HAL Université de Tours
Not a member yet
55851 research outputs found
Sort by
Genome-wide association study dissects the genetic architecture of progesterone content in Persian walnut leaves (Juglans regia L.)
No full textInternational audienceProgesterone (P4) is an endogenous sex steroid hormone involved in the ovulatory cycle and pregnancy of animal species. In sheep and goats, P4 analogues are used to induce synchronized ovulations and oestrus behavior of the females. In humans, P4 from chemical synthesis is used to treat peri-menopausal disorders. However, such molecules are released into aquatic environment and can be a source of pollution, are prohibited in organic farms and go against the trend of "naturality" in animal production as well as in human health. A natural alternative may consist in the extraction and use of P4 in plants. Mammalian hormones were discovered in an increasing number of plant species, including walnut leaves that contain high levels of P4. We compared the content of P4 in leaves of 170 accessions of Juglans regia from the walnut germplasm collection of INRAE Prunus-Juglans Biological Resources Center previously genotyped using the Axiom ™ J. regia 700 K SNP array. We conducted a genome-wide association study (GWAS) using multi-locus models. When collected in October, P4 content goes from 34,1 to 287,5 mg/kg dry weight of leaves. The two laciniate accessions have the largest P4 content. We identified seven significant marker-trait associations on chromosomes 1, 2, 3, 6, 7, 15 and 16, and a candidate gene involved in the metabolism of sterols, precursors of plant steroid hormones. Our results raise the huge variability of P4 content within J. regia and propose a candidate gene which may have a role in the control of this variability, opening the way to a potential use of walnut P4 by the pharmaceutical industry towards more natural source of chemical compounds.</div
Dataset of zootechnical, biological, oocyte and embryo production indicators, from ewes with contrasted metabolic status and submitted to chronic bisphenol S exposure
No full textInternational audienceThis dataset consists of raw data from an experimental design in the ovine model: zootechnical traits, biological indicators, oocyte collection and embryo production from ewes with contrasted metabolic status and submitted to chronic Bisphenol S (BPS) exposure. For 2 consecutive years, 120 primiparous ewes (60 different ewes for each year) were managed in a loose sheepfold, assigned to two diet groups Restricted (R, n = 30) and Well-fed (WF, n = 30) and supplemented with or without BPS (0, 4 or 50 lg/kg/day), generating six experimental groups named R-0, R-4, R-50, WF-0, WF-4, and WF-50 (n = 10 ewes/group). Oocyte collection was carried out during the breeding season of sheep between September and December. Diet management started in May and BPS treatment started in June, that is to say at least 3 months before oocyte collection. The dataset presents zootechnical traits (age, live weight, body condition score), metabolic indicators and hormones concentrations measured in plasma (non-esterified fatty acids, glucose, thyroid hormones, Anti-Mullerian hormone, progesterone, oestradiol and other steroids) as well as in follicular fluid for some of them (progesterone, oestradiol and others steroids), BPS and BPS-glucuronide concentrations in plasma and urine, data from follicular puncture and oocyte collection by ovum pick-up followed by in vitro embryo production (during the 2nd year of experiment). This large dataset can be re-used on the one hand by researchers working on reproductive physiology in interaction with energy metabolism in ruminants, to further investigate the effects of a restricted diet; on the other hand, by toxicologists and endocrinologists to investigate the effects of BPS (potential endocrine disruptor) on several hormones (i.e. steroids) and metabolites
Précisions sur les préjudices extrapatrimoniaux exceptionnels de la victime indirecte
No full textInternational audienc
自动医学翻译的优化和质量评估：基于 MQM 2.0 的方法论
No full textMachine translation quality assessment has become a crucial issue in the fields of applied linguistics and translation technologies. In this study, we will focus on medical language in English, which will be analyzed and translated into French using DeepL (and later ChatGPT). We have extracted specific passages to conduct a comparative analysis between machine translation and a reference translation.The main objective is to evaluate the quality of the translation provided by DeepL using the Multidimensional Quality Metrics (MQM) evaluation framework. This framework allows for an in-depth analysis of different aspects of translation, such as accuracy, fluency, and coherence. By identifying the strengths and weaknesses of machine translation compared to human translation, this study will contribute to improving translation processes and ensuring accurate and effective medical communication.L'évaluation de la qualité des traductions automatiques est devenue un enjeu crucial dans le domaine de la linguistique appliquée et des technologies de la traduction. Dans cette étude, nous nous concentrerons sur la langue médicale en anglais, qui sera analysée et traduite en français à l'aide de DeepL (plus tard chatgpt). Nous avons extrait des passages spécifiques pour mener une analyse comparative entre la traduction automatique et une traduction référentielle. L'objectif principal est d'évaluer la qualité de la traduction fournie par DeepL en utilisant le cadre d'évaluation des Multidimensional Quality Metrics (MQM). Ce cadre permet d'analyser en profondeur différents aspects de la traduction, tels que l'exactitude, la fluidité et la cohérence. En identifiant les forces et les faiblesses de la traduction automatique par rapport à la traduction humaine, cette étude contribuera à améliorer les processus de traduction et à garantir une communication médicale précise et efficace.评估机器翻译的质量已成为应用语言学和翻译技术领域的一个重要议题。在本研究中，我们将重点关注英语医学语言，并使用 DeepL（稍后将介绍 ChatGPT）对其进行分析并翻译成法语。我们提取了特定段落，以对机器翻译和参考翻译进行比较分析。主要目标是使用多维质量指标（MQM）评估框架来评估 DeepL 提供的翻译质量。该框架可以深入分析翻译的不同方面，例如准确性、流畅性和一致性。通过识别机器翻译与人工翻译相比的优缺点，这项研究将有助于改进翻译流程，并确保医疗交流的准确性和有效性
