Institutional Repository CICESE (Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada)
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Determination of the frequency of nuclear abnormalities in seabirds of the Baja California peninsula
No full textEn la actualidad, la creciente contaminación en los ecosistemas marinos que, derivada de las actividades humanas, ha puesto en riesgo a una gran cantidad de especies. Las aves marinas son un grupo especialmente afectado por la contaminación. Además de que, por sus características ecológicas, como su elevada posición en la cadena trófica y longevidad, se han usado como un grupo de organismos bioindicadores. El objetivo de este trabajo de tesis consistió en determinar la frecuencia de anormalidades nucleares (AN) presentes en cuatro especies de aves marinas de la península de Baja California: la fragata tijereta, el albatros de Laysan, la gaviota bajacaliforniana y el pelícano café. Así como identificar posibles diferencias en las frecuencias asociadas al año, la edad y la especie. La frecuencia de anormalidades nucleares fue determinada mediante la prueba de micronúcleos y anormalidades nucleares, por microscopia de fluorescencia. Posteriormente se empleó la prueba U de Mann-Whitney para determinar diferencias significativas entre dos grupos comparados. No se encontró un efecto de la edad sobre la frecuencia de AN, tampoco se encontraron variaciones interanuales. Sin embargo, se observaron diferencias significativas al comparar la frecuencia de AN de pollos de fragata tijereta con pollos de gaviota bajacaliforniana, siendo mayores en las gaviotas. En aves adultas se encontraron diferencias al comparar las frecuencias de albatros de Laysan con la fragata tijereta, siendo mayor en los albatros. Dentro de los factores que podrían estar implicados en estas diferencias, la zona de forrajeo podría ser el más importante. La prueba de micronúcleos y anormalidades nucleares permitió establecer valores de referencia para las cuatro especies analizadas, además el monitoreo de estas aves a través de esta prueba permitirá la detección temprana de contaminantes genotóxicos.Currently, the increasing pollution in marine ecosystems, resulting from human activities, has endangered many species. Seabirds are a group particularly affected by pollution. Moreover, due to their ecological characteristics, such as their high position in the food chain and longevity, they have been used as a group of bioindicator organisms. The objective of this thesis work was to determine the frequency of nuclear abnormalities (NA) present in four species of seabirds from the Baja California Peninsula: the magnificent frigatebird, Laysan albatross, yellow-footed gull, and brown pelican. Additionally, to identify possible differences in the frequencies associated with the year, age, and species. The frequency of nuclear abnormalities was determined using the micronuclei and nuclear abnormalities test, by fluorescence microscopy. Subsequently, the Mann-Whitney U test was used to determine significant differences between two compared groups. No age effect on the frequency of NA was found, nor were there interannual variations. However, significant differences were observed when comparing the frequency of NA in magnificent frigatebird chicks with yellow-footed gull chicks, with higher values in the gulls. In adult birds, differences were found when comparing the frequencies of Laysan albatrosses with frigatebirds, with higher values in the albatrosses. Among the factors that could be involved in these differences, foraging areas could be the most important. The micronuclei and nuclear abnormalities test allowed for the establishment of reference values for the four analyzed species. Furthermore, monitoring these birds through this test will allow for the early detection of genotoxic contaminants
Introducción a la Crisis Ambiental: Temas Clave y Desafíos
No full textLa crisis ambiental simboliza un complejo reto para la humanidad contemporánea. Resolver la problemática que plantea demanda de una acción global expedita y concertada. En el conjunto de efectos que se asocian a esta crisis podemos ubicar al cambio climático, a la pérdida de biodiversidad, el agotamiento de los recursos y a la contaminación. Plantean desafíos inusitados y demandan soluciones urgentes. Esto en virtud de que las alteraciones inherentes generan notorias implicaciones tanto en lo económico como en lo social. De esto se deriva la necesidad de soluciones integrales. Más aún, los gobiernos, las industrias, las comunidades y los individuos tienen un papel fundamental que desempeñar en la mitigación de la crisis ambiental a través de la instrumentación de prácticas sostenibles, reformas políticas, avances tecnológicos y la concienciación. Este ensayo aborda estos temas de un modo general. Insta primeramente a reconocer la gravedad de los problemas asociados a la crisis ambiental. Y en segundo lugar enfatiza la necesidad de trabajar en colaboración, si pretendemos lograr el advenimiento de un futuro sostenible y resiliente
