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Deteccion de mecanismos de resistencia a los antifungicos: analisis de las metodologias existentes y sus aplicaciones
El presente trabajo es una revisión bibliográfica que incluye una revisión inicial de los mecanismos de acción de los diferentes grupos de antifúngicos tanto en lo que respecta a síntesis y función de la membrana plasmática, como síntesis de la pared celular y síntesis de ácidos nucleicos. Posteriormente, se describen los principales mecanismos de resistencia por grupo de antifúngico, también se hace referencia a las diferentes técnicas moleculares de detección de aquellas mutaciones que conllevan a la resistencia a los antifúngicos, tales como la secuenciación, los microarreglos, reacción en cadena de la polimerasa, la tecnología ARMS, análisis de Curvas de Melting o de fusión, se incluye en este apartado la espectrometría de masas, no como un método de detección de mutaciones sino como un método que está tomando auge en la discriminación de aislamientos sensibles y resistentes a los antifúngicos. Por último, se incluyen algunos ejemplos de las aplicaciones de estas técnicas moleculares en la detección de mutaciones relacionadas a la resistencia a los antifúngicos.The following study is a literature review that includes an initial review of the action mechanisms of different antifungal groups, both in terms of synthesis and function of the plasma membrane, as well as cell wall synthesis and nucleic acid synthesis. Subsequently, the main resistance mechanisms by antifungal group are described, and molecular techniques for detecting those mutations that lead to antifungal resistance, such as sequencing, microarrays, polymerase chain reaction, ARMS technology, and melting curve analysis. Mass spectrometry is included in this section, not as a method for detecting mutations but as a method that is gaining popularity in the discrimination of susceptible and resistant isolates to antifungals. Finally, some examples of the applications of these molecular techniques in the detection of mutations related to antifungal resistance.UCR::Vicerrectoría de Investigación::Sistema de Estudios de Posgrado::Salud::Especialidad en Micología Médic
Manuela Sequeira
Esta obra de teatro reinterpreta algunos aspectos de la vida de Valentín Sequeira, quien era un personaje de la San José de 1836, cuando Braulio Carrillo era el jefe de estado. Valentín era muy conocido por sus jugarretas y humor y su astucia para lograr sus objetivos. Esta obra agrega el personaje ficticio de su hija Manuela quien siendo de carácter fuerte, es la que de cierta manera solapada presiona a Valentín a que le consiga una dote para ella poderse casar. Valentín hace uso de todo su talento para asegurarse esa dote.Sedes Regionales::Sede del Su
Tareas matemáticas en libros de texto de II ciclo escolar y su relación con la Política Curricular: educar para una nueva ciudadanía
Esta es una comunicación presentada en el V Encuentro Internacional de Estudiantes en Formación en Educación Matemática (V EIEFEM), celebrado el miércoles 12 de noviembre del 2025 en la sede universitaria Rodrigo Facio de la Universidad de Costa Rica. Este encuentro lo organizan estudiantes de licenciatura de la carrera de Educación Matemática en el marco de las Horas Práctica Profesional del X ciclo de carrera, con el apoyo del Departamento de Educación Matemática de la Escuela de Matemática de la UCR; asesorados por el docente a cargo del curso MA 0031 Investigación en Educación Matemática II del II ciclo 2025.Este trabajo forma parte de un estudio más amplio sobre la coherencia entre indicadores de las dimensiones de la Política Curricular de Costa Rica, y las tareas matemáticas en libros de texto de segundo ciclo de la Educación General Básica. El estudio fue realizado como un antecedente de campo del proyecto del Trabajo Final de Graduación durante el mes de septiembre del presente año. Se adaptaron 15 indicadores pero en esta ponencia se reportan los resultados obtenidos del indicador D1-5, que solicita a los estudiantes justificar, argumentar y explicar su pensamiento. Los resultados muestran que pocas tareas promueven la argumentación y la justificación, evidenciando una brecha entre lo que propone la Política Curricular y lo que realmente se presenta en los libros de texto.Sedes Regionales::Sede del SurVicerrectoría de Docencia::Ciencias Básicas::Facultad de Ciencias::Escuela de Matemátic
Memoria del III Congreso de Regionalización
El III Congreso de Regionalización, realizado en la Universidad de Costa Rica, Sede de Guanacaste, surge como una respuesta al contexto y a los desafíos actuales de la regionalización universitaria. Este congreso tuvo como objetivo principal desarrollar un ejercicio crítico-prospectivo sobre la regionalización de la Universidad de Costa Rica, con el fin de clarificar los derroteros que deben orientar la labor académica en las sedes regionales. Asimismo, buscó aportar a la reflexión institucional y a la generación de propuestas que contribuyan a las transformaciones que la sociedad costarricense requiere para el logro del bien común.
