HAL ENVT (Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse)
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Fièvre des montagnes dans les estives du Pays Basque : étiologie et facteurs de risque d’apparition du syndrome Belar joa chez les agnelles lors de la première transhumance
No full textTranshumant sheep farming in the Basque Country is affected by a common issue, which is widespread across a very large number of summer pastures and geographical areas. For decades, breeders and shepherds have been dealing with Mountain Fever, a syndrome that affects almost exclusively first-transhumance ewes. The young ewes, receptive and sensitive to infectious agents encountered for the first time in the mountains, become ill as early as the 5th day after arriving at the summer pasture. They develop a pronounced febrile syndrome, become isolated, lose weight and may eventually die ; or they gradually recover. A memory immune response is established for the rest of their life, following this first contact with the infectious agents involved in Belar joa syndrome. The results of this study confirm the strong involvement of the bacterium Anaplasma phagocytophilum in Mountain Fever. Furthermore, these studies highlight the significant frequency of multiple exposure an double or even triple co-infections with other tick-borne pathogens, including Anaplasma ovis, Babesia/Theileria and Mycoplasma ovis. These frequent combinations of pathogens complicate the diagnosis and the choice of treatments to implement.L’élevage ovin transhumant du Pays Basque est affecté par une problématique commune, généralisée à un nombre très élevé d’estives et de secteurs géographiques. Depuis des décennies, éleveurs et bergers font face à la Fièvre des montagnes, syndrome qui affecte quasi-exclusivement les agnelles de première transhumance. Ces dernières, réceptives et sensibles vis-à-vis des agents infectieux rencontrés pour la première fois en montagne, tombent malades dès le 5ème jour après l’arrivée sur l’estive. Elles développent un syndrome fébrile marqué, s’isolent, s’amaigrissent et peuvent finir par mourir ; ou elles se rétablissent progressivement. Une réponse immunitaire mémoire se met en place pour le restant de leur vie suite à ce premier contact avec les agents infectieux impliqués dans le syndrome Belar joa. Les résultats de ce travail confirment l’implication forte de la bactérie Anaplasma phagocytophilum dans la Fièvre des montagnes. De plus, ces travaux soulignent la fréquence importante de l’exposition multiple et des co-infections doubles, voire triples avec d’autres agents pathogènes transmis par les tiques, notamment Anaplasma ovis, Babesia/Theileria et Mycoplasma ovis. Ces associations fréquentes de pathogènes compliquent le diagnostic et le choix des traitements à mettre en place
Decoding the dynamics of calves’ respiratory and gut microbiota: exploring stability, resistance, and individual patterns
No full textInternational audienceTo uncover the intricate relationship between the microbiota, host, and environment in early life, we monitored the temporal dynamics of the nasal and gut microbiota in 30 veal calves over their rst ve months. Our ndings reveal that microbiota stability and individuality are speci c to each body site. Notably, the fecal microbiota demonstrated greater diversity, bacterial biomass, stability, and homogeneity as the animals matured. In contrast, nasal microbiota exhibited a skewed structure and higher turnover, likely driven by microbial immigration and mucociliary clearance. Weather, diet, and antibiotics were associated with both microbiotas, alongside host cytokine pro les. Rectal temperature signi cantly shifted the microbiota structure in both sites, more than diarrhea or respiratory scores. As calves aged, synchronized microbiota dynamics across body sites emerged. This study presents a detailed view of microbial temporal patterns and their connection to the host and environment, offering valuable insights for improving management during critical development periods
Exploration of different ion excitation modes in tandem mass spectrometry to optimizestructural information and identification levels in metabolomics and exposomics