Design of Antenna elements inspired by the geometry of the plant leaves
No full textUna antena es un dispositivo que tiene el objetivo de emitir y/o recibir ondas electromagnéticas hacia el espacio libre. Existe una gran diversidad de tipos de antenas que varían en diseño y dimensiones para satisfacer las necesidades de radiación. Las plantas presentan una variedad de formas con características específicas que operan a ciertas longitudes de onda en el espectro electromagnético. Para cumplir estas especificaciones de diseño, las geometrías presentes en las hojas de las plantas son estudiadas y analizadas, se describe el procedimiento para construir parches de antena “microstrip” y se evalúa las geometrías que representan una hoja real capturada de la naturaleza. Además, se analizan y se comparan las propiedades relacionadas a su desempeño eléctrico en una antena de parche “microstrip”, como el coeficiente de reflexión y el diagrama de radiación.An antenna is a device that emits and/or receives electromagnetic waves into free space. There is a wide variety of antenna types, which vary in design specifications and dimensions to meet radiation needs. Plants have shown a variety of shapes with specific characteristics that operate at certain wavelengths in the electromagnetic spectrum. The geometries present in plant leaves are studied and analyzed to meet these design specifications. The procedure to build “microstrip” antenna patches is described and the geometries that represent a real leaf are captured from nature and evaluated. Furthermore multiple leaves are analyzed and compared considering the properties related to their electrical performance in a “microstrip” patch antenna such as the reflection coefficient and the radiation pattern
Obtention and characterization of vNAR-type neutralizing antibodies of the soluble human receptor of IL6 and IL-1B cytokines
No full textEl síndrome de liberación de citocinas (CRS) es una patología severa derivada de una respuesta inflamatoria sistémica exacerbada, y es inducido por medicamentos, inmunoterapias e infecciones virales graves. La interleucina 6 (IL-6) y la interleucina 1β (IL-1β) son citocinas proinflamatorias asociadas al desarrollo del CRS, por lo que son consideradas como blanco terapéutico para tratamientos contra la inflamación. En este proyecto de tesis, se propuso el uso de fragmentos de anticuerpos tipo vNAR por su tamaño reducido, gran afinidad por su antígeno y su capacidad de penetración en los tejidos lo que los hacen una plataforma biológica ideal para contribuir con el desarrollo de tratamientos para la neutralización de moléculas como las citocinas mencionadas. Se obtuvo el vNAR W1β6 en un estado desnaturalizado, pero del cual se pudo obtener una fracción renaturalizada mediante el método de On column refolding y presentó capacidad de reconocimiento por la citocina IL-1β mediante ELISA. Para el receptor soluble de la IL-6 se obtuvieron siete vNARs que reconocen al complejo del receptor de la IL6 con su citocina (IL6R/IL6) mediante ELISA. De los anteriores se eligieron los vNARs candidatos IL6R-8 e IL6R-16 para determinar su capacidad de reconocimiento a diferentes concentraciones del antígeno, siendo IL6R-8 el que presentó una mejor capacidad de reconocimiento a la cantidad más baja de antígeno (7.8 ng). En el ensayo de neutralización del complejo IL6R/IL6, el vNAR V13 no detectó los niveles de producción de VEGF inducidos por el complejo en la línea celular epitelial C33A, al encontrarse por debajo de su límite de detección. Se obtuvieron tres anticuerpos con potencial de neutralización para las dos citocinas de interés en este trabajo. Por lo tanto, es necesario evaluar la capacidad neutralizante de los vNARs W1β6, IL6R-8 e IL6R-16 realizando los ensayos in vitro mediante la inmunodetección de la proteína STAT3 fosforilada y la detección de VEGF con un anticuerpo comercial anti-VEGF.El síndrome de liberación de citocinas (CRS) es una patología severa derivada de una respuesta inflamatoria sistémica exacerbada, y es inducido por medicamentos, inmunoterapias e infecciones virales graves. La interleucina 6 (IL-6) y la interleucina 1β (IL-1β) son citocinas proinflamatorias asociadas al desarrollo del CRS, por lo que son consideradas como blanco terapéutico para tratamientos contra la inflamación. En este proyecto de tesis, se propuso el uso de fragmentos de anticuerpos tipo vNAR por su tamaño reducido, gran afinidad por su antígeno y su capacidad de penetración en los tejidos lo que los hacen una plataforma biológica ideal para contribuir con el desarrollo de tratamientos para la neutralización de moléculas como las citocinas mencionadas. Se obtuvo el vNAR W1β6 en un estado desnaturalizado, pero del cual se pudo obtener una fracción renaturalizada mediante el método de On column refolding y presentó capacidad de reconocimiento