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Del llibre a l’escenari: l’adaptació teatral d’obres narratives de la literatura catalana al Teatre Nacional de Catalunya (1997-2024)
Treball de Fi de Màster en Estudis Comparatius de Literatura, Art i Pensament. Curs 2024-2025Tutor: Jaume Subirana Ortí
Immunoinformatics to guide vaccine design and biomarker discovery
La present tesi doctoral titulada "Immunoinformàtica per guiar el disseny de vacunes i el descobriment de biomarcadors" és un compendi d'articles dividit en una primera part de immunoinformàtica de cèl·lules T i una segona dedicada a estudis en cèl·lules B. Els articles de cèl·lules T engloben el desenvolupament de mètodes computacionals per a la predicció de la immunogenicitat d'epítops T i la predicció del seu processant antigènic (Article 1. PredIG i Article 2. NetCleave). A més, aquests mètodes són aplicats pel disseny de vacunes dirigides a cèl·lules T contra malalties infeccioses víriques (Articles 3 i 4) i pel descobriment de biomarcadors de resposta per a inhibidors de punts de control immunitaris en el context de les immunoteràpies de càncer (Article 5). La part de cèl·lules B està organitzada de forma similar enllaçant el desenvolupament d'un flux de treball computacional per a refinar les prediccions d'epítops B (Article 6. Brewpitopes); seguida per aplicacions en el desenvolupament d'anticossos terapèutics contra la COVID-19 (Article 7); i la composició d'una signatura d'anticossos per a la detecció precoç de càncer de pulmó (Article 8). La troballa principal d'aquest treball és el desenvolupament de predictors d'epítops i fluxos de treball computacionals focalitzats en el refinament de la immunogenicitat i l'antigenicitat d'epítops T i B respectivament. A més de la seva aplicació translacional per a guiar, de forma efectiva i comprensiva, projectes de disseny de vacunes i descobriment de biomarcadors en malalties víriques i càncer.The present doctoral thesis entitled "Immunoinformatics to guide vaccine design and biomarker discovery" is an article compendium divided in a first T cell immunoinformatics part and a second dedicated to B cell studies. The T cell articles encompass computational method development efforts in T cell epitope immunogenicity and antigen processing prediction (Article 1. PredIG and Article 2. NetCleave), applications in T-cell-directed vaccine design against viral diseases (Articles 3 and 4) and to response biomarker discovery for immune checkpoint inhibitors in cancer immunotherapy (Article 5). The B cell part is organized similarly entailing the development of a pipeline to refine B cell epitope predictions (Article 6. Brewpitopes); and applications in therapeutic antibody development for COVID-19 (Article 7); and an antibody-based signature for early lung cancer detection (Article 8). The milestone of this work is the development of epitope predictors and pipelines focused on immunogenicity and antigenicity refinement and their application for an effective and comprehensive guidance in vaccine design and biomarker discovery projects in viral infection and cancer.Programa de Doctorat en Biomedicin
Máscaras y metamorfosis : el vínculo de Rostros Ocultos con la obra daliniana
La presente tesis supone el primer estudio monográfico de la novela Rostros ocultos de Salvador Dalí que parte de sus manuscritos y del material conservado referente a su creación, en su mayoría inédito. La investigación muestra cómo el proyecto fue paralelo al de su autobiografía, construyendo con ambas una imagen de sí mismo, su esposa y su relación para el público. Tras realizar un estudio comparado con su producción artística y literaria, demostramos su importante conexión con los grandes temas de la obra daliniana. Su eje vertebrador es el amor, articulado principalmente a través del cledalismo y puesto en relación con el contexto bélico que rodea la trama. En ella se plantea el amor como una metamorfosis que confronta con lo bello y lo terrible de uno mismo y del mundo, mostrando asimismo conexiones personales con relación a su mujer y con el poeta Federico García Lorca. En Rostros ocultos reflejó cómo para él la vida era una gran mascarada en la que se (con)fundían vida y arte.This thesis is the first monographic study of Salvador Dalí's novel Hidden Faces based on his manuscripts and the material preserved concerning his creation, most of it unpublished. The research shows how the project ran parallel to that of his autobiography, constructing with both an image of himself, his wife and their relationship for the public and, after carrying out a comparative study with his artistic and literary production, we demonstrate its important connection with the major themes of Dalí's work. Its core theme is love, articulated mainly through cledalism and placed in relation to the war context that surrounds the plot. In it, love is presented as a metamorphosis that confronts the beautiful and the terrible in oneself and in the world, also showing personal connections with his wife and with the poet Federico García Lorca. In Hidden Faces he showed how for him life was a great masquerade in which life and art were (con)fused.Programa de Doctorat en Humanitat