Como resultado del congreso, se presentaron diversas ponencias que abordaron la regionalización desde múltiples perspectivas académicas, sociales y territoriales. El presente libro reúne los principales criterios, análisis y aportes derivados de estas ponencias, constituyéndose en un insumo relevante para la comprensión, fortalecimiento y proyección de la regionalización universitaria, así como para la toma de decisiones orientadas al desarrollo académico y social de las regiones.UCR::Sedes Regionales::Sede de Guanacast
Deshumanizar al Enemigo para conducir la guerra: el exterminio político y militar en la Política De Defensa y Seguridad Democrática, Colombia 2002-2006
Este documento presenta la investigación de tesis titulada “Deshumanizar al enemigo para conducir la guerra: el exterminio político y militar en la Política de Defensa y Seguridad Democrática, Colombia 2002-2006” que se centra en tres ejes fundamentales: la construcción del enemigo en esta política, la violencia ejercida contra el enemigo construido y la reconfiguración de la legalidad y la legitimidad en el proyecto de exterminio político y militar del mismo. Para ello, se construyó una línea de tiempo con los hechos militares y políticos más relevantes de la Política y se utilizaron métodos de investigación documental, análisis de datos y análisis del discurso político. En términos teóricos el análisis se realizó desde la teoría del Estado de Pierre Bourdieu en diálogo con conceptualizaciones de Carl Schmitt sobre la construcción del enemigo, el enemigo político y absoluto y la teoría del bonapartismo como un régimen visible en el presidencialismo de Álvaro Uribe Vélez, quien logró concentrar el poder del Estado, reconfigurar estructuras e incluso eludir (arbitrariamente) el andamiaje institucional, instalando una idea de seguridad que propuso una nueva idea de guerra contra el terrorismo. Este último se entendió pragmáticamente en la Política como cualquier forma de resistencia al proyecto de la Seguridad Democrática y al desvío del proyecto nacional de ley y orden.
Entre los principales hallazgos se destaca la consolidación de una red de alianzas políticas y militares sólida para construir y exterminar al enemigo construido, pero también como fuente de ganancias, retribuciones, pactos de cuidados políticos y económicos a lo largo del tiempo. Se produce la deshumanización del otro (contrincante político, periodistas, campesinos, indígenas, afrodescendientes, guerrilleros) mediante estrategias persuasivas de universalización y homogeneización que permiten legitimar el exterminio. Se establece que los planes articulados con Estados Unidos y el discurso del terrorismo como una amenaza regional y global aumentan la popularidad del proyecto de la Política que se alinea con el proyecto global neoliberal. La Política se consolida como el garante del capital (nacional y extranjero) bajo la militarización del territorio y una extendida violencia en el país.
En el contexto histórico colombiano, se evidencia una recurrencia en los patrones de violencia y exterminio hacia los grupos disidentes. Sin embargo, durante el período en cuestión, estos patrones se intensifican y adquieren características distintivas. Todo ello con una alta legitimidad popular. Se establece un proyecto más amplio como política de Estado que guiará la política de seguridad de Colombia en el siglo XXI.Vicerrectoría de Investigación::Sistema de Estudios de Posgrado::Ciencias Sociales::Maestría Académica en Sociologí
Protocolo de manejo del tratamiento antitrombótico perioperatorio en pacientes que van a ser sometidos a procedimientos de ablación e implante de dispositivos de estimulación cardiaca
El manejo del tratamiento antitrombótico en el periodo perioperatorio representa un desafío clínico significativo en pacientes que requieren procedimientos como la ablación cardíaca o el implante de dispositivos electrónicos cardíacos implantables (DECI). Por lo que la necesidad de equilibrar adecuadamente el riesgo tromboembólico asociado a suspender la anticoagulación con el peligro hemorrágico inherente al procedimiento quirúrgico exige un abordaje protocolizado, basado en la mejor evidencia disponible. A partir de lo anterior, el objetivo principal de este estudio es desarrollar un protocolo clínico para la optimización del tratamiento antitrombótico durante el periodo perioperatorio en pacientes sometidos a procedimientos de ablación o implante de DECI. Para tal fin, se lleva a cabo una revisión exhaustiva de la literatura científica actual, incluyendo guías internacionales de práctica clínica, estudios observacionales, ensayos clínicos controlados y metaanálisis, con el propósito de identificar estrategias seguras y eficaces aplicables en el contexto clínico local. El protocolo propuesto tiene como finalidad estandarizar la conducta médica frente a estos escenarios clínicos complejos, promoviendo la toma de decisiones informada y reduciendo la variabilidad en la práctica. Por lo tanto, la revisión bibliográfica realizada proporciona las bases científicas necesarias para la elaboración de flujogramas clínicos orientados a la práctica médica cotidiana.