por la citocina IL-1β mediante ELISA. Para el receptor soluble de la IL-6 se obtuvieron siete vNARs que reconocen al complejo del receptor de la IL6 con su citocina (IL6R/IL6) mediante ELISA. De los anteriores se eligieron los vNARs candidatos IL6R-8 e IL6R-16 para determinar su capacidad de reconocimiento a diferentes concentraciones del antígeno, siendo IL6R-8 el que presentó una mejor capacidad de reconocimiento a la cantidad más baja de antígeno (7.8 ng). En el ensayo de neutralización del complejo IL6R/IL6, el vNAR V13 no detectó los niveles de producción de VEGF inducidos por el complejo en la línea celular epitelial C33A, al encontrarse por debajo de su límite de detección. Se obtuvieron tres anticuerpos con potencial de neutralización para las dos citocinas de interés en este trabajo. Por lo tanto, es necesario evaluar la capacidad neutralizante de los vNARs W1β6, IL6R-8 e IL6R-16 realizando los ensayos in vitro mediante la inmunodetección de la proteína STAT3 fosforilada y la detección de VEGF con un anticuerpo comercial anti-VEGF
Morphologic and genetic characterization of polydorid species affecting Magallana gigas cultured in the San Quintin Bay
No full textEl ostión Magallana gigas u ostión japonés, es uno de los moluscos bivalvos de mayor importancia y producción a nivel mundial. En México la mayor producción de este bivalvo se obtiene en la Bahía de San Quintín (BSQ), en el estado de Baja California, que ronda las 2,000 toneladas anuales. Los moluscos bivalvos en general y el ostión japonés en particular están expuestos a la infestación por gusanos perforadores de la familia Spionidae que conforman el complejo Polydora-Boccardia. Una de sus características principales es que poseen la capacidad de asentarse sobre conchas calcáreas para después perforarlas, formando túneles donde establecen un refugio para vivir. Desde 1997, se han registrado la presencia de este tipo de gusanos en la BSQ afectando su cultivo y, hasta la fecha no se han identificado correctamente. En estudios recientes se corroboró la presencia de dos fenotipos en la Bahía, lo cual hace imprescindible su correcta identificación. El objetivo del presente estudio fue caracterizar morfológica y genéticamente ambos fenotipos. Para tal efecto, se obtuvieron ostiones cultivados en nueve granjas de la Bahía y se extrajeron los polidóridos mismos que fueron identificados por taxonomía convencional bajo un microscopio y siguiendo claves dicotómicas. Adicionalmente, se complementó esta identificación con ayuda de microscopia electrónica de barrido (MEB). Para la caracterización genética se realizó secuenciación Sanger y su secuenciación masiva de próxima generación. Los resultados obtenidos del análisis taxonómico convencional indicaron que uno de los fenotipos corresponde a Polydora websteri, lo que fue confirmado con el análisis genético molecular, que indicó una similitud del 99.5% con esta especie. El análisis taxonómico convencional y por MEB del segundo fenotipo indicó que se trata de un polidórido del género Boccardiella sin coincidir con ninguna de las especies descritas para el género. El análisis del genoma mitocondrial corroboró su pertenencia al género indicado, pero con una escasa similitud (79.85%) con una de las especies descritas, Boccardiella hamata, corroborando que se trata de una nueva especie denominada Boccardiella Vicentina. Así mismo, se diseñaron marcadores específicos para identificar a esta nueva especie, dando una herramienta diagnóstica de gran utilidad para el seguimiento de este epibionte.The Magallana gigas oyster or Japanese oyster is one of the most important bivalve molluscs and production worldwide. In Mexico, the largest production of this bivalve is obtained in San Quintín Bay (BSQ), in the state of Baja California, which is around 2,000 tons per year. Bivalve molluscs in general and Pacific oysters are exposed to infestation by borer worms of the Spionidae family that make up the Polydora-Boccardia complex. One of its main characteristics is that they can settle on calcareous shells and then drill them, forming tunnels where they establish a shelter to live. Since 1997, the presence of this type of worms has been recorded in the BSQ affecting its cultivation and, to date, they have not been correctly identified. Recent studies confirmed the presence of two phenotypes in the Bay, making their correct identification essential. The aim of this study was to characterize both phenotypes morphologically and genetically. For this purpose, cultured oysters were obtained from nine farms in the Bay and the polydorids themselves, which were identified by conventional taxonomy under a microscope and following dichotomous keys, were extracted. Additionally, this identification was complemented with the help of scanning electron microscopy (SEM). For genetic characterization, Sanger sequencing and next generation massive sequencing were performed. The results obtained from the conventional