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The impact of educational setting :a study of the English passive in German EFL and CLIL learners
No full textEncouraged by European and national policies, Content and Language Integrated Learning (CLIL) has been on a steady rise over the past decades. Research results uniformly suggest that CLIL benefits L2 acquisition, even though CLIL strands have frequently been reported to be selective with respect to learner variables such as intelligence and motivation. Combining learner corpus research (LCR) with second language acquisition (SLA) methodologies, the present study analyses how much of the perceived success of CLIL programmes is due to CLIL itself, and how much is triggered by selectivity. In an L2 database compiled for this purpose, we link the Secondary-Level Corpus of Learner English (SCooLE), a learner corpus of about 250,000 tokens, with experimental data and data on more than fifty learner variables collected by means of a learner profile questionnaire and psychometric tests. Being a prime example of the lexis-grammar interface in L2 acquisition, the English passive is the focus of our comparison of data from CLIL and non-CLIL settings. Occurring most frequently in scientific writing, we assume that the passive is more prevalent in CLIL materials, which cover the social and natural sciences, than in EFL (English as a Foreign Language) materials. An analysis of the Teaching Materials Corpus (TeaMC) reveals that this is indeed the case. Moreover, CLIL materials comprise fewer non-central passives, i.e. passives displaying adjectival features. We therefore expect to find both quantitative and qualitative differences in passive constructions produced by CLIL and non-CLIL learners. An analysis conducted in the framework of Contrastive Interlanguage Analysis (CIA) reveals that CLIL participants produce a greater number of passives as well as a lower proportion of non-central and erroneous passives, thus making their texts more target-like. By means of multiple regression modelling, we assess the role of CLIL as opposed to its selectivity. Results show that CLIL makes a significant contribution to L2 acquisition, although the selectivity of the system plays a greater part in explaining variability. Experimental data yields similar, but even clearer results. We conclude that, even though CLIL is selective, it is beneficial to the acquisition of the English passive.(LALE - Langues et lettres) -- UCL, 2016Accès restreint09/03/2016(LALE - Langues et lettres) -- UCL, 2016Anglai
Pipe pile driving into rock
No full textImpact driving technique is commonly used in offshore environments to install pipe piles. This technique consists in striking the pile head with a hammer to reach the required installation depth. The quest for offshore wind energy demands that pipe pile foundations be installed in increasingly challenging geotechnical conditions. To reach final installation depth, the pile has now to be driven through very dense soil with high resistance and even into rock layers. This increases the difficulty of pile driving while avoiding its damage during hammering. The objective of this thesis is to portray stresses in a pipe pile during driving into rock layer and to assess the structural integrity of the pile toe. An analytical approach has been attempted first to solve the problem for the static case. On one hand, an original analytical solution of a pipe pile subjected to non-axial static loading has been developed based on the Airy stress function. This solution gave results approaching those of Boussinesq’s plane strain solution for the case of large diameters. On the other hand, two novel closed-form solutions for cylindrical and spherical cavity expansion in a rock mass governed by a particular case of the Hoek-Brown yield criterion were developed and validated numerically. Two numerical methods were implemented to simulate dynamic pipe pile driving into rock: the Lagrangian method consisting in an axisymmetric modelling based on the “zipper type” technique and the Coupled Eulerian Lagrangian method (CEL-3D). Stresses in tubular piles during impact driving were evaluated, allowing the structural integrity of the pile toe to be assessed. To validate the proposed numerical models, a 1g reduced scale model was built, featuring different synthetic rock resistances. The developed experimental model is able to simulate pipe pile driving into rock. Comparison between numerical simulations (CEL-3D) and experimental tests showed similar results in terms of strains at the pile toe level. Based on numerical simulations and experimental results, the following conclusions can be drawn: • The power form of the Extended Drucker-Prager yield criterion can emulate the mechanical behaviour of rock mass governed by the Hoek-Brown yield criterion. • The “zipper-type” technique is applicable to quasi-static cone penetration into dense sand and fully coring penetration of pipe pile undergoing driving. • Pipe pile driving into good quality rock mass (σc>20 MPa) entails a significant risk of damaging the pile toe; the use of high steel grade is recommended.