IYTE GCRIS Database (Izmir Institute of Technology)
Not a member yet
11968 research outputs found
Sort by
Identification and Functional Characterization of M6a Rna Modifications in Cisplatin-Treated Hela Cells
No full textN6-metiladenozin (m⁶A), RNA üzerinde en fazla bulunan ve dinamik bir modifikasyondur. Bu çalışmada m⁶A modifikasyonun HeLa hücrelerinin sisplatin (CP) uygulamasına verdiği yatının düzenlenmesindeki fonksiyonu araştırılmıştır. İlk olarak, CP uygulanmış HeLa hücrelerinde temel m⁶A düzenleyicilerinin seviyeleri ve ardından m⁶A metilasyon dağılımı tüm transkriptom çapında incelendi. Analiz sonucunda, m⁶A yazıcılarının, özellikle METTL4'ün ekspresyonun değişikliğinin olası etkisi olarak, m⁶A metilasyon profilinde anlamlı farklar belirlendi. Özellikle, CP uygulamasını takriben global metilasyon seviyesindeki düşüş aynı uygulama sonucunda gözlemlenen METTL14'ün protein seviyesindeki önemli azalma ile ilişkilendirilebilir. METTL14 susturması sonucunda hücrelerin, özellikle transfeksiyonun 72. ve 96. saatlerinde CP'ye daha hassasiyet gösterdiği tespit edildi. Bu hassasiyet hücre ölümü ile ilgili genlerin RNA sevilerinde METTL14 susturulması sonucunda gözlemlenen artıştan kaynaklanıyor olabilir. Bununla birlikte, aday genler arasından, ATF3, ATF5, DUSP6 ve PEA15 gibi genler tutarlı ifade modelleri sergilerken, TP73, BMF, DAPK1 ve DAB2IP, CP RNA-seq verilerinde tanımlanan yönlere zıt mRNA seviyeleri sergiledi. Bu bulgular, METTL14'e bağlı gerçekleşen metilasyonun, bu genlerin mRNA düzenlenmesinde, dolasıyla CP etkisini artırmasında çok önemli bir rol oynadığını göstermektedir. Ayrıca, YTHDF2'nin pro-apoptotik adaylara koşula özgün olarak kontrol hücrelerinde daha fazla bağlanma yatkınlığı gösterdiği belirlenmiştir. Bu durum bu genlerin normal koşullarda YTHDF2 tarafından indüklenen RNA bozulması ile seviyelerinin kontrol edildiğini ancak CP uygulaması ile bağlanma etkinliğinin azalması nedeni ile aynı genlerin sabitliğinin arttığını işaret etmektedir. Bu çalışma, CP yanıtı ile dinamik m⁶A modifikasyonu arasındaki karşılıklı etkileşimi göstermektedir. Özellikle METTL14'ün sisplatin etkinliğini m⁶A metilasyonu ekseninde artırdığının altını çizerek, kanser tedavisinde m⁶A dağılımını düzenleyen yolakları hedef alan terapötik stratejilere yönelik araştırmalar için temel sağlayabilir.N6-methyladenosine (m⁶A) modification is the most abundant and dynamic RNA modification that critically influences transcript fate post-transcriptionally. This study investigated the role of m⁶A RNA modification in regulating the response to cisplatin (CP) treatment in HeLa cells. The status of core m⁶A modulators following CP exposure was examined, followed by a transcriptome-wide analysis of m⁶A methylation. The findings revealed significant alterations in the m⁶A RNA methylation landscape by possible effects of changes in the expression of key m⁶A writer proteins, particularly METTL14. METTL14 depletion increased CP sensitivity, significantly elevating RNA levels of cell-death-related genes at the 72nd and 96th hrs after siRNA transfection. Genes such as ATF3, ATF5, DUSP6, and PEA15 displayed consistent expression patterns, while TP73, BMF, DAPK1, and DAB2IP exhibited opposite mRNA levels compared to those identified in CP RNA-seq data. These findings suggest that METTL14-directed methylation plays a crucial role in the mRNA regulation of these genes. Furthermore, YTHDF2 was found to regulate mRNA abundance of candidates through mRNA decay, with enriched binding to pro-apoptotic genes (TP73, DAPK1, ATF3, BMF, GADD34, ATF3, DUSP6) in control cells rather than CP-treated cells. This indicates that these genes might be subject to YTHDF2-mediated post-transcriptional regulation. This study highlights the dynamic nature of m⁶A modification in response to CP treatment. It underscores the significant role of METTL14 in modulating transcript fate, providing a foundation for future research into therapeutic strategies targeting m⁶A regulatory pathways in cancer treatment
Design and Optimization of Hydraulic Actuator Used in Jet Fighter
