Universidad de Costa Rica

Kerwa repositorio (Universidad de Costa Rica)
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    ¿Cómo recuperar ríos en Costa Rica? Propuesta metodológica para la recuperación socioambiental de la microcuenca del río Guararí

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    Los ríos de Costa Rica presentan altos niveles de degradación socioambiental y una persistente incapacidad colectiva para revertir la problemática. Este trabajo final de investigación aplicada propone una metodología participativa y multisectorial para la recuperación socioambiental de la microcuenca del río Guararí, ubicada en Barva y Santa Bárbara de Heredia. Se plantea un prototipo de intervención que articula saberes técnicos y comunitarios, con base en soluciones innovadoras basadas en la naturaleza. La metodología de investigación combina revisión documental, entrevistas a especialistas, mapeo participativo con actores locales y análisis geoespacial. El estudio caracteriza el contexto histórico y socioambiental de la microcuenca, sistematiza buenas prácticas nacionales e internacionales, y diseña un prototipo estructurado en cinco fases: comprender, idear, probar, monitorear y escalar. Se enfatiza la importancia priorizar proyectos demostrativos de bajo costo, alto impacto y potencialmente escalables. La propuesta metodológica busca ser replicable y adaptable en otras microcuencas con condiciones similares, contribuyendo al desarrollo de estrategias efectivas y sostenibles para la recuperación de ríos.Costa Rica’s rivers face severe environmental degradation and a persistent lack of coordinated effective action to address the issue. This applied research proposes a participatory, multisectoral methodology for the socio-environmental restoration of the Guararí River micro-watershed, located in Barva and Santa Bárbara, Heredia. The study introduces an intervention prototype that integrates technical expertise and community knowledge through innovative, nature-based solutions. The methodology combines documentary review, expert interviews, participatory mapping with local stakeholders, and geospatial analysis. The research characterizes the historical and socio-environmental context of the micro-watershed, systematizes relevant national and international best practices, and develops a five-phase prototype: understand, ideate, test, monitor, and scale. Particular emphasis is placed on the identification of low-cost, high-impact, and potentially scalable pilot projects. The proposed methodology aims to serve as a replicable model for other micro-watersheds with similar conditions, contributing to the development of effective and sustainable river restoration strategies.UCR::Vicerrectoría de Investigación::Sistema de Estudios de Posgrado::Ingeniería::Maestría Profesional en Desarrollo Urbano y Gestión Territoria

    Huellas narrativas de la Guerra Fria en Centroamérica y el Caribe entre la historiografía y la novela Costa Rica 1948, Guatemala 1954 y Cuba 1959-1962.