taxonomic analysis indicated that one of the phenotypes corresponds to Polydora websteri, which was confirmed with the molecular genetic analysis, which indicated a 99.5% similarity with this species. The conventional taxonomic analysis and by SEM of the second phenotype indicated that it is a polydorid of the genus Boccardiella without coinciding with any of the species described for the genus. The analysis of the mitochondrial genome corroborated its belonging to the indicated genus, but with little similarity (79.85%) with one of the described species, Boccardiella hamata, corroborating that it is a new species called Boccardiella Vicentina. Likewise, specific markers were designed to identify this new species, providing a very useful diagnostic tool for monitoring this epibiont
Analysis of extreme precipitation during 2018 in eastern Mexico
No full textLas tormentas convectivas que generan precipitación extrema en México pueden llegar a producir daños graves, por lo que es importante estudiar los procesos que las generan con observaciones y modelos. En este trabajo se analiza la precipitación horaria, estacional y extrema que ocurrió en el 2018 en la región oriental de México, año en el que no entraron ciclones tropicales. Se utilizaron observaciones de precipitación (CHIRPS y PERSIANN-CCS), y variables atmosféricas del reanálisis ERA5 y un modelo regional no hidrostático a 4.5 km de resolución, el cual resuelve explícitamente la convección, en modo climático (RegCM4-NH) y en modo pronóstico (RegCM4-NH*). Los resultados muestran que todas las bases de datos producen un ciclo anual de precipitación con distribución bimodal y una canícula, con algunos sesgos entre ellas. A escala diurna, PERSIANN-CCS y ERA5 concuerdan en que la lluvia ocurre primero en las zonas de montaña en la tarde-noche, en la nochemadrugada en la costa y, en el océano en la madrugada-primeras horas del día, mientras que el RegCM4-NH sólo reproduce el ciclo diurno en la montaña. Se analizó la evolución de la circulación de dos eventos extremos diarios cuya precipitación (umbral P95 > 100 mm d-1 ) fue capturada por todas las bases de datos. El primer evento se asoció a una inestabilidad anómala en los vientos alisios y fuerte circulación ciclónica que generó inundaciones y daños en la zona fronteriza de Tamaulipas/Nuevo León el 21 de junio. El segundo evento ocurrió el 17 de octubre y fue debido al paso del frente frío No. 6 y un evento norte sobre el Golfo de México. ERA5 identificó la zona de los dos extremos con la circulación en superficie y altura, mínimos en la radiación de onda larga saliente, alta humedad relativa, ascensos en la vertical y divergencia en altura. RegCM-NH* no fue capaz de simular adecuadamente la circulación ni la precipitación del primer evento. Durante el segundo evento, el RegCM4-NH* capturó bien la circulación del evento norte pero no la precipitación. Los resultados del modelo indican que es necesario realizar nuevas simulaciones con el RegCM4-NH y RegCM4-NH* para mejorar la representación asociada a la precipitación y tormentas convectivas.Convective storms that generate extreme precipitation in Mexico can produce flash floods, landslides, and serious damage to population, so it is critical to study the processes that precipitation during 2018 in the eastern region of Mexico, a year with no entrance of tropical cyclones. For this, precipitation observations (CHIRPS and PERSIANN-CCS) were used, as well as atmospheric variables from a reanalysis (ERA5) and a non-hydrostatic regional climate model at 4.5-km horizontal resolution, which explicitly resolves the convection, in climate (RegCM4-NH) and forecast (RegCM4-NH*) modes. The results show that all the databases produce an annual precipitation cycle with a bimodal distribution and a midsummer drought, with some biases among them. On a diurnal scale, PERSIANN-CCS and ERA5 agree that rainfall occurs first in mountain areas in the evening-night, at night-early morning on the coast, and in the ocean in the early morning to early hours of the day, while RegCM4-NH only reproduces the diurnal cycle in the mountains. The circulation of two daily extreme events, whose precipitation (P95 threshold of approximately 150 mm d-1 ) was captured by all the databases, were analyzed in detail. The first event was associated with anomalous instability in the trade winds and strong cyclonic circulation that caused flooding and damage near the Tamaulipas/Nuevo León borderline on June 21. The second event occurred on October 17 and was due to the passage of cold front No. 6 and a Norte wind event over the Gulf of Mexico. ERA5 identified the region for the two extremes events with the circulation on the surface and mid-troposphere, minimum values in the outgoing long-wave radiation, high relative humidity, updrafts, and divergence in the upper troposphere. RegCM4-NH* was not able to simulate the location of the circulation and neither the precipitation related to the storm during the first event. In contrast, during the second event, RegCM4- NH* captured the North event circulation properly but not the precipitation. These results indicate that it is necessary to carry out new simulations with RegCM4-NH and RegCM4-NH* in the region to improve the representation of the processes associated with precipitation and convective storms
