Helsebibliotekets Research Archive
Not a member yet
1049 research outputs found
Sort by
Tiling array analysis of UV treated Escherichia coli predicts novel differentially expressed small peptides.
Despite comprehensive investigation, the Escherichia coli SOS response system is not yet fully understood. We have applied custom designed whole genome tiling arrays to measure UV invoked transcriptional changes in E. coli. This study provides a more complete insight into the transcriptome and the UV irradiation response of this microorganism.We detected a number of novel differentially expressed transcripts in addition to the expected SOS response genes (such as sulA, recN, uvrA, lexA, umuC and umuD) in the UV treated cells. Several of the differentially expressed transcripts might play important roles in regulation of the cellular response to UV damage. We have predicted 23 novel small peptides from our set of detected non-gene transcripts. Further, three of the predicted peptides were cloned into protein expression vectors to test the biological activity. All three constructs expressed the predicted peptides, in which two of them were highly toxic to the cell. Additionally, a remarkably high overlap with previously in-silico predicted non-coding RNAs (ncRNAs) was detected. Generally we detected a far higher transcriptional activity than the annotation suggests, and these findings correspond with previous transcription mappings from E. coli and other organisms.Here we demonstrate that the E. coli transcriptome consists of far more transcripts than the present annotation suggests, of which many transcripts seem important to the bacterial stress response. Sequence alignment of promoter regions suggest novel regulatory consensus sequences for some of the upregulated genes. Finally, several of the novel transcripts identified in this study encode putative small peptides, which are biologically active
Behandling av spiseforstyrrelser
NORSK: Kunnskapssenteret fikk i oppdrag fra Helsedirektoratet å utføre et systematisk litteratursøk med påfølgende sortering av mulig relevante systematiske oversikter. Helsedirektoratet skal bruke dette i sitt arbeid med nasjonale retningslinjer. Oppdraget var å finne oversikter om behandling av spiseforstyrrelser med vekt på familieterapi, kognitiv terapi, medikamentell, poliklinisk behandling og selvhjelp for personer med anoreksi, bulimi og overspisningslidelse. \ud
\ud
Vi utarbeidet et systematisk litteratursøk. I juni 2010 søkte vi i følgende databaser; Medline, Embase, PsycInfo, Cinahl, SveMed + og Cochrane Library. Tre medarbeidere gikk uavhengig av hverandere gjennom identifiserte publikasjoner/referanser og vurderte relevans etter inklusjonskriteriene.\ud
\ud
Søket resulterte i 4 269 referanser. Vi vurderte de identifiserte referansene til å være mulig relevante i henhold til de forhånsdefinerte inklusjonskriteriene og av disse ble 41 oversikter og metaanlyser inkludert. Vi sorterte oversiktene etter behandlingstiltak; 1) familieterapi, kognitiv terapi, medikamentell, poliklinisk behandling eller selvhjelp, og 2) etter diagnosegruppene anoreksi, bulimi og overspisningslidelse.\ud
\ud
Denne kartleggingen av forskningspublikasjoner viser hva som finnes av oppsummert forskning om medikamentelle og psykososiale tiltak i behandlingen av personer med spiseforstyrrelser. Oversiktene vi henviser til er ikke nødvendigvis systematiske eller av høy kvalitet. Konsekvensen er at vi anbefaler å kritisk vurdere oversiktene vi henviser til før de eventuelt brukes i nasjonal retningslinjer av spiseforstyrrelser.ENGLISH: 1-page key messages\ud
\ud
The Norwegian Knowledge Centre for the Health Services was commissioned by the Norwegian Directorate of Health to perform a systematic search for systematic reviews on psychosocial and medical interventions for persons with eating disorder, and sorting into medicational treatment, cognitive therapy, family therapy, self help and outpatient treatment, for persons diagnosed according to anorexia, bulimic or binge eating disorder.\ud
\ud
