Oskar Bordeaux
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Comparative studies of invasive Elodea canadensis Michx. in two climatically different regions
No full textElodea canadensis is a widespread invasive alien aquatic species in Europe. However, there is growing evidence that increasing anthropogenic eutrophication and other factors are leading to a decline in the populations of this species. We compared the structure of plant communities and the phenotypic plasticity of E. canadensis individuals across communities in Ukraine and Portugal to assess whether the species responds similarly to environmental variation, and to identify differences in its distribution, community role, and the environmental factors influencing the formation of morphological traits of the species and biomass. In both countries, E. canadensis preferentially occurs in oligo-mesotrophic and meso-eutrophic waters, forming similar communities, but in Ukraine the communities in lentic water bodies were floristically more diverse. Populations with high biomass of E. canadensis in Ukraine were formed in lentic water bodies with good water exchange, as well as in lotic ecosystems of both Ukraine and Portugal. Environmental clustering revealed a distinct ecological separation among water bodies, with the strongest contrast observed between lower-nutrient, higher-elevation Ukrainian lakes and nutrient-rich, lowland mixed lotic systems in both countries. The morphological traits of E. canadensis differed significantly between these clusters, particularly shoot length and leaf width, highlighting phenotypic responses to environmental gradients. We assume that anthropogenic eutrophication affects E. & scy;anadensis communities, and may lead to their decline or disappearance as trophic levels rise in both countries. Understanding these patterns is important for forecasting invasion dynamics under eutrophication and climate change, and for refining management strategies in freshwater ecosystems
Alternative Cholesky Decomposition and family of scale mixture of Normal distribution: A joint modeling approach
No full textIn Statistics, the analysis of longitudinal data is essential across various domains, including biomedical and agricultural research. Joint mean-covariance models have been widely used to capture within-subject dependence, often by parametrizing the scatter matrix via the Modified Cholesky Decomposition (MCD). However, the MCD has known drawbacks, such as sensitivity to the ordering of variables and challenges in parameter interpretation. As an alternative, the Alternative Cholesky Decomposition (ACD) offers improved numerical stability and interpretability, yet has been underexplored in robust modeling contexts. Traditional approaches also frequently assume normally distributed residuals, which may not hold in practice. While extensions based on the Student-t and Laplace distributions address heavier tails, they still rely on fixed parametric forms. To overcome both structural and distributional limitations, this paper proposes a novel joint regression model that combines the flexibility of ACD with the robustness of scale mixture of normal (SMN) distributions. We obtain maximum likelihood estimators and compare our model against classical and Student-t-based alternatives. Simulation studies show superior performance in estimation and prediction under outlier contamination. Real data applications further highlight the model’s robustness and practical utility
Exact separable solutions of two-dimensional time-fractional nonlinear biological population model under the regularized Prabhakar and ψ-Hilfer fractional-order derivatives
No full textThe main aim of this work is to investigate how to compute the exact separable solutions using the invariant subspace method for the fractional-order time derivative of two-dimensional nonlinear partial differential equations involving two space and one-time variables under two different fractional-order derivative definitions, namely the regularized Prabhakar and -Hilfer fractional-order derivatives. We also explicitly demonstrate the importance and usefulness of the method of the invariant subspace approach in computing the exact separable solutions for the two-dimensional fractional-order time derivative of the biological population model, which helps more accurately predict how populations will grow or shrink. More specifically, we show systematically how to compute the linear spaces for the above-mentioned model with the help of the invariant subspace approach. Furthermore, the computations of exact separable