No full textInternational audienceOne of the primary applications of mass spectrometry is to elucidate the molecular structure of compounds by analyzing their fragmentation profiles. This is achieved through tandem mass spectrometry (MS/MS), where specific precursor ions are isolated and subsequently excited using collision-, photon-, or electron-based activation methods. This excitation induces unimolecular dissociation, producing characteristic fragment ions1.Despite the valuable structural insights provided by MS/MS, challenges remain in precisely identifying specific classes of compounds within endogenous (metabolome) and exogenous (exposome) domains. These limitations hinder the generation of comprehensive spectral data, which is crucial for the accurate interpretation of complex "omics" datasets. This project aims to assess alternative fragmentation techniques to conventional Collision-Induced Dissociation (CID). Techniques such as Higher-energy Collision Dissociation (HCD), Ultraviolet Photodissociation (UVPD), and Electron-Induced Dissociation (EID) will be evaluated. The goal is to enhance structural information for compounds whose fragmentation with CID provides limited insights. A set of compounds — including pesticides, toxins, persistent organic pollutants (POPs), lipids, and others — has been selected to enrich spectral databases focused on metabolomics and exposomics.Additionally, the precise identification of metabolites from xenobiotics or unknown endogenous compounds is improved by comparative in silico analysis2. This involves comparing the dissociation spectra of unknown molecules with those of structurally related known compounds, using molecular networks. The project will also assess the ability of the excitation methods explored to support this data processing approach.Preliminary results comparing CID, HCD, and UVPD on several compounds will be presented to highlight the complementary nature of these different excitation modes
114. Population pharmacokinetic modelling of different sulphonamides associated with trimethoprim in pigs
No full textInternational audienceSulphonamides (S), one of the first bacteriostatic antibiotics developed, are widely prescribed in combination with trimethoprim (TMP) to treat various bacterial infections in pig farming. Currently, the 1:5 dose ratio of TMP:S used for pigs is a direct transposition of the ratio of TMP:sulphamethoxazole (SMX) determined decades ago for humans, in an attempt to obtain a supposed synergistic plasma concentration ratio of 1:19. However, major pharmacokinetic (PK) differences exist between humans and animals, and depend on the type of sulphonamide used. Here, we generated new PK data for pigs after three independent cross-over designs with intravenous and oral administrations of the main sulphonamides used in pig farming (i.e., sulphadimethoxine, sulphadiazine and SMX) combined with TMP. We analysed the data using a population pharmacokinetic modelling approach. The results indicated that the three sulphonamides and TMP have different elimination half-lives that result in a plasma concentration ratio that differs from 1:19 and changes over time
Author Correction: Striking convergent selection history of wheat and barley and its potential for breeding
No full textInternational audienc
Mise en place de la contractualisation des actes vétérinaires en élevages bovins allaitants : étude de la faisabilité dans une clientèle aveyronnaise
No full textContractual agreements between veterinarians and farmers are expanding in dairy production and represent a potential pathway for beef cow-calf farming. This study, conducted with 39 beef cattle farmers in Aveyron, assessed the feasibility of such contracts and identified conditions favorable to their implementation. The establishment of contractual arrangements appears feasible, with nearly one-third of farmers expressing interest. Apart from herd size, no farm or farmer characteristics significantly influenced this interest. Contracts could therefore be offered to all farms with more than 30 adult cows. Strategic areas were identified and should be targeted to develop the service. Cost remains a major barrier, as do the perceived absence of significant health issues and limited interest in enhanced herd monitoring.La contractualisation entre vétérinaire et éleveurs se développe en élevage laitier et apparaît comme une piste d’évolution pour l’élevage bovin allaitant. Cette étude, menée auprès de 39 éleveurs bovins allaitants de l’Aveyron, a évalué sa faisabilité et identifié des conditions favorables à son développement. La mise en place de la contractualisation apparaît faisable, près d’un tiers des éleveurs s’étant déclarés intéressés. Hormis la taille du cheptel, aucune caractéristique des exploitations ou des éleveurs n’a montré d’influence notable sur cet intérêt. Le contrat pourrait donc être proposé à l’ensemble des exploitations comptant plus de 30 vaches adultes. Certains domaines stratégiques ont été identifiés et devraient être ciblés pour le développement de l’offre. Le coût reste un frein important, tout comme l’absence de problèmes sanitaires majeurs perçus et l’intérêt limité pour un suivi renforcé
L'émergence de l'IA dans le domaine de la santé publique nécessite la mise en place d'une éthique opérationnelle afin de favoriser une utilisation responsable.
