Repositorio Digital Ikiam (Univ. Regional Amazónica)
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Mapping density, diversity and species-richness of the Amazon tree flora
Using 2.046 botanically-inventoried tree plots across the largest tropical forest on Earth, we mapped tree species-diversity and tree species-richness at 0.1-degree resolution, and investigated drivers for diversity and richness. Using only location, stratified by forest type, as predictor, our spatial model, to the best of our knowledge, provides the most accurate map of tree diversity in Amazonia to date, explaining approximately 70% of the tree diversity and species-richness. Large soil-forest combinations determine a significant percentage of the variation in tree species-richness and tree alpha-diversity in Amazonian forest-plots. We suggest that the size and fragmentation of these systems drive their large-scale diversity patterns and hence local diversity. A model not using location but cumulative water deficit, tree density, and temperature seasonality explains 47% of the tree species-richness in the terra-firme forest in Amazonia. Over large areas across Amazonia, residuals of this relationship are small and poorly spatially structured, suggesting that much of the residual variation may be local. The Guyana Shield area has consistently negative residuals, showing that this area has lower tree species-richness than expected by our models. We provide extensive plot meta-data, including tree density, tree alpha-diversity and tree species-richness results and gridded maps at 0.1-degree resolution
Estimación de la recarga de agua subterránea en la cuenca del Río Cutuchi, Cotopaxi, Ecuador
El requerimiento hídrico de las poblaciones en crecimiento ha generado un déficit en las
fuentes de agua subterránea, en ese sentido el objetivo de esta investigación es estimar
la recarga natural por infiltración de agua proveniente de precipitaciones en la cuenca
del río Cutuchi ubicada en la provincia de Cotopaxi. Se utilizaron series temporales de
precipitación para elaborar los modelos de precipitación, temperatura y
evapotranspiración. Los modelos obtenidos incluyendo el uso y tipo de suelo se usaron
para generar un modelo de escurrimiento superficial. Se aplicó la ecuación general de
balance hidrológico en un Sistema de Información Geográfica (SIG) para obtener el
modelo de infiltración. Los resultados indican que del total de la precipitación, el 55,8 %
se evapotranspira, el 16,3 % se escurre superficialmente y que el 27,9 % se infiltra en
el suelo. El volumen calculado que recarga las aguas subterráneas es de 53581,9
Hm3/año y la mayor parte se desarrolla al noroeste y suroeste de la cuenca, llegando a
valores máximos de infiltración de hasta 731,5 mm/año, y se reduce gradualmente hacia
el centro de la cuenca hasta llegar a 24 mm/año de infiltración
Determination of the soil temperature for the potential use of low enthalpy geothermal energy in the Tena Canton, Ecuador
La geotermia de baja entalpía es un tipo de energía que se obtiene del calor natural
almacenado en la parte superficial del subsuelo, el cual aprovecha el diferencial de
temperatura entre el subsuelo y la superficie. Se realizó un estudio para determinar la
distribución vertical de la temperatura del subsuelo durante un periodo de 150 días en tres
lugares del cantón Tena. Se usó datos experimentales para validar un modelo de perfiles
de temperatura, a partir de ese modelo se ha estimado perfiles de temperatura en tres
puntos previamente seleccionados, que poseen diferentes materiales geológicos dentro del
cantón Tena. Los resultados obtenidos se determinaron que las fluctuaciones de
temperatura disminuyen a medida que se profundiza desde superficie. En MB, se identificó
que a partir de los 5m de profundidad las temperaturas tienden a ser constantes a la media
anual del sitio, que es de aproximadamente 25°C. Mientras que en LP y PN, estas se
estabilizaron a los 6 y 8m de profundidad, respectivamente. El método indirecto es menos