No full textActuators have been used in many areas from past to present. It is an indispensable equipment in the areas of use in today's technology. They are classified according to their usage areas and drive type. Depending on the type of drive, there are hydraulic, pneumatic and electrical actuators. It also has many uses: construction, manufacturing, automotive, robotics and aerospace industries. Hydraulic actuators are frequently used equipment in the aviation industry. In this thesis, the hydraulic actuator rod used in jet fighters was examined. This actuator is used to move the flight control surfaces in the jet fighter. So hydraulic actuator is vital for jet fighters. First, by conducting a literature search, boundary conditions and parameters were determined for actuator design and analysis. The design of rod was made using the determined parameters and the design parameters were analyzed using the finite element method. Neuro-regression approach was used to model a compact, lightweight and durable actuator. After regression analysis, many scenarios were created to optimize the mass and von Mises stress of the rod. The design and optimization of the hydraulic actuator rod were achieved by using Differential Evolution, Nelder-Mead, Random Search and Simulated Annealing algorithms. It has been concluded that the model and optimization algorithms are reliable and applicable to the problem.Aktüatörler geçmişten günümüze kadar birçok alanda kullanılmaktadır. Günümüzün teknolojisindeki kullanım alanlarında vazgeçilmez bir ekipmandır. Kullanım alanlarına ve tahrik çeşidine göre sınıflandırılmaktadır. Tahrik çeşidine göre hidrolik, pnömatik ve elektriksel aktüatörler bulunmaktadır. Ayrıca birçok kullanım alanı vardır: inşaat, üretim, otomotiv, robotik ve havacılık sektörleri. Hidrolik aktüatörler havacılık sektöründe sıkça kullanılan bir ekipmandır. Bu tezde jet uçaklarında uçuş kontrol için kullanılan hidrolik aktüatörün rotu incelenecektir. Bu aktüatör jet uçaklarında uçuş kontrol yüzeylerinin hareket ettirilmesinde kullanılmaktadır. Bu yüzden hidrolik aktüatör jet uçakları için hayati öneme sahiptir. İlk olarak literatür araştırılması yapılarak aktüatör tasarımı ve analizi yapılmak için sınır koşulları ve parametreler belirlendi. Belirlenen parametreleri kullanarak deney tasarımı yapılmış ve sonlu elemanlar metodu ile tasarım parametreleri analiz edilmiştir. Kompakt, hafif, dayanıklı bir bir eyleyicinin modellenmesi için Nöro-regresyon yaklaşımı kullanılmıştır. Regresyon analizi yapıldıktan sonra rodun ağırlığını ve von Mises gerilimini optimize etmek için birçok senaryo oluşturulmuştur. Hidrolik aktüatörün rodunun tasarımı ve optimizasyonu Diferansiyel Evrim (Gelişim), Nelder-Mead, Rastgele Arama ve Benzetilmiş Tavlama algoritmaları kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Modelin ve optimizasyon algoritmalarının güvenilir ve probleme uygulanabilir olduğu sonucuna varılmıştır
Interdisciplinary Aspect of Sociological Knowledge in the Field of Architecture: the Conflict Analysis of İzmir Kültürpark
No full textKent, kamusal alanları ile birlikte ''çatışma'' ve ''uzlaşma'' dinamiklerinin oluşturduğu zemin içerisinde sürekli olarak değişim halindedir. Kamusal Mücadeleler bu etkileşimleri şekillendirerek görünür kılmakta, kente yönelik hakkı desteklekleyerek sosyal etkileşim paltformlarını oluşturmaktadır. Bu doğrultuda, kamusal mücadelelerin çözümsüzlük algısına karşılık çatışma kavramı; temel olarak karşıt aktörlerin uyumsuz hedeflerini temsil eden, toplumun doğal ve kaçınılmaz bir parçasıdır. Tarihsel süreç içerisinde kavram teorik olarak incelenmiş, mekanın bilgi alanı ve kentsel hegemonya sorgusu içerisine dahil olmuş; statik toplum algısına karşılık ''toplumsal değişimin itici gücü'' olması ile pozitif işlevleri de tanımlanmıştır. Bu noktada, çatışmanın sadece bölücü bir güç olarak düşünülmesi ise, ortak değerler ve uzlaşı inşası için gerekli bir adımın atlanılması anlamına gelmektedir. Bu doğrultuda tez çalışması, ''sosyal çatışma kuramı'' altlığı ile, '''çatışma alanlarının'' ''kamusal alan'' ve ''kent hakkı'' bağlamındaki pozitif çıktılarını ortaya çıkarmayı amaçlamakta, İzmir Kültürpark'ın 34 yıldır süregelen kentsel hak talebi üzerinden örneklem araştırmasını yürüterek, çatışmanın mekansal pratikler