We developed a systematic literature search. We performed systematic searches in Medline, Embase, PsycInfo, Cinahl, SveMed+ and Cochrane Library june 2010. Three of the project team read and assessed title and abstracts independently and assessed relevance after predefined inclusion criteria.\ud
\ud
The search identified 4269 articles. We included 41 reviews that were considered relevant after using predefined inclusion criteria, and sorted these references according to type of population and intervention. Abstracts of included reviews are presented in the appendix. We did not assess the methodological quality of the reviews, nor did we summarize or grade the evidence. We highly recommend using checklist to assess the quality of the reviews.\ud
\ud
Our mapping of research publications showed the existing summarized research of medication and psychosocial treatment for persons with eating disorder. The reviews we refer to are not necessarily systematic or of high quality. These potential weaknesses show the need for thorough assessment. We strongly recommend a critical appraisal, before utilization of this evidence into practice
Effekten av vitaminer, mineraler og andre kosttilskudd på mental helse hos mennesker med schizofreni
NORSK: Schizofreni er en alvorlig mental lidelse. Forløpet for schizofreni kan være kronisk, men delvis eller fullstendig bedring er også mulig. Den vanligste behandlingsmetoden er antipsykotiske medikamenter. Vitaminer, mineraler og andre kosttilskudd er noen ganger brukt som tilleggsbehandling, men effekten av slik behandling er usikker.\ud
\ud
Denne hasteoversikten ble bestilt av Helsedirektoratet i juni 2010, som en delbestilling av en større bestilling fra 2009. Kunnskapssenteret ble bedt om å framskaffe et kunnskapsgrunnlag som kunne hjelpe til å belyse effekten av vitaminer, mineraler og andre kosttilskudd på psykisk helse hos personer med schizofreni.\ud
\ud
Vi inkluderte syv systematiske oversikter av høy og moderat metodisk kvalitet. Oversiktene omhandlet effekten av ayurveda, flerumettede fettsyrer og kinesiske urtemedisiner som ginkgo. Resultatene fra disse oversiktene ga grunnlag for fire hovedkonklusjoner: \ud
\ud
Det er ikke grunnlag til å tro at effekten av ayurveda er bedre enn antipsykotika på mental helse hos personer med schizofreni.\ud
På grunn av svakt kunnskapsgrunnlag er det usikkert i hvilken grad kombinasjonsbehandling med flerumettede fettsyrer, som omega-3, pluss antipsykotika er bedre enn antipsykotika alene på mental helse hos mennesker med schizofreni.\ud
Det er mulig at kombinasjonsbehandling med ginkgo (en type kinesisk urtemedisin) pluss antipsykotika har bedre symptomreduserende effekt enn antipsykotika alene hos mennesker med schizofreni.\ud
Vi fant ingen nyere systematiske oversikter om effekten av vitaminer eller mineraler på mental helse hos mennesker med schizofreni. Vi søkte ikke etter primærstudier, og det er mulig at det fins gode primærstudier om effekten av kosttilskudd hos mennesker med schizofreni
Resultater fra kliniske effektstudier av screening for kolorektal kreft
NORSK: Bakgrunn\ud
De aller fleste tilfeller av kolorektal kreft utvikler seg fra godartede forstadier, såkalte adenomer i tykktarmen. Metoder for å oppdage kolorektalkreft og forstadier tidlig er derfor av stor interesse. Én aktuell tilnærming er å utføre masseundersøkelser av befolkningen, eller deler av denne – "screening".\ud
\ud
Oppdrag\ud
Per i dag er det to metoder for screening for kolorektal kreft som har vært evaluert i kliniske effektstudier med tanke på helsegevinst: undersøkelse for okkult blod i avføringen og sigmoidoskopi. På bestilling fra Nasjonalt råd for kvalitet og prioritering i helsetjenesten oppsummerer vi her hva vi idag vet om effekten av hver av disse metodene.\ud
\ud
Hovedfunn\ud
\ud
Både screening med undersøkelse for okkult blod i avføring og screening med sigmoidoskopi reduserer risiko for død som følge av kolorektal kreft\ud
På basis av kunnskapsgrunnlaget vi har i dag kan vi ikke si hvilken av metodene som er den mest effektiv
Litteratursøk med sortering – Psykososial behandling av ikke-affektive psykoser (herunder schizofreni).
