Repositorio Minciencias
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Plants cultivated in Choco, Colombia, as source of repellents against Tribolium castaneum (Herbst)
Essential oils (EOs) of eight plants collected in Choco, Colombia, including Piper divaricatum, P. pseudolanceifolium, P. confertinodum, P. diazanum, Ocimum campechianum, Siparuna conica, Mikania micrantha and Hedychium coronarium, were analyzed by gas chromatography–mass spectrometry and tested as repellents against Tribolium castaneum, using the area preference method, after 2 and 4 h exposure. The main components found in Eos were methyl eugenol, trans-β-cariophyllene, methyl eugenol, α-pinene, δ-cadinene, γ-elemene, α-pinene and 1,8-cineol, for O. campechianum, P. pseudolanceifolium, P. divaricatum, P. confertinodum, P. diazanum, S. conica, M. micrantha, and H. coronarium, respectively. Best repellent activities were observed for oils from
O. campechianum and P. pseudolanceifolium with mean repellent concentration (RC50) values of 0.00006 and 0.0001 μL/cm2 after 2 h, and 0.00003 and 0.0001 μL/cm2 after 4 h, respectively; whereas the least potent was that from M. micrantha, with RC50 values of 0.074 and 0.040 μL/cm2 at 2 and 4 h exposure times, respectively. Based on average percentage repellence, oils from P. pseudolanceifolium and O. campechianum were classified as Class IV repellents and were better than the commercial repellent IR3535, classified as Class II. These data evidence the Choco region as an important source of natural repellents with promising commercial opportunities.Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias5507-543-31904Programa: Bioprospección y desarrollo de ingredientes naturales para las industrias cosmética, farmacéutica y de productos de aseo con base en la biodiversidad colombianan
Colciencias 2005-2006
El presente documento
tiene por propósito presentar a la comunidad colombiana e internacional las
realizaciones del Programa Nacional de Prospectiva Tecnológica e Industrial
durante 2003-2006. Igualmente, con base en la experiencia adquirida, proponer
lineamientos estratégicos para su consolidación en un Programa de Prospectiva
en Ciencia, tecnología e Innovación para 2007-2010
Essential oil constituents as ecdysone receptor ligands of pest insects: in silico approach with autodock vina
The search for alternatives to the insect pest control has become a major global worry. These factor added to climate change may affect severely the agricultural production. Synthetic chemicals have been used as a system of control of these types of insects, although their application has raised various concerns including environment and human health damage. Nevertheless, the use of natural compounds, primarily those derived from plants like essential oils have been proposed as alternative for this purpose. Some authors have proposed different protein targets, among them chitin synthase, nicotinic acetylcholine receptor (nAChR), gamma-amino butyric acid (GABA) receptor and ecdysone receptor (EcR). However, the biochemical mechanisms responsible of their insecticide action are still lacking information. In this work, 47 constituents of essential oils were evaluated in silico in order to identify potential agonist of the ecdysone receptor to four pest insect species (Bemisia tabaci; 1Z5X, Tribolium castaneum, 2NXX, Heliothis virescens; 2R40, Helicoverpa armigera; 3IXP) using molecular docking protocols with AutoDock Vina 1.1 program. The results showed that essential oils constituents such as Camphorene, Kaur-16-ene, Pimara-7,15-dien-3-one, Pimara-7,15-dien-3-ol, Virifidol produced promising theoretical affinity values (between -8.2 to -8.8 kcal/mol) taking as reference the mean affinity value (-8.2 kcal/mol) obtained for eleven EcR LBD agonists with biological activity reported in the literature. AutoDock Vina affinities scores for several EcR LDB active compounds on the four different structures evaluated, found that only for H. virescen (PDB: 2R40) showed a significant linear correlation (r = 0.688, p-value <0.028) for theoretical affinity values and biological activity data, supporting the computational reliability of the predictions made by our docking simulations. Theoretical approaches suggest that these constituents of essential oils may be applied as possible natural insecticide agents and will provide a platform for structure-based design of stronger and selective insecticides with a lower risk to the environment and humans.Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias5507-543-31904Programa: Bioprospección y desarrollo de ingredientes naturales para las industrias cosmética, farmacéutica y de productos de aseo con base en la biodiversidad colombianan
Quantum‐chemical‐aided design of copolymers with tailored bandgaps and effective masses: The role of composition
