CR Biologies

Michel Delseny

Comptes Rendus
Biologies
Michel Delseny
Innate antiviral immunity in plant apical meristem explained
Volume 343, issue 4 (2020), p. 5-6
Published online: 21 April 2021
https://doi.org/10.5802/crbiol.42
This article is licensed under the
Creative Commons Attribution 4.0 International License.
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Les Comptes Rendus. Biologies sont membres du
Centre Mersenne pour l’édition scientifique ouverte
www.centre-mersenne.org
e-ISSN : 1768-3238
Comptes Rendus
Biologies
2020, 343, n 4, p. 5-6
https://doi.org/10.5802/crbiol.42
News and views / C’est apparu dans la presse
Innate antiviral immunity in plant apical meristem
explained
L’immunité innée antivirale des méristèmes apicaux des plantes
élucidée
Michel Delsenya
a Laboratoire Génome et Développement des Plantes, UMR 5096 CNRS-UPVD,
Université de Perpignan via Domitia, 66860 Perpignan, France.
E-mail: delseny@univ-perp.fr
Keywords. Plant, shoot apical meristem, antiviral immunity, WUSCHEL, protein synthesis.
Mots-clés. Plante, méristème apical caulinaire, immunité anti-virale, WUSCHEL, synthèse protéique.
Manuscript received and accepted 5th February 2021.
Plant shoot apical meristem is free from virus in-
vasion. This old observation allowed regeneration of
virus-free plants by in vitro culture and was at the ori-
gin of the blossoming of floral horticulture [1]. So far,
this phenomenon remained unexplained. Recently, a
gene known for 25 years, WUSCHEL (WUS), has been
shown to be responsible for this trait and the under-
lying mechanisms elucidated [2].
WUS has been isolated from an Arabidopsis
thaliana developmental mutant, with a tousled
phenotype, and codes for a homeodomain tran-
scription factor [3]. This is a major regulatory gene
for the maintenance of stem cells in the meristem
and is part of a signaling regulatory loop involving
auxin. Its expression is restricted to the few cells of
the central zone of the shoot apical meristem [4]. Wu
et al. [2] have observed that, following infection with
the Cucumber Mosaïc Virus (CMV), the virus did not
accumulate in the meristem but in the underneath
tissues, suggesting a role for WUS in limiting infec-
tion. Using knock-out and over-expressing, either
constitutive or dexamethasone-inducible, wus mu-
tants, they nicely demonstrated that WUS is respon-
sible for this antiviral immunity. They next showed
that this effect resulted from a global, non-virus-
specific, decrease in protein synthesis in the WUS
expression zone. By examining the transcriptome
of mock or CMV-infected apices, from plants ec-
topically overexpressing WUS in the whole tissues,
they identified a series of genes involved in protein
synthesis regulation, including several coding for
S-adenosyl- methionine-dependent methyltrans-
ferases (MTases). Six MTase genes are repressed by
WUS and up-regulated in a wus knock-out mutant
and five show a functional WUS DNA-binding motif.
Among these five MTase genes, only two, NOP2A and
ISSN (electronic) : 1768-3238 https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/biologies/
6 Michel Delseny
NOP2B, are expressed in the shoot apical meristem
and their expression is suppressed by infection by
CMV. These two MTases are nucleolar proteins in-
volved in m5 cytosine methylation of 25S ribosomal
RNA (rRNA). Repression of NOP2A and NOP2B by
WUS in the presence of CMV infection results in a
destabilization of pre-rRNA maturation and ribo-
some assembly and, ultimately, in a global inhibition
of protein synthesis, including that of viral proteins
in the shoot apical meristem. This work provides
a molecular explanation of antiviral immunity of
the shoot apical meristem and has already been
extended to other plants and other viruses.
French version
Le méristème apical des plantes est réfractaire à une
infection virale. Cette observation ancienne a per-
mis de régénérer des plantes dépourvues de virus par
culture in vitro d’apex. Elle est la base de l’essor de
l’horticulture florale [1]. Jusqu’à présent ce phéno-
mène restait inexpliqué. Il vient d’être établi qu’un
gène connu depuis près de 25 ans, WUSCHEL (WUS),
en était responsable et son mécanisme d’action a été
élucidé [2].
WUS a été isolé à partir d’un mutant de dévelop-
pement d’Arabidopsis thaliana, d’aspect ébouriffé,
d’où son nom, et code pour un facteur de transcrip-
tion à homéodomaine [3]. Il a été identifié comme un
régulateur majeur du maintien des cellules souches
du méristème apical et fait partie d’une boucle de si-
gnalisation impliquant l’auxine. Son expression est
localisée dans les quelques cellules de la zone cen-
trale du méristème [4]. Wu et al. [2] ont remarqué que
la présence du virus CMV (virus de la mosaïque du
concombre) était limitée aux parties de la plante si-
tuées sous la zone d’expression de WUS et cela les
a mis sur la piste de ce gène. En utilisant des mu-
tants dans lesquels l’expression de WUS est abolie ou
sur-exprimée de façon constitutive ou inductible par
la dexaméthasone, ils ont très élégamment démon-
tré que WUS était responsable de l’immunité anti-
virale. Ils ont ensuite montré que cet effet résultait
d’une diminution globale de la synthèse protéique
dans la zone d’expression de WUS, non-spécifique
de l’infection virale. Une analyse du transcriptome
de l’apex de plantes surexprimant WUS de façon ec-
topique et inductible, infectées ou non par le virus
a révélé plusieurs gènes impliqués dans la régula-
tion de la synthèse protéique, dont ceux de méthyl-
transferases S-adénosyl-L-méthionine-dépendantes
(MTases). Six d’entre eux sont réprimés par WUS et
sur-exprimés dans le mutant wus et cinq possèdent
un motif fonctionnel de liaison de WUS à l’ADN.
Seuls deux de ces gènes, NOP2A et NOP2B, sont
exprimés dans la zone méristèmatique et réprimés
dans cette zone lors d’une infection virale par le CMV.
Ces deux MTases sont des protéines nucléolaires res-
ponsables de la méthylation m5C de l’ARNr 25S. La
répression de ces deux MTases par WUS, en présence
du virus, a pour effet de déstabiliser la maturation du
pré-ARNr et l’assemblage des ribosomes, résultant
en une inhibition globale de la synthèse protéique,
dont celle induite par le virus. On dispose ainsi d’une
explication moléculaire de l’immunité du méristème
apical au virus, qui a déjà été validée pour plusieurs
autres plantes et virus.
References
[1] G. Morel, C. Martin, “Guérison de Dahlias atteints d’une mal-
adie à virus”, C.R. Acad. Sc. Paris 235 (1952), p. 1324-1325.
[2] H. Wu et al., “WUSCHEL triggers innate antiviral immunity in
plant stem cells”, Science 370 (2020), p. 227-231.
[3] K. F. Mayer, H. Schoof, A. Haecker, M. Lenhard, G. Jurgens,
T. Laux, “Role of WUSCHEL in regulating stem cell fate in the
Arabidopsis shoot meristem”, Cell 95 (1998), no. 6, p. 805-815.
[4] K. M., J. D., “Control of meristem size”, Ann. Rev. Plant. Biol. 70
(2019), no. 1, p. 269-291.
C. R. Biologies — 2020, 343, n 4, 5-6


