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    Compresión BZIP2 optimizada usando colas libres de bloqueo

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    Since the general trend nowadays is to have more and more processors (cores) available in each computer, the scalability of the data structures used in parallel programs must be carefully considered in order to guarantee that they take full advantage of the available processors. Because of increased containment, lock-based data structures usually do not perform proportionally as the number of processors increases. The use of well-designed lock-free data structures, like first in-first out, (fifo) queues, can boost the performance of a parallel program when many processors are available. In this work, a parallel version of bzip2, a popular compression and decompression program, is designed and implemented by using lock-free queues instead of the lock-based ones, and applying a two-buffer-output strategy. The performance of lock-free implementation is measured against lock-based implementations. Compression time was measured with different number of processors and different block sizes. Consistent with our hypothesis, the results show that our parallel lock-free implementation outperforms the other implementations.Debido a que la tendencia actual es tener más y más procesadores (cores) disponibles en cada computadora, la escalabilidad de las estructuras de datos usadas en programación paralela debe ser considerada cuidadosamente, para así garantizar que ellas saquen ventaja de los procesadores disponibles. Debido al aumento en la contención, usualmente las estructuras de datos basadas en bloqueos no mejoran su rendimiento proporcionalmente al incrementar el número de procesadores. El uso de estructuras de datos libres de bloqueos bien diseñadas, tales como las colas first in-first out, puede mejorar el rendimiento de un programa paralelo, cuando hay varios procesadores disponibles. En este trabajo se diseña e implementa una versión paralela de bzip2, un programa para compresión y descompresión de datos muy popular, usando colas libres de bloqueos en lugar de las basadas en bloqueos, y aplicando una estrategia de dos buffers de salida. Se compara el rendimiento de la implementación libre de bloqueos contra implementaciones basadas en bloqueos.  Se midió el tiempo de compresión usando diferente número de procesadores y diferentes tamaños de bloques.  Coincidiendo con la hipótesis de trabajo, los resultados muestran que la implementación paralela libre de bloqueos supera las otras implementaciones

    Composición proximal en algunas especies de pescado y mariscos disponibles en el pacífico costarricense

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    Fish and shellfish are the most complete foods due to their quality and quantity of nutrients. However, little is known about the chemical composition of the fishery resources of the Costa Rican Pacific Ocean. Therefore, this study aims to determine the nutritional potential of the (fresh) edible parts of six seafood species for consumption and with commercial importance in the Pacific area of Costa Rica. The proximate composition analysis—moisture, ash, ether extract and protein—were determined by AOAC methodology. The results indicated that the moisture content ranged from 77.13% for barracuda (Sphyraena ensis) and 83.12% for squid (Lolliguncula panamensis); ash was between 0.84% for squid and 1.65% for freshwater mussel (Anodonta luteola); the ether extract, from 1.16% for squid and 2.24% for freshwater clam. The freshwater clam had the lowest percentage of protein (10.73%); while the sole (Cyclopsetla querna) showed the highest percentage (19.86%). The studied species are a good alternative for human consumption due to their low fat and protein intake.El pescado y los mariscos son alimentos de los más completos por su calidad y cantidad de nutrientes; sin embargo, poco se sabe sobre la composición química de los recursos pesqueros del pacífico costarricense. Por tal razón, el objetivo del presente trabajo es determinar el potencial nutricional de las partes comestibles (fresco) de seis especies de pescados y mariscos de consumo e importancia comercial en la zona pacífica de Costa Rica. Los análisis de la composición proximal: humedad, cenizas, extracto etéreo y proteínas se determinaron según la metodología de AOAC. Los resultados indicaron que el contenido de humedad varió entre 77,13 % en barracuda (Sphyraena ensis) y 83.12% en calamar (Lolliguncula panamensis), la ceniza entre 0,84% en calamar y 1,65% en almeja de agua dulce (Anodonta luteola), el extracto etéreo entre 1,16% para el calamar y 2,24% para la almeja de agua dulce. La almeja de agua dulce presentó el menor porcentaje de proteínas (10,73%), mientras que el lenguado (Cyclopsetla querna) el mayor porcentaje (19,86%). Los resultados permiten concluir que las especies estudiadas son una buena alternativa para el consumo humano, por su bajo contenido en grasas y por el aporte proteico