(FSA - Sciences de l'ingénieur) -- UCL, 2016Accès embargo21/01/2016(FSA - Sciences de l'ingénieur) -- UCL, 2016Anglai
An experimental study of volcanic ash chemical reactivity :implications for atmospheric trace chemistry and ocean iron biogeochemistry
No full textVolcanic ash from explosive eruptions is increasingly recognised as an environmental agent, yet knowledge is limited on what controls ash reactivity within atmospheric, aquatic or terrestrial systems. Reactivity is likely driven primarily by interactions at the solid-fluid interface, but the chemical properties of the ash surface which mediate these interactions are poorly understood. Relatedly, the capacity of ash emissions to impact the atmospheric trace gas budget by providing reactive surfaces has not been quantified. Further, ash deposition to the ocean is capable of affecting marine primary production by supplying iron, but factors determining ash iron solubility have yet to be elucidated. The doctoral study sheds light on these issues through experimental investigation. Probe gas uptake measurements reveal varying densities of acid-base and redox surface sites on ash. Ash surface chemistry, originally defined by magma composition and mineralogy and subsequently modified by interaction with volcanic gases and condensates during eruption, in turn influences ash reactivity towards sulphur dioxide and ozone gas. Iron mobilisation from ash is initially governed by surface characteristics imparted by plume processing and later reflects dissolution of bulk glass and crystalline components. Interaction with water and acid gases during eruption and exposure to pH fluctuations during transport can significantly affect iron solubility and speciation in airborne ash. Our findings suggest that a combination of magmatic, eruptive and atmospheric factors underlie ash chemical reactivity. By providing new insight on the role of ash as a chemical agent in the atmospheric and oceanic environments, this work contributes to better understanding the potential impacts of explosive eruptions on the Earth System.(AGRO - Sciences agronomiques et ingénierie biologique) -- UCL, 2016Accès interdit19/01/2016(AGRO - Sciences agronomiques et ingénierie biologique) -- UCL, 2016Anglai
Prenatal modulation of the developing lung in congenital diaphragmatic hernia: functional, morphological, and biological consequences for the neonatal lung
No full textINTRODUCTION. Congenital diaphragmatic hernia (CDH) combines a congenital malformation of the diaphragm with lung hypoplasia, leading to severe respiratory distress and intractable pulmonary hypertension of the newborn. Despite advances in prenatal diagnosis and neonatal intensive care, CDH is associated with high mortality and devastating morbidities. In the absence of curative treatment, numerous prenatal therapies have been used experimentally with varying success. So far, only fetal tracheal occlusion has been tested in clinical trials, but the consequences for the human lung are poorly known. AIMS. To further characterize the rabbit model of CDH, which was subsequently used to assess the effects of prenatal therapies on airway and pulmonary vascular development, including tracheal occlusion, and two novel approaches, perfluorooctylbromide and an activator of soluble guanylate cyclase (BAY 41–2272), which were given through tracheal instillation.METHODS. After a diaphragmatic incision during the pseudoglandular stage, fetal rabbits were randomized against placebo/sham operation during the saccular stage for tracheal occlusion, perfluorocarbon or BAY 41–2272. At term operated fetuses and controls were subject to evaluation of lung mechanics and/or hemodynamics as well as postmortem lung analyses. Human fetal and neonatal lung tissue, including controls and CDH with tracheal occlusion or expectant management, was analyzed histologically and biochemically.RESULTS. The rabbit model of CDH was characterized by reduced lung volumes and impaired compliance, disorders of elastin