NORSK: Hva er effekten av psykososiale tiltak som nettverk, bolig, og kontinuitet i behandlingen for personer med ikke-affektive psykoser (herunder schizofreni)? Hva er effekten av medikamentelle og psykososiale tiltak for personer med rusinduserte psykoser?\ud
\ud
Nasjonalt kunnskapssenter for helsetjenesten har publisert et notat der grunnlaget er et systematisk og omfattende søk i databasene Cochrane Library, MEDLINE og EMBASE. Søket resulterte totalt i 1371 treff. To personer leste gjennom tittel og sammendrag uavhengig av hverandre. Vi inkluderte 37 referanser i henhold til fastsatte inklusjonskriterier og sorterte disse referansene ut fra to ulike innfallsvinkler, pasientpopulasjon og tiltak. Sammendraget (originale abstract) av hver enkelt oversikt er presentert. Vi har ikke vurdert den metodologiske kvaliteten, sammenfattet eller gradert kunnskapen av oversiktene. Vi minner derfor om at vi har tilgjengelige sjekklister for å vurdere kvaliteten: http://kunnskapssenteret.no/Verktøy/2031.cms.\ud
\ud
Denne kartleggingen av forskningspublikasjoner viser hva som finnes av oppsummert forskning om psykososiale tiltak i behandlingen av personer med ikke-affektive psykoser (herunder schizofreni). Vi har sett spesielt på bruk av nettverk, boligtiltak, og kontinuitet i behandlingen. For rusinduserte psykoser søkte vi etter forskning om effekt av medikamentelle tiltak og psykososiale tiltak.\ud
\ud
Oversiktene vi henviser til er ikke nødvendigvis systematiske eller av høy kvalitet.\ud
\ud
Konsekvensen er at vi anbefaler å kritisk vurdere kunnskapen vi henviser til før den eventuelt tas i praktisk bru
Screening for jernmangelanemi blant småbarn
NORSK: Gjeldende retningslinjer for å avdekke jernmangelanemi hos barn anbefaler målrettede undersøkelser blant ettåringer som ikke har fått ekstra jerntilskudd, er påfallende bleke eller mer enn vanlig syke. Videre anbefales at innvandrerbarn fra utenomvestlige land screenes ved ettårs alder og ved andre aldre hos nyankomne ved førstegangsundersøkelse.\ud
\ud
Disse anbefalingene er omdiskuterte. Helsedirektoratet har derfor bedt om en gjennomgang av hvordan andre land håndterer denne problemstillingen, og hva slags kunnskapsgrunnlag de baserer sine anbefalinger på.\ud
\ud
· Vi fant åtte retningslinjer der det gis anbefalinger om screening av småbarn for jernmangelanemi.\ud
\ud
· Anbefalingene er tildels sprikende.\ud
\ud
· Det er ikke utført kontrollerte studier der effekten av screening for jernmangelanemi har vært evaluert.\ud
\ud
· Det er ingen bred konsensus om hvorvidt testegenskapene til analysene som kan benyttes ved screening er tilstrekkelig gode\ud
\ud
· Det er heller ingen enighet om det å iverksette behandling (jerntilskudd) ved positivt testresultat er et hensiktsmessig tiltak.\ud
\ud
· Det mangelfulle kunnskapsgrunnlaget gjør at skjønnsmessige vurderinger nødvendigvis blir avgjørende for hvordan forskningen blir fortolket og omsatt til praktiske anbefalinge
European addiction severity index (EuropASI) i en oppfølgingsstudie av narkotikabrukere i behandling : refleksjon om kvaliteter ved instrumentet for forskning og praksisformål
NORSK SAMMENDRAG: SIRUS rapport 6/2010 beskriver og vurderer kartleggingsverktøyet European Addiction Severity Index (EuropASI) i en forskningssammenheng og for klinisk\ud
bruk. Materialet som danner grunnlag for rapporten er oppfølgingsstudien: «Hvilken nytte for hvem og til hvilken kostnad» der nærmere 500 narkotikamisbrukere rekruttert fra 20 norske behandlingstiltak er intervjuet i perioden 1998 til 2009. Intervjutidspunktene er ved inntak i behandling og etter ett, to, syv og ti år. EuropASI er valgt som hovedinstrument for denne studien, det vil si for beskrivelse av klientene ved inntak og for måling av endring i problembelastning. Erfaringer og data fra de tre første måletidspunktene inngår i rapporten. I tillegg utgjør undervisning i bruk av EuropASI og tilbakemeldinger fra behandlingstiltak som har implementert instrumentet, bakgrunnsmateriale og bidrar til vurdering og refleksjon. Hovedproblemstilling i den foreliggende rapporten er: Hva er styrker og svakheter ved EuropASI med hensyn til å kartlegge narkotikamisbrukere i behandling og evaluere endringer i problembelastning?\ud
1. Hvordan er EuropASI egnet som instrument for å beskrive klientutvalget i en forskningsstudie?\ud
