HAL ENVT (Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse)
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Étude de la compression interfragmentaire obtenue par une plaque LCP sur des modèles synthétiques de fractures : influence de la position des vis excentrées dans la plaque
No full textIn the case of a fracture, primary bone healing is made possible by the surgical reduction of the fracture. The reduction is achieved through the use of implants that allowing the application of interfragmentary compression, which is essential for primary healing. The most commonly used compressive implants are DCP and LCP plates. LCP plates allow hybrid use thanks to their combination holes. The compression depends on the quality of the reduction, but the position of the screws on the plate may also play a role. The aim of this study is to construct an experimental model of a simple transverse fracture to determine whether the position of the screws placed on an LCP plate affects the amount of compression at the fracture site. The results showed that screw position does not alter the value of interfragmentary compression at the fracture site. It will then be of interest to investigate whether the number and positioning of eccentric screws have an impact on the compression force value. The combination of eccentric and neutral screws could also be studied.Lors d’une fracture, la cicatrisation osseuse primaire est permise par la réduction chirurgicale. Cette dernière est obtenue grâce à l’utilisation d’implants qui permettent la mise en place d’un compression interfragmentaire indispensable à la cicatrisation primaire. Les implants compressifs les plus utilisés sont les plaques DCP d’un côté, et les plaques LCP de l’autre, qui permettent une utilisation hybride grâce à l’utilisation des trous combinés. La compression dépend de la qualité de la réduction, mais la position des vis sur la plaque pourrait aussi avoir son importance. L’objet de cette étude est donc de construire un modèle expérimental de fracture transverse simple permettant de déterminer si la position des vis mises en place sur un plaque LCP influence la valeur de la compression au foyer de fracture. Les résultats obtenus ont permis de montrer que la position de la vis ne modifie pas la valeur de la compression interfragmentaire au foyer de fracture. Il sera ensuite intéressant d’étudier si le nombre de vis excentrées utilisées et leurs positions exercent une influence sur la valeur de la force de compression. Il serait aussi probablement intéressant d’étudier l’association de vis excentrées et de vis neutre
Validation des méthodes de prélèvement et de conservation dans le cadre de l’étude du microbiote intestinal du chien
No full textNumerous publications focus on canine intestinal microbiota, but study protocols vary considerably: collection from fresh stools or rectal examination, immediate or delayed freezing, etc. These variations are likely to lead to methodological biases that could hinder comparisons between studies. Our work focused on comparing collection methods, temperatures and storage times in order to assess their impact on the canine microbial profile. Collecting fresh faeces and rectal examination gave similar results, but there was a notable difference in sampling methods. With regard to storage, storage at -20°C is equivalent to storage at -80°C, as opposed to refrigerated storage for one week. The impact of the time between food intake and sampling must also be taken into account in order to obtain comparable results.De nombreuses publications s’intéressent au microbiote intestinal canin, mais les protocoles d’étude présentent une variabilité importante : collecte sur selles fraîches ou toucher rectal, congélation immédiate ou différée etc. Ces facteurs de variations sont susceptibles d’induire des biais méthodologiques qui pourraient être un frein dans la comparaison des études. Notre travail a porté sur la comparaison des modes de prélèvement, des températures et des durées de stockage afin d’évaluer leur impact sur le profil microbien canin. La récolte de selles fraîches et le toucher rectal donnent des résultats similaires, mais il existe une différence notable avec l’échantillonnage. Concernant le stockage, une conservation à -20°C équivaut à une conservation à -80°C, contrairement à la conservation réfrigérée une semaine. L’impact du délai entre prise alimentaire et prélèvement est aussi à prendre en compte afin d’obtenir des résultats comparables
Lien entre fermentations microbiennes in vitro et performances in vivo chez les porcs sélectionnés sur leur consommation résiduelle
