Repositorio Digital Ikiam (Univ. Regional Amazónica)
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Geographic Distribution, Habitat, Reproduction, and Conservation Status of Crocodilians in the Americas
Get PDFThe chapter gives an introductory overview on the biology of the 11 species of crocodilians inhabiting the Americas. Geographical distribution is broadly discussed in the light of biogeographical and evolutionary origins. As a broad generalization, crocodilians are morphologically, genetically, and ecologically conservative and show a high dispersal ability, which together complicate the delimitation of species boundaries. Furthermore, distinct clades of crocodilians are a result of environmental selection for different adaptive characteristics. Gene flow occurs between clades, but distinct morphological varieties are sometimes a result of environmental filters. Thus, many taxa of crocodilians can be considered ecological species. Reproductive characteristics, such as nest-site choice and female reproductive output, influence reproductive success and thus population trends, so we discuss reproductive and habitat characteristics in the light of conservation genetics. Finally, the status of crocodilians is discussed both in terms of past hunting pressure and current conservation and management initiatives. In general, crocodilians can look after themselves if they have sufficient habitat, but some species are critically endangered by hunting, even though much of their original habitat remains intact. Conservation actions must be applied locally, taking into account threats and dispersal between source and sink populations. Given the difficulty of studying the dispersal of crocodilians by direct observation in most places in Latin America, the definition of effective management units will depend on genetic studies that can be linked to economic or conservation goals
Diseño de redes de monitoreo de calidad del agua en cuencas Amazónicas: Caso de estudio en la cuenca del río Tena
Get PDFEl incremento poblacional de la ciudad de Tena de los últimos cinco años ha alterado física, química y biológicamente su principal fuente hídrica, esto denota la importancia de monitorear el estado de la calidad del agua del río Tena. El diseño de redes de monitoreo con estaciones (sitios) para medir la calidad del agua, que incluya análisis hidroquímicos, biológicos, ecotoxicológicos y meteorológicos, permite conocer su estado y variabilidad temporal, con respecto a la variabilidad meteorológica (de temperatura, precipitación, humedad relativa, radiación solar) presente en la zona. El objetivo del presente estudio es el diseño de una red de monitoreo de la calidad del agua mediante múltiples líneas de evidencia. Inicialmente se recopiló la información geográfica de los aspectos biofísicos, sociales e información de calidad del agua de estudios anteriores realizados en la cuenca, luego se realizó el monitoreo de los parámetros físico-químico, microbiológicos y ecotoxicológicos. Las variables hidroquímicas se estudiaron mediante componentes principales y análisis jerárquico para la priorización de las variables de significancia para la red. Finalmente, en un mapa se presenta la zonificación de la cuenca para establecer las estaciones (sitios de muestreo permanente), junto con los parámetros y temporalidad sugeridos para el monitoreo. Los sitios sugeridos son los ríos Shitig (Alto Tena), Colonso (RBCC), Pashimbi (URAI), Calmituyaku (Muyuna) y el cauce principal del río Tena (centro de la ciudad), en los cuales se establecen en general monitorear los parámetros correspondientes a los grupos identificados según el tipo de contaminación y la temporalidad seca o lluviosa establecida en la zona de estudio. De esta manera la red de monitoreo se convierte en una herramienta de diagnóstico temprano que ayuda a la toma de decisiones y gestión territorial en la cuenca del río Tena
NefrOmics: Análisis transcriptómico de diferentes líneas celulares del tejido renal humano mediante herramientas bioinformáticas
Get PDFEl incremento de las enfermedades renales ha impulsado la búsqueda de nuevos blancos
terapéuticos. La gran cantidad de datos del transcriptoma y proteoma humano ha
catapultado el uso de herramientas bioinformáticas para buscar estas dianas. En ese
contexto, se propone el uso de este abordaje para analizar datos del transcriptoma de
diferentes tipos celulares del tejido renal humano. Analizamos genes sobreexpresados (Z
score ≥2) y con un porcentaje de sobreexpresión celular ≥ 50% en las células de los túbulos
renales, pericitos 1 y 2, podocitos, células mesangiales/fibroblastos, células musculares
lisas vasculares (vSMC), NKT, células T, macrófagos y células endoteliales. Posteriormente,
construimos tres redes de interacción proteína-proteína y mediante ontología génica
identificamos procesos biológicos, funciones moleculares y componentes celulares
asociados a enfermedades renales. Encontramos 419 genes sobreexpresados en 6 tipos
celulares. En los podocitos encontramos más del 80% de estos genes sobreexpresados
(352). En las células mesangiales encontramos 13 genes, NKT 41 genes, en los pericitos-1 4
genes, en las vSmM 8 genes y en las células T 1 gen. Los resultados de los podocitos se
pueden explicar por su función en el filtrado de moléculas, pero también ya que estas
células pueden desencadenar su propio sistema inmune. Además, proteínas exosomales y
proteínas trasportadoras participan en la respuesta inmune innata lo cual pone de
manifiesto la red de interacción de estas proteínas. En nuestro estudio también
destacamos la sobreexpresión de proteínas ribosomales, deshidrogenasas y proteínas del
choque térmico. A pesar de que algunas de estas proteínas parecen tener un rol
protagónico en algunas enfermedades como la ECR, no todas han sido reportadas en el
desarrollo de patologías renales lo que amerita su estudio
Estudio tomográfico de la corteza del cinturón subandino oriental ecuatoriano alrededor de la zona de la cascada san Rafael usando datos de la rensig.