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    Este es un trabajo que inicia con una reflexión teórica sobre la relación que se da entre las novelas y los textos historiográficos, entendidos ambos registros, con sus similitudes y referencias, como formas narrativas desde las cuales se cuenta el tiempo humano y, a su vez, cada texto, historiográfico o novelesco, viene a ser interpretado como huella de acontecimientos sociales que requieren elaboración, comprensión, y es por medio de esos textos que se intenta ese ejercicio. Los acontecimientos, entonces, anteceden a los textos y los posibilitan. Asimismo, entre el acontecimiento social y el texto que lo elabora se encuentra un sujeto situado, un sujeto afectado por su visión de mundo, por su historia personal, por su género, por la ideología, por su deseo y su voluntad política, un sujeto que transfiere sus emociones en los textos les carga de afectos y les da una dirección ideológica. Esta comprensión teórica de novelas y de textos historiográficos la pongo a trabajar para pensar la Guerra Fría y, puntualmente, sus efectos durante sus primeros años en tres sociedades caribeñas, dos centroamericanas: Guatemala y Costa Rica, y una insular: Cuba. Los acontecimientos escogidos son la Guerra Civil de 1948 en Costa Rica, la caída de Juan Jacobo Arbenz en 1954 en Guatemala y los primeros años de la Revolución cubana, 1959-1962. A cada uno de ellos me acerco por medio de un libro de historia y una novela, los cuales interpreto desde la propuesta teórica anteriormente expuesta, desde la que se sostiene además que las novelas y los textos historiográficos son formas complementarias de saber que unidas potencian la capacidad de comprensión de los investigadores y permiten un entendimiento más profundo de momentos determinantes para las sociedades, en este caso Costa Rica, Guatemala y Cuba. Para Costa Rica interpreto la novela Los leños vivientes, de Fabián Dobles y el libro de historia Crisis social y memorias en lucha: guerra civil en Costa Rica, 1940-1948. Para Guatemala trabajo la novela Tiempos recios, de Mario Vargas Llosa y el libro de historia La esperanza rota: la Revolución guatemalteca y los Estados Unidos, 1944-1954, de Piero Gleijeses. Finalmente, para al caso cubano me aproximo por medio de la novela La consagración de la primavera, de Alejo Carpentier y el libro Historia de la Revolución cubana, de Sergio Guerra y Alejo Maldonado.This is a work that begins with a theoretical reflection on the relationship between novels and historiographical texts, understood both registers, with their similarities and references, as narrative forms from which human time is told and, in turn, each text, historiographical or novelistic, comes to be interpreted as a trace of social events that require elaboration, comprehension, and it is through these texts that this exercise is attempted. The events, then, precede the texts and make them possible. Likewise, between the social event and the text that elaborates it there is a situated subject, a subject affected by their vision of the world, by their personal history, by their gender, by ideology, by their desire and their political will, a subject who transfers their emotions in the texts, charges them with affections and gives them an ideological direction. I put this theoretical understanding of novels and historiographical texts to work to think about the Cold War and, specifically, its effects during its first years in three caribbean societies, two central american: Guatemala and Costa Rica, and one insular: Cuba. The events chosen are the 1948 Civil War in Costa Rica, the fall of Juan Jacobo Arbenz in 1954 in Guatemala and the first years of the Cuban Revolution, 1959- 1962. I approach each of them through a history book and a novel, which I interpret from the theoretical proposal previously exposed, from which it is also argued that novels and historiographical texts are complementary forms of knowledge that together enhance the capacity of understanding of researchers and allow a deeper comprenhension of decisive moments for societies, in this case Costa Rica, Guatemala and Cuba. For Costa Rica I interpreted the novel Los leños vivientes, by Fabián Dobles and the history book Crisis social y memorias en lucha: guerra civil en Costa Rica, 1940- 1948. For Guatemala I worked on the novel Tiempos recios, by Mario Vargas Llosa and the history book La esperanza rota: la Revolución guatemalteca y los Estados Unidos, 1944-1954, by Piero Gleijeses. Finally, for the cuban case, I approach it through the novel La consagración de la primavera, by Alejo Carpentier and the book Historia de la Revolución cubana, by Sergio Guerra and Alejo Maldonado.Vicerrectoría de Investigación::Sistema de Estudios de Posgrado::Interdisciplinarias::Doctorado en Estudios de la Sociedad y la Cultur

    Formación de ciudadanías comunicativas en colectivos universitarios feministas. Los discursos de denuncia y emancipación en medios digitales sobre sexismo, acoso y hostigamiento sexual de la colectiva #Me pasó en la UCR

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    La presente tesis doctoral es el resultado de la investigación realizada sobre la formación de ciudadanías comunicativas en colectivos universitarios feministas, y su relación con los discursos de denuncia y emancipación sobre el sexismo, el acoso y el hostigamiento sexual, elaborados y publicados por la Colectiva Feminista Me pasó en la UCR. El objetivo general de esta investigación se relacionó con develar los discursos y las acciones de los procesos de formación de las ciudadanías comunicativas que desarrolla el colectivo feminista universitario, en los medios digitales como espacios públicos de acción. Y los objetivos específicos fueron: comprender las acciones colectivas relacionadas con las ciudadanías comunicativas que desarrolla el grupo feminista universitario; comprender los procesos de formación que suscitan la construcción de ciudadanías comunicativas en el colectivo feminista universitario; y discutir sobre los procesos de formación de las ciudadanías comunicativas desarrollados por el colectivo feminista, a partir de la relación entre la educación y la comunicación. El enfoque metodológico fue cualitativo con un diseño narrativo, basado en las entrevistas en profundidad, específicamente las historias de vida para el trabajo con las integrantes de la Colectiva, y las conversaciones digitales para la recopilación de los contenidos presentados en la red social digital Facebook como contexto de estudio. Además, de los estudios del discursos como base para el análisis de la información. El estudio permite concluir que: las acciones desarrolladas por la Colectiva se originan como una respuesta con un propósito socioeducativo. La naturaleza de estas acciones es social, pedagógica, feminista, y formativa de las ciudadanías comunicativas. Las acciones socioeducativas posibilitaron el abordaje del acoso y hostigamiento sexual no solo desde el marco legal sino desde las transformaciones sociales, educativas y personales. El proceso de formación contribuyó a dotar a las mujeres de recursos con los cuales pudieran abordar contenidos relacionados con violencia de género, más allá de espacios formales de escolarización como las escuelas, los colegios o las universidades.UCR::Vicerrectoría de Investigación::Sistema de Estudios de Posgrado::Ciencias Sociales::Doctorado en Educació

