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Prevalence of symptomatic and asymptomatic peripheral arterial disease and the value of the ankle-brachial index to stratify cardiovascular risk
No full textObjectives: To determine the prevalence of ankle-brachial index (ABI)<0.9 and symptomatic peripheral arterial disease (PAD), association with cardiovascular risk factors (CVRF), and impact of adding ABI measurement to coronary heart disease (CHD) risk screening. Design: Population-based cross-sectional survey of 6262 participants aged 35-79 in Girona, Spain. Methods: Standardized measurements (CVRF, ABI, 10-year CHD risk) and history of intermittent claudication (IC), CHD, and stroke were recorded. ABI<0.9 was considered equivalent to moderate-to-high CHD risk (> or =10%). Results: ABI<0.9 prevalence was 4.5%. Only 0.62% presented low ABI and IC. Age, current smoker, cardiovascular disease, and uncontrolled hypertension independently associated with ABI<0.9 in both sexes; IC was also associated in men and diabetes in women. Among participants 35-74 free of cardiovascular disease, 6.1% showed moderate-to-high 10-year CHD risk; adding ABI measurement yielded 8.7%. Conversely, the risk function identified 16.8% of these participants as having 10-year CHD risk>10%. In participants 75-79 free of cardiovascular disease, the prevalence of ABI<0.9 (i.e., CHD risk> or =10%) was 11.9%. Conclusions: ABI<0.9 is relatively frequent in those 35-79, particularly over 74. However, IC and CHD risk> or =10% indicators are often missing. Adding ABI measurement to CHD-risk screening better identifies moderate-to-high cardiovascular risk patients
Evaluación del valor pronóstico de la ecografía pulmonar en el infarto agudo de miocardio con elevación del ST (LUS-AMI)
No full textLa insuficiencia cardíaca (IC) es un factor pronóstico crucial en pacientes con infarto agudo de miocardio con elevación del ST (IAMEST). La ecografía pulmonar es una técnica ampliamente estudiada en pacientes con insuficiencia cardíaca (IC), pero apenas estudiada en pacientes con infarto agudo de miocardio. Este estudio prospectivo multicéntrico evaluó el papel de la ecografía pulmonar (EP), realizada al ingreso, como indicador pronóstico en pacientes con IAMEST. La presencia de líneas B se asoció con un mayor riesgo de eventos adversos intrahospitalarios, a 30 días y a un año. La incorporación de la EP mejoró la capacidad predictiva de las escalas de riesgo Zwolle y GRACE. Además, se desarrolló la escala Killip pLUS, y se evaluó su capacidad de predicción de mortalidad intrahospitalaria y eventos a un año respecto a otras escalas. La EP demostró ser una útil para optimizar la estratificación pronóstica en el IAMEST.Heart failure (HF) is a crucial prognostic factor in patients with ST-segment elevation myocardial infarction (STEMI). Lung ultrasound (LUS) is a well-studied technique in HF patients but has been scarcely explored in those with acute myocardial infarction. This multicenter prospective study evaluated the role of LUS, performed within the first 24 hours of admission, as a prognostic indicator in STEMI patients. A total of 373 patients were included, showing that the presence of B-lines is associated with a higher risk of adverse in-hospital events, as well as at 30 days and one year. The incorporation of LUS improved the predictive capacity of the Zwolle and GRACE risk scores. Furthermore, the Killip pLUS scale was developed and its ability to predict in-hospital mortality and one-year events was assessed compared to other scales. LUS proved to be a feasible, reproducible, and cost-effective technique, valuable for optimizing prognostic stratification.Programa de Doctorat en Biomedicin
Tres décadas de vallas en Ceuta y Melilla: crisificación, externalización y recrudecimiento del control migratorio en las fronteras exteriores de la UE
No full textEl artículo traza la evolución de los regímenes fronterizos de Ceuta y Melilla, desde el ingreso de España en la UE en 1986 hasta la actualidad. Pese al no reconocimiento de la soberanía española de las ciudades -ni, en consecuencia, de la legitimidad de las fronteras de la UE en África-, Marruecos se ha convertido en un actor indispensable en el esque-ma de gobernanza fronterizo-migratoria desplegado en Ceuta y Melilla, y ha rentabilizado esta nueva ventaja estratégica en el marco de sus relaciones bilaterales con España y con la Unión Europea. La lógica de externalización de las políticas de control fronterizo ha allanado el camino a un amplio abanico de prácticas de control migratorio en torno a las ciudades norteafricanas. Dichas prácticas han sido escrutadas en profundidad desde ópticasacadémicas, periodísticas y activistas. Su análisis ha arrojado luz, por un lado, sobre la lógica de excepcionalidad que rodea al régimen fronterizo de la UE en las ciudades y, por otro, sobre cómo los migrantes y activistas han desafiado, denunciado y resistido a dicho régimen, contribuyendo así a su constante reconfiguración. El texto concluye analizando las consecuencias de dos factores interrelacionados que han ejercido de vectores de cambio: por un lado, la «crisis» diplomático-fronteriza de mayo de 2021 y, por otro, la subsiguiente reapertura parcial de los pasos fronterizos de Ceuta y Melilla en mayo de 2022, tras dos años de cierre iniciado con el estallido de la pandemia de covid-19. Ambos factores han conducido a una nueva reconfiguración de la gestión de la movilidad transfronteriza en la región. Como ilustran los sucesos letales sucedidos en la valla de Melilla de junio de 2022, los cambios han desembocado en la consolidación de la cooperación operativa hispano-marroquí y en un nuevo recrudecimiento de las prácticas de obstaculización migratoria en la frontera exterior de la UE
