gender equity in modern taxonomy
No full textInternational audienceThere is an ongoing debate about how species are named, with several calls to revise naming conventions (e.g., Guedes et al. 2023, Harris and Xavier 2023). The science of describing species, taxonomy, has remained largely unchanged since Linnaeus introduced the binomial system centuries ago. However, naming species is largely influenced by the societal context in which scientists operate (Ceríaco et al. 2016, Mammola et al. 2023, Toussaint et al. 2024). In a hotly debated recent paper, Guedes and colleagues (2023) specifically argued that eponyms (that is, dedications to people) are predominantly assigned to “almost universally White, male upper-class Europeans” and advocated for discontinuing their use
Zoonotic potential of uropathogenic Escherichia coli lineages from companion animals
No full textInternational audienceEscherichia coli is responsible for urinary tract infections (UTI) in humans and pets. This study aims to provide data on the virulome and resistome of E. coli strains isolated during bacteriuria in companion animals and to assess their zoonotic potential. 135 E. coli strains prospectively collected from urine samples of 44 cats and 91 dogs in three French veterinary teaching hospitals were analyzed via antibiotic susceptibility tests and whole genome sequencing. Phylogroup B2 was overrepresented and several sequence types (STs) associated with human extra-intestinal pathogenic E. coli (ExPEC) were found. These included ST12, ST127 and ST141 (8 strains each), which were characterized by genetic homogeneity, and ST73 (23 strains) which contained several serotype-delineated sublineages with distinct distributions in pets and humans. Single nucleotide polymorphism (SNP) analysis further revealed the existence of highly related human and companion animal clones among these STs, indicative of a zoonotic potential. By contrast, other major human ExPEC STs (e.g. ST131, ST10, ST69, ST95 and ST1193) were rarely found (2 strains each), suggesting they might be less adapted to cats and dogs. Of note, ST372 (21 strains) was predominant and exclusively found in dogs. Pet E. coli UTI strains carried virulence genes commonly found in human E. coli UTI isolates. 15.6% of strains were predicted as multi-drug resistant. The major canine and feline ExPEC lineages were not associated with extended spectrum beta lactamase and AmpC production. Only one strain (from ST131) carried the blaCTX-M-15 gene. Persistent clones of E. coli isolated from five cats and nine dogs with recurrent infection had genetic traits similar to strains from other animals. Approximately one-third of the E. coli UTI strains from pets exhibited genetic similarities to those responsible for UTI in humans, suggesting a potential for zoonotic transmission. This study underscores the continued need to monitor and control antimicrobial resistance in companion animals