2. Hvordan er det egnet til å måle endring i klientenes situasjon etter behandling?\ud
3. Hvordan vurderes nytten av EuropASI i utrednings- og behandlingsarbeid?\ud
EuropASI betegnes gjennom sin konstruksjon og form som et standardisert,strukturert kartleggingsverktøy og plasseres i hovedsak innenfor en kvantitativ kunnskapstradisjon. For å vurdere kvaliteter ved instrumentet brukes begrepene reliabilitet og validitet som analytiske akser. Materiale fra forskningsstudien trekkes inn for å belyse variabler og skala mål. Hovedvekten er lagt på en detaljert gjennomgang av utvalgte variabler i inntaksintervjuet for å vise psykometriske kvaliteter og svakheter ved spørsmål som utgjør baseline i undersøkelsen. De ulike endringsmålene i EuropASI blir belyst og vurdert ved hjelp av data fra to oppfølgingsmålinger. EuropASI er et flerdimensjonalt kartleggingsverktøy med syv hovedområder i tillegg til demografiske opplysninger:\ud
1. Fysisk helse\ud
2. Utdanning/arbeid og forsørgelse\ud
3. Alkohol\ud
4. Narkotiske stoffer og medikamenter\ud
5. Kriminalitet\ud
6. Familie- og sosiale relasjoner\ud
7. Psykisk helse\ud
Mange av variablene er kontinuerlige, slik at alvorlighetsgraden av problemer kan måles. Det stilles spørsmål både av objektiv, verifiserbar karakter, spørsmål som\ud
kun er basert på subjektiv rapportering og av klientens egen opplevelse av\ud
problemtyngde og vurdering av hjelpebehov.\ud
Den flerdimensjonale tilnærmingen vurderes som en styrke ved instrumentet. I\ud
beskrivelsen av klientene sees rusmiddelbruk som et element i et ofte svært sammensatt problembilde. Endring i problembelastning er, gjennom det store spekteret av variabler innenfor de ulike dimensjonene, mulig å analysere slik at viktige samvariasjoner kan fremstilles. Innenfor klinisk virksomhet kan EuropASI nettopp benyttes til å belyse hvor mangefasettert misbruksproblemet ofte er, og\ud
derfor begrunne behovene for en bred intervensjon og tverrfaglig kunnskap.\ud
Inntaksintervjuet har i hovedsak tidsreferanser som «siste 30 dager» og «tidligere i livet». Både det aktuelle problembildet, men også vansker som har en lang historie blir kartlagt. «Siste 30 dager» er den gjennomgående tidsreferansen for måling av endring. Svakheter ved et så kort tidsvindu drøftes. Likeså at baselineinformasjon fra «tidligere i livet» ikke er supplert med en måleperiode på ett år eller seks måneder slik at den kan matches med informasjon fra oppfølgingsintervjuene og gi et mer stabilt endringsuttrykk enn siste 30 dagers målet. Vi drøfter også ambisjonen om det detaljerte målenivået på mange av variablene innenfor bredden av temaer som instrumentet dekker. Prosedyrer og kvalitetssikring for å oppnå\ud
størst mulig grad av reliabilitet i intervjusituasjonen og gjennom databehandling gjøres rede for og innholdsvaliditet i de ulike dimensjonene og i enkeltvariabler diskuteres. Det anbefalte endringsmålet, Composite Score vurderes kritisk. Erfaringer fra klienter som er intervjuet med ASI er gjennomgående svært positive, og både behandlere og klienter legger vekt på at bruker/aktørperspektivet står sentralt i intervjuet. Nytten for utrednings- og behandlingsarbeid fremheves og\ud
forklares. I et samarbeidsprosjekt mellom SIRUS, SERAF og Tyrili FoU er det utviklet en\ud
nasjonal opplæringsstandard for bruk av instrumentet og undervisningen er forankret ved SERAF. En faggruppe vil i løpet av 2011 vurdere om den 6. versjonen av ASI skal anbefales for bruk i Norge.ENGLISH SUMMARY: This paper describes and evaluates the charting tool European Addiction Severity Index (EuropASI) in a research context and for clinical use. The background for this report is the follow-up study: «Hvilken nytte, for hvem og til hvilken kostnad?» [What utility, for whom and at what cost?] in which nearly 500 drug abusers recruited from 20 Norwegian treatment facilities were interviewed from 1998 to 2009. The interviews were conducted with clients upon admission for treatment, and then after one, two, seven and ten years. EuropASI has been selected as the main instrument for this study, i.e. to describe clients upon admission and for charting changes in the scope of their problems. Experiences and data from the three first interviews are included in the report. More than ten years of experience teaching in the use of EuropASI as well as feedback from treatment facilities which\ud