No full textInternational audienceBioinformatic analysis of microbiota revealed that certain metabolic pathways are associated with low- and high- residual feed intake (HRFI and LRFI), such as the amino-acid biosynthesis pathway and the tRNA-aminoacyl synthesis pathway. The latter is associated with increased propionate production. Yet, in vitro fermentation-profile analyses revealed that LRFI pigs, from the most efficient genetic line, produced more acetate (+15%) and propionate (+56%) from the insoluble fraction (IF) containing the insoluble dietary fibre recovered after simulation of upper gastrointestinal digestion. Valerate was also more frequently abundant in LRFI pigs (P < 0.01). 16S sequencing analysis of the microbes responsible for fermentation suggested that propionate obtained from the fraction of feed that is indigestible by the host is produced mainly by Prevotella and Lactobacillus. This production was strongly correlated with backfat thickness in LRFI pigs (Spearman's correlation = 0.80), while a moderate correlation existed between butyrate production and feed efficiency in HRFI pigs (Spearman's correlation = 0.44). These results revealed that propionate production is related to fat metabolism, suggesting that GPR43 receptor activation by propionate could play a physiological role in adipose cells in RFI- pigs. These observations highlight significant functional differences between the microbiota of HRFI and LRFI pigs, as well as variability within more efficient pigs that could be exploited to improve performance.Cette étude a analysée les différences de microbiote intestinal entre des porcs de lignées efficaces, cad à la consommation moyenne journalière résiduelle faible (CMJR-) par rapport à des porcs non-efficaces (CMJR+). Le séquençage a montré un lien entre l’efficacité et certaines voies métaboliques, notamment pour la voie de la biosynthèse des acides aminés et la voie de synthèse de l’ARNt-aminoacyl chez les CMJR+ qui est associée à une production accrue de propionate. Cependant les analyses de profils de fermentation in vitro montrent que les porcs CMJR–, de la lignée plus efficace, produisent plus d’acétate (+15%) et de propionate (+56%) à partir des fibres insolubles (IF) récupérées après simulation de digestion par la partie haute du tube digestif. Le valérate est également plus fréquemment abondant chez les CMJR– (P < 0,01). L'analyse par séquençage 16S des microbes responsables de la fermentation suggère que le propionate obtenu à partir de la fraction de l’aliment qui est indigestible par l’hôte est principalement produit par Prevotella et Lactobacillus. Cette production est fortement corrélée à l'épaisseur du lard dorsal chez les porcs de la lignée CMJR– (Corrélation de Spearman = 0,8), tandis que chez les porcs CMJR+, une corrélation modérée existe entre la production de butyrate et l’indice de consommation (Corrélation de Spearman = 0,44). Ces résultats montrent que la production de propionate est corrélée au métabolisme adipeux, suggérant que l'activation du récepteur GPR43 par le propionate pourrait jouer un rôle physiologique dans les cellules adipeuses des porcs CMJR–. Ces observations mettent en évidence des différences fonctionnelles importantes entre les microbiotes des porcs CMJR+ et CMJR– ainsi qu’une variabilité au sein des porcs génétiquement plus efficaces, qui pourrait être exploitée pour améliorer les performances
Diversité structurale des oligosaccharides du lait et liens fonctionnels avec les capacités métaboliques des bactéries commensales et la réponse immunitaire intestinales chez le porc et le lapin
No full textDigestive disorders frequently occur around weaning on pig and rabbit farms, due to the incomplete development of the intestinal barrier in these species. In a context of antibiotic use reduction, developing new nutritional strategies to preserve digestive health around weaning is essential. Milk oligosaccharides, the first natural prebiotics available to newborns, regulate the composition of the intestinal microbiota and modulate the host immune response, playing a crucial role in holobiont assembly. However, the impact of milk oligosaccharide's structure on the microbiota and intestinal mucosal immunity remains largely unexplored. This PhD work aimed to understand the functional interactions between the structural diversity of milk oligosaccharides, the metabolic capacities of commensal intestinal bacteria, and the intestinal immune response. The ultimate purpose was to promote intestinal barrier maturation at weaning and limit digestive disorder incidence. First, an in-silico approach was used to create a thesaurus of synonyms and standardize the names of milk oligosaccharides identified in the scientific literature. This approach also involved creating an annotated corpus of scientific texts for future text mining applications. These tools will enable us to assess diversity patterns of milk oligosaccharides within and between species, including pigs and rabbits, our species of interest. Secondly, we studied the functional impact of milk oligosaccharides on the