The Gulf of California circulation using a simulation of the global numerical model HYCOM
No full textEl presente trabajo analiza la circulación en el Golfo de California (GC) utilizando una simulación de un año (2011-2012) del modelo numérico global HYCOM (Hybrid Coordinate Ocean Model). La simulación tiene una resolución de (1/12.5) ° e incluye forzamiento de mareas. La circulación en toda la columna de agua del GC se ve dominada por la presencia de varios remolinos que van alternando su sentido de rotación a lo largo del golfo. Los remolinos presentan variación estacional, siendo unos más energéticos en verano y otros en otoño-invierno. En el promedio anual del transporte de volumen en la boca del golfo se distinguieron 6 capas con agua entrando por arriba de los 65 m (0.134 Sv, 1 Sv=1 × 106 m3s-1), saliendo entre 65 y 174 m (0.212 Sv) y entrando entre 174 y 369 m (0.133 Sv). Los valores de transporte en las tres capas superficiales implican que dentro del golfo tiene que ocurrir subsidencia de la primera a la segunda capa, y surgencia de la tercera a la capa intermedia. El ciclo anual de la primera y la cuarta capa (370-800 m) están 180˚ fuera de fase, con máximo transporte entrando (saliendo) en la primera (cuarta) capa en julio. En noviembre el intercambio se invierte con agua saliendo (entrando) por la primera (cuarta) capa. Los valores extremos del ciclo anual de este intercambio oscilan entre 0.4 y 0.8 Sv. El agua entra al golfo por la mitad de la boca pegada al continente y sale en una región más confinada del lado de la península. El promedio anual del transporte neto barotrópico de salida (que es casi igual al transporte de entrada) a través de la boca del golfo fue de 1.02 Sv, lo cual nos permitió calcular una cota mínima del tiempo de residencia del golfo que fue de aproximadamente 4 años. En el promedio anual del transporte neto de calor el modelo no exportó calor, si no que importó una cantidad relativamente pequeña. Esto puede deberse a que el forzamiento superficial no captura bien la ganancia de calor en el golfo y/o a variaciones interanuales. El modelo captura bien el ciclo estacional del flujo de calor en la boca, coincidiendo con resultados publicados previamente: la entrada máxima de calor a finales de junio y la salida máxima de calor a finales de octubre.In the present work, the circulation of the Gulf of California (GC) is analyzed using a one-year simulation (2011-2012) of the global numerical model HYCOM (Hybrid Coordinate Ocean Model). The simulation has a resolution of (1/12.5) ° and includes tidal forcing. The circulation in the entire GC water column is dominated by the presence of several eddies that alternate their sense of rotation throughout the gulf. The eddies have seasonal variation, some being more energetic in summer and others in autumn-winter. In the mouth of the gulf the annually averaged transport of volume shows six layers with inflow above 65 m (0.134 Sv=1 × 106 m3s-1), outflow between 65 and 174 m (0.212 Sv) and inflow between 174 and 369 m (0.133 Sv). The transport values in these three surface layers imply that there must be a subsidence from the first to the second layer, and upwelling from the third to the intermediate layer, within the gulf. The annual cycle of the first and fourth (369-788 m) layers is 180˚ out of phase with maximum inflow (outflow) in the first (fourth) layer in July. In November the exchange reverses with outflow (inflow) in the first (fourth) layer. The maximum values of this exchange oscillate between 0.4 and 0.8 Sv. The water flows into the gulf through the half of the mouth section attached to the mainland and flows out in a more confined region on the side of the peninsula. The average annual net outflow barotropic transport (which is almost equal to inflow transport) across the mouth of the gulf was 1.02 Sv, which allowed us to calculate a minimum bound residence time of approximately 4 years. In the annual average of net heat transport, the model did not export heat, but rather imported a relatively small amount. This may be due to the model’s surface forcing not capturing the heat gained by the gulf from the atmosphere and/or interannual variations. However, the model captures the seasonal cycle of heat flow at the mouth well, which is a result that coincides with what is reported in the literature: maximum heat input at the end of June and maximum heat output at the end of October
Geological and petrogenetic study of Protrozoic-Paleozoic basement from the central-southern sector of the Chiapas Massif Complex, Mexico