implemented the instrument have provided additional background material and contributed here to reflection and evaluation. The main question discussed in this report is: What are the strengths and weaknesses of EuropASI with regards to charting drug abusers in treatment and evaluating changes in their burden of problems?\ud
1. How suitable is EuropASI as the main instrument for describing a client\ud
selection in a research study?\ud
2. How is it suited for measuring changes in clients' situations after the initiation\ud
of treatment?\ud
3. What utility does EuropASI appear to have in assessment and treatment\ud
planning/conducting treatment?\ud
EuropASI is described by means of its construction and form as a standardised, structured charting tool and is generally placed within a quantitative knowledge tradition. The method for evaluating qualities of the instrument has been the use of concepts reliability and validity as analytical axes. Material from the research study is introduced to indicate variables and scales of measurement. Chief emphasis has been put on a detailed review of selected variables in the initial treatment admissions interview to indicate psychometric qualities and weaknesses in questions forming the baseline in the study. The measurements of clients' changes as registered by EuropASI are made evident and evaluated by means of data from two follow-up interviews. EuropASI is a multi-dimensional instrument with seven primary areas in addition to demographical information:\ud
1. Physical health\ud
2. Education- employment and means of support\ud
3. Alcohol\ud
4. Narcotic substances and medications\ud
5. Criminality\ud
6. Family and social relations\ud
7. Mental health.\ud
Many of the variables are continual, enabling the scaling of problem seriousness. Some of the questions asked are of an objective, verifiable character. But most are based on the clients' subjective reporting. Specific questions also solicit the clients' own considerations of the gravity of their problems and opinion of treatment needs. The multi-dimensional approach is evaluated as a strongpoint of the instrument. In the description of clients, substance use is perceived as one element in a composite and complex array of problems. Through the wide range of variables within many dimensions, changes in the burden of problems can be analysed and important covariations ascertained. In clinical activity, EuropASI is utilised to shed light on the many facets a drug abuse problem often consists of, thus underscoring the need for a broad intervention and multidisciplinary understanding. In interviews during admittance for initial treatment, the instrument generally uses time references of «the past 30 days» and «earlier in life». This provides not only a reference for perceiving current problems but also for difficulties within a longer time-line. «The past 30 days» is a characteristic time frame for measuring changes. The weaknesses posed by this narrow window are pointed out. Moreover, the baseline information from «earlier in life» is not supplemented by questions and responses regarding «one year ago» or «six months ago», which would enable it to be matched against information from follow-up interviews and provide a more stable expression of change than the 30-day increment. We also discuss the ambition of a fairly detailed degree of measurements in a number of variables that the instrument covers. We describe procedures and quality control to ensure the highest degree of reliability in interview situations as well as in various stages in data processing. Furthermore, we discuss the content validity of the various dimensions and the individual variables. The recommended measurement of change - the Composite Score - is subjected to a critical evaluation. Clients who are interviewed with ASI continue to regard it positively and both clinicians and clients are content with the way that the user perspective is a core element of the interview. EuropASI's usefulness in conducting studies and in treatment settings is explained, but experienced weaknesses are also revealed. A national standard for instructing and training users of EuropASI has been developed. In 2011 a group of professionals will make an assessment of the sixth version of ASI for use in Norway
Listeria monocytogenes infection affects a subset of Ly49-expressing NK cells in the rat.
