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    BMC Gebomics

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    Background. Duck treatments and vaccine designs against the opportunistic human pathogen Pseudomonas aeruginosa have multiple issues, all associated with the diverse genetic traits present in this pathogen, ranging from multi-drug resistant genes to the molecular machinery for the biosynthesis of biofilms. Several candidate vaccines against P. aeruginosa have been developed, which target the outer membrane proteins; However, major issues arise when attempting to establish complete protection against this pathogen due to its presumably genotypic variation at the strain level. To shed light on this concern, we propose this study to assess the P. aeruginosa pangenome and its molecular evolution across multiple strains. Results the P. aeruginosa pangenome was estimated to contain almost 17,000 non-redundant genes, and approximately 15% of these constituted the core genome. Functional analyzes of the accessory genome indicated a wide presence of genetic elements directly associated with pathogenicity. An in-depth molecular evolution analysis revealed the full landscape of selection forces acting on the P aeruginosa pangenome, in which purifying selection drives evolution in the genome of this human pathogen. We also detected distinctive selection wide variety of outer membrane proteins, with the data supporting the concept of substantial genetic variation in proteins probably recognized antigens. Approaching the evolutionary information of genes under extremely positive selection, we designed a new multi-locus sequencing typing assay for and informative, rapid and cost-effective genotyping of P. Aeruginosa on a large scale.Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias5817-569-34856Establecimiento de módulo funcionales de secuencia en familias de metiltransferasas de RNA y su uso en la búsqueda de genes de resistencia a antibióticos en patógenos humanosn

    Estandarización del proceso de elaboración de queso costeño a partir de la operación pasteurización

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    El queso costeño es un producto típico principalmente de la región Caribe, especialmente en el Departamento de Sucre, se obtiene bajo procesos de coagulación enzimática de las proteínas presentes en la leche cruda y entera de la vaca; las familias de la región han elaborado este producto a través de generaciones, por medio de procesos rústicos y sin procesos específicos que hayan sido documentados; las empresas productoras de queso costeño son de tipo artesanal y de carácter familiar con escaso nivel tecnológico, lo que se refiere a bajas capacidades operativas, limitando la comercialización del producto al ámbito local y regional, con poco conocimiento administrativo, de competitividad, y de aseguramiento de la calidad de los productos y su proceso. Este documento pretende proponer un método que garantice la obtención de combinaciones de factores que garanticen la calidad del producto, las características homogéneas a partir de la pasteurización, evaluando su efecto sobre el rendimiento y las propiedades fisicoquímicas, microbiológicas y organolépticas del queso, para que este sea seguro al consumidor y pueda competir en los mercados globales.1129-586-35793Estandarización del proceso de elaboración de queso costeño a partir de la implementación y optimización de la operación de pasteurizaciónn

    Plan de monitoreo variables climatológicas es hidrológicas : el cálculo de las necesidades hídricas de los cultivos en la subcuenca río las piedras - Cauca

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    A través del monitoreo de variables climatológicas e hidrológicas que se han registrado en las estaciones pluviométricas establecidas por la empresa de Acueducto y Alcantarillado de Popayán en la Cuenca Piedras con serie de datos de 13 años e información hidrológica de la estación puente carretera río Piedras operada por el IDEAM hace 43 años, se orientó sistematizar está información y buscar su aplicación a través de la investigación sobre el cálculo de las necesidades hídricas de los cultivos en la subcuenca río las Piedras – Cauca. La investigación permitió que a través del monitoreo de las variables climatológicas e hidrológicas se pudiera realizar un análisis de los comportamientos del clima local, generando elementos de aplicación para iniciar la construcción de un sistema de alertas tempranas con aplicación en la agro climatología de la subcuenca.Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias1103-502-27605Optimización del esquema de negocios de la empresa de Acueducto y Alcantarillado de Popayán SA-ESP, mediante el desarrollo de un modelo de gestión integral del recurso hídrico para la competitividad con corresponsabilidad socialn

    Las Ferias Infantiles y Juveniles de Ciencia, Tecnología e Innovación como Espacios de Formación y Apropiación Social: Lineamientos pedagógicos del Programa Ondas