deposition within alveolar walls, and downregulation of elastogenesis-related genes. Moreover, this model reproduced features of pulmonary hypertension, including high right ventricular pressure and level of N-terminal-pro-B type natriuretic peptide, remodeling of pulmonary arterioles, decreased alveolar capillary density, and downregulation of vasodilation-related genes. In the rabbit model, lung distension caused by tracheal occlusion improved alveolar formation and elastogenesis, yet without correction of lung mechanical parameters. Tracheal occlusion increased also the expression of other extracellular matrix components, which reflected myofibroblast activity, and reduced the transcription of surfactant-associated proteins. Human neonatal lungs exposed to fetal tracheal occlusion displayed alveolar deposits of collagen and myofibroblasts. In human CDH as well as in the rabbit model of CDH, tracheal occlusion enhanced the pulmonary expression of transforming growth factor-β (TGFβ) and Rho kinase−associated proteins to the detriment of activation of SMAD2/3, which is normally detected in human lungs with advancing gestation. As an alternative to tracheal occlusion, pulmonary distension by perfluorocarbon in the fetal rabbit model of CDH improved lung mechanics and alveolar elastogenesis without transcriptional changes in extracellular matrix, surfactant protein genes or TGFβ. Finally, intratracheal instillation of BAY 41–2272 in the rabbit fetuses with CDH improved hemodynamics, reduced medial hypertrophy of pulmonary arterioles, and increased capillary bed formation by stimulating endothelial cell proliferation.CONCLUSIONS. In the fetal rabbit model of CDH, poor lung function after tracheal occlusion is compatible with activation of TGFβ and imbalance in extracellular matrix and epithelial homeostasis. In human CDH newborns treated by fetal tracheal occlusion, changes in the pulmonary interstitium and impaired TGFβ signaling raise the question of disturbances of postnatal lung development induced by tracheal occlusion. As potential alternatives to tracheal occlusion, prenatal perfluorocarbon improves lung hypoplasia, whereas prenatal BAY 41–2272 attenuates pulmonary hypertension.Doctorat en Sciences médicales (Médecine)info:eu-repo/semantics/nonPublishe
L'onde, la preuve et le militant: L'écosophie de Félix Guattari à l'épreuve de l'électrosensibilité et de la polémique sur les dangers des ondes électromagnétiques
No full textLes ondes électromagnétiques utilisées pour la téléphonie mobile, le WiFi ou encore le Bluetooth sont-elles nocives pour la santé et l’environnement ? La polémique fait rage entre ceux qui considèrent qu’il n’y a aucune raison de s’inquiéter, et qu’il n’est donc pas nécessaire de légiférer à ce sujet, et ceux qui voient de vrais faisceaux de preuves à propos de la dangerosité de ces ondes. Les militants contre celles-ci soulèvent des risques, des doutes ou même des certitudes sur leurs dangers sanitaires, mais aussi sociaux, environnementaux et même mentaux. Au cœur de la polémique, les malades des ondes, les électrosensibles, ont une place particulière :eux souffrent déjà des ondes et sont donc une vraie preuve de ce danger, leur corps est l’inscription de ce danger. À l’aide des outils conceptuels développés par le philosophe Félix Guattari, ce travail déploie cette controverse à travers ces multiples composantes. La thèse explore l’électrosensibilité comme une maladie relative à un milieu et à une époque, en décrivant les épreuves que les malades et les militants subissent.Doctorat en Philosophieinfo:eu-repo/semantics/nonPublishe
Silicon nanostructures and coplanar waveguides for biosensors
No full textThe biosensors market had a considerable development in the last decade and is expected to increase at a quick pace in the coming years. The driving force behind this important expansion is a constant need to improve the current methods for environmental monitoring and for rapid pathogen detection. Mainly destined to point-of-care devices, biosensors are spreading through home diagnostics, bio-defense, and food industry. This high demand pushes for the development of new and more precise devices. Two fundamentally different types of sensing devices were built and studied in this work. Both types of devices were engineered using conventional micro- and nano-fabrication techniques in order to allow for a quick integration with electronic circuits. The first type is based on silicon nanowires (SiNWs) and the devices function similarly to field effect transistors. The full manufacturing protocol, which results