preciso en la zona superficial respecto al experimental. Se identifica la zona superficial a 1m de profundidad, zona poco profunda a 5m y se cree que a partir de los 5m en adelante estaría la zona profunda donde la temperatura permanece constante durante un ciclo anual. La validación de resultados teóricos respecto al experimental mediante la correlación de Pearson muestra una buena correlación. La prueba estadística T entre los dos métodos utilizados, identifica que no existen diferencias significativas con respecto al método directTutor: Guzmán, Oswaldo, Cotutor: Valencia, Braya
Caracterización del perfil bioquímico, toxicológico de Bothrops taeniatus y su inmunoreconocimiento por antiveneno
Bothrops taeniatus, es una serpiente de la familia Viperidae, la cual es la responsable de una gran cantidad de accidentes ofídicos en el Ecuador. Esta víbora, siendo una de las más venenosas alrededor del mundo, tiene un especial impacto en comunidades indígenas y áreas rurales. A pesar de la existencia de antivenenos polivalentes dentro de Ecuador, estos no son específicos para B. taeniatus. Además, estos sueros presentan limitaciones, particularmente debido a la variabilidad en la composición del veneno. Esta investigación
se desarrolló por la escasez de información sobre la caracterización de las toxinas de este veneno. Por lo que, el objetivo de este estudio fue caracterizar bioquímica y biológicamente el veneno de B. taeniatus en Ecuador, así como su inmunoreconocimiento por un antiveneno polivalente generado usando venenos colombianos. Se emplearon diversas técnicas como: cromatografía líquida de alta resolución en fase reversa (RP-HPLC),
electroforesis de gel de poliacrilamida con dodecilsulfato de sodio (SDS-PAGE), cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas en tándem (LC-MS/MS), ensayos enzimáticos (fosfolipasa, caseinolíticos, de serino proteasa, y de L-aminoxidasa), y ensayos biológicos en modelos animales CD-1 (hemorrágico, edemogénico y de letalidad). También se evaluó la neutralización del veneno usando un antiveneno comercial. Se encontró una alta abundancia de fosfolipasas A2 (PLA2) y metaloproteasas de veneno de serpiente (SVMP). Los ensayos enzimáticos revelaron una fuerte actividad fosfolipásica.
Asimismo, se observó un efecto edematogénico y una capacidad hemorrágica significativa.
Igualmente, el suero antiofídico logró neutralizar la actividad hemorrágica y letal del
veneno. En conclusión, el análisis del veneno reveló una variedad de toxinas, y variabilidad
en su composición con respecto a otras investigaciones. Estos hallazgos proporcionan una
base sólida para futuros estudios sobre el potencial biotecnológico de sus toxinas, así como
para el desarrollo de antivenenos específicos que requieran menores dosis y reduzcan la
posibilidad de reacciones adversas y potencialmente letales.Tutora: Carolina del Carmen Proaño Bolaño
Diseño arquitectónico sostenible de un complejo deportivo para la Universidad Regional Amazónica Ikiam
La práctica deportiva es de suma importancia para la vida cotidiana de las personas, porque ayuda a mejorar la calidad de vida, mediante el fortalecimiento muscular del cuerpo, ayudando a combatir la obesidad, sedentarismo y la prevención de enfermedades cardiacas(OMS, 2020). En el Ecuador, en los últimos años, se ha evidenciado la carencia de construcciones deportivas y un ejemplo de esto se puede evidenciar en la infraestructura deportiva de la Universidad Ikiam, ya que actualmente el espacio deportivo que es destinado para la realización de actividades deportivas es insuficiente en comparación a la cantidad de usuarios que conforman parte de la comunidad universitaria y no adecuada para su entorno natural, teniendo como
resultado un espacio inutilizado y abandonado por parte de los estudiantes, docentes,
administradores y empleadores. Debido a esto, el presente proyecto busca desarrollar una infraestructura deportiva sostenible para la Universidad Regional Amazónica Ikiam que, muy aparte de brindar instalaciones eficientes para los diferentes deportes, este se integre de manera respetuosa y armoniosamente con su entorno natural puesto que la implantación establecida por el plan maestro de la institución se encuentra en una zona con factores ambientales enriquecedores. Mediante el uso de materiales tecnológicos y
