966 research outputs found

    BIO STAR COBIK

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    Nel corso degli ultimi anni c’è stato un esplosivo aumento nella capacità di acquisizione dei dati sperimentali associato ad un parallelo abbassamento esponenziale nel costo. Grazie a queste precondizioni tecnologiche ed economiche, è ora possibile considerare progetti di ricerca biomedica che, all’interno di necessari vincoli di privacy e bioetica, si pongano alla confluenza di questi due flussi di dati e che abbiano come obiettivo studi ad alta risoluzione su coorti dell’ordine della decina di migliaia di individui. Studi cioè che, a tecnologia corrente, possono produrre ciascuno dataset dell'ordine della decina di petabyte, ed in cui la quantità di informazione da analizzare e gestire è destinata a crescere di un ordine di grandezza almeno ad ogni successiva (in tecnologia) campagna di acquisizione sperimentale sugli stessi campioni biologici. Lo scopo di COBIK è di costruire una piattaforma software, una biobanca computazionale, in grado di gestire in maniera uniforme ed efficiente tutto il flusso informatico/computazionale necessario a condurre studi a grande scala basati sull’integrazione sistematica di dati clinici e sperimentali, in particolare nel contesto della genomica.The COBIK project deals with problems stemming from the recent huge increase in dataset size from biosciences and health informatics. Its main goal is building a software framework capable of efficiently and uniformly handling the computational throughput associated to large-scale studies based on the integration of clinical and experimental data, specifically in the field of genomics.Completato€ 2.000.00

    ARPAS SERVIZI

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    Testo in fase di caricamento.Completato€ 12.00

    CITYSCRIPTS

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    Il progetto propone di integrare e sperimentare all'interno del FIRE testbed SmartSantander un'architettura REST/HTTP per la prototipazione rapida via Web di applicazioni composte da WSN, internet-enabled objects, urban sensors, social networks e altre sorgenti di dati prodotti e trattati in tempo reale. Il lavoro sarà svolto a partire dall'asset esistente sviluppato al CRS4 chiamato paraimpu (http://paraimpu.crs4.it)In corso€ 126.76

    TOURRENIA

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    La missione di fondo del progetto - riferita a quattro territori chiave della moderna realtà mediterranea, lungo l’asse marino tirrenico-ligure - consiste nel rafforzare un modello di fruizione turistica più facile e riconoscibile e, nel contempo, valorizzare tutte le iniziative di turismo attivo presenti nei territori di riferimento e minimo comune denominatore dei comuni partner: vela; windsurf; kitesurf; biking; immersioni, equitazione ed escursioni naturalistiche. Poiché i turisti tendono a essere più esperti e più istruiti (e quindi più esigenti, indipendenti, attivi e ben informati sulle loro mete) si punta a introdurre nel settore più conoscenza, più informazione e più abilità a gestire reti complesse. Si intende superare le debolezze del turismo attuale, tra cui il suo sviluppo mono-dimensionale, la stagionalità, i costi, la dipendenza dai tour operator, le infrastrutture ancora sotto certi standard. L’obiettivo generale del Progetto Tourrenia è quello di migliorare la fruizione turistica dei territori coinvolti con particolare sostegno ai soggetti svantaggiati. Si punta, decisamente: al rafforzamento della collaborazione tra le istituzioni e le associazioni che erogano servizi turistici; all’ampliamento dell’integrazione transfrontaliera dei servizi ed alla loro promozione con il supporto delle nuove tecnologie; al miglioramento delle competenze tecnico-informatiche degli operatori turistici.Completato€ 273.64

    Compression-domain Seamless Multiresolution Visualization of Gigantic Meshes on Mobile Devices

