ReDivia - Repositorio Digital de l'Instit Valencià d'Investigacions Agràries
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    Detección de podredumbres en cítricos mediante espectroscopía VIS/NIR y métodos de aprendizaje automático

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    La presencia de podredumbres en poscosecha es uno de los principales problemas que afectan a la producción de cítricos. La detección y eliminación de la fruta infectada es una de las mayores preocupaciones de la industria debido a que un número relativamente bajo de frutos infectados puede propagar rápidamente la infección al resto de la producción. La detección de esta enfermedad se ha llevado a cabo manualmente usando luz ultravioleta que induce la fluorescencia visible de las lesiones fúngicas, pero la exposición de las personas a la iluminación ultravioleta es potencialmente peligrosa y es necesario evitarla. Este trabajo estudia la viabilidad de la espectroscopía de reflectancia en el visible e infrarrojo cercano (NIR) como una alternativa no destructiva para la detección automática de cítricos con podredumbre. Se adquirieron espectros de reflectancia de zonas sana y podrida de mandarinas cv. 'Clemenvilla' en la región espectral entre 650 nm y 1700 nm utilizando dos espectrofotómetros. Se utilizaron varios métodos de aprendizaje automático (análisis de componentes principales, análisis factorial y mapeo de Sammon) para transformar los datos de cada espectro en representaciones significativas de dimensionalidad reducida. Estas representaciones de menor dimensionalidad de datos se utilizaron posteriormente como vectores de entrada de un clasificador basado en análisis discriminante lineal para discriminar entre los dos tipos de piel: sana y podrida. Los mejores resultados de detección de frutas con podredumbre se obtuvieron usando un análisis factorial de los espectros NIR, dando una máxima precisión de la clasificación de 97,8%, con porcentajes de clasificación de fruta sana y podrida del 100% y 94,4%, respectivamente. Estos resultados hacen de esta herramienta una prometedora alternativa para detectar esta peligrosa enfermedad mediante técnicas automáticas y no destructivas

    DSS-SALTIRSOIL: Un sistema de ayuda a la decisión en internet para la obtención de recomendaciones de gestión del riego y el cultivo en tierras amenazadas por salinización

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    En el presente trabajo se presenta un ejemplo de utilización del sistema de ayuda a la decisión DSS-SALTIRSOIL para la recomendación del riego en una plantación de caqui “Rojo Brillante” en la zona de riegos del Magro de la Ribera del Xúquer (Valencia). De acuerdo con la simulación realizada con datos de la zona representativos de su meteorología (año 2010), suelo (franco arcilloso), calidad de agua (2.3 dS/m) y manejo del riego (goteo) y el cultivo, se esperaría una pérdida del 15% de producción como consecuencia de la salinización. Un incremento de la dotación anual de riego de 140 mm, o una disminución de la salinidad hasta 2.0 dS/m reducirían dicha pérdidas a tan solo un 10% en dicho año de meteorología media. No obstante, la simulación del periodo 2000-2015 indica que una disminución de 100 mm en la precipitación anual media supone una amenaza de pérdida de producción de más del 20% en promedio. En consecuencia una solución satisfactoria a los problemas de salinidad en el cultivo del caqui en la zona pasa necesariamente por usar aguas de riego de salinidad más baja (< 2.0 dS/m), o bien por un cambio del patrón del caqui a uno más tolerante a la salinidad como es el D. virginiana

    Computer vision for automatic quality inspection of dried figs (Ficus carica L.) in real-time

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    This work reports the development of automated systems based on computer vision to improve the quality control and sorting of dried figs of Cosenza (protected denomination of origin) focusing on two research issues. The first was based on qualitative discrimination of figs through colour assessment comparing the analysis of colour images obtained using a digital camera with those obtained according to conventional instrumental methods, i.e. colourimetry currently done in laboratories. Data were expressed in terms of CIE XYZ, CIELAB and HunterLab colour spaces, as well as the browning index measurement of each fruit, and then, analysed using PCA and PLS-DA based methods. The results showed that both chroma meter and image analysis allowed a complete distinction between high quality and deteriorated figs, according to colour attributes. The second research issue had the purpose of developing image processing algorithms to achieve real-time sorting of figs using an experimental prototype based on machine vision, simulating an industrial application. An extremely high 99.5% of deteriorated figs were classified correctly as well as 89.0% of light coloured good quality figs A lower percentage was obtained for dark good quality figs but results were acceptable since the most of the confusion was among the two classes of good product