NK cells are protective against certain bacterial and viral infections, and their production of IFN-γ is important for the early innate immune defence against L. monocytogenes. We have previously shown that depletion of NK cells in rats leads to increased bacterial burden upon L. monocytogenes infection, and that a subset of NK cells encompassing the majority of Ly49 receptors (Ly49s3+ NK cells) contributed to this effect. In this study, we have further investigated how the Ly49s3+ NK cell subset is affected by L. monocytogenes infection. We observed an increased percentage of Ly49s3+ NK cells in the spleen and a reduction in the bone marrow within the first 48 hrs of L. monocytogenes infection. Concomitantly, we observed increased expression levels of the inflammatory chemokine receptors CCR5 and CXCR3 by Ly49s3+ bone marrow NK cells, as compared to Ly49s3- NK cells, suggesting involvement of Ly49s3+ NK cells in the early phase of infection. However, NK cell production of IFN-γ was independent of Ly49 receptor expression. Furthermore, we observed increased expression levels of MHC class I molecules on both macrophages and NK cells during the first 48 hrs of infection, paralleled by a reduction in the surface expression of Ly49s3 on NK cells. In conclusion, L. monocytogenes infection modulates the tissue distribution of Ly49s3+ NK cells, and induces increased MHC class I expression and hence reduced surface expression of Ly49 receptors on NK cells. These changes indicate that L. monocytogenes infection may have multiple effects on NK cells in vivo, and suggests the involvement of Ly49-expressing NK cells in the immune responses towards L. monocytogenes
Resuscitation of newborn piglets. short-term influence of FiO2 on matrix metalloproteinases, caspase-3 and BDNF.
Perinatal hypoxia-ischemia is a major cause of mortality and cerebral morbidity, and using oxygen during newborn resuscitation may further harm the brain. The aim was to examine how supplementary oxygen used for newborn resuscitation would influence early brain tissue injury, cell death and repair processes and the regulation of genes related to apoptosis, neurodegeneration and neuroprotection.Anesthetized newborn piglets were subjected to global hypoxia and then randomly assigned to resuscitation with 21%, 40% or 100% O(2) for 30 min and followed for 9 h. An additional group received 100% O(2) for 30 min without preceding hypoxia. The left hemisphere was used for histopathology and immunohistochemistry and the right hemisphere was used for in situ zymography in the corpus striatum; gene expression and the activity of various relevant biofactors were measured in the frontal cortex. There was an increase in the net matrix metalloproteinase gelatinolytic activity in the corpus striatum from piglets resuscitated with 100% oxygen vs. 21%. Hematoxylin-eosin (HE) staining revealed no significant changes. Nine hours after oxygen-assisted resuscitation, caspase-3 expression and activity was increased by 30-40% in the 100% O(2) group (n = 9/10) vs. the 21% O(2) group (n = 10; p<0.04), whereas brain-derived neurotrophic factor (BDNF) activity was decreased by 65% p<0.03.The use of 100% oxygen for resuscitation resulted in increased potentially harmful proteolytic activities and attenuated BDNF activity when compared with 21%. Although there were no significant changes in short term cell loss, hyperoxia seems to cause an early imbalance between neuroprotective and neurotoxic mechanisms that might compromise the final pathological outcome