    A comprehensive review of hypotheses about the biological function of zearalenone, and a new hypothesis for the function of resorcylic and dihydroxyphenylacetic macrolactones in fungi

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    The special metabolite of Fusarium spp. zearalenone (ZEN) exerts estrogenic effects on mammals, stimulates plant growth, stimulates sexual development in fungi, and inhibits fungal growth. These activities inspired hypotheses about the biological function of ZEN. We briefly review the discovery of ZEN and its implications. The main subject of this review is a critical assessment of the hypotheses that ZEN is a fungal hormone, a plant hormone, a virulence factor, or a fungal defense metabolite. Conceptual and technical issues related to testing these hypotheses, such as inadequate analytical methods, confusion of incidental effects with biological functions, and lack of normalization, are illuminated. Based on these considerations, gene knockout experiments, and on the effects of biotic interactions on ZEN synthesis, we argue that ZEN is a defense metabolite protecting Fusarium spp. against mycoparasites and competitors. Similar reasoning and published data suggest that the Fusarium metabolite fusaristatin A fulfils the same function. Fungi produce many macrolactones of resorcylic acid (RALs) and dihydroxyphenylacetic acid (DHPLs) with properties similar to ZEN. Their widespread occurrence, antifungal activity, and further considerations prompt us to hypothesize that the fundamental function of fungal RALs and DHPLs lies in defense and interference competition.Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Agroalimentarias::Centro para Investigaciones en Granos y Semillas (CIGRAS

    Percepciones de los cuidadores de la salud de sus hijos con sobrepeso: un estudio cualitativo en Costa Rica

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    Introduction. Childhood obesity represents an increasingly complex challenge for global public health. In Costa Rica, approximately 30% of the school-age population is overweight, demanding a comprehensive and multidimensional approach. Objective. To explore the perceptions of caregivers of overweight schoolchildren from eleven elementary schools in San Pedro de Montes de Oca, Costa Rica regarding their children's health outcomes and the barriers they face in accessing the healthcare system. Methodology. A qualitative, exploratory, and phenomenological approach was adopted. Semi-structured telephone interviews were conducted with caregivers selected through convenience sampling, that is, those who were available and willing to participate at the time of the study. A thematic analysis was applied. Results. Emotional, cognitive, and structural dimensions emerged as factors influencing caregivers’ responses. Caregivers expressed surprise and concern regarding the clinical results, revealing a gap between visual perception of overweight and understanding of metabolic risks. Nonetheless, they valued the information received as a driver for change and reported taking immediate actions such as modifying diet and increasing physical activity. However, their efforts were constrained by inaccessible clinical language, inflexible work schedules, lack of clarity regarding procedures, and limited availability of specialists. Additionally, caregiving burdens and single parenthood further restricted their ability to follow up on medical recommendations. A transversal category reflected mixed views of the public healthcare system: caregivers acknowledged its importance but expressed frustration with delays and inefficiencies, which negatively affected their trust and adherence. Conclusions. Caregivers show a strong commitment to their children's health but face significant systemic barriers. Clearer communication, intersectoral strategies, and structural improvements focused on families are essential to ensure effective follow-up and continuity of care.UCR::Vicerrectoría de Docencia::Salud::Facultad de MicrobiologíaUCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias de la Salud::Centro de Investigación en Hematología y Trastornos Afines (CIHATA

    Análisis de estrategias neuroevolutivas para la clasificación diferencial de demencias