No full textEl Complejo Macizo de Chiapas (CMC) está constituido por rocas ígneas, metaígneas y metasedimentarias con edades del Mesoproterozoico al Mioceno. Dominantemente, el CMC secompone del Batolito de Chiapas (Pérmico tardío) que embeben y separan la Unidad Custepec (Paleozoico) del Complejo El Triunfo (neoproterozoico-paleozoico temprano), en los sectores centrosur y suroriental del Macizo. No existen trabajos que describan la naturaleza y eventos registrados en el área que conecta a ambos basamentos. Se presenta la cartografía geológica, análisis petrográficos, geocronología U-Pb (zircón) y Sm-Nd (granate), isotopía de Sm-Nd (roca total) y de Lu-Hf y oxígeno (zircón), así como geoquímica (roca total) de muestras del basamento ígneo y metaígneo encontrado en esta área. Inicialmente, se reporta y define un basamento del Calymmiano, Unidad Catarina, compuesto por gneis granítico y anfibolita, con edades modelo de manto empobrecido de Nd (TDM(Nd)) entre 2.0 y 1.8 Ga y de Hf en zircón (TDM(Hf)) entre 2.19 y 2.06 Ga (corteza promedio), y cuyos protolitos ígneos cristalizaron entre ~1.58 y ~1.50 Ga. Esta Unidad se formó por elretrabajamiento de una corteza paleoproterozoica y su mezcla con material juvenil en la margen continental activa de la esquina noroccidental de Amazonia en el Calymmiano. En el Toniano, durante la extensión y colapso del orógeno formado por la colisión de Amazonia y Báltica durante el ensamble de Rodinia, un evento tectonotermal causó la fusión parcial y retrabajamiento de la Unidad Catarina a los ~0.96 – 0.94 Ga, produciendo los protolitos ígneos del ortogneis cuarzo-feldespático con biotita. Adicionalmente, las anfibolitas y ortogneises anfibolíticos de la Unidad Custepec, junto con los granitoides que conforman el Batolito de Chiapas registran tres pulsos magmáticos durante el Paleozoico tardío, uno a los ~278 – 271 Ma, el segundo, probablemente, en el Pérmico tardío y el último a los ~255 – 249 Ma. La geoquímica, isotopía de Sm-Nd y núcleos de zircones heredados indican que la corteza proterozoica fue retrabajada y rejuvenecida durante los tres pulsos, en presencia del manto litosférico para el Pérmico temprano y del manto astenosférico a partir del Pérmico tardío. Esto se interpreta en términos de la transición de un arco volcánico en el noroccidente de Gondwana para el Carbonífero-Pérmico temprano, seguido por la ruptura del slab en el Pérmico tardío (después de la colisión entre Laurencia y Gondwana), a un ambiente post-colisional ...The Chiapas Massive Complex (CMC) is composed of Mesoproterozoic to Miocene igneous, metaigneous, and metasedimentary rocks. The CMC is mainly composed of the Chiapas Batholith (latest Permian), which enfolds and separates the Paleozoic and the Neoproterozoic-early Paleozoicinliers of Custepec Unit and El Triunfo Complex, located in the central-southern and southeastern sectors of CMC, respectively. Studies describing the basement and the events recorded by it in the area connecting both crustal inliers are scarce. This thesis presents geological mapping, petrographic analyses, U-Pb zircon and Sm-Nd garnet geochronology, Sm-Nd (whole-rock), Lu-Hf and oxygen (zircon) isotope systematics, and whole-rock geochemistry of the igneous and metaigneous basement from the central-southern sector of CMC. First, a newly discovered Calymmian basement is reported and defined as the Catarina Unit. This unit comprises felsic and mafic orthogneiss with protolith crystallization ages ~1.58 to ~1.50 Ga and Nd and Hf depleted mantle model ages between (TDM(Nd)) 2.0 and 1.8 Ga and (TDM(Hf)) between of 2.19 and 2.06 Ga (average crust). The Catarina Unit formed by crustal reworking of a Paleoproterozoic crust and its mixing with juvenile material in an active continental margin established in the NW corner of the Amazon craton in the Calymmian. By Tonian times, after Rodinia amalgamation and during the ongoing extension and collapse of the orogen formed by Amazonia and Baltica collision, a tectonothermal event caused the partial melting and crustal reworking of the Catarina Unit at ~0.96 – 0.94 Ga, producing the biotite quartz-feldspathic orthogneiss magmatic protoliths. Furthermore, the amphibolite and amphibolitic gneiss of the Custepec Unit, next to the Chiapas Batholith granitoids record three magmatic pulses during the late Paleozoic in the CMC, the first at ~278 – 271 Ma, the second probably occurred in the late Permian and the last one at ~255 – 249 Ma. Geochemistry, Sm-Nd isotope systematics, and inherited zircon cores indicate that reworking and rejuvenation of a Proterozoic crust took place during the three pulses, in the presence of the lithospheric mantle in the early Permian and the asthenospheric mantle since the late Permian. These results are interpreted in terms of the transition from a volcanic arc in the NW margin of Gondwana in the Carboniferous-early Permian, followed by the Rheic slab break-off in the late Permian (after Laurentia and Gondwana collided)..