Offloaded! The deferred departure procedure and its (un)intended effects to cross-border mobility at the Philippine border
Treball fi de màster en Estudis Migratoris. Curs 2022-2023Tutor: Lorenzo GabrielliThe Philippines is one of the top labor migrants sending countries in the world and has developed robust labor migration policy and procedures that has promoted the orderly migration for Filipino migrant workers. Despite this, issues and concerns were raised by Filipino migrants and travelers alike. The implementation of the Trafficking-in-Persons Act developed stricter guidelines for the departure formalities of Filipinos which at times have impeded their right to travel and leave the country. These individuals are sometimes deferred their departure from their outbound flights because of possible illegal recruitment, potential trafficking victims and with doubtful purposes of travel. This analysis, based on data from fieldwork with border agents in the Philippines and documents related to this, analyzes the impact surrounding the implementation of strict emigration procedures at Philippine border control points. Examining the data surrounding emigration regulations, it was discovered that overlapping administrative and bureaucratic procedures externalized at the border is negatively affecting the cross-border mobility of Filipinos at the Philippines border. Not only does it foster additional administrative, bureaucratic and financial burdens to would-be Filipino migrants, but it also creates conditions that would foster collusion at the border in the form of border corruption
Modular approaches and applications in reinforcement learning development and validation of next-generation frameworks
Reinforcement learning (RL) provides a unique framework for addressing sequential decision-making problems. Despite the numerous software frameworks proposed to accelerate the development of new algorithms and applications, RL researchers and practitioners often still rely on custom code. This thesis identifies and addresses some core issues contributing to this trend. In the first part, we propose a modular approach for defining distributed RL schemes using basic, reusable building blocks. In the second part, we contribute to the creation of TorchRL, the official PyTorch domain library for general decision-making. TorchRL is designed to be efficient, scalable, and broadly applicable. Finally, we leverage and validate TorchRL by developing ACEGEN, a library for language-based generative drug discovery, and use it to explore new solutions in this field.Programa de Doctorat en Tecnologies de la Informació i les Comunicacion
Medios nativos digitales y cambio social en democracias deficitarias. Un análisis crítico del caso colombiano
Aquesta investigació analitza els factors que determinen la capacitat dels mitjans nadius digitals per abordar problemàtiques socials i representar col·lectius històricament infrarepresentats en democràcies deficitàries, amb Colòmbia com a estudi de cas. Mitjançant una metodologia mixta que integra una revisió sistemàtica de la literatura científica, el mapeig de 46 mitjans nadius digitals i un estudi de cas múltiple de La Silla Vacía i Colombiacheck (amb l’anàlisi de 701 articles i 18 entrevistes), s’identifica un ecosistema mediàtic estratificat on emergeixen mitjans de “mitjana escala” que equilibren abast i compromís social. Es desenvolupa un model multinivell de factors estructurals (sostenibilitat integral, context sociopolític), organitzatius (innovació en entorns d’escassetat, autonomia editorial) i relacionals (legitimitat territorial, confiança comunitària). La recerca aporta dues conceptualitzacions originals: “Ecosistema Sociopolític Híbrid” i “Camp Periodístic Digital Independent en Democràcies Deficitàries”, contribuint a comprendre com operen aquests mitjans en la intersecció entre estructures institucionals, dinàmiques socials i mediacions tecnològiques al Sud Global.Esta investigación analiza los factores que determinan la capacidad de medios nativos digitales para abordar problemáticas sociales y representar grupos sociales históricamente subrepresentados en democracias deficitarias, con Colombia como caso de estudio. Mediante metodología mixta que integra revisión sistemática de la literatura científica, mapeo de 46 medios nativos digitales, y un estudio de caso múltiple de La Silla Vacía y Colombiacheck (con análisis de 701 artículos y 18 entrevistas), se identifica un ecosistema mediático estratificado donde emergen medios de “escala media” que equilibran alcance y compromiso social. Se desarrolla un modelo multinivel de factores estructurales (sostenibilidad integral, contexto sociopolítico), organizacionales (innovación en entornos de escasez, autonomía editorial) y relacionales (legitimidad territorial, confianza comunitaria). La investigación aporta dos conceptualizaciones originales: “Ecosistema Socio-político Híbrido” y “Campo Periodístico Digital Independiente en Democracias Deficitarias”, contribuyendo a comprender cómo estos medios operan en la intersección de estructuras institucionales, dinámicas sociales y mediaciones tecnológicas en el Sur Global.This research