Get PDFLas características litológicas y estructurales del subsuelo, son conocimientos
importantes al construir una infraestructura estratégica. Por ejemplo, los oleoductos
colapsaron a causa de la erosión regresiva que se vio afectada por la sismicidad,
litología y fallas, al noreste del Ecuador, esto causó problemas sociales y económicos
en el país. La tomografía sísmica permitió inferir las características litología del
subsuelo, donde, las rocas son correlacionadas con las velocidades de ondas sísmicas.
El estudio tuvo como objetivos: determinar las características sismolitológicas,
intrusiones magmáticas, estructuras del sistema volcánico y fallas, en la corteza del
cinturón Subandino Oriental ecuatoriano alrededor de la cascada San Rafael, por medio
de la tomografía sísmica. Las velocidades de ondas sísmica de la Red Nacional de
Sismógrafos (RENSIG) se usaron para los modelos de velocidades de ondas sísmica P
(vP), la variación de las ondas sísmicas P (∆vP) y el modelo vP ⁄ vS. El modelo vP ayudó
a determinar la sismicidad en el área de estudio, encontrando que, la cámara magmática
activa del Volcán Reventador causó mayor sismicidad. Además, el modelo vP permitió
definir a las fallas de Salado, Baeza, Chaco y Cosanga. El modelo ∆vP ayudó a conocer
las geometrías de la Granodiorita y la cámara magmática del Reventador, así mismo
con el Levantamiento Napo y los terrenos Loja y Salado. El modelo de vP/vS registró a
la cámara magmática del volcán Reventador, definiendo las estructuras volcánicas del
subsuelo, afirmando la presencia magma que migran hacia la superficie
Bioproductos desarrollados a partir de micelio de hongos: Una nueva cultu ra material y su impacto en la transición hacia una economía sostenible Fungal mycelium-bioproducts development: A new material culture and its impact on the transition to a sustainable economy
Get PDFEl biodiseño y biofabricación de biomateriales a partir de residuos vegetales lignocelulósicos y auto-generados por el micelio de hongos es un campo de investigación emergente desde las últimas dos décadas. Surge una nueva cultura material que se basa en los nuevos paradigmas de la fabricación alternativa partiendo de la lógica “de hacer crecer los nuevos materiales en lugar de extraerlos” e integrando los principios básicos de la economía circular y de la Biotecnología Material, asegurando la susceptibilidad de los mismos a ser biodegradados y volver a su estado original en la naturaleza. Su implementación a nivel
industrial en distintas áreas de la manufactura comienza a competir con el cuero de origen animal, materiales y productos de origen petroquímico, a la vez que promueve nuevas alternativas de alimentos proteicos sustentables que contribuyan al cambio de los patrones de consumo humano de alto impacto ambiental arraigados a nivel global. La presente revisión, aborda una mirada particular que va desde lo molecular a lo global sobre la nueva cultura micelial, considerando aspectos generales del
reino Fungi, la morfogénesis, composición química e integridad celular del micelio, los sistemas multienzimáticos extracelulares
de degradación de lignocelulosa que poseen los hongos, pasando por los principales sustratos empleados, los biomateriales desarrollados a partir de micelio a nivel industrial, destacando los biotextiles, materiales y productos para el empaquetamiento y aislamiento, nuevas fuentes alimentarias basadas en el micelio, el arte y el diseño arquitectónico. Finalmente, se presenta el estado del arte actual de las empresas o laboratorios vanguardistas que suscitan una economía circular basada en el micelio de hongos a nivel mundial, al reemplazar recursos y productos de origen fósil por materiales amigables con el entorno, generando
alternativas sostenibles y ciclos de producción con una baja demanda de energía y sin repercusiones al medio ambiente, es decir, promoviendo una nueva conciencia material
Caracterización bioquímica y efectos del veneno de Bothrocophias microphthalmus en preparaciones neuromusculares.