Innate antiviral immunity in plant apical meristem explained

Alain Chédotal

Comptes Rendus
Biologies
Alain Chédotal
Une nouvelle méthode de cartographie micrométrique 3D des vaisseaux
cérébraux
Volume 343, issue 1 (2020), p. 5-6
Published online: 5 June 2020
https://doi.org/10.5802/crbiol.12
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e-ISSN : 1768-3238
Comptes Rendus
Biologies
2020, 343, n 1, p. 5-6
https://doi.org/10.5802/crbiol.12
C’est apparu dans la presse / News and Views
Une nouvelle méthode de cartographie
micrométrique 3D des vaisseaux cérébraux
A novel method for micrometric 3D mapping of the
brain vasculature
Alain Chédotala
a Institut de la vision, Paris, France, Membre de l’Académie des sciences.
Courriel : Alain.chedotal@inserm.fr.
Manuscrit reçu le 17 mars 2020, accepté le 20 avril 2020.
Le cerveau humain ne représente qu’environ 2%
de la masse corporelle mais consomme près de 20%
de l’oxygène et du glucose, qui sont distribués aux
neurones et aux cellules gliales par un réseau extrê-
mement complexe et dense de vaisseaux sanguins.
La vascularisation du cerveau a été étudiée depuis
des siècles à l’aide de méthodes anatomiques, ou en-
core la tomographie par émission de positons et le
Doppler. Toutefois, aucune de ces méthodes n’a la ré-
solution suffisante pour établir une cartographie mi-
crométrique exhaustive de l’arbre neuro-vasculaire
cérébral. En outre, il n’est pas possible d’identifier de
manière indiscutable et précise les veines, les artères
et les capillaires du cerveau sur la seule base de cri-
tères anatomiques.
Au cours des dernières années, des méthodes
d’imagerie tridimensionnelle (3D) révolutionnaires
ont vu le jour. Des organes intacts, et même des ani-
maux entiers, peuvent être rendus transparents par
différentes méthodes de transparisation [1]. Des anti-
corps spécifiques de certaines cellules et l’utilisation
de microscopes à fluorescence à feuille de lumière
permettent l’imagerie en 3D, de gros blocs de tissus
(jusqu’à plusieurs centimètres cubes), normaux ou
pathologiques.
Dans un article récent [2], le groupe de Nicolas Re-
nier, travaillant à l’Institut du Cerveau à Paris, a décrit
une méthodologie analytique qui génère des cartes
vasculaires précises du cerveau de la souris à une
résolution sans précédent. Ils ont d’abord conçu un
cocktail d’anticorps, pour marquer simultanément
les cellules endothéliales (podocalyxine+ et CD31+),
présentes dans tous les types de vaisseaux, les cel-
lules musculaires lisses qui recouvrent les artères (ac-
tine musculaire lisse+), et les veines (facteur von
Willebrand+). Des cerveaux entiers ont ensuite été
éclaircis et imagés en 3D. Ils ont également utilisé
des algorithmes d’apprentissage automatique pour
reconstruire toutes les images en 3D et ont développé
deux logiciels, Tubemap et WobblySticher, pour, res-
pectivement, le traçage automatique du système vas-
culaire et l’assemblage optimal en 3D des mosaïques
d’images 3D. L’analyse des données a montré que
dans le cerveau d’une seule souris, la longueur totale
ISSN (electronic) : 1768-3238 https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/biologies/
6 Alain Chédotal
du système vasculaire est de 288 mètres (ce qui équi-
vaut à la hauteur de la plateforme supérieure de la
tour Eiffel !) et un assemblage de 9 millions de seg-
ments de vaisseaux reliés en 6,6 millions de points
de ramification. Leur analyse a également révélé que
la densité des vaisseaux est très variable entre les ré-
gions du cerveau. En outre, ils ont montré que cette
technologie peut aider à comprendre les processus
de remodelage vasculaire qui accompagnent les acci-
dents vasculaires cérébraux et d’autres maladies neu-
rologiques. Ces résultats et les nouveaux outils déve-
loppés, seront extrêmement précieux pour modéliser
le flux sanguin dans le système nerveux central. Une
autre étude récente [3] a démontré que le cerveau hu-
main peut également être transparisé optiquement.
Il sera maintenant intéressant de déterminer si les
deux méthodes peuvent être combinées pour décrire
le système vasculaire du cerveau humain. Il faudra
également tester et de valider cette méthode d’ana-
lyse vasculaire sur d’autres organes.
English version
The human brain only accounts for about 2% of the
body mass but consumes almost 20% of the oxygen
and glucose, which are distributed to neurons and
glial cells by a convoluted network of blood vessels.
Brain vasculature has been studied for centuries us-
ing anatomical methods, positron emission tomog-
raphy and transcranial Doppler among others. How-
ever, none is sufficiently powerful to build a micro-
metric map of the neurovascular tree. Moreover, a
comprehensive and accurate identification of brain
veins, arteries and capillaries on simple anatomical
criteria is not possible.
In the past few years, powerful three-dimensional
(3D) imaging methods have emerged. Intact ani-
mal organs, and even entire bodies, can be rendered
transparent with different clearing methods [1]. Cell-
specific antibodies and modern light-sheet fluores-
cence microscopes allows imaging in 3D, large pieces
of tissue (up to several cubic centimeters), normal or
pathological.
In a recent article [2], the group of Nicolas Re-
nier, working at the Brain Institute in Paris, described
an analytic pipeline that generates precise vascular
maps of the mouse brain at an unprecedented reso-
lution. They first designed a cocktail of antibodies, to
simultaneously label endothelial cells (podocalyxin+
and CD31+), present in all types of vessels, smooth
muscle cells which cover arteries (smooth muscle
actin+), and veins (von Willebrand Factor+). Whole-
brains were next cleared and imaged in 3D. They also
used machine learning to reconstruct all the images
in 3D and developed two powerful softwares, Tube-
map and WobblySticher, for automatic tracing of the
vasculature and optimal 3D stitching of the 3D im-
age mosaics, respectively. The analysis of the data
showed that in a single mouse brain, the total length
of the vasculature is of 288 m (equivalent to the
height of the upper platform of the Eiffel tower!) and
an assembly of 9 million vessel segments joined at 6.6
million branch points. Their analysis also revealed
that the density of the vessels is highly variable be-
tween brain regions. Furthermore, they showed that
this technology can help understanding the vascular
remodeling processes that accompany cerebrovascu-
lar accidents and other neurological diseases. These
results and new tools will be extremely valuable to
model blood flow in the central nervous system. An-
other recent study [3] has provided evidence that the
human brain can also be optically cleared. It will now
be interesting to determine if the two methods can
be combined to describe human brain vasculature. It
will also be important to test and validate this imag-
ing pipeline on other organs.
Références / References
[1] H. R. Ueda, A. Ertürk, K. Chung, V. Gradinaru, A. Chédotal,
P. Tomancak, P. J. Keller, « Tissue clearing and its applications
in neuroscience », Nat. Rev. Neurosci. 21 (2020), p. 61-79.
[2] C. Kirst, S. Skriabine, A. Vieites-Prado, T. Topilko, P. Bertin,
G. Gerschenfeld, F. Verny, P. Topilko, N. Michalski, M. Tessier-
Lavigne, N. Renier, « Mapping the fine-scale organization and
plasticity of the brain vasculature », Cell 180 (2020), p. 780-795,
e25.
[3] S. Zhao, M. I. Todorov, R. Cai, R. A. Maskari, H. Steinke, E. Kem-
ter, H. Mai, Z. Rong, M. Warmer, K. Stanic, O. Schoppe, J. C.
Paetzold, B. Gesierich, M. N. Wong, T. B. Huber, M. Duering,
O. T. Bruns, B. Menze, J. Lipfert, V. G. Puelles, E. Wolf, I. Bech-
mann, A. Ertürk, « Cellular and molecular probing of intact hu-
man organs », Cell 180 (2020), p. 796-812, e19.
C. R. Biologies, 2020, 343, n 1, 5-6