机器和神经翻译研究中平行语料库分析的方法：自然语言处理（NLP）中的处理、对齐和标记
No full textThis report focuses on the methodical analysis of parallel corpora in the context of machine and neural translation studies. The work described aims to explore in depth the processes of processing, alignment, and tokenization within automatic language processing, using a parallel corpus extracted from the medical domain. This corpus, comprising data in French and English from the European Medicines Agency database, serves as a basis for the application of advanced cleaning and structuring techniques. In order to guarantee the relevance and quality of the data used, we implemented a semi-automatic approach, combining filters and post-processing methods to obtain reliable and useful data for our study.As part of this research, different technological tools, such as SpaCy (https://spacy.io/api/token) and SentencePiece (https://github.com/google/sentencepiece), were evaluated and applied in order to optimize the analysis and processing of textual data. Our approach includes a comparative analysis of the available software to select those that best fit our analytical needs while overcoming the technical challenges encountered when integrating and using these tools. While detailing the steps and methodologies implemented, this report also highlights the obstacles encountered, such as the limitations of processing large volumes of text with existing software and the challenges related to setting up working environments adapted to these tools. Through careful planning and flexibility in the approach, this project aims to lay a solid foundation for future studies and applications in the field of machine-assisted translation.Ce rapport se concentre sur l'analyse méthodique des corpus parallèles dans le cadre de la traductologie machine et neuronale. Le travail décrit vise à explorer en profondeur les processus de traitement, d'alignement et de tokenisation au sein du traitement automatique du langage, en utilisant un corpus parallèle extrait du domaine médical. Ce corpus, comprenant des données en français et en anglais issues de la base de données de l'Agence européenne des médicaments, sert de fondement pour l'application des techniques avancées de nettoyage et de structuration. Afin de garantir la pertinence et la qualité des données utilisées, nous avons mis en œuvre une approche semi-automatique, associant filtres et méthodes de post-traitement pour obtenir des données fiables et utiles à notre étude.Dans le cadre de cette recherche, différents outils technologiques, tels que SpaCy (https://spacy.io/api/token) et SentencePiece (https://github.com/google/sentencepiece), ont été évalués et appliqués afin d'optimiser l'analyse et le traitement des données textuelles. Notre approche inclut une analyse comparative des logiciels disponibles pour sélectionner ceux qui correspondent le mieux à nos besoins analytiques, tout en surmontant les défis techniques rencontrés lors de l'intégration et de l'utilisation de ces outils. Tout en détaillant les étapes et méthodologies mis en œuvre, ce rapport met également en lumière les obstacles rencontrés, tels que les limitations du traitement de gros volumes de texte par des logiciels existants et les défis liés à la mise en place d'environnements de travail adaptés à ces outils. Grâce à une planification rigoureuse et une flexibilité dans l'approche, ce projet vise à poser des bases solides pour des études futures et des applications dans le domaine de la traduction assistée par machine.本报告重点介绍在机器翻译和神经翻译研究背景下对平行语料库进行的方法分析。本文所述的工作旨在利用从医学领域提取的平行语料库，深入探索自动语言处理中的处理、对齐和标记化过程。该语料库包含来自欧洲药品管理局数据库的法语和英语数据，为应用高级清理和结构化技术提供了基础。为了保证所用数据的相关性和质量，我们实施了一种半自动化的方法，结合了过滤器和后处理技术，以获取可靠且有用的数据。作为本研究的一部分，我们评估并应用了不同的技术工具，例如 SpaCy (https://spacy.io/api/token) 和 SentencePiece (https://github.com/google/sentencepiece)，以优化文本数据的分析和处理。我们的方法包括对可用软件进行比较分析，以选择最适合我们分析需求的软件，同时跨越在集成和使用这些工具时所遇到的技术挑战。本报告在详细介绍实施的步骤和方法的同时，还强调了遇到的障碍，例如使用现有软件处理大量文本的局限性，以及设置适合这些工具的工作环境所带来的挑战。通过精心规划和方法灵活性，该项目旨在为机器辅助翻译领域的未来研究和应用奠定坚实的基础
L'Encyclopédie des communautés et pratiques communautaires: Extraits choisis – Édition 2025
