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Mujeres africanas y afrodescendientes en la Guerra de los Diez Años en Cuba, 1868-1878, género e insurgencia
Esta tesis doctoral sostiene que las actividades de las mujeres africanas y afrodescendientes en la Guerra de los Diez Años o la primera guerra de independencia cubana contra el colonialismo español (1868–1878) transformaron radicalmente la insurgencia anticolonial en el este de la isla. A la vez que las dinámicas raciales y de género de la esclavitud y el racismo durante la guerra limitaron de forma violenta los caminos de estas mujeres hacia la libertad, sus experiencias fueron cruciales para impulsar la abolición de la esclavitud en Cuba. Articulando redes, asegurando alimentos y recursos, produciendo suministros y llevando a cabo las tareas de cuidado, estaban construyendo un sentido de comunidad basado en solidaridades raciales y de género. Mediante la creación de geografías insurgentes y expresiones fugitivas, las mujeres de ascendencia africana en Cuba, libres o esclavizadas, pusieron en práctica diferentes estrategias de supervivencia y resistencia basadas en el género en un contexto de creciente militarización, violencia y trabajo forzado.The aim of this dissertation is to show how African and Afro-descendant women’s activities within the Ten Years’ War, or the first independence war in Cuba against Spain (1868–1878), transformed anticolonial insurgency in the Eastern part of the island in radical ways. While race and gender dynamics of Cuba’s slave society violently limited these women’s paths to freedom, their experiences were crucial for pushing towards the abolition of slavery. By articulating networks, securing food and resources, producing supplies, and engaging in care work, they created a sense of community based on race and gender solidarities. In so doing, women of African descent, free or enslaved, displayed gendered strategies for survival and resistance in the face of increased militarization, violence, and forced labor.Programa de Doctorat en Històri
Evolutionary dynamics of cancer drug resistance and prediction of tumor modes of growth
Cancer remains a significant challenge in healthcare and is a leading concern worldwide. Despite advances in cancer therapy and the identification of numerous actionable events, relapse and drug resistance continue to complicate treatment outcomes. This thesis investigates the evolution of cancer from the perspectives of population genetics, computational simulations, and data analysis .We present a novel method developed to infer patterns of tumor growth in both primary tumors and metastatic sites using approximate Bayesian computation. By considering the sampling noise in DNA sequencing that occurs with the construction of the variant allele frequency distribution, we enable the reconstruction of tumor growth modes in samples with both high and low coverage distributions. Furthermore, we investigate the phenomenon of drug resistance using numerical simulations. We show that using the variant allele frequency distribution of a cancer sample, together with a target of drug resistance genes, informs about the time to relapse. Next, we analyze genomic patient data to identify genes that, when mutated, may contribute to either drug resistance or promote the development of metastases. This involves comparing cohort-wise selection estimates between primary tumors and their metastatic counterparts. Finally, we analyze the influence of genetic heterogeneity on the level of gene expression counts from single-cell RNA data in patients with acute myeloid leukemia. This work advances the field of cancer evolution by providing a new method to infer tumor modes of growth and helping to understand the measurability of cancer drug resistance in current sequencing methods.El càncer segueix sent un repte significatiu en l'àmbit de la salut i una de les principals preocupacions a nivell mundial. Malgrat els avenços en teràpies i la identificació d’objectius rellevants, les recaigudes i la resistència a fàrmacs segueixen complicant els pronòstics dels tractaments. Aquesta tesi investiga l'evolució del càncer des de les perspectives de la genètica de poblacions, les simulacions computacionals i l'anàlisi de dades.Presentem un mètode nou desenvolupat amb l’objectiu d’inferir patrons de creixement tumoral tant en tumors primaris com en metastàtics utilitzant el càlcul bayesià aproximat. Considerant el soroll de mostreig en la seqüenciació de l'ADN que es produeix en la construcció de la distribució de freqüència de l’al·lel