ve kentsel mücadeleler ile olan ilişkisini araştırmaktadır. Disiplinler arası bilimsel yöntemlerin senteziyle mekânın ve çatışmanın bilgisini ele alırken, teori ve pratiğin birleşik zemini içinde çözümlemektedir. Tez kapsamında; sosyal kuram temelli bir analizin, Kültürpark'ın bugünkü ve gelecekteki somut tezahürleri üzerine potansiyel bir yöntemsel çerçeve sunup sunmadığı sorgulamıştır. Bu amaç doğrultusunda çalışmanın teorik zemini Sosyal Çatışma Kuramı, Kentsel Hegemonyalar, Kamusal Alan, ve Kent Hakkı literatürü üzerine kurulmuştur. Pratik zemin Bartos ve Wehr'in ''çatışma haritama yöntemi'' aracılığı ile İzmir Kültürpark'ın mekansal çatışma analizini gerçekleştirmiştir. Bu doğrultuda tez çalışması, ''sosyal çatışma kuramı'' altlığı ile, '''çatışma alanlarının'' ''kamusal alan'' ve ''kent hakkı'' bağlamındaki pozitif çıktılarını ortaya çıkarmayı amaçlamakta, İzmir Kültürpark'ın 34 yıldır süregelen kentsel hak talebi üzerinden örneklem araştırmasını yürüterek, çatışmanın mekansal pratikler ve kentsel mücadeleler ile olan ilişkisini araştırmaktadır. Disiplinler arası bilimsel yöntemlerin senteziyle mekânın ve çatışmanın bilgisini ele alırken, teori ve pratiğin birleşik zemini içinde çözümlemektedir. Tez kapsamında; temel kaygısı ile sosyal kuram temelli bir analizin, Kültürpark'ın bugünkü ve gelecekteki somut tezahürleri üzerine potansiyel bir yöntemsel çerçeve sunup sunmadığı sorgulamıştır. Bu amaç doğrultusunda çalışmanın teorik zemini Sosyal Çatışma Kuramı, Kentsel Hegemonyalar, Kamusal Alan, ve Kent Hakkı literatürü üzerine kurulmuştur. Pratik zemin Bartos ve Wehr'in ''çatışma haritama yöntemi'' aracılığı ile İzmir Kültürpark'ın mekansal çatışma analizini gerçekleştirmiştir.City, with public spaces, is in a constant state of change through the dynamics of ''conflict'' and ''consensus.'' The public struggles shape and make visible these interactions, supporting urban rights and creating platforms for social interaction. Thus, conflict inherently represents the incompatible goals of opposing actors and is a natural and inevitable part of society. The concept has been theoretically examined throughout history, including the inquiry of urban hegemony and the knowledge of space, with defined positive functions as the ''driving force of social change,'' in contrast to society's static perception. Hence, considering the conflict as a dividing force overlooks the crucial step of establishing common interests and consensus. In this direction, the thesis aims to reveal the positive outcomes of ''conflictual areas'' in the context of ''public space'' and ''right to the city'' with the ''social conflict theory,'' and investigates the relationship of conflict with spatial practices and urban struggles by conducting a case study on the 34-year-long urban right demand of İzmir Kültürpark. Through the synthesis of interdisciplinary scientific methods, it analyzes the knowledge of space and conflict within the unified ground of theory and practice. Its main concern is to question whether social theory-based analysis offers a potential methodological framework for the present and future manifestations of Kültürpark. Consequently, the theoretical ground is based on the literature on Social Conflict Theory, Urban Hegemonies, Public Space, and the Right to the City. The practical ground consists of a spatial conflict analysis of İzmir Kültürpark through Bartos and Wehr's ''conflict mapping'' method
Contributory Roles of Concentration and Ph in Caco3 Growth Inhibition for Submicron Particles Synthesis With Additive Ca2+
No full textExcessive growth of CaCO3 precipitates is inhibited by additive Ca2+. Here, we report the influence of concentration and solution pH on the extent of growth inhibition. Equal volumes of equimolar CaCl2 and Na2CO3 solutions were mixed and continuously dispersed in Ca(OH)2 solution, where Ca2+ irreversibly adsorb on the precipitates. Compared to conditions where additive Ca2+ are absent, this method can produce more than 90% decrease in particle size. We observe the degree of growth inhibition increases as the concentration of additive Ca2+, relative to the volume of precipitates, increases. An unusual role of pH is also revealed: growth inhibition that leads to the synthesis of monodisperse submicron CaCO3 particles is only observed in high alkaline pH conditions. Additive Ca2+ adsorb on CaCO3 precipitates in pH conditions above the isoelectric point (pH ≈ 9), but their ability to limit CaCO3 growth diminishes when pH 12. © 2024 Elsevier B.V