Une nouvelle méthode de cartographie micrométrique 3D des vaisseaux cérébraux

Jean-François Bach

Comptes Rendus
Biologies
Jean-François Bach
André Capron 1930–2020
Volume 343, issue 1 (2020), p. 27-31
Published online: 5 June 2020
https://doi.org/10.5802/crbiol.13
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e-ISSN : 1768-3238
Comptes Rendus
Biologies
2020, 343, n 1, p. 27-31
https://doi.org/10.5802/crbiol.13
Notices biographiques / Biographical Notes
André Capron 1930–2020
Jean-François Bacha
a Secrétaire perpétuel honoraire de l’Académie des sciences, France.
Courriel : Jean-francois.bach@academie-sciences.fr.
Manuscrit reçu et accepté le 28 avril 2020.
ISSN (electronic) : 1768-3238 https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/biologies/
28 Jean-François Bach
André Capron est décédé à Seclin (Nord), le 10 jan-
vier 2020. Il avait 89 ans. Il avait été élu correspondant
de l’Académie des sciences le 3 novembre 1986, puis
membre le 6 juin 1988 dans la section de Biologie hu-
maine et sciences médicales. Il fut délégué aux rela-
tions internationales de l’Académie de 2003 à 2007,
une fonction qu’il occupa avec un grand brio, contri-
buant au rayonnement de notre compagnie, particu-
lièrement en Afrique. Avec la disparition d’André Ca-
pron, nous pleurons un immense scientifique, mais
aussi un homme exceptionnel et un très grand ami.
André Capron a consacré l’ensemble de sa carrière
scientifique à l’étude de la biologie des parasites et
au développement de nouvelles stratégies de préven-
tion des grandes endémies parasitaires, notamment
les bilharzioses.
Après des travaux d’helminthologie comparée,
André Capron s’est intéressé à une discipline alors
naissante, l’immunochimie, et a orienté ses activités
vers l’immunologie parasitaire dont il est désormais
reconnu comme l’un des fondateurs. Ses travaux ont
conduit au développement de méthodes nouvelles
de diagnostic immunologique des maladies parasi-
taires (bilharzioses, hydatidose, distomatose) et pa-
rallèlement à la mise en évidence des relations molé-
culaires entre l’hôte et le parasite.
André Capron a développé au cours des années
une œuvre scientifique considérable. Véritable vi-
sionnaire, il a été un des premiers à comprendre l’im-
portance des réactions immunitaires contre les pa-
rasites. Il comprit très tôt que le défi principal était
celui de la relation entre l’hôte et le parasite. Com-
ment expliquer que ces parasites n’étaient pas élimi-
nés alors qu’ils suscitaient une réponse immunitaire,
un état quasi symbiotique sous-tendu par des méca-
nismes d’une complexité allant au-delà de ce qui est
rencontré dans l’immunité contre les bactéries ou les
virus? André Capron fut un des tout premiers à abor-
der ce problème avec les outils de la science la plus
moderne tant au niveau cellulaire que moléculaire.
Il s’intéressa à plusieurs maladies parasitaires mais
consacra l’essentiel de ses activités aux bilharzioses,
des maladies causées par les schistosomes. Son tra-
vail, en collaboration avec son épouse Monique Ca-
pron, a posé les bases de notre compréhension de
cette maladie. Il suffit de citer ici la description du
mimétisme moléculaire qu’il décrivit entre les schis-
tosomes et des antigènes de l’hôte, la caractérisation
des mécanismes effecteurs qui contribuent à la dé-
fense contre le parasite, en particulier les anticorps
cytotoxiques et surtout des cellules jouant un rôle di-
rect pour le contrôle de l’infection comme les ma-
crophages et les éosinophiles, sujet sur lequel Mo-
nique Capron apporta une contribution décisive. An-
dré Capron et son équipe décrivirent avec une grande
précision la fonction des IgE, certes plus connues
pour leur rôle dans les maladies allergiques, mais
qui ont une action déterminante dans la lutte contre
les parasites. Il décrivit en particulier un récepteur
de haute affinité pour les IgE sur les cellules de l’in-
flammation, dont l’importance apparaît chaque jour
plus grande. Il identifia chez les schistosomes une
protéine dont il définit la structure et montra qu’elle
avait des effets immunosuppresseurs contribuant à
l’échec relatif de la défense de l’hôte contre le schis-
tosome. Au-delà de ces découvertes, on pourrait en
citer bien d’autres, le grand projet d’André Capron
était la mise au point d’un vaccin, étape ultime de la
défense contre les maladies infectieuses conçues au
sens large. Il identifia puis clona une molécule d’an-
tigène vaccinant. Il s’engagea alors dans la mise au
point d’un vaccin et mit en place des essais cliniques
avec des résultats très prometteurs. Ne doutons pas
que ce vaccin aura bientôt une large utilisation et
c’est certainement un de nos grands regrets qu’An-
dré Capron ne puisse pas voir ce qui représentera une
contribution majeure à la santé publique en Afrique.
Arrêtons-nous un instant sur l’implication d’An-
dré Capron à la contribution au développement des
pays africains. Il fut un des tout premiers avec Pierre
Aigrain à mettre en place une action dynamique de
la France dans le domaine de la santé. Il condui-
sit plusieurs programmes destinés à l’amélioration
de la santé des populations africaines. Il put pour-
suivre cette action au sein de l’Académie des sciences
en intervenant au niveau des conférences réunissant
les académies du G7, avec une attention particulière
pour la santé de la femme et de l’enfant, un sujet ma-
jeur auquel il était extrêmement attaché. Alors qu’il
