Institut de l'Information Scientifique et Technique
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Rapport technique : Définition d'un plan de simulation STICS à échelle européenne, dans le cadre du projet SLAM-B et identification des unités pédoclimatiques pertinentes: Travail préparatoire à l’extension du modèle STICS à l’échelle de l’Europe sur la période 1990-2050
No full textThis work is part of the SLAM-B project which aims to design and evaluate the bioeconomy trajectories of territories towards carbon neutrality. This report proposes a robust method for constructing homogeneous spatial units for agri-environmental simulation at the European scale. It aims to reconcile the diversity and heterogeneity of data sources (soil, climate, land use) with the constraints of spatial homogeneity and computational efficiency to feed STICS crop model.Several datasets are mobilized, including SoilGrids, ESDB, LUCAS and climate data associated with the Agri4Cast grid.Ce travail s'inscrit dans le projet SLAM-B qui vise à concevoir et évaluer les trajectoires de bioéconomie des territoires vers la neutralité carbone. Ce rapport propose une méthode robuste de construction d’unités spatiales homogènes pour la simulation agro-environnementale à l’échelle européenne. Il vise à concilier la diversité et l’hétérogénéité des sources de données (sol, climat, occupation des sols) avec les contraintes d'homogénéité spatial et d'efficacité computationnelle pour alimenter modèle de culture STICS.Plusieurs jeux de données sont mobilisés, dont SoilGrids, ESDB, LUCAS et les données climatiques associées à la grille Agri4Cast.Une classification non supervisée (k-moyennes) est ensuite mobilisée afin d’identifier des groupes homogènes de contextes pédo-climatiques, réduisant ainsi le nombre d’unités à simuler tout en limitant la perte d’information.L’ensemble de la démarche est évalué à travers des analyses zonales et azonales permettant de quantifier les effets des choix méthodologiques sur la distribution des surfaces et la représentativité des sols agricoles. Une attention particulière est portée aux arbitrages entre précision locale et soutenabilité computationnelle, ainsi qu’aux conséquences des opérations de rognage spatial et de filtrage des occurrences minoritaires
Contamination procedure for chemical risk assessment in periphyton v2
No full textThis document outlines a standardized contamination procedure for high-throughput chemical risk assessment using periphyton in a 48-well plate format. This miniaturized approach allows for the simultaneous evaluation of multiple chemicals and concentration gradients, bridging the gap between field-scale complexity and laboratory efficiency
La vie risquée mais enrichissante d'un doctorant interdisciplinaire : accrochez-vous, une seule publication suffit !
No full textLa multidisciplinarité a un impact important dans de nombreux domaines qui a permis de nombreuses avancées scientifiques. Sa poursuite est de plus en plus encouragée au sein de la communauté des chercheurs, notamment par les agences nationales de recherche à travers des financements dédiés. Cependant, la multidisciplinarité ne vient pas sans inconvénients. En effet, une recherche multidisciplinaire requiert de connaître l'état de l'art et le langage des différents domaines. De plus, une disparité trop forte entre les champs peut réduire l'impact scientifique de la recherche, et les publications multidisciplinaires ont souvent des difficultés à trouver leur place dans la plupart des journaux qui tendent à éviter les publications jugées trop complexes ou trop éloignées de leur discipline principale. Nous étudions la question du coût de la multidisciplinarité en nous focalisant sur le corpus des thèses françaises codirigées (données récupérées depuis theses.fr) pour déterminer comment un taux de multidisciplinarité élevé impacte la productivité d'un doctorant grâce à des métriques telles que son nombre de publications ou son nombre de citations (données récupérées depuis Scopus). Nous considérons les doctorants ayant deux superviseurs et utilisons la distance thématique entre les superviseurs comme indicateur du taux de multidisciplinarité de la thèse. Pour évaluer cette distance, nous proposons deux espaces métriques dans lesquels plonger les chercheurs, l'un basé sur les disciplines de Scopus et l'autre basé sur les journaux dans lesquels les chercheurs publient. Nos résultats montrent un impact négatif du taux de multidisciplinarité d'une thèse sur le nombre de publications et le nombre de citations du doctorant lors de sa thèse mais pas sans avantages : un regard plus attentif sur la population des doctorants ayant publié au moins une fois au cours de leur thèse montre un impact positif sur les chances de poursuivre en recherche. Ces résultats suggèrent que réussir une thèse multidisciplinaire est difficile mais que, lorsqu'elle est réussie, elle offre de meilleures perspectives pour poursuivre en recherche