alternatiu, possibilitem la reconstrucció dels modes de creixement del tumor en mostres amb distribucions de cobertura tant altes com baixes.A més, investiguem el fenomen de la resistència a fàrmacs utilitzant simulacions numèriques. Mostrem que utilitzant la distribució de freqüència de l’al·lel alternatiu d'una mostra de càncer juntament amb un conjunt de gens de resistència a fàrmacs obtenim informació sobre el temps fins a la recaiguda.A continuació, analitzem dades genòmiques de pacients per identificar gens que al mutar poden contribuir tant a la resistència a fàrmacs com a promoure el desenvolupament de metàstasis. Això implica comparar estimacions de selecció per cohorts de tumors primaris i els seus equivalents metastàtics.Finalment, analitzem la influència de la heterogeneïtat genètica en el nivell de recomptes d'expressió gènica a partir de dades d'ARN de cèl·lula única en pacients amb leucèmia mieloide aguda.Programa de Doctorat en Biomedicin
Pedagogía crítica
Se inicia este capítulo con un repaso de distintos enfoques para el desarrollo de una actitud crítica para la enseñanza de lenguas, desde la pedagogía crítica, pasando por las propuestas de la literacidad crítica, la lingüística aplicada crítica, la interculturalidad renovada (crítica) y la pedagogía para las multiliteracidades. Metodológicamente, se plantean recursos para desarrollar dicha actitud crítica a partir de las aportaciones de los Estudios Críticos del Discurso (ECD) y los Estudios Críticos del Discurso Multimodal (ECDM). Por lo tanto, un acercamiento crítico a la enseñanza del español como segunda lengua (L2) debe contemplar la concatenación y ensamblaje de todos estos postulados teóricos (pedagogías críticas en todas sus posibles manifestaciones, multimodalidad, pedagogía para las multiliteracidades, ECD y ECDM). Finalmente, se detallan consideraciones para desarrollar propuestas pedagógicas y un ejemplo de una posible secuencia didáctica a partir de diferentes soportes
Mechanobiology of apoptotic cell clearance in the early embryo
Spontaneous cellular errors can lead to cell death already in early embryo development. Apoptotic cell clearance is thus essential for tissue homeostasis and embryo survival. The outer epithelial layer of the embryo establishes an innate immune function and mediates the clearance of apoptotic cells. How mechanical forces and physical properties of apoptotic cells influence phagocytic tissue clearance has not been addressed in vivo. In this work, we systematically studied how biophysical target properties – as cell size, mechanics and ligand density – control phagocytosis and protrusion plasticity in epithelia. We identified that mechanical forces generated during epithelia-target interaction promote apoptotic cell fragmentation, ensuring efficient phagocytic clearance. We further discovered apoptotic cell softening as a pro-phagocytic signal. We identified that E-cadherin and its downstream effectors α-catenin and p120-catenin are key regulators of actomyosin dynamics at the phagocytic synapse that mediate the mechanosensitive clearance of apoptotic cells. This represents a novel function of the cadherin-catenin complex in apoptotic cell clearance.Els errors cel·lulars ocorren espontàniament durant els primers estadis del desenvolupament embrionari i en conseqüència, causen mort cel·lular. Per tant, la neteja fagocítica de cèl·lules apoptòtiques és essencial per mantenir l’homeòstasi dels teixits embrionaris i la supervivència de l’embrió. L’epiteli superficial embrionari, el primer teixit que es forma durant el desenvolupament, és capaç d’eliminar les cèl·lules apoptòtiques amb gran eficiència tant en embrions de peix zebra i de ratolí. Actualment es desconeix com les forces mecàniques i les propietats biofísiques de les cèl·lules apoptòtiques influencien el procés de neteja fagocítica, especialment en el context d’un organisme viu. En aquest manuscrit, hem estudiat sistemàticament com la mida i rigidesa de les cèl·lules apoptòtiques, així com la densitat dels lligands que presenten a la seva superfície, modulen la plasticitat protrusiva i la fagocitosi no professional de les cèl·lules epitelials. També hem identificat que els fagòcits exerceixen forces mecàniques a les cèl·lules apoptòtiques que promouen la seva fragmentació, un procés clau per garantir una posterior fagocitosi eficient. Finalment, hem descobert que la reducció progressiva de la rigidesa mecànica de les cèl·lules apoptòtiques constitueix un senyal pro-fagocític. Hem identificat que la E-caderina i els seus efectors posteriors α-catenina i p120-catenina són els principals reguladors de l’actina i la miosina a la sinapsi fagocítica i són els que medien una neteja fagocítica mecanosensible. Això representa una funció totalment nova del complex caderina-catenina, el qual ha sigut àmpliament estudiant en altres camps com ara el de les adhesions cel·lulars.Programa de Doctorat en Biomedicin