Extending a key observation made by Meyers et al. (Meyers et al., J Chem Phys, 1992, 97, 2750), a strategy for the systematic design of conducting polymers with tailor‐made bandgaps and carrier effective masses is described and quantum‐chemically implemented. Such strategy relies on the construction of alternating binary copolymers from well‐characterized parent polymers, in such a manner that those electronic parameters can be phenomenologically predicted from the composition of the copolymer. Illustrative calculations for three types of alternating copolymers built from five parent π‐conjugated polymers demonstrate the plausibility of the methodology and the internal consistency of its computational implementation. Specifically, it is shown that the bandgaps of copolymers built from parent monomers with similar chemical structures exhibit nearly linear behaviors as functions of composition, whereas the bandgaps of copolymers with dissimilar parent monomers exhibit nearly monotonic deviations from linearity. On the other hand, the electron and hole effective masses of copolymers with similar parent monomers do not show a significant dependence on composition, whereas for copolymers with dissimilar parent monomers these quantities also display nearly monotonic deviations from linearity. A qualitative rationalization of these trends in terms of the strengths of the inter‐parent–monomer interactions, which bears an intriguing resemblance to the behavior of the vapor pressure of binary solutions, is provided.Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias1106-452-21296Control cuántico de las propiedades electrónicas y de espín en nanoestructuras inorgánicas, orgánicas y biológicasn
Acoplamiento molecular in sillico de los componentes de aceites esenciales con las proteínas del virus del dengue
El virus del dengue (DENV) es un agente infeccioso arboviral, actualmente este no tiene tratamiento específico. El objetivo principal de este trabajo fue evaluar el acoplamiento molecular in silico de los componentes mayoritarios de aceites esenciales con reportada actividad anti-dengue con las proteínas del DENV. Para tal fin las proteínas fueron descargadas de Protein Data Bank (PDB): C, prM, E, NS3, NS5 polimerasa y NS5 metiltransferasa. Los componentes de los aceites esenciales, previamente optimizados, fueron acoplados empleando AutoDock Vina con las proteínas, preparadas y optimizadas. Los valores de afinidad teórica para los componentes de los aceites esenciales sobre las proteínas variaron entre -4.0 y -7.3 Kcal/mol. Las moléculas α-copaeno, β-bourboneno, germacreno D, spathulenol, β-cariofileno, óxido de cariofileno y (+)-epi-biciclosesquifellandreno, todas de naturaleza sesquiterpénica, fueron las que exhibieron la mayor interacción con las proteínas estudiadas. La mayor parte de las interacciones entre estas moléculas y las proteínas DENV fueron de tipo hidrofóbico. Este estudio computacional ha permitido inferir que todas las proteínas del virus del dengue son blancos potenciales para el acoplamiento concomitante de varios compuestos de aceites esenciales.Dengue virus (DENV) is an arboviral infectious agent, this currently has no specific treatment. The main objective of this work was to evaluate the in silico molecular docking of the major components of essential oils with anti-dengue reported with DENV proteins. For this purpose, proteins were downloaded from Protein Data Bank (PDB): C, prM, E, NS3, NS5 polymerase and NS5 methyltransferase. Components of essential oils, previously optimized, were coupled using AutoDock Vina with proteins prepared and optimized. Theoretical affinity values for the components of the essential oils on protein varied between -4.0 and -7.3 kcal/mol. The molecules α-copaene, β-bourbonene, germacrene D, spathulenol, β-caryophyllene, caryophyllene oxide and (+)-epi-bicyclosesquiphellandrene, all of nature sesquiterpene, were those that showed the greatest interaction with the proteins studied. The majority of the interactions between these molecules and proteins were DENV hydrophobic type. This study computational has permitted infer that all dengue virus proteins are potential targets for the concomitant docking of various compounds of essential oils.Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias5507-543-31904Programa: Bioprospección y desarrollo de ingredientes naturales para las industrias cosmética, farmacéutica y de productos de aseo con base en la biodiversidad colombianan
Colciencias cuarenta años: entre la legitimidad, la normatividad y la práctica
Si bien es cierto el actual gobierno colombiano, de manera explícita en su agenda política, considera que la innovación es un elemento necesario para la transformación económica que redunda en la mejora de la competitividad y productividad del país, no es menos cierto que dicha consideración ha sido tenida en cuenta desde los inicios de la actividad de Colciencias, de tal suerte que con el pasar de los años se ha ido conformando y fortaleciendo poco a poco un Sistema Nacional de Innovación (SNI).
Tal proceso de instauración y organización de un SNI ocurrido en estos cuarenta años suscita interrogantes
como ¿cuáles han sido las políticas y cuál el enfoque de cada una de ellas? ¿Cuáles han sido los medios para nutrir el diseño de esas políticas? ¿Cuáles han sido los mecanismos de coordinación, financiación y control entre quienes hacen parte del SNI? ¿Quiénes han sido los actores responsables de generar las actividades propias de un SNI?
Así, el propósito de este capítulo es exponer el proceso de construcción de un SNI colombiano desde la mirada de los sistemas viables. Los principales resultados de este análisis se refieren a que el proceso es de larga data, ha venido ganando en institucionalidad y en gobernabilidad, y que pese a que en general los propósitos están relacionados con la articulación y coordinación de los actores, este es a su vez su gran debilidad.While, Colombian government has defined innovation as a milestone for improving the country's competitiveness and productivity and it is reflected on its agenda. It is no less true that such consideration has been taken into account since the early Colciencias activities, in such a way that with the passing of the years has been shaped and gradually strengthening a National Innovation System (NIS).