in nanowires with trapezoidal shape, is carefully described. The effect of surface modification with (3-aminopropyl)triethoxysilane (APTES), on the electrical properties of the devices, was studied. Important changes in the threshold voltage and the subthreshold slope were observed between the as-fabricated devices and the APTES-conditioned ones. Furthermore, we show that the APTES significantly improves the stability of the SiNWs compared with more conventional micro-devices. The detection of proteins was studied with these SiNWs-based sensors. The second type of devices is based on coplanar waveguides and their functioning resembles that of capacitive sensors. These devices sense the change in the dielectric properties of the surrounding media and their use for the dielectric characterization of various materials is presented first. Subsequently, we employed these devices, operating in the radio-frequency range, in conjunction with gravitational sedimentation to develop a novel colloid-based biosensing method. This technique, in which the settling of bio-functionalized polystyrene beads clusters is monitored, was applied to the detection of proteins.(FSA - Sciences de l'ingénieur) -- UCL, 2016Accès restreint08/04/2016(FSA - Sciences de l'ingénieur) -- UCL, 2016Anglai
Discovering a new pathway involved in methionine repair in the bacterial envelope
No full textThe reactive species of oxygen (ROS) and chlorine (RCS) damage cellular components, potentially leading to cell death. In proteins, the sulfur-containing amino acid methionine (Met) is converted to methionine sulfoxide (Met-O), which can cause a loss of biological activity. To rescue proteins with Met-O residues, cells express methionine sulfoxide reductases (Msrs) in most subcellular compartments, including the cytosol, mitochondria and chloroplasts. However, no Msr had been identified in the periplasm of important human pathogens, including Escherichia coli, Salmonella Typhimurium and Pseudomonas aeruginosa. This was surprising as the periplasm is in immediate contact with the environment, and therefore particularly exposed to the toxic ROS and RCS generated by the host cells. During my thesis, I discovered and characterized, in collaboration with Benjamin Ezraty, a senior scientist in the lab of Frédéric Barras (CNRS), a new reducing enzymatic system rescuing periplasmic proteins from methionine oxidation. This system, which we named MsrPQ, is widely conserved throughout Gram-negative bacteria and protects proteins present in the bacterial cell envelope from bleach stress. The characterization of the MsrPQ system led to a number of major findings. First, we showed that the MsrPQ system reduces Met-O residues by uniquely involving a molybdopterin-based chemical mechanism. Second, we found that MsrPQ is able to reduce both the S and R isoforms of Met-O, unlike the other enzymes able to repair Met-O residues. Thus, MsrPQ is the first non-stereospecific Msr system identified. Third, by combining proteomics and bacterial genetics, we showed that MsrPQ is able to repair a wide range of periplasmic proteins, including the primary periplasmic chaperone SurA and the lipoprotein Pal. These results are consistent with the fact that MsrPQ is required to maintain the integrity of the envelope under bleach stress. Finally, we provided evidence that the reducing equivalents used by MsrPQ to reduce Met-O residues originate from the respiratory chain, revealing a novel connection between cellular metabolism and protein quality control.(BIFA - Sciences biomédicales et pharmaceutiques) -- UCL, 2016Accès interdit15/04/2016(BIFA - Sciences biomédicales et pharmaceutiques) -- UCL, 2016Anglai
Evidencing land cover dynamics and tropical forest seasonality :the benefit of 13 years of daily global observation (SPOT-VEGETATION)
Full text linkFacing environmental issues in a global change context requires improving our knowledge about the land surface and its dynamics. Today, the accumulation of satellite time series at moderate resolution constitutes unique datasets to monitor Earth’s surface evolution on each squared km. The ambition of this thesis was to exploit the multispectral reflectance variability as observed by the SPOT-VEGETATION time series (1999-2011) to characterize land surface dynamics at multi-annual and seasonal scales. Because of their single year strategy, current global land cover maps are sensitive to temporary events and to year-to-year variation related to meteorological and phenology change. An innovative land cover mapping approach takes advantage of the long time