commensal intestinal bacteria of piglets and rabbits, as well as the cecal immune cells of rabbits, in vitro. We demonstrated that the metabolic capacity of nine strains selected from 240 isolates obtained from piglet feces and suckling rabbit ceca in anaerobic culture, differs according to oligosaccharide structure (2'-fucosyllactose, 3'-sialyllactose, 6'-sialyllactose and lacto-N-tetraose) and bacterial species within the same genus. Analyzing the complete genomes of eight of these strains validated these results in silico. We then developed a model to isolate, culture, and stimulate mononuclear cells from the cecal lamina propria of rabbits. This enabled us to study the direct and indirect (via bacterial metabolites) effects of milk oligosaccharides on these cells. While milk oligosaccharides alone had little immunomodulatory effects, the metabolites derived from their bacterial degradation, notably propionate and isovalerate, significantly modulated the immune response. These results highlight the importance of the structure of milk oligosaccharides in their interactions with the microbiota and intestinal immunity. Ultimately, integrating research that considers the complexity of the intestinal barrier will enable a more detailed evaluation of the health benefits of milk oligosaccharides and guide the development of supplementation strategies for pig and rabbit farming.Les troubles digestifs sont fréquemment rencontrés autour du sevrage en élevages porcin et cunicole, en lien avec le développement incomplet de la barrière intestinale de ces espèces. Dans un contexte de réduction de l'usage des antibiotiques, de nouvelles stratégies nutritionnelles doivent être développées pour préserver la santé digestive au moment du sevrage. Premiers prébiotiques naturels disponibles pour le nouveau-né, les oligosaccharides du lait régulent la composition du microbiote intestinal et modulent la réponse immunitaire de l'hôte, jouant un rôle crucial dans l'assemblage de l'holobionte. Toutefois, l'impact de la structure des oligosaccharides du lait sur le microbiote et l'immunité mucosale intestinale reste peu exploré. Ce travail de thèse avait pour objectif de comprendre les interactions fonctionnelles entre la diversité structurelle des oligosaccharides, les capacités métaboliques des bactéries intestinales commensales et la réponse immunitaire intestinale, afin de favoriser la maturation de la barrière intestinale au sevrage. Dans un premier temps, afin d'appréhender la diversité structurelle des oligosaccharides du lait, une approche in silico a permis de construire un thésaurus de synonymes pour standardiser les noms des oligosaccharides du lait, ainsi qu'un corpus annoté de textes scientifiques pour des applications futures en analyse automatisée de textes. Ces outils permettront à terme d'évaluer les patrons de diversité des oligosaccharides du lait au sein et entre les espèces. Dans un second temps, nous avons étudié in vitro la fonctionnalité des oligosaccharides du lait sur les bactéries intestinales commensales de porcelets et lapereaux et les cellules immunitaires caecales de lapereaux. Nous avons démontré que la capacité métabolique de 9 souches, sélectionnées parmi 240 isolats obtenus en culture anaérobie à partir de fèces de porcelets et de contenu caecal de lapereaux allaités, diffère en fonction de la structure de l'oligosaccharide (2'-fucosyllactose, 3'-sialyllactose, 6'-sialyllactose et lacto-N-tetraose) et de l'espèce bactérienne. Une analyse du génome complet nous a permis de valider ces résultats in silico. Nous avons ensuite développé un modèle d'isolement, de culture et de stimulation des cellules mononuclées de la lamina propria caecale de lapereaux, permettant d'étudier leurs interactions directes et indirectes (au travers des métabolites bactériens) avec les oligosaccharides du lait. Si les oligosaccharides seuls n'ont eu que peu d'effets immunomodulateurs, les métabolites modulaient significativement la réponse immunitaire. L'ensemble de ces résultats soulignent l'importance de la structure des oligosaccharides du lait dans leurs interactions avec le microbiote et l'immunité intestinale. Les nouveaux outils développés dans le cadre de ce travail pourront contribuer à une meilleure caractérisation des effets d'autres nutriments ou postbiotiques sur le microbiote et l'immunité des porcelets et lapereaux. A terme, des recherches intégrant la complexité de la barrière intestinale permettront d'évaluer plus finement les bénéfices santé des oligosaccharides du lait en vue d'établir des stratégies de supplémentation adaptées aux élevages porcins et cunicoles
P19-30 Biotransformation of the colour developer Pergafast 201 in human in vitro models
No full textInternational audienc
P19-07 Assessment of the Metabolic Fate of Bisphenol A Alternatives Prioritized Under the PARC Project in HepaRG cells