Viral codon usage and the host transfer RNA
No full textThe expansion of viruses within cells requires efficient viral protein production. Counterintuitively, many viral genomes are enriched in suboptimal codons, which are typically associated with reduced protein outputs. Recent research using chikungunya virus (CHIKV) as a prototype model highlights the role of host transfer RNA (tRNA) modifications, collectively known as the tRNA epitranscriptome, in resolving this paradox. Upon infection, CHIKV triggers a DNA damage stress response that ultimately leads to changes in the tRNA epitranscriptome. These changes reprogram codon optimality, selectively enhancing the translation of specific suboptimal codons that are highly enriched in both host stress response genes and the viral genome. Hence, CHIKV codon usage optimally aligns with the tRNA modification landscape in infected cells. We propose that this interplay between viral codon usage, stress responses, and tRNA modifications is a shared strategy among viruses beyond CHIKV. Targeting this interplay may pave the way for the development of broad-spectrum antiviral therapies.This work was supported by the Spanish Ministry of Science, Innovation and Universities (PID2022-136939OB-I00 funded by MICIU/AEI/10.13039/501100011033), by the 2021 SGR 00176 grant from the Departament de Recerca i Universitats de la Generalitat de Catalunya, and an institutional "María de Maeztu" Program for Units of Excellence in R&D (CEX2018-000792-M). E.M. was the recipient of Marie Sklodowska-Curie Grant Agreement 101065094. We thank Andreas Meyerhans for fruitful discussions
Provably efficient large-scale reinforcement learning via primal-dual stochastic optimization
No full textReal-world sequential decision-making tasks are often characterized by large state spaces and unknown
dynamics. In this setting, an efficient method is tasked to learn a near-optimal decision-making policy
under a given sample-access model, with time and sample complexity that is independent of the size of
the state space. To this end, we study reinforcement learning in large Markov Decision Processes (MDPs),
with intractably many states, under a variety of sample-access models. We provide both time- and
sample-efficient methods with provable performance guarantees in the contexts of planning with a
generative model and offline reinforcement learning with a static dataset. Our approach taken in this
thesis is firmly rooted in the classic linear programming formulation of MDPs first introduced in the
1960's. In each context, starting from the approximate linear programs based on linear function
approximation, we introduce techniques to further reduce the problem dimension and enable efficient
learning. Thereafter, we develop algorithms via (stochastic) primal-dual optimization of the reduced
approximate linear programs, and under assumptions on the function approximator and MDP, derive timeand
sample-complexity guarantees by studying the corresponding duality gap. Along the way, we
contribute to the rich literature on stochastic optimization of convex-concave functions in unconstrained
domains.Las tareas de toma de decisiones secuenciales en el mundo real suelen caracterizarse por grandes espacios
de estados y dinámicas desconocidas. En este contexto, la tarea de un método eficiente es aprender una
política de toma de decisiones casi óptima bajo un modelo de acceso muestral dado, con una complejidad
temporal y muestral independiente del tamaño del espacio de estados. Con este fin, estudiamos el
aprendizaje por refuerzo en Procesos de Decisión de Markov (MDP) de gran tamaño, con un número
intratable de estados, bajo una variedad de modelos de acceso muestral. Proporcionamos métodos
eficientes tanto en tiempo como en muestras con garantías de rendimiento demostrables en los contextos
de la planificación con un modelo generativo y el aprendizaje por refuerzo offline con un conjunto de
datos estático. El enfoque adoptado en esta tesis está firmemente arraigado en la formulación clásica de
programación lineal de los MDP introducida por primera vez en la década de 1960. En cada contexto,
partiendo de los programas lineales aproximados basados en la aproximación de funciones lineales,
introducimos técnicas para reducir aún más la dimensión del problema y permitir un aprendizaje eficiente.