    Modificación del índice de calidad de riberas: Inclusión del componente social en la evaluación de la calidad ribereña de la microcuenca del río Burío-Quebrada Seca

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    This research was based on the comparison of the results obtained by applying the Riparian Quality Index-QBR (Munné et al., 2003) and the Riparian Quality Index modified-QBRm (Araya y Fernández, 2011) in six areas of the Burío-Quebrada Seca river micro-watershed, located in the provinces of Alajuela and Heredia, Costa Rica. The objective was to analyze the status of riparian vegetation by modifying the original index (QBR) with the inclusion of the social component (QBRm). The results of the application of the QBR index was 95 points ("very good" quality) at sampling points 1 and 2 (upper area of micro-watershed), 40 and 45 points ("bad" quality) at sampling points 3 and 4, respectively (middle area of micro-watershed), and 15 and 10 points ("very poor" quality) at the sampling points 5 and 6, respectively (lower area of micro-watershed). The results obtained from the application of QBRm index maintained the same trend and no statistically significant differences (CI 95% p: 0, 092) appeared. The QBRm index can be used to complement the strictly biological component of the QBR index and to contribute with decisions related to the integral management of the micro-watershed.Esta investigación se basó en la comparación de los resultados obtenidos mediante la aplicación del índice de calidad de riberas-QBR (Munné et al., 2003) y el índice de calidad de riberas modificado-QBRm (Araya y Fernández, 2011) en seis zonas de la microcuenca del río Burío y su tributario Quebrada Seca, ubicada en las provincias de Heredia y Alajuela, Costa Rica. El objetivo fue analizar el estado de la vegetación ribereña mediante la modificación del índice original (QBR) con la inclusión del componente social. Los resultados obtenidos de la aplicación del índice QBR fueron de 95 puntos (“muy buena” calidad) en los puntos de muestreo 1 y 2 (zona alta), 40 y 45 puntos (“mala” calidad) en los puntos de muestreo 3 y 4 (zona media), respectivamente y 15 y 10 puntos (“muy mala” calidad) en los puntos de muestreo 5 y 6, respectivamente (zona baja). Los resultados obtenidos a partir de la aplicación del índice QBRm mantienen la misma tendencia y no presentaron diferencias estadísticamente significativas (IC 95% p: 0, 092). El índice QBRm puede ser utilizado para complementar el componente estrictamente biológico del índice QBR y así contribuir a la toma de decisiones relacionadas con el manejo integral de la microcuenca

    Comparación de los resultados en la resolución de ambigüedades para una red de estaciones GNSS en Europa con el uso de datos GPS y la combinación con datos GLONASS, utilizando el programa de procesamiento Bernese

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    The parameters of the ambiguity in the original observation equations are integer numbers. Technically two procedures are necessary to fix the ambiguities: first, the parameters are estimated as real values; in the second step, they are set to integers. Fixing the ambiguities decreases the number of parameters to be estimated in the final adjustment of the network, taking this result in a reduction in the number of items stored in memory, in the time investing in the processing and an improvement in the quality of the calculate of  coordinates. It was made the comparative analysis between the results after processing the network two times: in the first one, only GPS observation was processed; in the second one, both GPS and GLONASS observations were processed. The network used in the project has 25 GNSS stations, located in Europe. The processing was made using the Bernese GNSS software version 5.2. The main conclusion is the importance in the selection of the ambiguity strategy due to is a topic that require an complete analysis, due to the impact that the choose computation method have in the finals results and in the processing time. Los parámetros de la ambigüedad en las ecuaciones de observación originales son números enteros. Técnicamente son necesarios dos pasos para fijar las ambigüedades: primero, los parámetros son estimados como valores reales; en el segundo paso se fijan a números enteros. La fijación de las ambigüedades disminuye el número de parámetros a estimar en el ajuste final, lo cual lleva a un ahorro en número de elementos que se almacena en la memoria, en el tiempo invertido en el procesamiento y una mejora en la calidad del cálculo de las coordenadas. Se efectuó la comparación entre los resultados de dos procesamientos de la misma red: en el primero, se procesaron solo observaciones GPS; en el segundo cálculo, se procesaron de forma conjunta observaciones GPS y  GLONASS. La red usada en el proyecto está conformada por 25 estaciones GNSS, ubicadas en Europa. El procesamiento se efectuó con el programa Bernese 5.2. Se concluyó que la selección de la estrategia para fijar ambigüedades es un aspecto que debe analizarse detenidamente, debido al impacto que tiene el método de cálculo seleccionado sobre los resultados finales y el tiempo de procesamiento requerido

