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Evaluation of IR Spectroscopy for Differentiating Blood Samples from Healthy Individuals and Long-COVID Patients with Exploratory Analyses
Masterarbeit Universität Innsbruck 202
From building bridges to erecting barriers : exploring the dynamics of expatriation
The study analyzes expatriate adaptation through the application of human capital theory, and adjustment theory. On this theoretical background, semi structured interviews were conducted with six expatriates, who represent different professional fields, in order to better understand the challenges of adapting to different cultural environments. Through thematic data analysis, the study highlights the importance of expatriate adaptation processes and the identification of possible ways to support expatriates to face the challenges presented in international work environments. Analysis of interview data indicated that key adjustment factors include language, family, mixed feelings, economic costs, social behavior, and cultural influences.submitted by Gloria KuqoMasterarbeit University of Innsbruck 202
Zwischen Globaler Integration und Lokaler Anpassung : Herausforderungen und Strategien aus dem HR-Management multinationaler Unternehmen
Mona RadmannDiplomarbeit Universität Innsbruck 202
Social Aspects of Female Entrepreneurship in Oppressive Environments : Qualitative insights from Afghanistan and Iran
Dissertation Universität Innsbruck 202
Trauerbewältigung mithilfe von Trauermusik der Musikkapelle Innervillgraten
Masterarbeit Universität Innsbruck 202
SurgiMind : segmentation of medical images
Accurate identification of anatomical structures in medical images is essential for successful clinical outcomes. Particularly in minimally invasive surgical procedures such as video-assisted thoracoscopic surgery (VATS). Due to anatomical variations and tissue inflammation after neoadjuvant therapy, successful and efficient identification of target structures can be impaired. Although neural networks have demonstrated excellent performance in general image segmentation tasks, their application in the medical domain is still limited.
In this study, we introduce the SurgiMind dataset consisting of labeled images taken from surgical video recordings and provide a statistical analysis to enable an accurate model evaluation. The dataset was created in collaboration with the Medical University of Innsbruck.
We propose a novel evaluation strategy based on DICE, IoU and Precision which is optimized for the medical context to distinguish performance in scenarios where anatomical structures are present and absent. In the evaluation, we show how this approach can illustrate the strengths and weaknesses of a segmentation network.
On the SurgiMind dataset, we evaluate U-Net and FCT as reference architectures. In addition, we introduce three FCT-based architectures that add established network components from other U-Net variants. Our results demonstrate that these newly introduced architectures outperform the traditional methods.Dennis BarnesMasterarbeit Universität Innsbruck 202
Employee acceptance and trust in AI : a quantitative case study on the implementation of langdock at personio
by Kathrin HeldauerMasterarbeit University of Innsbruck 202
Die rechtliche Angleichung der Schweiz an die Europäische Union : eine Analyse bilateraler Verträge und notwendiger Anpassungen
Nikola CvijetićDiplomarbeit Universität Innsbruck 202
Explorative Untersuchung zur Erfassung von Bindungsrepräsentationen : Weiterentwicklung und Validierung des AAP-Relationship Choices 4.0
Gemäß der Bindungstheorie werden frühe Bindungserfahrungen durch innere Arbeitsmodelle geprägt, die wiederum lebenslange Beziehungsmuster beeinflussen. Zur diagnostischen Erfassung der Bindungsrepräsentationen im Erwachsenenalter gelten das Adult Attachment Interview (AAI) und das Adult Attachment Projective Picture System (AAP) als etablierte reliable und valide narrative Interview-Verfahren. Beide Verfahren ermöglichen die Erfassung unverarbeiteter traumatischer Erfahrungen, ein Aspekt, der mit standardisierten Selbstauskunftsverfahren nur eingeschränkt, bis gar nicht zugänglich ist. Sie sind jedoch in ihrer praktischen Anwendung zeit- und ressourcenintensiv, wobei das AAP in Durchführung und Auswertung im Vergleich zum AAI bereits sehr viel ökonomischer ist. Um diese diagnostische Lücke mit einem noch ökonomischeren Ansatz zu schließen, wurde das Instrument Adult Attachment Projective – Relationship Choices 4.0 (AAP-RC 4.0) entwickelt, das projektive Bildstimuli mit standardisierten Antwortformaten, die die vier klassischen Bindungsmuster repräsentieren, verbindet. Ziel der vorliegenden Studie war die psychometrische Überprüfung der vier Bindungsskalen (sicher-gebunden, unsicher-distanziert, unsicher-verstrickt und unverarbeitetes Trauma) an einer Stichprobe von N = 286 Erwachsenen. Die Reliabilitätsanalysen ergaben folgende Werte für die internen Konsistenzen (Cronbach’s α): sicher-autonom = .894, unsicher-distanziert = .740, unsicher-verstrickt = .843, unverarbeitetes Trauma =.913. Zusätzlich wurden Unterschiede in der Trennschärfe zwischen dyadischen und monadischen Szenen analysiert sowie inhaltlich kritische Items identifiziert. Entgegen theoretischer Erwartung zeigten sich keine systematischen Unterschiede zwischen den Szenentypen. Die Ergebnisse bilden die Grundlage für konkrete Empfehlungen zur Überarbeitung kritischer Items, insbesondere der Skala unsicher-distanziert, sowie zur potenziellen Kürzung des Fragebogens. Die Studie leistet einen Beitrag zur Weiterentwicklung bindungsdiagnostischer Verfahren und eröffnet Perspektiven für Forschung und Anwendung im klinischen Kontext.According to attachment theory, early attachment experiences are shaped by inner working models, which in turn influence lifelong relationship patterns. The Adult Attachment Interview (AAI) and the Adult Attachment Projective Picture System (AAP) are established reliable and valid narrative interview methods for the diagnostic assessment of attachment representations in adulthood. Both methods enable the coding of unresolved traumatic experiences, an aspect that is only accessible to a limited extent or not at all with standardized self-reporting methods. However, both instruments are time-consuming and resource-intensive in their practical application, whereby the AAP is already much more economical in its implementation and evaluation compared to the AAI. In order to close this diagnostic gap with an even more economical approach, the Adult Attachment Projective - Relationship Choices 4.0 (AAP-RC 4.0) instrument was developed, which combines projective picture stimuli with standardized response formats representing the four classic attachment patterns. The aim of the present study was to psychometrically test the four attachment scales (secure-autonomous, insecure-dismissing, insecure-preoccupied and unresolved trauma) in a sample of N = 286 adults. The reliability analyses yielded the following values for the internal consistencies (Cronbach's α): secure-autonomous = .894, insecure-dismissing = .740, insecure-preoccupied = .843, unresolved trauma =.913. In addition, differences in the discriminatory power between dyadic and monadic scenes were analyzed and content-critical items were identified. Contrary to theoretical expectations, there were no systematic differences between the scene types (monadic/dyadic). The results form the basis for concrete recommendations for the revision of critical items, in particular the insecure-dismissing scale, as well as for the potential shortening of the questionnaire. The study contributes to the further development of attachment diagnostic procedures and opens up perspectives for research and application in a clinical context.Robert SassAbstract in englischer SpracheMasterarbeit Universität Innsbruck 202
The evolution of beta-catenin, Myc, and its proximal network in Macrostomum lignano and other flatworms
Die Fähigkeit von Organismen, sich zu regenerieren und fehlendes Gewebe richtig zu strukturieren, bleibt ein faszinierendes Forschungsthema. Die Regenerationsfähigkeit wirft spannende Fragen zu den Genen und Signalwegen auf, die eine Neuprogrammierung als Reaktion auf Verletzungen ermöglichen. Von zentraler Bedeutung für diese Prozesse ist der kanonische Wnt/β-Catenin-Signalweg. Während β-Catenin und das Myc-proximale Netzwerk (d. h. Max, Mxd und Mlx) bei Tierarten, darunter Tricladen (Planarien), identifiziert und umfassend untersucht wurden, ist wenig über die Rolle von β-Catenin oder die Evolution des Myc-Netzwerks bei anderen Plattwürmern bekannt. Um dieses Thema besser zu verstehen, untersucht meine Doktorarbeit die Evolution von β-Catenin bei Plattwürmern und erläutert seine mögliche Rolle während der Regeneration beim Plattwurm Macrostomum lignano. Darüber hinaus präsentiert sie eine detaillierte Analyse des Myc-Netzwerks bei Metazoen mit einem Schwerpunkt auf Plattwürmern.