Como resultado de este trabajo, se diseñaron algoritmos específicos para el manejo de la antiagregación plaquetaria y la anticoagulación en pacientes que serán sometidos a diversos procedimientos en el ámbito de la electrofisiología. Estos algoritmos tienen como propósito estandarizar el abordaje farmacológico en el periodo pre y postoperatorio, con el fin de minimizar el riesgo de complicaciones tromboembólicas o hemorrágicas y, al mismo tiempo, facilitar la toma de decisiones clínicas por parte de los profesionales involucrados en el manejo de estos pacientes, independientemente de su especialidad médica. Finalmente, se espera que su implementación contribuya a mejorar la seguridad del paciente, disminuir las complicaciones y optimizar los resultados perioperatorios en el ámbito de la cardiología intervencionista.Vicerrectoría de Investigación::Sistema de Estudios de Posgrado::Salud::Especialidad en Cardiologí
Prefactibilidad para el establecimiento de un modelo productivo de agricultura familiar de abacá (Musa textilis) y plátano (Musa acuminata), de la asociación agua vida campesinos del sur, para solicitar fondos al INDER, cantón de Corredores, Costa Rica
El presente trabajo tuvo como objetivo fundamental analizar la prefactibilidad para el establecimiento de un modelo productivo de agricultura familiar de abacá (musa textilis) y plátano (musa acuminata), de la Asociación Agua Vida Campesinos del Sur, para solicitar fondos al Inder, en el cantón de corredores. En base a este propósito se desarrollaron los estudios complementarios que permitieran determinar la prefactibilidad del proyecto, como el estudio de mercado, técnico, ambiental, legal administrativo y financiero.
El estudio de mercado permitió realizar una caracterización del mercado, conociendo la oferta de productos y subproductos del proyecto, competencia y comercialización, así como la posibilidad real de contar con una demanda a través de compradores tanto en abacá como en plátano,
El desarrollo del estudio técnico se enfocó a determinar las necesidades para el establecimiento de los cultivos, como terreno, modelo productivo, maquinaria y equipo, así como los costos de producción.
El estudio ambiental se orientó a identificar las posibles afectaciones, externalidades y medidas de mitigación por el establecimiento del modelo productivo.
Para el estudio legal administrativo, se dirigió el análisis hacia la identificación de los requerimientos legales y administrativos para el establecimiento del modelo productivo, si la asociación cumple con los requisitos mínimos como figura legal para la obtención de recursos por parte del Inder, así como costos administrativos para la ejecución y operación del proyecto.
Por su parte el estudio financiero, se enfocó en determinar la viabilidad financiera sobre los beneficios que generaría el proyecto, mediante el análisis de los indicadores TIR y VAN, así como presentar el detalle de los costos de inversión, operación, financiamiento y el flujo de caja.
Por último, dentro de las principales consideraciones se menciona la importancia que tiene este proyecto para los productores, la diversificación de la producción de la zona, así como que se logra demostrar que el proyecto cuenta con mercado y es rentable para el productor.