Tacit Racism Toward Roma Students: the Case of a Turkish Public School
No full textThis study aims to reveal hidden racist practices within a Turkish public school and explores their perpetuation through daily interactions between teachers and Roma students. As part of an applied research project dedicated to empowering Roma children in the educational setting, the study employs discourse analysis to expose tacit racist discourses circulating within the school. Using participant observation, casual conversations, in-depth interviews, and focus group discussions, the research reveals implicit discriminatory practices in classrooms. Teacher interviews expose a prevalent coping mechanism, i.e., denial, which reflects reluctance to acknowledge their role in perpetuating discrimination despite awareness of the structural inequalities faced by Roma students. While comprehending systemic challenges, the adherence of the teachers to the myth of meritocracy fosters cognitive dissonance, which results in a dismissive incomprehension of the realities of and occasional assignment of blame to Roma students. Cultural stereotypes and pseudogenetic explanations function as convenient means of rationalizing existing biases. Navigating cognitive dissonance, teachers frequently redirect their focus toward the behaviors of Roma people due to a sense of helplessness and the influence of the pervasive meritocratic narrative. This dynamic contributes to the perpetuation of institutional racism through the daily discourse of teachers, which inadvertently exacerbates this systemic issue
Advances in Nanocomposite Membranes for CO2 Removal
No full textNanocomposite membranes have emerged as a promising solution for efficient carbon dioxide (CO2) removal in gas separation processes. These membranes combine polymeric matrices with inorganic nanofillers to synergize the excellent separation performance of inorganic materials with the mechanical stability of polymers. The choice of nanofillers, such as porous and nonporous materials, significantly influences the gas permeability and selectivity of the resulting nanocomposite membranes. Porous fillers with interstitial channels and large surface areas are found to selectively adsorb CO2, enhancing membrane separation performance. On the other hand, nonporous fillers alter the polymer chain orientation, influencing gas separation differently. The 1D, 2D, and 3D morphologies of nanofillers offer unique properties in terms of surface-to-volume ratio, permeability, and selectivity. The fabrication of nanocomposite membranes also plays a crucial role, and advances in materials and manufacturing techniques have enabled the design of high-performing membranes. Asymmetric and symmetric configurations have been explored to optimize separation efficiency. Nevertheless, challenges such as aging, compaction, and swelling need to be addressed to ensure the long-term stability of nanocomposite membranes. Future research should focus on developing advanced theoretical models to better predict gas permeation behaviors in these membranes. Overall, nanocomposite membranes offer a promising avenue for efficient CO2 removal, contributing to sustainable environmental practices and energy production. © 2024 Elsevier Ltd. All rights reserved
Synthesis of Quinone-Based Porous Organic Polymers and Their Usage in Aqueous Zinc-Ion Batteries