était délégué aux relations internationales de l’Aca-
démie, il a mis en place l’important programme qui
a donné naissance en 2007 au GID, association in-
ternationale créée par onze académies de l’Europe
du Sud et du continent africain, et dont il fut le pre-
mier président. Le programme « santé de la mère et
de l’enfant » se poursuit au sein du GID avec un im-
pact conséquent sur le continent africain. Il a égale-
ment joué un rôle déterminant au sein de l’Organi-
C. R. Biologies, 2020, 343, n 1, 27-31
Jean-François Bach 29
sation mondiale de la santé, l’OMS, d’abord autour
des schistosomiases et ensuite de façon plus générale
dans le soutien au développement des pays d’Afrique
mais aussi d’Amérique latine avec lesquels il a déve-
loppé d’importants programmes de recherche, parti-
culièrement au Brésil.
André Capron était né en 1930. Il fut chef du ser-
vice d’immunologie au CHU de Lille, professeur à
l’université de Lille, fondateur et directeur du Centre
d’immunologie et de biologie parasitaire à l’Institut
Pasteur de Lille, dont il fut directeur général entre
1994 et 2000. Il présida le Conseil scientifique de l’In-
serm, le Conseil d’administration de l’ANRS et le Co-
mité stratégique régional de recherche en biologie et
santé.
L’œuvre et la personne d’André Capron ont été lar-
gement reconnues au niveau national et internatio-
nal. Il reçut de nombreuses décorations, il était en
particulier commandeur de la Légion d’honneur et
de l’Ordre national du mérite ; il était aussi, et il en
était fier, commandeur dans l’Ordre du Lion du Sé-
négal. Il était membre de l’Académie des sciences,
de l’Académie nationale de médecine, ainsi que de
l’Académie royale britannique de médecine tropi-
cale, dont il fut le vice-président. Il était docteur ho-
noris causa de plusieurs universités.
Il reçut de nombreux prix, en particulier le prix
Richard Lounsbery, attribué de façon conjointe par
l’Académie des sciences de France et celle des États-
Unis, et le prix de la fondation pour la recherche mé-
dicale, une distinction importante qui lui fut remise
conjointement avec son épouse, ce qui représenta
une consécration de leur œuvre commune.
André était certes un homme d’une intelligence
exceptionnelle, d’une capacité d’entreprendre
unique mais il avait aussi des qualités humaines
rarement rencontrées à ce niveau. Il a toujours mon-
tré dans sa vie tout autant que dans son œuvre scien-
tifique un enthousiasme, une générosité mais aussi
des ambitions qui ne cessaient de surprendre. Cet
enthousiasme communicatif le conduisit à de grands
succès. Il était doublé d’une grande affectivité ce
qui lui permettait de se réjouir de tous ses succès
mais aussi de s’inquiéter des vicissitudes auxquelles
il n’échappait pas. Au-delà d’une courtoisie exem-
plaire pour ne pas dire légendaire, André Capron
était prévenant pour ses proches, tant dans sa famille
que dans sa vie professionnelle. Sa générosité était
sans limite, comme en témoigne son attachement
sans faille à la cause des pays africains.
Au nom de l’académie, nous voulons lui dire toute
notre reconnaissance pour l’œuvre accomplie. Au
terme de cette trop brève évocation, je voudrais
conclure en disant de nouveau quelle est notre peine
mais aussi notre admiration pour un grand homme
qui va beaucoup nous manquer.
English version
André Capron died in Seclin (North) on January 10,
2020. He was 89 years old. He had been elected
“Correspondant” of the French Academy of sciences
on November 3, 1986, then Member on June 6, 1988
in the section of Human Biology and Medical Sci-
ences. He was Delegate for International Affairs of
the Academy from 2003 to 2007, a position he held
with great brilliance, contributing to the influence
of our Company, particularly in Africa. With the
passing of André Capron, we mourn an immense
scientist, but also an exceptional man and a great
friend.
André Capron devoted his entire scientific career
to the study of the biology of parasites and the devel-
opment of new strategies for the prevention of major
parasitic endemics, particularly bilharziosis.
After working in comparative helminthology, An-
dré Capron became interested in the then nascent
discipline of immunochemistry and oriented his ac-
tivities towards parasitic immunology, of which he is
now recognized as one of the founders. His work led
to the development of new methods for the immuno-
logical diagnosis of parasitic diseases (bilharziosis,
hydatidosis, distomatosis) and at the same time to
the identification of molecular relationships between
the host and the parasite.
Over the years, André Capron has developed con-
siderable scientific work. A true visionary, he was
one of the first to understand the importance of im-
mune reactions against parasites. He understood
very early on that the main challenge was the rela-
tionship between the host and the parasite. How
can we explain that these parasites were not elim-
inated when they elicited an immune response, a
quasi-symbiotic state underpinned by mechanisms
of a complexity that goes beyond what is encoun-
C. R. Biologies, 2020, 343, n 1, 27-31
30 Jean-François Bach
tered in immunity against bacteria or viruses? An-
dré Capron was one of the very first to approach this
problem with the tools of the most modern science
at both the cellular and molecular levels. He was
interested in several parasitic diseases but devoted