series to derive a multi-year global land cover map. This was found efficient to reduce the sensitivity to the observation period found in all global annual maps. In addition, a change detection method capitalizes on the land cover trajectories over the whole time series to highlight forest, cropland, grassland, bare area, urban area and water losses and gains. It provides for the first time a complete portrait of the Earth’s land surface transformations systematically described by the year of change and the land cover transition. At seasonal scale, vegetation phenology of tropical rainforest is prone to a large debate about the ability of remote sensing to monitor any vegetation cycle due to atmospheric contamination and more recently viewing and illumination geometry variation. Capitalizing on the 13-y reflectance values, this thesis proves that the seasonal dynamics of appropriate vegetation index are driven by leaf phenological events, themselves responding to light availability in order to enhance photosynthetic gain, in both Amazon and Congo basins.(AGRO - Sciences agronomiques et ingénierie biologique) -- UCL, 2016Accès libre18/02/2016(AGRO - Sciences agronomiques et ingénierie biologique) -- UCL, 2016Anglai
Influence of copper nutrition on alfalfa cell wall differentiation through a proteomic approach
No full textPlant cells are surrounded by a rigid frame, the so-called cell wall, which restricts cell expansion. The cell wall is a dynamic structure that provides the structural strength needed to allow upright growth of the plant and confers resistance to pathogens. In this thesis, the first objective is to disentangle the dynamism of the plant cell wall by a core proteomics study. This approach, which combines both gel-based and gel-free methods, is supported by a panel of molecular techniques among which fibre characterization, mineral analysis and targeted gene expression profiling. Since cell wall development and remodelling relies on cellular and extracellular processes, the classical total proteome analysis is complemented by a focused study of the cell wall proteome. These studies indicate that the stem cell wall has an active and highly adaptive metabolism which constantly evolves and recycles during development. Each stage of maturity has a unique cellular and extracellular protein profile. As second objective, we identify, using the same techniques, the effects of fertilisation with micronutrients on alfalfa stem development to assess if microelement application, especially copper, drives significant changes in the plant stem metabolism. Our results support the fact that copper application elicits general pathways of plant resistance and may prolong the juvenile status of the stem. However, a combined application of copper and zinc is detrimental for plant growth. Altogether this thesis provides an integrated overview of the molecular mechanisms occurring at the cellular and the extracellular level, and which are modulated with maturity and mineral availability.(AGRO - Sciences agronomiques et ingénierie biologique) -- UCL, 2016Accès restreint22/01/2016(AGRO - Sciences agronomiques et ingénierie biologique) -- UCL, 2016Anglai
Etude des effets d’un courant électrique pulsé de basses fréquences sur les kératinocytes humains
No full textCes dernières décennies, les populations, civiles en général et professionnelles en particulier, ont été soumises à une exposition croissante aux champs électriques (EF) et magnétiques (MF) d'extrêmement basses fréquences (ELF). Différentes réponses biologiques ont été observées sur différents types de cellules et de tissus exposés à des courants et des champs ELF. Ces études permettent une meilleure connaissance de notre environnement électromagnétique mais les mécanismes biologiques précis et les implications des fréquences ELF sur la santé restent peu connus. Il est nécessaire de développer des protocoles de recherche pour répondre à ces questions. La revue exhaustive de la littérature met clairement en avant :- le manque de connaissance des mécanismes cellulaires activés après stimulation ELF;- l'importance de leur étude pour toutes recherches liées à l'utilisation de la stimulation ELF;- l'efficacité des techniques omiques qui permettent l'identification de ces mécanismes cellulaires;- l'importance du choix des modèles expérimentaux utilisés afin de faciliter l'extrapolation des résultats chez l'homme.Pour répondre à ces observations, nous avons recherché les gènes et les mécanismes cellulaires impliqués lors de la stimulation ELF sur un modèle de culture d'explants de