Posteriormente, desarrollamos algoritmos a través de la optimización (estocástica) primal-dual de los
programas lineales aproximados reducidos y, bajo supuestos sobre el aproximador de funciones y el MDP,
derivamos garantías de complejidad temporal y muestral mediante el estudio de la brecha de dualidad
correspondiente. A lo largo del camino, contribuimos a la rica literatura sobre optimización estocástica de
funciones convexo-cóncavas en dominios sin restricciones.Programa de Doctorat en Tecnologies de la Informació i les Comunicacion
Transport-mediated antimicrobial interactions and resistance mechanism in Escherichia coli
No full textEsta tesis investiga los mecanismos de resistencia a antibióticos y la interacción entre antibióticos y toxinas en Escherichia coli, enfocándose en el paper del canal de membrana TolC en la expulsión de antibióticos e importación de toxinas. Mediante análisis de las dinámicas de crecimiento, secuenciación genómica, modelado matemático y microscopía de fluorescencia, exploramos la especificidad de TolC como mecanismo de transporte de diversos antibióticos y toxinas, identificando compuestos que usan dicho sistema de forma exclusiva, y estudiando las interacciones que resultan de la competición entre dichos compuestos por este canal de transporte. Entre los hallazgos clave de esta Tesis podemos destacar: (1) la diversidad en la dependencia de mecanismos de exportación por parte de distintos antibióticos; (2) la heterogeneidad en la respuesta de E. coli a la colicina E1, debida en parte a a aparición de mutaciones asociadas a canales de transporte y a regulación metabólica; (3) los efectos sinérgicos entre la colicina E1 y la mitomicina C resultantes de la competición entre ambas toxinas por el uso del canal TolC; y (4) la existencia de patrones complejos de resistencia cruzada y sensibilidad colateral en variantes resistentes a la colicina E1. Estos resultados revelan la adaptabilidad bacteriana al estrés por toxinas, y contribuyen a identificar interacciones inesperadas entre procesos celulares que contribuyen a la resistencia bacteriana. Nuestro trabajo contribuye por tanto a comprender las respuestas al estrés bacteriano, potencialmente informando nuevos enfoques terapéuticos contra infecciones resistentes a antibióticos.This thesis investigates antibiotic resistance mechanisms and the interactions between antibiotics and toxins in Escherichia coli, focusing on the TolC outer membrane channel’s role in antibiotic efflux and toxin import. Using growth dynamics analysis, whole genome sequencing, mathematical modeling, and fluorescence microscopy, we explored the specificity of TolC as a transport mechanism for a variety of antibiotics and toxins, dentified compounds that use the system exclusively, and studied the interactions between them that result from their competition for that transport channel. Key findings include: (1) varied efflux dependencies for different antibiotics; (2) heterogeneous population responses to colicin E1, with resistance conferred by mutations in import and metabolic genes; (3) synergistic effects between colicin E1 and mitomycin C due to TolC channel competition; and (4) complex cross-resistance and collateral sensitivity patterns in colicin-resistant variants. These results reveal the intricate adaptability of bacteria to antimicrobial stresses and identify unexpected interactions between cellular systems in conferring resistance. Our work contributes to understanding bacterial stress responses and adaptation mechanisms, potentially informing novel therapeutic approaches against antibiotic-resistant infections.Programa de Doctorat en Biomedicin
Horizontal partial cross ownership and innovation