solutions are investigated for the linear and nonlinear biological population models under the above-mentioned two different time fractional-order derivatives with the help of the computed invariant linear spaces. Additionally, we notice that the computed solutions of the considered equations under the -Hilfer fractional derivative are valid under the -Riemann–Liouville, -Caputo, Hilfer, Katugampola, Caputo–Katugampola, Riemann–Liouville, and Caputo fractional derivatives because the -Hilfer fractional derivative is a generalization of those fractional derivatives. Also, note that the computed exact separable solutions to the underlying equation under two fractional-order derivatives are expressed in terms of trigonometric, exponential, and polynomial functions with two or three parameters of Mittag-Leffler functions. In addition, the obtained solutions under different fractional-order derivatives are compared with two-dimensional (2D) graphical representations. Finally, the exact separable solutions are presented for the initial and boundary value problems (IBVPs) of the discussed model under various fractional-order derivatives and their comparison
IEEE Trans Comput Biol Bioinform
No full textMultiple objectives have emerged in tuning protein-protein interaction (PPI) networks, such as identifying cross-species network similarities and predicting protein complexes and functions. Despite the proliferation of tuning methodologies, challenges remain in balancing accuracy and efficiency. In this paper, we introduce GA2Vec, a novel approach for globally aligning multiple PPI networks using genetic algorithms in a many-to-many fashion. GA2Vec leverages vector embeddings of protein sequences from ProtBERT, ESM-2, and ProtT5-XL-UniRef50 to reconstruct weighted PPI networks, incorporating functional similarity through Gene Ontology (GO) term embeddings derived from the Anc2vec method. We employ four community detection algorithms to generate candidate clusters from the weighted graph, serving as initial solutions for the genetic algorithm. The genetic algorithm optimizes network alignment by refining these clusters using a fitness function based on similarity scores from pre-trained embeddings and GO terms, achieving a robust global network alignment. We demonstrate the effectiveness of our method through experiments on eukaryotic, prokaryotic, SARS-CoV, and virus-host biological networks. It achieves robust alignment between SARS-CoV-2 and SARS-CoV-1 PPI networks, balancing F1, cluster interaction quality (CIQ), internal cluster quality (ICQ), consistent clusters, and sensitivity, with scores reflecting its adaptability to diverse biological contexts
Dialogues Clin Neurosci
No full textSoon after the introduction of second-generation antipsychotics, antipsychotic off-label use (OLU) progressively became a common prescribing practice. This evolving practice should be regularly monitored considering the growing number of persons exposed to the adverse effects of antipsychotics. The aim of the present review was to synthesise the literature published over the last 15 years on antipsychotic OLU for mental health symptoms. Observational studies confirm the persisting high rate of antipsychotic OLU prescription in two out of three youths and 30-60% of adults using antipsychotics. Increasing rates of low-dose quetiapine prescriptions for anxiety or sleep symptoms are paradigmatic of the current public health concern regarding antipsychotic OLU. Such prescriptions receive impetus from industry-funded marketing strategies and prescribers' feeling of innocuousness, with a resulting underestimation of the risk of adverse drug reactions (ADR). However, antipsychotic OLU should be neither trivialised nor demonised since it may be the only therapeutic option in persons with resistant psychiatric disorders or serious ADR with labelled drugs. To reduce the populational impact of antipsychotic OLU, it is necessary to better control the influence of the pharmaceutical industry regarding newly marketed drugs and to better inform prescribers and users about the risks associated with OLU prescribing
Sous-traitance des préparations magistrales en officine : pratiques actuelles et à venir en lien avec la mise à jour des bonnes pratiques de préparation
No full textLes préparations magistrales sont des médicaments sur-mesure pour répondre aux besoins spécifiques des patients n’ayant pas d’alternatives thérapeutiques, nécessitant une expertise et une rigueur particulière. Afin que la production de ces médicaments soit correctement encadrée par une règlementation.