That process raises several questions such as: What have been the policies and its scope and focus? What have been the inputs for design these policies? What have been the mechanisms for management the process, the activities and the actors of the NIS? Who have been the actors of the NIS?
The aim of this chapter is to show the Colombian National Innovation using a System Viable approach. The
main results of this analysis are that the process is longstanding, has been gaining in institutional and governance and that although the purposes are generally related to the articulation and coordination of the actors, this is in turn its great weakness.Revista Colombia. Ciencia y Tecnologí
Risk factors and clinical features associated with adverse cardiovascular outcomes in a cohort of Colombian patients with early acute coronary syndrome
La enfermedad coronaria es la principal causa de mortalidad en todo el mundo, y ha pasado a convertirse en una de las principales causas de muerte en los individuos menores de 55 años. A pesar de esto, en nuestro medio existe una limitada información científica sobre la enfermedad coronaria ateroesclerótica en pacientes menores de 55 años, su caracterización, factores de riesgo y sus desenlaces clínicos. Métodos: Se realizó un estudio de cohorte para evaluar el efecto de los factores de riesgo cardiovasculares, las variables clínicas y angiográficas sobre la incidencia de un desenlace adverso cardiovascular mayor (MACE) definido como un nuevo evento coronario, accidente cerebrovascular y/o muerte; en pacientes con un primer evento coronario agudo antes de los 55 años. Se realizó una asociación entre las variables y el tiempo libre a un desenlace cardiovascular mayor adverso.Este documento tiene acceso restringido para consulta, categorizado como secreto empresarial, se debe solicitar autorización de los autoresDepartamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias1210-569-35150n
Evaluación de la actividad celulolítica y hemicelulolítica de un consorcio bacteriano aislado de residuos de Pino Caribe
l sector forestal genera una gran cantidad de residuos lignocelulósicos caracterizados por ser recalcitrantes, los cuales pueden ser transformados por medio de sistemas de fermentación en estado sólido, acelerando su trasformación con microorganismos que poseen enzimas lignocelulósicas. El objetivo de este estudio fue seleccionar un consorcio bacteriano productor de enzimas celulolíticas y hemicelulolíticas a fin de optimizar la transformación de corteza de Pinus caribaea por medio de un sistema de fermentación en estado sólido. Se seleccionaron 4 cepas (Bacilos Gram positivos y actinobacteria), las cuales en consorcio presentan un pico de expresión de las enzimas endoxilanasa a las 25 h (197,77 U/mL) y endoglucanasa a las 35 h (92,91 U/mL), el consorcio fue inoculado en corteza de pino, en la cual se evaluó la transformación de este residuo. Durante los primeros 15 días de transformación se evidencia un incremento en la temperatura, porcentaje de CO2 y microorganismo celulolíticos. En cuanto a las actividades enzimáticas, la endoglucanasa y la β glucosidasa presentaron una mayor expresión en la pila inoculada con el consorcio bacteriano (pila B). Se evidencio una disminucion en la relación C/N pasando de 48 a 44 y de 52 a 45,65 para las pilas Control (C) y B respectivamente. En conclusión, el aumento en la actividad enzimática puede favorecer la transformación de corteza de pino, aun así, interferencias con la técnica de medición usada no permiten evidenciar de forma clara el efecto del consorcio bacteriano celulolítico sobre la 31 transformación.Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias1203-586-35759Optimización de estrategias de siembra de materiales forestales con el uso de sustratos biotransformados enriquecidos con microorganismos benéficosn
Programa de monitoreo ambiental para la industria porcina
El presente documento, explica las principales causas originadas por las enfermedades transmitidas por alimentos (ETA); pretende dar un mirada integral a los programas de verificación (monitoreo) ambiental que pueden realizarse en la industria cárnica, teniendo en cuenta cuales son los peligros que se encuentran, cuales son los procesos realizados y como deben evaluarse.Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias1203-586-35758Diseño de un plan integral para reducir la prevalencia de Salmonella spp. y Listeria monocytogenes en plantas de beneficio, desposte y puntos de venta en la cadena cárnica porcinan
Programa de educación y comunicación ambiental
Estrategia de comunicación y educación ambiental que fortalezca la apropiación social del conocimiento y la interacción entre la empresa, los usuarios y la comunidad en general. Este documento presenta el Programa de Educación y Comunicación Ambiental, que se determinó es la estrategia oportuna para responder a este requerimiento. Un programa que es la guía de ruta con la secuencia de experiencias y materiales planeados para cumplir con el objetivo antes mencionado, una herramienta conceptual y metodológica trazada a mediano plazo y descrita en fases que se realizan en forma no secuencial.Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias1103-502-27605Optimización del esquema de negocios de la empresa de Acueducto y Alcantarillado de Popayán SA-ESP, mediante el desarrollo de un modelo de gestión integral del recurso hídrico para la competitividad con corresponsabilidad socialn