    Caracterización del profesorado de biología participante en la VII Olimpiada Costarricense de Ciencias Biológicas: Una mirada de sus estudiantes

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    This study aims to understand the strengths and areas of improvement on the teaching and learning process of biological sciences within the classroom; therefore, knowing the perception of students is fundamental. It is generated a baseline that reflects the current situation of the teaching-learning process in order to identify the educational actions that could be further enhanced, and those that need improvement from the teaching perspective. A characterization of the biology teachers who participated in VII Costa Rican Biology Olympiad, 2013, is presented from their students’ perspectives. The results obtained, through the implementation of a survey, were positive since 83% of teachers scored a high qualification in their teaching performance.Este estudio busca conocer aquellas fortalezas y oportunidades de mejora que se tiene en torno al proceso de enseñanza y aprendizaje de las ciencias biológicas en el aula y, por ello, conocer la percepción del estudiantado resulta fundamental. Se genera una línea base que refleja la situación actual del proceso de enseñanza-aprendizaje, con el fin de identificar las acciones educativas que se deben seguir potenciando y aquellas que se deben mejorar desde nuestra labor docente.  Se presenta una caracterización de docentes de biología que participaron en VII Olimpiada Costarricense de Ciencias Biológicas, 2013, a partir de los aportes de sus estudiantes. Los resultados obtenidos, mediante la implementación de una encuesta, fueron positivos ya que un 83% de docentes obtuvo una alta calificación en su desempeño docente

    Tendencias de investigación en el aprendizaje ubicuo: un micro estudio de publicaciones seleccionadas del 2000 al 2015

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    This article analyzes trends in ubiquitous learning research during the period 2000-2015. We searched for articles in English and Spanish that specifically addressed the topics of "ubiquitous learning" or "aprendizaje ubicuo". The selected papers were analyzed in the following categories: target population, subject area, type of contribution, country, publication media and type of paper. The results indicate that most of the initiatives are directed towards primary education; they do not address a specific subject area; and they contribute to the ubiquitous learning domain with the development of technology platforms. The country that has a dominant presence is Taiwan; the more prevalent publication journals are Computers and Education and Journal of Educational Technology & Society; and the kind of articles that are published have an orientation towards practical applications. The results serve as reference for educators and researchers who wish to contribute to this domain of knowledge, and for government authorities and educational institutions planning to promote and facilitate ubiquitous learning.Este artículo analiza el alcance de la investigación en el aprendizaje ubicuo durante el período 2000-2015, para lo cual se revisaron artículos en inglés y en español que abordaran expresamente el tópico de “ubiquitous learning” o “aprendizaje ubicuo”.  Los artículos seleccionados se analizaron en las siguientes categorías: población meta, área temática abordada, tipo de contribución, país, medio de publicación y tipo de artículo. Los resultados indican que la mayor parte de las iniciativas están dirigidas hacia la educación primaria, no abordan un área temática específica y contribuyen al aprendizaje ubicuo con el desarrollo de plataformas tecnológicas. El país que tiene una presencia dominante es Taiwán, los medios de mayor publicación son Computers and Education y Journal of Educational Technology & Society, y el tipo de artículos que más se publica tiene una orientación hacia la propuesta de aplicaciones prácticas. Los resultados obtenidos sirven de referencia para quienes desde la docencia e investigación desean contribuir con este dominio del conocimiento, y para las autoridades gubernamentales y de instituciones educativas que planeen promover y facilitar el aprendizaje ubicuo

    Avances biotecnológicos sobre maricultura en Costa Rica. Una revisión de la investigación desarrollada por la Escuela de Ciencias Biológicas de la Universidad Nacional