No full textInternational audienceL’Encyclopédie des communautés et pratiques communautaires propose un corpus inédit de connaissances sur les sources, formes et modes d’organisations collaboratives et collectives d’hier, d’aujourd’hui et de demain.Rassemblant des spécialistes internationaux de diverses disciplines, dont le droit, la sociologie, l’économie ou les sciences de la gestion, cet ouvrage de référence constitue une ressource précieuse pour comprendre et analyser les fondements et fonctionnements des communautés qui imaginent de nouvelles façons de vivre ensemble.Ainsi les communautés dont il est question ici sont celles qui s’articulent autour de trois axes : la défense d’un intérêt communautaire, comme la protection d’un espace naturel ; le partage d’un bien privatif ou commun, comme les habitats participatifs ; ou encore la production des connaissances, telle l’encyclopédie Wikipédia.Publiée en libre accès, cette encyclopédie évolutive, dont sont présentés ici les premiers extraits, a vocation à s’enrichir continuellement sous la supervision d’un comité scientifique international et pluridisciplinaire, afin d’offrir unevision plurielle et engagée des communautés et pratiques communautaires
Projet COSMOS : Transcriptions anonymisées d'interviews d'enfants sur la construction sémantique et les stéréotypes
No full textCe dépôt contient des données anonymisées issues du projet COSMOS (Construction Sémantique du Monde et Stéréotypes), une étude explorant les stéréotypes et les constructions sémantiques chez les enfants âgés de 6 à 11 ans. Les données, collectées en Bretagne (France) entre mars 2021 et mars 2022, proviennent de transcriptions d’entretiens individuels menés auprès de 184 élèves scolarisés dans 4 écoles.Les données sont organisées en deux formats (Excel et JSON) pour faciliter leur analyse qualitative, linguistique et statistique. Elles sont adaptées à des recherches en sociologie, linguistique, psychologie du développement, et sciences de l’éducation. Le processus d’anonymisation respecte les normes éthiques et réglementaires en vigueur (RGPD).Le dépôt inclut également un README détaillant les objectifs du projet, les concepts étudiés, les modalités de collecte, et les méthodes d’anonymisation.Utilisation potentielle : ces données peuvent être utilisées pour des études sur les représentations sociales, l'analyse sémantique, et le développement cognitif des enfants.This repository contains anonymized data from the COSMOS project (Semantic Construction of the World and Stereotypes), a study exploring stereotypes and semantic constructions in children aged 6 to 11.The data, derived from interview transcripts, was collected from 184 schoolchildren in Brittany, France, between March 2021 and March 2022.The objective is to analyze their responses to gain insights into their perception of various concepts.Ce dépôt contient des données anonymisées issues du projet COSMOS (Construction Sémantique du Monde et Stéréotypes), une étude visant à explorer les stéréotypes et les constructions sémantiques chez les enfants âgés de 6 à 11 ans.Les données, tirées de transcriptions d’entretiens individuels, ont été collectées auprès de 184 élèves scolarisés dans 4 écoles de Bretagne (France) entre mars 2021 et mars 2022.L’objectif est d’analyser leurs réponses pour mieux comprendre leurs perceptions de différents concepts et les schémas de pensée associés
Extensive environmental survey of free-living amoebae and their elusive association with Mycobacterium bovis or Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis
No full textInternational audienceFree-living amoebae (FLA) are described as environmental reservoirs for some bacteria able to resist their phagocytosis. In the environment, the fate of Mycobacterium bovis (Mbo) and Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (Map) responsible for bovine tuberculosis and paratuberculosis, respectively, remains poorly understood and is considered potentially problematic in the eradication and control of these diseases. We hypothesize that FLA may play a role in the persistence of Mbo and Map in the environment. In this study, 90 samples were collected from herds affected by one or both diseases to investigate the diversity of amoeba and their associated bacteria. Metabarcoding analyses revealed that Acanthamoeba, Copromyxa, Naegleria, and Vermamoeba were the most represented genera of FLA, with Pseudomonadota being the bacteria most commonly found associated with FLA. Although no Mbo and Map DNA were identified by sequencing, traces were detected by ddPCR (digital droplet PCR), specifically targeting these bacteria. In conclusion, we described a wide diversity of FLA and associated bacteria in this environment. It also suggests that Map and Mbo could be associated, even weakly, with FLA in the environment. However, this needs to be confirmed by detecting a highest amount of DNA and, if possible, cultivable Map and/or Mbo associated with these environmental FLA
Is monetary policy transmission green?
No full textInternational audienceThis paper examines whether traditional monetary policy affects firms differently based on their carbon emissions—a previously unexplored driver of monetary policy non-neutrality. We develop a theoretical model predicting that carbon-intensive (”brown”) firms are more sensitive to monetary policy shocks due to investor preferences for ”green” assets. We test this prediction using stock price data from U.S. firms between 2010 and 2019. Our findings confirm that brown firms are more sensitive to monetary policy shocks than green firms. This heightened sensitivity persists even after controlling for financial constraints and intensifies with rising climate awareness among investors. Our results suggest that traditional monetary policy is not carbon-neutral and unintentionally amplifies biases related to carbon emissions, highlighting important considerations for policymakers