Kapitel 1: Es wurde gezeigt, dass die Planarie Schmidtea mediterranea β-Catenin in vier Homologe mit unterschiedlichen Funktionen dupliziert hat. Unter ihnen überträgt β-Catenin1 das Wnt-Signal und etabliert die Körperachse in den vorderen und hinteren Regeneraten und intakten Würmern. Wichtig ist, dass die Ausschaltung von β-Catenin1 sogar bei regenerationsunfähigen Tricladenarten eine Kopfregeneration induziert. In diesem Kapitel haben wir Genom- und Transkriptomdaten für eine breite Palette von höherstufigen Plattwurmtaxa untersucht, um die Evolution von β-Catenin in Plattwürmern und seine mögliche Rolle in M. lignano zu bestimmen. Wir fanden heraus, dass alle Rhabditophora-Plattwürmer, außer den Catenuliden, β-Catenin duplizierten. Darüber hinaus beobachteten wir, dass M. lignano drei Homologe kodiert, während alle Tricladen sich zu vier β-Catenin-Homologen vervielfältigten. Die Stilllegung von M. lignano-β-Cateninen konnte bei allen Amputationsstufen und Behandlungsbedingungen keine Kopfregeneration auslösen. Unsere Hypothese ist, dass die Kopfregeneration kein konserviertes Merkmal bei Plattwürmern ist, sondern ein abgeleitetes Merkmal innerhalb der Tricladen. Schließlich untersuchten wir die Rolle von M. lignano-β-Cateninen bei posterioren Regeneraten und intakten Würmern. Unsere Ergebnisse zeigen, dass nur Mlig-β-Catenin1 das Wnt-Signal überträgt, die Blastembildung und Schwanzregeneration während der Behandlung blockiert und die proliferierenden Zellen im Wundbereich stark reduziert. Darüber hinaus haben wir gezeigt, dass der Knockdown von Mlig-β-Catenin1 bei intakten Würmern keine ektopischen Köpfe auslösen kann. Diese Ergebnisse zeigen, dass Mlig-β-Catenin1 für die Bestimmung der posterioren Identität erforderlich ist, und das Versagen bei der Auslösung ektopischer Köpfe deutet darauf hin, dass die Rettung des Kopfes möglicherweise eine Apomorphie der Planarien ist.
Kapitel 2: Wir haben die Evolution der Myc- und Max-Proteinfamilien bei Metazoen untersucht. Wir haben festgestellt, dass Max vollständig konserviert bleibt, obwohl Myc in verschiedenen Stämmen mehrfach verloren gegangen ist. Mithilfe von Myc-Sequenzen aus nicht-abgeleiteten Arten über die Metazoen-Phyla hinweg identifizierte unsere Analyse eine bislang unbeschriebene, konservierte N-terminale Myc-Box, die wir MB1.5 nannten. Darüber hinaus hat Myc bei Wirbeltieren und Nesseltieren eine umfassende Diversifizierung erfahren. Insbesondere kodieren Nesseltiere bis zu sieben Paraloge. Bei Protostomiern wurden die grundlegenden Helix-Hoop-Helix-Zipper-Transkriptionsfaktoren (bHLH-zip) für das Myc-proximale Netzwerk bei Stämmen wie Fadenwürmern, Zweiflüglern und zwei Plattwurmarten (Schistosoma mansoni und Schmidtea mediterranea) untersucht.
Kapitel 3: Wir wollten das Myc-proximale Netzwerk untersuchen und diskutierten, wie sich die Proteinfamilie bei Plattwürmern entwickelte. Wir fanden heraus, dass Max und Mlx sowie eine unveränderliche Anzahl von Mxd-Homologen konserviert sind. Wir identifizierten auch einzelne Homologe von Mnt in sechs der 14 Plattwurm-Taxa, was darauf hindeutet, dass Mnt viele Male verloren gegangen ist. Obwohl abgeleitet, gruppieren sich Plattwurmsequenzen im phylogenetischen Baum mit Orthologen anderer Tierarten. Insgesamt deuten diese Ergebnisse darauf hin, dass Plattwürmer Myc und Mga verloren haben, aber Orthologe erhalten haben, von denen gezeigt wurde, dass sie die Zellproliferation, -differenzierung und den Stoffwechsel beim Menschen regulieren, was darauf hindeutet, dass sie bei Plattwürmern ähnliche Rollen spielen könnten.