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    The development of mariculture in Costa Rica has required validation, innovation and generation of scientific-biotechnological knowledge. A revision of the main biotechnological advances on mariculture that have been applied and developed by the School of Biological Sciences of the National University of Costa Rica is presented. Experimentation and optimization of culture technology have boosted Crassostrea gigas oyster farming in the country and the establishment of local enterprises. Scientific research has generated globally significant biotechnological advances on the reproductive biology of penaeid shrimp and has allowed the controlled reproduction of commercial marine fish in the Gulf of Nicoya, Costa Rica. In addition, biotechnological techniques have been implemented and evaluated for growing algae, bacterial depuration of molluscs, Harmful Algal Blooms monitoring and bioremediation. Biotechnology research on mariculture and the transfer of new biotechnologies must be promoted and protected by the Intellectual Property of biotechnological innovations as tools for economic and social development in Costa Rica.El desarrollo de la maricultura en Costa Rica ha requerido de la validación, la innovación y la generación de conocimiento científico biotecnológico. Se presenta una revisión de los principales avances biotecnológicos sobre maricultura que han sido aplicados y desarrollados por la Escuela de Ciencias Biológicas de la Universidad Nacional de Costa Rica. La experimentación y optimización de la tecnología del cultivo de Crassostrea gigas ha impulsado la ostricultura en el país y el surgimiento de emprendimientos locales. La investigación científica realizada ha generado avances biotecnológicos de relevancia mundial sobre la biología reproductiva de camarones peneidos y ha permitido la reproducción controlada de peces marinos de interés comercial del Golfo de Nicoya, Costa Rica. Además, se han aplicado y evaluado técnicas biotecnológicas para el cultivo de microalgas, depuración bacteriana de moluscos, vigilancia de Floraciones Algales Nocivas y biorremediación. Se debe fortalecer la investigación biotecnológica sobre maricultura, fomentar la transferencia de la biotecnología desarrollada y promover la protección por medio de la propiedad intelectual de la innovación biotecnológica generada como herramientas para el desarrollo económico y social en Costa Rica.

    Activities That May Influence the Risk of Crocodile (Crocodylus Acutus: Reptilia: Crocodilidae) Attack to Humans in the Tempisque River Area, Guanacaste, Costa Rica.

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    One of the largest populations of crocodiles in Costa Rica is located at the Tempisque River. The species is threatened by habitat loss and poaching; but its populations have grown due to the protection given by law. The research was conducted in Guanacaste, Costa Rica. We made a characterization of popular knowledge, activities and perceptions of 374 residents of the study area. It was found that 55% believe that the crocodiles are abundant, 70% believe that populations have increased. The most dangerous activities done are recreation, swimming and fishing. There are significant differences between the proportions of response (X2: 71, n = 10, p <0.0001 X2). These activities are done daily (25%), weekly (30%), monthly (18%) and annually (10%). The risk of attack and the crocodile’s density in the river are not recognized. Also, a lack of knowledge about the natural history and ecology of the species is shown. The reasons for attacks are: the aggressiveness of the animals and their density. There are differences in the responses on the reasons of the attacks (X2: 35, n 8 p <0.0001). Generally, the crocodile perception is unfavorable.One of the largest populations of crocodiles in Costa Rica is located at the Tempisque River. The species is threatened by habitat loss and poaching; but its populations have grown due to the protection given by law. The research was conducted in Guanacaste, Costa Rica. We made a characterization of popular knowledge, activities and perceptions of 374 residents of the study area. It was found that 55% believe that the crocodiles are abundant, 70% believe that populations have increased. The most dangerous activities done are recreation, swimming and fishing. There are significant differences between the proportions of response (X2: 71, n = 10, p <0.0001 X2). These activities are done daily (25%), weekly (30%), monthly (18%) and annually (10%). The risk of attack and the crocodile’s density in the river are not recognized. Also, a lack of knowledge about the natural history and ecology of the species is shown. The reasons for attacks are: the aggressiveness of the animals and their density. There are differences in the responses on the reasons of the attacks (X2: 35, n 8 p <0.0001). Generally, the crocodile perception is unfavorable

    Proporción sexual, relación talla-peso y distribución geográfico-batimétrica de Squalus cubensis (SQUALIFORMES: SQUALIDAE) en la costa Caribe de Centroamérica