Este proyecto responde a la necesidad sistematizada de un grupo de familias que, a través de la organización, formalización, construcción conjunta, discusión sana y consenso, logran plasmar sus ideas en una solución real, construyendo un proyecto con el objetivo de mejorar sus condiciones de vida, generar empleo y riqueza a sus comunidades y a la vez contribuir con la reactivación económica desde la producción y diversificación.Sedes RegionalesVicerrectoría de Investigación::Sistema de Estudios de Posgrado::Ciencias Agroalimentarias::Maestría Profesional en Gerencia Agroempresaria
Depth-Driven Decline in Viral Diversity Unveils Novel Viruses in Global Deep-Sea Ecosystems
La tesis consta de tres artículos científicos. Donde, el artículo "The Influence of Depth on the Global Deep-Sea Plasmidome" ha sido recientemente aceptado en Scientific Reports y será publicado en el mes de enero.The environmental plasmidome, encompassing the collective plasmids within an ecosystem, plays a key role in microbial adaptation and evolution. Plasmids, as mobile DNA molecules, enable the transfer of beneficial traits among bacteria, especially in response to environmental stresses. This study examines the plasmidome of Costa Rica’s heavily polluted Virilla River, impacted by urbanization and industrial activities. We analyzed water and sediment samples across various sites to understand how pollution affects plasmid diversity and characteristics. By employing protocols for plasmidic DNA extraction, high-throughput sequencing, and ad hoc bioinformatics pipelines, we discovered that contaminated sites exhibit increased plasmid diversity, with the highest species richness observed at the most polluted site during the rainy season. Different bioinformatics methods were applied at each step, enhancing the accuracy, reliability, and robustness of the results, which in turn provided more reliable biological insights. The most effective circular detection method identified 28,043 circular contigs, predominating plasmid hosts associated with Gammaproteobacteria. Our findings suggest that polluted urban environments may promote the formation of longer plasmidic contigs. The study also revealed a significant increase in antibiotic resistance genes (ARGs) at highly polluted sites, particularly in freshwater samples and during the rainy season. This heightened diversity in contaminated environments has implications for the dissemination of antibiotic and metal-resistance genes, as well as other adaptive traits within microbial communities. This research underscores the need to study plasmids in natural environments to better comprehend their ecological roles and potential risks in polluted ecosystems.El plasmidoma ambiental, que abarca todos los plásmidos presentes en un ecosistema, desempeña un papel fundamental en la adaptación y evolución de los microorganismos. Los plásmidos, como elementos móviles de ADN, facilitan la transferencia de rasgos beneficiosos entre bacterias, especialmente en respuesta a presiones ambientales. Para estudiar el plasmidoma, se emplearon diversos métodos bioinformáticos que mejoran la precisión, fiabilidad y solidez de los resultados, proporcionando conocimientos biológicos más confiables. La implementación de este protocolo bioinformático en la supercomputadora Kabré, junto con su disponibilidad en repositorios como GitLab, facilita el acceso de este recurso a la comunidad científica en Costa Rica. Aunque el protocolo fue diseñado inicialmente para estudiar el plasmidoma en muestras del río Virilla, también hizo posible analizar el plasmidoma en muestras de aguas profundas a nivel global, así como el viroma (totalidad de virus) en estas muestras. Es relevante destacar que el análisis del plasmidoma en el río Virilla, gravemente contaminado por la urbanización y las actividades industriales, permitió comprender cómo la contaminación influye en la diversidad y las características de los plásmidos en el agua y sedimento de diferentes sitios. Mediante protocolos de extracción de ADN adaptados y secuenciación de alto rendimiento, descubrimos que los sitios contaminados actúan como puntos críticos de diversidad plasmídica, lo cual tiene importantes implicaciones para la propagación de resistencia a antibióticos, metales y otros rasgos adaptativos en las comunidades microbianas. Este estudio subraya la importancia de investigar los plásmidos en entornos naturales para comprender mejor sus roles ecológicos y los riesgos potenciales en ecosistemas contaminados.Plasmids play a crucial role in facilitating genetic exchange and enhancing the adaptability of microbial communities. Despite their importance, environmental plasmids remain understudied, particularly those in fragile and underexplored ecosystems such as the deep-sea. In this paper we implemented a bioinformatics pipeline to study the composition, diversity, and functional attributes of plasmid communities (plasmidome) in 81 deep-sea metagenomes from the Tara and Malaspina expeditions, sampled from the Pacific, Atlantic, and Indian Oceans at depths ranging from 270 to 4005 m. We observed an association between depth and plasmid traits, with the 270-1000 m range (mesopelagic samples) exhibiting the highest number of plasmids and the largest plasmid sizes. Plasmids of Alphaproteobacteria and Gammaproteobacteria were predominant across the oceans, particularly in this depth range, which also showed the