No full textInternational audienceThe paper discusses the responsible use of artificial intelligence (AI) in public health and in medicine, and questions the development of AI ethics in international guidelines in a public health perspective. How a global ethics approach can help conceiving responsible AI development and use for improving public health? By analysing key international guidelines in AI ethics (UNESCO, WHO, European High-Level Expert Group on AI) and available literature, the paper advocates for conceiving proper ethical and legal frameworks and implementation tools for AI in public health, based on pragmatic risk-based approach. It highlights how AI ethical principles meets public health objectives and focus on their value by addressing the meaning of human-centred innovations, transparency, accountability, diversity, equity, privacy protection, technical robustness, environmental protection, and post-marketing surveillance. It concludes that AI technology can reconcile individual and collective ethical approaches to public health, but requires specific legal frameworks and interdisciplinary efforts. Prospects include the development of supporting data infrastructures, of stakeholders' involvement to ensure long-term commitment and trust, of public and users' education, and of international organisations capacity to coordinate and monitor AI developments. It formulates a proposal to reflect on an integrated transparent public health functionality in digital applications processing data
CapriMam3D : les technologies 3D au service de la traite caprine de demain
No full textCe numéro traite de résultats de projets lauréats en 2019 l'appel à projet CASDAR (Compte d'Affectation Spéciale Développement Agricole et Rural), "Innovation et Partenariat" et "Recherche Technologique. Ces projets sont financés par le ministère de l'Agriculture et de la Souveraineté Alimentaire.International audienceCapriMam3D: 3D technologies to support goat milking tomorrowThe goat udder is at the heart of many issues: animal health and welfare, milk quality, zootechnical performance and well-being of farmers. The diversity of the udders involves adapting milking equipment and improving genetic selection on the morphology of the teats. CapriMam3D has developed a 3D scanner of the caprine udders which generates more precise and repeatable images than those obtained via conventional manual pointing.The standard for in vitro teat cup testing requires teats made of hard plastic, but thanks to 3D technologies, flexible and anatomical artificial teats have been created, with behaviors similar to those observed on milking farms. Thermography or congestion measurement of teat tissues with cutimeter allow in vivo tests to complete these approaches to measure the impact of milking equipment on teats and thus define the most suitable liner/teat combinations.La mamelle caprine est au centre de nombreux enjeux : santé et bien-être animal, qualité du lait, performances zootechniques et bien-être des éleveurs. La diversité des mamelles implique une adaptation des équipements de traite et une amélioration de la sélection génétique sur la morphologie des mamelles. CapriMam3D a permis de développer un scanner 3D des mamelles caprines avec des images obtenues plus précises et répétables que celles obtenues via un pointage classique manuel. La norme des tests des manchons trayeurs in vitro impose des trayons en plastique dur, mais grâce aux technologies 3D, des trayons artificiels souples et anatomiques ont été créés, aux comportements proches de ceux observés en ferme à la traite. Les méthodes comme la thermographie ou la mesure de congestion par cutimètre permettent de mesurer In vivo l'impact sur l'animal objectivant les couples manchons/trayons les plus efficaces et respectueux des animaux
Comparaison des approches RMN 1D et 2D pour l’identification de biomarqueurs hépatiques de l’exposition à faible dose de PolyChloroBiphényles (PCBs) chez le poulet
No full textInternational audienceLes polluants organiques persistants suscitent des préoccupations majeures en raison de leur toxicité, leur bioaccumulation et leur présence dans les aliments d’origine animale. Dans le cadre du projet ANR Sentinel (ANR-19-CE21-0011-02) visant à renforcer la surveillance de la sécurité alimentaire, les travaux portent sur une étude de cas dans l’objectif d’identifier des marqueurs endogènes suite à une exposition aux PCB chez le poulet par une approche non ciblée par RMN. Pour surmonter les limites de la RMN 1D, l’intérêt de la RMN 2D a été évalué à l’aide de séquences 2D rapides. Des extraits aqueux et lipidiques de foie de poulets exposés à de faibles doses de PCB (Aroclor 1260 : 4 ; 20 ; 200 µg/kg/jour) dans l’alimentation pendant 45 jours ont été analysés par RMN 1D et 2D (i.e. COSY ultrarapide, COSY rapide, TOCSY à échantillonnage non uniforme (NUS) et HSQC NUS) sur un spectromètre RMN 600 MHz. Des analyses statistiques multivariées ont été réalisées afin de différencier les animaux témoins des animaux exposés. Les premiers résultats sur les extraits lipidiques montrent que la RMN 2D HSQC NUS permet de séparer les groupes témoins et contaminés, alors qu’aucune séparation n’est observée en RMN 1D, révélant des biomarqueurs. Ces résultats mettent en avant la valeur ajoutée de la RMN 2D pour améliorer l’identification des marqueurs. Des analyses multi-tableaux intégrant toutes les séquences 2D sont en cours. Notre méthodologie innovante ouvre la voie au développement de nouvelles solutions pour un suivi efficace, applicables à d'autres études nutritionnelles