Understanding the impact of early microexon misregulation on zebrafish sleep/wake behaviour
The developing nervous system requires a well-orchestrated and diverse set of proteins, setting the foundation of how an animal perceives the world. Disruptions may result in neurodevelopmental disorders, including autism spectrum disorders (ASD), with patients displaying altered sensitivity to their environment. A highly-conserved program of neuron-specific microexons (3-27 nucleotides) is frequently disrupted in ASD and known to shape protein-protein interactions during late neurogenesis, fine-tuning neuronal processes such as synapse formation. Little is known as to how misregulation of this program affects signalling cascades in the developing brain, shaping behaviour. Using zebrafish larvae, we set out to investigate this using a mutant of the microexon splicing master regulator srrm3. Performing single-cell and bulk RNA-sequencing experiments we found that microexon-harbouring genes are more frequently differentially expressed. Phenotypically, using zebrafish tracking and calcium imaging, we described ASD-like phenotypes including sensory hypersensitivity, hyperlocomotion and sleep loss accompanied by altered neuronal firing in srrm3 mutants. Coupling of behavioural and pharmacological assays allowed us to identify in mutants aberrant cAMP signalling, likely resulting in a downregulation of synaptic plasticity genes that could be rescued pharmacologically. Our research sheds new light onto the dynamics of the developing zebrafish nervous system in the context of microexon misregulation, with wider implications on the connection between brain state and behaviour.El sistema nervioso en desarrollo requiere un conjunto bien orquestado y diverso de proteínas, que sientan las bases de cómo un animal percibe el mundo. Las interrupciones en este proceso pueden resultar en trastornos del neurodesarrollo, incluyendo los trastornos del espectro autista (ASD, por sus siglas en inglés), cuyos pacientes muestran una sensibilidad alterada a su entorno. Un programa altamente conservado de microexones específicos de neuronas (3-27 nucleótidos) se ve frecuentemente alterado en ASD y se sabe que modula las interacciones proteína-proteína durante la neurogénesis tardía, afinando procesos neuronales como la formación de sinapsis. Se sabe poco acerca de cómo la desregulación de este programa afecta las cascadas de señalización en el cerebro en desarrollo, moldeando los comportamientos. Utilizando larvas de pez cebra, nos propusimos investigarlo usando un mutante del regulador maestro del splicing de microexones, srrm3. Realizando experimentos de secuenciación de ARN a nivel de célula única y en bulk, encontramos que los genes que contienen microexones están más frecuentemente expresados de manera diferencial. Fenotípicamente, utilizando seguimientos de pez cebra de alta duración y técnicas de visualización de calcio, describimos fenotipos similares a los del ASD, incluyendo hipersensibilidad sensorial, hiperlocomoción y pérdida de sueño acompañados de una activación neuronal alterada en las mutantes srrm3. Una combinación de ensayos comportamentales y farmacológicos nos permitió identificar en los mutantes una señalización aberrante de cAMP, que probablemente resulta en una regulación negativa de genes de plasticidad sináptica que podría ser rescatada farmacológicamente. Nuestra investigación arroja nueva luz sobre las dinámicas del sistema nervioso en desarrollo del pez cebra en el contexto de la desregulación de microexones, con implicaciones más amplias en la conexión entre el estado cerebral y el comportamiento.Programa de Doctorat en Biomedicin
Reshaping ICT engineering identities: ethical insights from cross-professional analogies