Taxonomic and functional diversity of the epibenthic macroinvertebrate community in La Paz Bay, B.C.S.
No full textBahía de La Paz (BLP) es un área de transición entre dos grandes provincias zoogeográficas marinas, reflejando una gran diversidad biológica en el Golfo de California. El objetivo del presente estudio fue evaluar la estructura comunitaria y ecología funcional de las especies de macroinvertebrados epibénticos en arrecifes de BLP, ya que forman ensambles con roles importantes en la resiliencia y funcionalidad del entorno. El conteo de organismos se realizó a partir de 190 transectos de banda (2 x 25 m), en seis sitios alrededor de la bahía, mediante cinco muestreos durante el periodo de noviembre de 2017 a enero de 2019. Se comparó entre sitios y muestreos la diversidad taxonómica con los índices de riqueza (S), Simpson (λ), Shannon (H’), equitatividad (J’) y la diversidad funcional utilizando los atributos funcionales de cada especie para calcular indicadores como la riqueza funcional (FRic), uniformidad (FEve), divergencia (FDiv) y entropía de Rao (FDQ). Se hallaron 3731 individuos de 64 especies, representados por los phyla Echinodermata (22 sp., 2594 ind.), Mollusca (18 sp., 635 ind), Arthropoda (15 sp., 273 ind.), Cnidaria (6 sp., 54 ind.) y Annelida (3 sp., 175 ind.), los cuales formaron un total de 21 grupos funcionales. En general, comparando los seis sitios alrededor de la bahía, dos sitios mantuvieron patrones ecológicos contrastantes (ANOVA, p˂0.001), con el sitio Swanny con significativamente mayor diversidad (S= 8 sp., H’= 1.70, λ= 0.75, J’= 0.86) y funcionalidad (FRic= 10.5, FEve= 0.77, FDiv= 0.71, FDQ= 16.35) y el sitio Calerita con menor diversidad, tanto taxonómica (S= 3 sp., H’= 0.73, λ= 0.42, J’= 0.84) como funcional (FRic= 2.53, FEve= 0.82, FDiv= 0.73, FDQ= 9.89). Se destacaron diez especies que conformaron el 80% de la abundancia relativa: Eucidaris thouarsii (679 ind.), Phataria unifascialis (620 ind.), Toxopneustes roseus (339 ind.), Pharia pyramidata (307 ind.) y Pinctada mazatlanica (304 ind.). Con este estudio, se entienden mejor los patrones de escalas espaciales pequeños (dentro de la misma bahía) y provee mayor conocimiento sobre la funcionalidad y manejo de estas especies en BLP, la cual es una zona de interés turístico y pesquero.La Paz Bay (BLP) is a transitional area between two marine zoogeographic provinces with high biodiversity in the Gulf of California. The aim of this study was to determine the community structure and functional ecology of epibenthic macroinvertebrate species in BLP, as they form assemblages that play important roles in the resilience and functionality of the ecosystem. Organisms were evaluated in 190 band transects (2 x 25 m), at six sites over five survey periods, from November 2017 to January 2019. Site and seasonal comparisons of taxonomic diversity indices such as richness (S), Simpson (λ), Shannon (H'), and evenness (J') ; and of functional diversity using the functional traits of each species to calculate indicators such as functional richness (FRic), evenness (FEve), divergence (FDiv), and Rao's entropy (FDQ), were conducted. A total of 3731 individuals of 64 species were found, represented by the phyla Echinodermata (22 sp., 2594 ind.), Mollusca (18 sp., 635 ind.), Arthropoda (15 sp., 273 ind.), Cnidaria (6 sp., 54 ind.), and Annelida (3 sp., 175 ind.), which formed 21 functional groups. Two sites showed consistent contrasting ecological patterns (ANOVA, p<0.001). The Swanny site showed significantly higher taxonomic diversity (S=8 sp., H'=1.70, λ=0.75, J'=0.86) and functionality (FRic=10.5, FEve=0.77, FDiv=0.71, FDQ=16.35), while the Calerita site showed lower taxonomic (S=3 sp., H'=0.73, λ=0.42, J'=0.84) and functional diversity (FRic=2.53, FEve=0.82, FDiv=0.73, FDQ=9.89). Ten species represented 80% of the relative abundance: Eucidaris thouarsii (679 ind.), Phataria unifascialis (620 ind.), Toxopneustes roseus (339 ind.), Pharia pyramidata (307 ind.), and Pinctada mazatlanica (304 ind.). The exploration of these small–scale spatial patterns provides a better understanding of the functionality and management of these species in BLP, which is an important area for tourism and fishing
The oxygen minimum zone as driver of the habitat of marine predators in the northern Humboldt Current system