highest species diversity and abundance of metabolic pathways, including aromatic compound degradation. Surprisingly, relatively few antibiotic resistance genes were found in the deep-sea ecosystem, with most being found in the mesopelagic layer. These included classes such as beta-lactamase, biocide resistance, and aminoglycosides. Our study also identified the MOBP and MOBQ relaxase families as prevalent across various taxonomic classes. This research underscores the importance of studying the plasmidome independently from the chromosomal context. Our limited understanding of the deep-sea’s microbial ecology, especially its plasmidome, necessitates caution in human activities like mining. Such activities could have unforeseen impacts on this largely unexplored ecosystem.Deep-sea ecosystems remain poorly understood due to exploration challenges. Despite the advancements metagenomics has brought to our understanding of the ocean microbiome, the diversity and variability of marine viruses, particularly in the deep sea, are still not well characterized. For this study, raw reads from deep-sea shotgun sequencing samples were retrieved from Tara and Malaspina expeditions, encompassing depths from 270 to 4005 meters. A total of 64 samples containing viral reads were identified and analyzed through a comprehensive bioinformatics pipeline, including quality assessment, taxonomic classification, and metabolic annotation. The analysis reveals that microbial viral diversity significantly decreases with depth, with shallower waters exhibiting higher species richness and evenness. Furthermore, deep-sea viruses are predominantly novel, with a notable proportion of unclassified viral operational taxonomic units (vOTUs) with increasing presence of previously uncharacterized viral species at greater depths, emphasizing the underexplored reservoir of microbial viral diversity in these enviroment. Additionally, a higher abundance of auxiliary metabolic genes (AMGs) was observed at shallower depths, indicating potential roles in host metabolism and adaptation. Our findings underscore the impact of depth on microbial viral diversity and community composition in deep-sea and highlight the need for further exploration to fully understand their complexity and ecological roles.The environmental plasmidome, encompassing all plasmids present in an ecosystem, plays a crucial role in the adaptation and evolution of microorganisms. Plasmids, as mobile DNA elements, facilitate the horizontal transfer of beneficial traits among bacteria, particularly in response to environmental pressures. To study the plasmidome, various bioinformatics methods were employed to enhance the precision, reliability, and robustness of results, thereby providing more accurate biological insights. The implementation of this bioinformatics protocol on the Kabré supercomputer, along with its availability in repositories such as GitLab, ensures accessibility to the scientific community in Costa Rica. Although initially designed to examine the plasmidome in samples from the Virilla River, this protocol also enabled the investigation of plasmidomes in global deep-sea samples and facilitated the analysis of the virome (totality of viruses) in these samples. The analysis of the Virilla River plasmidome, a system heavily impacted by urbanization and industrial activities, revealed how pollution affects the diversity and characteristics of plasmids in water and sediment across various sites. Using optimized DNA extraction protocols and high-throughput sequencing, the study identified polluted sites as hotspots of plasmid diversity. This finding has profound implications for understanding the spread of antibiotic resistance, metal tolerance, and other adaptive traits within microbial communities. This study highlights the importance of investigating plasmids in natural environments to better understand their ecological roles and to assess the potential risks they pose in contaminated ecosystems.Consejo Nacional de Rectores (CONARE)
Vicerrectoría de Investigación de la Universidad de Costa Rica
International MarMib project: Impact of Marine Microplastic-Associated Biofilms on Environmental and Human HealthUCR::Vicerrectoría de Investigación::Sistema de Estudios de Posgrado::Ciencias Básicas::Maestría Académica en Biología con énfasis en Genética y Biología Molecula
Efecto de la sombra en la disipación de triazol - estrobilurina en hojas de café de la variedad “Villa Sarchí”
La disipación de los plaguicidas y, por ende, el periodo de eficacia en el control de la enfermedad meta, puede verse afectado por las condiciones ambientales. Se evaluó el efecto del sombrío en los sistemas de sombrío de 0 % y 50 % sobre la disipación de las moléculas epoxiconazol - piraclostrobina y la incidencia de la roya en hojas de café del cultivar “Villa Sarchí” durante una época de mayor intensidad de lluvia de octubre a diciembre del 2022 y una época seca de enero a marzo del 2023 durante 45 días en la localidad de San Pedro de Barva, Heredia. El depósito inicial del epoxiconazol y la piraclostrobina fue mayor en el sistema de 50 % de sombrío y en la época seca. La tasa de disipación fue mayor en el sistema de 0 % para ambas moléculas. La roya se desarrolló únicamente en el tratamiento de 0 % de sombrío en los segmentos de hojas inoculados con ureodosporas de roya bajo condiciones controladas de laboratorio. La incidencia de roya en