Rapport de mission - Polynésie française - Mai 2024
No full textEn mai 2024, une délégation de PELAGIS et PatriNat, deux unités d’appui et de recherche (UAR), a été organisé surle territoire polynésien afin de rencontrer les acteurs locaux, de restituer les travaux réalisés pour plusieurs programmes (REMMOA 2011, Listes rouges 2015) et de coconstruire les suites à donner.PatriNat s’est engagée dans l’accompagnement des acteurs des territoires d’Outre-mer pour une meilleure prise encompte de la biodiversité, notamment avec le renforcement de ses programmes socles sur la connaissance, ledéploiement de projets spécifiques et des appuis aux expertises locales.La mission visait à avoir une meilleure connaissance des attentes des acteurs du territoire polynésien et à établir un état des lieux des projets actuels de connaissance sur place. Durant cette mission, l’équipe a bénéficié de l’appui de la délégation de l’OFB en Polynésie française pour rencontrer les parties prenantes sur le suivi et la conservation de la biodiversité. Cette mission a également été facilitée par le délégué CNRS (et directeur du CRIOBE).Les échanges avec les acteurs locaux impliqués sur la connaissance et la préservation de la biodiversité se sontorganisés autour de deux thématiques principales :• Cette mission avait aussi pour but de restituer des éléments sur la campagne 2011 du programme REMMOA (REcensement des Mammifères marins et autre Mégafaune pélagique par Observation Aérienne) en Polynésie Française. Les échanges ont permis de recueillir des avis et des besoins pour préparer collectivement une nouvelle campagne de ce programme sur le territoire polynésien. • A la suite des résultats Liste rouge produits pour le territoire en 2015 sur la flore endémique et les oiseaux, la question de la mise à jour de ces évaluations doit être envisagée avec les acteurs polynésiens. La structuration et le partage des données sur les espèces et les habitats constituent un socle indispensable pour ce type d’étude et pour une contribution pertinente à la réglementation ou à la construction de zones clefs de biodiversité.Une série de rencontres institutionnelles et techniques a eu lieu, auprès du Haut-Commissariat, de la Vice-Présidence et de la Ministre en charge de la culture et de l’environnement, avec le directeur de la DIREN (Direction de l’environnement) ou encore la Déléguée à la Recherche du Pays. Du côté société civile, plusieurs associations et naturalistes se sont rendus disponibles. Un moment fort d’échange collectif a été accueilli par la CODIM (Communauté de communes) à Nuku Hiva, au sujet du dossier de classement UNESCO d’une série des sites de l’archipel des Marquises
Rapport sur l’HDR de Laura Naudeix, intitulée “Du poème au spectacle vivant : dramaturgie et histoire de l’opéra et du théâtre musical des XVIIe et XVIIIe siècles»
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Etude scientifique et participative sur la qualité du sol et de l’air et sur la perception des pollutions par les habitants dans la zone Sebikotane-Diamniadio, Sénégal - Résultats du projet AirGeo (2021 – 2024)
No full textMulti-criteria and multi-stage environmental study of Pl@ntnet service for the year 2024
No full textIn this study, we focus our investigation on Pl@ntNet, a citizen science platform, which re- lies on Artificial Intelligence (AI) models to identify plant species. Pl@ntNet provides a large-scale infrastructure supporting millions of users in over 200 countries. At this stage of deployment, and with years of experience developing the platform, Pl@ntNet is committed to understanding the environmental impacts of its identification service and contributing to the search for reduction opportunities. Our investigations assess the associated environmental impacts of Pl@ntNet for the year 2024. We based our approach on multi-criteria LCA, considering multiple impact type and the different life-cycle phases