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    El presente documento plantea métodos y procesos encaminados a lograr una eficiente organización y el éxito de las ferias infantiles y juveniles de CTI: escenarios propicios para la socialización y apropiación de resultados de investigación en los que los jóvenes investigadores, nacionales e internacionales, tienen la posibilidad de interactuar, compartir y formarse. Además, la publicación pretende generar un acercamiento al concepto de la apropiación social del conocimiento tal y como se establece en Colciencias y según la actual Política de Apropiación Social de la Ciencia, la Tecnología y la Innovación

    Early to Middle Miocene shallow-water corals from La Guajira, Colombia

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    Here we describe and illustrate 31 Miocene corals species from the Siamaná and Jimol Formations that were collected over two expeditions in the Guajira basin, Colombia during 2011 and 2014. Corals include 25 species, derived from 15 different genera and 12 families. Six of them remain with open nomenclature. From the 25 species found in the study area, 88% are extinct and the remaining under endanger status. Most of the species are hermatypic components of the Scleractinian order, with the exception of a member of the Milleporidae family. The corals described are composed of typical taxa from the Oligocene-Miocene transition, during which they were important components in building fringing and patch reefs in the circum- Caribbean/Gulf of Mexico region. The presence of typical Oligocene coral taxa such as Agathiphyllia spp., Antiguastrea sp., and Diploastrea spp. from La Guajira extend the distribution of these genera into the Miocene, adding a more recent geological presence in the Southern Caribbean. Coral assemblages suggest a development in clear, calm and shallow waters, under oligotrophic conditions and only moderate physical disturbance. Our descriptions represent the first effort to characterize the taxonomy of fossilized corals in Colombia.Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias7277-569-33195Links between marine biotic evolution and carbonate platform and petroleum reservoir development in the Guajira Basing, Colombia Caribbeann

    Protocolo elaboración de queso costeño pasteurizado

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    El presente documento describe detalladamente la realización del análisis organoléptico al queso costeño, contiene las indicaciones que debe seguir durante el procedimiento, así como las condiciones óptimas para ejecutar las actividades descritas.Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias1129-586-35793Estandarización del proceso de elaboración de queso costeño a partir de la implementación y optimización de la operación de pasteurizaciónn

    Síntesis de nuevos derivados del eugenol con actividad dual para el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer

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    En esta investigación se estudió la modificación química del eugenol proveniente del aceite esencial del clavo, Eugenia caryophyllus, para generar nuevos compuestos con actividad antioxidante e inhibitoria de la acetilcolinesterasa; por su actividad dual, estos compuestos se presentan como promisorios para su estudio farmacológico en la enfermedad de Alzheimer. El aceite esencial de Eugenia caryophyllus fue extraído del clavo de olor, adquirido en el mercado local, mediante un método de destilación convencional. La caracterización de este aceite mostró que contiene 11 compuestos, donde el mayoritario es el eugenol en un 71%. El eugenol fue aislado del aceite esencial, para su posterior modificación química. Para la síntesis de los nueve nuevos compuestos se utilizaron como sustratos: eugenol, isoeugenol y eugenol hidrogenado, los que se sometieron a reacciones de O-alquilación, usando como compuesto alquilante bromuros de etilo, butilo y octilo; cada uno de ellos fue caracterizado física (p.f., Rf) y espectrométricamente (IR, CG-MS, RMN 1H y 13C). Para determinar sus actividades biológicas, se realizaron ensayos de actividad antioxidante e inhibitoria de la acetilcolinesterasa. En la actividad antioxidante, se calculó el valor de TEAC para cada compuesto sintetizado usando Trolox® como compuesto de referencia, y Vitamina E (α-Tocoferol), butilhidroxianisol y butilhidroxitolueno como compuestos de control. Los valores de TEAC se encuentran en el rango de 6.93x10-8-3.26x10-7. En la actividad inhibitoria de la enzima se encontraron valores de IC50 de 21.29-57.19 μg/mL Los resultados obtenidos en esta investigación se dieron a conocer a la comunidad científica mediante la presentación de una ponencia en el Congreso Latinoamericano de Química CLAQ 2014.Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias5507-543-31904Programa: Bioprospección y desarrollo de ingredientes naturales para las industrias cosmética, farmacéutica y de productos de aseo con base en la biodiversidad colombianan