Get PDFEl género Bothrocophias está formado por seis especies características de
Sudamérica, sin embargo, ha sido muy poco explorado. Actualmente existen solo dos
análisis proteómicos completos correspondientes a B.campelli y B.myersi. Por lo cual, en el
presente estudio se realizó la caracterización bioquímica preliminar, evaluación enzimática
de las principales toxinas y el posible efecto neurotóxico en preparaciones de biventer
cervis de pollo (BCP) y diafragma frénico de ratón (DFR) del veneno de B. microphthalmus.
B. microphthalmus se distribuye desde Colombia hasta Perú. En Ecuador se encuentra en
las provincias de Napo, Pastaza, Zamora Chinchipe, Morona Santiago y Tungurahua.
Nuestros resultados indican que el veneno de B. microphthalmus está probablemente en
su mayoría constituido por metaloproteinasas, serinproteasas y fosfolipasas. Las
actividades enzimáticas analizadas sugieren similitudes y diferencias enzimáticas entre el
veneno de Bothrops atrox y B. microphthalmus, las cuales pueden tener implicaciones
fisiológicas en la víctima, si la respuesta farmacológica es dependiente de la acción
enzimática. B. microphthalmus no genera un efecto neurotóxico como función principal, el
mismo es una consecuencia del daño miotóxico producido por sus diferentes
componentes. Las preparaciones de BCP son más sensibles a los componentes del veneno
que las preparaciones de DFR. B. microphthalmus tiene un mayor efecto neuromuscular
en preparaciones de BCP en comparación con venenos del género Bothrops de Brasil. Por
ende, este trabajo representa un primer paso en el entendimiento de la acción y
composición de este veneno. Futuros estudios deben investigar los demás efectos tóxicos
inducidos por el veneno, así como sus toxinas involucrada
Edaphic heterogeneity and the evolutionary trajectory of Amazonian plant communities
Get PDFWe investigated how the phylogenetic structure of Amazonian plant communities
varies along an edaphic gradient within the non-inundated forests. Forty localities
were sampled on three terrain types representing two kinds of soil: clayey soils of
a high base cation concentration derived from the Solimões formation, and loamy
soils with lower base cation concentration derived from the Içá formation and al luvial terraces. Phylogenetic community metrics were calculated for each locality
for ferns and palms both with ferns as one group and for each of three fern clades
with a crown group age comparable to that of palms. Palm and fern communities
showed significant and contrasting phylogenetic signals along the soil gradient. Fern
species richness increased but standard effect size of mean pairwise distance (SES.
MPD) and variation of pairwise distances (VPD) decreased with increasing soil base
cation concentration. In contrast, palm communities were more species rich on less
cation-rich soils and their SES.MPD increased with soil base cation concentration.
Species turnover between the communities reflected the soil gradient slightly better
when based on species occurrences than when phylogenetic distances between the
species were considered. Each of the three fern subclades behaved differently from
each other and from the entire fern clade. The fern clade whose phylogenetic patterns
were most similar to those of palms also resembled palms in being most species-rich
on cation-poor soils. The phylogenetic structuring of local plant communities varies
along a soil base cation concentration gradient within non-inundated Amazonian rain
forests. Lineages can show either similar or different phylogenetic community struc ture patterns and evolutionary trajectories, and we suggest this to be linked to their
environmental adaptations. Consequently, geological heterogeneity can be expected
to translate into a potentially highly diverse set of evolutionarily distinct community
assembly pathways in Amazonia and elsewher
Electrical resistivity methods to characterize the moisture content in Brazilian sanitary landfill
Get PDFThe moisture content of the municipal solid waste (MSW) is a physical characteristic that plays a fundamental role in the stability and settlement of landfills. However, this physical index is difficult to monitor within the mass of landfilled MSW because it undergoes great variation due, mainly, to the heterogeneity and biodegradation of the waste. Brazilian MSW generally has a large amount of organic matter, that when biodegraded, generates a considerable volume of gases and fluids, aggravated by climatic conditions, such as high rainfall and temperatures. Hence, the importance of obtaining and evaluating the distribution of moisture content in the MSW mass over time. Currently, the electrical resistivity properties have been presented as an interesting approach to obtain the moisture content in