Evaluation de l'effet de mesures de restauration et d'entretien de milieux ouverts en sites Natura 2000: Analyse des premiers résultats de suivi
No full textPatriNat pilote depuis 2018 une étude de l’efficacité des mesures de gestion en sites Natura 2000. Dans ce cadre, six porteurs de projets ont mis en œuvre des suivis co-financés par l’OFB en parallèle de la mise en œuvre de la restauration et/ou de l’entretien de pelouses. Ces suivis sont cadrés par une méthodologie commune développée par PatriNat grâce à l’appui du MNHN. Le double objectif de ce projet est, d’une part, de déterminer si les mesures de gestion permettent ou non de stabiliser voire d’améliorer l’état de conservation des parcelles et, d’autre part, de tester des méthodes de suivis qui pourraient par la suite être réemployées en autonomie par des gestionnaires.Ce rapport présente l’analyse des données récoltées au cours des suivis de cinq années de suivi. Il présente également le retour d’expérience des gestionnaires, des personnes ayant appliqué les suivis et de l’équipe en charge de l’analyse des données, ce qui permet non seulement d’éclairer les résultats obtenus mais également de produire un regard critique sur les méthodes et d’en suggérer des évolutions.La gestion est complexe à mettre en œuvre. Au-delà de la difficulté pour le gestionnaire à en définir les modalités, le manque d’exploitant.e.s ou l’inadaptation des animaux aux contraintes des sites compromet parfois le pâturage, voire le rend impossible. Les gestionnaires n’ont alors d’autre choix que de se tourner vers la gestion mécanique, dont le dosage peut s’avérer particulièrement délicat. Si les mesures suivies par nos projets semblent plutôt permettre un maintien du niveau d’embroussaillement pour la majorité des parcelles suivies, elles restent insuffisantes pour en assurer le recul. Du point de vue botanique néanmoins, on constate en parallèle une amélioration encourageante de l’état des pelouses en elles-mêmes. L’expérience de ces premiers suivis constitue une base de test des méthodes à partir de laquelle des proportions d’évolutions sont formulées. Les analyses seront poursuivies et renforcées notamment avec les données des 12 autres projets en cours sur ces mêmes thématiques
Guix-HPC Activity Report 2025
No full textGuix-HPC is a collaborative effort to bring reproducible software deployment to scientific workflows and high-performance computing (HPC). Guix-HPC builds upon the GNU Guix software deployment tools and aims to make them useful for HPC practitioners and scientists concerned with dependency graph control and customization and, uniquely, reproducible research.Guix-HPC started as a joint software development project involving three research institutes: Inria , the Max DelbrückCenter for Molecular Medicine (MDC) and the Utrecht Bioinformatics Center (UBC). Guix for HPC and reproducibleresearch has since received contributions from many individuals and organizations, including CNRS , Université Paris Cité , the University of Tennessee Health Science Center (UTHSC), Cornell University, and AMD. HPC remains a conservative domain but over the years, we have reached out to many organizations and people who share our goal of improving upon thestatus quo when it comes to software deployment.This report—our eighth report!—highlights key achievements of Guix-HPC between our previous report a year ago and today, February 2026. This year was marked by exciting developments for HPC and reproducible workflows. Significantadvances were made in integrating Guix into the complex software landscape of HPC, taking the roles of software manager,workflow execution engine, backend for generating container images, or provider for the complete operating system layer.This year was also marked by the migration to Codeberg, a non-profit and community-led European platform whose mainobjective is to facilitate the expansion of the contributor community. Finally, support for reproducing computations fromthe past was also much improved. And, as usual, we have been using Guix for research, and teaching other researchers how to get started.</div