most of his activities to bilharziasis, diseases caused
by schistosomes. His work, in collaboration with his
wife Monique Capron, laid the foundation for our un-
derstanding of this disease. Suffice it to mention here
the molecular mimicry he described between schis-
tosomes and host antigens, the characterization of
the effector mechanisms that contribute to the de-
fence against the parasite, in particular cytotoxic an-
tibodies, and above all the cells playing a direct role
in the control of the infection such as macrophages
and eosinophils, a subject on which Monique Capron
made a decisive contribution. André Capron and his
team described with great precision the function of
IgE antibodies, which are better known for their role
in allergic diseases, but which have a decisive ac-
tion in the fight against parasites. In particular, he
described a receptor with a high affinity for IgE on
inflammatory cells, which is becoming increasingly
important. He identified a protein in schistosomes
whose structure he defined and showed that it had
immunosuppressive effects contributing to the rela-
tive failure of the host’s defence against the schisto-
some. Beyond these discoveries, one could mention
many others; André Capron’s major project was the
development of a vaccine, the ultimate step in the
defence against infectious diseases conceived in the
broadest sense. He identified then cloned a vaccine
antigen molecule. He then embarked on the develop-
ment of a vaccine and set up clinical trials with very
promising results. We have no doubt that this vac-
cine will soon be widely used and it is certainly one of
our great regrets that André Capron will not be able to
see what will be a major contribution to public health
in Africa.
Let us look for a moment at André Capron’s in-
volvement in contributing to the development of
African countries. He was one of the very first, along
with Pierre Aigrain, to set up a dynamic French ac-
tion in the field of health. He led several programmes
aimed at improving the health of African popula-
tions. He was able to pursue this action within the
French Academy of sciences by speaking at confer-
ences bringing together the G7 academies, with par-
ticular attention to women’s and children’s health, a
major subject to which he was extremely attached.
As the Academy’s Delegate for International Affairs,
he set up the important programme that gave birth
in 2007 to the GID, an international association cre-
ated by eleven academies from Southern Europe and
the African continent, of which he was the first pres-
ident. The "Mother and Child Health" programme
continues within the GID with a consequent im-
pact on the African continent. He has also played
a decisive role within the World Health Organiza-
tion, WHO, first around schistosomiasis and then
more generally in supporting the development of
African and Latin American countries with which he
has developed major research programs, particularly
in Brazil.
André Capron was born in 1930. He was head of
the immunology department at the University Hospi-
tal of Lille, professor at the University of Lille, founder
and director of the Centre for Immunology and Para-
sitic Biology at the Pasteur Institute of Lille, of which
he was director between 1994 and 2000. He chaired
the Inserm Scientific Council, the ANRS Board of Di-
rectors and the Regional Strategic Committee for Bi-
ology and Health Research.
The work and person of André Capron have been
widely recognized at the national and international
level. He received numerous decorations, in partic-
ular he was Commander of the Légion d’honneur
and the Ordre National du Mérite; he was also, and
proudly, Commander in the Order of the Lion of
Senegal. He was a member of the French Academy of
sciences, the National Academy of Medicine and the
British Royal Academy of Tropical Medicine, of which
he was Vice-President. He was an honorary doctor of
several universities.
He received many awards, in particular the
Richard Lounsbery Prize, awarded jointly by the
French and United States Academies of science, and
the Prize of the Foundation pour la Recherche Médi-
cale, an important distinction awarded jointly to him
and his wife, which represented a consecration of
their joint work.
André was certainly a man of exceptional intelli-
gence and a unique entrepreneurial ability, but he
also had human qualities rarely encountered at this
level. He always showed in his life as well as in his
scientific work an enthusiasm, a generosity but also
ambitions that never ceased to surprise. This com-
municative enthusiasm led him to great successes.
C. R. Biologies, 2020, 343, n 1, 27-31
Jean-François Bach 31
It was coupled with a great affectivity that allowed
him to rejoice in all his successes but also to worry
about the vicissitudes from which he could not es-
cape. Beyond an exemplary, not to say legendary,
courtesy, André Capron was considerate to his loved
ones, both in his family and in his professional
life. His generosity was boundless, as demonstrated
by his unfailing attachment to the cause of African
countries.
In the name of the Academy, we wish to express
our gratitude for the work he accomplished. At the
end of this too brief evocation, I would like to con-
clude by reiterating our sorrow but also our admira-
tion for a great man who will be sorely missed.
C. R. Biologies, 2020, 343, n 1, 27-31