kératinocytes humains mis en culture sur support dermique dévitalisé et stimulé par un courant électrique pulsé. Nous pensons que la recherche sur un modèle humain in vitro permet d'obtenir des résultats plus intéressants pouvant être extrapolés plus facilement aux études épidémiologiques ou cliniques.Les résultats préliminaires obtenus sur ce modèle de culture par Hinsenkamp et al. aboutissent à la même conclusion que leurs études des effets des champs sur le tissu osseux. Ils ont observés à partir de différents modèles, une maturation plus rapide de la matrice cartilagineuse associée à une accélération de l'ossification des tissus embryonnaires. Les analyses microarrays ont été réalisées sur 288 explants d'épiderme provenant de 3 cultures cellulaires indépendantes utilisant l'épiderme de 3 sujets différents. La première analyse des résultats montre que, pour un certain nombre de sondes, la valeur du taux d'expression est différente lorsque l'on compare deux à deux les conditions d'échantillonnage. Cette observation est valable pour l'évolution naturelle au cours du temps des cultures témoins (J4T/J1T :296 sondes; J7T/J1T :702 sondes; J12T/J1T :1006 sondes) ou des cultures stimulées (J4S/J1T :941 sondes; J7S/J1T :625 sondes; J12S/J1T :946 sondes) ainsi que pour la comparaison d'un temps stimulé à son temps témoin (J4S/J4T :304 sondes; J7S/J7T :220 sondes; J12S/J12T :496 sondes).L'analyse de l'évolution des résultats au cours du temps (comparaison de Jx à J1) pour le groupe témoin et stimulé montre que, si la stimulation augmente ou diminue la régulation de certains gènes par rapport à J1 (témoin), la variation n'est généralement pas suffisante pour statistiquement inverser le sens de la régulation naturellement observée dans le temps. Seuls 3 gènes (EPS8, ADAMTS1, NOS1) ne suivent pas cette règle.De plus, la comparaison des listes de gènes aux 3 temps d'échantillonnage J4, J7 et J12, montre que 3 gènes sont systématiquement exprimés dans les trois groupes stimulés comparés à leur témoin respectif :TXNRD1, ATF3 et MME. Ils sont connus pour jouer un rôle dans la prolifération, la différenciation et la mitose. L'analyse du rôle joué par DKK1 et MACF1 au temps J4 montre que la sur-expression de DKK1 et la sous-expression de MACF1 ont pour effet l'inhibition du "pathway Wnt" ce qui provoque une diminution de la prolifération et une augmentation de la différenciation terminale. Parmi les variations intéressantes, BMP-2 est sur-exprimée au temps J12. Cette protéine est connue pour jouer un rôle important dans l'ostéogenèse, l'angiogenèse et la maturation cellulaire.Une analyse par triangulation montre que la stimulation par un courant ELF pulsé accélère la sur- ou la sous-expression de certains gènes qui, dans des circonstances normales (groupe témoin non stimulé), auraient suivi la même tendance (sur- ou sous-régulation) mais de manière plus lente. Parmi ces gènes, CHEK1, DKK1, NDRG4, SPRR3 sont connus pour jouer un rôle dans la prolifération et la différenciation; UBE2D3 est actif dans la voie de signalisation de la BMP-2; les autres gènes sont actifs dans la mitose, le développement cellulaire et la réplication de l'ADN.Nous avons ensuite utilisé des outils informatiques qui permettent une analyse sans apriori des résultats :L'analyse du graphe orienté acyclique généré par WebGestalt sur base des données de GO a mis en évidence les processus biologiques impliquant les gènes présents dans nos résultats et dont la régulation a été modifiée. Ces gènes ont des fonctions dans les mécanismes du cycle cellulaire, de la mitose, de la prolifération ou de la différenciation. Ces résultats sont cohérents avec les résultats macroscopiques précédents et les premières observations présentées ci-dessus.Pour mettre en évidence les voies de signalisation actives dans les processus biologiques, nous avons utilisé KEGG qui indique que les voies "cycle cellulaire" et "voie de signalisation de p53" utilisent un nombre statistiquement significatif de gènes présents dans nos résultats. Le cycle cellulaire et la mitose sont impliqués dans la prolifération cellulaire. La différenciation a également besoin de cette étape proliférative puisque ce sont les cellules filles qui deviendront des cellules matures. La "voie de signalisation p53" est également active dans le cycle cellulaire, la différenciation, l'apoptose et le maintien de l'intégrité cellulaire. L'analyse des voies connexes à "p53" et à "cycle cellulaire", utilisant des gènes présents dans nos résultats, a mis en avant plusieurs cascades dont certaines utilisent des gènes actuellement connus pour