University education develops professional identities by instilling knowledge, skills, and attitudes. In engineering, this process often prioritizes technical expertise over societal considerations, fostering a narrow view of the “good engineer.” However, the growing need for ethics literacy - understanding and integrating technology's societal impacts into their professional practice - requires a broader perspective, particularly in Information and Communication Technologies (ICT), where ethical compliance is also increasingly mandated by regulatory frameworks. This study explores whether the medical profession's wellestablished social contract, which balances specialized knowledge with societal responsibility, can serve as an effective model for integrating ethics into engineering identities. Using qualitative analysis, it investigates how exposing ICT engineering students to this analogy reshapes their perceptions of their professional roles. Results suggest that the medical analogy encourages students to expand their understanding of engineering as a socially impactful profession, emphasizing societal welfare alongside technical competence. This approach demonstrates the potential of analogies to foster ethical literacy and reshape professional identities, contributing to discussions on ethical literacy and professional identity formation in engineering education.This work was supported by PID2020-112584RB-C33, PID2023-146692OB-C33, CEX2021-001195-M funded by MICIU/AEI/10.13039/501100011033, UPF-PlaCLIK and SGR 00930. DHL (Serra Húnter) also acknowledges the support by ICREA Academia
Roberto Bolaño and the visual imagination: a poetics of the eye
The eye was a fetish object for the surrealists, a locus of desire, a portal into the unconscious and the irrational. Roberto Bolaño carried Breton’s savage eye into the center of his own poetics, to see anew. In his work we find the eye as symbol and metaphor, its communicating gesture, its visionary capacity to plumb the depths of dreams, that is able to reclaim the raw, primal nature of perception. We also see the opposite, eyes that cannot see, that are obfuscated, that alight on arbitrary surfaces like stains on the wall or ceiling to open the space of imagination. In Bolaño's work the eye functions as an organizing principle that unifies the components of a poetic system. Shifting signifiers that recur and link and emphasize the thingness of Bolaño’s body of work, making it into an object to be contemplated, una figura sembrada de ojos. We suggest a new way of reading Bolaño. To do so, we look at the text, open the imagination to see Bolaño’s poetic system, his recurring pictograms that act as a second-tier language, geometrical figures that spatialize and constellate, the picture that lay embedded in the language. We locate, bracket, and observe examples of Bolaño’s recurring glyphs, which we call “bolañoglyphs” -windows, triangles, the number three, and the eye providentially casting its spell-shadow-screen– and approach this system through a comparison with another similar system though across the intermedial gulf of image and text; that of Miró’s famous miroglyphs. What happens when we read a painting-poem and look at a novel-poem?El ojo era un objeto fetiche para los surrealistas, un locus del deseo. Roberto Bolaño llevó el ojo salvaje de Breton al centro de su propia poética, para ver y mirar nuevamente. El ojo como símbolo y metáfora, su gesto comunicador, su capacidad visionaria para sondear el inconsciente, su capacidad para reivindicar la naturaleza cruda y primigenia de la percepción. El ojo opera como principio organizador que unifica los componentes de un sistema poético recursivo que enlaza y enfatiza el carácter de cosa de la obra de Bolaño, convirtiéndola en un objeto para ser contemplado, una figura sembrada de ojos. Se analiza su sistema poético: una serie de pictogramas recurrentes que actúan como un lenguaje de segundo orden, figuras geométricas que espacializan y constelan la imagen que yace incrustada en el lenguaje. Se localizan, colocan entre corchetes y observan ejemplos de los glifos recurrentes en su obra, aquí denominados «bolañoglifos» --ventanas, triángulos, el número tres y el ojo que proyecta providencialmente su hechizo-sombra-pantalla-- y se compara cómo el sistema de glifos verbales trasladó el sistema de figuras poético-pictóricas de Miró, sus célebres miroglifos.Programa de Doctorat en Humanitat
The evaluation of democratic performance from a comparative longitudinal perspective
This chapter examines how European citizens’ evaluations of different democracy models have evolved from 2012 to 2022, a period of significant economic, social, and political change. Building on the authors’ previous work on this topic, published in 2016, they once more focus on predictors of citizens’ evaluations of liberal, social, and direct models of democracy. The analysis shows a shifting pattern, with evaluations of liberal and social democracy becoming increasingly dependent on trust in political institutions and the impact of electoral defeats. These changes are linked to the influence of populist values and rising affective polarization. Overall, while support for democracy models remains stable, evaluations are more strongly influenced by political factors than before