No full textSulu çinko iyon piller (SÇİP'ler) güncel olarak enerji depolama alanında potansiyeli yüksek ve gelişime açık piller arasında yer almaktadır. Özellikle şebeke ölçekli uygulamalar için, diğer metal-iyon bataryalara göre SÇİP'lerin potansiyeli yüksek enerji yoğunluğuna sahip olmaları, doğadaki çinko metalinin bolluğu, güvenlikli yapıları ve uygun fiyatlı olmaları gibi birçok parametreye bağlıdır. Sulu çinko-iyon pillerin yüksek ölçekli uygulamalarda kullanılamamalarının en önemli sebebi yüksek performans gösteren katot malzemelerinin tasarımının kısıtlı olmasıdır. Gözenekli organik polimerler (GOP'lar), ayarlanabilir gözenek yapıları, yüksek yüzey alanlarına sahip olmaları ve işlevselleştirilebilir olmalarıyla, son yıllarda SÇİP'ler için katot malzemesi olarak geliştirilen bir polimer sınıfıdır. Bu çalışmada sulu çinko iyon pillerde katot malzemesi olarak elektrokimyasal performansı incelenmek için redoks aktif özellik gösteren kinon bazlı iki farklı polimer tasarlanmış ve sentezlenmiştir. Bu çalışmanın amacı, polimerlere redoks aktif özellik katan kinon gruplarının polimer üzerinde konumlanma pozisyonlarının elektrokimyasal performanslarına nasıl etki ettiğinin incelenmesidir. Bu bağlamda redoks-aktif kinon gruplarının para ve orto pozisyonlarında bağlandığı iki farklı polimer tasarlanıp sentezlenmiştir. Bu polimerlerin karakterizasyonları gerçekleştirilmiş ve temel elektrokimyasal testleri yapılmıştır. Her iki polimerin de geri dönüşümlü Zn2+ difüzyon mekanizmasını incelemek için farklı tarama hızlarında döngüsel voltametre (CV) analizi gerçekleştirilmiştir. Polimerlerin yük depolama kapasitelerini ölçmek için farklı akım yoğunluklarında Galvanostatik şarj/deşarj döngüleri incelendi. p-rGOP 0.1 A g-1 da 1.7 mAh g-1 deşarj kapasitesi göstermiş olup, o-rGOP ise aynı akım yoğunluğunda 1.2 mAh g-1 deşarj kapasitesi göstermiştir. Bu sonuçlar her iki polimerin de SÇİP'lerde kullanılmak için uygun katot malzemeleri olmadığı göstermektedir. Bu nedenle sentezlenen polimerlerin ileriki çalışmalarda diğer metal-iyon pillerde katot malzemesi olarak test edilmesi planlanmaktadır.Aqueous zinc-ion batteries (AZIBs) have great potential to gain a place in energy storage. Their high energy density, safety, cost-effectiveness, and natural abundance of zinc metal are why they are considered a promising battery technology over other metalion batteries. Designing high-performance cathode materials is the main challenge of AZIBs for large-scale applications. Porous organic polymers (POPs) are the newly developing cathode materials for AZIBs due to their high surface area, tunable pore structure, and functionalization. In this study, different quinone-functionalized redoxactive organic polymers were designed and synthesized to examine their electrochemical properties in AZIBs. The main purpose of this study is to investigate the effect of the redox-active pendant group (quinone for this work) positions on the electrochemical performance. Two redox-active polymers were synthesized in this context, and quinone groups were placed in para (p-rPOP) and ortho (o-rPOP) positions. Polymers were characterized, and electrochemical tests were performed. Cyclic voltammetry (CV) tests were collected at different scan rates for both polymers to prove the reversibility of Zn2+ ion insertion. Galvanostatic charge/discharge curves gave information about the charge storage capacity of redox-active organic.polymers. However, both polymers showed low electrochemical performance as cathode materials in AZIBs. o-rPOP and p-rPOP revealed the discharge capacity of 1.2 mAh g-1 and 1.7 mAh g-1 at a current density of 0.1 A g-1, respectively. These findings suggest that these polymers may not be suitable for use as cathodes in aqueous zinc-ion batteries. Therefore, it is planned to test them in different organic metal-ion batteries in future studies
Machinability Investigation on Cnc Milling of Recycled Short Carbon Fiber Reinforced Magnesium Matrix Composites
No full textThis study investigates the machinability of magnesium matrix composites reinforced with short carbon fibers, which represent novel materials in the field. AZ91 alloy and its composites containing 2.5 and 5 wt% recycled carbon fiber (rCF) reinforcements were used as workpieces. Face milling was conducted using uncoated carbide cutting tools under dry cutting conditions with varied cutting speeds (480-560-640 m min(-1)) and feed rates (0.65-0.8-0.95 mm min(-1)). The experimental design was based on the Taguchi L-9 (3(3)) orthogonal array. Analysis included cutting forces, surface roughness, wear on cutting inserts, and chip morphology