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    Esta tesis doctoral desarrolla y evalúa una estrategia neuroevolutiva para la clasificación diferencial de demencias mediante imágenes de resonancia magnética. La investigación aporta cuatro contribuciones fundamentales: (1) un corpus especializado de imágenes cerebrales para clasificar Enfermedad de Alzheimer, Demencia Frontotemporal y sujetos Cognitivamente Normales; (2) un flujo de trabajo (pipeline) para la transformación y reducción de dimensionalidad de dichas imágenes; (3) un nuevo algoritmo de optimización denominado Micro-Evolutionary Particle Swarm Optimization, que combina conceptos de enjambre de partículas con principios evolutivos y micropoblaciones; y (4) una solución computacionalmente eficiente para la clasificación diferencial de demencias aplicable en entornos clínicos con recursos limitados. La metodología aborda el desafío diagnóstico mediante: preprocesamiento avanzado de imágenes que reduce la dimensionalidad; validación del algoritmo Micro-Evolutionary Particle Swarm Optimization para optimizar parámetros en redes neuronales; y un marco completo para la clasificación diferencial. Se incorporan dos escenarios evaluativos: comparación entre neuroevolución mediante Micro-Evolutionary Particle Swarm Optimization y descenso de gradiente con retropropagación; y análisis comparativo con resultados de la literatura científica. Los resultados muestran que el enfoque neuroevolutivo logra rendimiento comparable a métodos tradicionales (76% vs 75% de exactitud), pero con reducción significativa en la información requerida (19 vs 604 componentes principales), evidenciando que el método captura eficientemente las características relevantes para el diagnóstico diferencial con representación más compacta. La investigación contribuye tanto a la inteligencia artificial como a la práctica clínica, estableciendo base para futuras investigaciones en la intersección entre computación evolutiva, aprendizaje profundo y medicina, con implicaciones para mejorar la detección temprana y diagnóstico diferencial de demencias.UCR::Vicerrectoría de Investigación::Sistema de Estudios de Posgrado::Ingeniería::Doctorado en Computación e Informátic

    SCIROCCO: Health System Conditions for Scaling Integrated Care in Latin American Contexts

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    The presentation analyzes how to adapt the SCIROCCO model to assess the maturity of Latin American health systems in relation to integrated care, considering their fragmented structures and diverse sociocultural and plurinational contexts. It offers a critical reading of the original European framework, emphasizing the need for territorial contextualization, local diagnostics, and person-centered approaches. Key conditions for scaling up integrated care include institutional readiness, political coordination, regional cooperation, and the development of interdisciplinary teams, with implementation planned for 2025–2026. The approach is grounded in adaptive social complexity and capacity-building rooted in Latin American realities.UCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias de la Salud::Centro de Investigación en Cuidado de Enfermería y Salud (CICES

    El trabajo sexual masculino en Costa Rica, en tiempos del neoliberalismo

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    La investigación analiza el trabajo sexual masculino en San José, Costa Rica, a partir del estudio de caso de una sala de masajes. Su objetivo es identificar y comprender las estrategias cotidianas -muchas de ellas discretas o simbólicas, como autodeterminación, gestión del estigma o conductas corporales- mediante las cuales estos hombres enfrentan las condiciones impuestas por el Estado neoliberal. La investigación revela formas específicas de resistencia y supervivencia que surgen de su interacción diaria con un entorno socialmente condicionado. Esto permite observar cómo se configuran relaciones de poder en este espacio particular, así como las maneras en que los trabajadores sexuales ejercen agencia política, incluso fuera de los escenarios públicos tradicionales. El estudio subraya que el trabajo sexual masculino ha sido históricamente invisibilizado en comparación con el femenino, a pesar de ser un fenómeno con claras implicaciones políticas. En un contexto transformado por el neoliberalismo y la globalización, que ha precarizado aún más las condiciones laborales, estos hombres desarrollan modos de acción que amplían la comprensión de cómo se enfrentan las desigualdades. Analizar estas formas de resistencia discreta permite reconocer saberes, significados y formas de agencia que han permanecido silenciadas, y contribuye a comprender mejor la conducta política en situaciones de desigualdad. Por ello, la investigación destaca la importancia de estudiar modalidades poco abordadas -como las salas de masajes- para precisar cómo el trabajo sexual masculino se configura, se experimenta y produce subjetividades dentro de la sociedad costarricense.Vicerrectoría de Investigación::Sistema de Estudios de Posgrado::Ciencias Sociales::Maestría Académica en Ciencias Política