    Incidence and etiology of postharvest diseases of fresh fruit of date palm (Phoenix dactylifera L.) in the grove of Elx (Spain)

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    The incidence and etiology of postharvest diseases affecting fresh date fruit in the palm grove of Elx (Spain) were determined under local environmental conditions. Latent and wound pathogens were assessed for two consecutive seasons on fruit of two important commercial cultivars, ‘Boufeggous’ and ‘Medjool’, grown in different orchards. Healthy dates were either surface-disinfected or artificially wounded in the rind and placed in humid chambers at 20ºC for up to 7 weeks. Irrespective of cultivar, season, orchard, and type of infection, the most important causal agents of disease were Penicillium expansum, Alternaria alternata, Cladosporium cladosporioides, and a black aspergillus species belonging to the Aspergillus niger clade. These fungi were identified by macroscopic and microscopic morphology and/or DNA amplification and sequencing. Their pathogenicity was demonstrated by fulfilling Koch’s postulates. Disease development at 20 and 5ºC was characterized on artificially inoculated date

    Memoria de Actividades 2015

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    Efecto de boquillas de baja deriva y convencionales sobre la deriva y el control de Aonidiella aurantii (Maskell) en cítricos

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    La deriva es la mayor fuente de contaminación durante los tratamientos fitosanitarios en cultivos arbóreos. Una de las tecnologías efectivas para su reducción es el uso de boquillas de baja deriva (LDN). Sin embargo, su uso podría afectar la eficacia de control. El objetivo de este trabajo fue estudiar el efecto de LDN sobre la deriva y la eficacia de los tratamientos fitosanitarios en el control de Aonidiella aurantii en cítricos frente a boquillas convencionales (STN). Para evaluar la deriva se realizó un ensayo siguiendo la metodología de la norma ISO 22866 en una parcela comercial de Clemenules. Para evaluar la eficacia se llevó a cabo un ensayo en una parcela comercial de Clemenules y se emplearon los siguientes productos: Reldan® E + Atominal® 10 EC, Reldan® E y aceite parafínico contra la primera, segunda y tercera generación respectivamente. En ambos casos las aplicaciones se realizaron con un volumen de caldo de aproximadamente 2500 L ha-1, empleando un turboatomizador. Se aplicó un tratamiento con boquillas STN Teejet de disco y núcleo, y otro con boquillas LDN Albuz modelo TVI, seleccionando en cada ensayo el diámetro adecuado para ajustar el volumen aplicado a las características de cada parcela. En el ensayo de eficacia también hubo un tratamiento Control (sin insecticidas). Los resultados mostraron que la boquilla LDN redujo en un 22.7% la deriva depositada. No se encontraron diferencias significativas de eficacia entre los tratamientos con LDN y STN, pero si entre estos y el Control. Por lo tanto, se deduce de este trabajo que las boquillas LDN son la solución para reducir la deriva en tratamientos contra A. auranti en cítricos sin comprometer la eficacia

    First Report of Black Heart of Pomegranate Caused by Alternaria alternata in Spain

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    Algunos aspectos estadísticos de interés en los ensayos de fertilización