analyzes the factors that determine the capacity of digital native media to address social issues and represent underrepresented groups in flawed democracies, with Colombia as a case study. Through a mixed methodology that integrates a systematic review of scientific literature, mapping of 46 digital native media, and a multiple case study of La Silla Vacía and Colombiacheck (including analysis of 701 articles and 18 interviews), the study identifies a stratified media ecosystem where “medium-scale” outlets emerge, balancing reach and social commitment. A multilevel model is developed, comprising structural factors (integral sustainability, sociopolitical context), organizational factors (innovation from scarcity, editorial autonomy), and relational factors (territorial legitimacy, community trust). The research contributes two original conceptualizations: “Hybrid Socio-political Ecosystem” and “Independent Digital Journalistic Field in Flawed Democracies”, enhancing understanding of how these media operate at the intersection of institutional structures, social dynamics, and technological mediations in the Global South.Universitat Pompeu Fabra. Doctorat en Comunicaci
Ablation of Glut1 drives oxidative phosphorylation and enhances antihumor activity in CD8+ T Cells
The thesis explores the potential of Glut1 ablation to enhance the antitumor activity of CD8+ T cells by inducing a metabolic shift from glycolysis to oxidative phosphorylation. Glut1-KO CD8+ T cells exhibited significantly improved antitumor effects both in vitro and in vivo, highlighting their enhanced ability to target solid tumors and their potential application in CAR T cell therapy. RNA sequencing data revealed that the absence of Glut1 not only triggers a metabolic transition in CD8+ T cells but also elucidates how metabolism can influence T cell cytokine secretion and subsets, thereby affecting immune function. These findings provide valuable insights and establish a novel direction for clinical research aimed at optimizing CAR T cell therapies for solid tumor treatment.La tesis explora el potencial de la ablación de Glut1 para mejorar la actividad antitumoral de las células T CD8+ mediante la inducción de un cambio metabólico de la glucólisis a la fosforilación oxidativa. Las células T CD8+ con Glut1-KO mostraron efectos antitumorales significativamente mejorados tanto in vitro como in vivo, destacando su mayor capacidad para atacar tumores sólidos y su posible aplicación en la terapia con células CAR T. Los datos de secuenciación de ARN revelaron que la ausencia de Glut1 no solo desencadena una transición metabólica en las células T CD8+, sino que también esclarece cómo el metabolismo puede influir en la secreción de citocinas y en los subconjuntos de células T, afectando así la función inmunológica. Estos hallazgos proporcionan información valiosa y establecen una nueva dirección para la investigación clínica enfocada en la optimización de las terapias con células CAR T para el tratamiento de tumores sólidos.Programa de Doctorat en Biomedicin
Structural basis of the early exocytosis : a spatio-temporal model of the vesicle tethering machinery
El proyecto tiene como objetivo general descifrar el mecanismo de la exocitosis utilizando biología estructural integrativa, lo cual ayudará a entender cómo las células controlan su crecimiento. Para ello, planteamos generar un modelo cuantitativo de la exocitosis con IMP (Integrative Modeling Platform), un software que nos permite combinar 1) datos de la estructura de las proteínas que participan en el proceso de la exocitosis, 2) datos temporales y 3) datos espaciales, para reconstruir un modelo 3D de la distribución espacial y temporal de las proteínas. Este modelo nos ayudará a entender cómo se coordina la maquinaria celular durante el proceso de la exocitosis, así como a diseñar nuevos experimentos que validen nuestras hipótesis.The project’s overarching goal is to decipher the mechanism of exocytosis using integrative structural biology, which will help to understand how cells control their growth. To achieve this, we aim to develop a quantitative model of exocytosis using IMP (Integrative Modeling Platform), a software that allows us to combine: 1) structural data of the proteins involved in the exocytosis process, 2) temporal data, and 3) spatial data, to reconstruct a 3D model of the spatial and temporal distribution of these proteins. This model will help us understand how the cellular machinery is coordinated during the exocytosis process and design new experiments to validate our hypotheses.Programa de Doctorat en Biomedicin
De la francofobia a la francofilia: la trayectoria militar, política y diplomática de Manuel de Sentmenat (1651-1703)