André Capron 1930–2020

Amelia Franke-Radowiecka

Nina Zmijewska

Tomasz Zubkiewicz

Michal Zalecki

Magdalena Klimczuk

Żaneta Listowska

Jerzy Kaleczyc

Nerve structures of the heart and their immunohistochemical characterization in 10-week-old porcine foetuses

Jie-Shi Tang

Miao Ma

Genetic diversity and genetic differentiation of invasive weed Xanthium italicum in China

Nicolas Cluzel

Amaury Lambert

Yvon Maday

Gabriel Turinici

Antoine Danchin

Leçons biochimiques et statistiques de l’évolution du virus SARS-CoV-2 : nouveaux chemins pour combattre les virus

Bernard Dujon

Comptes Rendus
Biologies
Bernard Dujon
The unlimited editing of nucleic acids in the oceans
Volume 343, issue 3 (2020), p. 215-217
Published online: 4 February 2021
https://doi.org/10.5802/crbiol.26
This article is licensed under the
Creative Commons Attribution 4.0 International License.
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Les Comptes Rendus. Biologies sont membres du
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e-ISSN : 1768-3238
Comptes Rendus
Biologies
2020, 343, n 3, p. 215-217
https://doi.org/10.5802/crbiol.26
News and Views / C’est apparu dans la presse
The unlimited editing of nucleic acids in the oceans
L’édition sans limite des acides nucléiques dans les océans
Bernard Dujona
a Sorbonne Université, Paris & Département “Genomes and Genetics”, Institut
Pasteur, 25, rue du Docteur Roux, F75015 Paris, France
E-mail: bdujon@pasteur.fr
Manuscript received and accepted 23rd October 2020.
Knowing that proteins are synthesized from the
genetic information of DNA, translated according
to the precise rules of the genetic code after be-
ing brought to the ribosomes by RNA molecules,
forms the essential basis of our current understand-
ing of the living world that we are entitled to de-
mand from any student of biology or medicine. How-
ever, there are a large number of organisms, among
the most abundant on the planet, that synthesize
proteins similar to all the others without real cor-
responding genes because the genetic information
necessary for their synthesis is gradually built up
at the level of RNA molecules by a process of se-
quence editing during the course of cellular life.
They are mainly Diplonemids, a group of flagel-
lated and hererotrophic marine microorganisms re-
lated to euglenas and trypanosomas. In them, the
mitochondrial genome is replaced by a collection of
small circular DNA molecules, called “chromosomes”,
each carrying one (or a few) tiny gene fragments,
called “module”. Each “chromosome” gives rise to
RNA molecules that then enter into precise molec-
ular processes of fragmentation, assembly and se-
quence rewriting to produce the final RNAs capa-
ble of directing protein synthesis. The phenomenon
has been studied so far mainly in Diplonema papilla-
tum [1, 2] while RNA editing is more generally recog-
nized at lower levels in many organisms.
In a recent work [3], the authors explored a new
group of Diplonemids including Hemistasia phaeo-
cysticola, and found that gene fragmentation and
RNA sequence editing broke previous records in
terms of numbers and molecular diversity in all 6
species studied. In parallel to the increase in the
number of “modules” (up to 163 distinct “chromo-
somes” have been identified in Namystynia kary-
oxenos), their reduction in size can be as small as 3
nucleotides. Moreover, the smaller “modules” can be
included in larger ones and be used for the forma-
tion of several distinct “genes” after assembly of the
RNA molecules. Finally, the editing of RNA sequences
reaches the record level of more than 12% of total nu-
cleotides after action on more than 1000 sites in the
sequences. More importantly, while RNA editing is
generally limited to a small number of distinct chem-
ical reactions (C-U transition or U addition/deletion)
in organisms that make most use of this mecha-
nism, the variety is greater in those Diplonemids (A-I
and G-A transitions, A addition/deletion). If molec-
ular mechanisms have already been elucidated for
ISSN (electronic) : 1768-3238 https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/biologies/
216 Bernard Dujon
some RNA editing reactions, others remain to be
discovered.
The reasons for these apparent eccentricities re-
main mysterious. Why fragment genes to the extreme
to make proteins similar to those of other organisms
having unfragmented or poorly fragmented genes?
Unless it was an ancestral form preserved here and
lost elsewhere? Or if the flexibility offered by “mod-
ules” made it easier to create new genes? The explo-
ration of as yet unstudied species belonging to the
least known evolutionary lines must continue. But
neither the complexity of the mechanisms involved,