Studying gene expression dynamics by integrating multiple Omics data
This thesis investigates the complex processes governing gene expression, from RNA transcription to protein synthesis, across diverse regulatory layers and biological contexts. By examining RNA localization between nuclear and cytosolic compartments, we developed and validated a novel method to accurately measure transcript distribution using RNA-Seq data. To explore the causal effects of histone post-translational modifications (PTMs) on RNA splicing and abundance, we integrated ChIP-Seq data with RNA-Seq and observed the impact of chromatin dynamics during a transdifferentiation. By analyzing time-resolved multi-Omics datasets, including RNA-Seq, ribosome profiling, and mass spectrometry, we tracked the temporal flow of gene expression from RNA to protein, uncovering the contributions of distinct regulatory events. Finally, we studied gene expression in coronary artery disease (CAD), identifying potential blood-based biomarkers for improved diagnosis and management. This work integrates multi-Omics approaches to provide novel insights into gene expression regulation, its temporal dynamics, and functional implications in health and disease.Aquesta tesi investiga els processos complexos que regulen l’expressió gènica, des de la transcripció de l’ARN fins a la síntesi de proteïnes, en diferents capes reguladores i contextos biològics. Analitzant la localització de l’ARN entre els compartiments nuclear i citosòlic, hem desenvolupat i validat un mètode innovador per mesurar amb precisió la distribució dels transcrits utilitzant dades d’RNA-Seq. Per explorar els efectes causals de les modificacions postraduccionals d’histones (PTMs) en l’splicing i l’abundància d’ARN, vam integrar dades de ChIP-Seq amb RNA-Seq per estudiar la dinàmica de la cromatina durant la trans- diferenciació. Analitzant dades multi-òmiques temporals (RNA-Seq, ribosome profiling i espectrometria de masses), vam desxifrar el flux d’informació de l’ARN a la proteïna, revelant les contribucions temporals de diferents esdeveniments reguladors. Finalment, vam estudiar l’expressió gènica en malaltia coronària (CAD), identificant biomarcadors en sang potencialment útils per al diagnòstic i la gestió clínica.Programa de Doctorat en Biomedicin
Configuración de la identidad femenina: su huella en la novela de formación colombiana
Esta investigación indaga sobre la configuración de la identidad femenina representada en las novelas de formación de escritoras colombianas publicadas entre 1980 y 2010. El corpus incluye algunas obras de Helena Araújo, Marvel Moreno, Silvia Galvis, Piedad Bonnett y Consuelo Triviño quienes adoptan una perspectiva crítica sobre la sociedad patriarcal y la condición de las mujeres. Se concluye que la configuración de la identidad de las protagonistas está influida por la manera como la sociedad colombiana concibe los roles de género. Se observa que las protagonistas asumen una postura crítica y subvierten los mandatos de género con el deseo de buscar una manera propia de ser mujeres y de estar en el mundo. Esto se evidencia en que las protagonistas narran su historia desde su propia voz y perspectiva. Los finales abiertos dan la posibilidad de construir la propia historia desde una orilla diferente a la de los determinismos sociales.This research project examines the configuration of female identity as represented in the formative novels of Colombian women writers published between 1980 and 2010. The corpus includes works by Helena Araújo, Marvel Moreno, Silvia Galvis, Piedad Bonnett, and Consuelo Triviño, who adopt a critical perspective on patriarchal society and the status of women. It can be concluded that the configuration of the protagonists' identity is influenced by the way in which Colombian society conceives of gender roles. It is observed that the protagonists assume a critical stance and subvert gender mandates with the desire to find their own way of being women and being in the world. This is evidenced by the fact that the protagonists narrate their story from their own voice and perspective. The open endings allow for the construction of one's own story from a perspective that is not constrained by social determinisms.Universitat Pompeu Fabra. Doctorat en Humanitat