Alles in allem liefert diese Arbeit neue Erkenntnisse über die Evolution und Rolle von β-Catenin und die Erhaltung des Myc-Netzwerks bei Plattwürmern. Diese Erkenntnisse erweitern unser Verständnis der Regeneration und bieten potenzielle Ansätze für eine umfassendere Forschung zur Gewebemusterung und -wiederherstellung, die möglicherweise mit den Mitgliedern der Transkription des Myc-Netzwerks in Verbindung stehen könnte, von denen bekannt ist, dass sie eine Rolle bei der Regulierung der Zellproliferation, -differenzierung und des Zellwachstums spielen.The ability of organisms to regenerate and to correctly pattern the missing tissue remains a fascinating research topic. Regenerative capacity raises intriguing questions about the genes and pathways enabling reprogramming in response to injuries. Central to these processes is the canonical Wnt/β-catenin pathway. While β-catenin and the Myc proximal network (i.e., Max, Mxd, and Mlx) have been identified and extensively studied in animal taxa, including triclads (planarians), little is known about the role of β-catenin or the evolution of the Myc network in other flatworms. To better understand this topic, my Ph.D. thesis explores the evolution of β-catenin in flatworms and elucidates its potential role during regeneration in the flatworm Macrostomum lignano. Additionally, it presents a detailed analysis of the Myc network in metazoans with a major focus on flatworms.
Chapter 1: It has been shown that the planarian flatworm Schmidtea mediterranea duplicated β-catenin into four homologs with distinct functions. Among them, β-catenin1 transduces the Wnt signalling and establishes the body axis in anterior and posterior regenerates and intact worms. Importantly, the knockdown of β-catenin1 induces head regeneration even in regeneration incompetent triclads species. In this chapter, we sampled genome and transcriptome data for a wide range of higher-level flatworm taxa to determine the evolution of β-catenin in flatworms and its potential role in M. lignano. We found that all rhabditophorans flatworms duplicated β-catenin except catenulids. Additionally, we observed that M. lignano encodes three homologs while all triclads multiplied to four β-catenin homologs. Silencing M. lignano-β-catenins failed to induce head regeneration at all amputation levels and treatment conditions. We hypothesise that regeneration of the head is not a conserved feature in flatworms but a derived trait within triclads. Finally, we investigated the role of M. lignano-β-catenins in posterior regenerates and intact worms. Our findings indicate that only Mlig-β-catenin1 transduces the Wnt signal, blocks blastema formation and tail regeneration during treatment, and strongly reduces proliferating cells in the wound area. Additionally, we demonstrated that Mlig-β-catenin1 knockdown cannot induce ectopic heads in intact worms. These results indicate that Mlig-β-catenin1 is necessary for determining posterior identity, and the failure to induce ectopic heads suggests that the rescue of the head is possibly an apomorphy of planarians.
In Chapter 2, we explored the evolution of Myc and Max protein families in metazoans. We found that even though Myc has been lost multiple times in different phyla, Max remains fully conserved. Using Myc sequences from non-derived species across metazoans phyla, our analysis identified a so far undescribed, conserved N-terminal Myc box, which we named MB1.5. Myc has undergone extensive structural diversification in cnidarians with up to seven paralogs.
In protostomes, the basic helix hoop helix zipper (bHLH-zip) transcription factors of the Myc proximal network have been explored in phyla such as nematodes, diptera, and two flatworm species (Schistosoma mansoni and Schmidtea mediterranea). In Chapter 3, we aimed to investigate the Myc proximal network and discussed how the protein family evolved in flatworms. We found that Max and Mlx and an invariable number of Mxd homologs are conserved. We also identified single homologs of Mnt in 6 of the 14 flatworm taxa, indicating that Mnt has been lost many times. Although derived, flatworm sequences cluster in the phylogenetic tree with orthologs of other animal taxa. Altogether, these results indicate flatworms lost Myc and Mga but conserved orthologs that have been shown to regulate cell proliferation, differentiation, and metabolism in humans, suggesting they may perform similar roles in flatworms.
Overall, this thesis provides novel insights regarding the evolution and role of β-catenin and the conservation of the Myc network in flatworms. These findings advance our understanding of regeneration, offering potential avenues for broader research into tissue patterning and restoration, which possibly would connect to the members of the transcription of the Myc network known to play a role in regulating cell proliferation, differentiation, and growth.Dissertation Universität Innsbruck 202