la época de octubre a diciembre se presentó a los 45 días únicamente con una concentración de 0,6 mg/kg de epoxiconazol y 0,53 mg/kg de piraclostrobina. En la época seca, la incidencia de roya se presentó desde los 14 días después de la aplicación, siendo mayor a los 45 días después de la aplicación con una concentración de 0,71 mg/kg de epoxiconazol y 0,28 mg/kg de piraclostrobina. Los segmentos con lesiones cloróticas desarrolladas en campo y llevados al laboratorio para determinar la incidencia de roya, se presentó en ambos sistemas de sombrío, e indistintamente de la concentración de ambas moléculas. Existe un control sobre el desarrollo micelial hasta los 14 días después de la aplicación del fungicida, no relacionada con una mayor concentración de epoxiconazol. La incidencia de roya en campo al finalizar el periodo de prueba fue mayor en el sistema de 0 % de sombrío y en época lluviosa, ya que en época seca las horas de mojadura foliar y le temperatura no son favorables para el desarrollo de la enfermedad. La vida media fue mayor en epoxiconazol en la época lluviosa y en el tratamiento de 50 % de sombrío.The dissipation of pesticides and, therefore, the effectiveness period in controlling the target disease, can be affected by environmental conditions. The effect of shading at 0% and 50% shading levels on the dissipation of the molecules epoxiconazole-pyraclostrobin and the incidence of Coffee Leaf Rust (CLR) of the “Villa Sarchí” cultivar was evaluated during a period of higher rainfall intensity from October to December 2022 and dry season from January to March 2023 over 45 days in San Pedro de Barva, Heredia. The initial deposit of epoxiconazole and pyraclostrobin in leaves was higher in the 50 % shading system and during the dry season. The dissipation rate was higher in the 0% shading system for both molecules. CLR was developed only in the 0 % shading treatment on leaf segments inoculated with CLR uredospores under controlled laboratory conditions. The incidence of CLR during October to December period appeared after 45 days, only with a concentration of 0.6 mg/kg of epoxiconazole and 0.53 mg/kg of pyraclostrobin. In dry season, the incidence of CLR appeared as early as 14 days after application, with higher levels at 45 days after application, with concentrations of 0.71 mg/kg of epoxiconazole and 0.28 mg/kg of pyraclostrobin. Leaf segments with chlorotic lesions developed in the field and brought to the laboratory to determine CLR incidence appeared in both shading systems, regardless of the concentration of both molecules. There was control over mycelial development up to 14 days after the fungicide application, which was not related to a higher concentration of epoxiconazole. The field incidence of CLR at the end of the trial period was higher in the 0 % shading system and during the rainy season, as during the dry period, the leaf wetness hours and temperature were not favorable for disease development. The half-life was longer for epoxiconazole during the rainy period and in the 50 % shading treatment.Instituto del Café de Costa Rica///Costa RicaUCR::Vicerrectoría de Investigación::Sistema de Estudios de Posgrado::Ciencias Agroalimentarias::Maestría Académica en Ciencias Agrícolas y Recursos Naturales con énfasis en Protección de Cultivo
Optimization of process conditions and kinetic microbial growth for milk fermentation using domestic kefir grains from Costa Rica
Kefir, a fermented milk product, differs from yogurt due to its unique microbial composition, offering a broad spectrum of health benefits. Given its global popularity and high cost, there is a significant trend towards domestic kefir production. This study explores the optimization of kefir fermentation using Costa Rican domestic kefir grains, assessing the effects of temperature, agitation, and initial starter culture concentration. A Central Composite Rotatable Design (CCRD) and response surface statistical approach were employed to evaluate these parameters. Microbial growth data was fitted into a quadratic model, revealing significant interactions, particularly with temperature affecting both lactic acid bacteria (LAB) and yeast populations. Optimized fermentation conditions were established at 25°C, 0 rpm, and 5 g/L initial biomass, under which final microbial populations reached 9.45±0.13 log(cfu)/mL for yeast and 9.23±0.06 log(cfu)/mL for LAB. The specific growth velocity for kefir biomass was 0.029 1/h and the total acid production rate was 0.060 g/(L h). Notably, the acetic acid production was significantly less than lactic acid, indicating a dominance of LAB over acetic acid bacteria, which is crucial for the desired flavor and health benefits of kefir. Additionally, microbial enumeration on GYC and Rogosa agars showed distinct colony formations, highlighting the complex microbial interactions within kefir. This comprehensive dataset suggests that the performance of non-commercial starter cultures can be significantly improved under controlled conditions, providing a basis for developing guidelines for domestic kefir production. This study not only optimizes kefir production but also ensures that home-prepared kefir can meet quality standards, potentially enhancing its nutritional and therapeutic benefits.Universidad de Costa Rica/[]/UCR/Costa RicaVicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ingeniería::Instituto Investigaciones en Ingeniería (INII