No full textLos depredadores tope altamente móviles necesitan hábitats con condiciones ambientales que tengan el potencial de agregar una alta abundancia de presas con una alta calidad energética para maximizar el éxito de su forrajeo. Hasta ahora, estos hábitats generalmente han sido caracterizados en términos de indicadores físicos y biológicos de alta productividad, capaces de atraer y sostener presas. Sin embargo, aún no han sido cuantificados los efectos de una característica biofísica del océano con efectos probados en la distribución vertical de potenciales presas: la profundidad del límite superior de la zona de mínimo oxígeno (ZMO). En la parte norte del Sistema de la Corriente de Humboldt frente a Perú (∼ 3-18° S), una ZMO poco profunda (30-50 m) afecta la distribución de la anchoveta peruana (Engraulis ringens), presa principal de varios depredadores marinos, incluidos las aves marinas y los delfines. Se hipotetiza que estos depredadores se agruparían en áreas productivas, pero con preferencia por lugares donde la profundidad relativa de la ZMO puede restringir a la presa verticalmente, haciéndola más accesible y maximizando el éxito de forrajeo. Se ajustaron modelos bayesianos de hábitat para seis especies de depredadores superiores predominantes en esta región, con múltiples combinaciones de covariables ambientales, técnicas de suavizado y efectos aleatorios temporales y espaciales. Los datos de aves marinas y cetáceos provienen de 23 cruceros científicos realizados por el Instituto del Mar del Perú durante entre el 2001 y el 2019. Los predictores de hábitat incluyeron las anomalías espaciales de la temperatura superficial del mar, la clorofila-a, la profundidad de la picnoclina y la profundidad de la ZMO. Los delfines oscuros (Lagenorhynchus obscurus) y comunes (Delphinus delphis) mostraron preferencias por áreas productivas y frías con una ZMO muy poco profunda, independientemente de la estación del año, mientras que los tursiones (Tursiops truncatus) se agregaron tanto en aguas frías como cálidas, también con ZMO poco profundas. Las dos primeras especies, de mayores demandas metabólicas, maximizarían la energía al seleccionar áreas con presas constreñidas en las capas superficiales, mientras que la última, con necesidades metabólicas más moderadas y dieta más diversa, explotaría hábitats menos restringidos. Los cormoranes guanayes (Leucocarbo bougainvilliorum) y pelícanos peruanos (Pelecanus thagus) mostraron preferencias por áreas costeras, product...Highly mobile top predators need habitats with environmental conditions with the potential of aggregating enough and high-quality prey, to maximize foraging success. Until now, the characterization of those habitats was in terms of physical and biological indicators of high production, capable of attracting and sustaining prey. Nevertheless, there has been no approach to quantifying the effects of a biophysical characteristic of the ocean with proven effects on the vertical distribution of potential prey for top predators: The upper limit of the oxygen minimum zone (OMZ) depth. In the northern branch of the Humboldt Current System off Peru (∼ 3-18° S), a shallow OMZ (30-50 m) affects the distribution of the Peruvian anchovy (Engraulis ringens), main prey for several marine predators, including seabirds and dolphins. We hypothesized these predators would aggregate in productive areas, but with preference for places where the relative OMZ depth can constrain prey vertically, making it more accessible and maximizing foraging success. We fitted Bayesian habitat models for six dominant top predator species in this region, with multiple combinations of environmental covariates, smoothing techniques, and temporal and spatial random effects. Cetacean data came from 23 dedicated scientific surveys carried out by Instituto del Mar del Perú spanning 2001-2019. Habitat predictors included the spatial anomalies of sea surface temperature, surface chlorophyl-a, pycnocline depth and OMZ depth. Dusky (Lagenorhynchus obscurus) and common dolphins (Delphinus delphis) preferred productive, cold areas with a very shallow OMZ, regardless of the season, while bottlenose dolphins (Tursiops truncatus) aggregated in both cold and warm waters, also with shallow OMZ. The former two species of higher metabolic demands would maximize energy intake by selecting areas with constrained prey in the upper layers, while the latter, of more moderate metabolic needs and more diverse prey, would exploit less restricted habitats. Cormorants (Leucocarbo bougainvilliorum) and pelicans (Pelecanus thagus) showed preferences for productive and cold coastal areas with a shallow OMZ. Boobies (Sula variegata) occupied productive with both shallow and deep OMZ areas due to a high flight range. The gregarious foraging behavior of cormorants would condition them to forage on large anchovy schools aggregated in the upper layers of coastal areas. Boobies, which can prey on more dispersed prey given they ..