nor the quantity of nucleic acids needed (there is
more DNA in the mitochondria of some Diplonemids
than in their nuclei) seems to be a handicap for these
microorganisms, judging from their abundance and
diversity. Many fundamental questions remain to be
clarified in the living world.
French version
Savoir que les protéines sont synthétisées à par-
tir de l’information génétique de l’ADN, traduite
selon les règles précises du code génétique après
avoir été apportée aux ribosomes par des molécules
d’ARN, forme la base essentielle de notre compré-
hension actuelle du monde vivant que l’on est en
droit d’exiger de tout étudiant en biologie ou mé-
decine. Pourtant, il existe un grand nombre d’or-
ganismes, parmi les plus abondants sur la planète,
qui synthétisent des protéines semblables à toutes
les autres sans véritables gènes correspondant car
l’information génétique nécessaire à leur synthèse
se construit graduellement au niveau des molécules
d’ARN par un processus d’édition des séquences
au cours de la vie cellulaire. Il s’agit principale-
ment de Diplonémides, un groupe de microorga-
nismes marins, flagellés et hérérotrophes, apparen-
tés aux euglènes et aux trypanosomes. Chez eux, le
génome mitochondrial est remplacé par une collec-
tion de petites molécules d’ADN circulaires, appelées
« chromosomes », portant chacune un (ou quelques)
minuscule fragment de gène, appelé « module ».
Chaque « chromosome » donne naissance à des mo-
lécules d’ARN qui entrent ensuite dans des processus
moléculaires précis de fragmentation, assemblage et
réécriture des séquences pour aboutir aux ARN fi-
naux capables de diriger la synthèse de protéines.
Le phénomène a été principalement étudié jusqu’à
présent chez le Diplonema papillatum [1, 2] tan-
dis que l’édition des ARN est plus généralement re-
connue à des niveaux moindres dans de nombreux
organismes.
Dans un travail récent [3], les auteurs ont exploré
un nouveau groupe de Diplonémides comprenant
Hemistasia phaeocysticola, et découvert que la frag-
mentation des gènes et l’édition des séquence d’ARN
y bat les précédents records en terme numérique et
en diversité moléculaire chez les 6 espèces étudiées.
En parallèle à l’augmentation du nombre de « mo-
dules » (jusqu’à 163 « chromosomes » distincts ont
été identifiés chez Namystynia karyoxenos), leur ré-
duction en taille peut aller jusqu’à seulement 3 nu-
cléotides. De plus, les plus petits « modules » peuvent
être inclus dans de plus grands et servir à la for-
mation de plusieurs « gènes » distincts après assem-
blage des molécules d’ARN. Enfin, l’édition des sé-
quences d’ARN atteint le niveau record de plus de
12% des nucléotides totaux après action sur plus de
1000 sites dans les séquences. Mais surtout, alors que
l’édition des ARN est généralement limitée à un pe-
tit nombre de réactions chimiques distinctes (C-U
transition ou addition/délétion de U) chez les or-
ganismes qui utilisent le plus ce mécanisme, la va-
riété est plus grande chez ces Diplonémides (A-I et
G-A transitions, addition/délétion de A). Si les méca-
nismes moléculaires ont déjà été élucidés pour cer-
taines réactions d’édition des ARN, d’autres restent
donc encore à découvrir.
Les raisons de ces apparentes excentricités res-
tent mystérieuses. Pourquoi fragmenter les gènes à
l’extrême pour fabriquer des protéines similaires à
celles d’autres organismes aux gènes non ou peu
fragmentés ? Sauf s’il s’agissait d’une forme an-
cestrale conservée ici et perdue ailleurs? Ou si la
flexibilité offerte par les « modules » facilitait la créa-
tion de nouveaux gènes ? L’exploration d’espèces
non encore étudiées appartenant aux lignées évo-
lutives les moins connues doit se poursuivre. Mais
ni la complexité des mécanismes mis en jeu, ni
la quantité d’acides nucléiques nécessaires (il
y a plus d’ADN dans les mitochondries de cer-
tains Diplonémides que dans leurs noyaux) ne
C. R. Biologies, 2020, 343, n 3, 215-217
Bernard Dujon 217
semblent constituer un handicap pour ces micro-
organismes si l’on en juge par leur abondance
et diversité. Beaucoup de questions fondamen-
tales restent à éclaircir dans le monde vivant.
References
[1] S. Moreira, M. Valach, M. Aoulad-Aissa, C. Otto, G. Burger,
“Novel modes of RNA editing in mitochondria”, Nucleic Acids
Res. 44 (2016), p. 4907-4919.
[2] S. Burger, M. Valach, “Perfection of eccentricity: mitochondrial
genomes of diplonemids”, IUBMB Life 70 (2018), p. 1197-1206.
[3] B. Haur, K. Zahonova, M. Valach, D. Faktorova, G. Prokopchuk,
Burger, J. Lukes, “Gene fragmentation and RNA editing without
borders: eccentric mitochondrial genomes of diplonemids”,
Nucleic Acids Res. 48 (2020), p. 2694-2708.
C. R. Biologies, 2020, 343, n 3, 215-217