to assess machinability. Taguchi, analysis of variance, and regression methods were employed to analyze cutting force and surface roughness results. Findings indicated satisfactory machinability for AZ91 alloy and comparatively poorer performance for the 5 wt% rCF reinforced composite, with increased reinforcement content correlating with higher cutting force and surface roughness. SEM and EDX analyses revealed significant built-up layer formation on cutting inserts, with predominantly spiral-shaped continuous chips observed in the experiments. Overall, the study affirmed the machinability of the composites and identified suitable cutting parameters for further investigations
Advancing Titanium-Based Surfaces Via Micro-Arc Oxidation With Solid Substance Incorporation: a Systematic Review
No full textDespite possessing numerous superior properties, titanium, and its alloys exhibit inadequacies in terms of tribocorrosion, bioactivity, and antimicrobial characteristics. In recent years, there has been a rapid increase in research focusing on micro-arc oxidation (MAO) surface treatments to enhance these properties. In the traditional MAO approach, researchers commonly investigate the introduction of additional functionalities to the surface through ion doping. However, over the past decade, studies have indicated that the inclusion of solid substances, either as substitutes for or in conjunction with ion doping, can provide further advantages in terms of multifunctionality. Therefore, this review comprehensively and systematically examines the characteristics of solid substances used during MAO, their incorporation mechanisms, and their influence on resulting biological and degradation behaviors, as well as properties such as photocatalytic activity, magnetic features, hightemperature oxidation resistance, electrical insulation, and thermal shock resistance. This review showed that the integration of solid substances during MAO represents a promising avenue for achieving multifunctional surface enhancements in titanium and its alloys. This review highlights the diverse range of properties and behaviors influenced by these solid substances, offering insights for future research and applications in the field of surface engineering and biomaterials science
The Effect of Co-Delivery of Oxygen and Anticancer Drugs on the Viability of Healthy and Cancer Cells Under Normoxic and Hypoxic Conditions
No full textHypoxia, cancer, tissue damage, and acidic pH conditions are interrelated, as chronic hypoxic conditions enhance the malignant phenotype of cancer cells, causing more aggressive tissue destruction, and hypoxic cells rely on anaerobic glycolysis, leading to the accumulation of lactic acid. Therefore, the administration of oxygen is necessary to support the functions of healthy cells until the formation of new blood vessels and to increase the oxygen supply to cancerous tissues to improve the efficacy of antitumor drugs on tumor cells. In addition to O2 supply, pH-dependent delivery of anticancer drugs is desired to target cancer cells and reduce drug side effects on healthy cells. However, the simultaneous delivery of O2 and pH-dependent anticancer drugs via nanomaterials and their effects on the viability of normal and cancer cells under hypoxic conditions have not been studied in sufficient numbers. This study describes the synthesis of a pH-responsive nanomaterial containing oxygen and anticancer drugs that exhibits sustained O2 release over a 14 d period under hypoxic conditions and pH-dependent sustained release of anticancer drugs over 30 d. The simultaneous administration of O2 and anticancer drugs results in higher cell survival of normal cells than that of cancer cells under hypoxic and normoxic conditions. The synthesis of pH-sensitive perfluorocarbon-based nanomaterials containing oxygen and anticancer drugs is reported. These nanomaterials provide oxygen release within 14 d and pH-dependent sustained release of anticancer drugs over 30 d. Co-delivery of oxygen and anticancer drugs by pH-sensitive nanomaterials promotes the viability of healthy cells compared to malignant cells under hypoxic conditions. imag