n'avoir de rôle que dans une seule cascade. Ces gènes sont des candidats potentiels à la fonction de marqueur de la stimulation ELF. On y retrouve entre autre FoxO :régulé par JNK (membre des MAPK), actif avec TGF-β1 dans la migration cellulaire et la diminution de l'apoptose; Jak/STAT qui active la voie "cytokine-cytokine receptor interaction" utile lors de la prolifération, différenciation, migration, apoptose et survie cellulaire; Wnt qui régule la prolifération, la différenciation ainsi que la mobilité cellulaire. D'autres voies d'intérêt mais n'utilisant pas de gène ayant une fonction unique ont été listées :PI3K/Akt, en partie régulée par la phosphorylation de FoxO, a une fonction dans la prolifération cellulaire.Les différentes analyses réalisées avec Pathway studio confirment qu'une grande majorité des gènes présents dans nos résultats sont actifs dans les processus de prolifération, différenciation, croissance cellulaire, cycle cellulaire, mitose, apoptose, migration et survie cellulaire. Plusieurs gènes et mécanismes discutés précédemment (ADAMTS1, ATF3, BMP-2, DKK1, DUSP4, MACF1, MME, PDGFRA, SFRP1, TXNRD1, WNT) ont été isolés par le programme. La recherche des mécanismes utilisant les gènes isolés lors de l'analyse par triangulation les relie à la prolifération, la différenciation, l'adhésion cellulaire, la réplication de l'ADN et la mort cellulaire.Pathway Studio nous a permis de localiser dans la cellule les protéines qui devraient finalement être traduites suite à la modification de l'expression de leurs gènes. Cette analyse permet d'étudier les interactions entre l'extérieur et l'intérieur de la cellule ainsi que rechercher les protéines stimulant un grand nombre d'autres protéines ou recevant un grand nombre de stimuli. La protéine extracellulaire Endothelin 1 (ET-1), codée par le gène EDN1, agit sur 9 protéines membranaires différentes :EGFR par l'intermédiaire de la signalisation des MAPK; PDGFRA; GLUT-3 (exprimé à partir du gène SLC2A3); COX-2 (exprimée à partir du gène PTGS2); EP4 (exprimée à partir du gène PTGER4); PLAUR et les gènes IER3, CD44 et IL6ST qui seront traduits en protéines membranaires. Neuregulin 1, codée par le gène NRG1, est la seconde protéine extracellulaire la plus active vers les protéines membranaires différentes. L'analyse des résultats met en évidence 840 interactions entre une protéine extracellulaire et une protéine nucléaire en incluant une protéine membranaire et une protéine cytoplasmique. Les protéines membranaires recevant des informations du plus grand nombre de protéines extracellulaires sont EGFR et FAS. C'est également EGFR, une des voies de signalisation les plus importantes de la régulation de la croissance, la survie, la prolifération et la différenciation cellulaire, qui transmet le plus d'informations aux protéines cytoplasmiques. FAS est capable de réguler l'apoptose et la prolifération en fonction du taux de fixation de son ligand.A l'aide d'un screening par la technique des microarrays de l'expression des gènes réalisé sur des échantillons témoins et stimulés, nous avons :- vérifié la cohérence des résultats avec les études historiques;- mis en évidence les processus biologiques responsables de la réponse cellulaire observée;- isolé une liste de gènes "marqueurs potentiels" impliqués spécifiquement dans ces mécanismes:- vérifié l'hypothèse que la stimulation ELF accélère dans le temps l'apparition de phénomènes qui seraient apparus naturellement mais avec une latence plus longue.Les observations faites dans le cadre de cette étude ont mis en évidence un nombre important d'informations. Plusieurs d'entre elles nécessitent des recherches complémentaires afin de préciser et de confirmer les résultats. Il serait intéressant :- de comparer et de grouper les résultats de la littérature montrant des effets similaires même si la stimulation ou le modèle de culture sont différents;- de développer les techniques de microdosimétrie afin de connaître avec précision la stimulation reçue par la cellule;- de développer l'étude des signaux afin de découvrir la composante active qui déclenche la réaction de la cellule;- de mettre en place un protocole étudiant la voie métabolique Wnt sur des cellules sanguines en incluant un dosage de la β-caténine pour étudier l'effet de la stimulation sur la leucémie infantile. Il faudra vérifier que les gènes exprimés dans nos résultats soient finalement traduits en protéines actives afin de confirmer leur rôle comme marqueurs de la stimulation ELF.Doctorat en Sciences biomédicales et pharmaceutiques (Médecine)info:eu-repo/semantics/nonPublishe