No full textInternational audienc
Étude du microbiote des chiots nés par césarienne, impact sur leur santé
No full textWith some breed having up to 90% of birth by cesarean section, the comprehension of it’s impact on the neonatal health is mandatory. While numerous studies have focused on the relationship between a C-section birth and modifications of the intestinal microbiota and the consequences it may have on health in children, in the canine species, only one study was publish on the subject. Our study aims to understand the modifications of the fecal microbiota in relation to the birth mode, but a lack of samples and a high mortality rate in the litters led us to try to understand if the neonatal mortality has a link to the composition of the fecal microbiota. This experimental work was conducted on a sample of 34 puppies, for which 16S rRNA gene sequencing was performed using fecal samples collected from 3 to 56 days of life. The puppies’ microbial profiles are influenced by the litter, their age but not their sex. The fecal microbiota of the deceased puppies and the living puppies seem different with a predominant role of bacteria from the canine buccal microbiota.Avec certaines races de chiens ayant jusqu’à 90% de naissances par césariennes, la compréhension de son impact sur la santé néonatale est nécessaire. Bien que de nombreuses études chez l’Homme se soient penchées sur le lien entre la naissance par césarienne et des modifications du microbiote intestinal et les conséquences sur la santé des enfants qui en découlent, dans l’espèce canine, une seule étude a été publiée sur le sujet. Notre étude avait donc pour objectif de comprendre les modifications du microbiote fécal en lien avec le mode de naissance, néanmoins un manque d’échantillons et un taux de mortalité au sein des portées particulièrement élevé à conduit à tenter de comprendre si la mortalité néonatale est en lien avec des modifications de la composition du microbiote fécal. Ce travail expérimental a été réalisé sur un échantillon de 34 chiots pour lesquels des séquençages du gène de l’ARNr 16S ont été réalisés à partir de prélèvements fécaux entre 3 et 56 jours de vie. Les profils microbiens des chiots sont influencés par la portée, leur âge mais pas par leur sexe. Le microbiote fécal des chiots morts et des chiots vivants semble différent avec un rôle prédominant de bactéries du microbiote buccal canin dans cette différenciation
Next-generation enteric neuroscience — fostering the future of the field
No full textInternational audienceThe Little Brain Big Brain meeting was established more than 30 years ago as an opportunity for early career researchers to meet, present and discuss exciting new developments in the field of enteric neuroscience and neurogastroenterology. Crucially, the meeting is organized by young investigators, for young investigators. In this Viewpoint, past attendees and organizers of the Little Brain Big Brain meeting discuss their research interests, share their experience with this unique meeting and provide insights into progress in the field of enteric neuroscience and neurogastroenterology and its future outloo
Amélioration de la consultation de médecine préventive du chaton de moins de 6 mois : élaboration d’un questionnaire à destination des propriétaires
No full textThe Small Animal Hospital of the National Veterinary School of Toulouse has been developing for the past few years the VetPrev unit, aiming to improve its services in preventive medicine. Feline consultations are one of the areas explored in this project, which aims to enhance animal health and welfare within households through the veterinary guidance provided. In this context, this present study is to be a first report to improve preventive medicine consultations for kittens under 6 months of age. An online survey was developed in order to assess owners’ knowledge regarding kittens needs, their level of satisfaction and the main advice they expect during consultations. The main areas of preventive medicine - including vaccination, antiparasitic treatments, nutrition, behavior and breed - have been explored.The 740 responses have shown a good level of owners knowledge and satisfaction regarding fundamental aspects of kittens health. Other topics such as nutrition and behavior have been quite more controversial subjects, with less satisfaction from the owners, with some responses highlighting the lack of veterinary advice. Although there were not discussed in the survey, owners also reported that the various diseases a cat may encounter throughout its life are not enough discussed during consultations. Finally, other causes of dissatisfaction, mainly related to consultations beeing too short, were identified.The survey was distributed to a broad sample of owners and not limited to the vet school clients. The data collected in