Manuel de Sentmenat i Lanuza fou un destacat servidor de la Monarquia Hispànica, amb una dilatada i distingida trajectòria militar, política i diplomàtica. Durant bona part de la seva vida combaté els francesos, demostrant una gran capacitat de servei i lleialtat, qualitats que li permeteren ascendir en el cursus honorum, accedir a la noblesa titulada i esdevenir el primer marquès de Castelldosrius. Tanmateix, el rumb de la seva carrera canvià completament quan fou nomenat ambaixador ordinari de la Monarquia Hispànica. Després de la mort de Carles II, fou l’encarregat de trametre el testament del monarca a Lluís XIV i es convertí en el primer vassall hispànic a reconèixer Felip V i a jurar fidelitat a la nova dinastia. A partir d’aquell moment, la seva anterior francofòbia desaparegué, i esdevingué una figura emblemàtica del canvi dinàstic i un servidor clau de les Dues Corones. El diplomàtic català esdevingué protegit de Lluís XIV, fou distingit amb la Grandea d’Espanya malgrat el seu modest patrimoni, i fou nomenat virrei del Perú, càrrec des del qual havia d’afavorir els interessos comercials francesos al Nou Món.Manuel de Sentmenat y Lanuza fue un destacado servidor de la monarquía hispánica súbdito hispánico con una dilatada y distinguida trayectoria militar, política y diplomática. Durante buena parte de su vida combatió a los franceses, demostrando una gran capacidad de servicio y lealtad, que le permitieron escalar en el cursus honorum, accediendo a la nobleza titulada y convertirse en el I marqués de Castelldosrius. Sin embargo, el rumbo de su trayectoria cambió por completo cuando fue nombrado embajador ordinario de la monarquía hispánica. Tras la muerte de Carlos II, fue el encargado de remitir el testamento de Carlos II a Luis XIV y se convirtió en el primer vasallo español en reconocer a Felipe V y jurar lealtad a la nueva dinastía. Desde ese momento, su anterior francofobia desapareció, convirtiéndose en una figura emblemática del cambió dinástico y en un servidor clave de las Dos Coronas. El diplomático catalán se convirtió en un protegido de Luis XIV, siendo distinguido con la Grandeza de España, a pesar de su modesto patrimonio, y fue nombrado virrey del Perú, desde donde habría de favorecer los intereses comerciales galos en el Nuevo Mundo.Manuel de Sentmenat y Lanuza was a prominent servant of the Spanish Monarchy with a long and distinguished military, political, and diplomatic career. For the biggest part of his life, he fought against the French, demonstrating remarkable dedication and loyalty—qualities that enabled him to rise through the cursus honorum, attain titled nobility, and become the first Marquis of Castelldosrius. However, the course of his career changed completely when he was appointed ordinary ambassador of the Spanish Monarchy. Following the death of Charles II, he was tasked with delivering the monarch’s will to Louis XIV and became the first Spanish subject to recognize Philip V and swear allegiance to the new dynasty. From that moment on, his previous Francophobia vanished, and he became an emblematic figure of the dynastic change and a key servant of the Two Crowns. The Catalan diplomat became a protégé of Louis XIV, was granted the rank of Grandee of Spain despite his modest personal wealth, and was appointed Viceroy of Peru, a position from which he was expected to advance French commercial interests in the New World.Universitat Pompeu Fabra. Doctorat en Històri
Changes in Sino-British trade before the First Opium War based on supercargoes
The Sino-British trade system before the First Opium War was not a static structure entirely controlled by the Qing government; instead, it underwent a process of reconstruction through Sino-British interactions. In fact, Sino-British trade was essentially under joint management by the Guangdong authorities representing the interests of the Qing government and the supercargoes representing the interests of the British East India Company. Using James Drummond and William Jardine as case studies, I examine the activities of the supercargoes, representing the social elite, in China and the role-switching between East India Company employees and private merchants. Through the analysis, the thesis aims to reveal the symbiotic relationship between the Hong merchant system and the British East India Company’s monopolJardiney on trade with China, highlighting the pivotal role supercargoes played in shaping Sino-British trade and relations before the First Opium War.El sistema de comercio sino-británico antes de la Primera Guerra del Opio no era una estructura estática controlada enteramente por el gobierno Qing; en cambio, fue objeto de una reconstrucción a través de las interacciones sino-británicas. De hecho, el comercio sino-británico estaba esencialmente bajo una gestión conjunta entre las autoridades de Guangdong, que representaban los intereses del gobierno Qing, y los supercargadores, que representaban los intereses de la Compañía Británica de las Indias Orientales. Utilizando a James Drummond y William Jardine como estudios de caso, examino las actividades de los sobrecargos, que representaban a la élite social, en China, y el cambio de roles entre los empleados de la Compañía de las Indias Orientales y los comerciantes privados. A través de este análisis, la tesis busca revelar la relación simbiótica entre el sistema de los comerciantes hong y el monopolio comercial de la Compañía de las Indias Orientales en China, destacando el papel fundamental que jugaron los sobrecargos en la configuración del comercio y las relaciones sino-británicas antes de la Primera Guerra del Opio.Programa de Doctorat en Històri