soluciones bioclimáticas, el complejo deportivo para la institución no solo será un espacio construido para el deporte, sino que también aportará con una construcción de cómo la arquitectura sostenible puede adaptarse al lugar y jugar un papel fundamental hacia las construcciones del futuro.Tutora: Myriam Alexandra Larco Beníte
Determinación de coeficiente foliar para la vainilla (Vanilla sp.) y la papa china [Colocasia esculenta (L.) Schott]
El resultado principal obtenido, se basa en la determinación de un coeficiente foliar para cada una de dos especies de plantas de interés para la investigación, la vainilla (Vanilla sp.) y la papa china [Colocasia esculenta (L.) Schott]. El procedimiento seguido consiste en considerar una cantidad adecuada de nodos, tomando las medidas en un sistema de coordenadas rectangulares, ubicada la hoja de forma conveniente, a partir de los cuales se construye utilizando una modificación de la interpolación segmentada de segundo orden, que considera la condición sobre la segunda derivada, en lugar de la primera, con el propósito de modelar el borde de la hoja conservando la intensidad con la que se curva, identificada con la concavidad. Construido el borde de la hoja, se calcula el área que este encierra y se compara con la de un rectángulo que la contiene de forma inscrita, para determinar el coeficiente foliar que pueda ser utilizado en estudios sobre procesos de fotosíntesis en la planta. Son utilizadas dos modalidades de hojas para este fin, las hojas medidas experimentalmente y otro conjunto de hojas, generadas de forma artificial y proporcional, desde las de tamaño menor hasta las más grandes. Los cálculos se realizan con programas formulados en el Asistente Matemático Matlab
Prioritization of a Micro-basin of the Daule River Sub-basin with Strong Erosional Problems and Their Effect to the Turbidity of the Water in the City of Guayaquil, Coastal Ecuador
La toma de agua potable de la ciudad de Guayaquil se encuentra sobre el río Daule, abasteciendo a 2,7 millones de habitantes que se ven afectados por la turbidez del agua, incluso llevando a INERGAGUA a suspender el servicio con altas pérdidas económicas. Ante esto, la erosión hídrica y los efectos del uso del suelo se calcularon utilizando la Ecuación Universal de Pérdida de Suelo (USLE), estimando el factor de erosividad (R) a través del índice de agresividad climática de Fournier. Se utilizaron datos medios mensuales y anuales de precipitaciones de 14 estaciones de la cuenca. Las otras variables como el factor de erodibilidad del suelo (K), la longitud y gradiente de la pendiente (LS), el factor de cobertura (C), el factor de uso y el manejo del suelo (P), se cuantificaron con un análisis matemático de las variables. Inicialmente, la subcuenca se consideró como un modelo global y luego como un modelo distribuido, subdividiéndola en 88 microcuencas, lo que permitió una estimación más precisa de una erosión hídrica anual promedio de 130,04 t/ha/año. Para determinar el tipo y nivel de erosión, se utilizó la escala FAO, observando 14 microcuencas con tasas de erosión que van desde 154.3487 t/ha/año hasta 846.3418 t/ha/año, cuyo rango de erosión va de muy severo a catastrófico, lo que resulta en la necesidad de intervención inmediata. Aplicando el factor de entrega de sedimentos (SDF), se estimó que el 5,12% del total erosionado, es decir, 8.089 toneladas/ha/año llega al río. Palabras claveErosión hídricaSedimentosSubcuencaMicrocuencaNivel de erosió
Species diversity and spatial distribution of mosquitoes (Diptera: Culicidae) from La Isla Amazon Park, Napo Province, Ecuador
Introduction: Vector-borne diseases are prevalent in the Amazon and Coastal regions of Ecuador. However,
there is a scarcity of mosquito ecology studies in these areas. The most recent list of species reported for the
country comprises 8 tribes, 22 genera, and 200 species.
Objectives: To document the Culicidae species found in La Isla Amazon Park, Napo, Ecuador, including those
with epidemiological significance; and to analyze their composition, abundance, and diversity, focusing on larval habitats during the dry and rainy periods.