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    This article describes the geographic and bathymetric distribution of Squalus cubensis; some specimens were captured during a prospecting survey campaign that was held from January 3 to February 3, 2011, aboard the R/V Miguel Oliver on the Caribbean coast of Central America. 140 individuals were captured in 96 sets (65 males and 75 females) from 24 to 100 cm in total length, and between 70 and 3,040 grs of total weight. A marked difference in the sizes was found, indicating a sexual dimorphism. The length-weight relationship between sexes showed no significant differences in the slopes of the respective regressions. The spatial distribution of catches showed that more individuals were obtained primarily in Panama at depths ranging from 250 to 950 m, followed by Honduras. Over 75% of the catch occurred in a layer of the water column with temperatures between 12°C and 17°C. This study provides important preliminary information about sex ratio and length-weight relationship in S. cubensis captured in this area.Se describe la distribución geográfica y batimétrica de Squalus cubensis capturados a bordo del B/O Miguel Oliver en la costa Caribe de Centroamérica, durante una campaña de prospección pesquera realizada del 3 de enero hasta el 3 de febrero del 2011. Se analizaron 96 lances, se capturaron 140 individuos (65 machos y 75 hembras) de 24 hasta 100 cm de longitud total, y entre 70 y 3 040 grs de peso total. En cuanto a la talla, se encontró una marcada diferencia que indica dimorfismo sexual.  La relación talla-peso para ambos sexos no presentó diferencias significativas en las pendientes de las regresiones entre sexos. La distribución espacial de las capturas mostró que la mayor cantidad de individuos se obtuvo, principalmente, en Panamá a profundidades que van desde los 250 hasta los 950 m, seguido por Honduras. Más del 75% de las capturas se dieron en un estrato de la columna de agua con temperaturas entre los 17°C y los 12°C. El presente trabajo proporciona información preliminar importante, pues es la primera vez que se documenta una captura de esta especie que permita estimar proporción de sexos, estructuras de tallas y la relación peso–talla de S. cubensis en el Caribe de Centroamérica.

    Evaluación breve de la presencia de diatomeas y su relación con algunos parámetros físico-químicos en el río Pirro, Heredia, Costa Rica

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    The assessment of water quality in river ecosystems located in urban areas in the tropics based on the use of diatoms is scarce. This exploratory study aimed to establish the composition and species richness of diatoms in relation to physicochemical parameters as base element for monitoring the Pirro urban micro-watershed river in Heredia, Costa Rica. Materials were collected in the upper, middle, and lower river during dry, rainy, and transitional seasons. Dissolved oxygen, pH, conductivity, temperature, and composition diatomaceous were evaluated by scraping an area of 20 cm x 20 cm rocks. 18 diatom species with low abundance such as Navicula seminulum, N. minimum and N. cryptotenella were observed. These are indicatives of moderate conditions of pollution; others kinds, such as Nitzschia, display tolerant species to contaminants. The greatest diversity of species of diatoms occurred in the rainy season, and significant differences between sampling season and species richness were observed. In conclusion, Pirro river has poor sanitary conditions based on the presence of many different species, and the low channel of the river is the most affected by pollution. However, it is necessary to boost the information on this subject.La evaluación de la calidad de agua en ecosistemas fluviales en áreas urbanas en el trópico, basada en la utilización de diatomeas, es escasa. Este estudio exploratorio pretendió establecer la composición y riqueza de especies de diatomeas en relación con los parámetros físicos químicos como elemento base para un monitoreo de la microcuenca urbana del río Pirro, Heredia, Costa Rica. Los materiales se colectaron en la parte alta, media y baja del río durante la época seca, lluviosa y de transición. Se analizó el pH, el oxígeno disuelto, la conductividad, la temperatura y la composición de diatomeas raspando una superficie de 20 cm x 20 cm de rocas. Se observaron 18 especies de diatomeas con poca abundancia, con presencia de Navicula seminulum, N. minima y N. cryptotenella que son indicadoras de condiciones moderadas de contaminación y del género Nitzschia que presenta especies tolerantes a contaminantes. La mayor diversidad de especies de diatomeas ocurrió en la época lluviosa y se observaron diferencias significativas entre las épocas del muestreo y la riqueza de especies. Se concluye, con base en la presencia de especies, que el río Pirro presenta condiciones sanitarias malas y que el cauce bajo es el sitio más afectado por la contaminación. Pero es necesario aumentar la información en esta temática

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