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    En este trabajo se describen algunos aspectos estadísticos del diseño y análisis de los experimentos que en ocasiones no son considerados por los investigadores o reciben escasa atención. Se presentan las ideas básicas del diseño de experimentos, con especial énfasis en el caso de bloques completos al azar con una y varias observaciones por unidad experimental. Se remarca la importancia de los objetivos del estudio en el diseño experimental y de la relación que existe entre el diseño y el análisis de los resultados. Se exponen algunos de los errores más frecuentes en el diseño y análisis de experimentos y se introduce la geoestadística como una herramienta útil para la caracterización espacial de algunas variables del suelo y de las plantas, así como para la estimación de estas variables en zonas no medidas y se discute el papel de la variabilidad espacial del suelo en el diseño y análisis de los ensayos de campo. Por último se presenta el sistema de dominio público R para el análisis estadístico de los datos experimentales y también para la realización de gráficos de alta calidad

    Respuesta del granado ‘Mollar’ a la fertilización N-P-K bajo distintos regímenes de riego deficitario controlado

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    Son escasos los estudios realizados sobre las prácticas agronómicas y su relación con la producción, alteraciones fisiológicas y composición físico-química del fruto en el granado. En las zonas de clima semiárido, en las que se cultiva principalmente el granado en España, el manejo de la nutrición y el riego son factores determinantes de la calidad del fruto. Asimismo, la relación entre el estado hídrico y nutricional de la planta son factores cruciales de la producción que pueden afectar a dos de las fisiopatías más importantes que afectan a la granada, el golpe de sol y el rajado. En este trabajo se pretende analizar la respuesta productiva del granado ‘Mollar’ a tres estrategias de riego con dos dosis de abonado N-P-K, estudiando las funciones que relacionan la eficiencia en el uso del agua (EUA) y la producción con el agua y abono recibidos por el cultivo. El trabajo experimental se realizó durante las campañas 2014 y 2015 en una parcela comercial situada en Aspe (Alicante). Respecto a la fertilización, los tratamientos fueron 1) 100% y 2) 50% de la dosis anual recomendada en la zona de estudio de (170)N, (100)P2O5 y (205)K2O kg.ha-1; combinados con tres estrategias de riego 1) Control, regado al 100% de las necesidades hídricas estimadas del cultivo (ETc), 2) Riego deficitario controlado RDCflo con severas restricciones (riego del 25% del Control) durante el periodo de floración-cuajado y 3)RDCmad, en las que la restricción severa (riego del 25% respecto al Control) se aplicó durante la última fase de desarrollo del fruto y la maduración. Las estrategias de riego y fertilización mostraron efectos de interacción significativa en la producción por árbol, peso medio del fruto y porcentaje de frutos con daños por rajado. Resultados preliminares parecen demostrar que la aplicación de la dosis menor de fertilización no tiene efectos negativos significativos en los aspectos productivos estudiados. El empleo del RDIflo mejoró la eficiencia productiva por árbol y redujo la afección por rajado

    An RNA-Seq-based reference transcriptome for Citrus

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    Previous RNA-Seq studies in citrus have been focused on physiological processes relevant to fruit quality and productivity of the major species, especially sweet orange. Less attention has been paid to vegetative or reproductive tissues, while most Citrus species have never been analysed. In this work, we characterized the transcriptome of vegetative and reproductive tissues from 12 Citrus species from all main phylogenetic groups. Our aims were to acquire a complete view of the citrus transcriptome landscape, to improve previous functional annotations and to obtain genetic markers associated with genes of agronomic interest. 28 samples were used for RNA-Seq analysis, obtained from 12 Citrus species: C.medica, C.aurantifolia, C.limon, C.bergamia, C.clementina, C.deliciosa, C.reshni, C.maxima, C.paradisi, C.aurantium, C.sinensis and Poncirus trifoliata. Four different organs were analysed: root, phloem, leaf and flower. A total of 3421 million Illumina reads were produced and mapped against the reference C.clementina genome sequence. Transcript discovery pipeline revealed 3326 new genes, the number of genes with alternative splicing was increased to 19739, and a total of 73797 transcripts were identified. Differential expression studies between the four tissues showed that gene expression is overall related to the physiological function of the specific organs above any other variable. Variants discovery analysis revealed the presence of indels and SNPs in genes associated with fruit quality and productivity. Pivotal pathways in citrus such as those of flavonoids, flavonols, ethylene and auxin were also analysed in detail

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