Methods: We evaluated different larval habitats, considering collection duration as the primary criterion. We
used CDC and Shannon traps to collect adult mosquitoes during both rainy and dry periods. To assess sampling effort, we used accumulation curves and non-parametric estimators of species richness, while we employed Hill numbers to determine diversity. Additionally, we used the Berger-Parker and Pielou indices to evaluate species dominance and evenness. We conducted cluster analysis and ANOSIM tests to assess the similarity between habitats and the differences in taxonomic composition between periods.
Results: We collected a total of 802 individuals from 15 species and 4 taxonomic units, 5 genera, and 4 tribes. Notably, this may be the first records of Wyeomyia felicia Dyar & Núñez Tovar and Culex derivator Dyar & Knab from Ecuador. Additionally, the presence of Culex dunni Dyar and Psorophora ferox von Humboldt (both recog-nized as vectors) was correlated with increased rainfall.
Conclusions: The abundance of mosquitoes, including potential vector species, increased during the rainy sea-son, indicating a higher risk of pathogen transmission. However, the relationship between rainfall amount and diversity patterns is not well-defined
Comprehensive genome-wide identification and expression profiling of ADF gene family in Citrus sinensis, induced by endophytic colonization of Beauveria bassiana
Endophytic entomopathogenic species are known to systematically colonize host plants and form symbiotic associations that benefit the plants they live with. The actin-depolymerizing factors (ADFs) are a group of gene family that regulate growth, development, and defense-related functions in plants. Systematic studies of ADF family at the genome-wide level and their expression in response to endophytic colonization are essential to understand its functions but are currently lacking in this field. 14ADF genes were identified and characterized in the Citrus sinensis genome. The ADF genes of C. sinensis were classified into five groups according to the phylogenetic analysis of plant ADFs. Additionally, the cis-acting analysis revealed that these genes play essential role in plant growth/development, phytohormone, and biotic and abiotic responses; and the expression analysis showed that the symbiotic interactions generate a significant expression regulation level of ADF genes in leaves, stems and roots, compared to controls; thus enhancing seedlings' growth. Additionally, the 3D structures of the ADF domain were highly conserved during evolution. These results will be helpful for further functional validation of ADFs candidate genes and provide important insights into the vegetative growth, development and stress tolerance of C. sinensis in responses to endophytic colonization by B. bassiana
First insights in terrestrial mammals monitoring in the Candelaria and Machay Reserves in the Ecuadorian Tropical Andes
Habitat disturbance leads to biodiversity decline and modifications in the landscape
structure and composition, affecting both dispersal movements and ecological processes
at different temporal and spatial scales. The Ecuadorian Tropical Andes harbour suitable
habitats for the distribution of a wide variety of species; however, there is a lack of studies
focused on mammal diversity and its association with the habitat attributes in the central eastern slopes. Here, we reported the diversity of terrestrial mammals recorded between
2019 and 2021 in a camera-trap monitoring study in the Candelaria and Machay reserves in the upper basin of the Pastaza River, Ecuador. We performed site-occupancy probability
analysis to assess the influence of spatial variables in the species’ occurrence and also,
based on natural marks, we reported preliminary findings in Andean bear individual
identification. We detected 22 species of terrestrial mammals. Alpha diversity was similar
between reserves with slightly higher species richness in Machay. Evenness indices
showed unequal species distribution, with the Andean bear and domestic dogs exhibiting
greater dominance. In addition, species composition was dissimilar between reserves,
where the species turnover mostly explained the beta diversity. We observed that Andean
bear and puma detections increased according to the natural vegetation cover. Conversely,
domestic dogs were frequently detected in cells with an increasing proportion of pastures
and crops. Additionally, we identified 26 Andean bears and six individuals recaptured
during our study. Our results caution about the disturbance derived from human activities
since we recorded unprecedented detections of domestic dogs in wild habitats.
Nonetheless, it highlights the importance of private conservation areas (e.g. Candelaria,
Machay and others) for supporting the occurrence and dispersal of terrestrial mammal
species between larger areas in the upper basin of the Pastaza River