    La biotecnología en Iberoamérica: situación actual y tendencias

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    "Este informe, elaborado a requerimiento del Observatorio Iberoamericano de la Ciencia y la Tecnología del Centro de Altos Estudios Universitarios de la OEI, ofrece un análisis de la situación actual y tendencias de la I+D en biotecnología en el marco del espacio iberoamericano del conocimiento y su inserción en las corrientes de investigación mundiales. Para ello se ha recuperado y analizado la información contenida en bases de datos de publicaciones científicas y de patentes de invención, bajo la supervisión y el asesoramiento de expertos regionales en este campo. Se trata de un estudio de metodología similar al publicado por este mismo equipo en 2008 sobre el campo de la nanotecnología, permitiendo así miradas comparables a dos disciplinas de creciente importancia."Observatorio CT

    Memorias Científicas : X Congreso Colombiano de Ciencias Farmacéuticas y XIV Simposio Colombiano de Ciencia y Tecnología Cosmética, FARMACOSMETICA 2016

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    El presente documento recoge 3 investigaciones realizadas en modo trabajos área Farmacéutica Modalidad Presentación Oral para el X Congreso Colombiano de Ciencias Farmacéuticas y XIV Simposio Colombiano de Ciencia y Tecnología Cosmética, celebrado en Cartagena; relacionados con la investigación sobre el estudio de las plantas y el manejo de la leishmaniasis, los cuales se presentaron bajo los siguientes títulos: (1) Protocolos de validación de métodos analíticos para la Cuantificación de fármacos para el centro del servicio Farmacéutico y monitoreo de fármacos de la costa caribe; (2) Desarrollo de una formulación para el tratamiento de la leishmaniasis cutánea; (3) Nanopartículas: como alternativa para el transporte eficaz de fármacos para tratar la Leishmaniasis. Mediante estudios se establecieron características de desempeño de los derivados de las plantas, bajo protocolos de validación usados en la cuantificación de fármacos como elemento importante en el tratamiento de las enfermedades parasitarias e infecciosas.Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias1107-569-33684Aislamiento y purificación de compuestos con potencial actividad antileishmanial a partir de Cordia dentada Poir. y Heliotropium indicum L.n

    Serie de estudios y evaluaciones de ciencia, tecnología e innovación N° 022005

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    El presente es el informe final del estudio “Evaluación de gestión, resultados e impacto de los programas de formación en los niveles de maestría y doctorado financiados por Colciencias durante el período 1992-2004”. El estudio tuvo una duración total de 8 meses y fue realizado por la Unión Temporal de las firmas B.O.T. y Tecnos bajo la dirección de Eduardo Aldana- Socio Director de B.O.T. En su elaboración participaron los siguientes consultores: por B.O.T. Daniel Aldana (Gerente), Leonardo Garnica y Daniel De Castro; por Techos: Luis Javier Jaramillo, Jorge Ahumada, Pedro Amaya, Luis Gustavo Flórez, Alberto Ospina y Juan Carlos Rodríguez (coordinador de encuestadores). Los autores agradecemos de manera muy especial el apoyo y la activa participación de la Subdirección de Programas Estratégicos de Colciencias en cabeza de su Subdirectora, la Dra. Zully David Hoyos, de la División de Recursos Humanos en cabeza de su Jefe, la Dra. Heublyn Castro, y de los demás funcionarios de Colciencias que apoyaron las actividades realizadas. Nuestro agradecimiento especial también para Colfuturo, Icetex y la Fundación Fulbright - en cabeza de sus directores, Dr. Jerónimo Castro, Dra. Martha Lucía Villegas y Dr. Agustín Lombana - por su apoyo y diligente colaboración. Agradecemos también los comentarios del grupo de expertos convocado por Colciencias para la revisión de la versión preliminar de este informe. Agradecemos por sobre todo el entusiasmo de cada uno de los encuestados y entrevistados sin quienes este estudio no hubiese podido llevarse a cabo. Finalmente, y aunque los resultados de este informe no los comprometen ni a las entidades a las cuales están vinculados, agradecemos la asesoría brindada por parte de Fabio Sánchez, Director del CEDE, y Andrés Martínez estudiante de doctorado de la Universidad de Michigan.Colombia. Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación Colciencia

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