landfills indirectly. This study aimed to apply geoelectrical methods as a tool to obtain and evaluate the moisture content distribution in an experimental cell of a sanitary landfill using Archie’s law, which correlates the volumetric moisture content and electrical resistivity. Moisture content values were obtained in laboratory tests with MSW samples collected in two vertical holes and electrical resistivity measurements by means of vertical electrical sounding. The moisture content and the resistivity values of the samples were used to calculate the parameters a and m of Archie’s law. This allowed to convert the resistivity tomography to moisture content tomography. The good correlation achieved between the moisture content calculated by Archie’s law and that obtained from samples indicates that the use of electrical resistivity methods is useful to assess and monitor quantitatively the moisture content in landfills using Archie’s law
Hongos aislados de muestras de asfalto de la cantera de Pungarayacu, Provincia de Napo, Ecuador: un acercamiento in silico a su potencial hidrocarbonoclástico y biotecnológico
Get PDFLos hongos presentan un gran potencial estructural, fisiológico y enzimático que los convierte en
organismos promisorios para ser empleados en procesos de biorremediación de suelos contaminados
con hidrocarburo no convencionales, tales como los que se encuentran depositados en la
Amazonía ecuatoriana. Debido a que existen pocas investigaciones sobre procesos de
biotransformación y/o mineralización microbiológica de asfaltenos, así como a los continuos
derrames de crudos recalcitrantes en esta región megadiversa del planeta tierra con alto impacto
socio ambiental, el presente estudio tuvo como objetivo aislar y caracterizar hongos cultivables
con alto potencial hidrocarbonoclástico provenientes de muestras de asfalto aflorante de la
cantera de Pungarayacu en la Provincia de Napo, Ecuador. Se aislaron e identificaron
molecularmente 6 cepas fúngicas mediante amplificación por PCR y secuenciación de la región
ITS2 pertenecientes a los siguientes géneros y especies: Fusarium croci, Coniochaeta hoffmannii,
Xenoacremonium falcatum, Trichoderma yunnanense, Penicillium amphiboloria y,
Neocosmospora rubicola. Una vez identificadas las cepas aisladas, se procedió a realizar un estudio
de minería de genomas (Genome Minning) para identificar posibles genes y proteínas asociados a
procesos de biorremediación en el genoma del hongo levaduriforme Coniochaeta hoffmannii,
centrando los estudios en lacasas y peroxigenasas aromáticas. Los resultados mostraron que las
enzimas hipotéticas Lac3, POA1 y POA2 poseen características esenciales para ser consideradas
como catalizadores biológicos en procesos de micoremediación ambiental. Los resultados
proporcionados en el presente estudio brindan una base sólida para continuar explorando el
potencial de cepas de hongos aislados de afloramientos naturales de asfalto en la Amazonía
ecuatoriana para la biorremediación de desechos petrolizados y la restauración de ecosistemas
impactado
On the modelling of the vibration behaviors via discrete singular convolution method for a high-order sector annular system
Get PDFThis research presents a numerical investigation on the dynamic information of the axisymmetric sandwich annular sector plate via a higher-order continuum elasticity theory. The sandwich annular sector plate comprises multi-hybrid nanocomposite reinforced (MHCR) face sheets in the top, bottom layers, and a honeycomb core. For modeling the thermal situation and the thickness of the structure, three-kinds of thermal loading are presented. For simulating MHCR face sheets, the role of the mixture and Halpin–Tsai micromechanics model is utilized. For obtaining the governing equations and various boundary conditions, first-order shear deformation theory (FSDT), as well as Hamilton’s principle, are presented. For solving the equations and obtaining eigenvalue, and eigenvector of the current structure, discrete singular convolution method (DSCM) as a numerical one is investigated. Consequently, a parametric study is carried out to examine the impacts of honeycomb network angle, thickness to length ratio of the honeycomb, honeycomb to face sheet thickness ratio, fibers angel, outer to inner radius ratio, and weight fraction of CNTs on the dynamics of the current sandwich structure. The results show that for clamped edge and each th/lh, increasing θh/π is a reason for decreasing the natural frequency of the disk. Another consequence is that the impact of temperature changes on the frequency of the disk is hardly dependent on the fiber angle. It means that the effect of temperature changes on the frequencies of the current system is more considerable at 0.2 ≤ θf ⁄π ≤ 0.4 and 0.6 ≤ θf ⁄π ≤ 0.8