this study reflect the practices and advice received in private veterinary clinics and do not represent the practices of the preventive medicine department.Le Centre Hospitalier Universitaire Vétérinaire des Animaux de Compagnie de l’Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse a développé depuis quelques années le pôle VetPrev, destiné à améliorer son offre en médecine préventive. La consultation du chat fait notamment partie des axes étudiés au sein de ce projet, visant à optimiser le bien-être animal et la santé au sein des foyers grâce aux conseils vétérinaires reçus en médecine préventive. Dans ce cadre, cette étude a pour objectif d’être un premier support à l’amélioration de la consultation de médecine préventive du chaton de moins de 6 mois. Un questionnaire en ligne a été mis en place afin de réaliser un état des lieux des connaissances des propriétaires sur les besoins des chatons ainsi que de leur satisfaction et des principaux conseils attendus en consultation. Les domaines principaux de la médecine préventive (vaccination, traitements antiparasitaires, alimentation, comportement, santé, race) ont été abordés. Les 740 réponses obtenues ont permis de mettre en évidence des connaissances et une satisfaction des propriétaires très correcte sur les points fondamentaux de la santé du chaton. D’autres sujets tels que l’alimentation ou le comportement sont cependant sujets à quelques controverses et insatisfactions des propriétaires, dont une partie met en avant un manque de conseils vétérinaires. Non évoquées dans le questionnaire, les différentes maladies auxquelles peut être confronté le chat tout au long de sa vie ne semblent également pas assez évoquées en consultation. Enfin, des causes d’insatisfaction liées majoritairement à des consultations trop rapides sont mises en évidence.Le questionnaire a été adressé à un vaste échantillon de propriétaires, qui n’étaient pas uniquement clients de l’école vétérinaire. Les données apportées par cette étude sont le reflet des pratiques et des conseils reçus en cliniques vétérinaires privées, et ne reflètent pas les pratiques du service de médecine préventive
Decoupling transcriptome layers: the distinct and variable nature of circular RNAs
No full textInternational audienceBackgroundCircular RNAs (circRNAs) and mRNAs are distinct transcripts from the same genes, produced by different splicing mechanisms. This study investigates the behavior of the circular transcriptome relative to the linear one across biological conditions and tissues. We analyzed transcriptomic data from 36 bovine monocyte-derived macrophage (MDM) samples collected during an ex vivo Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis (MAP) infection experiment, stratified by Johne’s disease (JD) antibody status (JD+ or JD−) and by infection condition (control or MAP infected). We extended our analysis to healthy bovine tissues, including neonatal and post-pubertal testes, and liver and muscle samples from 12 animals stratified by sex and feed efficiency.ResultsIn the 36 MDM samples, we identified 3358 exonic circRNAs derived from 1895 genes. By comparing the mean expression levels of circRNAs and linear transcripts, and considering the number of expressed genes, we estimate that the circular transcriptome is approximately 100 times smaller than the linear transcriptome. Analyses of the circular and linear transcriptomes revealed that MAP infection impacted only the linear transcriptome of MDM_JD− . The other three transcriptomes—circular JD− , circular JD+ , and linear JD+ —showed no infection-specific response. In the testes, maturation was associated with profound but uncoordinated changes in the circular and linear transcriptomes. While circRNA abundance declined, the linear transcriptome underwent a complete reorganization marked by the activation of novel genes. In the liver, female samples clustered by feed efficiency only when the entire linear and top-expressed circular transcriptomes were considered, respectively. In MDMs, the circular transcriptomes of control and infected samples, as well as the JD+ linear transcriptome, were dominated by donor-specific signatures. In contrast, the JD− linear transcriptome reflected MAP infection, with infection-specific structuring overriding inter-individual variation.ConclusionsIn both MDM and tissue samples, circular and linear transcriptomes follow distinct and largely independent regulatory logics. While both capture inter-individual variation, circRNA expression appears more variable and may carry fewer physiological signals, especially when no clear phenotypic signature has been detected in the corresponding linear transcriptome. These findings demonstrate that circular and linear RNAs arise from complementary and nonredundant layers of gene regulation, emphasizing the importance of analyzing both in parallel