    Molecular dynamics of Lys49 PLA2-like toxins: Insights into solution and membrane-bound conformations

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    Snakebite envenoming is a neglected tropical disease that causes death and disability. Lysine 49 phospholipase A2-like (Lys49 PLA2-like) proteins are abundant toxins in many viperid venoms and play a significant role in their toxicity. They induce skeletal muscle necrosis by disrupting the plasma membrane through a mechanism independent of phospholipid hydrolysis. X-ray structures of Bothrops asper Lys49 PLA2-like proteins were analysed for sequence, folding and quaternary structure, and compared with dimer geometries of Lys49 PLA2s from other viper species in the PDB. Sequence and folding were mainly conserved, whilst quaternary structure was not. With a single exception, all quaternary structures fell into two categories: compact and extended. The B. asper extended and compact Lys49 PLA2 conformations were simulated in solution and in a membrane bilayer with molecular dynamics and scrutinised in light of mechanistic proposals and experimental data. Both conformations dissociated into monomers in solution. Membrane binding was more stable with higher fractions of negatively charged phospholipids, achieved through the inclusion of DMPA. The extended dimer desorbed in pure POPC, kept its dimeric conformation when adsorbed to POPC/DMPA (9:1), and dissociated into monomers in POPC/DMPA (1:1). Still, the protein remained adsorbed in the latter case. The compact dimer desorbed from the membrane in the pure POPC bilayer, lost its conformation in POPC/DMPA (1:1), and dissociated into monomers in a POPC/DMPA (9:1) composition. The monomers oscillated between vertical (compact-like) and horizontal (extended-like) orientations. These scenarios show that the current hypotheses for the membrane disruption mechanism by Lys49 PLA2-like proteins are not entirely aligned with the evidence, and alternative possibilities need to be considered. Our observations suggest that Lys49 PLA2s could act as monomers but may also associate into higher-order oligomers during membrane interaction. This highly complex molecular scenario aligns with recent evidence indicating that the membrane promotes protein oligomerisation.Fundação para a Ciência e a Tecnologia/[UID/50006]/FCT/PortugalMinistério da Educação, Ciência e Inovação/[UID/50006]/MECI/PortugalRede Nacional de Computação Avançada/[2021.09753]//PortugalRede Nacional de Computação Avançada/[2023.10650]//PortugalFundação para a Ciência e a Tecnologia/[CEECIND/01374/2018/CP1545/CT0003]/FCT/PortugalUniversidad de Costa Rica/[]/UCR/Costa RicaUCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias de la Salud::Instituto Clodomiro Picado (ICP)UCR::Vicerrectoría de Docencia::Salud::Facultad de Microbiologí

    LiProS: Findable, Accessible, Interoperable, and Reusable Data Simulation Workflow to Predict Accurate Lipophilicity Profiles for Small Molecules

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    Lipophilicity is a fundamental physicochemical property widely used to evaluate key parameters in drug design, materials science, and food engineering. It plays a critical role in predicting membrane permeability, absorption, and distribution of compounds. Moreover, lipophilicity is commonly integrated into scoring functions to model biomolecular interactions and serves as an important molecular descriptor in machine learning models for property prediction and compound classification. The election of the appropriate pH-dependent lipophilicity (mathematical equation) model is important to ensure its accuracy. The incorporation of the ion apparent partition coefficient (mathematical equation) into predictions of pH-dependent lipophilicity profiles can be essential for accurately reproducing experimental results. In accordance with the principles for findable, accessible, interoperable, and reusable data to improve data management and sharing, here, we introduce LiProS, a FAIR workflow that is easily accessible through a Google Colab notebook. LiProS assists researchers in efficiently determining the appropriate pH-dependent lipophilicity profile based on the SMILES code of their molecules of interest. In addition, LiProS demonstrated its utility in the analysis of ionizable compounds within the NAPRORE-CR natural products database, enabling the identification of the most appropriate lipophilicity formalism tailored to the physicochemical characteristics of these compounds.Universidad de Costa Rica/[115-C2126]/UCR/Costa RicaUniversidad de Costa Rica/[908-C3610]/UCR/Costa RicaUCR::Vicerrectoría de Docencia::Ciencias Básicas::Facultad de Ciencias::Escuela de QuímicaUCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias de la Salud::Laboratorio de Ensayos Biológicos (LEBI

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