The unlimited editing of nucleic acids in the oceans

Comptes Rendus
Biologies
Michel Delseny
Genus Variovorax is a key player in the root microbiome
Volume 343, issue 3 (2020), p. 221-222
Published online: 4 February 2021
https://doi.org/10.5802/crbiol.28
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Creative Commons Attribution 4.0 International License.
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Les Comptes Rendus. Biologies sont membres du
Centre Mersenne pour l’édition scientifique ouverte
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e-ISSN : 1768-3238
Comptes Rendus
Biologies
2020, 343, n 3, p. 221-222
https://doi.org/10.5802/crbiol.28
News and Views / C’est apparu dans la presse
Genus Variovorax is a key player in the root
microbiome
Le genre Variovorax, un acteur clé du microbiome racinaire
Michel Delseny a
a Laboratoire Génome et Développement des Plantes, UMR5096 CNRS-UPVD,
Université de Perpignan via Domitia, 66860 Perpignan, France
E-mail: delseny@univ-perp.fr
Manuscript received and accepted 26th October 2020.
Plant microbiome [1] interferes with plant pheno-
types by acting on plant fitness, access to nutriments,
stress tolerance, disease resistance and growth ca-
pacity [2]. However, the myriad of interactions be-
tween microorganisms in a natural plant micro-
biome are largely unknown, and thereby the mech-
anisms which are shaping the resulting phenotypes.
A recent approach of this problem relies on the use
of a reconstructed microbiome [3], previously de-
scribed [4], made of 185 bacteria species, whose
genomes have been sequenced [1]. Such an artifi-
cial microbiome is inoculated to sterile Arabidopsis
plantlets, either under normal growth conditions or
under a variety of stress conditions.
For each situation, the enrichment of a given
species in the plant or in the substrate is mea-
sured. This led the authors to define 4 groups of
species: group A contains species enriched in the
substrate, group B species which do not show any
difference between plantlets and substrate and
two groups of alphaproteobacteria (C) and acti-
nobacteria (D) which are enriched in the plantlets.
When plantlets are inoculated with subpopulations
A, B, C, or D, a root growth inhibition is observed
only with groups C or D, but this effect is reverted
when C or D are co-inoculated with group A. This
indicates that group A contains bacteria able to in-
terfere with those of groups C and D to restore root
growth. Co-inoculating plants with populations C
or D and individual strains from group A identified
genus Variovorax as the responsible for this effect.
Root growth is known to be inhibited by the various
plant hormones auxin, ethylene and cytokinines. All
Variovorax strains have been shown to be able to
mitigate root growth inhibition caused by auxin and
ethylene, but not by cytokinines. Further analysis
revealed that Variovorax strains contained genes in-
volved in auxin degradation, thus providing a mech-
anism explaining the observed effects. Therefore,
this genus is a key-player to maintain root growth in
a complex ecosystem. Similar results were obtained
with tomato plantlets.
ISSN (electronic) : 1768-3238 https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/biologies/
222 Michel Delseny
French version
Le microbiome des plantes [1] interfère avec leur
phénotype en agissant sur leur bon état physique,
leur accès aux nutriments, leur tolérance aux stress,
leur résistance aux pathogènes, ou encore leur ca-
pacité de croissance [2]. Cependant les interactions
entre bactéries au sein du microbiome sont large-
ment inconnues et, par suite, les mécanismes par
lesquels elles modifient les phénotypes. Une ap-
proche récente de cette question [3] s’appuie sur la
reconstitution d’un microbiome représentatif, précé-
demment défini [4], constitué de 185 espèces bac-
tériennes dont les génomes ont été séquencés [1].
Il est inoculé à des plantules d’Arabidopsis stériles,
en conditions normales ou en diverses conditions de
stress.
Dans un premier temps, l’enrichissement des dif-
férentes espèces dans la plante et dans le substrat a
été mesuré. Les auteurs ont ainsi pu regrouper les
différentes espèces en 4 groupes : un groupe d’es-
pèces enrichies dans le substrat (A), un qui ne pré-
sentait pas de variation (B) et deux groupes, cor-
respondant respectivement à des alphaprotéobacté-
ries (C) et des actinobactéries (D), qui étaient enri-
chies sur la plante. Ils ont observé que les plantes
inoculées avec les bactéries des groupes C et D
présentaient un phénotype d’inhibition de la crois-
sance racinaire qui disparaissait lorsque les plantes
étaient inoculées avec un mélange AC ou AD, indi-
quant que le groupe A contenait des espèces capables
d’interférer avec les bactéries inhibitrices de la crois-
sance racinaire. En testant individuellement chacune
des espèces du groupe A en association avec les po-
pulations C et D, il est apparu que les bactéries du
genre Variovorax étaient responsables de la restau-
ration de la croissance racinaire. Celle-ci est inhibée
par plusieurs hormones végétales : l’auxine, l’éthy-
lène et les cytokinines. Toutes les souches de Variovo-
rax sont capables de lever les inhibitions provoquées
par l’auxine et l’éthylène, mais pas celle provoquée
par les cytokinines. La poursuite de l’étude a montré
que les souches de Variovorax possèdent une série de
gènes dont la fonction est de dégrader l’auxine. Ainsi,
ce genre est un acteur clé du microbiome végétal, ca-
pable de dégrader l’auxine produite par les bactéries
inhibitrices et capable de maintenir la croissance ra-
cinaire au sein d’un écosystème complexe. Des résul-
tats similaires ont été obtenus avec des plantules de
tomate.
References
[1] A. Levy et al., “Genomic features of bacterial adaptation to
plants”, Nature Genet. 50 (2018), p. 138-150.
[2] P. Trivedi et al., “Plant–microbiome interactions: from commu-
nity assembly to plant health”, Nature Rev. Microb. 18 (2020),
p. 607-621.
[3] O. M. Finkel et al., “A single bacterial genus maintains root
growth in a complex microbiome”, Nature (2020), p. 103-108.
[4] O. M. Finkel et al., “The effects of soil phosphorus content on
plant microbiota are driven by the plant phosphate starvation
response”, PLoS Biol. 17 (2019), article no. e3000534.
C. R. Biologies, 2020, 343, n 3, 221-222


Genus Variovorax is a key player in the root microbiome

Hervé Jactel

Jean-Luc Imler

Louis Lambrechts

Anna-Bella Failloux

Jean Dominique Lebreton

Yvon Le Maho

Jean-Claude Duplessy

Pascale Cossart

Philippe Grandcolas

Insect decline: immediate action is needed

Yann Hénaut

Lizbeth Esmeralda Lara-Sánchez

Benjamín Morales-Vela

Salima Machkour-M’Rabet

Learning capacities and welfare in an Antillean manatee, Trichechus manatus manatus

Not a member yet

Innate antiviral immunity in plant apical meristem explained

Une nouvelle méthode de cartographie micrométrique 3D des vaisseaux cérébraux

André Capron 1930–2020

Nerve structures of the heart and their immunohistochemical characterization in 10-week-old porcine foetuses

Genetic diversity and genetic differentiation of invasive weed <i>Xanthium italicum</i> in China

Leçons biochimiques et statistiques de l’évolution du virus SARS-CoV-2 : nouveaux chemins pour combattre les virus

The unlimited editing of nucleic acids in the oceans

Genus <i>Variovorax</i> is a key player in the root microbiome

Insect decline: immediate action is needed

Learning capacities and welfare in an Antillean manatee, <i>Trichechus manatus manatus</i>

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