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    We present a software architecture for distributing and rendering gigantic 3D triangle meshes on common handheld devices. Our approach copes with strong bandwidth and hardware capabilities limitations in terms with a compression-domain adaptive multiresolution rendering approach. The method uses a regular conformal hierarchy of tetrahedra to spatially partition the input 3D model and to arrange mesh fragments at different resolution. We create compact GPU-friendly representations of these fragments by constructing cache-coherent strips that index locally quantized vertex data, exploiting the bounding tetrahedron for creating local barycentic parametrization of the geometry. For the first time, this approach supports local quantization in a fully adaptive seamless 3D mesh structure. For web distribution, further compression is obtained by exploiting local data coherence for entropy coding. At run-time, mobile viewer applications adaptively refine a local multiresolution model maintained in a GPU by asynchronously loading from a web server the required fragments. CPU and GPU cooperate for decompression, and a shaded rendering of colored meshes is performed at interactive speed directly from an intermediate compact representation using only 8bytes/vertex, therefore coping with both memory and bandwidth limitations.The quality and performance of the approach is demonstrated with the interactive exploration of gigatriangle-sized models on common mobile platforms.99-10

    FORWARD GENOMICS-IMMUNOGENOMICS

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    I fenomeni autoimmunitari risultano da una mancanza di tolleranza immunologica periferica. Recentemente sono stati individuati geni specifici responsabili del mantenimento della tolleranza immunologica e sono state caratterizzate alcune malattie paradigmi di malattie monogeniche autoimmuni. Tuttavia, la maggior parte dei pazienti con più manifestazioni autoimmuni non hanno mutazioni a carico dei geni noti. L'obiettivo generale di questo studio è di identificare i meccanismi molecolari e cellulari che portano all’esordio precoce dei fenomeni autoimmunitari multipli. L’obiettivo specifico del progetto è la caratterizzazione del profilo genomico di pazienti molto ben caratterizzati dal punto di vista clinico e immunologico. I pazienti arruolati nello studio sono selezionati per la presenza di più malattie autoimmuni e l'assenza di mutazioni genetiche conosciute. Le attività principali sono: a) caratterizzazione clinica e valutazione genetica, b) studio del profilo immunologico; e c) definizione dell’assetto molecolare.Completat

    The perfect cocktail: l'arte di scegliere e combinare le licenze libere

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    Il seminario è il primo di sei appuntamenti organizzati da Sardegna Ricerche per approfondire aspetti poco noti legati alla gestione dei beni immateriali. Si propone di affrontare le tematiche legate all'adozione delle licenze libere (free e open source software) e di fornire nozioni operative per la scelta della licenza di un progetto, di singole porzioni del software e per le combinazioni tra le varie licenze.2013-12-09Centro dei Congressi Fiera Internazionale della Sardegna piazzale CONI - CagliariCiclo di sei seminari sulla gestione dei beni immaterial

    An Update on the Seal Hadoop-based Sequencing Processing Toolbox

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    Contributed presentation to the 14th Bioinformatics Open Source Conference.2013-07Berlin14th Bioinformatics Open Source Conferenc

    Progetto Imaging 3D

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    In cors

    Automated moving mesh techniques in CFD. Application to fluid-structure interactions and rigid motions problems

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    Collana seminari interni 2012, Number 20120411.In the Computational Fluid Dynamics (CFD) simulation codes, the physical domain is divided into a finite number of small control volumes, corresponding to the cells of a computational grid, where discrete versions of the integral form of the continuum transport equations are applied. For the simulation of the moving meshes (fluids or solids), we employ specific morphing techniques combined with rigid motions. Since morphing strategies can easily lead to poor quality cells, it becomes important to keep under control the topological deformations that can take place both into the surface mesh and into the volume cells, by means of specific mesh quality metrics and re-meshing procedures. The work done in getting the control of the morphing/re-meshing techniques in order to use them in applications that principally treat with fluid-structure interactions and rigid bodies motions is here presented. In such applications, when local deformations of surfaces occur, bad topological effects like warped, twisted or self-intersected faces can easily lead to the appearance of negative volume cells, determining the simulation to stop running. We give a demonstration of how various morphing techniques have been applied to simulations that especially treat with structural and moving parts, in particular, in cases where the deformations arise from considerations related to solid displacements and stresses (pipe's walls vibrations) or to rigid body motions (translations). Surface boundary mesh extraction and CAD geometry updating strategies to avoid mesh degeneration are investigated and developed. Java programming is employed for the automation of the re-meshing procedures

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