No full textWe study the effects of partial cross ownership (PCO) among rival firms on their incentives to innovate. PCO in our model gives rise to a price effect due to its effect on price competition and hence on the marginal benefit from investment, as well as a cannibalization effect which arises because each firm internalizes part of the negative externality of its investment on the rival's profit. We show that overall, PCO may benefit or harm consumers depending on the size of the PCO stakes, their degree of symmetry, the size of the innovation, its marginal cost, and whether it is drastic or not
CardIA: a deep learning-based workflow for LVEF extraction from 4D CMR images
No full textTreball de fi de grau en Bioinformàtica. Curs 2024-2025Tutors: Paula Petrone, Guillermo VillanuevaLes malalties cardiovasculars són la principal causa de mort al món, i la fracció d’ejecció del ventricle esquerre (LVEF) és clau per al diagnòstic. Presentem CardIA, un sistema automatitzat basat en aprenentatge profund que quantifica la LVEF a partir de ressonància magnètica cardíaca en 4D. El model optimitza la detecció de regions d’interès, segmenta amb precisió mitjançant una arquitectura U-Net++ i adapta el diagnòstic segons el sexe del pacient. Validat amb dades clíniques, CardIA assoleix una precisió experta i redueix el temps de segmentació de minuts a segons.Las enfermedades cardiovasculares son la principal causa de muerte en el mundo, y la fracción de eyección del ventrículo izquierdo (LVEF) es clave para su diagnóstico. Presentamos CardIA, un sistema automatizado basado en aprendizaje profundo que cuantifica la LVEF a partir de resonancia magnética cardíaca en 4D. El modelo optimiza la detección de regiones de interés, segmenta con precisión usando una arquitectura U-Net++ y adapta el diagnóstico según el sexo del paciente. Validado con datos clínicos, CardIA alcanza precisión experta y reduce el tiempo de segmentación de minutos a segundos.Cardiovascular diseases are the leading cause of death worldwide, and left ventricular ejection fraction (LVEF) is key for diagnosis. We present CardIA, an automated deep learning-based system that quantifies LVEF from 4D cardiac MRI data. The model enhances region-of-interest detection, performs accurate segmentation using a U-Net++ architecture, and adapts diagnosis based on patient sex. Validated with clinical data, CardIA achieves expert-level accuracy and reduces segmentation time from minutes to seconds
¿Quién teme a la historia en el arte contemporáneo? Investigación artística y modelos de historicidad
No full textSpatial analysis of Amazonian Dark Earth formation supports an anthropic origin at the Caldeirão site, Brazil
No full textAmazonian Dark Earths (ADEs) are distinct archaeological sites in the Amazon, characterized by their enriched nutrient content in soil layers. While activities related to human occupation are acknowledged as the primary driver of the geochemical properties of ADEs, the intra-site spatial variations in their formation processes, and how they relate to human settlement, are not completely documented. In this study, we employ geostatistical analysis to investigate spatial variations in the geochemical signature and pottery concentration of ADE at the Caldeirão site, Central Amazon, a site that has sparked ongoing debates due to the revival of a natural genesis hypothesis of ADEs. Our findings reveal non-homogeneous spatial distribution of the ADE geochemical signature at the site, suggesting multiple foci of human activity at different temporal stages. Notably, we document the possible emergence of a semi-circular village pattern, prevalent in other Amazonian contexts, gradually transitioning to a more homogeneous ADE cover during the final stage of occupation. This observed pattern, consistent with archaeological and ethnographic evidence, provides compelling evidence for human activity as the primary driver of ADE formation at Caldeirão, laying to rest the hypothesis of a natural origin