Depuis 2007, les bonnes pratiques de préparation visent à garantir la qualité et la sécurité des préparations. En raison de la complexité et des responsabilités que cette activité engendre, la majorité des officines fait le choix de déléguer la réalisation des préparations magistrales aux officines spécialisées, les sous-traitants. La sous-traitance de ces préparations est en perpétuelle évolution et soumise aux exigences règlementaires croissantes. Cette thèse examine les pratiques actuelles des sous-traitants de préparations magistrales dans le contexte des nouvelles bonnes pratiques de préparations, publiées en 2023. L’objectif est de démonter l’importance de la sous-traitance pour la prise en charge pharmaceutique, alliant expertise technique, conformité règlementaire et efficacité opérationnelle afin d’assurer des préparations de qualité optimale. La première partie aborde les généralités des préparations pharmaceutiques, en présentant l’évolution historique et l’importance de ces préparations dans le domaine pharmaceutique. Expliquant également, le cadre légal, les conditions de remboursement et la tarification des préparations. La seconde partie étudie la mise à jour des bonnes pratiques de préparation, mettant l’accent sur la qualité, la traçabilité, la gestion du risque. Leur application impacte directement les soustraitants et nécessite une adaptation continue. La troisième partie, illustrée par l’exemple de la pharmacie PETIT en Guadeloupe, acteur clé de la sous-traitance en outre-mer, discute de l’importance cruciale des préparations notamment dans le contexte des tensions d’approvisionnement des spécialités et dans le domaine pédiatrique. Ce travail met en lumière l’importance de la sous-traitance des préparations magistrales en officine et le rôle du pharmacien. Il souligne les défis et les opportunités lies à l’évolution des bonnes pratiques de préparation garantissant des préparations de haute qualité pour une prise en charge optimale des patients
Therapie
No full textLa France est engagée dans une transition juridique et organisationnelle depuis de nombreuses années. Elle doit adapter son cadre national avec les nécessités juridiques de protection des données personnelles, avec les ambitions européennes et la concurrence internationale. Depuis la loi Informatique et Libertés de 1978 et jusqu’à la loi de 2019 sur la transformation du système de santé, les réformes ont renforcé les exigences en matière de protection des données personnelles, tout en ouvrant la voie à des usages innovants. Les récents règlements européens, comme l’AI Act (2024) et l’Espace européen des données desanté (2024), visent à renforcer cette dynamique, en assurant un cadre sécurisé, transparent et compétitif pour le partage et l’utilisation des données de santé. Comment garantir une véritable efficacité dans la réutilisation des données issues du soin tout en respectant les droits fondamentaux des citoyens ? Comment concilier des ambitions nationales et européennes avec les réalités techniques et organisationnelles du système de santé, dans les équipes cliniques et de recherche, et au plus près des patients et des usagers dans nos territoires ? Ces questions sont essentielles car l’accès et l’usage des données de santé sont perçus comme des leviers majeurs pour améliorer la qualité des soins, soutenir l’innovation et renforcer la compétitivité du système de santé franc¸ais. L’étude d’impact de la réforme de 2019 souligne que la transformation du système de santé devra reposer sur une meilleure prise en compte des besoins des patients et des professionnels, en favorisant les initiatives territoriales. Dans ce contexte, la France fait face à une priorité : instaurer une coordination renforcée entre les niveaux national et local, tout en préservant la confiance des usagers. Cette confiance si précieuse doit permettre d’assurer cette transition pour atteindre les objectifs nationaux et européens en matière de valorisation scientifique et économique des données
Estudio arqueométrico de la producción cerámica de la cultura Chupícuaro
No full textRéinterpréter les interactions Chupicuaro - Cuicuilco à la lumière des technologies céramiques (période préclassique, Mésoamérique).Se realizaron caracterizaciones microestructurales y químicas de más de 200 tiestos de cerámica procedentes de dos sitios arqueológicos en el valle de Acámbaro, Guanajuato (TR.6 y JR.24). Los resultados son consistentes con lo que se sabe de la producción doméstica local, donde la cocción se realizaba al aire libre, utilizando recursos locales tanto para las arcillas como los pigmentos para la decoración pintada. En el valle de Acámbaro habrían coexistido varios lugares de fabricación alfarera con sus propias fuentes de materias primas, produciendo cerámica con técnicas y estilos caracterizados por su uniformidad regional. Esta producción evolucionó a través del tiempo pues el estudio revela un cambio en las fuentes de materias primas entre los dos periodos sucesivos Chupícuaro y Mixtlan
Analysis of socio-spatial mediations in the researcher-practitioner relationship within the participatory research project Cov-Culture
No full textLa recherche participative Cov’culture a pour objectif d’étudier les effets de la crise sanitaire sur les pratiques des acteurs du spectacle vivant en Nouvelle-Aquitaine en associant à l’analyse des professionnels du secteur.Cette communication s’intéresse aux médiations et coopérations qui s’opèrent entre chercheurs et praticiens au sein du dispositif, et entre les professionnels et leur environnement dans le processus de changement induit par la crise.The participatory research Cov’culture aims to study the effects of the health crisis on the practices of live performance actors in Nouvelle-Aquitaine by involving professionals from the sector in the analysis.This communication focuses on the mediations and cooperations that take place between researchers and practitioners within the system, and between professionals and their environment in the process of change induced by the crisis